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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-14 |
Computational identification of FOXP3-associated spatial prognostic markers in HCC via digital pathology
2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109119
PMID:41135296
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研究论文 | 本研究通过计算分析数字病理切片,识别了肝细胞癌中与FOXP3相关的空间预后标志物 | 首次在点水平分辨率上计算识别空间差异基因,提供了一种经济高效且可扩展的空间生物标志物发现方法 | 样本量有限且统计功效可能不足,存在观察到的种族差异 | 识别肝细胞癌中具有预后意义的空间标志物 | TCGA-LIHC队列的肝细胞癌患者数字病理切片 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学分析,数字病理分析 | 计算流程,空间基因推断 | 数字病理切片,基因表达数据 | TCGA-LIHC队列样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2025-11-14 |
Investigating the Shared Genetic Architecture of 3 Age-Related Ocular Disorders
2026-Jan, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2025.100942
PMID:41211298
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研究论文 | 本研究通过遗传关联分析探索年龄相关性黄斑变性、白内障和原发性开角型青光眼三种年龄相关性眼病的共享遗传结构、因果关系及细胞类型特异性表达模式 | 首次综合运用跨性状荟萃分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术系统揭示三种年龄相关性眼病间的遗传关联和分子机制 | 依赖于公开可用的GWAS数据库数据,可能存在样本选择偏差 | 探索年龄相关性眼病的共享遗传结构和分子机制,为靶向治疗提供依据 | 年龄相关性黄斑变性(AMD)、白内障和原发性开角型青光眼(POAG)三种年龄相关性眼病 | 遗传学 | 眼科疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化分析 | NA | 遗传数据、基因表达数据 | 来自公开GWAS数据库的三种眼病相关数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-11-14 |
Introduction to Oral Immunity
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_1
PMID:41225090
|
综述 | 本章全面概述口腔免疫系统的组成、功能及其在维持局部耐受与系统免疫平衡中的双重作用 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学等新技术在口腔免疫研究中的应用前景 | NA | 阐述口腔免疫机制及其与系统免疫的关联 | 口腔免疫组分(上皮屏障、唾液因子、免疫细胞)及微生物群 | 免疫学 | 口腔炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 宏基因组学, 多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2025-11-14 |
Inflammatory Mediators in Peri-Implantitis: From Pathophysiology to Therapeutic Targets
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_21
PMID:41225110
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综述 | 本文探讨种植体周围炎的炎症介质作用机制及其作为治疗靶点的潜力 | 整合基因多态性、蛋白质组学和单细胞RNA测序技术揭示种植体周围炎特有的细胞互作与炎症通路 | NA | 阐明种植体周围炎的病理机制并探索精准医疗策略 | 种植体周围炎相关炎症介质与分子通路 | NA | 种植体周围炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 基因多态性分析 | NA | 基因组数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-11-14 |
Microbiota shape the colon epithelium controlling inter-crypt absorptive goblet cells via butyrate-GP R109A signalling
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2573045
PMID:41208257
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肠道微生物通过丁酸盐-GPR109A信号通路调控结肠上皮细胞中兼具吸收和分泌特征的跨隐窝杯状细胞 | 发现了一种新型的跨隐窝杯状细胞群体,该细胞同时具有吸收和分泌功能,且其数量受微生物代谢产物丁酸盐通过GPR109A受体调控 | NA | 阐明微生物来源信号如何影响结肠上皮细胞身份和功能 | 结肠上皮细胞、肠道微生物群 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-11-14 |
Effects of esketamine on electrophysiology and metabolic reprogramming in brain organoids: insights into antidepressant mechanisms
2025-Dec, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03198-4
PMID:40885845
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研究论文 | 本研究通过脑类器官探究艾司氯胺酮对电生理和代谢重编程的影响 | 首次在人类脑类器官模型中系统研究艾司氯胺酮对电生理和代谢的浓度与时间依赖性影响 | 研究仅限于体外脑类器官模型,未进行体内验证 | 探究艾司氯胺酮的抗抑郁作用机制 | 健康对照和抑郁症患者来源的iPSC脑类器官 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,电生理记录,代谢分析 | 脑类器官模型 | 电生理数据,单细胞转录组数据,代谢数据 | 健康对照和抑郁症患者来源的脑类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-11-14 |
Influence of Age on Fracture Healing in Young and Middle-Aged Mice in a Proximal Femur Fracture Model
2025-Dec, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.70063
PMID:40931376
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研究论文 | 本研究通过小鼠股骨近端骨折模型探讨年龄对骨折愈合的影响 | 首次在年轻和中年小鼠中系统比较股骨近端骨折愈合差异,并发现衰老细胞和SASP因子在年龄相关愈合延迟中的作用 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别差异和更老年齡组 | 确定年龄对小鼠股骨近端骨折愈合的影响及分子机制 | 12周和52周龄雄性C57BL/6J小鼠 | 骨生物学 | 骨质疏松性骨折 | 多重细胞因子分析,µCT分析,组织形态计量学,免疫染色,空间转录组学 | NA | 图像,分子表达数据 | 年轻和中年雄性C57BL/6J小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2025-11-14 |
Immunomodulatory effects of a short-term gluten-free diet on pediatric celiac disease: Findings from a single-cell transcriptomics study
2025-Dec, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2025.110063
PMID:40803542
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析短期无麸质饮食对儿童乳糜泻患者免疫细胞的调节作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析短期无麸质饮食对儿童乳糜泻患者外周血单个核细胞的免疫调节机制 | 样本量较小(仅5名患者),结果需谨慎解读,需要更大队列研究进一步验证 | 探究短期无麸质饮食对儿童乳糜泻患者免疫细胞转录组的影响 | 儿童乳糜泻患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名儿童乳糜泻患者(治疗前后配对样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序 |
| 9 | 2025-11-14 |
GPR91 mediates low shear stress-induced endothelial ferroptosis via EGR1-dependent GPX4 repression
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112127
PMID:40939914
|
研究论文 | 本研究揭示了低剪切力通过GPR91/EGR1/GPX4信号轴诱导血管内皮细胞铁死亡的新机制 | 首次发现GPR91作为机械敏感受体连接低剪切力与铁死亡信号通路,并阐明EGR1介导的GPX4转录抑制机制 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步在体实验验证 | 探究低剪切力诱导内皮细胞铁死亡的分子机制 | 血管内皮细胞、HEK293T细胞、动脉粥样硬化斑块 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-11-14 |
Elevated P4HB expression in hepatocellular carcinoma and its role in UCA1-mediated malignant progression
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112131
PMID:40945634
|
研究论文 | 本研究探讨了P4HB在肝细胞癌中的表达及其通过UCA1促进恶性肿瘤进展的机制 | 首次发现P4HB与lncRNA UCA1之间的相互作用,并揭示其通过增强糖酵解促进HCC恶性行为的新机制 | NA | 研究P4HB在肝细胞癌进展中的作用及其作为诊断生物标志物的潜力 | 肝细胞癌细胞和患者血清样本 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序,ROC分析,体外和体内功能实验 | NA | 单细胞测序数据,血清蛋白水平数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-11-14 |
YWHAG mediated epithelial-mesenchymal transition facilitates tumor progression and metastatic spread in non-small cell lung cancer
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112139
PMID:40962000
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研究论文 | 本研究揭示YWHAG通过调控上皮-间质转化促进非小细胞肺癌进展和转移的分子机制 | 首次阐明YWHAG通过LRRK2/PI3K/AKT信号轴驱动EMT的分子机制,并利用肺特异性基因敲除小鼠模型验证其在肿瘤转移中的作用 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证相对有限 | 阐明YWHAG在非小细胞肺癌进展中的功能和机制 | 非小细胞肺癌细胞系(NCI-H292, A549)、TCGA泛癌数据集、单细胞RNA测序数据、基因敲除小鼠模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 过表达, 免疫共沉淀, 免疫荧光, 生物发光成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | TCGA泛癌数据集(29种癌症类型)、两个单细胞RNA测序数据集(GSE117570 & GSE148071) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-11-14 |
Time-Series Transcriptomics Identifies Xanthine Dehydrogenase in Injured Neurons Correlated With Orthodontic Pain
2025-Dec, Orthodontics & craniofacial research
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/ocr.70036
PMID:41002069
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研究论文 | 本研究通过时间序列转录组学分析,发现黄嘌呤脱氢酶(Xdh)在正畸疼痛高峰期的受损神经元中高表达,并开发了OTMPTGTA网络平台供研究人员探索疼痛相关基因 | 首次将时间序列转录组学应用于正畸疼痛研究,识别出Xdh在Atf3+受损神经元中的关键作用,并开发了用户友好的数据分析平台 | 研究基于小鼠模型,需要进一步验证其在人类中的适用性;样本量相对有限 | 探索正畸牙齿移动疼痛的分子和细胞机制 | 小鼠三叉神经节组织和神经元 | 转录组学 | 正畸疼痛 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠三叉神经节组织样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-11-14 |
Expression patterns of desmosome family members during tooth development and the role of Desmocollin-3 in cytodifferentiation of stratum intermedium
2025-Dec, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定牙釉质中间层特异性标志物,并探讨Desmocollin-3在维持细胞完整性和分化中的功能 | 首次发现桥粒家族基因在牙釉质中间层高表达,并证实Dsc3对维持细胞结构和釉质细胞分化支持功能的关键作用 | 研究主要使用细胞系模型,缺乏体内实验验证 | 探究牙发育过程中桥粒蛋白家族的表达模式及Dsc3在牙釉质中间层细胞分化中的功能 | 出生后12天磨牙组织、SF2牙上皮细胞系 | 发育生物学 | 牙发育异常 | 单细胞RNA测序、基因敲低 | NA | 单细胞转录组数据、细胞表型数据 | 出生后12天磨牙组织、SF2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-11-14 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Disulphidptosis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103955
PMID:41106220
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 首次系统研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达特征,并验证INF2和DSTN作为新型生物标志物的价值 | 需要进一步的实验室验证和临床试验来探索INF2和DSTN的治疗靶向性及其对免疫微环境的影响 | 研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达水平及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 口腔鳞状细胞癌样本和二硫死亡相关基因 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA测序,实时PCR,单细胞RNA测序,功能富集分析,生存分析,免疫细胞浸润分析 | NA | RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-11-14 |
The NF-κB Signalling Regulates the Abnormal Functions of Neutrophils in Severe Periodontal Disease
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103973
PMID:41145025
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析揭示了中性粒细胞在重度牙周炎中通过NF-κB信号通路调控炎症反应的关键机制 | 首次在单细胞水平系统揭示NF-κB信号通路调控牙周炎中性粒细胞异常功能的分子机制,并发现Nrf2转录因子在PD中性粒细胞中的特异性表达 | 研究主要基于公共数据库数据和体外实验,缺乏在体功能验证和更大样本量的临床验证 | 探索重度牙周炎中中性粒细胞的调控机制 | 牙周炎患者的中性粒细胞和牙龈卟啉单胞菌LPS刺激的人牙龈中性粒细胞 | 生物信息学 | 牙周病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA转录组测序, 实时PCR, 共免疫染色 | hdWGCNA, pySCENIC, ClusterProfiler | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 来自GEO数据库的单细胞和批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-11-14 |
Tregs With High CD29 Expression Promote Cell Adhesion and Contribute to the Malignant Transformation of MASLD
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70421
PMID:41200753
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研究论文 | 本研究揭示了CD29高表达调节性T细胞通过促进细胞粘附驱动MASLD恶性转化为肝癌的机制 | 首次发现Tregs通过上调CD29表达促进细胞粘附,从而驱动代谢功能障碍相关脂肪肝病向肝癌的恶性转化 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Tregs在MASLD向HCC恶性转化过程中的作用机制 | MASLD小鼠模型中的调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | MASLD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-11-14 |
Esaxerenone inhibits renal macrophage proliferation through MR/TGF-β1 pathway in db/db mice
2025-Dec-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124008
PMID:41067301
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研究论文 | 本研究探讨了盐皮质激素受体阻滞剂esaxerenone通过MR/TGF-β1通路抑制db/db小鼠肾脏巨噬细胞增殖的作用机制 | 首次揭示esaxerenone通过MR/TGF-β1信号通路特异性抑制高糖诱导的巨噬细胞增殖,特别是M1亚型 | 研究仅使用db/db小鼠模型,未在其他糖尿病模型验证;体外实验使用骨髓来源巨噬细胞,与肾脏原位巨噬细胞存在差异 | 研究盐皮质激素受体阻滞对糖尿病肾病中巨噬细胞增殖的影响及其机制 | db/db糖尿病模型小鼠和骨髓来源巨噬细胞 | 分子病理学 | 糖尿病肾病 | 免疫组织化学、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 动物模型 | 分子标记表达数据、细胞表型数据、基因表达数据 | 8周龄db/db小鼠,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-11-14 |
The epidermal immune microenvironment plays a central role in the pathogenesis of psoriasis
2025-Dec, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2025.102674
PMID:41072151
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研究论文 | 本文探讨了表皮免疫微环境在银屑病发病机制中的核心作用 | 揭示了表皮免疫微环境作为银屑病核心致病机制,强调角质形成细胞既是炎症效应器又是疾病驱动者的双重角色 | NA | 阐明银屑病的发病机制并探索新的治疗靶点 | 银屑病患者的皮肤免疫微环境 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2025-11-14 |
A Tertiary Lymphoid Structure-Related Gene Signature Predicts Prognosis and Treatment Response in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2646
PMID:41208844
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个与三级淋巴结构相关的六基因特征,用于预测肝细胞癌患者的预后和治疗反应 | 首次建立了基于三级淋巴结构的六基因特征评分系统,并在多个独立队列中验证了其对免疫治疗反应的预测价值 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性临床试验进一步验证 | 开发预测肝细胞癌预后和治疗反应的生物标志物 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,LASSO-Cox回归 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多个独立肝细胞癌队列(包括TCGA和GEO数据库) | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-11-14 |
Analysis of the SH3-Domain Kinase Binding Protein 1 Predictive Model for Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and CCCTC-Binding Factor Transcriptional Regulatory Study
2025-Dec, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2668
PMID:41208840
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研究论文 | 通过多组学整合分析系统评估SH3KBP1在胰腺导管腺癌中的表达模式、生物学功能及调控机制 | 首次通过机器学习算法结合多组学数据鉴定SH3KBP1作为胰腺癌关键预测生物标志物,并揭示CTCF转录因子对其的调控机制 | 样本量相对有限(179例肿瘤样本和171例非肿瘤样本),需更大规模验证 | 系统研究SH3KBP1在胰腺导管腺癌中的表达特征、生物学功能及转录调控机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤组织及细胞系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CRISPR基因敲除,转录因子结合位点预测 | 支持向量机(SVM),LASSO回归,SHAP分析 | mRNA表达数据,蛋白质组学数据,单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 | 179例PDAC肿瘤样本,171例非肿瘤样本(包括4例癌旁组织和167例正常对照),300对PDAC和非肿瘤样本的蛋白质组学数据 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 所有分析均在R平台上使用专业软件包完成 |