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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-15 |
Exploring the Epidemiology and Molecular Mechanisms of Riboflavin Against Chronic Kidney Disease Based on Data Mining, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2025 Nov-Dec, Journal of the American Nutrition Association
IF:6.8Q1
DOI:10.1080/27697061.2025.2509900
PMID:40435123
|
研究论文 | 本研究通过数据挖掘、单细胞RNA测序和分子对接探索核黄素与慢性肾脏病的流行病学关联及分子机制 | 首次结合流行病学调查、单细胞RNA测序和分子对接技术系统揭示核黄素通过调节炎症因子和信号通路预防慢性肾脏病的机制 | 研究主要基于公共数据库和回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索核黄素与慢性肾脏病的流行病学关联及其分子作用机制 | 慢性肾脏病患者及核黄素作用靶点 | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 数据挖掘, 逻辑回归模型, 限制性立方样条 | 逻辑回归模型, 中介分析模型 | 流行病学调查数据, 基因表达数据, 蛋白质结构数据 | 美国国家健康与营养调查数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-15 |
Comprehensive molecular characterization of craniopharyngiomas using whole transcriptome and spatial transcriptomics approaches
2025-Oct, Brain tumor pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s10014-025-00509-z
PMID:40634824
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研究论文 | 通过全转录组测序和空间转录组学方法对颅咽管瘤进行全面的分子特征分析 | 首次结合全转录组测序和空间转录组学技术系统分析颅咽管瘤两种亚型的分子差异 | 样本量相对有限（24个肿瘤样本），健康垂体组织数据来自外部数据库 | 分析颅咽管瘤两种亚型的分子差异，为诊断和治疗提供依据 | 颅咽管瘤肿瘤样本（ACP和PCP亚型）及健康垂体组织 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序, 空间转录组学, Sanger测序 | 生物信息学分析流程 | 转录组数据, 空间基因表达数据 | 24个肿瘤样本，外加GTEx数据库中的健康垂体数据 | NA | 全转录组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-15 |
Leptin Aggravates Thoracic Aortic Dissection Through Impairment of Energy Metabolism in Nrip2+ Smooth Muscle Cells
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502027
PMID:40667784
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研究论文 | 本研究探讨瘦素通过影响Nrip2+平滑肌细胞能量代谢加剧胸主动脉夹层的机制 | 发现新型Nrip2平滑肌细胞亚群及其在瘦素诱导的血管平滑肌细胞表型转换中的保护作用 | 动物模型研究，需要进一步验证人类临床相关性 | 阐明肥胖相关胸主动脉夹层的发病机制 | 瘦素敲除小鼠、血管平滑肌细胞、胸主动脉夹层患者 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | UK Biobank数据及小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-15 |
PLAUR+ Neutrophils Drive Anti-PD-1 Therapy Resistance in Patients with Hepatocellular Carcinoma by Shaping an Immunosuppressive Microenvironment
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507167
PMID:40673864
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研究论文 | 本研究揭示PLAUR+中性粒细胞通过塑造免疫抑制微环境驱动肝细胞癌患者抗PD-1治疗耐药 | 首次发现PLAUR+中性粒细胞是免疫治疗耐药的关键驱动因素，并通过基于结构的虚拟筛选鉴定出新型PLAUR抑制剂 | 未明确PLAUR+中性粒细胞在其它癌症类型中的普适性作用 | 探究肝细胞癌免疫治疗耐药的机制并开发逆转策略 | 肝细胞癌患者临床队列和临床前模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 多组学分析、空间转录组学、单细胞RNA测序、基于结构的虚拟筛选 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 临床队列和多种体内肿瘤模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-15 |
Joint representation and visualization of derailed cell states with Decipher
2025-Jul-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03682-8
PMID:40702544
|
研究论文 | 提出一种名为Decipher的深度生成模型，用于整合单细胞基因组学数据并可视化正常与异常细胞状态间的转变 | 开发了首个能够联合建模和可视化正常与扰动单细胞RNA-seq数据的深度生成模型，揭示共享和破坏的细胞动态 | NA | 开发计算工具以整合跨条件的单细胞基因组学数据并表征正常到异常细胞状态的转变 | 单细胞RNA测序数据中的细胞状态 | 机器学习 | 胰腺炎、急性髓系白血病、胃癌 | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-15 |
Etiological basis for chronic pain genetic variation in brain and dorsal root ganglia cell types
2025-Jul-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.07.03.25330832
PMID:40630576
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研究论文 | 通过整合慢性疼痛GWAS数据与单细胞测序数据，揭示慢性疼痛遗传变异在脑部和背根神经节细胞类型中的病因学基础 | 首次在脑部和背根神经节中系统识别与慢性疼痛相关的特定细胞类型，并揭示其在中央和外周神经系统中的细胞类型特异性遗传结构 | 样本量相对有限（特别是背根神经节样本），主要基于相关性分析 | 阐明慢性疼痛的遗传变异在特定细胞类型中的分布和作用机制 | 人类脑组织、背根神经节、小鼠背角组织 | 生物信息学 | 慢性疼痛 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞染色质可及性分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | GWAS样本1,235,695例，背根神经节样本12例 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞染色质可及性分析 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-15 |
CrebA regulation of secretory capacity: Genome-wide transcription profiling coupled with in vivo DNA binding studies
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.12.659381
PMID:40667345
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研究论文 | 通过DNA结合实验和单细胞RNA测序研究果蝇CrebA转录因子调控分泌能力的机制 | 结合全基因组转录谱分析和体内DNA结合研究，首次在单细胞水平揭示CrebA调控分泌通路基因的机制 | CrebA结合基因数量远超其调控基因，功能结合的特征尚不明确；在其他果蝇胚胎组织中的作用仍需验证 | 探究CrebA转录因子调控分泌能力的分子机制及其在进化中的保守性 | 果蝇胚胎唾液腺及哺乳动物Creb3L家族转录因子 | 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, DNA结合测定, 表达分析, 结合位点诱变 | NA | 基因表达数据, DNA结合数据 | 野生型和CrebA缺失型果蝇胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-15 |
A Molecular, Spatial, and Regulatory Atlas of the Hydra vulgaris Nervous System
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.15.531610
PMID:36993575
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术构建了水螅神经系统最全面的分子和空间图谱 | 首次系统鉴定水螅神经系统的八种神经元类型和十五种转录亚型，并解析其空间分布和基因调控网络 | 研究聚焦于水螅这一模式生物，结果向更复杂神经系统的推广性有待验证 | 揭示神经系统发育、稳态和再生的分子机制 | 水螅（Hydra vulgaris）神经系统 | 发育神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 轨迹推断 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-15 |
White and Brown Adipose Tissue Share a Common Fibro-Adipogenic Progenitor Population
2025-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656577
PMID:40501707
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现白色和棕色脂肪组织共享共同的纤维-脂肪生成祖细胞群 | 首次在棕色脂肪组织中鉴定出纤维-脂肪生成祖细胞样细胞，扩展了该组织中已知祖细胞群体的范围 | 使用培养的原代细胞模型可能无法完全反映体内真实情况 | 研究白色和棕色脂肪前体细胞在培养条件下的身份特征和异质性 | 培养的原代白色和棕色脂肪前体细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 原代白色和棕色脂肪前体细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-15 |
T cell-mediated SIV dissemination into the CNS: a single-cell transcriptomic analysis
2025-May-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6537361/v1
PMID:40386405
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示CD4+细胞毒性样T细胞在SIV病毒进入中枢神经系统的关键作用 | 首次在急性SIV感染期发现同时表达髓系和淋巴系基因的独特脑细胞簇，并鉴定CD4+细胞毒性样T细胞是病毒进入中枢神经系统的主要媒介 | 研究仅基于三只急性感染猕猴，样本量较小，且为动物模型研究 | 表征急性感染期间脑淋巴细胞的作用及CD4+T细胞表型在SIV传播至中枢神经系统中的功能 | 急性SIV感染的恒河猴脑部和血液细胞 | 单细胞转录组学 | HIV/SIV感染 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 三只急性SIV感染恒河猴的脑部和血液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-15 |
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568150
PMID:38045252
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研究论文 | 开发了一种基于深度神经网络的衰老细胞检测方法DeepScence，用于单细胞和空间转录组数据 | 提出了CoreScence衰老相关基因集，并开发了能够同时在单细胞和空间转录组数据中准确识别衰老细胞的深度学习方法 | NA | 开发准确识别衰老细胞的计算方法 | 衰老细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组测序，空间转录组测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-15 |
Single-cell multi-omics analysis reveals the mechanism of action of a novel antioxidant polyphenol nanoparticle loaded with STAT3 agonist in mediating cardiomyocyte ferroptosis to ameliorate age-related heart failure
2025-Mar-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03317-x
PMID:40158134
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析探究了负载STAT3激动剂的抗氧化多酚纳米颗粒通过介导心肌细胞铁死亡改善年龄相关性心力衰竭的作用机制 | 开发了新型抗氧化多酚纳米颗粒PN@Col，首次结合单细胞RNA测序和AUCell分析揭示STAT3在心力衰竭中的关键作用，并验证其通过减轻氧化应激和铁死亡改善心脏功能 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化仍需进一步验证；样本规模有限 | 探究新型纳米颗粒治疗剂对年龄相关性心力衰竭的治疗效果及作用机制 | 心肌细胞、老年心力衰竭小鼠模型 | 单细胞多组学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、AUCell分析、细胞实验、动物实验 | NA | 基因表达数据、实验数据 | 老年心力衰竭小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-15 |
LSD1 inhibition corrects dysregulated MHC-I and dendritic cells activation through IFNγ-CXCL9-CXCR3 axis to promote antitumor immunity in HNSCC
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643710
PMID:40166238
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研究论文 | 本研究探讨LSD1抑制通过IFNγ-CXCL9-CXCR3轴调节MHC-I和树突状细胞激活以增强头颈鳞癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次发现LSD1抑制通过激活H3K4me2与MHC-I直接相互作用的新机制，并阐明其在CXCL9-CXCR3轴介导的抗肿瘤免疫中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化价值需进一步验证 | 阐明LSD1在头颈鳞癌抗肿瘤免疫中的作用机制 | 头颈鳞癌小鼠模型、人源化小鼠模型、人类头颈鳞癌细胞系、外周血单核细胞 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型、细胞共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | 小鼠模型、人类细胞系和TCGA数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-10-15 |
Data-driven fine-grained region discovery in the mouse brain with transformers
2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.05.592608
PMID:38766132
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研究论文 | 提出一种基于Transformer的自监督空间域检测工作流程CellTransformer，用于小鼠大脑精细区域发现 | 开发了新颖的编码器-解码器架构CellTransformer，能够分层学习组织特征，并实现多百万细胞数据集的扩展分析 | NA | 解决器官尺度空间转录组数据分析中的关键瓶颈，实现精细组织空间域的检测 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，自监督学习 | Transformer，编码器-解码器架构 | 空间转录组数据 | 900万细胞，200多个组织切片，4只小鼠 | NA | 空间转录组学，MERFISH，Slide-seqV2 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-15 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术鉴定滑液中的常驻滑膜巨噬细胞，探讨其在滑膜屏障完整性评估和炎症性关节炎中的作用 | 首次在人类滑液中鉴定常驻滑膜巨噬细胞，并建立新型体外组织块模型验证发现 | 研究未明确这些细胞在滑膜屏障破坏后是否持续或引发慢性炎症 | 研究常驻滑膜巨噬细胞在滑液中的存在及其与滑膜屏障完整性的关联 | 人类滑液样本和滑膜组织 | 免疫学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | 体外组织块模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-15 |
Bypassing cisplatin resistance in Nrf2 hyperactivated head and neck cancer through effective PI3Kinase targeting
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.10.632413
PMID:39868226
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研究论文 | 本研究评估PI3K抑制剂在绕过Nrf2介导的顺铂耐药头颈癌中的疗效 | 发现PI3K抑制剂gedatolisib可通过激活自噬、衰老和破坏脂肪酸代谢来抑制顺铂耐药头颈癌增殖并增强顺铂效果 | 研究主要使用临床前模型，尚未进行人体临床试验 | 评估PI3K抑制剂在克服头颈鳞状细胞癌顺铂耐药中的治疗效果 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)细胞系和多种小鼠模型 | 癌症治疗研究 | 头颈癌 | 转录组学、代谢组学、信号通路分析、空间转录组学 | 皮下、原位和转移性异种移植模型，免疫缺陷和人源化小鼠模型 | 基因表达数据、代谢数据、信号通路数据 | 多种头颈癌细胞系和多个小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-15 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Adventitial Fibroblast Alterations during Mouse Atherosclerosis
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.05.616802
PMID:39868275
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠动脉粥样硬化过程中外膜成纤维细胞的动态变化 | 首次在动脉粥样硬化发生过程中对外膜细胞进行单细胞RNA测序分析，并发现SERPINH1基因在成纤维细胞中的差异表达及其功能影响 | 研究仅使用雄性Ldlr -/-小鼠模型，样本量较小（每组两个样本，每个样本来自三只小鼠混合） | 探究外膜细胞在动脉粥样硬化中的作用机制 | 小鼠主动脉外膜细胞和人类外膜成纤维细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性Ldlr -/-小鼠，每组两个样本（每个样本由三只小鼠混合） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-15 |
Unsupervised multi-scale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2024-Dec-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5671748/v1
PMID:39764102
|
研究论文 | 开发了一种无监督多尺度聚类方法，用于识别单细胞转录组数据中的细胞类型和亚型层次结构 | 构建稀疏细胞-细胞相关性网络，以无监督方式在多尺度分辨率下识别细胞类型和亚型 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中的细胞聚类方法，以揭示更精细的细胞景观结构 | 单细胞转录组数据中的细胞类型和亚型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多尺度聚类 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-15 |
Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
2024-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.12.612751
PMID:39314376
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术验证了骨髓微环境中不同空间区室对炎症的反应差异 | 首次结合scRNA-seq和流式细胞术系统验证了骨髓中央区和骨内膜区7个关键基质细胞群体，并揭示了I型干扰素反应特异性影响中央区基质细胞的炎症表型 | 研究主要基于小鼠模型，人类骨髓微环境的可比性仍需验证 | 探究炎症对造血干细胞和骨髓微空间区室的调控机制 | 小鼠骨髓中的造血干细胞/祖细胞（HSPC）和基质细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性疾病 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 多个小鼠品系的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-15 |
FlyBase: updates to the Drosophila genes and genomes database
2024-05-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyad211
PMID:38301657
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研究论文 | 介绍果蝇数据库FlyBase的最新开发进展和功能更新 | 新增单细胞RNA测序数据、改进功能信息展示、更新直系同源分析流程、新增化学报告功能以及加强科普资源 | NA | 维护和更新果蝇基因组数据库资源 | 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)基因和基因组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、功能注释数据、化学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |