单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32055 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-31 |
TBXAS1 deficiency causes autoinflammation responsive to IL-6 inhibitor
2025-Oct-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.09.014
PMID:41162285
|
研究论文 | 本研究揭示了TBXAS1缺陷通过花生四烯酸代谢异常导致自身炎症的新机制，并证实IL-6抑制剂治疗的有效性 | 首次发现TBXAS1缺陷通过PGE2-EP2/cAMP/CREB通路诱导IL-6表达引发自身炎症，并成功应用IL-6抑制剂治疗 | 研究仅纳入2例患者，样本量较小 | 探索TBXAS1缺陷引起自身炎症的分子机制并研究靶向治疗策略 | 2例TBXAS1缺陷患者及其外周血单个核细胞 | NA | Ghosal血骨发育不良 | 全外显子组测序, Sanger测序, qRT-PCR, Western blotting, 细胞因子珠阵列, ELISA, 质谱分析, 飞行时间流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质数据, 代谢物数据, 单细胞转录组数据 | 2例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-31 |
GZMK+CD8+ T cells target a specific acinar cell type in Sjögren's disease
2025-Oct-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.08.014
PMID:41162286
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了干燥综合征中特定腺泡细胞的选择性丢失和GZMK+CD8+ T细胞的致病机制 | 首次识别了PRR4⁺CST3⁺WFDC2⁻浆黏液腺泡细胞在干燥综合征中的选择性丢失，并发现GZMK⁺CD8⁺ T细胞通过亚溶细胞效应机制损害线粒体完整性和激活先天免疫信号 | 研究样本限于人类小唾液腺，需要进一步验证在其他组织和其他自身免疫疾病中的普适性 | 探索干燥综合征中不同细胞类型的复杂相互作用及其在疾病病理中的作用 | 人类小唾液腺组织、患者来源的原代上皮细胞和自体T细胞 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞转录组学、空间转录组学、空间免疫表型分析、体外细胞实验 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、空间定位数据 | 人类小唾液腺样本（包括干燥综合征患者和对照） | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-31 |
Multi-omics profiling uncovers paradoxical Epstein-Barr virus involvement in autoimmune liver disease pathogenesis
2025-Oct-27, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01975-6
PMID:41144108
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示EB病毒在自身免疫性肝病发病机制中的复杂作用 | 首次提供EB病毒与自身免疫性肝病关联的遗传学证据，发现EB病毒在疾病中可能扮演双重角色 | 基于观察性研究和数据库分析，因果关系仍需进一步验证 | 探究EB病毒与自身免疫性肝病之间的因果关系和分子机制 | 自身免疫性肝病患者群体和EB病毒相关抗体 | 生物信息学 | 自身免疫性肝病 | 双样本孟德尔随机化分析,GSMR,GWAS,转录组分析,单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞测序数据 | 基于FinnGen数据库的GWAS汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | NA |
| 184 | 2025-10-31 |
Deciphering splicing heterogeneity at single-cell resolution by SCSES
2025-Oct-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64517-5
PMID:41145486
|
研究论文 | 开发了一种名为SCSES的计算框架，用于在单细胞水平增强选择性剪接分析 | 通过数据扩散在相似细胞和事件间共享信息来推断和补全缺失的剪接变化 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序中准确表征剪接变化的挑战 | 单细胞剪接异质性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数据扩散算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2025-10-31 |
Hmox1 expression indicates distinct injury phenotypes of proximal tubule cells in sepsis-associated acute kidney injury
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05764-w
PMID:41145479
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，鉴定Hmox1作为脓毒症相关急性肾损伤中近端小管细胞损伤的特异性生物标志物 | 首次发现Hmox1高表达和低表达的近端小管细胞亚群在SAKI中表现出不同的表型特征 | NA | 识别SAKI诊断的特异性生物标志物并阐明其病理机制 | 肾组织中的近端小管细胞 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-31 |
SPP1+ macrophages promote colorectal cancer progression by activating JAK2/STAT3 signaling pathway
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21420-9
PMID:41145614
|
研究论文 | 本研究揭示SPP1+巨噬细胞通过激活JAK2/STAT3信号通路促进结直肠癌进展的机制 | 首次发现SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的极性改变通过JAK2/STAT3通路调控结直肠癌进展 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞极性改变对结直肠癌进展的影响及分子机制 | 结直肠癌细胞(MC38)和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 细胞共培养, CCK-8检测, TUNEL染色, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | 小鼠结直肠癌模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-31 |
Intratumoral plasma cells predict patient prognosis and responsiveness to neoadjuvant immunotherapy in advanced gastric cancer
2025-Oct-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01071-9
PMID:41145683
|
研究论文 | 本研究通过多中心数据整合分析，开发了基于肿瘤内浆细胞的MZB1阳性评分系统，用于预测晚期胃癌患者对免疫治疗的预后和反应性 | 首次发现成熟三级淋巴结构是胃癌浸润浆细胞中体细胞超突变和克隆选择的关键位点，并建立了基于浆细胞浸润程度的MZB1阳性评分系统 | 研究依赖于胃镜活检组织，存在组织样本大小的固有局限性 | 开发新的生物标志物来预测胃癌患者对免疫治疗的反应和预后 | 晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,转录组测序 | NA | 组织样本,转录组数据,空间转录组数据 | 来自七个独立医疗中心的胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2025-10-31 |
KIAA1429-mediated M6A methylation inhibits osteoclast differentiation via stabilizing Lrp4 mRNA and protects against osteoporosis
2025-Oct-27, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00800-z
PMID:41146006
|
研究论文 | 本研究探讨KIAA1429介导的m6A甲基化通过稳定Lrp4 mRNA抑制破骨细胞分化并预防骨质疏松的机制 | 首次揭示KIAA1429通过m6A-YTHDC1-LRP4-TNFAIP3轴抑制NF-κB信号通路的新机制 | 未明确说明样本规模及临床数据的具体来源 | 探究KIAA1429在骨质疏松及破骨细胞分化中的生物学功能及分子机制 | 骨质疏松患者临床样本、卵巢切除小鼠模型、破骨细胞 | 表观遗传学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, m6A甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2025-10-31 |
MX1 is a novel crucial prognostic and therapeutic target inducing chemoresistance in right-sided colon cancer: insights from machine learning-based multi-omics analysis
2025-Oct-27, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00840-8
PMID:41146251
|
研究论文 | 本研究通过机器学习驱动的多组学分析，发现MX1是右侧结肠癌中诱导化疗耐药的关键预后和治疗靶点 | 首次将MX1鉴定为右侧结肠癌中与化疗耐药和肿瘤微环境失调密切相关的关键靶点，并揭示了其通过VEGFA-VEGFR2通路促进血管生成的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要更多体内实验和临床前研究来确认MX1的治疗潜力 | 识别和表征与右侧结肠癌进展和治疗反应相关的关键生物标志物 | 右侧结肠癌患者和结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结肠癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)，机器学习算法，单细胞RNA测序，qRT-PCR，免疫组化染色，CCK-8检测，transwell迁移实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，临床样本数据 | TCGA数据集和四个GEO数据集中的右侧结肠癌样本，临床样本验证 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-31 |
Integrative metaprogram analysis reveals transcriptional dysregulation of oxidative stress response in granulosa cells from polycystic ovary syndrome
2025-Oct-27, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01811-2
PMID:41146316
|
研究论文 | 通过整合元程序分析揭示多囊卵巢综合征颗粒细胞中氧化应激反应的转录失调 | 开发整合单细胞和批量RNA测序的元程序分析框架，首次在PCOS颗粒细胞中鉴定出10个转录元程序并发现GPX3作为连接氧化应激与代谢功能障碍的关键调控基因 | 研究依赖于公共数据集和实验室生成数据，需要进一步实验验证GPX3的功能机制 | 探究多囊卵巢综合征的分子机制，特别关注氧化应激相关通路 | 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,微阵列 | 非负矩阵分解,加权基因共表达网络分析 | RNA测序数据,微阵列数据 | 包含GSE240688单细胞数据集、实验室批量RNA-seq数据集和GSE34526验证微阵列数据集，以及193个GTEx卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,微阵列 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-31 |
scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations
2025-Oct-27, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.056
PMID:41161490
|
研究论文 | 提出一种基于视觉迁移学习和表格到图像转换的标记基因细胞类型注释方法scMapNet | 结合掩码自编码器和视觉变换器，通过树状图转换利用细胞标记基因信息，并在大量未标记数据上进行预训练 | 未明确说明方法在特定细胞类型或组织中的局限性 | 开发能够充分学习细胞标记基因知识和未标记数据信息的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 掩码自编码器, 视觉变换器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-10-31 |
CAT1 modulates hepatic fibrosis via IL-6-mediated inflammatory and fibrogenic pathways in hepatic stellate cells
2025-Oct-27, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120075
PMID:41161609
|
研究论文 | 本研究探讨了阳离子氨基酸转运体1（CAT1）通过调控IL-6介导的炎症和纤维化通路在肝纤维化中的作用机制 | 首次揭示CAT1通过IL-6/JAK2/STAT3信号通路调控肝星状细胞活化，并证实CAT1-IL-6轴在肝纤维化中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未进行临床验证 | 阐明CAT1在肝纤维化中的作用机制及其与IL-6通路的关系 | 肝星状细胞（HSCs）、CCl4诱导的肝纤维化模型和非酒精性脂肪肝病（NAFLD）模型 | 生物信息学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、功能实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-31 |
A synthetic circular RNA targeting miR-340-5p promotes optic nerve regeneration and retinal ganglion cell survival following axotomy
2025-Oct-24, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115527
PMID:41138896
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向miR-340-5p的合成环状RNA，能够促进视神经轴切后的神经再生和视网膜神经节细胞存活 | 首次通过计算模型筛选出调控多个再生相关基因的关键miRNA，并设计环状RNA海绵特异性靶向miR-340-5p，同时激活促再生和促存活信号通路 | Circ-340-5p对神经元存活的促进作用在轴切后六周未能持续维持 | 探索通过调控miRNA促进中枢神经系统轴突再生的新策略 | 小鼠背根神经节神经元和视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，计算建模，体外神经突生长实验 | 计算模型 | 基因表达数据 | C57BL/6雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-31 |
Integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals neutrophil diversity and spatial heterogeneity in acute kidney injury
2025-Oct-22, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148478
PMID:41135905
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了急性肾损伤中中性粒细胞的多样性和空间异质性 | 首次在AKI中鉴定出9个中性粒细胞亚群，其中6个为AKI中首次发现，3个为文献中全新亚群；发现了以中性粒细胞为中心的新型微环境单元 | NA | 探索急性肾损伤中中性粒细胞的多样性和空间异质性 | 急性肾损伤中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 预后风险模型 | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-31 |
Identification and Validation of Iron Metabolism-Related Biomarkers in Endometriosis: A Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics Study
2025-Oct-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47100831
PMID:41150779
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞转录组学识别并验证子宫内膜异位症中铁代谢相关生物标志物 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学方法系统研究铁代谢相关基因在子宫内膜异位症中的作用机制 | 研究样本量有限，主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索铁代谢相关基因在子宫内膜异位症中的生物标志物价值 | 子宫内膜异位症患者样本 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个GSE数据集(GSE86534, GSE105764, GSE213216) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-31 |
Single-cell analysis of differential fat deposition in chicken pectoral muscle and abdominal fat tissues
2025-Oct-02, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105938
PMID:41108936
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析固始鸡胸肌和腹部脂肪组织的差异脂肪沉积特征 | 首次在固始鸡中应用单细胞RNA测序技术比较不同脂肪组织的细胞类型和分子特征，发现G0S2基因在腹部脂肪细胞中的特异性功能 | 仅分析了2周龄鸡的组织样本，缺乏其他发育阶段的单细胞数据 | 阐明家禽脂肪沉积的组织特异性机制 | 固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | 单细胞组学 | 肥胖相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2至22周龄固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-10-31 |
Acellular Tissue Engineered Vessels as Coronary Artery Bypass Grafts
2025-Oct, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2025.101379
PMID:40939573
|
研究论文 | 评估小直径无细胞组织工程血管在灵长类动物模型中作为冠状动脉搭桥移植物的可行性和耐久性 | 首次在灵长类动物模型中验证小直径无细胞组织工程血管作为冠状动脉搭桥移植物的长期性能，并发现宿主细胞从旁路冠状动脉向内生长可调节移植物直径 | 研究样本量较小（n=5），仅观察了6个月的短期效果 | 开发冠状动脉搭桥手术的替代血管移植物 | 成年狒狒的右冠状动脉 | 组织工程 | 心血管疾病 | 空间转录组学，组织学分析 | NA | 医学影像数据，基因表达数据，组织学数据 | 5只成年狒狒 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-31 |
Harnessing scRNA-seq and bulk RNA-seq to identify CD39+ T cell genes for rheumatoid arthritis diagnosis and therapy
2025-Oct-01, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf130
PMID:40974094
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，识别CD39+ T细胞相关基因作为类风湿关节炎诊断和治疗的生物标志物 | 首次结合scRNA-seq和bulk RNA-seq分析CD39+ T细胞基因特征，发现PELI1等关键基因的诊断价值并构建lncRNA-miRNA-PELI1调控网络 | 未明确说明样本来源和具体样本量，需要进一步实验验证PELI1的生物学功能 | 识别类风湿关节炎诊断和治疗生物标志物 | CD39+ T细胞及其相关基因 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2025-10-31 |
AURKA Enhances Antitumor Immunity by Activating CD4+ T Cell Proliferation in Colorectal Cancer
2025-Oct, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2025.2559403
PMID:40995659
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示AURKA在结直肠癌中通过激活CD4+ T细胞增殖增强抗肿瘤免疫的双重功能 | 首次整合空间转录组学发现AURKA在肿瘤周围T细胞富集区与免疫激活标志物共表达，并证实其可作为免疫治疗生物标志物 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证AURKA的预后和预测价值 | 阐明AURKA在结直肠癌肿瘤增殖和免疫微环境调控中的双重作用机制 | 结直肠癌患者样本和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, CIBERSORT, ssGSEA, IHC, HE染色 | 小鼠模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床病理数据 | 未明确具体样本数量，包含临床队列和小鼠模型 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 200 | 2025-10-31 |
Targeting Intratumoral Copper Inhibits Tumor Progression via p62-Mediated EZH2 Degradation and Potentiates Anti-PD-1 Immunotherapy in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417795
PMID:40719074
|
研究论文 | 本研究揭示了铜在口腔鳞状细胞癌中的关键作用机制，发现通过靶向铜离子可促进EZH2降解并增强抗PD-1免疫治疗效果 | 首次发现铜通过SMURF2调控EZH2蛋白稳定性，并证实铜螯合剂与抗PD-1联合治疗的协同作用 | 研究主要聚焦于OSCC，其他癌症类型的适用性需进一步验证 | 探究铜在口腔鳞状细胞癌进展中的作用机制及治疗潜力 | 口腔鳞状细胞癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫组化染色，siRNA，蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，组织染色图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |