单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30177 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-30 |
Characteristics and significance of γδ T cells in colorectal cancer
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2532231
PMID:40726078
|
研究论文 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌中的特征及其预后意义 | 首次在两项独立队列中通过多重免疫组化和单细胞RNA测序分析γδ T细胞在结直肠癌中的分布特征及其与患者生存期的关联 | 研究结果在第二队列中的HR置信区间较宽(0.50-1.33)，可能影响统计效力 | 阐明γδ T细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用机制 | 结直肠癌患者组织样本中的γδ T细胞和αβ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 1687例结直肠癌患者(两个队列) + 62例单细胞RNA测序样本 |
| 2 | 2025-07-30 |
Inhibition of FAK promotes pancreatic cancer immunotherapy by mediating CXCL10 secretion to enhance CD8+ T cell infiltration
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2539442
PMID:40726089
|
研究论文 | 本研究探讨了FAK在胰腺癌免疫治疗中的作用及其通过促进CXCL10分泌增强CD8+ T细胞浸润的机制 | 揭示了FAK在胰腺癌免疫抑制微环境中的具体作用及其抑制剂与免疫检查点抑制剂的协同抗肿瘤效应 | FAK在胰腺癌发展和进展中的具体作用及其对肿瘤免疫微环境的调控机制尚未完全阐明 | 探索FAK作为胰腺癌免疫治疗靶点的潜力及其调控肿瘤免疫微环境的机制 | 胰腺癌患者来源的类器官、免疫细胞、小鼠胰腺癌模型及双人源化模型 | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞测序、患者来源类器官(PDO)与免疫细胞的共培养系统 | 小鼠胰腺癌模型、双人源化模型 | 单细胞测序数据、临床标本数据 | 未明确提及具体样本数量，涉及患者来源类器官、小鼠模型及临床标本 |
| 3 | 2025-07-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals altered immune and stromal landscape in primary and liver metastasis of gastric cancer
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102163
PMID:40727437
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胃癌原发灶和肝转移灶中免疫和基质细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上比较了胃癌原发灶和肝转移灶的肿瘤微环境差异，并识别出与肝转移相关的特定细胞类型 | 样本量相对较小（7例GC，5例LM），且为回顾性研究 | 鉴定与胃癌肝转移相关的基质细胞 | 胃癌组织、邻近正常组织、肝转移灶和健康肝组织 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq, RNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 7例GC、2例NT、5例LM和3例HL组织样本，共计107,875个细胞 |
| 4 | 2025-07-30 |
B- and T cell receptor sequencing elucidates characteristics of lymphocyte depletion by ocrelizumab
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113068
PMID:40727939
|
研究论文 | 该研究通过分析B细胞和T细胞受体序列，揭示了ocrelizumab治疗对多发性硬化症患者淋巴细胞耗竭的特征 | 首次在ocrelizumab治疗背景下，对多发性硬化症患者的B细胞和T细胞受体库进行了全面分析，并发现了组织驻留记忆细胞的基因表达特征和初始治疗抵抗现象 | 样本量相对较小，未来需要更大规模的研究验证发现 | 阐明ocrelizumab治疗对多发性硬化症患者适应性免疫系统的影响 | 35名多发性硬化症患者、11名健康供体和14名接受natalizumab治疗的多发性硬化症患者 | 免疫学 | 多发性硬化症 | B细胞和T细胞受体测序、单细胞转录组学 | NA | 序列数据、转录组数据 | 35名MS患者(ocrelizumab治疗组)、11名健康供体、14名MS患者(natalizumab治疗组)、29名供体的脑脊液和血液样本 |
| 5 | 2025-07-30 |
From iPSCs to myotubes: Identifying potential biomarkers for human FSHD by single-cell transcriptomics
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70423
PMID:40726336
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-07-30 |
Unravelling the Role of PIEZO1 in Adipogenesis of Fibrogenic/Adipogenic Progenitors for Muscle Fat Infiltration After Rotator Cuff Tear
2025-Aug, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.70004
PMID:40726363
|
研究论文 | 本研究探讨了机械环境变化如何影响肩袖撕裂后的肌肉脂肪浸润，并确定了PIEZO1在纤维/脂肪祖细胞脂肪生成中的作用 | 揭示了PIEZO1通过ERK/KLF4信号通路抑制脂肪生成的机制，并发现低强度脉冲超声(LIPUS)可通过上调PIEZO1表达减轻脂肪浸润 | 研究主要基于动物模型和体外实验，临床转化效果需进一步验证 | 探索肩袖撕裂后机械环境变化对肌肉脂肪浸润的影响机制及潜在治疗方法 | 人类和小鼠的纤维/脂肪祖细胞(FAPs) | 肌肉生物学 | 肩袖撕裂 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、实时定量PCR、Western blot | PIEZO1基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人类和小鼠FAPs |
| 7 | 2025-07-30 |
Dose-escalation studies of mesenchymal stromal cell therapy for decompensated liver cirrhosis: phase Ia/Ib results and immune modulation insights
2025-Jul-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02318-4
PMID:40721581
|
研究论文 | 该研究通过Ia/Ib期临床试验评估了间充质基质细胞(MSC)治疗失代偿性肝硬化(DLC)的安全性和耐受性，并探讨了其免疫调节效应 | 首次在人体中证实MSC治疗的剂量效应关系，并鉴定MX1单核细胞作为MSC免疫调节的关键介质 | 样本量相对较小，且为单臂研究设计 | 评估MSC治疗DLC的安全性和免疫调节机制 | 失代偿性肝硬化患者 | 细胞治疗 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序、飞行时间质谱细胞术 | NA | 临床数据、多组学数据 | Ia期4个剂量组，Ib期2个剂量组 |
| 8 | 2025-07-30 |
Interplay between Matrix Viscoelasticity and Integrin Engagement Modulates Cancer-Associated Fibroblast States
2025-Jul-29, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500389
PMID:40726283
|
研究论文 | 本研究探讨了基质粘弹性和整合素结合如何调节癌症相关成纤维细胞（CAFs）的状态，首次在体外模型中展示了这种调控机制 | 首次展示了基质粘弹性和整合素结合如何共同调节CAFs的状态，并开发了可用于研究CAF功能和靶向治疗的新模型 | 研究仅在体外模型中进行，尚未在体内验证 | 理解CAFs亚群的功能并开发治疗策略 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 细胞生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学，藻酸盐水凝胶培养 | 体外CAF模型 | 转录组数据，形态学数据 | 患者来源的CAFs |
| 9 | 2025-07-30 |
Ligilactobacillus Murinus and Lactobacillus Johnsonii Suppress Macrophage Pyroptosis in Atherosclerosis through Butyrate-GPR109A-GSDMD Axis
2025-Jul-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501707
PMID:40726432
|
研究论文 | 研究发现两种肠道益生菌Ligilactobacillus murinus和Lactobacillus johnsonii通过丁酸盐-GPR109A-GSDMD轴抑制动脉粥样硬化中的巨噬细胞焦亡 | 首次揭示了阿司匹林通过调节肠道菌群及其代谢产物丁酸盐来抑制动脉粥样硬化的机制 | 研究主要基于小鼠模型和人类队列，需要进一步验证在更广泛人群中的适用性 | 探索药物-微生物群-代谢物相互作用在动脉粥样硬化中的作用 | Ligilactobacillus murinus和Lactobacillus johnsonii两种肠道益生菌 | 微生物组学 | 心血管疾病 | 宏基因组学和代谢组学分析，单细胞测序 | NA | 微生物组数据，代谢组数据，单细胞测序数据 | 小鼠模型和人类队列 |
| 10 | 2025-07-30 |
NFATC3 enhances osteosarcoma progression by increasing PD-L1 and CXCL2 levels
2025-Jul-29, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02850-x
PMID:40728758
|
研究论文 | 本研究探讨了NFATC3基因在骨肉瘤(OS)中的表达及其功能，揭示了NFATC3通过促进肿瘤细胞增殖和重塑免疫微环境来驱动OS的发展 | 首次发现NFATC3通过增加PD-L1和CXCL2的表达促进骨肉瘤进展，并揭示了其在肿瘤微环境中的作用机制 | 研究主要基于细胞系和体外实验，缺乏体内动物模型的验证 | 探究NFATC3在骨肉瘤进展中的作用及其分子机制 | 骨肉瘤细胞系(143B、SJSA、HOS、MG63、MNNG)和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | qRT-PCR、单细胞测序分析、肿瘤细胞与巨噬细胞共培养系统 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 多个骨肉瘤细胞系和测序数据集 |
| 11 | 2025-07-30 |
Refining the resolution of the yeast genotype-phenotype map using single-cell RNA-sequencing
2025-Jul-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.93906
PMID:40720279
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术提高酵母基因型-表型图谱的分辨率 | 通过大规模单细胞RNA测序数据整合到基因型-表型图谱中，揭示了表型变异与转录组变异之间的新关联 | 研究仅针对酵母细胞，可能不适用于其他生物系统 | 提高基因型-表型图谱的分辨率，理解转录组调控在性状变异中的作用 | 4489个F2分离株的18,233个酵母细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 表达数量性状位点(eQTL)定位 | NA | RNA测序数据 | 18,233个酵母细胞来自4,489个F2分离株 |
| 12 | 2025-07-30 |
Enhanced Media Optimize Bovine Myogenesis in 2D and 3D Models for Cultivated Meat Applications
2025-Jul-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413998
PMID:40720723
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研究论文 | 本研究通过多组学方法表征了牛肌肉祖细胞（MPCs）体外分化的分子景观，并探索了小分子对其的增强作用，从而在2D和3D培养模型中鉴定出优于传统方法的增强培养基 | 利用多组学技术和小分子调控，开发出能增强牛肌肉祖细胞分化的新型培养基，并在2D和3D培养模型中验证其效果 | 研究仅针对牛肌肉祖细胞，未涉及其他物种或细胞类型 | 开发可持续的体外肉类生产技术 | 牛肌肉祖细胞（MPCs） | 细胞培养与组织工程 | NA | 多组学分析（转录组学和蛋白质组学），单细胞转录组学 | 2D培养和3D骨骼肌构建体 | 分子数据（转录组和蛋白质组数据） | 未明确说明具体样本数量 |
| 13 | 2025-07-30 |
N-Oxide-Driven Heme-Activatable Biomolecule Labeling for Visualization of Labile Heme in Living Cells and Mouse Brain
2025-Jul-28, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04990
PMID:40720736
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research paper | 开发新型化学探针，用于活细胞、固定样本和体内模型中不稳定血红素的检测 | 提出了一种基于N-氧化物驱动的不稳定血红素可激活生物分子标记策略，首次实现了在活细胞和活体小鼠大脑中对不稳定血红素的荧光成像和3D组织可视化 | 未明确说明探针在复杂生物环境中的长期稳定性和潜在毒性 | 研究不稳定血红素在生理和病理过程中的作用 | 不稳定血红素（原卟啉IX与铁离子形成的复合物） | 化学生物学 | NA | 荧光成像、3D组织可视化、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、组学数据 | 活细胞和活体小鼠大脑 |
| 14 | 2025-07-30 |
Impact of ATP Synthase Subunit β on TLR Signaling Pathway in Promoting Airway Remodeling and Heterogeneity of Small Airway Epithelial Cells in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jul-28, Journal of innate immunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1159/000547329
PMID:40720940
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研究论文 | 本研究探讨了ATP合成酶亚基β（ATP5B）在慢性阻塞性肺疾病（COPD）发病机制中的作用，重点关注上皮细胞异质性和气道重塑 | 首次发现ATP5B通过激活TLR信号通路促进COPD气道重塑，并揭示其作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 阐明COPD中气道重塑和上皮细胞功能障碍的调控机制 | 小气道上皮细胞和BEAS-2B细胞系 | 呼吸系统疾病研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CS/LPS诱导的COPD小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，使用BEAS-2B细胞系和小鼠模型 |
| 15 | 2025-07-30 |
Comprehensive single-cell transcriptomic analysis reveals fibroblast subpopulations and the prognostic association of COMT in prostate cancer progression， COMT ， COMT
2025-Jul-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10624-8
PMID:40721434
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示前列腺癌中成纤维细胞亚群及COMT在癌症进展中的预后关联 | 首次在前列腺癌中通过单细胞RNA测序鉴定出三种具有独特基因表达谱的成纤维细胞亚群，并发现COMT作为肿瘤微环境的关键调节因子和预后标志物 | 需要进一步研究验证这些发现并探索COMT在前列腺癌进展和治疗抵抗中的机制作用 | 探索前列腺癌中成纤维细胞的分子特征及COMT表达的预后意义 | 前列腺癌样本中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫荧光检测 | Cox回归风险评分模型 | RNA测序数据, 临床数据 | 来自GEO数据库和TCGA数据库的前列腺癌样本 |
| 16 | 2025-07-30 |
Integrated in vivo combinatorial functional genomics and spatial transcriptomics of tumours to decode genotype-to-phenotype relationships
2025-Jul-28, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01437-1
PMID:40721510
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研究论文 | 开发了一种名为PERTURB-CAST的方法，用于在组织层面识别扰动，并结合空间转录组学技术研究肿瘤的基因型与表型关系 | 提出了PERTURB-CAST方法和CHOCOLAT-G2P框架，整合了空间转录组学和功能基因组学，用于研究肿瘤异质性 | 未提及具体样本量或实验验证的广泛性 | 解码肿瘤的基因型与表型关系 | 肿瘤组织 | 功能基因组学 | 肝癌 | 空间转录组学（10X Visium） | NA | 转录组数据 | NA |
| 17 | 2025-07-30 |
Leveraging single-cell spatial transcriptomics and connectomics to resolve brain circuit function in psychiatry
2025-Jul-28, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02178-0
PMID:40721521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2025-07-30 |
Deciphering state-dependent immune features from multi-layer omics data at single-cell resolution
2025-Jul-28, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02266-3
PMID:40721531
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学、宿主遗传学、血浆蛋白质组学和肠道宏基因组学等多层组学数据，构建了一个免疫细胞图谱，揭示了免疫细胞状态依赖的动态调控特征 | 首次在单细胞分辨率下构建了包含日本人群的多层组学免疫细胞图谱，并揭示了细胞状态依赖的免疫特征 | 研究主要基于日本人群，可能不适用于其他种族群体 | 解析免疫细胞状态依赖的特征及其与遗传变异的关系 | 235名日本人的外周血单个核细胞，包括COVID-19患者和健康个体 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞转录组学、血浆蛋白质组学、肠道宏基因组学 | NA | 单细胞转录组数据、遗传数据、蛋白质组数据、宏基因组数据 | 235名日本人（包括COVID-19患者和健康个体）的超过150万个外周血单个核细胞 |
| 19 | 2025-07-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals a B cell-related immunosuppressive landscape and a potential suppressor in hepatocellular carcinoma
2025-Jul-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06869-6
PMID:40721811
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肝细胞癌中与B细胞相关的免疫抑制景观及潜在抑制因子 | 首次在单细胞水平上揭示了肝细胞癌中B细胞相关的免疫抑制景观，并发现血清淀粉样蛋白A2（SAA2）作为新的肿瘤抑制因子 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步的实验验证B细胞和SAA2在肝细胞癌中的具体作用机制 | 探索肝细胞癌微环境中的免疫抑制机制并寻找新的治疗靶点 | 肝细胞癌组织和对应非癌组织中的B细胞和肝细胞 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 蛋白质印迹分析 | NA | 单细胞转录组数据, 临床样本数据 | 肝细胞癌组织和对应非癌组织的单细胞转录组数据, TCGA和GTEx数据库数据集, 临床HCC样本 |
| 20 | 2025-07-30 |
Identification of CD4_Naive cells related gene FMO4 as a positive regulator of the poor prognosis of septic CRC patients
2025-Jul-28, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03917-5
PMID:40722152
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分析，探讨了CD4_Naive细胞相关基因FMO4在结直肠癌（CRC）相关脓毒症预后中的作用 | 首次发现FMO4基因与CD4_Naive细胞浸润减少及CRC脓毒症患者不良预后相关，并揭示了其在异生物质分解代谢和牛磺酸代谢中的作用 | 样本量较小（仅32例血液样本），需要更大规模的研究验证 | 探究T细胞及相关基因在CRC相关脓毒症预后中的作用 | CRC合并脓毒症患者 | 生物医学 | 结直肠癌, 脓毒症 | 单细胞测序, 孟德尔随机化(MR)分析, 功能富集分析 | NA | 单细胞测序数据, 临床样本数据 | 32例CRC合并脓毒症患者的血液样本 |