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当前共找到 33643 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-12-04 |
Development and Validation of a Prognostic Model for Lung Cancer Based on Machine Learning and Immune Microenvironment Analysis
2025-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70962
PMID:41319095
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研究论文 | 本研究基于机器学习和免疫微环境分析，开发并验证了一个用于肺癌的预后模型 | 整合了多种机器学习算法和单细胞RNA测序数据，识别了关键的免疫基因和细胞间通讯网络，为肺癌预后提供了新的预测工具和免疫学见解 | 研究依赖于公共数据库（TCGA和GEO）的数据，可能存在样本选择偏差，且模型在独立队列中的验证未在摘要中明确说明 | 开发一个准确的肺癌预后预测工具，并探究免疫微环境在肺癌进展和治疗反应中的作用 | 肺癌患者及其RNA表达谱和临床数据 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法组合 | RNA表达谱数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2025-12-04 |
Epigenetic Regulation of G6PD Drives Metabolic Reprogramming in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70202
PMID:41054380
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤特异性增强子在肝内胆管癌代谢重编程中的作用，特别是G6PD和戊糖磷酸途径的调控 | 首次将增强子介导的表观遗传调控与肝内胆管癌中的G6PD过表达和戊糖磷酸途径活性联系起来，揭示了肿瘤特异性增强子作为关键表观遗传驱动因子的新作用 | 未来研究需探索将增强子分析整合到精准医学框架中，并开发新的增强子靶向策略 | 研究肿瘤特异性增强子在肝内胆管癌代谢重编程中的作用及其治疗潜力 | 肝内胆管癌肿瘤上皮细胞 | 表观遗传学 | 肝内胆管癌 | 原生延伸转录本捕获分析基因表达，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2025-12-04 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Effect of Commensal Bacteria on the Multistep Development of Esophageal Cancer
2025-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70226
PMID:41077998
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了食管共生菌在食管鳞状细胞癌多阶段发展中的作用，包括其对上皮细胞恶性转化和炎症性成纤维细胞形成的影响 | 首次在单细胞水平上系统分析了食管共生菌在ESCC肿瘤微环境中的异质性分布及其对慢性炎症和免疫抑制状态的调控机制 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化的适用性需进一步验证；抗生素处理可能产生非特异性效应 | 阐明食管共生菌在食管鳞状细胞癌发生发展中的具体作用机制 | 小鼠自发性食管鳞状细胞癌模型中的54,562个单细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 54,562个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-12-04 |
Integration of scRNA-Seq and scATAC-Seq Reveals Malignant Characteristics of Sarcomatoid Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70220
PMID:41082386
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，揭示了肉瘤样透明细胞肾细胞癌的恶性特征 | 首次利用scATAC-seq识别肉瘤样分化肿瘤细胞的转录调控特征，并鉴定出DST、FRMD4A和PREX2作为该疾病的肿瘤标志物 | 研究仅基于单例患者样本，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 阐明肉瘤样透明细胞肾细胞癌的恶性特征，为诊断和治疗提供新见解 | 肉瘤样透明细胞肾细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | scRNA-seq, scATAC-seq, WES | NA | 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据、全外显子组测序数据 | 1例肉瘤样ccRCC患者样本，以及19例经典ccRCC样本（共19,819个肿瘤细胞和21,684个细胞核） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 185 | 2025-12-04 |
MedakaBase as a unified genomic resource platform for medaka fish biology
2025-Dec-01, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsaf030
PMID:41122912
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研究论文 | 本文介绍了MedakaBase作为一个统一的基因组资源平台，用于支持青鳉鱼生物学研究，整合了多物种的基因组数据和分析工具 | 首次为青鳉鱼建立了一个统一的基因组资源平台，整合了分散的组学数据，并提供面向基因的分析功能，包括单细胞转录组优化的基因模型 | 平台目前主要覆盖七个Oryzias物种，数据范围可能有限，且依赖于NBRP团队生成的部分原始数据 | 为青鳉鱼生物学研究提供一个统一的基因组资源平台，整合和分析多物种的组学数据 | 青鳉鱼（Oryzias latipes）及其他六个Oryzias物种的基因组数据 | 基因组学 | NA | 基因组测序、转录组分析、单细胞转录组分析 | NA | 基因组序列、转录组数据、基因组变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2025-12-04 |
β-catenin initiates peritoneal fibrosis by triggering mitochondrial fission-mediated mesothelial cell senescence fate transition
2025-Dec-01, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00669-1
PMID:41320784
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研究论文 | 本研究揭示了β-catenin通过触发线粒体分裂介导的间皮细胞衰老命运转变，从而启动腹膜纤维化的机制 | 首次在单细胞水平上明确了长期腹膜透析患者中间皮细胞向衰老命运的转变，并阐明了β-catenin-Drp1-线粒体分裂-TGF-β1信号轴在驱动这一过程及后续纤维化中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，其结论在人体中的普适性及长期疗效仍需进一步临床验证 | 探究腹膜纤维化的起始机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 腹膜间皮细胞、来自腹膜透析患者的透析液流出物和腹膜活检标本、PDF诱导的小鼠模型、原代培养的间皮细胞 | 单细胞组学与分子病理学 | 终末期肾病相关的腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序，转录组测序，免疫荧光，Western blotting | NA | 单细胞RNA测序数据，转录组数据，蛋白质印迹数据，免疫荧光图像 | 包含腹膜透析患者临床队列、小鼠模型及原代细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 187 | 2025-12-04 |
Restoring macrophage iron homeostasis by natural carrier-free nanoplatform for the therapy of rheumatoid arthritis syndromes
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102544
PMID:41322152
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研究论文 | 本研究开发了一种无载体纳米药物RTNs，通过自组装天然产物RBA和TMP，用于恢复巨噬细胞铁稳态以治疗类风湿关节炎综合征 | 首次利用无载体自组装纳米平台结合天然产物，靶向巨噬细胞铁稳态治疗RA，并整合单细胞测序分析阐明机制 | 未明确提及样本量细节或长期毒性数据，且研究基于动物模型，临床转化潜力待验证 | 开发安全有效的策略治疗类风湿关节炎综合征，特别是针对铁过载引发的巨噬细胞极化问题 | 类风湿关节炎患者（通过佐剂诱导关节炎啮齿动物模型模拟） | NA | 类风湿关节炎 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2025-12-04 |
distQTL: distribution quantitative trait loci identification by population-scale single-cell data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf155
PMID:41323105
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为distQTL的方法，利用Fréchet回归和群体规模单细胞RNA测序数据来识别分布定量性状位点，以更精细地解析基因表达调控异质性 | 首次将Fréchet回归应用于单细胞eQTL分析，使用完整的经验分布作为响应对象，而非传统的均值等汇总统计量，从而能更全面地捕捉基因表达分布的遗传调控 | 方法依赖于大规模单细胞RNA测序数据，计算成本较高，且在当前研究中仅应用于外周血单个核细胞，尚未扩展到其他组织或细胞类型 | 开发一种新方法来识别影响基因表达分布的遗传变异，以克服传统批量eQTL方法在细胞异质性方面的局限 | 来自982名捐赠者的外周血单个核细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Fréchet回归 | 单细胞基因表达数据 | 982名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2025-12-04 |
A practical protocol of processing mineralized tissue for Visium spatial transcriptomics
2025-Dec, Mechanobiology in medicine
DOI:10.1016/j.mbm.2025.100163
PMID:41323651
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研究论文 | 本文提出了一种用于处理矿化组织以进行Visium空间转录组学分析的优化工作流程 | 使用Morse's溶液替代传统EDTA脱钙，实现快速脱钙（<24小时）同时保持RNA质量，并强调使用SCHOTT NEXTERION® Slide H（3-D水凝胶涂层）以增强脆弱脱钙骨切片的粘附性 | NA | 克服矿化组织空间转录组学分析中因脱钙过程导致的RNA完整性和基因检测问题 | 完整和骨折的小鼠股骨样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠股骨样本（具体数量未明确说明） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium V2和Visium HD |
| 190 | 2025-12-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune cell alterations in patients with allergic rhinitis treated with Peiyuan Tong-qiao decoction
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102325
PMID:41323806
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了培元通窍汤治疗过敏性鼻炎患者后免疫细胞的变化 | 首次在过敏性鼻炎治疗中应用单细胞RNA测序技术，系统揭示了中药治疗后免疫细胞亚群、细胞间通讯及转录调控网络的动态变化 | 样本量有限，未设置安慰剂对照组，缺乏长期疗效随访数据 | 探索培元通窍汤治疗过敏性鼻炎的作用机制 | 过敏性鼻炎患者治疗前后的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量，仅说明采集了治疗前后的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2025-12-04 |
A scheduler for rhythmic gene expression
2025-Dec, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00155-9
PMID:41073798
|
研究论文 | 本研究利用秀丽隐杆线虫蜕皮时钟作为模型，探讨了遗传振荡器如何调控数千个基因的有序表达 | 开发了基于200多个转录因子结合位点的线性模型来预测染色质动态，并识别出九个关键调控因子，这些因子通过叠加作用决定调控元件的峰值相位和振幅，同时还能通过相消干涉产生非节律性活性 | 研究基于特定模型生物（秀丽隐杆线虫），其发现在其他生物系统中的普适性仍需验证 | 探究遗传振荡器如何调控复杂基因表达模式的时序编排 | 秀丽隐杆线虫的蜕皮时钟及相关基因表达调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 时间分辨ATAC-seq | 线性模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-12-04 |
Cancer-associated fibroblasts: Recent advances and therapeutic implications
2025-Dec-01, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2025.102601
PMID:41330025
|
综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）的最新研究进展及其在肿瘤微环境中的关键作用，并探讨了针对CAFs的治疗策略 | 整合了单细胞测序和空间转录组学的最新发现，揭示了CAFs的功能异质性、空间组织、时间动态及免疫调节功能，并讨论了靶向CAF亚群的新兴治疗策略 | 作为一篇综述，未提供原始实验数据，且CAFs的复杂性和治疗靶向性仍需更多临床验证 | 总结CAFs的生物学特性及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用，探索靶向CAFs的治疗机会 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 193 | 2025-12-04 |
Digital twins for in vivo metabolic flux estimations in patients with brain cancer
2025-Dec-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.10.022
PMID:41330373
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研究论文 | 本文开发了两种基于机器学习的框架，用于在脑癌患者体内进行代谢通量估计，克服了组织取样、肿瘤微环境异质性和非稳态条件等挑战 | 提出了首个用于人类患者体内代谢通量估计的数字孪生框架和单细胞代谢通量分析框架，将第一性原理模拟与深度学习相结合，实现了从临床前模型到人类患者的转化 | 方法依赖于患者样本的可获得性和质量，且需要整合多种数据类型（如scRNA-seq和同位素示踪），可能限制其广泛临床应用 | 开发能够在人类脑癌患者体内进行代谢通量分析的计算框架，以促进代谢靶向治疗的发展 | 脑癌患者和脑癌小鼠模型中的肿瘤细胞与非恶性细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、C-同位素示踪、代谢通量分析 | 卷积神经网络（CNN） | 单细胞RNA测序数据、同位素示踪数据、模拟数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2025-12-04 |
CellUntangler: Separating distinct biological signals in single-cell data with deep generative models
2025-Dec-01, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101073
PMID:41330382
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CellUntangler的深度生成模型，用于从单细胞RNA测序数据中分离不同的生物信号 | 提出了一种新的深度生成模型，将细胞嵌入到由多个子空间组成的潜在空间中，每个子空间采用适当的几何结构来捕获不同的生物信号，从而能够同时解耦多种过程 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够从单细胞数据中分离不同生物信号的方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2025-12-04 |
A genome-scale single-cell CRISPRi map of trans gene regulation across human pluripotent stem cell lines
2025-Dec-01, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101076
PMID:41330380
|
研究论文 | 本研究构建了一个跨人类多能干细胞系的基因组规模CRISPR干扰扰动图谱，结合单细胞RNA测序，以探索基因调控的遗传背景依赖性 | 首次在人类多能细胞中实现了跨多个遗传背景的基因组规模CRISPR干扰扰动图谱，结合单细胞RNA测序，揭示了扰动效应的遗传变异 | NA | 理解人类基因组调控，解析疾病相关突变或基因表达变化的基础 | 人类多能干细胞系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR干扰 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 196 | 2025-12-04 |
Integrating Multiple Clustering Techniques and Performance Measures via Ranking for scRNA-Seq Data
2025-Dec, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.70331
PMID:41330405
|
研究论文 | 本文提出了一种通过整合多种聚类技术和性能度量来评估和排名单细胞RNA-seq数据聚类方法的新方法 | 将微阵列数据时代的稳定性度量适应于单细胞数据，并结合多种现有度量来评估聚类技术在不同参数选择下的特性，通过聚合方法对所有度量进行排名 | 研究仅基于五个已知分组和一个未知分组的数据集进行验证，可能未覆盖所有单细胞数据场景 | 评估和排名单细胞RNA-seq数据的聚类技术，以提高聚类结果的可靠性和准确性 | 单细胞基因表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 聚类技术 | 基因表达数据 | 六个数据集（五个已知分组，一个未知分组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-12-04 |
Association of Neuronal Autoantibodies with Overall Survival in Patients with Gastric Cancer
2025-Dec-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0495
PMID:41332104
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研究论文 | 本研究在无副肿瘤性神经系统综合征的胃癌患者中检测神经元自身抗体，并阐明其与临床预后及肿瘤微环境免疫抑制特征的关联 | 首次在无副肿瘤性神经系统综合征的胃癌患者群体中系统检测神经元自身抗体，并发现其阳性与患者总生存期缩短及肿瘤组织CD8+ T细胞浸润减少相关 | 单中心队列研究，样本量有限；单细胞测序仅在有限肿瘤样本中进行；需要进一步机制研究验证 | 探究胃癌患者中神经元自身抗体的存在及其与临床预后和肿瘤微环境免疫状态的关系 | 胃癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 基于小鼠脑组织的免疫荧光检测、基于细胞的检测法、单细胞测序 | NA | 血清样本、肿瘤组织、单细胞测序数据 | 323例胃癌患者（TBA阳性144例，TBA阴性179例） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 198 | 2025-12-04 |
Characterize Oral-to-Blood Microbial DNA Translocation in Individuals with Cocaine Use Disorder
2025-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.686400
PMID:41280052
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研究论文 | 本研究首次证明通过吸烟或鼻吸方式摄入可卡因的个体，其口腔微生物群失调，并存在选择性的口腔至血液微生物易位 | 首次在人体中证实可卡因使用障碍（COC）个体存在口腔微生物群失调及选择性的口腔至血液微生物易位，并揭示了其与先天免疫激活的关联 | 样本量较小（10名COC患者，24名对照），为横断面研究，无法确定因果关系 | 探究可卡因使用障碍个体口腔是否为循环微生物DNA易位的来源，及其对免疫系统的影响 | 当前患有可卡因使用障碍的个体（通过吸烟或电子烟方式摄入）及人口统计学匹配的非药物使用对照者 | 微生物组学，免疫学 | 物质使用障碍（可卡因使用障碍） | 微生物16S rRNA V4区测序，单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | DNA序列数据，单细胞基因表达数据 | 34名参与者（10名可卡因使用障碍患者，24名对照） | NA | 16S rRNA基因测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2025-12-04 |
Single-cell multiomics reveals macrophage-derived IL-23 and CXCL9/10 drive pathogenic IFNG+IL17+ T cells in immunotherapy-related colitis
2025-Nov-29, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011959
PMID:41320225
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了巨噬细胞来源的IL-23和CXCL9/10驱动IFNG+IL17+ T细胞在免疫治疗相关结肠炎中的致病作用 | 首次在免疫治疗相关结肠炎中鉴定出具有双重Th1/Th17特征的致病性IFNG+IL17+CD4+ T细胞亚群，并阐明其由组织驻留记忆T细胞分化而来，同时揭示了巨噬细胞通过IL-23和CXCL9/10信号通路驱动该过程的机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要更大规模的人类队列验证；机制研究虽深入但部分信号通路的具体调控细节仍需进一步探索 | 阐明免疫检查点阻断治疗相关结肠炎的免疫病理机制，并寻找不影响抗肿瘤疗效的治疗靶点 | 免疫治疗相关结肠炎患者和小鼠模型中的免疫细胞，特别是IFNG+IL17+CD4+ T细胞和肠道巨噬细胞 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学, 流式细胞术, qPCR, 体内中和抗体阻断, 巨噬细胞耗竭 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, T细胞受体序列数据, 流式细胞术数据, qPCR数据 | 人类irColitis病变样本和小鼠模型样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 200 | 2025-12-04 |
Neutrophil extracellular traps-STC1 positive feedback loop promotes immune evasion and metastasis in bladder cancer
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012736
PMID:41314976
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研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌中中性粒细胞胞外陷阱（NETs）与抗吞噬检查点STC1之间的正反馈环路在促进免疫逃逸和转移中的关键作用 | 首次发现NETs通过TLR2-MAPK-FosL1轴上调STC1，形成NETs-STC1自增强反馈环路，并阐明STC1通过隔离钙网蛋白抑制抗原呈递及分泌形式增强NET形成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床验证仍需进一步开展；反馈环路在其他癌症类型中的普适性未明确 | 探究膀胱癌免疫治疗耐药机制及NETs在其中的作用 | 膀胱癌患者临床队列、小鼠肺转移模型、肿瘤细胞与中性粒细胞共培养体系 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 免疫荧光染色、扫描电镜、蛋白质组学、单细胞转录组学 | 小鼠肺转移模型 | 临床队列数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据、影像数据 | 多个接受免疫检查点抑制剂治疗的临床队列（具体样本量未明确） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |