单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-09-26	Type I IFN drives neutrophil swarming, impeding lung T cell-macrophage interactions and TB control 2025-Dec-01, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20250466 PMID:40986319	研究论文	本研究通过比较不同小鼠模型，揭示了I型干扰素在结核感染早期通过促进中性粒细胞聚集而限制CD4+ T细胞浸润的免疫机制	发现相对耐药小鼠反而表现出更强的早期I型干扰素反应，并首次阐明I型干扰素通过调控中性粒细胞群聚影响T细胞-巨噬细胞空间互作的机制	研究局限于小鼠模型，尚未在人类感染中验证	探究结核分枝杆菌感染早期决定感染结果的免疫机制	C57BL/6和C3HeB/FeJ品系小鼠的肺部免疫反应	免疫学	结核病	bulk RNA-seq, scRNA-seq	NA	基因表达数据	两种品系小鼠在感染初数周内的肺部组织样本
2	2025-09-26	Daytime SHP2 inhibitor dosing, when immune cell numbers are elevated, shrinks neurofibromas 2025-Dec, Life science alliance IF:3.3Q1 DOI:10.26508/lsa.202503359 PMID:40992926	研究论文	本研究探讨SHP2抑制剂在特定给药时间下通过靶向单核细胞来源巨噬细胞缩小神经纤维瘤的机制	首次揭示SHP2抑制剂疗效与给药时间（白天）和免疫细胞浸润水平的关联性	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体验证	探究SHP2抑制剂对神经纤维瘤体积和免疫微环境的影响	神经纤维瘤小鼠模型及其肿瘤微环境中的免疫细胞	肿瘤免疫学	神经纤维瘤病	流式细胞术、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、细胞计数数据	肿瘤小鼠模型（具体数量未明确说明）
3	2025-09-26	Single-cell RNA sequencing reveals early cell dynamics of MSC-based therapy in long bone critical-size defects in mice 2025-Nov, Journal of orthopaedic translation IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.jot.2025.08.007 PMID:40995603	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示小鼠长骨临界尺寸缺损中基于MSC治疗的早期细胞动态变化	首次在临界尺寸骨缺损模型中应用单细胞RNA测序技术，系统分析MSC治疗对局部免疫微环境的早期调控机制	研究仅观察术后1周的早期变化，缺乏长期疗效评估；样本量有限且仅使用小鼠模型	阐明MSC在骨缺损愈合早期调控局部微环境的作用机制	BALB/c雄性小鼠的股骨临界尺寸缺损模型	单细胞组学	骨缺损	单细胞RNA测序（scRNA-seq），UMAP降维分析，Louvain聚类	NA	单细胞转录组数据	小鼠随机分为三组（空白组、支架组、支架+MSC组），术后1周采集缺损组织进行测序
4	2025-09-26	Technological innovations promote cancer stem cell-based translational research 2025-Oct-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217949 PMID:40712971	综述	本文综述了技术创新如何促进基于癌症干细胞（CSCs）的转化研究	综合评述了单细胞测序、器官芯片平台和人工智能等前沿技术在揭示CSC分子调控机制和开发靶向干预策略中的创新应用	NA	探讨技术发展如何推动基于癌症干细胞的治疗策略研究	癌症干细胞（CSCs）及其肿瘤微环境	转化医学	癌症	单细胞测序、功能基因组学、器官芯片平台、人工智能（AI）	NA	NA	NA
5	2025-07-29	Radiotherapy in combination with PD-1 and TIGIT blockade mediate antitumor abscopal effects and immune memory via CD8+ T cells 2025-Oct-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217935 PMID:40714064	研究论文	本研究探讨了放疗联合抗PD-1和抗TIGIT抗体（aPD-1/aTIGIT）的协同抗肿瘤效果，重点关注原发性和远隔肿瘤控制、免疫机制及长期免疫记忆	揭示了CD8 T细胞作为远隔效应和长期免疫的核心介质，强调了M1巨噬细胞极化在增强治疗协同作用中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行临床试验验证	探索放疗联合免疫治疗增强抗肿瘤效果的机制	小鼠模型中的LLC、CMT-167、B16-F10、MC38肿瘤	肿瘤免疫治疗	癌症	流式细胞术、多色免疫荧光、单细胞转录组学、Luminex细胞因子分析	小鼠肿瘤模型	细胞和分子数据	多种小鼠肿瘤模型（LLC、CMT-167、B16-F10、MC38）
6	2025-09-26	Inhibition of ACVR1 in Cancer-Associated Fibroblasts Suppresses Colorectal Cancer Cell Growth 2025-Oct, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1 DOI:10.1245/s10434-025-17765-0 PMID:40745121	研究论文	本研究通过类器官模型揭示ACVR1-BMP7轴是结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的潜在治疗靶点	首次利用二维类器官模型模拟结直肠癌组织特征，发现ACVR1抑制剂可抑制癌症相关成纤维细胞增殖	研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步临床验证	探索结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的分子靶向治疗策略	结直肠癌细胞、癌症相关成纤维细胞、小鼠模型	癌症研究	结直肠癌	单细胞RNA测序、类器官培养、小鼠异种移植模型	二维类器官模型	基因表达数据、生存分析数据	涉及人类结直肠癌样本和小鼠模型
7	2025-09-26	Poor Collateralization in T2DM: Role of SLC4A10+ MAIT Cells 2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322718 PMID:40808651	研究论文	本研究探讨2型糖尿病患者中黏膜相关恒定T细胞对侧支循环不良的调控机制	首次发现MAIT细胞通过CCL3L1-CCR5轴驱动巨噬细胞促炎极化进而抑制侧支形成的新机制	样本量有限，机制研究主要基于动物模型和体外实验	揭示2型糖尿病合并慢性完全闭塞患者侧支循环不良的免疫学机制	2型糖尿病合并慢性完全闭塞患者及糖尿病小鼠模型	免疫学与心血管疾病	2型糖尿病与心血管并发症	单细胞RNA测序、共培养实验、小鼠后肢及心肌缺血模型	动物疾病模型	单细胞转录组数据、临床数据	包含初始队列和独立验证队列的2型糖尿病患者群体
8	2025-09-26	CXCL4-Induced PBMCs Modulate Vascular Extracellular Matrix via Wnt5a-Dependent Matrix Metalloproteinase-7 and Calcifying Extracellular Vesicle Release 2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322067 PMID:40836918	研究论文	本研究揭示了CXCL4诱导的单核细胞通过Wnt5a-CaMKII信号轴促进血管基质钙化的新机制	首次发现CXCL4诱导的炎症单核细胞通过Wnt5a-CaMKII信号轴分泌富含MMP7和S100A8的钙化细胞外囊泡	机制研究主要基于体外实验，需要更多体内验证	探究CXCL4诱导的单核细胞在血管炎症反应中促进细胞外基质钙化的分子机制	人外周血单核细胞、血管平滑肌细胞、人颈动脉斑块组织	血管生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序、细胞外囊泡分析、组织学验证	NA	基因表达数据、组织切片图像	人外周血单核细胞样本和人颈动脉斑块组织样本
9	2025-09-26	Genomic Insights at the Maternal-Fetal Interface: Preeclampsia Subtypes and Clinical Implications 2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.125.321710 PMID:40874308	综述	基于单细胞转录组学探讨子痫前期母胎界面的分子特征及临床亚型分类	通过单细胞分辨率揭示母胎界面细胞特异性基因表达变化，首次明确区分胎盘主导型与母体心血管主导型两种子痫前期亚型	未涉及具体样本量及实验验证数据	解析子痫前期的分子病理机制并指导临床分型	母胎界面细胞（合体滋养细胞、基质细胞、免疫细胞）	基因组学	妊娠期高血压疾病	单细胞转录组学	NA	基因组表达数据	NA
10	2025-09-26	Computational Analysis of Exosome-Derived Signature in TNBC: Integrating Single-Cell and Bulk Transcriptomics for Prognosis Prediction 2025-Oct, Clinical and translational science DOI:10.1111/cts.70368 PMID:40994257	研究论文	通过整合单细胞和批量转录组数据构建三阴性乳腺癌外泌体相关预后标志物	首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，从外泌体相关基因角度开发TNBC预后预测模型	需要进一步验证该标志物与外泌体生物学的直接关系	探索外泌体相关基因在三阴性乳腺癌预后预测中的作用	三阴性乳腺癌患者样本（10例单细胞测序样本+TCGA/METABRIC队列）	计算生物学	三阴性乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序，机器学习	整合机器学习方法（包含单变量Cox回归）	基因表达数据（转录组数据）	10个TNBC样本的31,140个细胞 + TCGA和METABRIC队列数据
11	2025-09-26	Tumor necrosis facilitates perihilar cholangiocarcinoma metastasis by ANGPTL6-augmented vessel permeability and tumor dissemination 2025-Oct, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101514 PMID:40995437	研究论文	本研究探讨肿瘤坏死对肝门部胆管癌转移的影响及其分子机制	首次通过空间蛋白质组学发现ANGPTL6在肿瘤坏死区域的特异性富集，并阐明其通过增加血管通透性促进转移的新机制	研究样本仅限肝门部胆管癌患者，机制研究仍需更深入的验证	探究肿瘤坏死在肝门部胆管癌中的预后意义及分子调控机制	306例肝门部胆管癌患者组织样本及体外/体内模型	数字病理	肝门部胆管癌	激光捕获显微切割、高分辨率质谱、单细胞RNA测序	NA	蛋白质组数据、转录组数据、临床病理数据	306例肝门部胆管癌患者（其中162例存在肿瘤坏死）
12	2025-09-26	Expression and Clinical Implications of LAG-3 in Small Cell Lung Cancer 2025-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202502183R PMID:40960909	研究论文	本研究通过多组学数据分析探讨LAG-3在小细胞肺癌中的表达特征及其临床意义	首次系统评估28种免疫检查点分子在SCLC中的表达谱，发现LAG-3具有最高过表达水平并验证其免疫治疗预测价值	回顾性研究设计，需要前瞻性临床试验进一步验证LAG-3的生物标志物作用	探索PD-L1之外可用于免疫检查点抑制剂的潜在生物标志物	小细胞肺癌细胞系和肿瘤组织样本	数字病理学	肺癌	RNA-seq、微阵列、scRNA-seq、免疫组化	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	多个公共数据库（CCLE等）和内部数据集，包含细胞系和肿瘤标本数据
13	2025-09-26	Glioblastoma exploits ATP from leading-edge astrocytes to fuel its infiltrative growth revealed by spatially resolved chimeric analysis 2025-Sep-26, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adv5673 PMID:40991701	研究论文	本研究通过开发空间分辨嵌合分析工具SCAR，揭示了胶质母细胞瘤利用前沿星形胶质细胞的ATP促进浸润性生长的代谢机制	开发了SCAR计算工具用于解析人鼠嵌合癌症模型的空间转录组数据，首次发现浸润性胶质母细胞瘤通过CKB介导的代谢重编程利用星形胶质细胞的ATP	研究基于人鼠嵌合模型，与人类真实肿瘤微环境可能存在差异	探究胶质母细胞瘤浸润性生长的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用机制	胶质母细胞瘤细胞和肿瘤微环境中的星形胶质细胞	空间转录组学	胶质母细胞瘤	空间转录组学、人鼠嵌合癌症模型	SCAR计算工具	空间基因表达数据	NA
14	2025-09-26	Cyclic Heptapeptide FZ1 Acts as an Integrin αvβ3 Agonist to Facilitate Diabetic Skin Wound Healing by Enhancing Angiogenesis 2025-Sep-25, Journal of medicinal chemistry IF:6.8Q1 DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c01734 PMID:40910702	研究论文	本研究首次发现环状七肽FZ1可作为整合素αvβ3激动剂，通过激活FAK-AKT/ERK1/2信号通路促进VEGFC表达，从而增强血管生成并加速糖尿病皮肤伤口愈合	首次鉴定出靶向整合素αvβ3的肽类激动剂FZ1，并阐明其通过FAK依赖性信号通路促进糖尿病伤口愈合的新机制	NA	开发促进糖尿病伤口愈合的有效治疗剂并阐明其调控机制	环状七肽FZ1及其在糖尿病伤口愈合中的作用机制	生物医学	糖尿病并发症	单细胞RNA测序、RNA干扰、表面等离子共振、分子对接	NA	实验数据	糖尿病伤口模型
15	2025-09-26	Rolling circle amplification for next-generation molecular diagnostics, genome analysis, and spatial transcriptome profiling 2025-Sep-25, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/d5nr03032c PMID:40917009	综述	本文全面探讨滚环扩增技术的基本原理、设计改进及其在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用	将RCA与CRISPR检测、生物传感器和纳米粒子辅助信号放大技术集成，显著提升了诊断潜力	存在反应特异性、自动化和成本效益等关键挑战	推动RCA技术在高通量分子诊断、生物标志物发现及空间多组学平台的应用发展	核酸、蛋白质、细胞外囊泡和单细胞等生物分子	分子诊断技术	癌症	滚环扩增、CRISPR检测、纳米粒子辅助信号放大	NA	核酸序列、基因表达数据	NA
16	2025-09-26	AURKA Enhances Antitumor Immunity by Activating CD4+ T Cell Proliferation in Colorectal Cancer 2025-Sep-25, Cancer investigation IF:1.8Q3 DOI:10.1080/07357907.2025.2559403 PMID:40995659	研究论文	本研究通过多组学分析揭示AURKA在结直肠癌中通过激活CD4+ T细胞增殖增强抗肿瘤免疫的双重功能	首次整合空间转录组学发现AURKA在肿瘤周边T细胞富集区的免疫调节作用，并验证其作为免疫治疗生物标志物的潜力	研究样本量有限，需要更大规模临床队列验证AURKA的预后价值	阐明AURKA在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫调节机制	结直肠癌患者样本和小鼠模型	肿瘤免疫学	结直肠癌	bulk RNA-seq, scRNA-seq, 10x Visium空间转录组, CIBERSORT/ssGSEA, IHC/HE染色	小鼠模型	基因组学数据、空间转录组数据、临床病理数据	包含临床队列和动物模型的多个数据集
17	2025-09-26	Nonalcoholic Fatty Liver Disease Exacerbates the Advancement of Renal Fibrosis by Modulating Renal CCR2+PIRB+ Macrophages Through the ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP Axis 2025-Sep-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202509351 PMID:40995682	研究论文	本研究揭示了非酒精性脂肪肝病通过ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP轴调控肾脏CCR2+PIRB+巨噬细胞加剧肾纤维化的机制	首次发现NAFLD通过肝脏分泌ANGPTL8激活肾脏特异性CCR2+PIRB+巨噬细胞，并阐明其通过破坏亚油酸代谢和促进Th17细胞活化加剧肾纤维化的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证	探究NAFLD促进肾纤维化的具体分子机制	小鼠模型（UUO手术+HFD诱导NAFLD）、原代肾脏巨噬细胞、共培养体系	病理机制研究	非酒精性脂肪肝病、肾纤维化	单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、流式细胞术、免疫荧光	动物疾病模型	基因表达数据、代谢物数据、细胞表型数据	小鼠模型及体外细胞实验（具体数量未明确说明）
18	2025-09-26	Single-Cell Immune Profiling Reveals Neutrophils Promote Myasthenia Gravis Exacerbation Through BAFF Secretion 2025-Sep-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202509260 PMID:40995750	研究论文	通过单细胞测序揭示中性粒细胞通过分泌BAFF促进重症肌无力恶化的新机制	首次发现中性粒细胞-BAFF-浆细胞轴在MG急性加重中的作用，并证实IFN-γ信号通路是该过程的关键驱动因素	NA	探究中性粒细胞在重症肌无力急性加重中的具体作用机制	重症肌无力患者骨髓和外周血样本、实验性自身免疫性重症肌无力小鼠模型	免疫学	重症肌无力	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因敲除模型、血清细胞因子分析	NA	基因表达数据、临床数据	重症肌无力患者队列（具体数量未明确）
19	2025-09-26	Integrated single-cell transcriptomics and Mendelian randomization identify neutrophil-associated biomarker genes in colorectal cancer 2025-Sep-25, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-03452-9 PMID:40996626	研究论文	通过整合单细胞转录组学与孟德尔随机化方法，识别结直肠癌中中性粒细胞相关的生物标志物基因	首次结合scRNA-seq、MR和共定位分析系统鉴定中性粒细胞相关基因在CRC中的因果作用	研究依赖公共数据库数据，需进一步实验验证功能性机制	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
20	2025-09-26	Identification of immunosuppressive CD4+ T-cell subtype and construction of prognostic model for hepatocellular carcinoma 2025-Sep-25, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-03556-2 PMID:40996677	研究论文	通过单细胞RNA测序鉴定肝癌中免疫抑制性CD4+ T细胞亚型并构建预后模型	首次识别SPP1+TNFRSF18+ CD4+ T细胞作为肝癌免疫逃逸的关键驱动者，并构建九基因预后模型	样本量较小（16例患者），需在更大队列中验证	阐明CD4+ T细胞在肝癌免疫逃逸中的作用并开发预后工具	肝癌患者组织样本和公共数据库数据	生物信息学	肝癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接、动力学模拟	LASSO Cox回归模型	基因表达数据	16例HCC患者（GSE149614），TCGA-LIHC和GSE109211数据库验证