单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2025-12-14
Fibroblast diversity within human gut-associated lymphoid tissues
2026-Mar-02, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,绘制了人类肠道相关淋巴组织中成纤维细胞的多样性图谱 首次识别CD24作为区分GALT成纤维细胞的标记物,并揭示了不同GALT亚型中成纤维细胞的功能差异 研究主要基于观察性数据,功能验证实验相对有限 探索人类肠道相关淋巴组织中成纤维细胞的多样性和功能 人类肠道相关淋巴组织(包括Peyer斑块、黏膜孤立淋巴滤泡和黏膜下孤立淋巴滤泡)中的成纤维细胞 单细胞组学 克罗恩病 单细胞RNA测序,流式细胞术,共聚焦激光显微镜 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据,显微镜图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2 2025-12-14
Microglia and Myeloid Cell Populations of the Developing Mouse Retina
2026-Feb, Glia IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞和单核RNA测序技术,识别了小鼠视网膜发育过程中独特的髓系细胞群体,并验证了它们在神经纤维层和血管生成前沿的解剖位置 首次在视网膜中识别并验证了发育特异性髓系细胞群体,包括Spp1和Hmox1标记的两种小胶质细胞亚群,揭示了NRF2转录因子在调控这些状态转换中的作用 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他物种中的普适性尚需验证,且功能机制探究有限 探究小胶质细胞在视网膜发育过程中的具体作用和分子特征 发育中的小鼠视网膜髓系细胞群体,特别是小胶质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA RNA序列数据 多个发育时间点的小鼠视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
3 2025-12-14
Fibroblast Dysregulation in Multiple Idiopathic External Cervical Resorption: Laboratory Investigation From a Rare Case of 13 Affected Teeth
2026-Jan, International endodontic journal IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过全外显子组测序、组织病理学分析和单细胞RNA测序,探讨了多发性特发性外颈吸收(MIECR)的病理机制,重点关注成纤维细胞在疾病进展中的作用 首次在MIECR病例中结合全外显子组测序、单细胞RNA测序和体外实验,揭示了GNAS错义突变和PI3K/Akt信号通路在成纤维细胞异常活化和骨吸收中的作用 研究基于单一罕见病例,样本量有限,结果可能不具有普遍性,且病因关联(如化疗暴露)仅为观察性推测 探究多发性特发性外颈吸收(MIECR)的病因和病理机制,以开发更有效的诊断和治疗策略 一名患有MIECR影响13颗牙齿的药剂师患者的病变组织(肉芽组织和拔除牙齿)及健康牙龈组织 数字病理学 牙科疾病 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 组织病理学分析, 体外实验 NA 基因组数据, 转录组数据, 组织图像 1名患者的病变组织和健康组织 NA 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 NA NA
4 2025-12-14
PD-1+/CXCR6+CD8+T lymphocytes promote MASLD malignant progression through inflammatory and immune dysregulation
2026-Jan-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了PD-1+/CXCR6+ CD8+ T淋巴细胞通过炎症和免疫失调促进代谢功能障碍相关脂肪性肝病恶性进展的机制 揭示了在MASLD向HCC进展过程中,CD8 T细胞亚群(特别是PD-1+和CXCR6+亚群)的动态变化及其通过促进炎症和免疫失调驱动恶性转化的新机制 研究主要基于动物模型和临床样本的相关性分析,具体的分子机制和因果关系的深入验证有待进一步研究 阐明CD8 T细胞在MASLD向HCC恶性进展中的作用机制 MASLD模型小鼠、MASLD/HCC患者的临床样本 免疫学 肝细胞癌 流式细胞术、单细胞测序 NA 流式细胞数据、单细胞测序数据、临床生化数据 动物模型(HFD和HFD/HCC组小鼠)及MASLD/HCC患者临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2025-12-14
The China Brain Multi-omics Atlas Project (CBMAP)
2026-Jan, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 中国脑多组学图谱项目旨在生成涵盖中国多个地区和广泛年龄段的1000多个人脑的综合分子参考图谱,以解决东亚人群在脑研究中代表性不足的问题 整合基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组和代谢组数据,利用空间转录组学、蛋白质组学和单核3D染色质结构分析等先进技术,为脑科学社区提供关键资源 NA 研究衰老相关脑表型和神经精神疾病的分子基础,加速脑疾病的药物发现和精准医疗 1000多个人脑样本,涵盖广泛年龄范围和多个中国地区 数字病理学 神经精神疾病 空间转录组学、蛋白质组学、单核3D染色质结构分析 NA 基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 超过1000个人脑样本 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、单细胞多组学 NA NA
6 2025-12-14
Breakthroughs of ultrasound-targeted microbubble destruction in treating myocardial ischemia-reperfusion injury: from angiogenesis regulation to precise inflammation suppression
2025-Dec-31, Drug delivery IF:6.5Q1
综述 本文综述了超声靶向微泡破坏技术在治疗心肌缺血再灌注损伤中的最新进展,涵盖从血管生成调控到精准炎症抑制等多个方面 系统总结了UTMD技术通过调控HIF-1α/VEGF通路促进血管生成、抑制NLRP3炎症小体激活以减轻炎症反应的双重作用机制,并强调了结合放射组学、人工智能及多组学技术(如单细胞RNA测序)实现精准诊断与治疗的新策略 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体临床研究结果,主要基于现有文献进行总结与展望 探讨超声靶向微泡破坏技术治疗心肌缺血再灌注损伤的机制、应用及未来研究方向 心肌缺血再灌注损伤及其相关的分子通路、细胞过程与治疗策略 心血管疾病 心血管疾病 超声靶向微泡破坏、单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学、放射组学、人工智能图像分析 NA 多组学数据、医学影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
7 2025-12-14
MMP14-Dependent Activation of TGF-β Signaling Enhances Malignancies via Promoting Necroptosis in Glioblastoma
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了MMP14通过激活TGF-β信号通路促进坏死性凋亡,从而增强胶质母细胞瘤恶性行为的新机制 首次将MMP14鉴定为胶质母细胞瘤中与坏死性凋亡相关的枢纽基因,并阐明了其通过TGF-β/SMAD2/RIP1信号轴调控坏死性凋亡异质性的分子机制 研究主要基于生信分析和体外实验,缺乏体内动物模型的深入验证,临床转化潜力有待进一步评估 探究坏死性凋亡在胶质母细胞瘤恶性进展中的功能及调控机制 胶质母细胞瘤细胞及肿瘤微环境 数字病理学 胶质母细胞瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 WGCNA 转录组数据 未明确具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
8 2025-12-14
Predictive markers for the efficacy of CAR T-cell therapy: the interplay between CAR T-cell fitness and systemic immunity
2025-Dec-23, Blood advances IF:7.4Q1
综述 本文探讨了预测CAR T细胞疗法疗效的生物标志物,重点关注CAR T细胞适应性与系统性免疫的相互作用 整合了单细胞转录组学、蛋白质组学和细胞因子多功能性分析等新兴技术,结合机器学习方法,用于识别预测性生物标志物和优化治疗策略 NA 识别和验证CAR T细胞疗法的预测性生物标志物,以改善患者分层和治疗效果 CAR T细胞疗法在淋巴恶性肿瘤患者中的疗效和安全性 机器学习 淋巴恶性肿瘤 单细胞转录组学、蛋白质组学、细胞因子多功能性分析 机器学习 转录组数据、蛋白质组数据、细胞因子数据 NA NA NA NA NA
9 2025-12-14
Ovarian somatic tissue rejuvenates circulating apolipoproteins and promotes cognitive health in postreproductive female mice
2025-Dec-13, GeroScience IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过移植年轻卵巢体细胞组织或细胞,探索了其在改善老年雌性小鼠认知功能和脂质信号方面的作用 首次利用单细胞转录组学和拉曼光谱技术,识别出两种卵巢体细胞类型,这些细胞通过脂质信号通路恢复老年雌性小鼠的健康状态 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证,且具体分子机制需进一步阐明 探究年轻卵巢体细胞组织或细胞移植对老年雌性小鼠健康,特别是认知功能和脂质信号的影响 老年、生殖后雌性小鼠及其血清、组织样本 生物医学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学,拉曼光谱 NA 转录组数据,光谱数据,生理数据 老年雌性小鼠样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2025-12-14
Integrative bulk and single-cell transcriptomic profiling identifies core gene networks and potential therapeutic targets in glioma
2025-Dec-13, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合多队列批量转录组数据和单细胞RNA测序数据,系统识别了胶质瘤的核心基因网络和潜在治疗靶点 采用多算法整合策略(包括CytoHubba、LASSO、SVM-RFE和随机森林)筛选特征基因,并结合单细胞转录组数据验证了核心基因在肿瘤细胞亚群中的特异性表达模式 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,临床样本验证规模有限(69例),且功能机制尚未通过实验完全验证 识别胶质瘤的新型诊断生物标志物和潜在治疗靶点 胶质瘤组织样本及相关转录组数据 生物信息学 胶质瘤 批量RNA测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR WGCNA,LASSO回归,SVM-RFE,随机森林 基因表达数据,单细胞转录组数据 504个批量转录组样本(来自5个GEO数据集)和69个临床验证样本 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
11 2025-12-14
Spatial transcriptomics reveals expression gradients in developing wheat inflorescences at cellular resolution
2025-Dec-13, The Plant cell
研究论文 本研究利用MERFISH空间转录组技术,在细胞分辨率下揭示了小麦花序发育过程中沿顶端-基部轴的基因表达梯度 首次在小麦花序组织中优化并应用MERFISH技术,实现了200个基因在细胞水平的空间定位,揭示了花序发育的时空组织模式 仅分析了200个基因的表达模式,可能未覆盖所有相关基因;研究聚焦于小麦特定发育阶段,其他物种或阶段需进一步验证 解析小麦花序发育过程中基因表达的空间模式,以理解花序架构多样性的分子基础 小麦(Triticum aestivum)花序组织,包括四个发育阶段 空间转录组学 NA MERFISH(多重错误鲁棒荧光原位杂交) NA 空间转录组数据 约50,000个细胞,覆盖四个发育阶段 NA 空间转录组学 NA NA
12 2025-12-14
Atherosclerosis licenses for an exceeding immune response in COVID-19 disease by interferon priming in circulating myeloid cells
2025-Dec-13, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)患者感染COVID-19后,其循环髓系细胞因表观遗传印记而表现出过度炎症反应的分子机制 首次在单细胞水平揭示了ASCVD患者感染SARS-CoV-2后髓系免疫反应的失调特征,并证实了表观遗传印记通过I型干扰素信号通路导致过度炎症反应的机制 研究主要基于中度COVID-19患者,未涵盖重症病例;体外感染实验可能无法完全模拟体内复杂环境 阐明心血管疾病患者感染COVID-19后出现更严重炎症反应的分子机制 动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)患者与COVID-19患者的免疫细胞 单细胞组学与免疫学 心血管疾病与COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)、多重细胞因子检测、酶联免疫吸附试验(ELISA)、批量RNA测序 NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据、细胞因子数据、临床数据 德国全国性队列(NAPKON)中的ASCVD合并COVID-19患者 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA测序 NA NA
13 2025-12-14
Spatially defined multicellular functional units in colorectal cancer revealed from single cell and spatial transcriptomics
2025-Dec-12, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序、Slide-seq空间转录组学和原位多重RNA分析,绘制了健康和发育不良结肠细胞生态系统的详细空间图谱,并揭示了结直肠癌中空间定义的细胞功能单元 通过整合单细胞和空间转录组学技术,首次在结直肠癌中识别出具有特定细胞组成、表达程序和局部相互作用的细胞邻域,并验证了这些特征在小鼠模型和人类患者中的保守性 研究主要基于小鼠模型,虽然与人类数据进行了比较,但直接应用于临床仍需进一步验证;技术整合可能受限于空间分辨率和样本数量 旨在表征结直肠癌肿瘤生态系统的空间组织和功能相互作用,以理解疾病进展机制 可诱导遗传性结直肠癌小鼠模型以及人类结直肠癌患者样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 原位多重RNA分析 NA RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Slide-seq Slide-seq空间转录组技术
14 2025-12-14
Tissue signatures of human macrophages during homeostasis and activation
2025-Dec-12, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究通过多模态单细胞测序和体外刺激实验,定义了来自器官捐赠者的肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结的人类巨噬细胞的组织特异性特征 首次系统性地揭示了人类巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性基因和蛋白表达谱,并展示了这些特征在极化刺激下的稳定性 研究基于器官捐赠者的样本,可能无法完全反映疾病状态或个体差异的影响 探究人类巨噬细胞在不同组织中的身份特征及其在稳态和激活状态下的变化 从肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结分离的人类巨噬细胞和单核细胞 单细胞组学 NA 多模态单细胞测序, 单核转座酶可及染色质测序, 体外刺激实验 NA 单细胞RNA-seq数据, 单细胞ATAC-seq数据, 蛋白质表达数据 来自个体器官捐赠者的多个组织样本(肺、小肠、脾脏、骨髓、淋巴结) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
15 2025-12-14
Uncovering the toxicological impact of benzo[a]pyrene on Alzheimer's disease via network toxicology, machine learning, and single-cell transcriptomics
2025-Dec-12, Journal of Alzheimer's disease : JAD
研究论文 本研究整合网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学和文献计量学,探索苯并[a]芘在阿尔茨海默病中的分子机制 首次整合网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学和文献计量学,系统揭示环境神经毒物苯并[a]芘通过靶向EGFR和HSP90AB1促进阿尔茨海默病发展的分子机制,并发现EGFR作为潜在生物标志物的诊断价值 研究主要基于生物信息学分析和公开数据集,缺乏体内或体外实验验证;单细胞数据仅来源于一个数据集(GSE157827),样本代表性可能有限 探索环境神经毒物苯并[a]芘在阿尔茨海默病发病机制中的作用 苯并[a]芘与阿尔茨海默病的共同靶点基因及其分子机制 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA-seq,分子对接 LASSO,SVM 基因表达数据,单细胞转录组数据 使用了GEO数据库的AD差异表达数据和单细胞RNA-seq数据集(GSE157827),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
16 2025-12-14
MOH: a novel multilayer multi-omics heterogeneous graph for single-cell clustering
2025-Dec-12, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为MOH的新型多层多组学异构图算法,用于单细胞聚类分析 MOH通过构建多层异构图整合三种单细胞组学数据(scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学),并引入层内和层间边来捕捉关联和相似性关系,克服了传统方法仅整合两种组学数据且忽视细胞间相互作用的局限 未明确提及具体局限性,但暗示了模型在引入新组学数据时可能需要调整图结构,这可能影响其可扩展性 开发一种能够整合多种单细胞组学数据的聚类算法,以更准确地识别细胞群体 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学 机器学习 癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、空间转录组学 多层异构图算法 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
17 2025-12-14
Heterogeneity of the intestinal mononuclear phagocyte compartment in health and inflammatory bowel disease
2025-Dec-12, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,探索了人类肠道单核吞噬细胞在健康和克罗恩病中的异质性 发现了具有DC3转录特征的CD1c cDC亚群,并揭示了肠道cDC2s/DC3s在克罗恩病中增加且来源于特定前体细胞 研究主要关注回肠和结肠,未全面覆盖其他肠道区域或更广泛的炎症性肠病类型 探究人类肠道单核吞噬细胞多样性及其在炎症状态下的变化 人类回肠和结肠固有层中的单核吞噬细胞 单细胞组学 克罗恩病 单细胞RNA测序, 细胞转录组和表位索引测序, 流式细胞术, 成像技术 NA 单细胞转录组数据, 表位数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
18 2025-12-14
Integrated single-cell atlases unveil the operation principles of whole-brain 5-HT neuronal subsystems
2025-Dec-12, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文通过整合单细胞图谱揭示了全脑5-HT神经元子系统的运作原则 开发了包括单细胞投射组学数据集、两个独立的scRNA-seq数据集和全脑5-HT神经元功能成像数据库在内的资源数据集,并首次在斑马鱼中整合分析了5-HT神经元的七个亚群及其功能模块化运作 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的直接应用可能有限,且数据集整合可能受技术差异影响 阐明5-HT神经元子系统在全脑中的运作原则及其在生理和行为调控中的复杂角色 斑马鱼全脑的5-HT神经元 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、功能成像 NA 单细胞投射组学数据、scRNA-seq数据、功能成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
19 2025-12-14
Hepatic CD4 T Cells Predict Hepatocellular Carcinoma Risk on Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis Patients
2025-Dec-12, United European gastroenterology journal IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过分析MASH患者的肝活检样本,发现肝内CD4+ T细胞浸润增加与HCC风险相关,并结合临床参数构建了预测模型 首次在MASH患者中系统性地结合组织病理学、多重免疫组化和单细胞RNA-seq数据,识别出CD4+ T细胞密度作为HCC风险的预测标志物,并开发出高精度的预测模型 样本量较小(预HCC组10例,对照组13例),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 识别MASH患者发展为HCC的预测性免疫特征 MASH患者的肝活检样本(FFPE组织) 数字病理学 肝细胞癌 多重免疫组化,单细胞RNA-seq 预测模型(基于逻辑回归或类似方法) 图像,基因表达数据 23例MASH患者肝活检样本(预HCC组10例,对照组13例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2025-12-14
In situ DC-primed vaccine combined with CD137 agonist elicits long-lasting antitumor immunity through cDC1-mediated tumor antigen-specific CD8+ T cell responses
2025-Dec-12, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了原位DC疫苗联合CD137激动剂在肺癌和结肠癌小鼠模型中通过cDC1介导的肿瘤抗原特异性CD8+ T细胞反应诱导持久抗肿瘤免疫的机制 结合原位疫苗与CD137激动剂,揭示了cDC1依赖的CD8+ T细胞激活机制,并通过单细胞RNA测序发现Treg功能重塑及CD40L-CD40通路介导的细胞间互作 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证;单细胞测序分析可能受样本量和技术限制 评估原位DC疫苗联合CD137激动剂在癌症免疫治疗中的疗效与机制 肺癌和结肠癌小鼠模型中的免疫细胞(CD8+ T细胞、cDC1、Tregs等) 癌症免疫学 肺癌, 结肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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