单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-05-23	A multimorphic variant in ThPOK causes an inborn error of immunity with T cell defects and fibrosis 2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20241174 PMID:40392549	研究论文	本文报道了由ThPOK基因变异引起的首例人类疾病，该变异导致CD4+ T细胞缺陷和纤维化等多种症状	首次发现ThPOK基因变异导致的人类疾病，揭示了ThPOK在CD4+ T细胞发育、TCR激活和纤维化调控中的新作用	研究仅基于一个患者案例，样本量较小	探究ThPOK基因变异对人类免疫系统和纤维化途径的影响	一名携带ThPOKK360N变异的患者及其细胞模型	免疫学	免疫缺陷病	单细胞RNA测序	NA	基因测序数据	1名患者
2	2025-05-23	Mendelian randomization combined with single-cell sequencing data analysis of chemokines and chemokine receptors and key genes and molecular mechanisms associated with epilepsy 2025-Jun-04, Neuroreport IF:1.6Q4 DOI:10.1097/WNR.0000000000002168 PMID:40298633	研究论文	结合孟德尔随机化和单细胞测序数据分析趋化因子及其受体在癫痫中的作用及分子机制	首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，识别出与癫痫相关的关键基因和免疫细胞	研究结果需要进一步的实验验证，样本来源和数量未明确说明	探索趋化因子及其受体相关基因在癫痫中的功能和潜在调控机制	趋化因子及其受体相关基因、癫痫	生物信息学	癫痫	孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	NA
3	2025-05-23	Insights of immune cell heterogeneity, tumor-initiated subtype transformation, drug resistance, treatment and detecting technologies in glioma microenvironment 2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.07.033 PMID:39097088	review	本文全面综述了胶质瘤微环境中四种主要免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞、髓源性抑制细胞）的异质性、亚型转化机制及其对化疗耐药和治疗策略的影响	系统总结了胶质瘤诱导免疫细胞亚型转化的确切机制，并探讨了单细胞测序技术在探索免疫细胞亚型中的应用	NA	深入理解胶质瘤微环境中免疫细胞的异质性及其在肿瘤进展和治疗中的作用	胶质瘤微环境中的免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞、髓源性抑制细胞等）	digital pathology	glioma	单细胞测序	NA	NA	NA
4	2025-05-23	Single-cell atlas of human gingiva unveils a NETs-related neutrophil subpopulation regulating periodontal immunity 2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.07.028 PMID:39084404	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示牙龈组织中与NETs相关的中性粒细胞亚群及其在牙周免疫中的作用	首次构建了牙周微环境的单细胞图谱，并发现了与NETs相关的中性粒细胞亚群(NrNeu)，揭示了牙龈成纤维细胞通过MIF-CD74/CXCR4轴激活NETs的具体调控关系	动物模型的结果可能无法完全反映人类牙周炎的复杂情况，NETs抑制剂的作用机制仍需进一步研究	阐明NETs在牙周免疫病理中的具体功能和机制	健康个体和牙周炎患者的牙龈组织	数字病理	牙周炎	单细胞RNA测序，高维加权基因共表达网络分析，伪时间分析	六种机器学习方法构建的预测模型	RNA测序数据	健康个体和牙周炎患者的牙龈组织样本
5	2025-05-23	RNA modification gene WDR4 facilitates tumor progression and immunotherapy resistance in breast cancer 2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.06.029 PMID:38960276	研究论文	该研究基于RNA修饰相关基因开发了一种预测乳腺癌患者治疗反应和生存结果的策略	提出了一个包含九个基因的签名RMscore，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗反应，并发现WDR4通过m7G修饰调节细胞周期和mTORC1信号通路	缺乏对乳腺癌中各种RNA修饰临床价值的全面阐述	预测乳腺癌患者的治疗反应和生存结果	乳腺癌患者	癌症研究	乳腺癌	批量转录组、单细胞转录组和基因组学分析、流式细胞术、免疫组织化学和免疫荧光染色	NA	转录组数据、基因组数据	NA
6	2025-05-23	Histone deacetylases facilitate Th17-cell differentiation and pathogenicity in autoimmune uveitis via CDK6/ID2 axis 2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.07.029 PMID:39107200	research paper	本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶（HDACs）在自身免疫性葡萄膜炎（AU）中通过CDK6/ID2轴促进Th17细胞分化和致病性的机制	揭示了HDACs通过CDK6/ID2轴调控Th17细胞分化和致病性的新机制，并提出了潜在的治疗策略	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证仍需进一步扩大	探究HDACs在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用及其潜在治疗靶点	自身免疫性葡萄膜炎患者和小鼠模型中的免疫细胞	免疫学	自身免疫性葡萄膜炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、siRNA、特异性抑制剂和过继转移实验	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠模型	基因表达数据、细胞表型数据	自身免疫性葡萄膜炎患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和EAU小鼠模型的免疫细胞
7	2025-05-23	ST6GALNAC1-mediated sialylation in uterine endometrial epithelium facilitates the epithelium-embryo attachment 2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.07.021 PMID:39111624	研究论文	研究ST6GALNAC1介导的子宫内膜上皮唾液酸化在胚胎着床中的作用	首次揭示了ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎着床中的关键作用，并鉴定了CD44作为sTn的载体	研究主要基于体外模型和小鼠实验，人类胚胎着床的复杂性可能未被完全涵盖	探讨ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎着床中的功能	人类和小鼠的子宫内膜上皮细胞及胚胎	生殖生物学	生殖系统疾病	免疫组织化学、免疫沉淀结合质谱分析、scRNA-seq、免疫荧光染色	体外植入模型和小鼠模型	蛋白质组学数据和RNA测序数据	人类子宫内膜样本和小鼠模型
8	2025-05-23	Functional diversity of cardiac macrophages in health and disease 2025-Jun, Nature reviews. Cardiology DOI:10.1038/s41569-024-01109-8 PMID:39743564	review	本文综述了心脏巨噬细胞在健康和疾病中的功能多样性，探讨了它们的发育起源、转录特征以及在心脏稳态和疾病中的不同作用	利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了心脏巨噬细胞的新细胞状态和疾病相关细胞邻域	NA	探讨心脏巨噬细胞在心脏疾病发病机制中的作用，为新的治疗靶点和诊断工具的研发提供基础	心脏巨噬细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
9	2025-05-23	The molecular mechanism by which CTSB degrades FPN to disrupt macrophage iron homeostasis and promote the progression of atherosclerosis 2025-Jun, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3 DOI:10.1007/s11010-025-05228-9 PMID:39960586	研究论文	本文研究了CTSB通过降解FPN破坏巨噬细胞铁稳态并促进动脉粥样硬化进展的分子机制	首次揭示了CTSB通过降解FPN调控巨噬细胞铁死亡进而影响动脉粥样硬化进展的分子机制	研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证相对有限	阐明CTSB在动脉粥样硬化进展中的作用机制	巨噬细胞铁稳态和动脉粥样硬化斑块	分子病理学	心血管疾病	单细胞转录组分析、基因敲除、药理学抑制	ApoE敲除小鼠和高脂饮食SD大鼠模型	基因表达数据、蛋白质水平数据	两种动物模型（数量未明确）和人类AS组织单细胞数据
10	2025-05-23	Integrated single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals that CD177+ Tregs enhance immunosuppression through apoptosis and resistance to immunotherapy in hepatocellular carcinoma 2025-Jun, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03330-2 PMID:40055567	research paper	该研究通过单细胞和空间转录组分析，发现CD177+ Tregs通过凋亡和免疫治疗抵抗增强肝细胞癌的免疫抑制	首次鉴定CD177作为肿瘤浸润Treg细胞的生物标志物，并揭示其在肝细胞癌免疫抑制中的关键作用	研究主要基于体外实验和小鼠模型，临床转化效果需进一步验证	探索肝细胞癌中Treg细胞的免疫抑制机制并寻找新的治疗靶点	CD177+ Treg细胞	癌症免疫学	肝细胞癌	单细胞转录组测序	CD177 Treg条件性敲除小鼠模型	转录组数据	NA
11	2025-05-23	Transcriptional reprogramming triggered by neonatal UV radiation or Lkb1 loss prevents BRAFV600E-induced growth arrest in melanocytes 2025-Jun, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03339-7 PMID:40057604	研究论文	研究探讨了新生儿UVB辐射或Lkb1缺失如何通过转录重编程阻止BRAFV600E诱导的生长停滞，从而促进黑色素瘤的发展	揭示了新生儿UVB辐射或Lkb1缺失通过转录重编程绕过BRAF诱导的生长停滞的新机制，并识别了与黑色素瘤发展和药物抵抗相关的基因	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类黑色素瘤的临床相关性需要进一步验证	探索BRAF突变黑色素瘤发展的机制，特别是新生儿UVB辐射或Lkb1缺失的作用	黑色素细胞和黑色素瘤	癌症生物学	黑色素瘤	单细胞转录组学、基因组分析	小鼠模型	基因组数据、转录组数据、临床数据	未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和临床数据
12	2025-05-23	Ifosfamide alleviates autoimmune toxicity and enhances antitumor efficacy in melanoma immunotherapy 2025-06, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2025.116851 PMID:40081767	研究论文	研究探讨了异环磷酰胺（IFO）在减轻自身免疫毒性及增强黑色素瘤免疫治疗效果中的作用	首次揭示了IFO在自身免疫条件下的广泛抑制作用，并展示了其增强CD8 T细胞活化的特异性免疫调节效应	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证IFO的效果	开发管理免疫相关不良事件（irAEs）的新策略，并增强免疫检查点抑制剂（ICI）的抗肿瘤效果	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠模型和荷瘤小鼠	免疫治疗	黑色素瘤	单细胞RNA测序	EAU小鼠模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
13	2025-05-23	Single-cell multiome reveals root hair-specific responses to salt stress 2025-Jun, The New phytologist DOI:10.1111/nph.70160 PMID:40269556	研究论文	利用单细胞测序技术，研究非结球白菜根尖在盐胁迫下的转录和染色质可及性变化	首次创建了非结球白菜根尖在正常和盐胁迫条件下的单细胞转录和染色质可及性图谱	研究仅针对非结球白菜，未涉及其他作物	探究植物对盐胁迫的响应机制	非结球白菜根尖	植物生物学	NA	单细胞测序	NA	单细胞转录组和染色质可及性数据	未明确说明样本数量
14	2025-05-23	Characterization of ROMK cellular heterogeneity along the mouse kidney thick ascending limb 2025-Jun, Pflugers Archiv : European journal of physiology DOI:10.1007/s00424-025-03086-4 PMID:40358700	研究论文	研究小鼠肾脏厚升支中ROMK的细胞异质性	揭示了ROMK蛋白在厚升支细胞中的异质性分布及其与分子标记物的关联	研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本	探究肾脏厚升支中ROMK的分布模式及其功能异质性	小鼠肾脏厚升支细胞	细胞生物学	NA	RNAscope原位杂交、迭代间接免疫荧光成像（4i多重染色）、机器学习	NA	图像、RNA序列数据	未明确说明样本数量，使用小鼠肾脏组织
15	2025-05-23	Swimming induces bone loss via regulating mechanical sensing pathways in bone marrow 2025-Jun, Mechanobiology in medicine DOI:10.1016/j.mbm.2025.100125 PMID:40395774	研究论文	该研究通过建立长期游泳训练模型，探讨了低负荷运动对骨稳态的影响机制	揭示了游泳通过调节骨髓中的机械感应通路（如Integrins和ERK1/2信号通路）诱导骨丢失的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究低负荷运动（如游泳）对骨稳态的影响机制	小鼠的骨组织和骨髓细胞	骨生物学	骨丢失	单细胞测序、microCT扫描、组织学染色	小鼠长期游泳训练模型	基因表达谱数据、影像数据	未明确说明小鼠数量
16	2025-05-23	Dual cytokine-engineered macrophages rejuvenate the tumor microenvironment and enhance anti-PD-1 therapy in renal cell carcinoma 2025-05-27, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114725 PMID:40294469	研究论文	研究开发了一种双细胞因子工程化的巨噬细胞，用于重编程肾细胞癌的肿瘤微环境并增强抗PD-1疗法的效果	开发了同时递送IL-12和CXCL-9的双细胞因子工程化巨噬细胞，能够重塑肿瘤微环境并显著增强抗PD-1疗法的效果	NA	克服肾细胞癌对抗PD-1疗法的耐药性	肾细胞癌的肿瘤微环境	肿瘤免疫治疗	肾细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
17	2025-05-23	ICOS+CD4+ T cells define a high susceptibility to anti-PD-1 therapy-induced lung pathogenesis 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.186483 PMID:40198121	research paper	该研究探讨了抗PD-1治疗诱导的肺毒性机制，特别是在老年小鼠模型中ICOS+CD4+ T细胞的作用	揭示了ICOS+CD4+ T细胞在抗PD-1治疗诱导的肺毒性中的关键作用，并发现ICOS-ICOSL相互作用的破坏可以减轻这种毒性	研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证有限	研究抗PD-1治疗诱导的免疫相关不良事件（irAEs）的细胞机制，特别是在老年个体中	老年小鼠模型和癌症患者的CD4+ T细胞	免疫学	癌症	单细胞转录组学，过继性T细胞转移	小鼠模型	基因表达数据，细胞表型数据	老年小鼠和年轻小鼠，部分癌症患者数据
18	2025-05-23	Shared roles of immune and stromal cells in the pathogenesis of human bronchiolitis obliterans syndrome 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.176596 PMID:40232854	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究人类闭塞性细支气管炎综合征（BOS）的发病机制，揭示免疫细胞和基质细胞在其中的共同作用	首次在CLAD-BOS和cGVHD-BOS两种形式的BOS中发现CD8+组织驻留记忆T细胞（TRM）的扩增群体，并识别出与巨噬细胞趋化和增殖相关的基因和通路	样本量较小（4例CLAD-BOS患者、3例cGVHD-BOS患者和3例对照）	理解闭塞性细支气管炎综合征（BOS）的疾病机制	人类肺移植后的慢性肺同种异体移植功能障碍BOS（CLAD-BOS）和异基因造血干细胞移植后的慢性移植物抗宿主病BOS（cGVHD-BOS）	生物医学研究	闭塞性细支气管炎综合征	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	4例CLAD-BOS患者、3例cGVHD-BOS患者和3例对照
19	2025-05-23	Characterization of a pathogenic nonmigratory fibroblast population in systemic sclerosis skin 2025-May-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.185618 PMID:40232859	research paper	本研究鉴定并比较了系统性硬化症（SSc）皮肤中迁移性和非迁移性成纤维细胞的特性及其在疾病不同阶段的作用	首次分离并描述了SSc皮肤中的非迁移性‘常驻’成纤维细胞群体，揭示了其在疾病不同阶段的独特致病特征和治疗靶点潜力	研究主要基于体外实验和有限的样本分析，需要进一步在体实验验证这些发现	探究系统性硬化症皮肤中不同成纤维细胞群体的致病机制及其在疾病进展中的作用	系统性硬化症患者的皮肤成纤维细胞	digital pathology	systemic sclerosis	bulk and single-cell RNA-seq, multichannel immunofluorescence	NA	RNA-seq data, immunofluorescence images	来自系统性硬化症患者皮肤活检的成纤维细胞样本
20	2025-05-23	Bisecting GlcNAc expression by bone marrow stromal cells modulates TGF-β1-driven macrophage polarization in myeloid leukemias 2025-May-22, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2024.287091 PMID:40400458	研究论文	研究骨髓基质细胞中双分N-乙酰葡萄糖胺（GlcNAc）表达如何通过TGF-β1调控髓系白血病中的巨噬细胞极化	揭示了骨髓基质细胞中特定糖链（减少的双分GlcNAc）通过TGFβ1分泌促进M2极化巨噬细胞亚型的机制，并发现这一过程提高了PD-L1表达，从而损害CD8+ T细胞功能	NA	探讨骨髓基质细胞中糖链修饰对髓系白血病肿瘤微环境中巨噬细胞极化的影响	骨髓基质细胞、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	髓系白血病（AML和MDS）	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组织化学数据	NA