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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-05-18 |
Gain of function NOTCH4 variants disrupt angiogenesis in systemic sclerosis
2026-Feb-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.015
PMID:41644364
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研究论文 | 该研究通过遗传学、单细胞RNA测序、功能实验和小鼠模型,探讨NOTCH4功能获得性变异在系统性硬化症血管生成障碍中的作用 | 首次发现NOTCH4功能获得性变异与非洲裔美国人系统性硬化症的严重血管表型相关,并揭示NOTCH4信号通路抑制可逆转血管生成障碍和内皮-间质转化 | 研究主要聚焦于非洲裔美国人群体,样本量有限,且未完全阐明NOTCH4变异在其他人种中的作用机制 | 探究系统性硬化症中严重血管表型的遗传病因及NOTCH4信号通路作为治疗靶点的潜力 | 非洲裔美国系统性硬化症患者及其血管表型 | 数字病理学 | 硬皮病 | NGS,单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据、单细胞转录组数据 | 非洲裔美国系统性硬化症患者与对照组的基因型数据,以及相应的小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 182 | 2026-05-18 |
In vivo CRISPR screen reveals regulation of macrophage states in neuroinflammation
2026-Feb, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02151-6
PMID:41345278
|
研究论文 | 利用体内CRISPR筛选技术,揭示细胞因子在神经炎症中对巨噬细胞状态的调节作用 | 建立了结合可编辑祖细胞的体内CRISPR筛选流程,实现了对多发性硬化小鼠模型中巨噬细胞调控的规模化分析,并联合单细胞转录组学与生物传感器监控细胞因子效应 | NA | 解析细胞因子在神经炎症中调控巨噬细胞状态的分子机制 | 小鼠多发性硬化模型中的巨噬细胞及血源性中枢神经系统髓系细胞 | 机器学习 | 多发性硬化 | CRISPR筛选、单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 超过100种细胞因子受体和信号分子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2026-05-18 |
Suppression of endothelial cell PANoptosis: qingyi decoction targets the TMAO-HMGB1 pathway to mitigate lung injury in acute pancreatitis rats
2026-01-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02212-y
PMID:41518397
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研究论文 | 本研究探讨了清胰汤通过抑制TMAO-HMGB1通路介导的内皮细胞PANoptosis来减轻重症急性胰腺炎相关肺损伤的作用与机制 | 首次揭示了TMAO诱导内皮细胞PANoptosis的机制,并阐明清胰汤通过调节TMAO-HMGB1通路发挥保护作用 | 主要基于动物模型和体外实验,临床转化尚需进一步验证 | 评估清胰汤通过调节肠道菌群代谢物TMAO减轻重症急性胰腺炎相关肺损伤的作用机制 | 重症急性胰腺炎大鼠模型及人脐静脉内皮细胞 | 机器翻译 | 急性胰腺炎 | LC-MS/MS, RNA-seq, scRNA-seq, ELISA, RT-qPCR, Western blot, 流式细胞术 | NA | 文本 | 大鼠模型及体外细胞实验,具体样本数未提及 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | RNA-seq及scRNA-seq分析 |
| 184 | 2026-05-18 |
LncRNA PVT1 drives macrophage polarization and triple-negative breast cancer progression via PPARγ-mediated transcriptional activation
2026-01-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02232-8
PMID:41518478
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研究论文 | 本研究揭示了lncRNA PVT1通过PPARγ介导的转录激活驱动巨噬细胞极化和三阴性乳腺癌进展的分子机制 | 首次阐明PVT1作为表观遗传支架协调NOP56-E2F1复合体调控PPARγ表达,从而驱动巨噬细胞向促肿瘤M2表型极化 | 未提及具体局限性 | 探讨lncRNA PVT1与PPARγ在三阴性乳腺癌进展中调控巨噬细胞重编程的分子相互作用 | 三阴性乳腺癌小鼠模型、THP-1/U937巨噬细胞、MDA-MB-231和MCF-7乳腺癌细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、RNA/DNA pull-down、荧光素酶报告基因实验、流式细胞术、TUNEL检测 | NA | 基因表达数据 | 原位三阴性乳腺癌小鼠肿瘤组织(含9种细胞类型) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 185 | 2026-05-18 |
Digital twins for in vivo metabolic flux estimations in patients with brain cancer
2026-Jan-06, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.10.022
PMID:41330373
|
研究论文 | 开发两种机器学习框架,实现脑癌患者体内代谢通量估算的数字孪生模型 | 首次将数字孪生框架与单细胞代谢通量分析相结合,实现人类患者体内代谢通量估算,突破传统仅限于临床前模型的限制 | 未提及临床应用验证和模型泛化能力评估 | 开发基于机器学习的体内代谢通量估算框架,用于脑癌患者 | 脑癌患者肿瘤样本及小鼠模型 | 机器学习 | 脑癌 | 单细胞RNA测序、同位素示踪 | 卷积神经网络 | 基因表达数据、代谢通量数据 | 脑癌患者及小鼠样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2026-05-18 |
Hepatic Arterial Flow-Induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-Expressing Macrophages
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101728
PMID:41565157
|
研究论文 | 研究门静脉高压中肝动脉血流诱导的门管束纤维化,重点关注VCAM-1和表达骨桥蛋白的巨噬细胞的作用 | 首次揭示了肝动脉缓冲反应通过VCAM-1介导的Spp1+巨噬细胞招募驱动门管束纤维化的分子机制 | 未明确说明,但基于动物模型(大鼠)可能需在人体中验证 | 探究门静脉高压时肝动脉血流增加如何通过分子机制诱导门管束病理性重塑 | Sprague-Dawley大鼠门静脉高压模型 | 数字病理学 | 门静脉高压 | 微CT、单细胞RNA测序、RNA荧光原位杂交 | NA | 图像数据(微CT)、转录组数据 | 大鼠模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据集GSE171904 |
| 187 | 2026-05-18 |
Molecular and Chromatin Accessibility Programs Underlying Epithelial Injury and Impaired Regeneration in Neonatal Necrotizing Enterocolitis
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101730
PMID:41571092
|
研究论文 | 利用多组学方法绘制新生儿坏死性小肠结肠炎中上皮损伤和再生障碍的分子与染色质可及性图谱 | 整合了单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学等多组学数据,揭示了Ezh2作为LGR5+肠道干细胞身份和再生的关键调控因子,并发现WNT信号通路在维持上皮完整性中的重要作用 | 主要基于新生儿小鼠模型,人类NEC的验证尚需进一步研究 | 阐明新生儿坏死性小肠结肠炎中上皮再生缺陷的分子机制并识别治疗靶点 | 新生儿坏死性小肠结肠炎小鼠模型的小肠组织及肠道干细胞 | 数字病理学 | 新生儿坏死性小肠结肠炎 | bulk RNA测序, 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 多重容错荧光原位杂交 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | 多个新生小鼠样本 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 188 | 2026-05-18 |
Tuft Cells in the Gut Limit Cognitive Disorders by Regulating Gut Homeostasis
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101747
PMID:41621641
|
研究论文 | 该文章研究了肠道簇细胞通过调节肠道稳态来限制认知障碍的机制 | 首次揭示了肠道簇细胞在认知障碍中的作用,并阐明了其通过调节肠道菌群和2型免疫来影响认知功能的机制 | 未提及具体局限性,但研究仅在动物模型中进行,尚未验证在人类中的相关性 | 探究肠道簇细胞在认知障碍中的作用及其机制 | 小鼠(缺簇细胞小鼠Pou2f3-/-和野生型WT小鼠,阿尔茨海默病模型小鼠) | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 16S rRNA测序、FITC-葡聚糖实验、流式细胞术、单细胞RNA测序、荧光成像、结肠类器官 | NA | 序列数据、图像数据 | 10月龄小鼠(缺簇细胞小鼠和野生型小鼠),阿尔茨海默病模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2026-05-18 |
Spatial Analysis of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Defines a Paradoxical Keratin 17-Positive, Low-Grade Epithelial Population Harboring Malignant Features
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101749
PMID:41638478
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序,发现导管内乳头状黏液性肿瘤中组织学低级别上皮细胞中存在表达恶性转录特征的角蛋白17阳性亚群 | 首次在组织学低级别IPMN中识别出表达恶性特征(KRT17、S100A10、CEACAM5)的上皮细胞亚群,挑战了传统组织学分级对恶性潜能的判断 | 未明确说明样本量大小和外部验证集的代表性,可能影响结论的普适性 | 探究IPMN进展过程中的转录组变化,识别高风险恶变亚群 | 包含低级别异型增生、高级别异型增生和IPMN来源癌变的患者组织样本 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 包含多个患者样本的大型队列及外部空间转录组数据集 | Nanostring | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | Nanostring GeoMx | Nanostring GeoMx空间转录组学系统 |
| 190 | 2026-05-18 |
Uncovering core stemness biomarkers in HBV-HCC through integrated multi-omics
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0349171
PMID:42133686
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示HBV相关肝细胞癌的核心干性生物标志物 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据,识别出与HBV感染相关的肝细胞癌干性内皮亚群,并发现SSR2和UBE2D3作为候选诊断和预后生物标志物 | 基于计算机模拟分析,缺乏实验验证;样本量有限,需进一步在更大队列中验证 | 鉴定HBV相关肝细胞癌中与癌症干细胞特征相关的核心调控因子 | HBV相关肝细胞癌患者的单细胞和批量转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 随机森林 | 转录组数据 | 多个独立队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2026-05-18 |
Unraveling the significance of decorin in endometriosis development through single cell sequencing and experimental approaches
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0349505
PMID:42139232
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2026-05-18 |
GLP-1R Agonism Directly Improves the Pumping Capacity of Murine Collecting Lymphatic Vessels
2025-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.26.696603
PMID:41509291
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研究论文 | GLP-1R激动剂直接提高小鼠集合淋巴管的泵血能力 | 首次发现GLP-1R激动剂(如semaglutide)可直接作用于淋巴管内皮细胞(LECs),通过血管舒张增加淋巴管泵血能力,且该作用独立于体重减轻带来的系统性益处 | 机制中除一氧化氮、活性氧和血管舒张性前列腺素外,其他信号成分尚待阐明 | 研究GLP-1R激动剂对淋巴管功能的直接作用及其分子机制 | 健康野生型小鼠、饮食诱导肥胖小鼠和高胆固醇血症ApoE KO小鼠的淋巴管 | 数字病理学 | 继发性淋巴水肿 | 单细胞RNA测序、荧光共聚焦显微镜、压力肌动描记术 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠淋巴管样本,具体数量未报告 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于淋巴管细胞转录组分析 |
| 193 | 2026-05-18 |
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.693132
PMID:41509209
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研究论文 | 详细描述了一种用于小鼠肌肉骨骼组织的空间转录组样本处理流程,利用Xenium Prime 5K平台实现高质量转录检测 | 首次针对小鼠肌肉骨骼组织(包括完整膝关节、胫骨和腰椎)开发了综合样本处理流程,通过共包埋策略实现多样本同时切片,并解决了矿化组织脱钙过程中RNA保存的难题 | 未提及明显局限性 | 建立适用于小鼠肌肉骨骼组织的空间转录组样本处理方案,实现高质量转录检测并保留解剖结构 | 成年小鼠的完整膝关节、胫骨和腰椎组织 | 数字病理学 | 不适用 | 基于成像的空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 成年小鼠的多个肌肉骨骼组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium Prime 5K | 10x Genomics Xenium Prime 5K平台进行成像型空间转录组分析 |
| 194 | 2026-05-18 |
Integrating pathology genomics and single-cell genomics to identify lactate metabolism-related prognostic features and therapeutic strategies for melanoma
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02190-1
PMID:41006685
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研究论文 | 通过整合病理基因组学与单细胞基因组学,识别与黑色素瘤乳酸代谢相关的预后特征和治疗策略 | 首次整合病理图像特征、单细胞转录组、空间转录组等多组学数据,构建乳酸代谢预后模型(LMS),并发现RAB32在肿瘤代谢重编程和侵袭性中的核心作用 | 未提及明显的局限性 | 系统表征黑色素瘤中乳酸代谢的分子特征,构建预后模型并探索潜在治疗策略 | 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者的病理图像、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据及临床信息 | 数字病理学、机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、深度学习、基因集变异分析、RAB32敲低实验 | ResNet50卷积神经网络、LMS预后模型(基于10种机器学习算法的101种组合) | 图像、文本(基因表达数据)、视频(非核心) | TCGA训练集和验证集样本、单细胞测序样本、小鼠异种移植模型样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序技术、空间转录组学技术、病理图像分析技术 | NA | NA |
| 195 | 2026-05-18 |
Endothelial SPRY1 deficiency associates with angiogenic-metabolic reprogramming in pulmonary arterial hypertension: a multi-omics analysis of bulk and single-cell transcriptomic profiles
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02175-0
PMID:41006686
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研究论文 | 通过多组学分析揭示内皮SPRY1缺陷与肺动脉高压中血管生成-代谢重编程的关系 | 首次通过整合单细胞RNA测序数据和高维加权基因共表达网络分析与机器学习,鉴定SPRY1为肺动脉高压发病机制中的新型关键生物标志物,并证实其在疾病中的显著下调 | 研究仅基于数据库分析,且仅在一个大鼠模型中验证,缺乏更多临床样本和功能验证实验 | 探究肺动脉高压中内皮细胞稳态失调的分子机制,特别是SPRY1在血管重塑中的作用 | 肺动脉高压患者和正常对照的肺组织样本,以及野百合碱诱导的PAH大鼠模型 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、机器学习 | 高维加权基因共表达网络分析、机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的肺动脉高压患者和正常对照肺组织样本,以及野百合碱诱导的PAH大鼠模型组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2026-05-18 |
ERO1A-positive tumor epithelial cells in colorectal cancer progression: a multi-omics perspective
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02184-z
PMID:41028408
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研究论文 | 本研究采用多组学方法,整合21个多中心结直肠癌队列数据,鉴定了ERO1A阳性肿瘤上皮细胞亚群,并发现其与癌症进展和不良预后相关 | 首次鉴定出ERO1A阳性上皮细胞亚群在结直肠癌进展中的关键作用,并构建了基于该细胞亚群与肿瘤微环境相互作用的风险预测模型ETSRM,该模型优于111个现有结直肠癌模型 | 未提及明显局限 | 探讨ERO1A阳性肿瘤上皮细胞在结直肠癌进展中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 结直肠癌肿瘤上皮细胞,特别是ERO1A阳性上皮细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、批量转录组学、空间转录组学、蛋白质组学 | 风险预测模型(ETSRM) | 转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 | 2767名患者,来自21个结直肠癌队列 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 197 | 2026-05-18 |
LCN2 drives ferroptosis-associated ischemia-reperfusion injury after renal transplantation: integrated machine learning and in vivo validation
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02182-1
PMID:41205031
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研究论文 | 通过整合机器学习与体内验证,揭示LCN2在肾移植后铁死亡相关缺血再灌注损伤中的关键作用 | 首次结合加权基因共表达网络分析、113种机器学习算法和单细胞测序,系统鉴定并验证LCN2在肾移植缺血再灌注损伤中驱动铁死亡和免疫失调的核心机制,提出新型诊断框架和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类移植队列数据,LCN2抑制剂的临床转化效果和长期安全性尚需进一步验证 | 探究LCN2在肾移植后铁死亡相关缺血再灌注损伤中的作用,并构建基于机器学习的诊断模型 | 小鼠缺血再灌注损伤模型和人类肾移植队列样本 | 机器学习 | 肾脏疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 机器学习的 | 逻辑回归, 随机森林, 集成模型 | 基因表达数据, 转录组数据 | 6个小鼠IRI转录组数据集(83个样本)和2个人类移植队列(212个样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用GSE237429单细胞RNA-seq数据集 |
| 198 | 2026-05-18 |
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-12, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110925
PMID:41207622
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术,研究了寒冷暴露后皮下白色脂肪组织中胆碱能脂肪巨噬细胞的转录组可塑性和起源 | 首次对胆碱能脂肪巨噬细胞在急性热生成反应中的转录组动态进行高分辨率评估,揭示了其混合起源和寒冷诱导的广泛基因表达变化 | NA(摘要未提及局限性) | 阐明胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露中的转录组动态及其起源与身份 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠皮下白色脂肪组织样本(热中性或急性冷暴露后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2026-05-18 |
Neutrophil CD11b is a pivotal PANoptosis marker correlated with disease activity in antineutrophil cytoplasmic antibody-associated vasculitis
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02193-y
PMID:41100001
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研究论文 | 本研究鉴定CD11b为中性粒细胞PANoptosis的关键标志物,并发现其活性与ANCA相关性血管炎疾病活动度呈正相关 | 首次发现CD11b作为PANoptosis关键基因在AAV中的枢纽作用,并揭示其通过脂肪酸代谢异常调控中性粒细胞活化与PANoptosis的机制 | 未明确说明样本量大小及多中心验证,动物模型仅使用ANCA-GN小鼠,临床相关性分析可能受限于单中心数据 | 鉴定ANCA相关性血管炎中PANoptosis关键标志物并探索其与疾病活动度的关联 | AAV患者外周血中性粒细胞、尿液及血浆样本、肾活检标本、ANCA-GN小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 基因微阵列,单细胞测序,免疫荧光染色,代谢途径分析 | 综合生物信息分析 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | AAV患者血液、尿液和肾标本,ANCA-GN小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 来自GEO数据库的基因微阵列数据及小鼠单细胞测序数据 |
| 200 | 2026-05-18 |
Deciphering macrophage heterogeneity and factors driving M2 polarization in lung adenocarcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02172-3
PMID:41099999
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析肺腺癌中巨噬细胞的异质性及驱动M2极化的因素 | 首次发现BCAT1在免疫耐药患者组织中与M2巨噬细胞浸润正相关,并证实BCAT1可通过驱动M2极化促进免疫抑制微环境 | 未提及具体局限性 | 揭示肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性和可塑性,并识别影响其极化的基因 | 肺腺癌患者组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用公开数据集GSE207422 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |