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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1 | 2025-10-06 |
Cell-type-directed network-correcting combination therapy for Alzheimer's disease
2025-Oct-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.06.035
PMID:40695276
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研究论文 | 提出一种基于细胞类型特异性网络校正的阿尔茨海默病联合疗法 | 首次将单细胞转录组学、药物扰动数据库和临床记录整合,开发细胞类型特异性多靶点药物发现策略 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 开发针对阿尔茨海默病多因素特征的精准联合疗法 | 阿尔茨海默病小鼠模型(同时具有Aβ和tau沉积) | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、临床记录 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2 | 2025-10-06 |
An inducible model of human post-implantation development derived from primed and naive stem cells
2025-Oct-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.08.005
PMID:40885193
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研究论文 | 本研究通过结合启动态和初始态人多能干细胞开发了可诱导干细胞胚胎模型,模拟人类植入后早期发育过程 | 首次通过结合启动态hPSC和初始态hPSC来源的转基因诱导胚外细胞,建立了可诱导的干细胞胚胎模型 | 模型尚不完美,存在一定局限性 | 研究人类植入后早期发育过程 | 人类干细胞胚胎模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 可诱导干细胞胚胎模型(iSCBEMs) | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3 | 2025-10-06 |
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09313-3
PMID:40702188
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研究论文 | 开发了一种多组学单细胞测序方法,用于精确识别CRISPR编辑的疾病等位基因功能效应 | 结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模式单细胞功能基因组学方法 | 未明确说明样本规模和技术重复次数 | 识别疾病相关非编码等位基因的因果变异及其功能效应 | 人类原代T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因 | 功能基因组学 | 自身免疫疾病 | CRISPR-Cas编辑, 多组学单细胞测序 | NA | 基因组DNA, 转录组, 蛋白质表达 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
4 | 2025-10-06 |
Protocol for single-cell spatial transcriptomic profiling of cultured cells and engineered tissues without embedding or sectioning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104074
PMID:40938748
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研究论文 | 本文提出了一种无需包埋或切片即可对培养细胞和工程组织进行单细胞空间转录组分析的新方案 | 开发了适用于标准包埋切片不兼容的2D工程组织和细胞培养物的空间转录组分析新方法 | NA | 建立适用于特殊样本类型的空间转录组分析技术方案 | 2D工程组织和细胞培养物 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间技术 |
5 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis reveals the attenuation of the interferon pathway as a driver of chemo-refractory ovarian cancer
2025-Sep-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102316
PMID:40885189
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研究论文 | 通过多组学分析揭示干扰素通路减弱是卵巢癌化疗耐药的关键驱动因素 | 首次发现化疗耐药卵巢癌中I型干扰素通路活性降低与缺氧通路增强的分子特征,并证实干扰素活性可独立预测化疗反应 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探索卵巢高级别浆液性癌化疗耐药的分子机制 | DECIDER观察性试验中化疗耐药卵巢癌患者的治疗前活检样本 | 多组学分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,空间蛋白质分析,体外实验 | NA | 基因组学数据,转录组学数据,蛋白质组学数据 | DECIDER临床试验注册患者(NCT04846933) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | NA |
6 | 2025-10-06 |
Appendiceal B lymphocytes contribute to the pathogenesis of experimental colitis through fueling colonic CD4+ T polarization
2025-Sep-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2025.09.001
PMID:40945653
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研究论文 | 本研究揭示阑尾B淋巴细胞通过CCL20-CCR6轴迁移至结肠并促进CD4+ T细胞介导的Th1/Th17免疫反应,从而加剧实验性结肠炎 | 首次阐明阑尾B淋巴细胞通过特定迁移机制加剧结肠炎的具体病理机制,并提出阑尾口炎症可能代表溃疡性结肠炎的特殊亚型 | 研究主要基于动物模型,人类数据验证仍需进一步扩展 | 探究阑尾B淋巴细胞在实验性结肠炎发病机制中的作用 | 小鼠模型和溃疡性结肠炎患者的结肠组织 | 免疫学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序,免疫荧光共染色 | NA | 基因表达数据,组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing: enhancing the predictive accuracy of tumor immunotherapy efficacy
2025-Sep-08, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20253017
PMID:40857744
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫治疗疗效预测中的应用现状与前景 | 系统阐述scRNA-seq技术如何提升免疫治疗疗效预测准确性,并探讨生物材料整合带来的新研究方向 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究进行理论分析 | 探讨单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫治疗领域的应用价值与发展方向 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8 | 2025-10-06 |
Folliculin Deletion in the Mouse Kidney Results in Cystogenesis of the Loops of Henle via Aberrant TFEB Activation
2025-Sep, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.05.010
PMID:40499782
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研究论文 | 本研究通过构建肾单位特异性Folliculin基因敲除小鼠模型,揭示了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的关键作用 | 首次证明Folliculin基因缺失通过异常激活TFEB导致亨利氏袢囊肿形成,并阐明了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的特异性作用 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究Folliculin基因在整个肾单位中的具体功能及其在囊肿形成中的作用机制 | 肾单位特异性Folliculin基因敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除技术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织形态学数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9 | 2025-10-06 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组技术解码HepaRG细胞在化学物质暴露下的应激状态 | 首次使用TempO-LINC平台系统分析多种化学物质诱导的细胞应激反应,并基于文献来源的基因特征对单个细胞进行应激表型评分 | 仅使用HepaRG细胞系,未验证其他细胞类型;仅观察24小时暴露效应,缺乏更长时程的动态变化数据 | 解码细胞应激状态以应用于毒理学研究 | HepaRG肝细胞系 | 单细胞组学 | 毒理学 | 单细胞转录组测序 | 基于广义Jaccard度量的聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 约40,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC单细胞转录组平台 |
10 | 2025-10-06 |
Cellular communication network factor 2 regulates smooth muscle cell transdifferentiation and lipid accumulation in atherosclerosis
2024-12-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae215
PMID:39365752
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研究论文 | 本研究揭示了细胞通讯网络因子2在调控平滑肌细胞转分化和动脉粥样硬化脂质积累中的保护作用 | 首次发现SMC特异性CCN2缺失通过调控内质网应激、内吞作用和脂质积累机制促进动脉粥样硬化发展 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明CCN2在动脉粥样硬化中调控平滑肌细胞可塑性的功能和机制 | 人类和小鼠的血管平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | 可诱导小鼠SMC CCN2缺失模型 | 基因表达数据 | 人类和小鼠动脉粥样硬化样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11 | 2025-10-06 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,发现白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病进展中的关键驱动作用 | 首次在ACM中鉴定出炎症-纤维化空间生态位,并证明抗IL-1β治疗可改善疾病表型 | 研究样本量有限,动物模型结果需在人类中进一步验证 | 探索致心律失常性心肌病的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | ACM患者心肌样本和Desmoglein-2突变小鼠模型 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | ACM患者和对照供者心肌样本 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
12 | 2025-10-06 |
Physical modeling of embryonic transcriptomes identifies collective modes of gene expression
2024-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.26.605398
PMID:39131269
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研究论文 | 本研究通过统计物理学方法分析海鞘胚胎单细胞测序数据,识别基因表达的集体模式 | 利用自然变异和统计物理建模技术,首次在完整互连胚胎水平研究发育过程,推断细胞间相互作用网络 | 研究基于海鞘胚胎数据,结果在其他生物系统中的普适性需要进一步验证 | 研究胚胎发育过程中基因表达的集体协调机制 | 早期海鞘胚胎细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞测序 | 统计物理模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
13 | 2025-10-05 |
Remodeling of senescent macrophages in synovium alleviates trauma- and aging-induced osteoarthritis
2026-Jan, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.09.016
PMID:41035432
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研究论文 | 本研究开发了一种新型senotherapeutic纳米颗粒pCQ/SOD,通过重塑滑膜衰老巨噬细胞缓解创伤性和衰老性骨关节炎 | 首次发现滑膜衰老巨噬细胞在骨关节炎中的关键作用,并开发了靶向递送SOD的纳米颗粒治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索骨关节炎中免疫衰老机制并开发相应治疗策略 | 骨关节炎滑膜组织中的衰老巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 骨关节炎 | 单细胞测序, RNA-seq, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠骨关节炎模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
14 | 2025-10-05 |
Short-chain fatty acids from gut microbiota restore Th17/Treg balance in rheumatoid arthritis: Mechanisms and therapeutic potential
2025-Dec, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2025.100316
PMID:41036443
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综述 | 系统阐述肠道微生物来源的短链脂肪酸通过多重机制恢复类风湿关节炎中Th17/Treg平衡的作用及治疗潜力 | 首次系统整合多组学方法揭示肠道-关节轴机制,提出微生物组指导的个性化医疗新范式 | NA | 探讨短链脂肪酸调节Th17/Treg平衡的机制及其在类风湿关节炎治疗中的应用潜力 | 类风湿关节炎患者及临床前模型 | NA | 类风湿关节炎 | 代谢组学、单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学、代谢组学 | NA | NA |
15 | 2025-10-05 |
Loss of Prominin 2 expression inhibits AKT/mTOR signaling to limit glycolysis and drive ferroptosis in breast cancer cells
2025-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120047
PMID:40818819
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研究论文 | 本研究揭示了Prominin 2通过AKT/mTOR信号通路促进乳腺癌糖酵解和抑制铁死亡的致癌机制 | 首次发现PROM2通过与AKT相互作用激活mTOR信号通路,同时调控糖酵解和铁死亡两个关键生物学过程 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化价值需要进一步验证 | 阐明Prominin 2在乳腺癌中的致癌功能及分子机制 | 乳腺癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化,Western blot,RNA测序,GSEA,免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,代谢指标数据 | 临床样本和细胞系(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
16 | 2025-10-05 |
KANSL3 directs transcriptional programs essential for hepatic metabolism and differentiation
2025-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503238
PMID:41044006
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子KANSL3在肝细胞分化和代谢中的关键作用 | 首次发现KANSL3通过组蛋白乙酰化调控肝细胞转录网络,对肝脏发育和疾病具有重要影响 | NA | 探究KANSL3在肝脏代谢和分化中的功能机制 | 肝细胞、胆管和胎儿肝脏类器官 | 表观遗传学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
17 | 2025-10-05 |
Meiotic cohesin RAD21L shapes 3D genome structure and transcription in the male germline
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv2283
PMID:41032613
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研究论文 | 本研究探讨减数分裂特异性黏连蛋白亚基RAD21L缺失对雄性生殖细胞3D基因组结构和基因表达的影响 | 首次揭示RAD21L在调控减数分裂染色质空间组织和异源染色体端粒相互作用中的关键作用 | 研究主要关注雄性生殖细胞,未涉及雌性生殖系统的相关机制 | 阐明RAD21L在精子发生过程中对3D基因组结构和转录调控的功能 | 雄性生殖细胞(精原细胞和初级精母细胞) | 基因组学 | 生殖系统疾病 | 荧光激活细胞分选, 高通量染色体构象捕获, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组三维结构数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 染色体构象捕获 | NA | NA |
18 | 2025-10-05 |
COL8A1 Regulates Endothelial Phenotype in Inflammatory Endothelial-to-Mesenchymal Transition
2025-Oct-03, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00339.2025
PMID:41042748
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研究论文 | 本研究探讨胶原蛋白VIIIα1链在炎症性内皮-间质转化过程中的调控作用 | 首次揭示COL8A1在内皮-间质转化过程中具有双相调控作用,早期抑制促进转化而晚期表达反映血管重塑 | 研究主要基于体外细胞实验,需要更多体内实验验证 | 阐明COL8A1在炎症性内皮-间质转化中的分子机制 | 小鼠和人类内皮细胞,人主动脉内皮细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光分析,慢病毒过表达,siRNA干扰 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
19 | 2025-10-05 |
Single-cell atlas of cervical organoids uncovers epithelial immune heterogeneity and intercellular cross-talk during Chlamydia infection
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady1640
PMID:41042872
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示宫颈类器官在衣原体感染期间的免疫异性和细胞间通讯 | 首次整合患者来源宫颈类器官与单细胞转录组技术构建感染期间上皮细胞图谱,发现未感染旁观者细胞在免疫应答中的关键作用 | 研究主要聚焦上皮细胞,其他免疫细胞类型参与程度需进一步验证 | 解析宫颈上皮细胞在病原体感染过程中的免疫协调机制 | 患者来源宫颈类器官和天然宫颈组织 | 单细胞生物学 | 生殖道感染 | 单细胞RNA测序,三维类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
20 | 2025-10-05 |
Padlock-designed MOFs triggers an "avalanche effect" to enhance apoptosis and suppress metastasis in central nervous system lymphoma
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv2647
PMID:41042871
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研究论文 | 开发了一种靶向肠道巨噬细胞的卡铂锁设计MOF系统,通过肠脑轴实现中枢神经系统淋巴瘤的精准治疗 | 首次利用锁设计MOF触发“雪崩效应”,通过肠道巨噬细胞迁移实现脑靶向给药,重新定义了中枢神经系统淋巴瘤的治疗策略 | NA | 克服血脑屏障障碍,开发中枢神经系统淋巴瘤的新型治疗方法 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 生物医学工程 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |