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当前共找到 39345 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-05-10 |
Hypoxia Affects Stem Cell Fate in Patient-Derived Ileum Enteroids in a HIF-1α-Dependent Manner
2025-Dec-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15010031
PMID:41511315
|
研究论文 | 本研究探讨缺氧如何通过HIF-1α依赖性方式影响患者来源回肠类器官中干细胞命运 | 首次证明生理性缺氧通过HIF-1α稳定化直接调控肠道上皮干细胞命运，揭示氧梯度在隐窝-绒毛轴中维持肠道稳态的机制 | 未明确说明，但可能包括类器官模型与体内环境的差异及样本量限制 | 研究氧气可用性如何影响肠道干细胞增殖和分化 | 患者来源的人回肠类器官（肠类器官） | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 患者来源的人回肠类器官（具体数量未提及） | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 批量RNA测序和单细胞RNA测序于Illumina NovaSeq平台 |
| 182 | 2026-05-10 |
Accurate imputation of pathway-specific gene expression in spatial transcriptomics with PASTA
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67421-0
PMID:41397970
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研究论文 | 提出一种名为PASTA的空间通路基因表达插补方法，利用细胞类型和空间邻近性提高预测准确性 | 创新性地将通路信息整合到空间转录组基因表达插补过程中，利用邻近细胞及同类型细胞的相似表达模式提高预测鲁棒性和生物学相关性 | 标题和摘要未明确提及方法的局限性 | 准确预测空间转录组中未测量的基因表达，特别是在通路水平上实现稳定且具有生物学意义的插补 | 空间转录组数据中未测量的基因表达 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | PASTA（通路导向空间基因插补模型） | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 183 | 2026-05-10 |
Differential Localization of β-Catenin Protein in CTNNB1 Mutant Endometrial Cancers Results in Distinct Transcriptional Profiles
2025-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100791
PMID:40348058
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研究论文 | CTNNB1突变型子宫内膜癌中β-catenin蛋白差异定位导致不同的转录谱 | 首次揭示突变型β-catenin蛋白在子宫内膜癌中的不同亚细胞定位（细胞核 vs 膜/细胞质）与独特转录谱的关联，并发现TROP2作为潜在治疗靶点 | 未提及 | 研究具有CTNNB1外显子3突变的子宫内膜样子宫内膜癌中，β-catenin蛋白核定位与非核定位对下游基因表达的影响 | CTNNB1突变型子宫内膜样子宫内膜癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | NA | 基于蛋白定位选择感兴趣区域（ROIs）进行空间转录组分析 |
| 184 | 2026-05-10 |
A STAT3/integrin axis accelerates pancreatic cancer initiation and progression
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116010
PMID:40701148
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研究论文 | 本文发现STAT3/整合素轴通过调控ITGB3表达加速胰腺癌的起始与进展，并揭示其表观遗传调控机制 | 首次发现STAT3通过结合ITGB3增强子区域调控其表达，建立18基因预后特征，为胰腺癌分层治疗提供新靶点 | 未在临床样本中验证18基因特征的实际应用，缺乏体内动物模型对机制的直接验证 | 阐明STAT3通路在胰腺导管腺癌进展中的下游调控机制及临床意义 | 缺氧或制瘤素M处理的胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | ChIP-seq, 单细胞转录组学 | NA | 测序数据 | 未指定样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台进行单细胞转录组分析 |
| 185 | 2026-05-10 |
A Spatially Coordinated Keratinocyte-Fibroblast Circuit Recruits MMP9+ Myeloid Cells to Drive IFN-I-Driven Inflammation in Photosensitive Autoimmunity
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.19.670635
PMID:40894544
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学等方法，揭示紫外线B通过角化细胞-成纤维细胞-髓系细胞环路驱动光敏感性自身免疫的机制 | 首次发现MMP9+ CD14+髓系细胞是光敏感性的关键效应细胞，并描述了角化细胞-成纤维细胞-髓系细胞多细胞炎症级联环路 | 研究主要基于人类体外模型和临床样本，可能未完全复制体内微环境的复杂性 | 阐明紫外线B暴露如何触发皮肤特异性自身免疫的分子机制 | 皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者皮肤组织及健康对照皮肤 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮, 皮肌炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 (seqFISH+), 紫外线B激发, 体外模型 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 涉及皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者皮损及非皮损皮肤样本，健康对照皮肤样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | seqFISH+ | NA |
| 186 | 2026-05-10 |
High KYNU Expression Is Associated with Poor Prognosis, KEAP1/STK11 Mutations, and Immunosuppressive Metabolism in Patient-Derived but Not Murine Lung Adenocarcinomas
2025-May-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17101681
PMID:40427178
|
研究论文 | 本研究发现了肺腺癌中KYNU基因的双峰表达与患者预后不良相关，并揭示了其与KEAP1/STK11突变及免疫抑制代谢的关系 | 首次揭示KYNU在肺腺癌患者来源肿瘤中与KEAP1/STK11共突变相关且具有免疫抑制代谢表型，而在小鼠模型中表达模式与人类不一致，凸显了物种差异 | 小鼠肺腺癌模型无法忠实再现人类KYNU的表达模式，给临床前模型研究带来挑战 | 发现肺腺癌中与预后相关的双峰表达基因，揭示其潜在致癌基因型及新的治疗见解 | 肺腺癌患者肿瘤样本及其对应的免疫微环境、代谢状态和小鼠模型 | 机器学习 | 肺腺癌, 胰腺癌, 肾癌, 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | 聚类模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | 多个肺腺癌数据集，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 187 | 2026-05-10 |
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025337
PMID:39977705
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术在慢性移植物抗宿主病中定义致病性IL-17和CSF-1基因表达特征 | 利用信息丰富的临床前慢性移植物抗宿主病模型，通过单细胞测序“逆向工程”定义小鼠血液中可随时间变化的IL-17和CSF-1特征，用于评估患者 | 靶向治疗仅对部分患者有效，且费用高昂、美国以外地区难以获取，目前依赖试错法使用 | 定义致病性IL-17和CSF-1基因表达特征，以促进选择合适治疗和识别高危个体进行预防性治疗 | 慢性移植物抗宿主病（cGVHD）患者和临床前模型小鼠 | 机器学习 | 慢性移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 70%的cGVHD诊断患者和一半移植后100天发展为cGVHD的患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序系统 |
| 188 | 2026-05-10 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals efferocytosis signature predicting immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2025-05, Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.dld.2025.01.196
PMID:39904693
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析开发了与胞葬作用相关的基因签名（ER.Sig），用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次结合单细胞和bulk转录组数据，利用十种机器学习算法构建胞葬作用相关基因签名，并多组学验证其在预测免疫治疗反应中的价值 | 数据来源于公共数据库，缺乏独立的外部验证队列；研究仅基于转录组水平，未进行功能实验验证 | 开发胞葬作用相关基因签名以预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者 | 机器学习和数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和bulk RNA测序 | 随机生存森林模型（与其他九种算法比较后选择） | 转录组数据（单细胞和bulk层面） | 多个公共数据集，包括肝细胞癌患者样本和IMvigor210免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2026-05-10 |
Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis
2025-Mar, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748
PMID:39921941
|
研究论文 | 通过先进的单细胞转录组学分析，识别囊性纤维化中的新型治疗靶点 | 发现了先前未与囊性纤维化气道疾病相关的新基因和调控网络，揭示了潜在的治疗靶点 | 未明确说明局限性 | 深入理解囊性纤维化相关的基因表达，识别新的治疗靶点 | 囊性纤维化患者和健康对照的肺部细胞 | NA | 囊性纤维化 | 先进单细胞转录组学技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2026-05-10 |
B-cell interleukin 1 receptor 1 modulates the female adipose tissue immune microenvironment during aging
2025-Feb-13, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae219
PMID:39378334
|
研究论文 | 该论文研究了B细胞白细胞介素1受体1（Il1r1）在衰老过程中调节雌性脂肪组织免疫微环境的作用 | 首次通过B细胞特异性敲除Il1r1小鼠模型，揭示了IL-1β-B细胞信号在衰老脂肪组织炎症反应中的性别特异性作用 | 研究仅关注了小鼠模型，未在人类样本中验证；且主要分析了雌性脂肪组织，对雄性机制探讨不足 | 探究IL-1β信号如何通过B细胞影响衰老相关脂肪组织炎症和代谢功能 | 小鼠内脏白色脂肪组织（vWAT）中的免疫细胞 | 免疫学 | 衰老相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | B细胞特异性Ilr1敲除小鼠（BKO）及对照小鼠的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2026-05-10 |
Intervention of Tanshinone IIA on the PGK1-PDHK1 Pathway to Reprogram Macrophage Phenotype After Myocardial Infarction
2024-12, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07520-6
PMID:37991600
|
研究论文 | 探讨丹参酮IIA通过PGK1-PDHK1通路调控心肌梗死后巨噬细胞能量代谢及表型转化的作用机制 | 首次揭示丹参酮IIA通过PGK1-PDHK1信号通路调控巨噬细胞能量代谢模式，进而影响其表型极化，为心肌梗死治疗提供新靶点 | 未明确丹参酮IIA对PGK1的直接结合方式及临床转化效果 | 研究丹参酮IIA是否通过调控巨噬细胞能量代谢影响其表型变化，并探索其在心肌梗死治疗中的潜力 | 心肌梗死模型小鼠及巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、RNA-seq、RT-PCR、ELISA、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像 | 未明确样本数量，涉及小鼠心肌梗死模型及巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2026-05-10 |
Integrative Multiomics in the Lung Reveals a Protective Role of Asporin in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-Oct-15, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 利用多组学整合分析揭示肺组织中Asorin在肺动脉高压中的保护作用 | 首次通过最大规模的PAH肺组织生物库多中心数据整合，结合转录组、基因组、单细胞和药理学分析，发现ASPN基因在PAH中的保护性角色并验证其治疗潜力 | 未明确提及限制，但可能涉及样本量虽大但仍有限，后续需进一步动物和人体验证 | 通过多组学整合阐明肺动脉高压（PAH）的病理机制，并识别潜在保护性靶点 | 人类PAH肺组织样本（96例患者和52例对照）及Sugen-缺氧大鼠模型 | 机器学习 | 肺动脉高压 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析, 贝叶斯调控网络, 药物转录组学 | 贝叶斯调控网络 | 基因表达数据, 基因组数据, 单细胞数据, 临床表型数据 | 96例PAH肺组织样本和52例对照肺组织样本 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 193 | 2026-05-10 |
Muscle-resident mesenchymal progenitors sense and repair peripheral nerve injury via the GDNF-BDNF axis
2024-Sep-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97662
PMID:39324575
|
研究论文 | 发现肌肉驻留间充质祖细胞（FAPs）通过GDNF-BDNF轴感知并修复周围神经损伤 | 首次揭示FAPs在周围神经再生中的先前未被认识的作用，以及其通过GDNF-BDNF轴响应损伤的分子机制 | 未提及明显局限性 | 研究FAPs如何感知解剖上遥远的周围神经损伤及其对神经再生的直接贡献 | 肌肉驻留间充质祖细胞（FAPs）和周围神经损伤 | NA | 周围神经损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（包括年轻和年老小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2026-05-10 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
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研究论文 | 提出结合细胞形态与空间转录组学的肿瘤生态系统深度分析框架METI | 首次将组织学特征（细胞形态）与空间转录组数据整合，无需配对scRNA-seq数据即可分析肿瘤微环境 | 未提及跨平台兼容性和大规模验证中的计算开销 | 开发无需单细胞测序数据即可分析肿瘤微环境的端到端集成工具 | 胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前病变组织样本 | 数字病理学， 计算机视觉， 机器学习 | 胃癌， 肺癌， 膀胱癌 | 空间转录组测序 | NA | 图像数据， 空间转录组数据 | 多种肿瘤组织（胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前病变） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 195 | 2026-05-10 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 研究组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其通过调控巨噬细胞极化抑制牙槽骨丢失的机制 | 首次探讨JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调控作用及其对牙槽骨丢失的保护机制 | 研究结果主要基于小鼠模型和体外细胞实验，缺乏人体体内直接验证；且样本量较小 | 探究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调控牙周炎的潜在机制 | 人牙龈组织样本（健康与炎症各9例）、小鼠牙周炎模型、巨噬细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞测序、RT-qPCR、免疫组化、Western blotting、免疫荧光染色、siRNA转染 | NA | 基因表达数据、组织样本数据 | 9例健康牙龈组织、9例炎症牙龈组织；小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 196 | 2026-05-10 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析人牙槽骨炎症微环境中肉芽组织的细胞组成和异质性，构建单细胞转录组图谱以阐明其自然转归的潜在结局 | 首次通过单细胞RNA测序构建了人牙槽骨不同类型肉芽组织的单细胞图谱，揭示了炎症肉芽组织在自然消退后与修复性肉芽组织在细胞组成和基因表达上的相似性，并鉴定了与炎症调控和血管生成相关的关键基因（如Igbp5、Zfp36、Timp3等） | 未提供明确的局限性描述 | 探究人牙槽窝肉芽组织的细胞组成和异质性，构建单细胞转录组图谱，以揭示炎症微环境中肉芽组织自然转归的潜在结局 | 人牙槽窝肉芽组织样本（来自牙周炎拔牙后行延迟位点保存或自体牙移植的12名患者） | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、HE染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 12个牙槽窝肉芽组织样本，共捕获20,448个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2026-05-10 |
GZMK+CD8+ T cells Target A Specific Acinar Cell Type in Sjögren's Disease
2024-Jul-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3601404/v2
PMID:38196575
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research paper | 利用单细胞和空间转录组学技术，构建了健康与干燥综合征（SjD）患者唾液腺的细胞图谱，发现GZMK+CD8+ T细胞靶向特定的浆液黏液腺泡细胞亚群，揭示了SjD的病理机制 | 首次鉴定出新的浆液黏液腺泡细胞类型，并发现GZMK+CD8+ T细胞在SjD中特异性靶向该细胞群体，展示了免疫反应对高分泌腺泡细胞的影响 | NA | 阐明Sjögren病中免疫反应对唾液腺细胞类型的影响及具体细胞亚群的病理学作用 | 人类小唾液腺组织中的细胞类型，包括腺泡细胞和免疫细胞 | machine learning, digital pathology | Sjögren病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类小唾液腺组织样本（健康与SjD患者） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 198 | 2026-05-10 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-04, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 本文提出一个多物种、多组学的元分析框架，以促进心血管再生靶点的发现 | 提出基于单细胞RNA测序技术的多物种、多组学元分析框架，整合跨物种、跨发育阶段的心脏健康与损伤研究数据，驱动心血管再生新靶点的发现 | NA | 提出策略性框架以识别促进心血管再生的新靶点 | 健康与受伤心脏的多物种研究，涵盖不同发育阶段 | 机器学习和生物信息学 | 缺血性心脏病 | 单细胞RNA测序 | 元分析框架 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2024-08-08 |
Using advanced spatial and single-cell transcriptomics to characterize the human endometrium
2021-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00982-0
PMID:34857955
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2026-05-09 |
Immune gene MMP9 as a potential key mediator in TCDD exposure-associated atherosclerosis: An integrated study based on network toxicology and experimental validation
2026-Jul, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116073
PMID:41895505
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学和实验验证，发现免疫基因MMP9是TCDD暴露相关动脉粥样硬化的关键介质 | 首次通过系统生物信息学分析与实验结合，揭示MMP9作为TCDD暴露诱导动脉粥样硬化的核心免疫基因及其调控通路 | 主要依赖公开数据库和计算机模拟，体外模型仅涉及HUVEC细胞，缺乏体内动物模型验证 | 探索TCDD暴露与动脉粥样硬化之间的潜在分子机制，为环境相关动脉粥样硬化的风险评估、早期诊断和靶向干预提供新见解和候选靶点 | TCDD暴露相关动脉粥样硬化 | 网络毒理学 | 心血管疾病 | 网络毒理学, RT-qPCR, Western blot, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习, SHAP, WGCNA, 伪时间分析 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |