单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28482 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-06-05 |
Targeting INF2 with DiosMetin 7-O-β-D-Glucuronide: a new stratagem for colorectal cancer therapy
2025-Jun-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14357-9
PMID:40452021
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习技术，识别INF2作为结直肠癌的特异性生物标志物，并发现DiosMetin 7-O-β-D-Glucuronide作为INF2抑制剂具有潜在的治疗价值 | 首次将INF2识别为结直肠癌的特异性生物标志物，并发现天然化合物DiosMetin 7-O-β-D-Glucuronide作为其抑制剂 | 未提及样本量大小，且研究结果需进一步临床验证 | 开发针对结直肠癌的靶向治疗策略 | 结直肠癌组织和细胞 | 生物医学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、机器学习、免疫组织化学、细胞生物学实验、计算对接 | NA | RNA测序数据、图像数据 | NA |
| 182 | 2025-06-05 |
Novel roles for CREG1 in hematopoiesis revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Jun-01, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01407-9
PMID:40452027
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示CREG1在造血过程中的新作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究CREG1在成年斑马鱼造血发育中的功能，揭示了CREG1在调节B细胞、T/NK细胞和红细胞发育中的关键作用 | 研究仅针对斑马鱼模型，人类造血系统中CREG1的作用仍需进一步验证 | 探究CREG1在造血过程中的功能及其分子机制 | 成年斑马鱼的肾脏骨髓细胞 | 生物医学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 斑马鱼模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，使用creg1缺陷型斑马鱼作为研究对象 |
| 183 | 2025-06-05 |
Single-cell and spatial transcriptome profiling identifies cellular heterogeneity and immunosuppressive tumor microenvironment in inflammatory breast cancer
2025-Jun-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.061
PMID:40460936
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示炎症性乳腺癌的细胞异质性和免疫抑制性肿瘤微环境 | 首次在单细胞和空间水平上分析了炎症性乳腺癌的免疫细胞群和信号通路，并发现CXCL13表达降低与患者预后不良相关，同时筛选出两种潜在的免疫调节天然产物 | 研究样本量未明确说明，且天然产物的免疫调节作用需进一步验证 | 解析炎症性乳腺癌的病理和分子基础，开发精准医疗策略 | 炎症性乳腺癌（IBC）和非炎症性乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qRT-PCR、荧光染色、NanoString GeoMx数字空间分析仪、肿瘤-免疫细胞共培养实验 | NA | RNA测序数据、空间转录组数据 | NA |
| 184 | 2025-06-05 |
Spatial Transcriptomics Shows a Distinctive Tumour Microenvironment in the Invasive Versus Premalignant Portion of Early Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2025-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70125
PMID:40462294
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术研究早期皮肤鳞状细胞癌（SCC）在侵袭性部分与癌前部分的肿瘤微环境差异 | 首次利用NanoString GeoMx DSP技术对早期皮肤SCC的侵袭性和癌前部分的肿瘤微环境进行空间转录组学分析，揭示了不同细胞类型中基因表达的差异 | 研究样本量较小（17例患者），且为回顾性研究 | 探究皮肤鳞状细胞癌从癌前病变（AK）向恶性转变过程中肿瘤微环境的基因表达变化 | 早期皮肤鳞状细胞癌组织样本中的肿瘤细胞、免疫细胞和成纤维细胞 | 数字病理 | 皮肤鳞状细胞癌 | 空间转录组学（NanoString GeoMx DSP） | NA | 基因表达数据 | 17例患者的早期皮肤SCC组织样本 |
| 185 | 2025-06-05 |
MACanalyzeR scRNAseq analysis tool reveals PPARγHIGH/GDF15HIGH lipid-associated macrophages facilitate thermogenic expansion in BAT
2025-May-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60295-2
PMID:40450001
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研究论文 | 介绍了一种名为MACanalyzeR的单细胞RNA测序工具，用于全面分析单核细胞/巨噬细胞的代谢特征，并揭示了PPARγHIGH/GDF15HIGH脂质相关巨噬细胞在棕色脂肪组织热生成扩展中的作用 | 开发了MACanalyzeR工具，首次识别出PPARγHIGH/GDF15HIGH脂质相关巨噬细胞亚群在棕色脂肪组织热生成中的关键作用 | 研究仅基于肥胖雄性小鼠模型，未涉及人类或其他性别样本 | 探究巨噬细胞在棕色脂肪组织功能调控中的作用机制 | 肥胖雄性小鼠(db/db和高脂饮食喂养小鼠)的棕色脂肪组织 | 免疫代谢 | 肥胖 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 肥胖雄性小鼠模型(db/db和HFD-fed小鼠) |
| 186 | 2025-06-05 |
BPIFB1 is a prognostic biomarker and mediated collagen synthesis in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-May-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042671
PMID:40441200
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研究论文 | 本研究探讨了BPIFB1在特发性肺纤维化(IPF)中的表达及其与预后的关系，揭示了BPIFB1在肺纤维化过程中的分子作用 | 首次发现BPIFB1在IPF中高表达，并与其不良预后相关，同时揭示了BPIFB1可能通过调节肺成纤维细胞分化和胶原合成参与IPF的发病机制 | BPIFB1在血液中的表达水平在对照组和IPF患者中相似，限制了其作为血液生物标志物的应用 | 探究BPIFB1在特发性肺纤维化中的分子作用及其与预后的关系 | 特发性肺纤维化患者和对照组的基因表达数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、转录组分析、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，使用了Gene Expression Omnibus数据库的数据 |
| 187 | 2025-06-05 |
Precision targeting of β-catenin induces tumor reprogramming and immunity in hepatocellular cancers
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60457-2
PMID:40442146
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研究论文 | 该研究探讨了针对β-catenin的精准靶向治疗在肝细胞癌（HCC）中的肿瘤重编程和免疫调节作用 | 研究使用了一种新型的siRNA（LNP-CTNNB1）靶向CTNNB1，并在多种β-catenin突变的免疫活性HCC模型中显示出显著的肿瘤反应，同时揭示了β-catenin抑制对免疫调节转录因子和免疫信号通路的激活作用 | 研究主要基于动物模型和有限的临床数据，尚未在广泛人群中验证其效果 | 探索β-catenin靶向治疗在肝细胞癌中的疗效及其与免疫检查点抑制剂（ICI）的联合应用潜力 | β-catenin突变的肝细胞癌（HCC）模型和患者样本 | 肿瘤免疫治疗 | 肝细胞癌 | siRNA技术、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、临床数据 | 多种β-catenin突变的免疫活性HCC模型及IMbrave150 III期试验患者队列 |
| 188 | 2025-06-05 |
Bronchopulmonary dysplasia with pulmonary hypertension associates with semaphorin signaling loss and functionally decreased FOXF1 expression
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60371-7
PMID:40442177
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了早产儿肺部损伤导致的支气管肺发育不良（BPD）及伴随的肺动脉高压（PH）的细胞和分子机制 | 研究发现BPD+PH患者中存在独特的异常毛细血管细胞状态，并揭示了semaphorin信号通路在正常肺发育中的关键作用 | 研究样本可能有限，且机制研究主要在动物模型中进行验证 | 识别人类BPD的潜在细胞和分子驱动因素 | 早产儿肺部组织（BPD和BPD+PH患者）与足月婴儿的对比 | 分子生物学 | 支气管肺发育不良（BPD）和肺动脉高压（PH） | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 早产儿和足月婴儿的肺部组织样本（具体数量未提及） |
| 189 | 2025-06-05 |
Construction and validation of a lipid metabolism-related genes prognostic signature for skin cutaneous melanoma
2025-May-29, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152115
PMID:40460484
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研究论文 | 本研究构建并验证了一个与脂质代谢相关基因（LMGs）相关的预后特征，用于预测皮肤黑色素瘤（SKCM）患者的生存结果 | 首次构建了基于脂质代谢相关基因的预后特征，并验证其在SKCM中的独立预后价值，同时通过实验验证了关键基因CCNA2的功能 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在样本选择偏差，且实验验证仅针对一个关键基因 | 探讨脂质代谢相关基因在SKCM中的功能作用及预后意义 | 皮肤黑色素瘤（SKCM）患者 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | mRNA测序、单细胞RNA测序、NMF算法、WGCNA、LASSO回归、Cox回归分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据、临床随访数据 | 来自TCGA和GEO数据库的SKCM患者数据，外部验证队列包括GSE65904和GSE54467 |
| 190 | 2025-06-05 |
[Progress in investigating astrocyte heterogeneity after spinal cord injury based on single-cell sequencing technology]
2025-May-25, Zhongguo gu shang = China journal of orthopaedics and traumatology
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在脊髓损伤后星形胶质细胞异质性研究中的进展 | 利用单细胞测序技术揭示了脊髓损伤后星形胶质细胞的异质性及其与神经再生修复的关联 | 目前所有发现仍需更多基础研究和充分的临床试验验证 | 探索单细胞测序技术在脊髓损伤后星形胶质细胞研究中的应用 | 脊髓损伤后的星形胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 191 | 2025-06-05 |
ICOS+CD4+ T cells define a high susceptibility to anti-PD-1 therapy-induced lung pathogenesis
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186483
PMID:40198121
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研究论文 | 研究探讨了抗PD-1治疗引起的肺毒性机制，特别是在老年小鼠模型中ICOS+CD4+ T细胞的作用 | 揭示了ICOS+CD4+ T细胞在老年环境中对抗PD-1治疗引起的肺毒性中的关键作用，并提出了ICOS-ICOSL相互作用的干预策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证有限 | 探索抗PD-(L)1治疗引起的免疫相关不良事件（irAEs）的细胞机制 | 老年小鼠模型和癌症患者的CD4+ T细胞 | 免疫治疗 | 肺癌 | 单细胞转录组学，过继性T细胞转移 | 小鼠模型 | 基因表达数据，临床数据 | 老年和年轻小鼠模型，部分癌症患者样本 |
| 192 | 2025-06-05 |
Characterization of a pathogenic nonmigratory fibroblast population in systemic sclerosis skin
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185618
PMID:40232859
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research paper | 该研究鉴定了系统性硬化症（SSc）皮肤中一种致病性的非迁移性成纤维细胞群体 | 发现了一种未被传统外植体培养方法分离的非迁移性成纤维细胞群体，并揭示了其在系统性硬化症不同阶段的致病作用 | 研究主要基于体外实验和基因表达分析，需要进一步体内实验验证 | 探究系统性硬化症皮肤中不同成纤维细胞群体的致病机制 | 系统性硬化症患者的皮肤成纤维细胞 | digital pathology | systemic sclerosis | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, multichannel immunofluorescence | NA | gene expression data, immunofluorescence images | 系统性硬化症患者的皮肤活检样本 |
| 193 | 2025-06-05 |
Transcriptional signatures of endothelial cells shape immune responses in cardiopulmonary health and disease
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191059
PMID:40401523
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review | 本文综述了心肺血管系统中内皮细胞（ECs）在健康和疾病状态下对免疫反应的调控作用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了心肺血管系统中内皮细胞的异质性及其免疫调节特性 | NA | 探讨内皮细胞在心肺健康和疾病中的免疫调节功能 | 心肺血管系统中的内皮细胞 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 194 | 2025-06-05 |
Microglia activation orchestrates CXCL10-mediated CD8+ T cell recruitment to promote aging-related white matter degeneration
2025-May-22, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01955-w
PMID:40404995
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研究论文 | 研究揭示了小胶质细胞激活通过CXCL10介导的CD8+ T细胞招募促进衰老相关白质退化的机制 | 揭示了CXCL10-CXCR3轴在衰老白质中CD8 T细胞招募和保留中的关键作用，以及这些细胞对白质退化的致病影响 | 研究主要基于小鼠模型，人类衰老白质退化的直接证据仍需进一步研究 | 探究衰老相关白质退化中小胶质细胞的功能及其与免疫系统的相互作用 | 小鼠的髓鞘化轴突和白质 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 195 | 2025-06-05 |
Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T-Cell Treatment Efficacy
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.13.653878
PMID:40463198
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学分析，发现低强度I型干扰素信号可增强CAR T细胞治疗r/r DLBCL的疗效 | 提出了一种利用低强度I型干扰素信号增强CAR T细胞疗效的新策略，并验证了其在不同共刺激信号CAR T细胞中的普适性 | 研究样本量较小（8例患者），需要在更大规模临床试验中验证 | 提高CD19靶向CAR T细胞治疗复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤的疗效 | 复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 8例r/r DLBCL患者 |
| 196 | 2025-06-05 |
Longitudinal single-cell analysis reveals RUNX1T1 as an early driver in treatment-induced neuroendocrine transdifferentiation
2025-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653660
PMID:40463134
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研究论文 | 该研究通过纵向单细胞转录组测序揭示了RUNX1T1作为治疗诱导神经内分泌转分化早期驱动因子的作用 | 首次发现t-NEPC发展过程中的早期中间过渡细胞状态，并鉴定RUNX1T1为NEPC转分化的关键转录调控因子 | 研究基于PDX模型，可能不完全反映人类肿瘤的复杂性 | 阐明治疗诱导神经内分泌前列腺癌(t-NEPC)发展的分子机制 | 前列腺癌腺癌向神经内分泌癌转分化过程 | 数字病理学 | 前列腺癌 | scRNA-seq | PDX模型 | 单细胞转录组数据 | 7个时间点的LTL331/331R PDX模型样本 |
| 197 | 2025-06-05 |
Prg4+ fibro-adipogenic progenitors in muscle are crucial for bone fracture repair
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.654160
PMID:40462922
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研究论文 | 本文研究了肌肉中Prg4+纤维脂肪祖细胞在骨折修复中的关键作用 | 揭示了Prg4+纤维脂肪祖细胞在骨折修复中的新机制，即这些细胞可以从肌肉迁移到骨折部位并分化为软骨细胞、成骨细胞和骨细胞 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证；在膜内骨损伤模型中，Prg4+ FAPs的贡献显著低于骨折模型 | 探究肌肉细胞在骨折修复中的作用机制 | 小鼠模型中的Prg4+纤维脂肪祖细胞 | 骨科学 | 骨折 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠骨折模型和膜内骨损伤模型 | 基因表达数据和细胞定位数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了小鼠模型进行研究 |
| 198 | 2025-06-05 |
Selective GSK3α Inhibition Promotes Self-Renewal Across Different Stem Cell States
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.653860
PMID:40463072
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研究论文 | 本研究揭示了选择性抑制GSK3α通过BRD0705促进多种干细胞状态的自我更新能力 | 首次发现选择性GSK3α抑制剂BRD0705可独立于β-catenin信号通路支持多种干细胞的长期自我更新，并开发出能稳定共培养不同多能干细胞状态的BRD0705/IWR1组合培养体系 | 研究仅在小鼠干细胞模型中进行，尚未验证其在人类干细胞中的适用性 | 探究选择性GSK3α抑制对干细胞自我更新能力的调控作用 | 小鼠胚胎干细胞(ESCs)、外胚层干细胞(EpiSCs)和神经干细胞(NSCs) | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、表观基因组分析 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 多种小鼠干细胞系（具体数量未明确说明） |
| 199 | 2025-06-05 |
Single-Cell RNA Sequencing and Inferred Protein Activity Analysis Reveal a Distinct Tumor Phenotype in Early-Onset Colorectal Cancer Patients
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.15.653154
PMID:40462964
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research paper | 通过单细胞RNA测序和推断的蛋白质活性分析，揭示了早发性结直肠癌患者的独特肿瘤表型 | 整合公共数据和内部临床样本，结合scRNA-seq和mIF技术，首次定义了EO-CRC中一个以前未被识别的上皮亚群，该亚群以TLR4和CCR5的高表达为特征 | 研究样本量可能有限，且仅比较了EO-CRC和LO-CRC，未涉及其他类型的结直肠癌 | 探究早发性结直肠癌（EO-CRC）与晚发性结直肠癌（LO-CRC）在分子和微环境驱动因素上的差异 | 早发性结直肠癌（EO-CRC）和晚发性结直肠癌（LO-CRC）患者 | digital pathology | colorectal cancer | scRNA-seq, mIF, VIPER | NA | RNA sequencing data, immunofluorescence data | 公共数据和内部临床样本（具体数量未提及） |
| 200 | 2025-06-05 |
High-Resolution Spatial Profiling of Microglia Reveals Proximity Associated Immunometabolic Reprogramming in Alzheimer's Disease
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654329
PMID:40462993
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研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学技术揭示阿尔茨海默病中小胶质细胞的免疫代谢重编程 | 首次提供了跨物种、解剖区域和AD病理负担的小胶质细胞免疫代谢状态的高分辨率图谱 | 研究依赖于小鼠模型和人类尸检组织，可能无法完全反映活体情况 | 探究阿尔茨海默病病理标志物附近小胶质细胞基因表达与代谢特征的关系 | PS19、APP/PS1和5xFAD小鼠模型及人类死后背外侧前额叶皮层组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 高分辨率空间转录组学(Xenium平台) | 机器学习 | 空间转录组数据 | 三种小鼠模型和人类尸检组织 |