单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-05-30	Landscape of spatial disruption of homeostasis in the middle temporal gyrus of epileptic patients 2025-Aug-01, Brain research IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.brainres.2025.149688 PMID:40350141	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）技术，探讨癫痫患者中颞回（MTG）的细胞和空间稳态破坏	结合单细胞和空间转录组数据，揭示了癫痫患者中颞回的细胞层特异性基因表达模式和空间动态变化，并识别了与空间稳态破坏相关的关键基因	NA	阐明癫痫患者中颞回的细胞和空间稳态破坏机制	癫痫患者的中颞回（MTG）组织	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST）	空间转移张量（STT）算法	基因表达数据、空间转录组数据	NA
2	2025-05-30	Immune checkpoint inhibitor-associated pneumonitis: focus on diagnosis and underlying mechanisms 2025-Jul-01, Current opinion in pulmonary medicine IF:2.8Q2 DOI:10.1097/MCP.0000000000001175 PMID:40265506	review	本文综述了免疫检查点抑制剂（ICI）相关肺炎的诊断、风险因素和治疗策略，特别关注其潜在的病理生理机制	通过单细胞RNA测序和生物标志物（如自身抗体）的鉴定，增强了对ICI相关肺炎的理解，揭示了细胞介导和体液机制在病理生理中的作用	尽管皮质类固醇是治疗的一线药物，但类固醇难治性肺炎仍然常见且死亡率高	提供ICI相关肺炎的最新研究进展，以指导靶向治疗和未来研究方向	免疫检查点抑制剂（ICI）相关肺炎	NA	lung cancer	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
3	2025-05-30	NOTCH1 Mutation and Survival Analysis of Tislelizumab in Advanced or Metastatic Esophageal Squamous Cell Carcinoma: A Biomarker Analysis From the Randomized, Phase III, RATIONALE-302 Trial 2025-Jun, Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology IF:42.1Q1 DOI:10.1200/JCO-24-01818 PMID:40179324	research paper	该研究通过分析RATIONALE-302试验的数据，探讨NOTCH1突变作为预测tislelizumab在晚期或转移性食管鳞状细胞癌中生存获益的生物标志物	首次发现NOTCH1突变可作为预测tislelizumab治疗食管鳞状细胞癌生存获益的生物标志物，并通过单细胞RNA测序揭示了潜在分子机制	研究样本量有限，需要更大规模的研究验证NOTCH1突变的预测价值	探索预测tislelizumab在食管鳞状细胞癌中疗效的生物标志物	晚期或转移性食管鳞状细胞癌患者	digital pathology	esophageal squamous cell carcinoma	肿瘤基因组分析、转录组测序、单细胞RNA测序	NA	基因组数据、转录组数据	RATIONALE-302研究中的患者样本
4	2025-05-30	Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients 2025-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-025-03011-7 PMID:40211026	研究论文	本研究构建了一个多维策略，用于预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后	通过整合基因组特征和肿瘤免疫微环境分析，开发了一个新的预测模型（EM-CXCL10），其预测性能优于传统的肿瘤突变负荷（TMB）和突变评分	样本量较小（60例患者），且仅部分患者接受了基因测序和细胞因子测试	预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后	晚期胆道癌患者	肿瘤免疫学	胆道癌	520基因面板测序、多重循环细胞因子测试、单细胞转录组数据分析	LASSO算法、Cox回归模型	基因组数据、转录组数据、临床数据	60例晚期胆道癌患者（其中30例进行基因测序，50例进行细胞因子测试）
5	2025-05-30	Identification and regulation of EMT cells in vivo by laser stimulation 2025-Jun, APL bioengineering IF:6.6Q1 DOI:10.1063/5.0268350 PMID:40438388	研究论文	本研究通过激光刺激方法探讨PLCG2在上皮-间质转化（EMT）细胞中的作用及其调控机制	首次使用飞秒激光扫描光刺激方法激活细胞内钙信号并诱导PLCG2上调，以研究其在EMT和肿瘤发展中的直接作用	PLCG2抑制剂对转移性细胞无明显影响，其具体机制尚不明确	探究PLCG2是否作为EMT的直接驱动因子及其在肿瘤发展中的作用	前列腺癌PC3细胞及EMT细胞	肿瘤生物学	前列腺癌	飞秒激光扫描光刺激、单细胞RNA测序	皮下肿瘤模型	RNA测序数据	NA
6	2025-05-30	BCLAF1 restrains stress responses in hematopoietic stem cells to support expansion and repopulation 2025-May-29, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024014916 PMID:40435510	研究论文	本文发现BCLAF1在造血干细胞（HSC）的扩增和移植后重建中起关键调节作用	首次揭示了转录调节因子BCLAF1在限制HSC应激反应中的新功能，以维持胚胎发生期间的HSC发育和移植后的重建功能	研究主要基于小鼠模型，人类HSC中的具体机制尚需进一步验证	探究BCLAF1在造血干细胞发育和功能维持中的作用	小鼠胎儿和成年造血干细胞	造血干细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	小鼠基因敲除模型	基因表达数据	NA
7	2025-05-30	Improving predictive accuracy in multiple myeloma using a plasma cell profile derived from single-cell RNA sequencing 2025-May-29, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2025.287586 PMID:40438979	研究论文	通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞异质性，发现一种特别具有侵袭性的细胞亚群，并基于此开发了一个7基因标志物的风险分层模型	首次在单细胞分辨率下识别出与多发性骨髓瘤患者不良预后相关的侵袭性细胞亚群，并开发了一个新的7基因标志物风险分层模型	研究样本量较小（12名新诊断患者），需要在更大样本中验证	提高多发性骨髓瘤的风险分层准确性	多发性骨髓瘤患者（特别是超高危患者）的肿瘤细胞	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq），数字PCR	Cox风险比例模型	RNA测序数据	12名新诊断多发性骨髓瘤患者，并在5个独立数据集中验证
8	2025-05-30	Lichenoid graft-versus-host disease shows a high interferon score, with IFNAR1 inhibition preventing skin inflammation 2025-May-29, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1 DOI:10.1111/jdv.20760 PMID:40439472	研究论文	本研究旨在解析苔藓样移植物抗宿主病(lGVHD)的免疫学机制，并评估在小鼠模型中阻断I型干扰素(IFN-I)通路对局部炎症的影响	揭示了lGVHD皮肤中强烈的I型和II型干扰素特征，以及T细胞和巨噬细胞中Th2/Th17和激活标志物的增加表达，提出IFNAR1可能是治疗苔藓样慢性GVHD的有希望的治疗靶点	样本量较小，人类lGVHD皮肤样本仅3例，健康对照4例，且小鼠模型的结果需要在更大规模的临床研究中验证	解析苔藓样GVHD的免疫学机制并探索其治疗靶点	人类lGVHD皮肤样本和小鼠ccGVHD模型	免疫学	移植物抗宿主病	单细胞基因表达分析(scRNA-Seq)、批量RNA-Seq、定量PCR、生物信息学分析	小鼠ccGVHD模型	基因表达数据	人类lGVHD皮肤样本3例，健康对照4例；另一队列lGVHD样本8例；lGVHD病变13例，健康对照10例
9	2025-05-30	Comprehensive Characterization of Bihormonal Cells and Endocrine Cell Lineages in Mammalian Pancreatic Islets 2025-May-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202416326 PMID:40439685	研究论文	该研究全面表征了哺乳动物胰腺胰岛中的双激素细胞和内分泌细胞谱系，并探讨了它们在β细胞恢复中的潜在作用	使用基因工程小鼠模型和先进的成像流式细胞术，发现双激素细胞极其罕见，并通过单细胞RNA测序和双重组酶谱系追踪技术揭示了这些细胞的特性	研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类胰岛生物学的复杂性	阐明双激素细胞在胰腺胰岛中的作用及其在β细胞恢复中的潜力	哺乳动物胰腺胰岛中的双激素细胞和内分泌细胞谱系	细胞生物学	糖尿病	基因工程、成像流式细胞术、单细胞RNA测序、双重组酶谱系追踪	NA	基因表达数据、细胞图像数据	基因工程小鼠模型和人类胰岛样本
10	2025-05-30	Mendelian randomization reveals limited causal effects of genetic variants on cervical cancer risk: insights from immune cell populations 2025-May-29, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02819-2 PMID:40439950	research paper	该研究利用孟德尔随机化方法探讨免疫细胞相关遗传变异与宫颈癌风险之间的潜在因果关系	首次系统评估多种免疫细胞亚群遗传变异对宫颈癌风险的因果效应	仅发现弱关联性，无法确定免疫细胞遗传因素在宫颈癌发病中的主要作用	探究免疫细胞相关遗传变异与宫颈癌风险的因果关系	宫颈癌风险与免疫细胞亚群遗传变异	genetic epidemiology	cervical cancer	Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing	inverse-variance weighted, MR-Egger, simple median, weighted median	genetic data, single-cell RNA-seq data	NA
11	2025-05-30	Pan-Cancer Spatial Profiling Reveals Conserved Subtypes and Niches of Cancer-Associated Fibroblasts 2025-May-29, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2181 PMID:40440095	research paper	该研究通过泛癌空间分析揭示了癌症相关成纤维细胞（CAF）的保守亚型和微环境	利用空间多组学数据首次定义了四种基于空间组织和细胞邻域的CAF亚型，为CAF分类提供了新框架	研究主要基于空间多组学数据，可能受限于样本数量和癌症类型的覆盖范围	解析肿瘤微环境中基质细胞的异质性及其对治疗反应的影响	多种癌症类型中的癌症相关成纤维细胞（CAF）	digital pathology	cancer	single-cell spatial multi-omics, scRNA-Seq	NA	spatial multi-omics data	多种癌症类型的广泛单细胞空间多组学数据集
12	2025-05-30	Elevating single-particle encapsulation in droplet microfluidics by utilizing surface acoustic wave and flow control 2025-May-28, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/d4lc00787e PMID:40302630	研究论文	提出了一种结合表面声波(SAW)和鞘流控制的微滴微流控系统，以提高单颗粒封装效率	通过整合SAW和鞘流控制，实现了颗粒的线性排列和顺序封装，显著提高了封装效率	未提及系统在更复杂生物样本或实际临床环境中的表现	提高微滴微流控系统中的单颗粒封装效率	聚苯乙烯微球、磁珠和H22细胞	微流控技术	NA	表面声波(SAW)和鞘流控制	NA	NA	使用了不同浓度的聚苯乙烯微球、磁珠和H22细胞溶液
13	2025-05-30	Exploring the Epidemiology and Molecular Mechanisms of Riboflavin Against Chronic Kidney Disease Based on Data Mining, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking 2025-May-28, Journal of the American Nutrition Association IF:6.8Q1 DOI:10.1080/27697061.2025.2509900 PMID:40435123	研究论文	本研究通过数据挖掘、单细胞RNA测序和分子对接技术，探讨了核黄素与慢性肾脏病（CKD）的流行病学关联及其分子机制	首次结合流行病学分析和分子机制研究，揭示了核黄素通过调节炎症因子和信号通路（如MAPK信号通路）降低CKD风险的潜在机制	研究主要基于公开数据库和计算分析，缺乏实验验证	探索核黄素在预防慢性肾脏病中的临床潜力及其作用机制	核黄素与慢性肾脏病的关联及分子机制	生物信息学	慢性肾脏病	数据挖掘、单细胞RNA测序、分子对接	Logistic回归模型、限制性立方样条	流行病学数据、基因表达数据	基于美国国家健康与营养调查（NHANES）数据，CKD加权患病率为14.8%
14	2025-05-30	Unraveling the mechanisms of irAEs in endometrial cancer immunotherapy: insights from FAERS and scRNA-seq data 2025-May-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-02723-3 PMID:40436981	研究论文	该研究整合FAERS数据库和单细胞转录组数据，探讨子宫内膜癌免疫治疗中PD-1抑制剂相关不良反应的潜在机制	首次整合FAERS数据库和单细胞转录组数据，发现PD-1抑制剂可能通过补偿性激活CXCR4和CXCR6通路导致不良反应	需要进一步的临床研究和机制研究来验证这些发现	探讨子宫内膜癌免疫治疗中PD-1抑制剂相关不良反应的潜在机制	子宫内膜癌患者和免疫检查点抑制剂相关不良反应	数字病理学	子宫内膜癌	FAERS数据库分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	Weibull建模	药物不良反应报告数据、单细胞转录组数据	FAERS数据库中2,202例免疫检查点抑制剂相关报告，以及子宫内膜癌的单细胞转录组数据
15	2025-05-30	Deciphering the cellular and molecular landscape of cervical cancer progression through single-cell and spatial transcriptomics 2025-May-28, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-00948-z PMID:40437003	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，全面解析了宫颈癌发展过程中肿瘤微环境的细胞和分子特征	首次整合scRNA-seq和stRNA-seq技术揭示宫颈癌进展中的细胞异质性和SPP1+巨噬细胞的关键作用	样本量有限，未包含所有宫颈癌亚型	解析宫颈癌发展过程中的肿瘤微环境动态变化	正常宫颈组织、HPV感染组织、高级别鳞状上皮内病变和浸润性宫颈癌组织	数字病理学	宫颈癌	scRNA-seq, stRNA-seq	NA	转录组数据	包含正常、HPV感染、HSIL和浸润性癌多阶段样本
16	2025-05-30	Remodelling hypoxic TNBC microenvironment restores antitumor efficacy of Vγ9Vδ2 T cell therapy 2025-May-28, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-025-03045-x PMID:40437021	研究论文	研究通过重塑三阴性乳腺癌（TNBC）的缺氧微环境，恢复Vγ9Vδ2 T细胞治疗的抗肿瘤效果	揭示了γδ T细胞在TNBC微环境中的功能异质性，提出通过抑制HIF-1信号通路增强Vγ9Vδ2 T细胞治疗效果的策略	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化效果尚需进一步验证	探索增强Vγ9Vδ2 T细胞治疗TNBC效果的策略	三阴性乳腺癌（TNBC）微环境中的γδ T细胞	肿瘤免疫治疗	三阴性乳腺癌	流式细胞术、原子力显微镜、共聚焦激光扫描显微镜、小鼠模型	小鼠模型	scRNA-seq数据、流式细胞数据、显微镜图像	TCGA数据、公开scRNA-seq数据集、小鼠模型实验数据
17	2025-05-30	Natural killer cells adopt an activated and decidual-like phenotype after autologous hematopoietic stem cell transplantation in children with cancer 2025-May-28, Communications medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1038/s43856-025-00911-w PMID:40437214	研究论文	本研究探讨了儿童癌症患者自体造血干细胞移植(autoHSCT)后自然杀伤(NK)细胞的动态功能及其表型变化	首次发现儿童autoHSCT后NK细胞呈现短暂性蜕膜样表型，并阐明IL-15和TGF-β联合作用可诱导该表型	样本量较小(13例儿童患者)，且对照使用成人健康供体(8例)	探究autoHSCT后NK细胞功能重建机制以优化儿童癌症治疗效果	儿童癌症患者(autoHSCT前后)及健康成人供体的NK细胞	免疫学	儿童癌症	多参数流式细胞术、单细胞RNA测序、细胞因子检测	NA	流式细胞数据、RNA-seq数据、临床数据	13例儿童患者(3-11岁)和8例健康成人供体(25-62岁)
18	2025-05-30	ITIH4 attenuates acute lung injury by Fe-containing particulate matter in mice via Hippo pathway in type II alveolar epithelial cells 2025-May-28, Respiratory research IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s12931-025-03256-z PMID:40437524	research paper	研究ITIH4通过调节Hippo通路在II型肺泡上皮细胞中减轻含铁颗粒物引起的小鼠急性肺损伤	首次揭示ITIH4通过调节Hippo通路在II型肺泡上皮细胞中减轻含铁颗粒物引起的急性肺损伤	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探究ITIH4对含铁颗粒物引起的急性肺损伤的保护作用及其机制	C57BL/6JNarl和B6.Sftpc-CreERT2;Ai14(RCL-tdT)-D小鼠	呼吸系统疾病研究	急性肺损伤	单细胞RNA测序、电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)	小鼠急性肺损伤模型	基因表达数据、蛋白质水平数据	未明确说明具体数量的小鼠样本
19	2025-05-30	Single-cell RNAseq of Angiotensin II-induced abdominal aortic tissue identifies aneurysm-associated cell clusters in C57BL/6J mice 2025-May-28, Bioscience reports IF:3.8Q2 DOI:10.1042/BSR20241235 PMID:40440080	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究血管紧张素II诱导的小鼠腹主动脉瘤（AAA）模型中与动脉瘤相关的特定细胞群	首次识别出一种由内皮细胞转化的特殊细胞群（恶性ECs），并发现Cxcl12-Cxcr4/Ackr3轴可能在AAA形成中发挥作用	研究仅在小鼠模型中进行，未在人类样本中验证	探究腹主动脉瘤形成过程中特定细胞群的作用	C57BL/6J小鼠的腹主动脉组织	单细胞测序	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	不同年龄（14周、20周、32周）和不同血管紧张素II剂量（1.44 mg/kg/day、2.16 mg/kg/day）的C57BL/6J小鼠
20	2025-05-30	Comparative analysis of the syncytiotrophoblast in placenta tissue and trophoblast organoids using snRNA sequencing 2025-May-27, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.101170 PMID:40424181	研究论文	通过单核RNA测序比较胎盘组织和滋养层类器官中的合胞体滋养层	使用单核RNA测序技术揭示了合胞体滋养层的三种核亚型，并鉴定了类器官培养条件对核亚型比例的影响	未提及具体样本量限制，但合胞体滋养层的特殊结构可能带来技术挑战	研究合胞体滋养层的分化过程和核异质性	胎盘组织和滋养层类器官中的合胞体滋养层	单细胞组学	NA	单核RNA测序(snRNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	未明确说明具体样本量，但涉及早孕期、足月胎盘和类器官样本