单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37260 篇文献,本页显示第 181 - 200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
181 2026-03-09
Longitudinal Profiling of Tumor and Immune Compartments Uncovers Patterns of Dysregulation and Associations with Response in Multiple Myeloma
2026-Mar-04, Blood cancer discovery IF:11.5Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,包括单细胞RNA测序和批量RNA测序,揭示了多发性骨髓瘤中肿瘤与免疫微环境之间的动态相互作用及其与治疗反应和疾病进展的关联 首次在纵向研究中结合单细胞RNA测序和批量测序,系统分析了多发性骨髓瘤的免疫微环境变化,并识别出幼稚B细胞重建作为持久反应的生物标志物以及癌症-睾丸抗原作为进展期高风险疾病的潜在靶点 研究样本量相对有限(102名患者),且主要基于骨髓样本,可能无法完全代表全身性免疫状态 探究多发性骨髓瘤治疗反应和疾病进展的免疫相关因素 多发性骨髓瘤患者(102名)的骨髓样本(243个) 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 全基因组测序 NA RNA测序数据, 基因组数据 102名患者,243个骨髓样本,631,226个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 全基因组测序 NA NA
182 2026-03-09
Dissociable perfusion chip (DPC): perfusable microfluidic chip for single-cell screening of anti-cancer drugs in live glioblastoma explants
2026-Mar-04, Lab on a chip IF:6.1Q2
研究论文 本研究介绍了一种可分离灌注芯片(DPC),用于在活体胶质母细胞瘤(GBM)组织中并行培养和药物扰动,并支持下游单细胞RNA测序(scRNA-seq)以筛选抗癌药物 DPC采用机械夹层而非化学附着方式,实现三维组织切片的正压灌注和非破坏性分离,克服了传统方法的局限性 本研究为概念验证工作,未来需在更多新鲜人类GBM切片上进行多药物筛选和进一步验证 开发一种微流控芯片平台,用于在活体GBM组织中快速、高分辨率地识别细胞类型特异性药物反应 人类胶质母细胞瘤(GBM)切除组织切片 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、微流控技术 NA 单细胞RNA测序数据、荧光评估数据 人类GBM患者手术切除的新鲜组织切片(手术1小时内处理),以及小鼠GBM样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
183 2026-03-09
Epigenetically regulated pancreatic GABA-somatostatin signaling underlies gestational diabetes-induced glucose intolerance in offspring
2026-Mar-04, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究揭示了妊娠期糖尿病通过表观遗传调控胰腺GABA-生长抑素信号通路,导致子代糖耐量异常的机制 首次发现宫内高血糖通过下调DNA去甲基化酶TET2/3,导致GABA合成基因甲基化增加和生长抑素蛋白升高,从而损害胰岛素分泌 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅涉及脐动脉血GABA含量检测,需要更多临床验证 探究妊娠期糖尿病对子代糖尿病风险的机制及潜在干预策略 小鼠胰腺胰岛细胞、人类脐动脉血样本 表观遗传学与代谢疾病 妊娠期糖尿病及其子代代谢异常 scRNA-seq、代谢组学分析、基因敲除技术 基因敲除小鼠模型(TET2/3双敲除) 单细胞转录组数据、代谢物数据、表观遗传数据 未明确样本数量,涉及小鼠模型和人类脐动脉血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
184 2026-03-09
Endothelial Transcription Factor EB Protects Against Doxorubicin-Induced Endothelial Toxicity and Cardiac Dysfunction
2026-Mar-03, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究探讨了内皮细胞特异性转录因子EB(TFEB)在阿霉素诱导的内皮毒性和心脏功能障碍中的保护作用 首次揭示了内皮TFEB通过调控DAB2基因来保护内皮细胞免受阿霉素损伤,并改善心脏功能 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类临床相关性尚需进一步验证 研究TFEB在内皮细胞中对阿霉素诱导的心脏毒性的保护机制 内皮细胞特异性TFEB转基因和敲除小鼠、人类和小鼠心脏微血管内皮细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 RNA测序、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀定量PCR(ChIP-qPCR) NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 内皮细胞特异性TFEB转基因和敲除小鼠及其同窝对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
185 2026-03-09
Campylobacter jejuni infection impacts host-derived miRNAs targeting bacterial and host genes
2026-Mar-03, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
研究论文 本研究探讨了空肠弯曲菌感染如何影响宿主来源的miRNA表达,这些miRNA靶向细菌和宿主基因 首次揭示了特定病原体(空肠弯曲菌)感染会显著改变宿主细胞外囊泡(EV)来源的miRNA表达谱,并发现这些miRNA可能同时靶向细菌毒力基因和宿主上皮细胞免疫调节基因 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;miRNA与靶基因的预测需要进一步实验验证 探究空肠弯曲菌感染对宿主miRNA表达谱的影响及其在宿主-病原体相互作用中的作用 无菌小鼠、定植13种细菌的小鼠、以及额外感染空肠弯曲菌的小鼠 微生物组学与宿主-病原体相互作用 肠道感染 miRNA测序、空间转录组学 NA miRNA表达数据、空间转录组数据 三组小鼠(无菌组、C13定植组、C13+空肠弯曲菌感染组) NA miRNA测序、空间转录组学 NA NA
186 2026-03-09
Interferon-γ-Responsive Microglia-Derived Extracellular Vesicles Inhibited Neurogenesis After Stroke via MicroRNA-199a-5p/SIRT1 Axis
2026-Mar-03, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 本研究揭示了脑卒中后干扰素-γ反应性小胶质细胞来源的细胞外囊泡通过miR-199a-5p/SIRT1轴抑制神经干细胞存活和神经元分化,从而加剧脑损伤 首次阐明了脑卒中后干扰素-γ反应性小胶质细胞通过分泌细胞外囊泡调控神经发生的具体分子机制,即通过miR-199a-5p靶向抑制SIRT1 研究主要在雄性小鼠模型中进行,未考虑性别差异;体外实验使用BV2小胶质细胞系,可能与体内原代细胞存在差异 探究脑卒中后干扰素-γ反应性小胶质细胞在神经功能恢复中的作用及机制 成年雄性小鼠、BV2小胶质细胞系、神经干细胞 神经科学 缺血性脑卒中 单细胞RNA测序、免疫染色、qRT-PCR、ELISA、miRNA测序、生物信息学分析、荧光素酶报告基因检测 动物疾病模型(小鼠MCAO模型)、细胞模型 单细胞转录组数据、miRNA表达数据、图像数据、行为学数据 未明确说明具体样本数量,使用成年雄性小鼠和细胞系进行研究 NA 单细胞RNA-seq NA NA
187 2026-03-09
Silencing Adamts2 attenuates fibroblast-mediated fibrosis and promotes axonal regeneration in an in vitro model
2026-Mar-03, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序分析小鼠脊髓损伤后成纤维细胞变化,筛选出高表达基因Adamts2,并在体外模型中验证其靶向RNAi可减弱成纤维细胞的促纤维化表型并促进轴突再生 首次利用单细胞测序数据识别脊髓损伤后成纤维细胞中特异性高表达的Adamts2基因,并证明其沉默可抑制纤维化并促进神经再生 研究基于体外模型,未在体内动物模型中验证Adamts2靶向治疗的实际效果 探索减轻脊髓损伤后纤维化瘢痕抑制轴突再生的治疗策略 小鼠脊髓成纤维细胞和运动神经元 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 体外TGFβ诱导的成纤维细胞模型 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
188 2026-03-09
Targeting FGFR1-regulated SPP1 signaling repolarizes immunosuppressive macrophages and sensitizes Hepatocellular Carcinoma to anti-PD-1 therapy
2026-Mar-03, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了FGFR1通过激活MAPK信号和诱导SPP1表达,促进免疫抑制性巨噬细胞极化并抑制T细胞功能,从而导致肝细胞癌对PD-1抑制剂产生耐药性的机制 首次将FGFR1与肝细胞癌免疫检查点阻断耐药性联系起来,并证明FGFR1抑制剂BGJ398与抗PD-1疗法联合使用可协同增强抗肿瘤效果 研究主要基于小鼠模型和临床数据集分析,缺乏大规模前瞻性临床试验验证 探究肝细胞癌对免疫检查点阻断产生耐药性的机制,并寻找克服耐药性的治疗策略 肝细胞癌小鼠模型、临床患者数据集 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型及临床数据集(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
189 2026-03-09
Cell-specific gene expression plasticity in response to hypoxia promotes high-altitude adaptive evolution
2026-Mar-03, Science China. Life sciences
研究论文 本研究通过绵羊模型,利用单细胞RNA测序技术揭示了细胞特异性基因表达可塑性在高原缺氧适应进化中的作用 首次在细胞水平上展示了基因表达可塑性如何被遗传适应逆转,并发现了免疫细胞中高水平的逆转可塑性通过强选择促进遗传适应 研究主要基于绵羊模型,结果在人类或其他物种中的普适性需进一步验证 探索缺氧环境下可塑性与遗传适应之间的分子和细胞机制 绵羊的大脑、心脏和肺组织 单细胞转录组学 缺氧相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 27只动物,包括236,805个细胞和906,315个细胞核 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
190 2026-03-09
PlantscRNAdb 4.0: Improved marker identification and annotation under a cell-type uniformity for plants
2026-Mar-02, Molecular plant IF:17.1Q1
研究论文 介绍PlantscRNAdb 4.0数据库,这是一个更新的综合数据库,整合了新的植物细胞类型本体论,覆盖33种植物物种,并提供了基于深度学习的细胞类型注释工具 开发了HCMarker工具,采用多指标评分系统用于稳健准确地识别植物细胞类型标记基因,并引入了PCmaster_anno,一个基于深度学习的工具,利用数据库的广泛数据改进自动化植物细胞类型注释 NA 改进植物单细胞RNA测序数据的标记基因识别和细胞类型注释,提供一个标准化的框架 33种植物物种的单细胞RNA测序数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 深度学习 RNA测序数据 107个scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
191 2026-03-09
Population Analysis and Immunologic Landscape of Melanoma in People Living with HIV
2026-Mar-02, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过分析HIV感染者与未感染者的黑色素瘤临床数据及肿瘤免疫微环境,揭示了HIV感染者黑色素瘤的独特临床和免疫特征 首次结合大规模电子健康记录与空间免疫转录组学,系统比较HIV感染者与未感染者黑色素瘤的临床差异及肿瘤微环境免疫抑制特征 样本量相对有限(空间转录组学n=11,多重免疫荧光n=29),且为观察性研究,无法完全排除混杂因素 解析HIV感染者黑色素瘤的临床特征和免疫微环境差异,探究HIV感染对黑色素瘤预后的影响机制 HIV感染者(PLWH)与未感染者(PLw/oH)的黑色素瘤患者 数字病理学 黑色素瘤 空间免疫转录组学,多重免疫荧光(mIF) NA 电子健康记录,肿瘤组织样本 电子健康记录:1,087名HIV感染者,394,437名未感染者;空间转录组学:11例样本;多重免疫荧光:29例样本(15名HIV感染者,14名未感染者) NA 空间转录组学 NA NA
192 2026-03-09
Dermal fibroblasts respond to IL-4 and IL-13 and promote T cell recruitment in atopic dermatitis
2026-Mar-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq分析揭示了特应性皮炎中免疫作用成纤维细胞的作用,发现IL-4和IL-13刺激成纤维细胞产生趋化因子,促进T细胞招募,从而加剧炎症 首次在特应性皮炎中鉴定出转录独特的免疫作用成纤维细胞群,并证明其通过IL-4Rα依赖机制产生趋化因子CCL8,激活CCR3受体招募T细胞,揭示了成纤维细胞在2型免疫反应中的主动角色 研究主要基于小鼠模型和人类皮肤样本的体外实验,可能不完全反映人类体内复杂环境;未详细探讨其他细胞类型或信号通路在成纤维细胞激活中的潜在影响 探究特应性皮炎中成纤维细胞在2型免疫反应中的作用机制 人类特应性皮炎皮肤样本和小鼠模型中的成纤维细胞 单细胞组学 特应性皮炎 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 人类AD皮肤和小鼠模型样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
193 2026-03-09
IFN signaling is associated with radiotherapy response in malignant peripheral nerve sheath tumors
2026-Mar-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞转录组学、全基因组CRISPR干扰筛选及多平台分子分析,揭示了I型IFN信号在恶性外周神经鞘瘤放疗反应中的关键作用,并探讨了其与T细胞浸润的关联 首次在MPNST中系统性地结合bulk与单细胞转录组学、CRISPR筛选及多平台分析,明确了I型IFN信号作为放疗反应的功能性介质,并揭示了其在免疫微环境调控中的新机制 研究主要基于小鼠同种异体移植模型和患者样本分析,临床转化需进一步验证;IFN信号靶向的免疫调节剂联合放疗的疗效尚未在临床试验中评估 探究恶性外周神经鞘瘤放疗反应异质性的生物学机制,并寻找改善放疗效果的潜在靶点 恶性外周神经鞘瘤细胞、小鼠同种异体移植模型及患者手术样本 数字病理学 恶性外周神经鞘瘤 bulk转录组学, 单细胞转录组学, 全基因组CRISPR干扰筛选, 多平台分子分析 NA 转录组数据, 分子分析数据 包括MPNST细胞、小鼠模型及患者样本,具体数量未明确 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
194 2026-03-09
Mapping cellular heterogeneity and dynamic interactions in pancreatic cancer
2026-Mar-02, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在胰腺导管腺癌研究中的应用,重点探讨了肿瘤内异质性、微环境成分、细胞亚群动态变化及潜在治疗靶点 系统总结了scRNA-seq在PDAC研究中的工作流程、数据分析方法及其在识别肿瘤异质性、细胞亚群转化和微环境调控中的创新应用 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于已有研究进行总结,可能受限于现有文献的覆盖范围和深度 探讨单细胞RNA测序技术如何帮助理解胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性、微环境动态及治疗靶点 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤细胞、微环境成分(如免疫细胞、癌症相关成纤维细胞)、细胞亚群及生物标志物 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
195 2026-03-09
Unveiling the impact of electroacupuncture on retinal cells in myopic guinea pigs via single-cell sequencing
2026-Mar-02, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,系统探究了电针对近视豚鼠视网膜细胞功能特征的影响 首次结合单细胞RNA测序技术,系统揭示了电针通过调节视网膜细胞功能(如光感受器锥细胞、Müller胶质细胞和小胶质细胞)来缓解近视进展的分子机制 研究仅基于豚鼠模型,结果可能无法直接外推至人类;样本量未明确说明,可能影响统计效力 探究电针干预如何通过调节视网膜细胞功能来抑制近视进展 近视豚鼠的视网膜细胞 数字病理学 近视 单细胞RNA测序,实时荧光定量PCR,Western blotting NA 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
196 2026-03-09
The Biomarkers and Underlying Mechanisms of Mitochondrial and Programmed Cell Death Related Genes in Epilepsy by Combining Transcriptome and Single-Cell Sequencing
2026-Mar, Journal of Korean Neurosurgical Society IF:1.4Q3
研究论文 本研究结合转录组和单细胞测序技术,探索了线粒体和程序性细胞死亡相关基因在癫痫中的生物标志物及其潜在机制 首次结合转录组和单细胞RNA测序分析,鉴定出与线粒体和程序性细胞死亡相关的癫痫生物标志物LTBR和IRF1,并探索了其作为药物靶点的潜力 研究依赖于公共数据集GSE134697和GSE168375,样本来源和数量可能有限;RT-qPCR验证的临床样本规模未明确说明 探究线粒体相关基因和程序性细胞死亡相关基因在癫痫中的生物标志物、作用机制及潜在治疗靶点 癫痫患者与对照样本的基因表达数据 生物信息学 癫痫 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 Spearman相关分析, cytoHubba插件算法, ROC曲线分析 基因表达数据 基于公共数据集GSE134697和GSE168375,具体样本数量未明确说明;另有RT-qPCR验证的临床样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
197 2026-03-09
Targeting NRP1 in Endothelial Cells Facilitates the Normalization of Scar Vessels and Prevents Fibrotic Scarring
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞测序等技术揭示了疤痕血管重塑特征,并发现靶向NRP1可抑制EndMT、促进血管正常化,从而预防疤痕形成 首次构建疤痕患者内皮细胞图谱,发现NRP1高表达内皮细胞具有间充质特征,并开发了靶向NRP1的功能性水凝胶喷雾用于预防疤痕 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证 探究疤痕血管结构异常及内皮细胞异质性,寻找预防疤痕形成的治疗靶点 疤痕组织中的内皮细胞 数字病理学 皮肤疤痕 单细胞测序, 皮肤镜检查, 扫描电子显微镜, 免疫荧光染色 NA 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 疤痕患者样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
198 2026-03-09
CANTAO: guiding clustering and annotation in single-cell RNA sequencing using average overlap
2026-Mar, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CANTAO的新方法,通过平均重叠度量来指导单细胞RNA测序数据的聚类和注释,以提高细胞身份识别的准确性和生物学意义 提出了平均重叠度量,通过比较差异表达基因的排名列表来定义单细胞聚类之间的距离,从而在未知细胞身份的情况下实现稳健的聚类比较和注释 未明确提及具体局限性,但可能依赖于差异表达基因的准确性,且在复杂或噪声数据中性能需进一步验证 开发一种方法以改进单细胞RNA测序数据中细胞聚类的评估和注释,特别是在未知细胞身份的情况下 单细胞RNA测序数据,包括已知真实细胞身份的基准数据集和未分选的小鼠胸腺细胞 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及基准数据集和小鼠胸腺细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
199 2026-03-09
Single-Cell and Multiomic Analysis Reveals Neutrophil Heterogeneity and Prognostic Value in Cervical Lesions
2026-Mar, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序揭示了宫颈病变中中性粒细胞的异质性,并构建了基于中性粒细胞浸润的风险预后模型 首次在宫颈癌中系统鉴定出五个中性粒细胞亚群(N0-N4),发现N4亚群在疾病进展中显著增加,并揭示了其通过Wnt信号通路和细胞外基质重塑促进肿瘤进展的新机制 样本量相对有限(20例),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 探究中性粒细胞在宫颈癌肿瘤微环境中的异质性及其在疾病进展和预后中的作用 宫颈活检组织样本 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,组织微阵列分析 风险预后模型 单细胞转录组数据,空间转录组数据,组织图像数据 20例宫颈活检样本(涵盖不同疾病阶段) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
200 2026-03-09
Evolution of the Spatial transcriptomic landscape during the progression of high-grade pancreatic intraductal papillary mucinous neoplasms to invasive cancer
2026-Mar, Pancreatology : official journal of the International Association of Pancreatology (IAP) ... [et al.] IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,分析了同一患者正常胰腺、高级别IPMN和侵袭性PDAC样本,揭示了IPMN向PDAC进展过程中的分子机制和微环境变化 首次在IPMN向PDAC进展中整合空间转录组学与多计算分析方法,识别了ELF3/MYC/KLF4扩增、7个功能异质性亚克隆以及免疫-基质景观重塑 样本量较小(仅3个新鲜组织样本),且来自单一患者,可能限制结果的普遍性 阐明高级别胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤向侵袭性胰腺导管腺癌进展的分子机制和微环境动态 同一患者的正常胰腺组织、高级别IPMN组织和侵袭性PDAC组织 空间转录组学 胰腺癌 空间转录组学 Spatial inferCNV, SpaCET, CellChat 空间转录组数据 3个新鲜组织样本(来自同一患者) NA 空间转录组学 NA NA
回到顶部