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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1 | 2025-10-17 |
Advances in single-cell DNA sequencing enable insights into human somatic mosaicism
2025-Nov, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00832-3
PMID:40281095
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综述 | 本文综述了单细胞DNA测序技术在揭示人类体细胞嵌合现象方面的最新进展 | 突破了传统单细胞DNA测序的技术瓶颈,能够解析复杂克隆模式组织的遗传景观、稀缺样本和非循环细胞的遗传特征 | NA | 探讨单细胞DNA测序技术在理解体细胞嵌合机制和疾病诊断中的应用 | 人类体细胞和组织样本 | 基因组学 | 癌症和非癌性疾病 | 单细胞DNA测序、全基因组扩增、全基因组测序 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |
2 | 2025-07-17 |
Mapping trait-associated cells with spatial transcriptomics
2025-Nov, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00877-4
PMID:40664743
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3 | 2025-10-17 |
Nonhuman Primate Model of Super-selective Intra-arterial Ophthalmic Arterial Interventional Thrombolysis for Treatment of Ophthalmic Arterial Embolism Resulting From Hyaluronic Acid Filler Cosmetic Injection
2025-Oct-16, Aesthetic surgery journal
IF:3.0Q1
DOI:10.1093/asj/sjaf132
PMID:40601619
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研究论文 | 本研究建立了非人灵长类动物眼动脉栓塞模型,评估超选择性眼动脉介入溶栓治疗对透明质酸填充剂注射所致眼动脉栓塞的疗效 | 首次在非人灵长类动物中建立眼动脉栓塞和再灌注模型,模拟临床视网膜缺血再灌注过程,并采用单细胞测序技术分析视网膜变化 | 研究样本量有限,且为非人灵长类动物模型,临床转化需进一步验证 | 验证眼动脉介入溶栓治疗对透明质酸填充剂所致眼动脉栓塞的疗效,建立临床相关视网膜缺血再灌注模型 | 恒河猴眼动脉栓塞模型 | 眼科研究 | 眼动脉栓塞 | scRNA-seq, 数字减影血管造影, 眼底荧光血管造影, 视网膜电图, 组织染色, 透射电镜 | NA | 基因表达数据, 影像数据, 电生理数据, 组织学数据 | 恒河猴眼动脉栓塞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4 | 2025-10-17 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Depletion and Dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-Specific Th1 and Th17 Cells Early After Acquisition of Human Immunodeficiency Virus
2025-Oct-15, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf354
PMID:40605619
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了HIV感染早期结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭与功能失调 | 首次在HIV感染前后纵向分析结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞的单细胞转录组变化,发现早期耗竭模式和功能失调特征 | 样本量有限,仅对部分个体进行了纵向分析 | 探究HIV感染对结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞应答的影响机制 | HIV感染者和未感染者的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞 | 单细胞组学 | 结核病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | HIV感染和未感染个体队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5 | 2025-10-17 |
Multimodal glioma immunotherapy combining TLR9-targeted STAT3 antisense oligodeoxynucleotides with PD1 immune checkpoint blockade
2025-Oct-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf099
PMID:40214214
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向STAT3的双链反义寡核苷酸联合PD1免疫检查点阻断的多模式胶质瘤免疫疗法 | 开发了新型细胞选择性双链STAT3反义寡核苷酸,能特异性靶向胶质瘤细胞和胶质瘤相关髓系细胞而不影响T细胞,并首次证明其与PD1抑制剂联用可克服胶质母细胞瘤的免疫治疗抵抗 | 单药治疗无法达到治愈效果,仅能招募有限数量的耗竭性CD8+ T细胞;研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发针对胶质母细胞瘤的新型免疫联合治疗策略 | 人U251胶质母细胞瘤异种移植模型、小鼠GL261和QPP8胶质瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 反义寡核苷酸技术、免疫检查点阻断、空间转录组学 | 动物疾病模型 | 体内实验数据、免疫细胞分析数据 | 免疫健全和免疫缺陷小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
6 | 2025-10-17 |
Charting the single-cell and spatial landscape of IDH-wild-type glioblastoma with GBmap
2025-Oct-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf113
PMID:40312969
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研究论文 | 本研究构建了IDH野生型胶质母细胞瘤的单细胞和空间图谱GBmap,揭示了肿瘤异质性和空间组织结构 | 创建了首个整合26个数据集的胶质母细胞瘤单细胞图谱GBmap,开发了量化肿瘤组织的TSS评分系统,识别了7个不同的肿瘤生态位 | 基于回顾性数据整合,需要前瞻性验证;样本来源可能存在批次效应 | 解析胶质母细胞瘤的细胞异质性、空间结构和临床相关性 | IDH野生型胶质母细胞瘤患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 迁移学习 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 240名患者的110万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
7 | 2025-10-17 |
Antibiotic treatment limits survival of peripheral and bone marrow B-cell populations
2025-Oct-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024013694
PMID:40668665
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析,揭示了抗生素治疗通过破坏细胞生存信号导致骨髓B细胞耗竭的机制 | 首次发现抗生素治疗会导致骨髓B细胞在所有发育阶段的显著耗竭,并证实这与MYC生存信号通路受损有关,而非干扰素信号中断 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类中进行验证;抗生素的具体种类和剂量影响需进一步研究 | 探究抗生素治疗对骨髓造血系统特别是B细胞群体的影响机制 | 小鼠骨髓造血室和周围B细胞群体 | 免疫学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 粪便微生物群移植 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8 | 2025-10-17 |
Distinct follicular T cell subsets regulate lymphoma progression and outcomes
2025-Oct-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.013
PMID:40614737
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了滤泡性淋巴瘤中非Tfh滤泡T细胞亚群的异质性及其在肿瘤进展和预后中的作用 | 首次系统鉴定了滤泡性淋巴瘤中转录和空间特征独特的非Tfh滤泡T细胞亚群,并发现其具有抗肿瘤特性和独立预后价值 | 未明确说明样本规模和研究人群特征,机制研究仍需进一步验证 | 探索滤泡性淋巴瘤中滤泡T细胞的异质性及其在疾病进展和预后中的作用机制 | 滤泡性淋巴瘤患者的滤泡T细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴瘤 | 多组学分析、单细胞测序、空间转录组、多重蛋白分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
9 | 2025-10-17 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.12.623125
PMID:39605504
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究疟原虫在雌性按蚊体内的发育阶段转换和宿主-寄生虫相互作用 | 首次在单细胞水平揭示疟原虫在蚊媒中肠内的关键发育转变和宿主-寄生虫相互作用,发现寄生虫优先与中肠祖细胞相互作用,并鉴定出SIP2转录因子对肝细胞感染的关键作用 | NA | 阐明疟原虫在按蚊体内的发育生物学过程和宿主-寄生虫相互作用机制 | 疟原虫和按蚊中肠细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,共享蚊-寄生虫条形码分析 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像数据 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫和蚊子细胞,包括野外来源的寄生虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10 | 2025-10-17 |
Coordinated regulation of cortical astrocyte maturation by OLIG1 and OLIG2 through BMP7 signaling modulation
2025-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.03.008
PMID:40139307
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研究论文 | 本研究揭示了OLIG1和OLIG2通过调控BMP7信号通路协调皮质星形胶质细胞成熟的分子机制 | 首次发现OLIG1和OLIG2协同调控星形胶质细胞成熟,并阐明其通过直接结合Bmp7增强子抑制表达的作用机制 | NA | 探索皮质星形胶质细胞成熟的调控机制 | 皮质星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,体内过表达 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11 | 2025-10-17 |
Comprehensive molecular characterization of craniopharyngiomas using whole transcriptome and spatial transcriptomics approaches
2025-Oct, Brain tumor pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s10014-025-00509-z
PMID:40634824
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研究论文 | 通过全转录组和空间转录组学方法对颅咽管瘤进行全面的分子特征分析 | 首次结合批量转录组测序和原位空间转录组学技术系统分析颅咽管瘤两种亚型的分子差异 | 样本量相对有限(24个肿瘤样本),健康垂体组织数据来自公共数据库 | 分析颅咽管瘤两种亚型的体细胞突变和基因表达差异 | 颅咽管瘤肿瘤样本(包括ACP和PCP亚型)和健康垂体组织 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序, 空间转录组学, Sanger测序 | 生物信息学分析流程 | 转录组数据, 空间基因表达数据 | 24个肿瘤样本,外加GTEx数据库中的健康垂体数据 | NA | 全转录组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
12 | 2025-10-17 |
Inhibition of Glutamine Metabolism Attenuates Tumor Progression Through Remodeling of the Macrophage Immune Microenvironment
2025-Oct, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400738
PMID:40653724
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研究论文 | 本研究通过开发谷氨酰胺拮抗剂前药JHU083,探索了抑制谷氨酰胺代谢通过重塑巨噬细胞免疫微环境来抑制肿瘤进展的机制 | 开发了在癌组织中选择性生物活化的谷氨酰胺拮抗剂前药JHU083,并首次系统揭示了其通过同时靶向谷氨酰胺成瘾的癌细胞和调节巨噬细胞M1/M2平衡发挥抗肿瘤作用 | 研究仅限于两种免疫完整的小鼠癌症模型,尚未在人类临床试验中验证 | 评估谷氨酰胺代谢抑制对肿瘤细胞和免疫微环境的影响 | 两种免疫完整的小鼠肿瘤模型和体外骨髓来源的巨噬细胞 | 癌症免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
13 | 2025-10-17 |
Leptin Aggravates Thoracic Aortic Dissection Through Impairment of Energy Metabolism in Nrip2+ Smooth Muscle Cells
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502027
PMID:40667784
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研究论文 | 本研究探讨瘦素通过影响Nrip2+平滑肌细胞的能量代谢加剧胸主动脉夹层的机制 | 发现新型Nrip2平滑肌细胞亚群及其在瘦素诱导的血管平滑肌细胞表型转换中的保护作用 | 研究主要基于动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明肥胖相关瘦素升高在胸主动脉夹层发病机制中的作用 | 瘦素敲除小鼠和胸主动脉夹层患者的血管平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
14 | 2025-10-17 |
PLAUR+ Neutrophils Drive Anti-PD-1 Therapy Resistance in Patients with Hepatocellular Carcinoma by Shaping an Immunosuppressive Microenvironment
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507167
PMID:40673864
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研究论文 | 本研究揭示PLAUR+中性粒细胞通过塑造免疫抑制微环境驱动肝细胞癌患者抗PD-1治疗耐药 | 首次发现PLAUR+中性粒细胞是免疫治疗耐药的关键驱动因素,并开发出新型PLAUR抑制剂 | NA | 探索肝细胞癌免疫治疗耐药的机制并开发逆转策略 | 肝细胞癌患者和临床前模型中的中性粒细胞亚群 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,多组学分析,基于结构的虚拟筛选 | NA | 转录组数据,空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
15 | 2025-10-17 |
Single-Cell Analyses Reveal a Functionally Heterogeneous Exhausted CD8+ T-cell Subpopulation That Is Correlated with Response to Checkpoint Therapy in Melanoma
2025-Apr-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3918
PMID:40042995
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研究论文 | 通过单细胞分析发现与黑色素瘤检查点治疗反应相关的功能异质性耗竭CD8+ T细胞亚群 | 识别出PD-1和CTLA4共表达(CPHi)的CD8+ TIL亚群与治疗反应相关,并揭示该亚群的功能异质性 | 研究主要关注晚期黑色素瘤患者,结果在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 寻找能够预测免疫检查点抑制剂治疗反应的生物标志物 | 晚期黑色素瘤患者的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞(TIL) | 免疫肿瘤学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
16 | 2025-10-17 |
Comprehensive analysis of cuproptosis-related genes involved in immune infiltration and their use in the diagnosis of hepatic ischemia-reperfusion injury: an experimental study
2025-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001893
PMID:38935114
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证,研究铜死亡相关基因在肝缺血再灌注损伤中的免疫浸润作用及诊断价值 | 首次系统分析铜死亡相关基因在HIRI中的作用,构建基于8个特征DE-CRGs的诊断模型,并验证其与免疫浸润的关联 | 研究主要基于公共数据库数据,动物模型验证仅部分确认了7个DE-CRGs | 探索铜死亡在肝缺血再灌注损伤中的作用机制及诊断价值 | 肝缺血再灌注损伤患者样本和动物模型 | 生物信息学 | 肝缺血再灌注损伤 | 基因表达分析,单细胞测序,机器学习算法 | LASSO逻辑回归,诺模图模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | GSE151648数据集,GSE14951微阵列数据集,GSE171539单细胞测序数据集,HIRI小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,微阵列 | NA | NA |
17 | 2025-10-17 |
Antibiotic use attenuates response to immune checkpoint blockade in urothelial carcinoma via inhibiting CD74-MIF/COPA: revealing cross-talk between anti-bacterial immunity and ant-itumor immunity
2025-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001901
PMID:38995167
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研究论文 | 本研究探讨抗生素使用通过抑制CD74-MIF/COPA信号通路削弱尿路上皮癌患者对免疫检查点阻断治疗的应答 | 首次通过单细胞分析揭示肿瘤内细菌通过CD74-MIF/COPA信号通路连接抗菌免疫与抗肿瘤免疫的分子机制 | 研究基于观察性数据和回顾性分析,需要进一步实验验证因果关系 | 评估抗生素使用对尿路上皮癌患者免疫检查点阻断治疗效果的影响并探索分子机制 | 尿路上皮癌患者 | 肿瘤免疫学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序,单细胞微生物组分析,批量RNA测序 | NA | 临床数据,转录组数据,微生物组数据 | 3496例尿路上皮癌患者,8个UC样本和63185个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
18 | 2025-10-17 |
Artificial intelligence-based multi-modal multi-tasks analysis reveals tumor molecular heterogeneity, predicts preoperative lymph node metastasis and prognosis in papillary thyroid carcinoma: a retrospective study
2025-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001875
PMID:38990290
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研究论文 | 本研究通过人工智能多模态多任务分析揭示甲状腺乳头状癌的分子异质性,并预测术前淋巴结转移和预后 | 开发了整合组织病理学图像、基因组、转录组和免疫细胞数据的深度学习多模态模型,首次在PTC中实现多维度预测 | 回顾性研究设计,样本来源有限,需要前瞻性验证 | 探索PTC分子异质性,预测淋巴结转移和疾病无进展生存期 | 甲状腺乳头状癌患者 | 数字病理 | 甲状腺癌 | DNA二代测序,单细胞RNA测序,深度学习 | 深度学习多模态模型,GradCAM | 组织病理图像,基因组数据,转录组数据,免疫细胞数据 | 1011例PTC患者(256例来自队列1,275例来自队列2,490例来自TCGA) | NA | 单细胞RNA测序,DNA二代测序 | NA | NA |
19 | 2025-10-17 |
Integrative Multiomics in the Lung Reveals a Protective Role of Asporin in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-Oct-15, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 通过整合多组学方法研究肺动脉高压,发现asporin在肺血管中发挥保护作用 | 发现ASPN基因编码的asporin是肺动脉高压中的新型保护性靶点,具有治疗潜力 | 获取人类肺动脉高压肺样本较为困难,样本量相对有限 | 阐明肺动脉高压的病理生物学机制并发现新的治疗靶点 | 肺动脉高压患者肺组织样本、肺动脉平滑肌细胞、Sugen-低氧大鼠模型 | 多组学整合分析 | 肺动脉高压 | 转录组分析、全基因组关联研究、贝叶斯调控网络、单细胞转录组学、药物转录组学 | 贝叶斯网络、动物模型 | 转录组数据、临床病理数据、单细胞数据 | 96例疾病样本和52例对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析, 多组学整合 | NA | NA |
20 | 2025-10-17 |
YAP1 Status Defines Two Intrinsic Subtypes of LCNEC with Distinct Molecular Features and Therapeutic Vulnerabilities
2024-Oct-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0361
PMID:39150543
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研究论文 | 本研究通过YAP1状态将大细胞神经内分泌癌分为两个具有不同分子特征和治疗脆弱性的亚型 | 首次发现YAP1状态可定义LCNEC的两个内在亚型,并揭示了各自独特的分子特征和治疗脆弱性 | 研究样本量有限,主要基于细胞系和核心针活检样本 | 阐明大细胞神经内分泌癌的生物学特征并探索个性化治疗策略 | LCNEC细胞系、患者基因组数据和临床前模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、图像、序列数据 | LCNEC患者核心针活检样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |