单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28588 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-06-08 |
NOTCH2 disrupts the synovial fibroblast identity and the inflammatory response of epiphyseal chondrocytes
2025-May-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110206
PMID:40345585
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research paper | 研究NOTCH2信号在小鼠软骨细胞中对转录组和细胞群体的影响，特别是在炎症反应和骨关节炎中的作用 | 揭示了NOTCH2功能获得性突变如何改变软骨细胞的转录组和细胞群体，特别是对关节滑膜成纤维细胞特性的破坏 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证 | 探究NOTCH2信号在软骨细胞炎症反应和骨关节炎发病机制中的作用 | 小鼠软骨细胞，特别是NOTCH2功能获得性突变模型和条件性NOTCH2功能获得性模型 | 分子生物学 | 骨关节炎 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 两种NOTCH2功能获得性突变小鼠模型的初级骨骺细胞 |
| 182 | 2025-06-08 |
Multi-Omics Biomarkers for Predicting Efficacy of Biologic and Small-Molecule Therapies in Adults With Inflammatory Bowel Disease: A Systematic Review
2025-05, United European gastroenterology journal
IF:5.8Q1
DOI:10.1002/ueg2.12720
PMID:39656426
|
系统综述 | 本文系统综述了用于预测成人炎症性肠病患者对生物制剂和小分子药物治疗效果的多组学生物标志物 | 综合分析了多种组学方法（包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、微生物组学和代谢组学）在预测治疗效果中的应用，特别强调了多组学数据集整合模型的影响 | 研究基于PubMed文献，可能存在发表偏倚，且未涉及所有潜在生物标志物 | 推进精准医学领域，通过生物标志物预测炎症性肠病患者对不同治疗方案的响应 | 成人炎症性肠病患者 | 精准医学 | 炎症性肠病 | 多组学方法（基因组学、转录组学、蛋白质组学、微生物组学、代谢组学） | 多组学整合模型 | 多组学数据 | NA |
| 183 | 2025-06-08 |
Mechanisms of hematopoietic clonal dominance in VEXAS syndrome
2025-Apr-07, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03623-9
PMID:40195449
|
研究论文 | 本研究揭示了VEXAS综合征中造血克隆优势的机制，并提供了用于临床前研究的模型 | 首次揭示了VEXAS综合征中造血克隆优势的具体机制，并成功构建了人源化疾病模型 | 研究样本量较小（仅9名男性患者），可能限制结果的普遍性 | 探究VEXAS综合征中造血克隆优势的致病机制 | VEXAS综合征患者和构建的人源化模型 | 血液病学 | VEXAS综合征 | 单细胞转录组学、碱基编辑 | 人源化模型 | 转录组数据、表型数据 | 9名男性VEXAS综合征患者 |
| 184 | 2025-06-08 |
IL-12-producing cytokine factories induce precursor exhausted T cells and elimination of primary and metastatic tumors
2025-Apr-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010685
PMID:40169286
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research paper | 本研究评估了局部施用IL-12细胞因子工厂的安全性和抗肿瘤效果，展示了其在多种癌症类型中的治疗效果 | 利用临床可转化的细胞因子递送平台，诱导前体耗竭T细胞（Tpex）在肿瘤微环境中的分化，避免了传统IL-12治疗的毒性问题 | 研究主要基于小鼠模型和非人类灵长类动物，临床效果尚需进一步验证 | 开发一种新型免疫治疗方法，以诱导Tpex细胞的招募和系统性免疫，对抗多种实体瘤 | 前体耗竭T细胞（Tpex）、结直肠癌小鼠模型、黑色素瘤小鼠模型 | 免疫治疗 | 结直肠癌、黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、细胞因子递送平台 | NA | RNA测序数据、体内实验数据 | 9只结直肠癌小鼠、黑色素瘤小鼠模型、非人类灵长类动物 |
| 185 | 2025-06-08 |
Ferroptosis in idiopathic pulmonary fibrosis: mechanisms, impact, and therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567994
PMID:40469306
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综述 | 本文综述了铁死亡在特发性肺纤维化(IPF)中的机制、影响及治疗机会 | 整合了铁死亡生物学的最新进展，提出了针对IPF的精准抗纤维化治疗新方向 | IPF的确切病因仍不明确，铁死亡在其中的具体作用机制有待进一步研究 | 探讨铁死亡在IPF发病机制中的作用及潜在治疗策略 | 特发性肺纤维化(IPF)及其相关细胞类型(肺泡上皮细胞、巨噬细胞、成纤维细胞等) | 病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | NA | NA |
| 186 | 2025-06-08 |
Toward precision oncology in LUAD: a prognostic model using single-cell sequencing and WGCNA based on a disulfidptosis relative gene signature
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581915
PMID:40469299
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研究论文 | 本研究旨在利用单细胞测序和WGCNA构建一个基于二硫键凋亡相关基因特征的预后模型，以评估其在肺腺癌（LUAD）中的预后价值 | 首次将二硫键凋亡机制与LUAD预后模型相结合，并发现KCNK1作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 开发肺腺癌预后预测模型并探索新的治疗靶点 | 肺腺癌患者和相关的基因特征 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq, WGCNA, ssGSEA, LASSO回归 | 预后模型 | 基因表达数据 | TCGA LUAD数据集中的样本 |
| 187 | 2025-06-08 |
Exploring the landscape of Parkinson's disease transcriptomics: a quantitative review of research progress and future directions
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1505374
PMID:40469842
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综述 | 本文通过文献计量分析揭示了帕金森病转录组学领域的研究现状和新兴趋势 | 首次对2011年至2025年帕金森病转录组学研究进行全面文献计量分析，揭示了单细胞和空间转录组学技术进步推动的研究活动激增 | 数据异质性和生物标志物验证高失败率等挑战依然存在 | 探索帕金森病转录组学的研究进展和未来方向 | 帕金森病转录组学相关文献 | 生物信息学 | 帕金森病 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 208篇研究文章 |
| 188 | 2025-06-08 |
Expression and potential regulatory mechanism of cellular senescence-related genes in Alzheimer's disease based on single-cell and bulk RNA datasets
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1595847
PMID:40470298
|
research paper | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模测序数据，识别了阿尔茨海默病中细胞衰老相关基因的调控枢纽，并探索了潜在的分子机制和治疗靶点 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据，系统分析了AD中细胞衰老相关基因的调控网络，并鉴定了特定细胞亚型中的关键基因 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索细胞衰老在阿尔茨海默病发病机制中的作用并寻找潜在治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者脑组织中的不同细胞亚型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，但分析了7种细胞亚型 |
| 189 | 2025-06-08 |
Biological and prognostic insights into the prostaglandin D2 signaling axis in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1562261
PMID:40474982
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA数据分析，探索了肺腺癌肿瘤微环境中前列腺素D2信号轴的作用及其预后意义 | 首次在肺腺癌中系统性地研究了前列腺素D2信号轴的细胞间通讯机制及其临床意义 | 研究主要基于计算推断，部分结果需要更多实验验证 | 探索肺腺癌肿瘤微环境中代谢物介导的细胞间通讯机制 | 肺腺癌肿瘤微环境中的细胞类型和代谢物 | 肿瘤微环境 | 肺腺癌 | scRNA-seq, RT-qPCR, 免疫荧光 | MEBOCOST, ESTIMATE, ssGSEA | 单细胞RNA数据, 批量RNA数据 | TCGA-LUAD数据集和两个GEO数据集 |
| 190 | 2025-06-08 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses reveal elevated amino acid metabolism promoting tumor-directed immune evasion in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575829
PMID:40475762
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析，揭示了结直肠癌中氨基酸代谢升高促进肿瘤导向的免疫逃逸 | 开发了一个基于AUCell算法的氨基酸代谢评分，并构建了一个31基因的AA评分和6基因的风险评分，用于预测PD-1阻断治疗的响应和预后 | 样本量相对较小，仅包括17名接受PD-1阻断治疗的CRC患者和23名CRC患者的独立数据集 | 探究结直肠癌中氨基酸代谢与免疫逃逸的关系，并开发预测预后和药物敏感性的工具 | 结直肠癌患者的肿瘤细胞和肿瘤浸润免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、LASSO和Cox回归分析 | AUCell算法、机器学习 | 转录组数据 | 17名接受PD-1阻断治疗的CRC患者的46,374个上皮细胞和23名CRC患者的独立数据集 |
| 191 | 2025-06-08 |
Expression of PSMD14 in lung adenocarcinoma and its impact on immune cell infiltration and prognosis: a comprehensive analysis based on RNA and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560693
PMID:40475775
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research paper | 本研究探讨了PSMD14在肺腺癌中的表达及其对免疫细胞浸润和预后的影响 | 首次全面分析了PSMD14在肺腺癌中的表达及其与免疫细胞浸润和患者预后的关系，并整合了RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分有限 | 探索PSMD14在肺腺癌中的表达及其对肿瘤免疫和临床结果的影响 | 肺腺癌患者样本及相关的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | digital pathology | lung cancer | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 免疫组化图像 | 肺腺癌患者样本及公开数据集中的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 |
| 192 | 2025-06-08 |
Metabolic profiles in laryngeal cancer defined two distinct molecular subtypes with divergent prognoses
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1512502
PMID:40475768
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research paper | 该研究通过综合分析转录组、突变、甲基化和单细胞RNA测序数据，确定了与代谢相关的喉癌亚型，并开发了预后和诊断模型 | 首次通过多组学数据定义了喉癌的两种代谢相关分子亚型，并开发了高性能的诊断和预后预测模型 | 样本量相对有限（114例），且需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索喉癌的代谢相关分子亚型及其对预后的影响 | 喉癌患者 | digital pathology | laryngeal cancer | 转录组测序, 突变分析, 甲基化分析, 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归, Random Forest算法 | 基因组数据, 转录组数据, 甲基化数据 | 114例喉癌患者（来自TCGA数据库） |
| 193 | 2025-06-08 |
Tumor-infiltrating lymphocytes in cancer immunotherapy: from chemotactic recruitment to translational modeling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1601773
PMID:40475782
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综述 | 本文综述了肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）在癌症免疫治疗中的作用及其研究进展 | 探讨了TILs的表型和功能多样性，以及其在肿瘤微环境中的动态相互作用，并强调了新兴技术在TIL生物学研究中的应用 | 未提及具体临床应用的局限性 | 探讨TILs在癌症免疫治疗中的作用及其研究进展 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）及其在肿瘤微环境中的动态相互作用 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞测序、新抗原预测、生物材料平台 | 3D肿瘤球体、类器官共培养、同源小鼠模型、人源化系统 | NA | NA |
| 194 | 2025-06-08 |
stGuide advances label transfer in spatial transcriptomics through attention-based supervised graph representation learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1566675
PMID:40476268
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research paper | 本文提出了一种基于注意力机制的监督图学习模型stGuide，用于空间转录组学中的跨切片对齐和高效标签转移 | stGuide利用参考注释引导的监督表示，通过注意力机制将查询切片映射到共享嵌入空间，并通过最近邻信息分配点级标签 | NA | 解决空间转录组学数据中的批次效应、不平衡参考注释和组织异质性等问题，实现高效的标签转移 | 人类背外侧前额叶皮层和乳腺癌数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 注意力机制监督图学习 | attention-based supervised graph learning model | 空间转录组数据 | NA |
| 195 | 2025-06-08 |
Identifying genetic variants that influence the abundance of cell states in single-cell data
2024-Oct, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01909-1
PMID:39327486
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Genotype-Neighborhood Associations (GeNA)的统计工具，用于在高维单细胞数据中识别影响细胞状态丰度的遗传变异 | GeNA工具无需预定义细胞状态，灵活识别与遗传变异最相关的细胞状态丰度 | 研究仅基于969名个体的外周血单细胞RNA测序数据，可能需要更大样本量验证 | 识别影响单细胞数据中细胞状态丰度的遗传变异 | 单细胞RNA测序数据中的免疫细胞状态 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | GeNA统计模型 | 单细胞RNA测序数据 | 969名个体的外周血样本 |
| 196 | 2025-06-08 |
Mapping the cellular biogeography of human bone marrow niches using single-cell transcriptomics and proteomic imaging
2024-Jun-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.04.013
PMID:38714197
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和蛋白质组学成像技术，绘制人类骨髓微环境的细胞生物地理学图谱 | 首次整合单细胞RNA测序和CODEX空间分析技术，揭示了人类骨髓中非造血细胞的异质性及其空间组织，并预测了造血细胞与非造血细胞亚群之间的相互作用 | 样本来源和数量可能限制了结果的普遍性，且技术整合的复杂性可能影响数据解读 | 研究人类骨髓中非造血细胞的异质性及其空间组织，以理解其对造血过程的贡献 | 人类骨髓中的非造血细胞和造血细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病（AML） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、共检测索引（CODEX） | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组成像数据 | 29,325个非造血细胞和53,417个造血细胞，以及超过120万个细胞的空间分析 |
| 197 | 2025-06-08 |
Metabolic regulator ERRγ governs gastric stem cell differentiation into acid-secreting parietal cells
2024-Jun-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.016
PMID:38733994
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研究论文 | 该研究通过小鼠模型和人类胃细胞，揭示了代谢调节因子ERRγ在胃干细胞分化为分泌胃酸的壁细胞过程中的关键作用 | 首次发现ERRγ在壁细胞分化中的核心作用，并详细描述了壁细胞分化的分子、细胞和超微结构阶段 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明壁细胞分化的分子机制 | 胃干细胞和壁细胞 | 细胞生物学 | 胃部疾病 | scRNA-seq | 小鼠模型和人类胃细胞器官模型 | 基因表达数据和细胞形态数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和人类胃细胞 |
| 198 | 2025-06-08 |
Interleukin-36γ-producing macrophages drive IL-17-mediated fibrosis
2019-10-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aax4783
PMID:31604843
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，研究了生物材料和合成材料植入后巨噬细胞的功能亚群及其在组织修复和纤维化中的作用 | 发现了CD9IL-36γ巨噬细胞亚群，这些巨噬细胞在缺乏IL-17受体的小鼠中几乎不存在，表明它们可能参与IL-17依赖的免疫和自身免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型，人类组织样本的验证仍需进一步研究 | 研究巨噬细胞亚群在生物材料和合成材料植入后的功能及其在组织修复和纤维化中的作用 | 巨噬细胞亚群 | 免疫学 | 纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠和人类组织样本 |
| 199 | 2025-06-08 |
Lifting the veil on macrophage diversity in tissue regeneration and fibrosis
2019-10-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aaz0749
PMID:31604845
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research paper | 该研究使用单细胞RNA测序技术揭示了巨噬细胞在组织修复和纤维化中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞多样性在组织修复和纤维化中的具体作用 | NA | 研究巨噬细胞在组织修复和纤维化过程中的作用机制 | 巨噬细胞 | 生物医学 | 纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 200 | 2025-06-07 |
Identification of macrophage-associated diagnostic biomarkers and molecular subtypes in gestational diabetes mellitus based on machine learning
2025-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2025.2513893
PMID:40476676
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research paper | 该研究通过整合scRNA-seq和RNA-seq数据，探索了与巨噬细胞相关的妊娠期糖尿病(GDM)诊断基因和亚型 | 提出了CB-DSNMF算法用于识别GDM亚型，并构建了基于内皮细胞转录组的高精度诊断模型 | 未提及样本量是否足够大以验证模型的普适性 | 探索GDM的分子机制并开发诊断工具 | 妊娠期糖尿病(GDM)患者 | machine learning | gestational diabetes mellitus | scRNA-seq, RNA-seq | ensemble machine learning algorithms, CB-DSNMF | gene expression data | NA |