单细胞与空转测序相关文章

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序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
1	2026-06-13	Jinhuang San alleviates plasma cell mastitis by restoring Th17/Treg balance through the HTR7/IL-6/JAK2/STAT3 axis 2026-Oct-28, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.jep.2026.121965 PMID:42242601	研究论文	探究金黄散通过HTR7/IL-6/JAK2/STAT3轴恢复Th17/Treg平衡缓解浆细胞性乳腺炎的机制	首次揭示金黄散通过调控巨噬细胞中HTR7/IL-6/JAK2/STAT3轴恢复Th17/Treg平衡来治疗浆细胞性乳腺炎的分子机制	缺乏临床样本验证，虚拟HTR7敲除的模拟分析可能无法完全反映体内真实情况	阐明金黄散治疗浆细胞性乳腺炎的作用机制	浆细胞性乳腺炎小鼠模型和巨噬细胞-CD4+ T细胞共培养体系	NA	浆细胞性乳腺炎	转录组测序, 单细胞RNA测序, UPLC-Q-Orbitrap-MS/MS	NA	转录组数据, 单细胞RNA测序数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
2	2026-06-13	LC3B promotes bladder cancer cell proliferation via the Sp1-cyclin D1/p27 axis with pan-cancer clinical associations 2026-Sep, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112560 PMID:42066829	研究论文	该研究揭示了LC3B通过Sp1-cyclin D1/p27轴促进膀胱癌细胞增殖的机制，并评估了其在多种癌症中的临床相关性	首次发现LC3B通过非经典自噬途径调控细胞周期，即通过增强Sp1介导的Cyclin D1转录并抑制p27表达，促进G1/S期转换，从而驱动膀胱癌细胞增殖	LC3B的非脂化依赖性功能机制尚未完全阐明，且泛癌分析主要基于转录组数据，缺乏蛋白水平的验证	阐明LC3B在膀胱癌中的表达模式、生物学功能和分子机制，并评估其在多种人类癌症中的临床相关性	膀胱癌上皮细胞以及T24T和J82膀胱癌细胞系	机器学习	膀胱癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	涉及膀胱癌T24T和J82细胞系，以及多种肿瘤类型的泛癌分析数据	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
3	2026-06-13	The BTN3A3-TOMM22 axis preserves mitochondrial homeostasis to facilitate HCC stemness and drug resistance 2026-Sep-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2026.218557 PMID:42069175	研究论文	该研究利用整合组学和实验验证，发现BTN3A3通过与TOMM22相互作用维持线粒体稳态，促进肝癌干性和耐药性，并揭示了pan-BTN3单克隆抗体5E08的潜在治疗价值	首次揭示BTN3A3在肝癌中通过非免疫途径驱动线粒体重编程促进干性和耐药的新机制，并发现TOMM22是BTN3A3的新型相互作用蛋白	未明确说明研究局限性	探究线粒体功能与肝癌干性之间的分子机制，寻找新的治疗靶点	BTN3A3、TOMM22、肝细胞癌（HCC）细胞系、CD90/EpCAM癌症干细胞、原位异种移植模型、患者来源类器官（PDOs）	数字病理学	肝癌	批量转录组学、单细胞转录组学、质谱分析、免疫共沉淀、原位异种移植模型、患者来源类器官	NA	转录组数据、蛋白质相互作用数据	涉及HCC细胞系、原位异种移植模型和患者来源类器官	NA	单细胞RNA-seq、批量RNA-seq	NA	NA
4	2026-06-13	Targeting dysregulated glycolysis in type 2 diabetic osteoporosis: Identification of a diagnostic gene signature and therapeutic validation of calcifediol 2026-Sep-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2026.124473 PMID:42184924	研究论文	结合生物信息学与实验验证，鉴定2型糖尿病骨质疏松（T2DOP）中与糖酵解失调相关的诊断基因特征，并验证骨化二醇的治疗效果	首次综合运用差异表达分析、WGCNA、113种机器学习算法和scRNA-seq，系统鉴定T2DOP糖酵解相关核心生物标志物，并通过分子对接和体内实验验证骨化二醇的治疗潜力	骨化二醇的临床价值需在后续研究中进一步验证	探究2型糖尿病骨质疏松中糖酵解相关基因的机制，并筛选潜在治疗药物	2型糖尿病骨质疏松患者及T2D小鼠模型	机器学习	2型糖尿病骨质疏松	生物信息学分析、scRNA-seq、分子对接	机器学习模型（113种算法）	基因表达数据、单细胞转录组数据	骨质疏松与2型糖尿病数据集的合并数据	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
5	2026-06-13	A GPCR atlas across human microglial states in Alzheimer's disease: Insights from snRNA-seq and hiPSC models 2026-Sep, Experimental neurology IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115845 PMID:42173233	综述	系统回顾了2020至2025年间基于人脑组织的snRNA-seq研究，分析了阿尔茨海默病中五种关键小胶质细胞状态的GPCR表达特征，并结合hiPSC模型数据优先筛选出保守的候选GPCR	首次系统整合snRNA-seq与hiPSC衍生小胶质细胞数据，全面解析阿尔茨海默病不同小胶质细胞状态下的GPCR差异表达谱，并筛选出高兴趣的保守GPCR候选靶点	主要基于已发表研究的再分析，可能受原始数据质量和分析流程差异影响；hiPSC模型与真实人脑微环境存在差异，限制了部分发现的直接转化	阐明阿尔茨海默病中小胶质细胞不同状态的GPCR表达特征及潜在功能，为药物研发提供候选靶点	阿尔茨海默病相关的小胶质细胞状态（疾病相关、tau相关、炎症相关、增殖相关和干扰素相关小胶质细胞）	数字病理学	阿尔茨海默病	snRNA-seq, 单细胞测序	NA	基因表达数据, 转录组数据	NA	NA	单核RNA测序, 单细胞RNA测序	NA	NA
6	2026-06-13	Rheumatoid arthritis synovial fibroblasts promote the glycolysis of myeloid-derived suppressor cells via TREM1/mTOR axis 2026-Sep-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116961 PMID:42242136	研究论文	通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示类风湿关节炎中成纤维样滑膜细胞通过TREM1/mTOR轴促进髓系抑制细胞糖酵解的机制	首次阐明TREM1信号在介导成纤维样滑膜细胞与髓系抑制细胞交互作用中的关键角色，并揭示其通过PI3K-AKT-mTOR-HIF-1α级联驱动糖酵解重编程的机制	未提供明显局限性信息	探究类风湿关节炎中髓系抑制细胞代谢重编程的驱动因素及调控机制	类风湿关节炎患者的髓系抑制细胞和成纤维样滑膜细胞（MH7a细胞）	机器学习和数字病理学	类风湿关节炎	单细胞RNA测序、流式细胞术、空间转录组学、细胞外酸化率检测、葡萄糖摄取和乳酸生成检测	NA	单细胞转录组数据、空间转录组数据、代谢检测数据	未明确说明样本数量	10x Genomics	单细胞RNA测序, 空间转录组学	10x Chromium, 10x Visium	10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学分析
7	2026-06-13	Tepraloxydim metabolite exposure disrupts placental function revealed by single-cell sequencing and metabolomics 2026-Aug-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2026.154073 PMID:42229169	研究论文	本研究结合单细胞RNA测序和代谢组学，系统探究除草剂tepraloxydim代谢物DMP对小鼠胎盘细胞组成、转录程序和代谢稳态的影响	首次系统揭示DMP通过代谢重编程和细胞命运改变破坏胎盘结构与功能的机制	未提及，摘要中无相关信息	探究DMP对胎盘发育的影响及其潜在机制	小鼠胎盘组织	数字病理学	妊娠相关疾病	单细胞RNA测序, 代谢组学	无特定模型	表达谱数据, 代谢物数据	小鼠模型，具体样本数量未提及	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
8	2026-06-13	Inferring gene regulatory networks via adversarially regularized directed graph autoencoder 2026-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2026.108762 PMID:41775092	研究论文	提出通过对抗正则化有向图自编码器推断基因调控网络的方法	结合一阶和二阶邻近度捕获复杂拓扑结构，并通过对抗训练策略将目标向量正则化为基因表达数据的先验分布，以保持生物统计特性	未明确指出具体限制，但可能依赖于高质量的训练数据和网络拓扑假设	开发一种能够处理基因调控网络复杂拓扑和非同分布基因表达数据的新型推断方法	基因调控网络、基因表达数据	机器学习	NA	单细胞RNA测序	有向图自编码器、生成对抗网络	基因表达数据	DREAM5数据集和七个单细胞RNA测序数据集	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
9	2026-06-13	scDCL: A multi-view single-cell RNA sequencing clustering method based on dual contrastive learning 2026-Aug, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2026.108998 PMID:41791270	研究论文	提出一种名为scDCL的多视图单细胞RNA测序聚类方法，通过双对比学习整合ZINB掩码自编码器、图神经网络和双对比学习，以同时捕捉细胞内在特征和全局结构特征	首次将ZINB掩码自编码器、图神经网络和双对比学习集成在一个统一框架中，通过多视图特征生成和双重对比损失来增强聚类紧凑性和分离性，同时保持结构一致性	未提及具体的局限性	解决单细胞RNA-seq数据中高稀疏性、强非线性和极端维度带来的聚类挑战，提高聚类性能	单细胞RNA测序数据中的细胞群体	机器学习	NA	scRNA-seq	ZINB掩码自编码器、图神经网络、双对比学习	基因表达数据	多个公开数据集	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
10	2026-06-13	GLUL drives metabolic reprogramming and confers docetaxel resistance in prostate cancer 2026-Aug, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2026.118008 PMID:42044811	研究论文	该论文发现谷氨酸-氨连接酶（GLUL）驱动前列腺癌代谢重编程并导致多西他赛耐药	首次将GLUL确定为多西他赛耐药的关键代谢驱动因子，并揭示谷氨酰胺合成作为去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中可药用的脆弱点	未提及具体局限性	探索前列腺癌中多西他赛耐药的代谢决定因素及GLUL的作用机制	前列腺癌临床样本、细胞系及异种移植模型	机器学习和数字病理的交叉领域	前列腺癌	转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、代谢物数据	临床样本及独立队列验证	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台
11	2026-06-13	Single-cell RNA sequencing unveils CD8+ T cell heterogeneity in the diffuse large B-cell lymphoma microenvironment: A systematic review 2026-Aug, Critical reviews in oncology/hematology DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105381 PMID:42144172	系统综述	通过单细胞RNA测序揭示弥漫大B细胞淋巴瘤微环境中CD8+ T细胞的异质性	首次系统性整合单细胞RNA测序研究，构建了弥漫大B细胞淋巴瘤中CD8+ T细胞的动态耗竭轨迹图谱，发现了Tpex亚群与预后的关联以及CXCR5+TCF7+ S1亚群对化疗敏感性的预测作用	未进行荟萃分析，仅基于定性系统综述; 需要未来多中心研究验证CD58和CD8-fit等新靶点	系统综述单细胞RNA测序研究以刻画弥漫大B细胞淋巴瘤中CD8+ T细胞的异质性及其临床意义	弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的CD8+ T细胞	自然语言处理	弥漫大B细胞淋巴瘤	单细胞RNA测序	不适用	基因表达数据	18项合格研究，具体样本量未说明	不适用	不适用	不适用	不适用
12	2026-06-13	Loss of foxp3a drives sex-specific immune-metabolic remodeling across the gut-liver-gonad axis in zebrafish 2026-Aug, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1 DOI:10.1016/j.fsi.2026.111461 PMID:42214511	研究论文	研究发现foxp3a缺失导致斑马鱼肠道-肝脏-性腺轴出现性别特异性免疫代谢重塑	首次证明foxp3a是哺乳动物FOXP3的功能性斑马鱼同源物，并揭示其在性别差异性黏膜免疫调控中的关键作用	未明确说明研究局限性	探究foxp3a在性别和器官间免疫代谢调控中的差异作用	foxp3a缺失的斑马鱼模型	机器学习	NA	单细胞RNA测序、转录组分析、微生物组分析、多组学整合分析	NA	基因表达数据、微生物组数据	未明确说明样本数量	10x Genomics	单细胞RNA测序、批量RNA测序	10x Chromium	用于肠道黏膜细胞的单细胞RNA测序
13	2026-06-13	STING Drives Psoriatic Inflammation by Promoting Neutrophil Recruitment and Facilitating NETosis 2026-Jul, Immunology IF:4.9Q2 DOI:10.1111/imm.70130 PMID:41775627	研究论文	研究了STING通路在银屑病中通过促进中性粒细胞募集和NETosis驱动炎症的机制	首次揭示STING在银屑病中性粒细胞中直接调控NET形成及细胞募集的双重作用，并发现小鼠品系间STING通路激活的差异	小鼠模型与人类银屑病的差异性，以及品系特异性差异提示通路调控的复杂性，可能影响个体化治疗响应	阐明STING在中性粒细胞介导的银屑病炎症中的具体作用机制	银屑病患者皮损和血液中性粒细胞、IMQ处理的小鼠模型（野生型、STING-/-、PADi4-/-）、HL-60细胞	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	人类银屑病皮损和血液中性粒细胞样本、小鼠模型样本	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
14	2026-06-13	Silencing Adamts2 attenuates fibroblast-mediated fibrosis and promotes axonal regeneration in an in vitro model 2026-Jul, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112450 PMID:41785981	研究论文	通过单细胞测序数据分析小鼠脊髓损伤后成纤维细胞的变化，筛选出特异性高表达基因Adamts2，并验证其沉默可减轻纤维化并促进轴突再生	首次利用单细胞测序数据鉴定出Adamts2在脊髓损伤后成纤维细胞中特异性高表达，并证明沉默Adamts2可通过上调神经营养因子激活AKT和ERK信号通路，减轻纤维化并促进轴突再生	该研究仅基于体外模型，缺乏体内验证，且机制研究未完全阐明Adamts2在体内微环境中的具体作用路径	探索抑制Adamts2能否减轻成纤维细胞介导的纤维化，并促进中枢神经损伤后的轴突再生	小鼠脊髓成纤维细胞和运动神经元	数字病理学	脊髓损伤	单细胞测序，RNA干扰	NA	基因表达数据	未提及具体样本量	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
15	2026-06-13	Tumor immune microenvironment in cervical cancer: Histological subtype-specific immune landscapes and therapeutic implications 2026-Jul, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189581 PMID:41932455	综述	综述了宫颈癌不同组织学亚型中肿瘤免疫微环境的异质性，重点关注免疫细胞组成、基质结构和代谢影响，并探讨了亚型特异性免疫治疗策略	首次系统总结宫颈癌不同组织学亚型（鳞癌、腺癌、腺鳞癌及罕见亚型）的免疫微环境异质性，结合单细胞及空间转录组学数据揭示亚型特异性免疫特征	未纳入原始实验数据，依赖已发表文献的二次分析，可能受限于当前研究样本量和数据质量	阐明宫颈癌组织学亚型特异性免疫微环境差异，为开发分层治疗策略提供理论基础	宫颈癌主要组织学亚型（鳞癌、腺癌、腺鳞癌、神经内分泌癌、透明细胞癌及胃型腺癌）的肿瘤免疫微环境	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学	NA	单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据	NA	10x Genomics, Illumina	单细胞RNA测序, 空间转录组学	10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq	10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序，10x Visium 用于空间转录组学分析
16	2026-06-13	Neutrophil extracellular traps-related biomarkers in idiopathic pulmonary arterial hypertension: A machine learning-based identification and experimental validation study 2026-Jul, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2026.04.008 PMID:42085826	研究论文	采用机器学习与实验验证相结合的方法，识别特发性肺动脉高压中与中性粒细胞胞外陷阱相关的生物标志物	首次通过整合生物信息学与机器学习算法（WGCNA、三种互补算法）系统筛选出五个NETs相关生物标志物（CSF3R、MGAM、ITGAM、TLR8、SELP），并结合单细胞RNA测序和动物模型进行实验验证	未提及具体限制，但可能包括样本量较小、仅使用公共数据库、缺乏多中心验证等潜在局限	识别特发性肺动脉高压中与中性粒细胞胞外陷阱相关的分子生物标志物，揭示其致病机制	特发性肺动脉高压患者与对照组样本，以及单核细胞诱导的大鼠肺动脉高压模型	机器学习	肺动脉高压	转录组测序、单细胞RNA测序、蛋白表达检测	加权基因共表达网络分析、三种机器学习算法（具体类型未明确）	基因表达数据、单细胞转录组数据	40例特发性肺动脉高压患者与34例对照样本（训练集），独立验证集数据未明确说明	NA	bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq	NA	数据集GSE117261和GSE48149来源的测序平台未明确说明
17	2026-06-13	Transcriptomic sequencing analysis of the tumor microenvironment atlas and potential mechanisms of metastasis in papillary thyroid carcinoma 2026-Jul, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2026.05.006 PMID:42134246	研究论文	整合单细胞RNA测序与批量转录组数据，绘制甲状腺乳头状癌肿瘤微环境图谱，揭示转移相关细胞亚群和机制	首次整合肿瘤、瘤周甲状腺和淋巴结组织的单细胞RNA-seq数据，结合机器学习模型预测淋巴结转移状态和预后，并识别出多种与转移相关的细胞亚群（如Mac-APOC1巨噬细胞、RGS5+肌成纤维细胞）及其动态转变	NA	阐明甲状腺乳头状癌转移的微环境基础，构建预测淋巴结状态和预后的机器学习模型	甲状腺乳头状癌患者的肿瘤组织、瘤周甲状腺组织和淋巴结组织	机器学习	甲状腺癌	单细胞RNA测序、批量转录组测序	随机森林、Lasso-Cox回归	单细胞转录组数据、批量转录组数据	包括转移性和非转移性病例的肿瘤、瘤周甲状腺和淋巴结样本	NA	单细胞RNA测序、批量RNA测序	NA	NA
18	2026-06-13	Synergistic Oncogenesis Cooperative Role of Epstein Barr Virus and Human Papillomavirus in Cancer Progression 2026-Jul, Reviews in medical virology IF:9.0Q1 DOI:10.1002/rmv.70173 PMID:42250259	综述	综述了EB病毒和高危型人乳头瘤病毒在癌症进展中的协同致癌作用，探讨了共感染的分子和免疫机制	区分了病毒共存在与生物学活性共感染，并总结了共感染在促进基因组不稳定性、慢性炎症和免疫逃逸中的协同机制	由于方法学异质性和病毒检测技术差异，因果协同作用尚缺乏充分验证	总结EBV-HPV共感染在致癌作用中的合作角色，并指出未来研究方向	EBV和HPV病毒及其在宫颈癌、口咽癌和鼻咽癌等上皮恶性肿瘤中的共感染	数字病理学	宫颈癌, 口咽癌, 鼻咽癌	PCR, 原位杂交, 免疫组织化学, 空间转录组学, 单细胞分析	NA	文本, 图像	NA	NA	空间转录组学, 单细胞分析	NA	NA
19	2026-06-13	Characterization of T-Cell Ubiquitination in Melanoma and Development of a Risk Signature Using Single-Cell and Bulk RNA-Seq 2026-Jul, Immunology IF:4.9Q2 DOI:10.1111/imm.70139 PMID:42012139	研究论文	利用单细胞和 bulk RNA-seq 数据，鉴定黑色素瘤中与泛素化相关的预后基因特征，并探索其与免疫微环境的关系	首次整合单细胞和 bulk RNA-seq 数据，建立基于泛素化相关基因的六基因预后特征，并揭示其在 T 细胞分化和免疫调控中的作用	标题和摘要未提及具体局限性	开发基于泛素化相关基因的预后特征，并探索其在皮肤黑色素瘤免疫调节中的作用	皮肤黑色素瘤的转录组数据，包括单细胞和 bulk RNA-seq 数据	机器学习	黑色素瘤	RNA-seq, 单细胞 RNA-seq	Cox 回归	转录组数据	NA	NA	单细胞 RNA-seq, bulk RNA-seq	NA	NA
20	2026-06-13	Mining single-cell transcriptomic data reveals distinct T-cell population in pediatric B-ALL and AML at diagnosis 2026-Jun-23, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2025019565 PMID:41979357	研究论文	通过整合单细胞转录组数据分析，揭示儿童B-ALL和AML在诊断时T细胞群体的差异	首次在儿童白血病中系统比较B-ALL与AML的T细胞亚群异质性，并发现一种表达血红蛋白基因的稀有T细胞亚群与B-ALL预后改善相关	仅利用已有公开数据集，可能受不同实验批次和平台差异影响；样本量中AML患者数相对较少	表征儿童B-ALL和AML患者骨髓中T细胞亚群的转录组特征，为免疫治疗策略提供依据	儿童B-ALL（89例）和AML（26例）患者及健康捐赠者（9例）的骨髓T细胞	单细胞转录组学	儿童B细胞急性淋巴细胞白血病，急性髓系白血病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	总计124例样本（89例B-ALL、26例AML、9例健康供者），47610个T细胞	NA	单细胞RNA测序	NA	采用整合分析已有单细胞RNA测序数据集