单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
181	2025-09-11	A pheromone receptor in cichlid fish mediates attraction to females but inhibits male parental care 2024-Sep-09, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2024.07.029 PMID:39094572	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和CRISPR基因编辑技术，揭示了慈鲷鱼中信息素受体Or113a在介导雄性对雌性吸引行为及抑制雄性亲代抚育中的双重作用	发现信息素受体Or113a能够感知非PGF配体，并首次证明单个信息素受体在行为调控中获得新功能，驱动雄性避免亲代抚育	研究聚焦于特定慈鲷鱼谱系，结论在其他鱼类中的普适性尚未验证	探究脊椎动物信息素信号演化如何导致新生殖行为策略的产生	慈鲷鱼（特别是雌性繁殖信号感知及雄性行为调控）	NA	NA	单细胞转录组学, CRISPR基因编辑	NA	基因表达数据, 行为观测数据	NA（未明确说明样本数量，但使用慈鲷鱼模型进行研究）
182	2025-09-11	Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of dendritic-like "hybrid" neutrophils from skull bone marrow 2024-Sep-09, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.008 PMID:39255776	研究论文	本文揭示了胶质母细胞瘤通过招募和分化颅骨骨髓中的树突状“杂交”中性粒细胞来抑制肿瘤生长的机制	首次发现具有树突状特征的中性粒细胞亚群来源于颅骨骨髓而非循环系统，并证实其通过抗原呈递激活T细胞抗肿瘤免疫	NA	探究肿瘤相关中性粒细胞在胶质母细胞瘤中的生物学作用及来源机制	胶质母细胞瘤患者和小鼠模型中的中性粒细胞	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	scRNA-seq（单细胞RNA测序）、标记颅骨移植、靶向消融	NA	基因表达数据、细胞功能实验数据	患者和小鼠胶质母细胞瘤样本（具体数量未明确说明）
183	2025-09-11	Translatome profiling reveals Itih4 as a novel smooth muscle cell-specific gene in atherosclerosis 2024-07-02, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae028 PMID:38289873	研究论文	本研究利用翻译核糖体亲和纯化测序技术鉴定动脉粥样硬化中平滑肌细胞特异性基因表达，发现Itih4作为新型标志基因	首次建立SMC特异性TRAP小鼠模型（SMCTRAP-AS），并发现Itih4等多个既往未报道与动脉粥样硬化SMCs相关的基因	研究基于转基因小鼠模型，结果向人类临床转化的适用性需进一步验证	解析动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的基因表达特征	SMCTRAP和SMCTRAP-AS转基因小鼠的胸主动脉样本	分子生物学	心血管疾病	TRAP-seq（翻译核糖体亲和纯化测序）、免疫荧光染色、空间转录组学	NA	测序数据、图像数据	15月龄SMCTRAP和SMCTRAP-AS小鼠的主动脉样本
184	2025-09-11	Serine protease inhibitor, SerpinA3n, regulates cardiac remodelling after myocardial infarction 2024-07-02, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae075 PMID:38666458	研究论文	本研究探讨丝氨酸蛋白酶抑制剂SerpinA3n在心肌梗死后心脏重塑中的调控作用	首次揭示SerpinA3n通过调节基质功能和炎症反应影响心肌梗死后心脏修复的因果机制	研究基于小鼠模型，人类临床适用性需进一步验证	理解Serpins在心肌梗死后瘢痕形成调控中的作用	心肌梗死小鼠模型	心血管疾病研究	心血管疾病	条件性基因敲除、单细胞转录组学、蛋白质组学、组织学分析	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据、组织图像数据	使用SerpinA3n条件性敲除小鼠模型进行研究
185	2025-09-11	Small nucleolar RNA host gene 18 controls vascular smooth muscle cell contractile phenotype and neointimal hyperplasia 2024-05-29, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae055 PMID:38498586	研究论文	本研究揭示长链非编码RNA SNHG18通过调控miR-22-3p维持血管平滑肌细胞收缩表型并抑制损伤诱导的新内膜增生	首次发现SNHG18在血管疾病中的功能作用，并阐明其通过竞争性结合ADAR2调控miR-22生物合成的新机制	NA	探索SNHG18在血管平滑肌细胞表型调控和血管损伤修复中的作用	小鼠和人类血管平滑肌细胞及动脉组织	分子生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序、转录组分析、功能获得/缺失实验	NA	RNA测序数据、基因表达数据	小鼠和人类动脉样本（具体数量未明确说明）
186	2025-09-11	Interleukin-1 receptor accessory protein blockade limits the development of atherosclerosis and reduces plaque inflammation 2024-05-07, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae046 PMID:38563353	研究论文	研究使用新型抗IL1RAP阻断抗体探究其在动脉粥样硬化中的作用，发现阻断IL1RAP可减小斑块大小并减轻炎症	首次使用非消耗性IL1RAP阻断抗体，并揭示其通过抑制趋化因子产生减少斑块炎症和负担的机制	研究基于小鼠模型，人类应用需进一步验证；样本量未明确说明	探究IL1RAP在动脉粥样硬化发展中的作用及治疗潜力	载脂蛋白E缺陷小鼠（Apoe-/-）和人类动脉粥样硬化斑块样本	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学分析、体外细胞实验	NA	基因表达数据、细胞表型数据、组织图像数据	NA（具体数量未在摘要中说明）
187	2025-09-11	Cardiac and perivascular myofibroblasts, matrifibrocytes, and immune fibrocytes in hypertension; commonalities and differences with other cardiovascular diseases 2024-05-07, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae044 PMID:38395029	综述	本文讨论了高血压中心脏和血管周围成纤维细胞亚群（包括肌成纤维细胞、基质纤维细胞和免疫纤维细胞）的更新定义、调控机制及其在心血管病理生理中的作用	强调了基质纤维细胞和免疫纤维细胞在心血管纤维化中的新作用，并整合了谱系追踪和单细胞RNA测序研究的新知识	分子机制导致成纤维细胞活化的具体途径仍大部分未知，且适应性与适应不良性纤维化的转化条件需进一步明确	探讨高血压及相关心血管疾病中成纤维细胞亚群的分类、调控机制及病理作用	心脏和血管周围的成纤维细胞亚群（肌成纤维细胞、基质纤维细胞、免疫纤维细胞）	心血管病理学	心血管疾病	谱系追踪，单细胞RNA测序	NA	NA	NA
188	2025-09-11	An update on periodontal inflammation and bone loss 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1385436 PMID:38919613	综述	本文更新了关于牙周炎症和骨丢失的最新研究进展，重点探讨了牙周病的免疫反应机制及其系统性影响	利用scRNA-seq和动物研究提供了对牙周病免疫反应的新见解，强调了菌群失调在疾病发生发展中的关键作用	NA	探讨牙周病的免疫机制及其与系统性疾病的关联，以开发新的治疗策略	牙周病及其相关的免疫细胞和口腔微生物组	NA	牙周病	scRNA-seq	NA	NA	NA
189	2025-09-11	Transcriptional changes in specific subsets of Drosophila neurons following inhibition of the serotonin transporter 2023-06-24, Translational psychiatry IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41398-023-02521-3 PMID:37355701	研究论文	研究果蝇血清素转运体抑制后特定神经元亚型的转录组变化	利用果蝇模型和单细胞RNA测序技术，首次在特定Kenyon细胞亚型中解析SERT抑制的转录响应，并区分发育期与成年期的差异效应	转录组变化有限，且一种突变等位基因导致显著人为表达变化，需在其他神经回路中进一步验证	探究血清素转运体（SERT）抑制对特定神经元转录组的影响	果蝇蘑菇体中的Kenyon细胞	神经科学	NA	荧光激活细胞分选（FACS）、bulk RNA测序、单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	果蝇dSERT突变等位基因及SSRI西酞普兰喂食的成年果蝇样本
190	2025-09-11	RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Traumatic Spinal Cord Injury (Review) 2023, Sovremennye tekhnologii v meditsine DOI:10.17691/stm2023.15.6.08 PMID:39944372	综述	本文综述了基于单细胞和单核RNA测序及空间转录组学技术在创伤性脊髓损伤研究中识别细胞类型、揭示分子机制和治疗靶点方面的进展	整合单细胞/单核RNA测序与空间转录组学技术，实现细胞类型精确定位和分子病理分析，为神经连接重组和感觉运动功能恢复机制提供新视角	依赖实验模型数据，人类细胞群体特异性信息尚不完善，需进一步比较验证	通过转录组分析揭示创伤性脊髓损伤的细胞分子机制并探索治疗靶点	脊髓组织中的各类细胞（神经元、神经胶质细胞等）及其在创伤反应中的分子特征	数字病理	创伤性脊髓损伤	RNA-seq, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学	NA	转录组数据, 空间信息数据	NA（综述文章未指定具体样本量）
191	2025-09-11	Mouse primordial germ-cell-like cells lack piRNAs 2022-12-05, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.004 PMID:36473462	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和小RNA测序发现，体外分化的第6天小鼠原始生殖细胞样细胞缺乏piRNA表达	首次证明体外培养的mPGCLCs未能建立功能性piRNA通路，与体内E13.5期性原细胞存在显著差异	研究仅针对第6天的mPGCLCs，未探讨更长时间分化后piRNA通路可能的变化	探究小鼠原始生殖细胞样细胞中piRNA通路的表达状态	小鼠原始生殖细胞样细胞(mPGCLCs)	发育生物学	NA	单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 小RNA-seq	NA	RNA测序数据	多个第6天mPGCLC细胞系
192	2025-09-10	BCAP31 promotes colorectal cancer metastasis via oxidative phosphorylation-dependent macrophage immunosuppression: A single-cell transcriptomic study 2025-Nov, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.08.002 PMID:40769312	研究论文	通过单细胞转录组研究揭示BCAP31通过氧化磷酸化依赖的巨噬细胞免疫抑制促进结直肠癌转移	首次发现BCAP31作为关键风险基因通过线粒体-免疫串扰机制驱动免疫抑制，并建立10基因巨噬细胞相关预后特征	NA	探究结直肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞驱动的免疫抑制机制	结直肠癌组织样本及肿瘤微环境中的免疫细胞	生物信息学	结直肠癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 孟德尔随机化分析	NA	单细胞转录组数据	NA
193	2025-09-10	Hyperactivation of the m6A demethylase FTO to down-regulate SLC7A11/xCT-mediated redox homeostasis and epigenetic remodeling in facial infiltrating lipomatosis 2025-Nov, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.08.001 PMID:40769313	研究论文	本研究揭示了m6A去甲基化酶FTO通过下调SLC7A11破坏氧化还原稳态和表观遗传重编程，从而驱动面部浸润性脂肪瘤病（FIL）发生的分子机制	首次发现FTO通过m6A依赖性方式抑制SLC7A11表达，破坏GSH/GSSG氧化还原平衡，并通过SIRT6-H3K9ac表观遗传重编程促进脂肪生成的新机制	研究主要基于细胞和动物模型，临床转化仍需进一步验证	探究面部浸润性脂肪瘤病（FIL）的分子发病机制和治疗靶点	FIL脂肪组织、脂肪干细胞和祖细胞（ASPCs）以及小鼠异种移植模型	分子生物学	面部浸润性脂肪瘤病	Western blotting, qPCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序, MeRIP-seq, RIP-qPCR, 荧光素酶报告实验, ATAC-seq, ChIP-qPCR, 酶活性检测	NA	分子生物学数据、测序数据、蛋白质表达数据	FIL患者组织和细胞样本，以及小鼠模型
194	2025-09-10	Transcriptional profiling uncovers microglial HIF-1α signaling as a therapeutic target of radiation-induced brain injury 2025-Nov, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.08.014 PMID:40784586	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示颅脑辐射后小胶质细胞HIF-1α信号通路的特异性激活，并证明其作为辐射性脑损伤治疗靶点的潜力	首次在单细胞水平发现辐射特异性激活小胶质细胞HIF-1α信号通路，且该现象无法通过传统批量分析检测	研究基于小鼠模型，临床转化需进一步验证；HIF-1α抑制仅带来认知功能部分恢复	探究辐射性脑损伤的细胞分子机制并寻找治疗靶点	小鼠模型中的小胶质细胞和海马体相关认知功能	神经科学	脑部疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），药理学抑制	NA	转录组数据	小鼠实验模型（具体数量未明确说明）
195	2025-09-10	Multi-omics analysis of polyamine metabolism implicates NT5E/CD73 in the progression of pancreatic cancer 2025-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217887 PMID:40582491	研究论文	通过多组学分析揭示多胺代谢在胰腺癌进展中的作用，并鉴定NT5E/CD73为关键调控基因	首次对胰腺癌中多胺代谢进行系统性多组学整合分析，开发基于多胺代谢的预后模型（PMscore），并发现NT5E在代谢重编程和免疫调控中的双重功能	NA	探究多胺代谢在胰腺导管腺癌（PDAC）中的全面作用及临床意义	胰腺导管腺癌（PDAC）患者样本及肿瘤微环境	多组学分析	胰腺癌	批量转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、主成分分析、随机森林算法	预后模型（PMscore）	转录组数据、单细胞数据	NA
196	2025-09-10	CEMIP2 sensitizes PDAC to chemotherapy through extracellular matrix remodeling by hyaluronan degradation 2025-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217898 PMID:40623543	研究论文	本文揭示了CEMIP2通过降解透明质酸重塑细胞外基质，增强胰腺导管腺癌对化疗的敏感性	首次阐明CEMIP2通过HA降解机制调节肿瘤微环境，发现其与CAF亚群和免疫细胞的功能状态调控相关	机制研究主要基于小鼠模型，临床样本验证仍需扩展	探究CEMIP2在PDAC化疗耐药性中的分子机制和治疗潜力	胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和小鼠模型	肿瘤生物学	胰腺癌	scRNA-seq, CyTOF, 蛋白质组学分析	NA	基因表达数据、蛋白质数据、单细胞测序数据	临床PDAC标本和小鼠模型，具体样本量未明确说明
197	2025-09-10	The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis 2025-Oct, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2025.05.015 PMID:40389038	研究论文	本研究通过大鼠脓毒性腹膜炎模型，揭示内脏大神经消融通过选择性调节中性粒细胞亚群平衡显著增强细菌清除能力	首次证明内脏大神经特异性调控中性粒细胞（而非巨噬细胞）的激活状态，并发现其通过改变杀菌性中性粒细胞与静止亚群的比例影响免疫应答	研究局限于大鼠模型，尚未在人类中验证；神经消融的长期效应未评估	阐明交感神经内脏大神经在感染过程中对免疫调节和细菌清除的具体作用机制	大肠杆菌诱导脓毒性腹膜炎的SD大鼠模型	免疫学	脓毒症	流式细胞术、单细胞RNA测序、蛋白质标记检测	NA	基因表达数据、蛋白质数据、细胞计数数据	大鼠模型（具体数量未明确说明），包含假手术对照组和神经消融实验组
198	2025-09-10	Multimodal associations between brain morphology, immune-inflammatory markers, spatial transcriptomics, and behavioural symptoms in autism spectrum disorder 2025-Oct, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2025.07.021 PMID:40721173	研究论文	本研究探讨自闭症谱系障碍中攻击行为与神经炎症、脑结构差异及基因表达模式的关联	首次结合空间转录组学与多模态神经生物学数据，揭示攻击行为与前额-边缘-纹状体网络失衡及神经炎症的复杂相互作用	样本量较小（n=42），仅包含男性参与者，且神经影像数据仅来自攻击组子集（n=13）	识别自闭症谱系障碍中攻击行为的神经生物学机制并为治疗策略提供依据	42名11-38岁男性自闭症谱系障碍患者（分攻击组与非攻击组）	神经科学	自闭症谱系障碍	多重检测分析、MRI、变形基形态测量法（DBM）、空间转录组学	NA	行为问卷数据、血浆生物标志物数据、神经影像数据、基因表达数据	42名男性ASD患者（21名攻击组/21名非攻击组），其中13名攻击组参与者接受MRI扫描
199	2025-09-10	Testis-specific protein HSF5 is essential for proper chromatin organization and transcriptional reprogramming to drive pachynema progression 2025-Sep-18, Zoological research IF:4.0Q1 DOI:10.24272/j.issn.2095-8137.2025.019 PMID:40923305	研究论文	本研究通过多组学方法揭示HSF5在调控染色质组织和转录重编程中的关键作用，以驱动粗线期进展	首次发现HSF5可能通过与USP7形成复合物抑制减数分裂性染色体上的H2AK119ub修饰，并揭示其在XY小体形成和转录调控网络中的新功能	HSF5与USP7相互作用的分子机制尚未完全阐明，需要进一步实验验证	阐明HSF5在哺乳动物减数分裂前期I中调控染色质动态和转录重编程的分子通路	小鼠精母细胞（特别是粗线期精母细胞）	分子生物学	男性不育症	ATAC-seq, 单细胞RNA测序, 多组学分析	NA	基因组测序数据, 转录组数据, 表观遗传数据	HSF5缺失小鼠模型的精母细胞样本
200	2025-09-10	Single-cell transcriptome combined with genetic tracing reveals a roadmap of fibrosis formation during proliferative vitreoretinopathy 2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2424487122 PMID:40920930	研究论文	本研究结合单细胞转录组和遗传谱系追踪技术，揭示了增殖性玻璃体视网膜病变中纤维化形成的细胞来源和分子机制	首次整合单细胞转录组学与遗传谱系追踪技术，系统描绘RPE细胞在PVR中的命运转变过程，并鉴定TSP-1为关键驱动基因	NA	解析增殖性玻璃体视网膜病变中纤维化形成的细胞机制和潜在治疗靶点	视网膜色素上皮细胞、免疫细胞、Müller细胞	单细胞组学	眼科疾病	单细胞转录组测序、遗传谱系追踪	NA	单细胞转录组数据	NA