单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-05-29	Understanding psoriatic disease at single-cell resolution: an update 2025-Jul-01, Current opinion in rheumatology IF:5.2Q1 DOI:10.1097/BOR.0000000000001085 PMID:40160177	综述	本文回顾了单细胞技术在银屑病研究中的最新进展，包括单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学	揭示了银屑病中免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞亚型的多样性及其在疾病进展中的关键作用，特别是通过空间转录组学发现了角质形成细胞中的代谢失调	NA	探讨单细胞技术在银屑病研究中的应用及其对靶向治疗的潜在影响	银屑病中的免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学	NA	转录组数据	NA
2	2025-05-29	Immune checkpoint inhibitor-associated pneumonitis: focus on diagnosis and underlying mechanisms 2025-Jul-01, Current opinion in pulmonary medicine IF:2.8Q2 DOI:10.1097/MCP.0000000000001175 PMID:40265506	review	本文综述了免疫检查点抑制剂（ICI）相关肺炎的诊断、风险因素及治疗策略，并重点探讨其潜在的病理生理机制	强调了单细胞RNA测序技术和生物标志物（如自身抗体）在理解ICI相关肺炎中的作用，揭示了细胞介导和体液机制共同参与的病理生理过程	尽管皮质类固醇是一线治疗，但类固醇难治性肺炎仍常见且死亡率高，现有治疗策略存在局限性	更新ICI相关肺炎的诊断与治疗知识，并探索其病理生理机制以指导靶向治疗开发	免疫检查点抑制剂（ICI）引发的肺炎	NA	lung cancer	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	NA	NA
3	2025-05-29	Impact of HLA alloimmunization on clinical outcomes of severe aplastic anemia treated with immunosuppressive therapy 2025-Jun-10, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024015301 PMID:40085951	research paper	该研究探讨了HLA同种免疫对接受免疫抑制治疗的严重再生障碍性贫血患者临床结果的影响	首次在大型iAA患者队列中研究了HLA同种免疫的临床相关性，并发现其与疾病预后相关	研究样本量有限，且来自特定临床试验队列	评估HLA同种免疫对iAA患者临床结局的影响	444名接受免疫抑制治疗的严重再生障碍性贫血患者	血液病学	再生障碍性贫血	单细胞RNA测序	NA	临床数据和RNA测序数据	444名患者（其中99名存在HLA同种免疫）
4	2025-05-29	Elevated Fcy receptor expression augments pro-inflammatory macrophage phagocytosis in systemic sclerosis and associated rheumatic diseases 2025-Jun-01, Rheumatology (Oxford, England) DOI:10.1093/rheumatology/keae688 PMID:39672802	research paper	本研究探讨了系统性硬化症（SSc）和其他风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型，揭示了FcγR表达巨噬细胞在吞噬作用和炎症反应中的驱动作用	通过单细胞RNA测序和体外实验，首次揭示了SSc和相关风湿性疾病中FcγR高表达巨噬细胞的促吞噬表型及其在炎症反应中的作用	研究主要基于体外实验和已有数据集分析，需要更多体内实验验证	探究SSc和其他风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型及其驱动机制	SSc、RA、PsA和axSpA患者的巨噬细胞	免疫学	风湿性疾病	scRNA-seq, 流式细胞术, Western blot, RT-qPCR	NA	基因表达数据, 蛋白质数据	来自健康对照和SSc患者的皮肤和肺巨噬细胞单细胞RNA测序数据集（GSE138669/GSE212109），以及来自HC、SSc、RA、PsA和axSpA患者的CD14+单核细胞分化的人单核细胞衍生巨噬细胞（hMDMs）
5	2025-05-29	Construction and validation of a regulatory T cells-based classification of renal cell carcinoma: an integrated bioinformatic analysis and clinical cohort study 2025-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-01030-9 PMID:39714755	研究论文	通过整合生物信息学分析和临床队列研究，构建并验证了基于调节性T细胞的肾细胞癌分类系统	首次定义了44个与Treg状态相关的预后基因，并构建了RCC-TSC分类系统，揭示了高免疫浸润RCC亚型的预后和治疗意义	研究主要依赖于回顾性数据，前瞻性验证仍需进一步研究	探索Treg与肾细胞癌异质性之间的关系，并建立预后分类系统	肾细胞癌患者	数字病理学	肾细胞癌	单细胞RNA测序、免疫组化染色	monocle2伪时间分析、多变量Cox比例风险回归分析	RNA-seq数据、临床数据	TCGA-KIRC队列的537个RNA-seq样本和新华队列的370名肾肿瘤患者
6	2025-05-29	Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease 2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology DOI:10.1152/ajplung.00296.2024 PMID:39772753	mini-review	本文探讨了肺内皮细胞在健康和肺血管疾病中的异质性，特别关注单细胞RNA测序技术的应用	利用scRNA-seq技术揭示了肺内皮细胞的异质性及其在肺动脉高压发病机制中的作用，发现了新的细胞类型如aerocytes和general capillary ECs	NA	研究肺内皮细胞异质性在肺血管疾病中的作用	肺内皮细胞	生物医学	肺动脉高压	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单核RNA测序, 空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
7	2025-05-29	Decellularised Amniotic Membrane for the Neurogenic Expression of Human Mesenchymal Stem Cells 2025-Jun, Journal of biomedical materials research. Part B, Applied biomaterials DOI:10.1002/jbm.b.35588 PMID:40424302	研究论文	研究脱细胞羊膜（DAM）对人间充质干细胞（hMSCs）神经分化的诱导作用，以促进周围神经病变的神经再生	使用DAM诱导hMSCs神经分化，并通过空间转录组测序和网络药理学分析揭示其促进神经修复的机制	未提及具体样本量及实验设计的详细局限性	探究DAM在神经再生中的作用及其潜在治疗应用	人间充质干细胞（hMSCs）和脱细胞羊膜（DAM）	再生医学	周围神经病变	空间转录组测序、免疫荧光染色、网络药理学分析	NA	基因表达数据、细胞图像数据	NA
8	2025-05-29	Elevating single-particle encapsulation in droplet microfluidics by utilizing surface acoustic wave and flow control 2025-May-28, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/d4lc00787e PMID:40302630	研究论文	本文提出了一种结合表面声波(SAW)和鞘流控制的微滴微流控系统，以提高单颗粒封装效率	通过SAW和鞘流控制实现颗粒的线性排列和顺序封装，显著提高了单颗粒封装效率，突破了传统方法的理论上限	NA	提高微滴微流控系统中的单颗粒封装效率	聚苯乙烯微球、磁珠和H22细胞	微流控技术	NA	表面声波(SAW)和鞘流控制	NA	NA	多种浓度的聚苯乙烯微球、磁珠和H22细胞溶液
9	2025-05-29	Targeting Ferroptosis Alleviates Pulmonary Arterial Hypertension, Insights from Transcriptomic and Experimental Analyses 2025-May-28, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202500001 PMID:40432432	研究论文	本研究探讨了铁死亡在肺动脉高压（PAH）发展中的作用及其分子机制，并通过转录组和实验分析验证了靶向铁死亡对PAH的治疗潜力	首次揭示了铁死亡在PAH内皮细胞损伤和血管重塑中的关键作用，并发现HIF1α信号在铁死亡诱导中的重要性	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证有限	探究铁死亡在PAH发病机制中的作用并开发潜在治疗策略	肺动脉高压（PAH）患者和小鼠模型	分子病理学	肺动脉高压	转录组测序、单细胞RNA测序	PAH小鼠模型（缺氧+SU5416诱导）	基因表达数据、组织学数据	未明确说明患者样本量，使用小鼠模型进行实验
10	2025-05-29	Immunotyping the Tumor Microenvironment Reveals Molecular Heterogeneity for Personalized Immunotherapy in Cancer 2025-May-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202417593 PMID:40433880	research paper	开发了一种名为TMEclassifier的机器学习工具，用于将肿瘤微环境（TME）分类为三种亚型，以指导个性化免疫治疗	首次提出了一种高度可访问、高通量的方法来定义肿瘤微环境的异质性，并通过机器学习工具TMEclassifier对癌症进行分类	虽然在小鼠模型和前瞻性胃癌队列中验证了TMEclassifier的预测能力，但还需要在更广泛的癌症类型和更大样本中进行验证	研究肿瘤微环境的异质性，以指导个性化免疫治疗策略	肿瘤微环境（TME）及其在癌症免疫治疗中的作用	machine learning	cancer	bulk RNA sequencing, single-cell RNA sequencing	machine-learning tool (TMEclassifier)	RNA sequencing data	前瞻性胃癌队列（TIMES-001）及其他多样本队列
11	2025-05-29	Blood Biomarker-Based Predictive Indicator for Liver Metastasis in Alpha-Fetoprotein-Producing Gastric Cancer and Multi-Omics Tumor Microenvironment Insights 2025-May-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202503499 PMID:40433893	研究论文	本研究开发了一种基于血液生物标志物的预测指标（ANLiM评分），用于预测甲胎蛋白产生性胃癌（AFPGC）患者的肝转移风险，并通过多组学分析揭示了肝转移AFPGC的免疫抑制性肿瘤微环境特征	结合AFP和中性粒细胞-淋巴细胞比率（NLR）开发了新型预测指标ANLiM评分，并通过单细胞RNA测序等技术首次揭示了AFPGC肝转移的免疫微环境特征	回顾性研究设计可能引入选择偏倚，样本量相对有限（317例）	开发AFPGC肝转移预测工具并探索其肿瘤微环境特征	甲胎蛋白产生性胃癌（AFPGC）患者	肿瘤学	胃癌	全外显子组测序、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、多重免疫荧光	多变量逻辑回归模型、列线图	临床数据、基因组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据	317例AFPGC患者
12	2025-05-29	Single-Cell Analysis Reveals that Vitamin C Inhibits Bone Metastasis of Renal Cancer via Cell Cycle Arrest and Microenvironment Remodeling 2025-May-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202501011 PMID:40433925	研究论文	本研究通过单细胞分析揭示了维生素C通过细胞周期阻滞和微环境重塑抑制肾癌骨转移的机制	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了维生素C在骨转移微环境中的抗肿瘤作用，并提出了维生素C与CXCR2拮抗剂联合治疗的新策略	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证	探索维生素C抑制肾癌骨转移的分子机制及其治疗潜力	肾癌细胞及其骨转移微环境	肿瘤学	肾癌	单细胞RNA测序	小鼠骨转移模型	基因表达数据	未明确说明样本数量，使用纤维蛋白凝胶诱导的3D肿瘤球体来源的肾癌细胞
13	2025-05-29	PROS1-MERTK Axis Drives Tumor Microenvironment Crosstalk and Progression in Papillary Thyroid Microcarcinoma 2025-May-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413474 PMID:40433916	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了PROS1-MERTK轴在甲状腺微小乳头状癌（PTMC）进展中的关键作用	首次揭示了PROS1-MERTK信号通路通过旁分泌和自分泌机制加速PTMC进展，并鉴定出NFYB和FOXP2作为PROS1转录的激活剂	样本量较小（19个手术组织标本），且仅针对PTMC进行研究	探索甲状腺微小乳头状癌（PTMC）进展的分子机制和生物标志物	15名患者的19个手术组织标本，包括癌旁组织、非进展性PTMC、进展性PTMC和进展性PTC	肿瘤生物学	甲状腺癌	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	RNA测序数据	19个手术组织标本（来自15名患者）
14	2025-05-29	Single-cell targeted transcriptomics reveals subset-specific immune signatures differentiating asymptomatic and cardiac patients with chronic Chagas disease 2025-May-28, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1 DOI:10.1093/infdis/jiaf269 PMID:40434116	研究论文	通过单细胞靶向转录组学揭示了慢性查加斯病无症状患者和心脏病患者亚群特异性免疫特征	首次应用免疫基因靶向单细胞RNA测序技术，揭示了慢性查加斯病不同临床形式患者的免疫细胞亚群特异性基因表达模式	研究仅基于外周血单个核细胞(PBMCs)，未涉及其他组织或更广泛的样本	揭示慢性查加斯病不同临床形式(无症状和心脏病)患者的免疫特征差异	慢性查加斯病患者的外周血单个核细胞(PBMCs)	单细胞转录组学	查加斯病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	来自无症状(IND)和心脏病(CCC)患者的外周血单个核细胞样本
15	2025-05-29	Circadian Gene BMAL1 Regulation of Cellular Senescence in Thyroid Aging 2025-May-28, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.70119 PMID:40434135	研究论文	研究昼夜节律基因BMAL1在甲状腺衰老过程中对细胞衰老的调控作用	揭示了BMAL1基因下调通过抑制NFKBIA表达加速甲状腺细胞衰老和损害激素合成的新机制	NA	探究甲状腺衰老的分子和功能特征及其与甲状腺激素合成的关系	人类甲状腺组织和小鼠模型	分子生物学	甲状腺疾病	scRNA-seq, 转录组测序	甲状腺特异性Bmal1敲除小鼠模型	基因表达数据	年轻、中年和老年组的人类甲状腺组织
16	2025-05-29	Potential of SPHK1 as a prognostic marker and therapeutic target in colorectal cancer: insights from bioinformatics and experimental analysis 2025-May-28, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002506 PMID:40434736	研究论文	本研究通过生物信息学和实验分析探讨了SPHK1在结直肠癌（CRC）进展中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力	首次系统评估了SPHK1在CRC中的表达模式、分子机制及其与免疫浸润和肿瘤微环境的关联	样本量相对较小（90对CRC和正常组织），且主要依赖公共数据库数据	探究SPHK1在CRC进展中的分子机制及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力	结直肠癌组织和细胞系	生物信息学与肿瘤学	结直肠癌	多组学分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化（MR）、多重荧光免疫组化	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质表达数据	90对CRC和正常组织样本
17	2025-05-29	Comparative analysis of the syncytiotrophoblast in placenta tissue and trophoblast organoids using snRNA sequencing 2025-May-27, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.101170 PMID:40424181	研究论文	通过单核和单细胞RNA测序比较分析胎盘组织和滋养层类器官中的合体滋养层	首次使用单核RNA测序揭示合体滋养层的三种核亚型，并鉴定了保守的STB标记物RYBP	未明确说明样本数量及具体实验重复次数	研究合体滋养层(STB)的分化过程及其核异质性	胎盘组织和滋养层类器官(TOs)中的合体滋养层	单细胞组学	NA	单核RNA测序(snRNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	未明确说明具体样本数量(涉及早孕期、足月胎盘及两种培养条件的类器官)
18	2025-05-29	Polyamine acetylation mediates crosstalk between cancer cells and myeloid cells to promote mesenchymal/plurimetabolic states in glioblastoma 2025-May-27, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noaf128 PMID:40424600	研究论文	本研究探讨了多胺乙酰化在胶质母细胞瘤(GBM)中介导癌细胞与髓系细胞间的代谢串扰，促进间充质/多代谢状态的作用	首次揭示了SAT1及其产物N1-乙酰精胺在连接肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞/髓系细胞(TAMs)代谢活动中的新作用	研究主要基于体外实验和动物模型，人类临床样本验证仍需进一步研究	探究多胺代谢重编程如何影响GBM亚型分类的恶性细胞内在和微环境依赖的生物学过程	人类和小鼠GBM肿瘤及细胞系	肿瘤代谢	胶质母细胞瘤	液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、单细胞RNA测序	NA	代谢组数据、转录组数据	人类和小鼠GBM肿瘤及细胞系(具体数量未明确说明)
19	2025-05-29	Longitudinal scRNA-seq of retinal organoids derived from Stargardt disease patient with ABCA4 mutation 2025-May-27, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-05079-5 PMID:40425564	research paper	利用携带ABCA4基因突变的Stargardt病患者来源的iPSCs生成视网膜类器官，并进行纵向单细胞RNA测序研究	首次使用中国STGD患者常见变异的iPSCs生成视网膜类器官，并通过纵向scRNA-seq分析揭示了ABCA4相关病理变化的发育机制	研究仅针对中国人群中常见的ABCA4变异，可能无法涵盖所有STGD病例的遗传多样性	研究Stargardt病的发病机制和视网膜发育过程	携带ABCA4突变的患者来源iPSCs生成的视网膜类器官	digital pathology	Stargardt病	scRNA-seq, iPSCs技术	视网膜类器官模型	单细胞转录组数据	多个发育阶段(40, 90, 150, 200和260天)的视网膜类器官样本
20	2025-05-29	Single cell RNA sequencing reveals the role of local renin-angiotensin system in regulating ovarian physiological cycle and promoting PCOS 2025-May-27, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-025-02531-8 PMID:40425574	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了卵巢局部肾素-血管紧张素系统（RAS）在调节卵巢生理周期及促进多囊卵巢综合征（PCOS）中的作用	首次在单细胞水平上揭示了卵巢局部RAS在发情周期中的动态变化，并提供了AngII与IRS1/PI3K/AKT通路交互作用导致胰岛素抵抗（IR）可能是PCOS潜在机制的初步证据	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究卵巢局部RAS在生理周期调节及PCOS发病机制中的作用	小鼠卵巢细胞	单细胞测序	多囊卵巢综合征	scRNA-seq	PCOS小鼠模型	单细胞RNA测序数据	未明确说明样本数量