单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28846 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-06-18 |
Roles of central nervous system resident and recruited macrophages in the brain barrier system
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00986
PMID:39885670
|
综述 | 本文综述了脑屏障系统中巨噬细胞的起源、发育、重要分子及功能，重点关注小胶质细胞和边界相关巨噬细胞 | 强调了单细胞测序技术和重要细胞标志物的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于现有文献进行综述 | 探讨脑屏障系统中驻留和招募巨噬细胞的作用 | 脑屏障系统中的巨噬细胞（包括小胶质细胞、边界相关巨噬细胞和招募的巨噬细胞） | 神经免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-06-18 |
Molecular mechanisms after optic nerve injury: Neurorepair strategies from a transcriptomic perspective
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00794
PMID:40313107
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综述 | 本文综述了视神经损伤后的分子机制，以及通过转录组学视角探讨神经修复策略 | 利用单细胞转录组学技术揭示了视神经损伤和青光眼模型中视网膜神经节细胞损伤的分子机制，并鉴定了与神经保护和轴突再生相关的关键基因和转录因子 | 未来研究需要整合先进的单细胞测序与多组学方法，以更全面地研究视网膜神经节细胞损伤和再生的细胞特异性反应 | 探讨视神经损伤后的分子机制，并寻找神经修复的新策略 | 视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 微阵列分析、RNA测序、单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9筛选、ATAC-seq分析 | 视神经挤压模型和青光眼模型 | 转录组数据 | NA |
| 3 | 2025-06-18 |
Single-cell transcriptomic profiling of the whole colony of Botrylloides diegensis: insights into tissue specialization and blastogenesis
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204265
PMID:40406997
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术对Botrylloides diegensis整个群体进行了转录组分析，揭示了细胞异质性并鉴定了细胞和组织标记物 | 首次对整个B diegensis群体进行单细胞转录组测序，鉴定了29个主要细胞簇，并揭示了组织特化和发育路径 | NA | 理解B diegensis的发育、组织功能和再生机制 | Botrylloides diegensis群体(包括个体、芽体和血管被膜) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 整个B diegensis群体(具体数量未明确说明) |
| 4 | 2025-06-17 |
Data-informed insights into sex differences in peripheral blood mononuclear cells from single-cell transcriptomics
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101525
PMID:40520998
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-06-17 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals epithelial cell alterations in benign prostatic hyperplasia following finasteride treatment
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101526
PMID:40520997
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-06-18 |
Analysis of Hyperexpanded T Cell Clones in SARS-CoV-2 Vaccine-Associated Liver Injury by Spatial Proteomics and Transcriptomics
2025-Jul, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70172
PMID:40522253
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研究论文 | 通过空间蛋白质组学和转录组学分析SARS-CoV-2疫苗相关肝损伤中的超扩增T细胞克隆 | 使用新型组合多重免疫荧光（mIF）-RNA原位杂交（RISH）方法和单细胞空间转录组学技术，在单细胞水平上定位和表征超扩增CD8+ T细胞克隆 | 研究样本仅来自一名严重SVALI患者的肝脏移植样本，样本量有限 | 表征SARS-CoV-2疫苗相关肝损伤（SVALI）中的免疫浸润特征 | 一名严重SVALI患者的肝脏移植样本中的T细胞克隆 | 空间组学 | 肝损伤 | T细胞受体测序、多重免疫荧光（mIF）-RNA原位杂交（RISH）、单细胞空间转录组学（Xenium原位平台） | NA | 空间蛋白质组学和转录组学数据 | 1例肝脏移植样本 |
| 7 | 2025-06-18 |
Suppression of the Prostaglandin I2-Type 1 Interferon Axis Induces Extramedullary Hematopoiesis to Promote Cardiac Repair After Myocardial Infarction
2025-Jun-17, Circulation
IF:35.5Q1
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research paper | 本研究探讨了脾脏髓外造血（EMH）在心肌梗死（MI）后心脏修复中的作用及其机制 | 揭示了PGI2-IFN轴在MI后脾脏EMH中的作用，为缺血性心脏损伤提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究脾脏EMH在MI后心脏修复中的作用及其调控机制 | 小鼠模型中的脾脏造血干细胞/祖细胞（HSPCs） | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 流式细胞术、液相色谱-串联质谱、单细胞RNA测序 | Tcf21CreER Scfflox/flox MI小鼠模型 | 转录组数据、脂质组数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了GFP+造血干细胞和Tcf21CreER Scfflox/flox小鼠 |
| 8 | 2025-06-18 |
Splenic CD169+Tim4+ Marginal Metallophilic Macrophages Are Essential for Wound Healing After Myocardial Infarction
2025-Jun-17, Circulation
IF:35.5Q1
|
research paper | 该研究揭示了脾脏CD169+Tim4+边缘金属性巨噬细胞在心肌梗死后伤口愈合中的关键作用 | 首次发现脾脏CD169+Tim4+巨噬细胞通过循环进入心脏并促进炎症消退和组织修复 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅涉及循环细胞观察 | 探究心肌梗死后伤口愈合的细胞机制 | 脾脏CD169+Tim4+边缘金属性巨噬细胞(MMMs) | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、谱系追踪、细胞追踪、脾切除术、联体共生、细胞过继转移 | 小鼠心肌梗死模型 | 流式细胞数据、单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型和人类ST段抬高型心肌梗死患者 |
| 9 | 2025-06-18 |
Rescue of naïve porcine circovirus type 3 and its pathogenesis in CD pigs
2025-Jun-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00341-25
PMID:40353661
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研究论文 | 本研究成功拯救了原始猪圆环病毒3型（PCV3）并研究了其在剖腹产猪（CD猪）中的致病机制 | 首次通过TEM观察PCV3病毒颗粒，并阐明了其在CD猪中的免疫抑制机制 | 由于病毒分离失败，PCV3在猪中的致病机制尚未准确阐明 | 研究PCV3病毒的致病机制及其对免疫系统的影响 | 原始猪圆环病毒3型（PCV3）及剖腹产猪（CD猪） | 病毒学 | 猪圆环病毒感染 | 免疫荧光检测（IFA）、Western blotting、透射电子显微镜（TEM）、scRNA-seq | NA | 分子生物学数据、细胞学数据、组织病理学数据 | PK-15细胞、CD猪 |
| 10 | 2025-06-18 |
Dissection of the global responses of mandarin fish pyloric cecum to an acute ranavirus (MRV) infection reveals the formation of serositis and then ascites
2025-Jun-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.02308-24
PMID:40366173
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research paper | 研究揭示了急性MRV感染如何首先影响鳜鱼幽门盲囊的浆膜层，进而导致纤维性浆膜炎和腹水 | 首次在单细胞水平上解析了鳜鱼幽门盲囊对MRV感染的全局反应，揭示了病毒驱动的浆膜炎是腹水形成的根本原因 | 研究仅关注了急性感染期的细胞反应，未涉及慢性感染或长期影响 | 探究MRV感染鳜鱼后导致严重腹水的病理机制 | 鳜鱼幽门盲囊组织 | 兽医学 | 鱼类病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 未明确说明样本数量，研究对象为鳜鱼个体 |
| 11 | 2025-06-18 |
Unraveling the cross-talk between a highly virulent PEDV strain and the host via single-cell transcriptomic analysis
2025-Jun-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00555-25
PMID:40396761
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示高致病性PEDV毒株与宿主之间的相互作用 | 首次利用单细胞测序技术分析了PEDV感染后宿主肠道细胞的组成、基因表达和细胞间通讯的变化，并发现PEDV可在B和T淋巴细胞中启动复制但无法产生感染性子代 | 研究仅针对一种流行的PEDV毒株，可能无法代表所有毒株的特性 | 理解PEDV与宿主的相互作用及其致病机制 | 猪流行性腹泻病毒(PEDV)及其感染的仔猪空肠细胞 | 病毒学 | 猪流行性腹泻 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 19,612个空肠细胞（来自PEDV感染和对照仔猪） |
| 12 | 2025-06-18 |
ECT2+ cell group acts as cancer stem cell in malignant pleomorphic adenoma
2025-Jun-17, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00974-x
PMID:40523903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了唾液腺多形性腺瘤癌（CXPA）的单细胞图谱，并鉴定出ECT2+细胞群作为CXPA中的癌症干细胞（CSC） | 首次在CXPA中鉴定出ECT2+细胞群作为CSC，并证实其与肿瘤侵袭性和预后的强相关性 | CXPA中CSC的研究仍处于初步阶段，需要更多样本验证 | 探究CXPA的肿瘤异质性及其癌症干细胞的特性 | 唾液腺多形性腺瘤癌（CXPA） | 肿瘤学 | 唾液腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | CXPA患者肿瘤组织 |
| 13 | 2025-06-18 |
Single-cell transcriptomics analysis of the healing process of ligament rupture
2025-Jun-17, Bone & joint research
IF:4.7Q1
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了韧带断裂愈合过程中的细胞和遗传特征 | 首次在韧带组织中明确识别出肌腱细胞和成纤维细胞，并发现人类前交叉韧带组织中存在十种不同的肌腱细胞亚型 | 样本量较小（仅6例），且仅针对前交叉韧带进行研究 | 探究韧带断裂修复和愈合过程中的细胞和遗传机制 | 健康个体和韧带断裂患者的ACL组织 | 单细胞组学 | 韧带损伤 | scRNA-seq, 免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例（3例健康对照+3例患者）共83,195个细胞 |
| 14 | 2025-06-18 |
Single-Cell RNA Sequencing Delineates Renal Anti-Fibrotic Mechanisms Mediated by TRPC6 Inhibition
2025-Jun-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501175
PMID:40525246
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了TRPC6通道抑制在慢性肾脏病中的抗纤维化机制 | 发现了一种新型内皮细胞亚群ECRIN，并揭示了TRPC6抑制通过Prnp转录因子调控网络减轻肾纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类CKD样本，临床转化需要进一步验证 | 探究TRPC6通道抑制在慢性肾脏病中的治疗潜力及其分子机制 | 小鼠UUO模型、2个月慢性缺血再灌注损伤模型及人类CKD患者的肾脏样本 | digital pathology | chronic kidney disease | scRNA-Seq, immunofluorescence, western blot | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和人类CKD患者的肾脏样本（具体数量未明确说明） |
| 15 | 2025-06-18 |
Endothelial Cell Phenotypic Plasticity in Cardiovascular Physiology and Disease: Mechanisms and Therapeutic Prospects
2025-Jun-16, American journal of hypertension
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/ajh/hpaf027
PMID:39989120
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research paper | 本文探讨了内皮细胞在心血管生理和疾病中的表型可塑性及其机制与治疗前景 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞的分子多样性和转录异质性，并探讨了内皮细胞重编程等新型治疗策略 | 未具体说明研究中使用的样本数量或实验模型的局限性 | 研究内皮细胞的表型可塑性在心血管疾病中的作用及其治疗潜力 | 内皮细胞及其在心血管疾病中的表型转变 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16 | 2025-06-18 |
Single-Cell Expression Analysis of Ductal Carcinoma In Situ Identifies Complex Genotypic-Phenotypic Relationships Altering Epithelial Composition
2025-Jun-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3023
PMID:40101158
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析导管原位癌（DCIS）的基因表达，揭示了其与浸润性乳腺癌（IBC）的关系 | 首次在单细胞水平上分析DCIS的基因表达和克隆异质性，并发现基底膜完整性失衡是浸润性转变的关键因素 | 研究样本量有限，且未涵盖所有DCIS亚型 | 探究DCIS向浸润性乳腺癌转变的分子机制 | 导管原位癌（DCIS）病变组织及匹配的正常乳腺组织 | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | RNA-seq数据 | 临床标本中的DCIS和正常导管混合样本 |
| 17 | 2025-06-18 |
Single-cell multi-omics reveals that FABP1 + renal cell carcinoma drive tumor angiogenesis through the PLG-PLAT axis under fatty acid reprogramming
2025-Jun-16, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02377-9
PMID:40518526
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research paper | 该研究通过单细胞多组学技术揭示了FABP1阳性肾细胞癌通过PLG-PLAT轴在脂肪酸重编程下驱动肿瘤血管生成的机制 | 发现了FABP1阳性肿瘤通过PLG-PLAT功能轴促进纤溶酶相关肿瘤血管生成的新机制，并提出了靶向该轴可能增强酪氨酸激酶抑制剂治疗敏感性的策略 | 研究仍缺乏对脂肪酸代谢重编程在肾细胞癌中作用的深入探索 | 探究肾细胞癌中脂肪酸代谢重编程与肿瘤血管生成的关系 | FABP1阳性肾细胞癌及其与内皮细胞的相互作用 | digital pathology | renal cell carcinoma | single-cell multi-omics, spatial transcriptomics | NA | single-cell sequencing data, spatial transcriptomics data | 未明确说明样本数量 |
| 18 | 2025-06-18 |
LARP7 Protects Vascular Smooth Muscle Cell Contractile Phenotype in CKD by Coupling with P300
2025-Jun-16, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000761
PMID:40522739
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研究论文 | 本研究探讨了LARP7在维持血管平滑肌细胞（VSMC）收缩表型及缓解慢性肾病（CKD）相关血管病变中的作用 | 发现了LARP7作为内源性正调节因子通过其与P300的相互作用维持VSMC收缩表型的新机制 | 研究主要基于体外和动物模型，临床样本验证有限 | 探究LARP7在CKD相关血管病变中的作用机制 | 血管平滑肌细胞（VSMC） | 分子生物学 | 慢性肾病（CKD） | 单细胞RNA测序、免疫染色分析 | NA | RNA测序数据、免疫染色图像 | CKD患者及小鼠模型样本 |
| 19 | 2025-06-18 |
RIDDEN: Data-driven inference of receptor activity from transcriptomic data
2025-Jun-16, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013188
PMID:40522999
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研究论文 | 开发了一种名为RIDDEN的计算工具，用于从受体调控的基因表达谱中预测受体活性，而非基于配体和受体基因的表达 | RIDDEN是首个直接关注受体活性而非配体-受体相互作用的计算方法，且不依赖配体和受体的共表达来推断活性 | NA | 开发一种能够从转录组数据中推断受体活性的计算工具，以促进细胞间通讯的研究 | 受体活性的系统水平分析 | 生物信息学 | NA | 转录组数据分析 | RIDDEN | 转录组数据 | 229种不同受体的14463个扰动基因表达谱 |
| 20 | 2025-06-18 |
Spatial Transcriptomics to Study Virus-Host Interactions
2025-Jun-16, Annual review of virology
IF:8.1Q1
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review | 本文探讨了空间转录组学在研究病毒-宿主相互作用中的潜力及其技术细节 | 强调了空间转录组学在病毒致病机制研究中的变革性潜力 | 未提及具体的技术实施难点或数据解读的限制 | 开发新的抗病毒治疗方法和诱导保护性免疫的策略 | 植物、动物和人类中的病毒疾病 | digital pathology | NA | spatial transcriptomics | NA | transcriptomic data | NA |