单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-05-13	CD8+ T cells in breast cancer tumors and draining lymph nodes: PD-1 levels, effector functions and prognostic relevance 2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2025.2502354 PMID:40351118	研究论文	本研究评估了表达不同PD-1水平的CD8 T细胞在luminal乳腺癌患者不同组织中的功能状态和分布，并探讨了其预后相关性	首次在luminal乳腺癌患者中详细描述了CD8 T细胞在不同组织中的耗竭阶段分布，并发现PD-1表达能有效区分CD8 T细胞的耗竭阶段	研究仅针对luminal乳腺癌患者，结果可能不适用于其他乳腺癌亚型	探讨CD8 T细胞在乳腺癌肿瘤组织中的耗竭状态及其临床意义	luminal乳腺癌患者的肿瘤组织、瘤旁组织和肿瘤引流淋巴结中的CD8 T细胞	肿瘤免疫学	乳腺癌	TCR-β测序、scRNA-seq	NA	基因表达数据、单细胞RNA测序数据	未明确说明样本数量，但涉及luminal乳腺癌患者的多组织样本
2	2025-05-13	COL1A1-positive endothelial cells promote gastric cancer progression via the ANGPTL4-SDC4 axis driven by endothelial-to-mesenchymal transition 2025-Jul-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217731 PMID:40254092	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了COL1A1阳性内皮细胞通过ANGPTL4-SDC4轴促进胃癌进展的机制	首次建立了胃癌内皮细胞单细胞图谱，并发现COL1A1阳性内皮细胞亚群通过EndoMT过程促进肿瘤侵袭和转移	研究样本量相对较小（97例），且机制验证主要在细胞水平进行	探究内皮-间质转化（EndoMT）在胃癌进展中的具体作用和分子机制	胃癌患者样本中的内皮细胞	digital pathology	gastric cancer	scRNA-seq, ssGSEA, Monocle2, CellChat, 多重免疫荧光	NA	单细胞RNA测序数据	97例胃癌样本（来自6个scRNA-seq队列）
3	2025-05-13	Spatial lipidomics reveals sphingolipid metabolism as anti-fibrotic target in the liver 2025-Jul, Metabolism: clinical and experimental DOI:10.1016/j.metabol.2025.156237 PMID:40127860	研究论文	本研究通过空间脂质组学等方法揭示了鞘脂代谢作为肝脏抗纤维化靶点的重要性	首次结合空间脂质组学、转录组学和成像质谱细胞术等多组学方法，系统研究了鞘脂代谢在肝纤维化中的作用	研究样本量有限，且主要在动物模型和体外实验中进行验证	探究肝纤维化中脂毒性机制和鞘脂代谢的作用	SLD患者肝组织和3种小鼠模型	数字病理学	肝病	空间脂质组学、转录组学、成像质谱细胞术(IMC)、scRNA-seq	NA	组织样本、测序数据、质谱数据	SLD患者肝组织和3种小鼠模型
4	2025-05-13	Pan-cancer analysis reveals BAF complexes as immune-related biomarkers and validation in triple-negative breast cancer 2025-Jul-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123607 PMID:40194763	research paper	通过泛癌分析揭示BAF复合物作为免疫相关生物标志物，并在三阴性乳腺癌中进行验证	首次强调BAF复合物模型对患者预后的重要性，并证实BAF复合物在泛癌进展中作为免疫相关生物标志物的作用，特别是ACTL6A在三阴性乳腺癌中的双重作用	研究主要基于数据库分析，实验验证部分可能不足	解码特定BAF复合物在癌症病理、免疫和靶向治疗中的潜力	BAF复合物，特别是ACTL6A，在三阴性乳腺癌中的作用	digital pathology	breast cancer	RNA sequencing, single-cell RNA sequencing	BAFs model and nomogram	gene expression data	数据来自The Cancer Genome Atlas, Gene Expression Omnibus, 和 IMvigor210数据库
5	2025-05-13	Fibroblast to macrophage-like cell transition in renal inflammatory injury through the MR/CSF1 pathway induced by aldosterone 2025-Jul-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123627 PMID:40216224	research paper	该研究验证了成纤维细胞向巨噬细胞样细胞转变是参与肾脏炎症性损伤的巨噬细胞新来源	揭示了醛固酮通过MR/CSF1信号通路诱导成纤维细胞向巨噬细胞样细胞转变的新机制	研究主要基于大鼠模型和体外细胞实验，人类样本验证有限	探究肾脏炎症性损伤中巨噬细胞的新来源及其机制	Wistar大鼠和人类慢性肾脏病患者的肾脏样本	肾脏病学	慢性肾脏病	流式细胞术、免疫荧光染色、单细胞RNA测序	动物模型（大鼠）和体外细胞模型	基因表达数据和免疫组织化学数据	Wistar大鼠分组实验和人类肾脏活检样本
6	2025-05-13	Differences in transcriptome characteristics and drug repositioning of Alzheimer's disease according to sex 2025-Jun-15, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106909 PMID:40220916	研究论文	本研究通过RNA测序和转录组分析，探讨了阿尔茨海默病（AD）患者中性别差异对转录组特征和药物重定位的影响	首次在AD患者的外周血和前额叶皮层组织中系统地研究了性别相关的转录组差异，并预测了性别特异性药物	样本量较小（54名患者），且部分数据来自公开数据库，可能影响结果的普遍性	探索AD患者中性别差异对转录组特征和药物重定位的影响	AD患者、轻度认知障碍（MCI）患者和健康对照者的外周血和前额叶皮层组织	转录组学	阿尔茨海默病	RNA-seq, snRNA-seq, 转录组分析	NA	RNA测序数据	54名患者（包括AD、MCI患者和健康对照者）
7	2025-05-13	Exploring the Molecular Mechanisms of Fisetin in Treating Periodontitis Through Multiomics and Network Pharmacology 2025-Jun, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2024.12.012 PMID:39755534	研究论文	本研究通过多组学和网络药理学方法探讨了非瑟酮治疗牙周炎的分子机制	首次结合网络药理学、单细胞转录组学和空间转录组学技术，系统研究了非瑟酮对牙周炎的治疗作用及其分子机制	研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在临床患者中验证非瑟酮的疗效	探索非瑟酮治疗牙周炎的分子机制及其潜在治疗效果	牙周炎动物模型和人牙周膜成纤维细胞(PDLFs)	分子药理学	牙周炎	网络药理学分析、单细胞转录组学、空间转录组学	动物模型	转录组数据	NA
8	2025-05-13	The influence of age on cellular senescence in injured versus healthy muscle and its implications on rotator cuff injuries 2025-Jun, Journal of shoulder and elbow surgery IF:2.9Q1 DOI:10.1016/j.jse.2025.02.008 PMID:40057173	research paper	该研究探讨了年龄对受伤与健康肌肉中细胞衰老的影响及其对肩袖损伤的意义	研究发现老年患者肩袖组织中的细胞衰老标志物显著升高，特别是ATF3基因在调节纤维化形成中可能具有保护作用	研究样本量有限，且仅通过单细胞RNA测序分析，未进行功能验证实验	探究年龄对肩袖损伤中细胞衰老的影响机制	年轻和老年患者的肩袖肌肉组织样本	生物医学	肩袖损伤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	年轻和老年患者的肩袖肌肉组织样本
9	2025-05-13	IL-4 alters TLR7-induced B cell developmental program in lupus 2025-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2025.110472 PMID:40068727	research paper	该研究探讨了IL-4如何改变TLR7诱导的B细胞发育程序，从而影响系统性红斑狼疮（SLE）中的自身抗体形成	研究发现IL-4能够重编程B细胞发育，减少自身抗体和特定B细胞亚群，为SLE治疗提供新思路	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类SLE患者的临床适用性尚需进一步验证	探究IL-4对TLR7诱导的B细胞发育程序的影响及其在SLE中的作用	BXD2小鼠和SLE患者的B细胞	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞转录组分析	NA	基因表达数据	BXD2小鼠和SLE患者B细胞样本（具体数量未明确说明）
10	2025-05-13	MAP4K4 aggravates microvascular anomalies in diabetic retinopathy in a YTHDF2-dependent manner 2025-Jun, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06398-3 PMID:40072537	research paper	该研究揭示了MAP4K4通过YTHDF2依赖的方式加剧糖尿病视网膜病变中的微血管异常	首次发现MAP4K4通过YTHDF2/MAP4K4/NF-κB轴调控糖尿病视网膜病变的微血管异常，为治疗提供了新靶点	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，未涉及大规模临床样本验证	探究MAP4K4在糖尿病视网膜病变微血管异常中的作用机制	糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜、db/db小鼠模型和人类原代视网膜内皮细胞	digital pathology	diabetic retinopathy	scRNA-seq	db/db小鼠模型	RNA测序数据、蛋白质表达数据	8例增殖性糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜和11例非糖尿病患者的正常视网膜组织
11	2025-05-13	Intrapancreatic adipocytes and beta cell dedifferentiation in human type 2 diabetes 2025-Jun, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06392-9 PMID:40072535	研究论文	本研究探讨了胰腺内脂肪沉积与2型糖尿病患者β细胞去分化的空间关系及其机制	首次在人类胰腺中证实脂肪含量与β细胞去分化标志物ALDH1A3表达的正相关性，并揭示脂肪细胞通过免疫微环境促进β细胞功能失调的机制	样本量较小（50例器官捐献者），且仅为观察性研究无法确定因果关系	探究2型糖尿病中胰腺脂肪与胰岛β细胞功能障碍的关联机制	人类胰腺组织（15例2型糖尿病患者 vs 35例非糖尿病患者）	糖尿病研究	2型糖尿病	组织学分析、单细胞RNA-seq生物信息学分析	NA	组织切片图像、单细胞转录组数据	50例器官捐献者胰腺样本（15例糖尿病+35例对照），另分析11例糖尿病单细胞RNA-seq数据
12	2025-05-13	Understanding Enzalutamide-Resistance Based on a Functional Single-Cell Approach 2025-Jun, The Prostate DOI:10.1002/pros.24895 PMID:40211483	研究论文	通过单细胞RNA测序和功能实验研究前列腺癌细胞对恩杂鲁胺的耐药机制	发现恩杂鲁胺治疗前存在的AR-low细胞亚群在治疗中被选择并扩增，导致耐药性	研究主要基于细胞系和异种移植模型，未涉及临床患者样本	探索前列腺癌细胞对恩杂鲁胺耐药的分子机制	前列腺癌细胞系LNCaP及其亚群	癌症生物学	前列腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 基因集富集分析(GSEA), 异种移植模型	NA	RNA测序数据	LNCaP细胞系及其亚群
13	2025-05-13	High-resolution transcriptome analysis on a mouse model of neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy using single-nucleus RNA-seq 2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3 DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102026 PMID:40342532	research paper	该研究利用单核RNA测序技术对新生儿缺氧缺血性脑病小鼠模型进行了高分辨率转录组分析	首次在HIE研究中应用单核RNA测序技术，揭示了海马区神经元群体的显著减少和小胶质细胞的特定激活	研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步验证才能推广到人类	深入理解新生儿缺氧缺血性脑病的发病机制	新生儿缺氧缺血性脑病小鼠模型	基因组学	新生儿缺氧缺血性脑病	单核RNA测序(snRNA-seq)	小鼠疾病模型	RNA测序数据	NA
14	2025-05-13	The human endometrium: atlases, models, and prospects 2025-Jun, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.gde.2025.102341 PMID:40154154	综述	本文综述了人类子宫内膜的单细胞转录图谱和模型，探讨了其在研究子宫内膜生物学中的新途径、局限性及未来方向	通过单细胞分析揭示了子宫内膜的多样性和动态性，发现了WNT、NOTCH和TGFβ信号通路的调控作用，并利用先进的体外模型捕捉子宫内膜的细胞异质性和结构	子宫内膜功能障碍的病因学研究不足，影响了有效的诊断和治疗	研究子宫内膜的生物学特性及其功能障碍的机制	人类子宫内膜	生物医学	子宫内膜异位症	单细胞转录组分析	体外模型	转录组数据	NA
15	2025-05-13	Hypoxia-induced RHCG as a key regulator in psoriasis and its modulation by secukinumab 2025-Jun, APL bioengineering IF:6.6Q1 DOI:10.1063/5.0250742 PMID:40351602	研究论文	本文研究了缺氧诱导的RHCG在银屑病中的关键调控作用及其被secukinumab调节的机制	揭示了RHCG在缺氧条件下对银屑病发病机制的关键作用，并发现secukinumab通过下调RHCG表达改善病情	RHCG在银屑病中的具体致病机制尚未完全阐明	探究RHCG在银屑病发病机制中的作用及其治疗潜力	角质形成细胞(KCs)和免疫细胞	生物信息学	银屑病	空间转录组学分析、单细胞转录组学分析、批量数据分析	NA	转录组数据、临床样本数据	未明确说明样本数量
16	2025-05-13	Cyclopamine Attenuates Pulmonary Arterial Hypertension Development: Implications of Hedgehog Signaling Involvement for the Pathophysiology 2025-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202403350R PMID:40353829	研究论文	探讨环巴明通过抑制Hedgehog信号通路对肺动脉高压（PAH）发展的潜在治疗作用	首次提出环巴明作为Hedgehog信号抑制剂在PAH治疗中的潜在应用，并揭示了其对血管重塑的抑制作用	体外实验显示环巴明对缺氧促进的细胞增殖抑制作用有限，且研究仅基于小鼠模型和人类肺动脉平滑肌细胞	探索PAH的新型治疗方法	C57BL/6J雄性小鼠和人类肺动脉平滑肌细胞（HPASMC）	病理生理学	肺动脉高压	单细胞RNA测序分析，RNA测序分析	动物模型（小鼠）	基因表达数据	小鼠模型和人类肺动脉平滑肌细胞
17	2025-05-13	Multifaceted profiling of virus-specific CD8 T cells reveals distinct immune signatures against cytomegalovirus infection states during pregnancy 2025-May-16, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.112416 PMID:40343282	研究论文	通过MHC-dextramer单细胞RNA测序和流式细胞术，研究了孕妇中针对巨细胞病毒(CMV)不同感染阶段的CD8 T细胞免疫特征	揭示了不同CMV感染阶段CD8 T细胞的表型和抗原识别特征，为评估先天性感染风险提供了新方法	样本量有限，仅针对孕妇群体进行研究	研究孕妇中针对CMV不同感染阶段的细胞免疫特征	孕妇中IE1和pp65 CMV抗原特异性CD8 T细胞	免疫学	巨细胞病毒感染	MHC-dextramer单细胞RNA测序, 流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据	具有不同抗CMV血清学模式的孕妇样本(包括IgGIgM/AI-low, IgGIgM/AI-high和IgGIgM)
18	2025-05-13	Sex differences in adenosine deaminase activity associate with disparities in SARS-CoV-2 innate immunity 2025-May-16, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.112418 PMID:40343269	research paper	该研究探讨了腺苷脱氨酶（ADA）活性在性别差异中对SARS-CoV-2先天免疫反应的影响	揭示了ADA活性性别差异与hERV和ISG表达的关系，并发现IL-18是性别特异性ADA2表达的驱动因素	研究样本可能不足以代表所有人群，且机制研究仍需进一步验证	探究性别差异在抗病毒先天免疫反应中的机制	健康人群和COVID-19患者的血液和肺部单核细胞群	免疫学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	健康人群和COVID-19患者队列
19	2025-05-13	Single-cell RNA sequencing highlights a significant retinal Müller glial population in dry age-related macular degeneration 2025-May-16, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.112464 PMID:40343286	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了干性年龄相关性黄斑变性（dAMD）中视网膜Müller胶质细胞的关键作用及其损伤机制	发现了一组高表达Sox2的Müller细胞亚群，这些细胞在AMD小鼠模型和患者中发挥重要稳态和神经保护作用，并首次揭示了铁死亡和凋亡是导致这些细胞损伤的原因	研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，需要在更大规模的人类样本中验证这些发现	解析干性年龄相关性黄斑变性的细胞机制和关键致病通路	干性年龄相关性黄斑变性小鼠模型和患者样本中的视网膜细胞	单细胞组学	年龄相关性黄斑变性	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	AMD小鼠模型和dAMD患者样本（具体数量未明确说明）
20	2025-05-13	Schwann cells secrete IGFBP5 to facilitate the growth of keloids 2025-May-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123534 PMID:40049369	研究论文	本研究通过单细胞测序技术探究了瘢痕疙瘩（KD）中雪旺氏细胞及其分泌蛋白IGFBP5的作用机制	首次发现雪旺氏细胞通过分泌IGFBP5蛋白促进瘢痕疙瘩的生长，并揭示了IGFBP5通过p53/p21/Cyclin D1通路调控细胞周期	研究主要基于体外实验和兔耳瘢痕模型，临床转化仍需进一步验证	阐明瘢痕疙瘩病理生长的分子机制	瘢痕疙瘩组织、正常瘢痕组织、雪旺氏细胞、IGFBP5蛋白	分子病理学	皮肤纤维增生性疾病	单细胞测序、重组蛋白功能验证、兔耳瘢痕模型	NA	基因表达数据、蛋白质功能数据	未明确说明样本数量（包含KD和NS组织样本）