单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-06-07	Identification of macrophage-associated diagnostic biomarkers and molecular subtypes in gestational diabetes mellitus based on machine learning 2025-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology DOI:10.1080/21691401.2025.2513893 PMID:40476676	research paper	该研究通过整合scRNA-seq和RNA-seq数据，探索了与巨噬细胞相关的妊娠期糖尿病(GDM)诊断基因和亚型	提出了CB-DSNMF算法用于识别GDM亚型，并构建了基于内皮细胞转录组的高精度诊断模型	未提及样本量是否足够大以验证模型的普适性	探索GDM的分子机制并开发诊断工具	妊娠期糖尿病(GDM)患者	machine learning	gestational diabetes mellitus	scRNA-seq, RNA-seq	ensemble machine learning algorithms, CB-DSNMF	gene expression data	NA
2	2025-06-07	NanoCRISPR-assisted biomimetic tissue-equivalent patch regenerates the intervertebral disc by inhibiting endothelial-to-mesenchymal transition 2025-Nov, Biomaterials IF:12.8Q1 DOI:10.1016/j.biomaterials.2025.123404 PMID:40398216	research paper	该研究提出了一种纳米CRISPR辅助的生物仿生组织等效补片，通过抑制内皮-间质转化来再生椎间盘	使用纳米CRISPR系统靶向消除VEGF介导的血管生成因子，并结合仿生纳米纤维支架促进椎间盘修复	研究未提及长期效果评估或潜在副作用	开发一种新型椎间盘修复方法，解决当前治疗无法充分解决的生物学修复和血管生成问题	椎间盘（特别是纤维环）的再生	生物医学工程	椎间盘退行性疾病	单细胞RNA测序、纳米CRISPR系统	NA	NA	未明确提及样本数量
3	2025-06-07	The battle within: Discovering new insights into phytopathogen interactions and effector dynamics 2025-Sep, Microbiological research IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.micres.2025.128220 PMID:40398012	综述	本文全面回顾了植物病原体与宿主之间复杂的相互作用，特别是效应蛋白触发的免疫机制及其在感染中的作用	强调了元种群动态和快速适应在植物病原体效应蛋白和植物抗性蛋白修饰中的作用，以及环境因素和气候变化对宿主-病原体互作的影响	NA	探讨植物病原体效应蛋白的作用机制及其在疾病管理策略中的应用	植物病原体效应蛋白、植物抗性蛋白、宿主-病原体互作	植物病理学	植物病害	生物信息学、单细胞转录组学	NA	NA	NA
4	2025-06-07	Immune-endothelial cell crosstalk in hepatic endothelial injury of liver fibrotic mice 2025-Aug-05, European journal of pharmacology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.ejphar.2025.177730 PMID:40374060	研究论文	本研究探讨了肝纤维化中肝内皮细胞损伤的机制及细胞间通讯的潜在调控通路	揭示了肝内皮细胞与免疫细胞之间的细胞通讯机制，特别是通过Ptprc-Mrc1和Sell-Podxl信号通路维持肝纤维化过程中的细胞相互作用	研究仅使用了C57BL/6雄性小鼠模型，可能不适用于其他物种或性别	探索肝纤维化中肝内皮细胞损伤的机制及细胞间通讯的调控通路	C57BL/6雄性小鼠的肝内皮细胞和免疫细胞	肝脏病理学	肝纤维化	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、扫描电子显微镜（SEM）、PCR技术	NA	基因表达数据、显微图像	24,534个细胞，聚类为10个主要细胞亚群
5	2025-06-07	A multimorphic variant in ThPOK causes an inborn error of immunity with T cell defects and fibrosis 2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20241174 PMID:40392549	research paper	该研究报道了由ThPOK基因变异引起的首例人类疾病，揭示了该变异对CD4+ T细胞发育、TCR激活及纤维化途径调控的新作用	首次发现ThPOK基因变异导致的人类疾病，揭示了ThPOK在CD4+ T细胞发育、TCR激活及纤维化途径调控中的新作用	仅报道了一例患者，样本量较小	研究ThPOK基因变异对人类免疫系统及纤维化的影响	一名携带ThPOKK360N变异的患者及其细胞模型	免疫学	免疫缺陷病	单细胞RNA测序、慢病毒转导	NA	基因测序数据、转录组数据	1例患者及其细胞模型
6	2025-06-07	Transcriptional profile and quantitative proteomics revealed NGF-p75NTR-associated synaptic plasticity and heterogeneity for diabetic encephalopathy and the potential role of CoQ10 for diabetic induced cognitive deficits in mice 2025-Aug, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167823 PMID:40185338	research paper	该研究通过转录组和定量蛋白质组学揭示了NGF-p75NTR相关的突触可塑性和糖尿病脑病的异质性，并探讨了CoQ10在糖尿病诱导认知缺陷中的潜在作用	首次研究了DICD相关及CoQ10处理的蛋白质组变化，以及DICD与对照组之间的异质性变化，并发现NGF-p75NTR信号通路显著参与突触可塑性调节	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床中进行验证	探讨CoQ10在糖尿病诱导认知缺陷（DICD）中的细胞和分子特征及其潜在作用	糖尿病脑病（DE）和糖尿病诱导认知缺陷（DICD）小鼠模型	digital pathology	diabetic encephalopathy	TMT-based quantitative proteomics, scRNA-sequencing, Western blotting	NA	proteomics data, transcriptomics data	小鼠模型（具体数量未明确说明）
7	2025-06-07	CTLA4 modulates B cell receptor signals to inhibit HBsAb secretion in chronic hepatitis B patients 2025-Aug, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167848 PMID:40279930	研究论文	本研究探讨了CTLA4在慢性乙型肝炎(CHB)患者B细胞中对HBsAb分泌的抑制作用及其机制	首次揭示了CTLA4通过结合SHP-1抑制Jak-STAT和B细胞受体信号通路，从而影响HBsAb分泌的新机制	研究主要基于体外实验和小鼠模型，需要进一步临床验证	探索CHB患者B细胞功能缺陷的分子机制及潜在治疗靶点	慢性乙型肝炎患者的B细胞	免疫学	慢性乙型肝炎	单细胞RNA测序	HBV小鼠模型	RNA测序数据	CHB患者外周和肝脏HBsAg特异性B细胞
8	2025-06-07	DSG2 attenuates gemcitabine efficacy through PTX3 in lung adenocarcinoma 2025-Aug, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167881 PMID:40316058	研究论文	本研究探讨了DSG2在肺腺癌中对吉西他滨疗效的影响及其通过PTX3介导的机制	首次揭示了DSG2通过PTX3/NFκB/STAT3通路介导吉西他滨耐药的新机制	研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证	探究DSG2在肺腺癌中对吉西他滨疗效的影响机制	肺腺癌细胞和组织	肿瘤学	肺腺癌	单细胞测序、KEGG和GSEA多组学数据库分析、体外实验	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	TCGA数据库中的肺腺癌组织样本
9	2025-06-07	Fenofibrate inhibits activation of cGAS-STING pathway by alleviating mitochondrial damage to attenuate inflammatory response in diabetic dry eye 2025-Aug-01, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.05.383 PMID:40339725	research paper	本研究探讨了cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼症(DDE)中的作用，并研究了非诺贝特通过减轻线粒体损伤抑制该通路的治疗效果及机制	首次揭示了cGAS-STING信号通路在DDE发病机制中的关键作用，并发现非诺贝特通过减轻线粒体损伤抑制该通路的新治疗策略	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未进行人体临床试验	探究cGAS-STING信号通路在DDE中的作用及非诺贝特的治疗机制	糖尿病干眼症(DDE)小鼠模型和永生化人角膜上皮细胞(HCE-T)	分子生物学	糖尿病干眼症	单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 基因表达综合数据库(GEO)分析	STZ诱导的DDE小鼠模型	RNA测序数据, 细胞实验数据	未明确说明样本数量，使用了GEO数据库数据和实验动物模型
10	2025-06-07	Single-cell RNA sequencing identifies cellular heterogeneity in endothelial and epithelial cells associated with nitrogen dioxide-induced acute lung injury 2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118385 PMID:40403690	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究了二氧化氮诱导的急性肺损伤中内皮细胞和上皮细胞的异质性变化	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了二氧化氮诱导的急性肺损伤中内皮细胞和上皮细胞的异质性变化，并发现了新的上皮细胞亚群Ly6a肺泡细胞	研究仅关注了内皮细胞和上皮细胞的变化，未涉及其他可能参与急性肺损伤的细胞类型	探究二氧化氮诱导的急性肺损伤的分子机制	内皮细胞和上皮细胞	数字病理学	急性肺损伤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量
11	2025-06-07	Characterizing microglial heterogeneity in autophagy impairment of Paraquat-induced Parkinson's disease-like neurodegeneration 2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118364 PMID:40403688	研究论文	本研究通过建立百草枯诱导的帕金森病样神经退行性变模型，利用单细胞RNA测序技术揭示了小胶质细胞在自噬障碍中的异质性及其在病理过程中的核心作用	首次在百草枯暴露背景下生成自噬的单细胞RNA测序图谱，发现小胶质细胞亚型在自噬调节中的异质性，并鉴定出一个自噬特异性小胶质细胞亚型	研究主要基于动物模型和体外细胞实验，结果向人类帕金森病的直接转化需要进一步验证	探究百草枯诱导的帕金森病样神经退行性变中自噬障碍的细胞异质性	百草枯诱导的帕金森病样神经退行性变模型中的小胶质细胞	神经退行性疾病研究	帕金森病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	百草枯诱导的PD样神经退行性变模型	转录组数据	未明确说明样本数量，使用动物模型和BV2细胞系
12	2025-06-07	Subacute dibutyl phthalate exposure impairs hepatic T cells and facilitates hepatitis B progression in mouse liver 2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118398 PMID:40440982	research paper	该研究探讨了亚急性邻苯二甲酸二丁酯（DBP）暴露如何通过损害肝脏T细胞功能促进乙型肝炎病毒（HBV）的进展	首次揭示了DBP通过驱动T细胞耗竭加剧HBV进展的机制，并提出了针对免疫耗竭的治疗策略	研究主要基于小鼠模型，人类流行病学数据的相关性分析尚未完全验证因果关系	探究亚急性DBP暴露对HBV进展的影响及其免疫调节机制	HBV感染患者和小鼠模型	免疫学	乙型肝炎	单细胞RNA测序、流式细胞术、共培养实验	小鼠模型	RNA测序数据、流式细胞数据、流行病学数据	HBV感染患者肝脏组织和小鼠模型
13	2025-06-07	Integrated analyses reveal CXCL11 as an inhibitor in ovarian cancer and its facilitation of an M1 macrophage switch via the JAK2/STAT1 pathway 2025-Jun-26, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114900 PMID:40409100	研究论文	本文通过整合分析揭示了CXCL11在卵巢癌中的抑制作用及其通过JAK2/STAT1通路促进M1巨噬细胞极化的机制	首次系统地识别了M1巨噬细胞相关分子并确立了它们在卵巢癌中的预后意义，特别是CXCL11的双重功能	研究主要基于生物信息学分析和体外功能实验，缺乏体内实验验证	深入了解M1样肿瘤相关巨噬细胞在卵巢癌中的积极作用，并识别可靠的生物标志物以分层卵巢癌患者的疾病进展风险	卵巢癌(OC)中的M1样肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其相关分子机制	肿瘤生物学	卵巢癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量转录组数据分析	NA	转录组数据	未明确说明样本数量
14	2025-06-07	Eleutheroside A inhibits PI3K/AKT1/mTOR-mediated glycolysis in MDSCs to alleviate their immunosuppressive function in gastric cancer 2025-Jun-26, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114907 PMID:40409102	研究论文	研究探讨了刺五加苷A（EA）通过抑制PI3K/AKT1/mTOR信号通路和HIF-1α介导的糖酵解，减轻髓源性抑制细胞（MDSCs）的免疫抑制功能，从而抑制胃癌（GC）肿瘤生长的机制	首次揭示了EA通过靶向PI3K/AKT1/mTOR信号通路和HIF-1α介导的糖酵解，调节MDSCs的免疫抑制功能，为胃癌治疗提供了新的免疫治疗策略	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类临床试验中验证EA的效果和安全性	探究EA对胃癌免疫抑制微环境的调节作用及其机制	胃癌小鼠模型、MDSCs、CD4+/CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	胃癌	流式细胞术、免疫荧光、bulk RNA-seq、scRNA-seq、网络药理学分析、PPI网络分析、分子对接、SPR、qPCR、Western blotting、Seahorse assays	小鼠皮下胃癌模型	RNA-seq数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像	小鼠模型、TCGA数据库、两个scRNA-seq数据集（GSE183904和GSE150290）
15	2025-06-07	Integrative single-cell and bulk transcriptomics with Mendelian randomization reveals NAD-related biomarkers in diabetic retinopathy: Insights and experimental validation 2025-Jun-26, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114949 PMID:40435823	研究论文	本研究通过整合单细胞和批量转录组学与孟德尔随机化方法，揭示了糖尿病视网膜病变中与NAD相关的生物标志物，并进行了实验验证	首次整合单细胞和批量转录组学与孟德尔随机化方法，识别出CCDC88A和GPD2作为糖尿病视网膜病变的潜在生物标志物，并发现小胶质细胞在疾病中的关键作用	研究主要基于公共数据库数据，实验验证样本量有限	识别与NAD相关的生物标志物并阐明其在糖尿病视网膜病变中的分子机制	糖尿病视网膜病变患者	生物信息学	糖尿病视网膜病变	scRNA-seq, RT-qPCR, 孟德尔随机化分析	NA	转录组数据	公共数据库数据及实验验证样本
16	2025-06-07	Characterization of m6A-Related Genes in Tumor-Associated Macrophages for Prognosis, Immunotherapy, and Drug Prediction in Lung Adenocarcinomas Based on Machine Learning Algorithms 2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202500293RR PMID:40474570	research paper	该研究通过机器学习算法分析了肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的m6A相关基因，用于预后、免疫治疗和药物预测	首次在肺腺癌中鉴定出与m6A修饰相关的巨噬细胞基因(MMRGs)，并利用多种机器学习算法构建预后模型和筛选潜在治疗药物	研究结果需要进一步的实验验证和临床转化	探索m6A修饰在肿瘤相关巨噬细胞中的作用及其对肺腺癌进展的影响	肺腺癌患者的肿瘤相关巨噬细胞和m6A相关基因	machine learning	lung cancer	单细胞转录组分析、分子对接、分子动力学、免疫组化、免疫荧光	多种机器学习算法(共13种)	转录组数据、蛋白质表达数据	NA
17	2025-06-07	Inhibition of Cholesterol Synthesis in T Cells Protects the Liver Against Steatosis, Inflammation, and Oxidative Stress in Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis 2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202500115R PMID:40476852	研究论文	本研究探讨了抑制T细胞中胆固醇合成对代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）中肝脏脂肪变性、炎症和氧化应激的保护作用	揭示了通过药理学调节T细胞胆固醇代谢作为治疗MASH的新策略	研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探究T细胞胆固醇代谢在MASH发病机制中的作用及潜在治疗靶点	小鼠MCD饮食诱导的MASH模型中的CD8 T细胞	免疫代谢	代谢功能障碍相关脂肪性肝炎	单细胞转录组分析	小鼠MCD饮食诱导模型	转录组数据	NA
18	2025-06-07	Habitual Exercise Modulates Neuroimmune Interaction to Mitigate Aortic Stiffness 2025-Jun-06, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325656 PMID:40304034	研究论文	研究探讨了习惯性运动如何通过调节神经免疫相互作用来减轻主动脉硬化	揭示了运动通过调节交感神经与免疫细胞的相互作用来减轻主动脉硬化的新机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探究运动对主动脉硬化中神经免疫相互作用的调节作用	C57BL/6小鼠	心血管疾病	心血管疾病	单细胞RNA测序、免疫组织化学、基因敲除	小鼠模型	基因表达数据、生理参数	未明确说明具体数量，但涉及多种处理组的小鼠
19	2025-06-07	Excess Neprilysin in Placental EVs Impairs CNP-NPRB-Mediated Vasodilation to Trigger Preeclamptic Hypertension 2025-Jun-06, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325673 PMID:40304042	research paper	研究发现子痫前期胎盘细胞外囊泡中过量的NEP通过降解CNP，损害血管舒张功能，从而引发高血压	首次揭示胎盘细胞外囊泡中NEP通过CNP-NPRB信号通路导致子痫前期高血压的机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证	阐明子痫前期发病机制中胎盘与血管功能障碍之间的联系	胎盘细胞外囊泡、子宫动脉血管、血管平滑肌细胞	生殖医学	子痫前期	液相色谱-质谱联用技术、单细胞RNA测序、腺病毒转染	小鼠疾病模型	分子生物学数据、生理学数据	未明确说明样本数量，使用正常和子痫前期胎盘组织及对应小鼠模型
20	2025-06-07	T Cell Exhaustion-Related Gene Signatures Predict Immunotherapy and Chemotherapy Response in Kidney Renal Clear Cell Carcinoma 2025-Jun-06, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals DOI:10.1089/cbr.2025.0060 PMID:40474808	研究论文	本研究开发了一个基于T细胞耗竭（TEX）的预后模型，用于预测肾透明细胞癌（KIRC）患者的生存结果和治疗反应	通过TEX相关基因特征预测免疫治疗和化疗反应，为个性化治疗策略提供新见解	研究样本主要来自TCGA数据库，可能缺乏外部验证队列的广泛代表性	预测KIRC患者的免疫治疗和化疗反应，优化个性化治疗策略	肾透明细胞癌（KIRC）患者	数字病理学	肾癌	基因集变异分析、加权相关网络分析、单细胞RNA测序、实时定量PCR	随机森林、LASSO-Cox回归	基因表达数据	518名来自TCGA的KIRC患者，以及IMvigor210和GDSC数据库的数据