单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-04-25	Prenatally derived macrophages support choroidal health and decline in age-related macular degeneration 2025-Jul-07, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20242007 PMID:40261298	research paper	该研究揭示了人类脉络膜中免疫细胞的组成和空间分布，特别是两种具有不同FOLR2表达的巨噬细胞群在年龄相关性黄斑变性（AMD）中的变化	首次发现并描述了FOLR2+巨噬细胞在脉络膜健康中的作用及其在AMD中的减少和功能失调	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证可能不足	探究脉络膜免疫细胞在年龄相关性黄斑变性（AMD）中的作用	人类脉络膜和小鼠模型	digital pathology	age-related macular degeneration	3D multiplex immunofluorescence, single-cell RNA sequencing, flow cytometry	NA	image, RNA-seq data	NA
2	2025-04-25	Molecular mechanism of PANoptosis and programmed cell death in neurological diseases 2025-Jun-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106907 PMID:40204169	综述	本文系统解析了PANoptosis的分子机制及其在神经系统疾病中的作用，并提出了针对PANoptosis的治疗框架	揭示了PANoptosis作为一种新型的程序性细胞死亡方式，整合了焦亡、凋亡和坏死性凋亡的核心分子元件，并在神经炎症性疾病中发挥关键作用	目前关于PANoptosis在神经系统疾病中的具体分子机制仍需进一步研究	探讨PANoptosis的分子机制及其在神经系统疾病中的病理作用，并开发精准调节剂作为新一代治疗方法	PANoptosis及其在神经系统疾病中的作用	分子生物学	神经系统疾病	单细胞转录组学	NA	分子信号数据	NA
3	2025-04-25	CD200-based cell sorting results in homogeneous transplantable striatal neuroblasts for human cell therapy for Huntington's disease 2025-Jun-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106905 PMID:40220917	research paper	该研究通过CD200标记筛选出均质的可移植纹状体神经母细胞，用于亨廷顿病的人类细胞治疗	利用单细胞RNA测序技术识别CD200作为人类纹状体神经母细胞的表面标记，并建立了基于CD200的免疫磁分选流程	研究仅在成年小鼠模型中进行了验证，尚未在人类临床试验中测试	开发一种减少异质性和批次差异的细胞选择策略，以改善神经退行性疾病的细胞治疗效果	人类纹状体神经母细胞和多能干细胞	细胞治疗	亨廷顿病	单细胞RNA测序，免疫磁分选	NA	RNA测序数据	NA
4	2025-04-25	Developmental landscape and asymmetric gene expression in the leaf vasculature of Brassica rapa revealed by single-cell transcriptome 2025-Jun, Horticulture research IF:7.6Q1 DOI:10.1093/hr/uhaf060 PMID:40271455	研究论文	通过单细胞转录组技术揭示了中国白菜叶片维管束的发育景观和不对称基因表达	首次生成了中国白菜叶片维管束的单细胞转录组景观，揭示了不同维管细胞类型的特异性基因表达模式及其在叶片形态发生中的作用	研究仅针对中国白菜，结果是否适用于其他植物尚需验证	理解叶片维管束细胞类型的特性及其在叶片形态发生中的作用	中国白菜叶片维管束细胞	植物生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	12个细胞簇，覆盖7种已知细胞类型
5	2025-04-25	Fibroblasts fluctuating between mesenchyme and epithelium are involved in hair follicle mesenchyme development 2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3 DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102006 PMID:40271513	研究论文	研究探讨了间充质和上皮细胞之间的转换在毛囊间充质发育中的作用	揭示了表达特定标记的成纤维细胞在毛囊发育中的动态转换及其对毛囊间充质干细胞生成的贡献	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	阐明间充质-上皮/上皮-间充质转换在皮肤发育中的精确作用和功能	新生小鼠皮肤	发育生物学	NA	单细胞RNA测序和免疫组织化学分析	NA	基因表达数据和图像数据	小鼠皮肤样本
6	2025-04-25	Single-cell dynamics of breakthrough toxicities after anakinra prophylaxis for axicabtagene ciloleucel in lymphoma 2025-May-13, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024015161 PMID:39928957	research paper	研究探讨了使用每日一次预防性阿那金拉（anakinra）预防淋巴瘤患者接受axicabtagene ciloleucel治疗后出现细胞因子释放综合征（CRS）和神经毒性（NT）的效果	通过单细胞RNA测序揭示了阿那金拉预防下突破性CRS和NT的分子免疫信号机制，特别是干扰素γ（IFN-γ）通路的显著富集	每日一次预防性阿那金拉在大多数患者中不足以预防需要住院治疗的毒性反应	探索预防CAR-T细胞疗法相关毒性的策略，以实现门诊治疗和管理	接受axicabtagene ciloleucel治疗的大细胞淋巴瘤患者	digital pathology	lymphoma	single-cell RNA sequencing	NA	RNA sequencing data	未明确提及具体样本数量，但涉及接受CAR-T治疗的患者
7	2025-04-25	Integrated bioinformatics and experimental verification to dissect the mechanisms and bioactive ingredients of Radix Rehmanniae in treating multiple sclerosis 2025-May-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151790 PMID:40233432	研究论文	本研究结合生物信息学和实验验证，探讨了生地黄治疗多发性硬化的机制及其生物活性成分	首次采用网络药理学和生物信息学方法，结合实验验证，全面解析了生地黄治疗多发性硬化的多成分-多靶点作用模式，并鉴定了其主要生物活性成分	研究主要基于体外实验和生物信息学预测，缺乏体内实验的进一步验证	探究生地黄治疗多发性硬化的机制及其生物活性成分	生地黄及其生物活性成分（如松果菊苷和毛蕊花糖苷）	生物信息学	多发性硬化	网络药理学、转录组学、单细胞RNA测序、分子对接	NA	基因表达数据	基于GSE数据集的转录组学和单细胞RNA测序数据
8	2025-04-25	Single-cell transcriptomics reveals the mechanisms of lung injury induced by galt gene editing in mouse 2025-May-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151780 PMID:40233430	研究论文	本研究通过单细胞转录组学揭示了Galt基因编辑在小鼠中引起的肺损伤机制	首次使用CRISPR/Cas9技术构建Galt c.847 + 1G > T突变小鼠模型，并结合单细胞RNA测序技术分析肺组织细胞群变化	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探究Galt c.847 + 1G > T突变对肺组织的影响机制	Galt基因编辑小鼠的肺组织	单细胞转录组学	半乳糖血症	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、PCR、Western blotting	小鼠模型	单细胞转录组数据	Galt基因编辑小鼠的肺组织样本
9	2025-04-25	Deciphering the Dysregulating IGF-1-SP1-CD248 Pathway in Fibroblast Functionality during Diabetic Wound Healing 2025-May, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.07.035 PMID:39293711	研究论文	本研究揭示了IGF-1-SP1-CD248通路在糖尿病伤口愈合过程中对成纤维细胞功能的调控作用	首次发现IGF-1通过蛋白激酶B/mTOR信号通路和SP1转录因子调控CD248表达，并阐明TNFα在糖尿病环境中促进IGF-1抵抗的机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证相对有限	探索糖尿病伤口愈合障碍的分子机制并寻找潜在治疗靶点	糖尿病伤口愈合过程中的成纤维细胞	分子生物学	糖尿病溃疡	单细胞转录组分析、免疫组化染色	NA	基因表达数据、组织样本	糖尿病患者和小鼠的皮肤伤口样本
10	2025-04-25	Profiling Long Noncoding RNA in Psoriatic Skin Using Single-Cell RNA Sequencing 2025-May, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.09.010 PMID:39342985	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术对银屑病患者皮肤中的长链非编码RNA（lncRNA）进行表达谱分析	首次在单细胞水平上对银屑病皮肤中的lncRNA进行系统性的表达谱分析，并鉴定了细胞类型特异性的lncRNA	样本量较小（6名患者），且仅针对银屑病皮肤进行研究	探究lncRNA在银屑病皮肤中的表达模式及其与细胞增殖/表皮分化的关系	银屑病患者的皮损和未受累皮肤组织	基因组学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学	NA	RNA测序数据	6名银屑病患者的配对皮损和未受累皮肤样本
11	2025-04-25	Emerging Techniques in Spatial Multiomics: Fundamental Principles and Applications to Dermatology 2025-May, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.09.006 PMID:39503694	review	本文综述了空间多组学技术在皮肤学研究中的基本原理、优势、局限性和应用潜力	空间多组学技术能够同时捕获DNA、基因组可及性、组蛋白修饰和蛋白质，具有空间分辨的单细胞分辨率，为皮肤复杂异质性研究提供了新视角	技术尚处于早期阶段，可能存在一些未解决的技术限制和应用挑战	探讨空间多组学技术在皮肤学研究中的应用潜力	皮肤组织	分子病理学	皮肤病	空间多组学技术	NA	基因组、蛋白质组和表观基因组数据	NA
12	2025-04-25	Human Enteric Glia Diversity in Health and Disease: New Avenues for the Treatment of Hirschsprung Disease 2025-May, Gastroenterology IF:25.7Q1 DOI:10.1053/j.gastro.2024.12.011 PMID:39725172	研究论文	本研究探索了健康与疾病状态下人类肠道神经胶质细胞的多样性，并为赫希施普龙病的治疗提供了新途径	首次在儿科肠道中鉴定出两种主要的肠道神经胶质细胞类别，并揭示了它们在赫希施普龙病中的持续存在，为使用5-HT激动剂治疗提供了新靶点	研究主要基于儿科样本和斑马鱼模型，可能无法完全代表成人或其他物种的情况	探索健康与疾病状态下肠道神经胶质细胞的多样性及其在赫希施普龙病治疗中的潜在应用	儿科肠道样本和赫希施普龙病患者样本，以及野生型和ret突变斑马鱼	神经生物学	赫希施普龙病	单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、免疫荧光、荧光原位杂交	NA	RNA测序数据、荧光图像	儿科对照和赫希施普龙病患者的全层肠切除材料，以及野生型和ret突变斑马鱼
13	2025-04-25	Murine Aortic Valve Cell Heterogeneity at Birth 2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322280 PMID:40079140	research paper	该研究通过单细胞转录组学分析了出生后第1天小鼠主动脉瓣结构的细胞异质性	发现了一个独特的出生后第1天瓣膜内皮细胞亚群和3个未被充分认识的瓣膜间质细胞亚群	研究仅关注出生后第1天的主动脉瓣细胞异质性，未涵盖其他发育阶段	探索主动脉瓣在出生后成熟过程中建立和维持结构与功能的细胞机制	小鼠主动脉瓣细胞	单细胞转录组学	心血管疾病	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	出生后第1天小鼠主动脉瓣样本
14	2025-04-25	Glucagon-like peptide-1 receptor signaling activation in alveolar type II cells enhances lung development in neonatal rats exposed to hyperoxia 2025-May, Redox biology IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.redox.2025.103586 PMID:40080965	研究论文	本研究探讨了GLP-1R信号在肺泡II型细胞中对高氧暴露新生大鼠肺发育的促进作用及其潜在机制	首次揭示了GLP-1R信号通过调节线粒体分裂和糖代谢促进肺发育的新机制，并发现高氧通过抑制m6A甲基化影响GLP-1R激活	研究仅基于新生大鼠模型，尚未在人类样本中验证	探索GLP-1R在肺发育调控中的作用及其分子机制	新生Sprague-Dawley大鼠的肺泡II型细胞和RLE-6TN细胞	NA	支气管肺发育不良	单细胞RNA测序、Western blotting、双免疫荧光染色、Seahorse XF96代谢分析、MeRIP-qPCR	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢数据	新生大鼠肺组织在不同时间点(3、7、10、14天)的样本
15	2025-04-25	Chemokine (C-C Motif) Ligand 2 Expressing Adventitial Fibroblast Expansion During Loeys-Dietz Syndrome Aortic Aneurysm Formation 2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322069 PMID:40109260	research paper	本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了Loeys-Dietz综合征（LDS）主动脉瘤形成中外膜成纤维细胞的作用	揭示了LDS主动脉瘤形成中外膜成纤维细胞的促炎症状态转变及其在疾病中的关键作用	样本量较小，人类样本仅5例LDS和2例对照	阐明LDS主动脉瘤发病机制中的细胞状态转变和转录组学变化	小鼠LDS模型和人类LDS手术样本中的主动脉组织	分子生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序、RNA原位杂交、免疫荧光和免疫组织化学	Tgfbr2G357W/+小鼠模型	转录组数据	小鼠模型和人类样本（n=5 LDS和n=2对照）共>30,000个细胞
16	2025-04-25	MrgD as a Novel Modeling and Treatment Target for Pulmonary Hypertension 2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322337 PMID:40143817	研究论文	本研究探讨了MrgD在肺动脉高压（PH）中的作用及其作为治疗靶点的潜力	首次揭示了MrgD在PH中的保护作用及其通过PIM1-AKT-MAZ信号通路调控肺动脉平滑肌细胞增殖的机制	研究主要基于动物模型，人类样本验证有限	探究MrgD在肺动脉高压发病机制中的作用及其治疗潜力	肺动脉高压动物模型（Sugen5416+缺氧、野百合碱诱导）和人类肺动脉平滑肌细胞	心血管疾病研究	肺动脉高压	单细胞测序、RNA测序、分子生物学实验	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、细胞增殖数据	多种PH动物模型及人类肺动脉平滑肌细胞
17	2025-04-25	Extracellular vesicle-packaged GBP2 from macrophages aggravates sepsis-induced acute lung injury by promoting ferroptosis in pulmonary vascular endothelial cells 2025-May, Redox biology IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.redox.2025.103614 PMID:40156957	研究论文	本研究探讨了巨噬细胞来源的细胞外囊泡（EVs）在脓毒症诱导的急性肺损伤（si-ALI）中的作用及其机制，发现GBP2通过促进肺血管内皮细胞铁死亡加剧肺损伤	首次揭示了GBP2通过OTUD5促进GPX4泛素化进而驱动内皮细胞铁死亡的机制，并筛选出具有潜在治疗作用的小分子化合物Plantainoside D	研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	阐明巨噬细胞来源EVs在si-ALI中的作用机制并探索潜在治疗靶点	巨噬细胞、肺血管内皮细胞、脓毒症患者和小鼠模型	分子病理学	急性肺损伤/脓毒症	蛋白质组测序、转录组重分析、单细胞测序、RNA干扰、腺相关病毒转染、高通量筛选、分子对接、分子动力学模拟、细胞热位移分析	CLP小鼠模型、内皮特异性Gpx4敲除小鼠	蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据	脓毒症患者外周血样本、THP-1和RAW264.7细胞系、CLP小鼠模型
18	2025-04-25	Single-cell RNA sequencing reveals a reprogramming of hepatic immune cells and a protective role for B cells in MASH-driven HCC 2025-May-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000668 PMID:40257356	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中肝脏免疫细胞的重编程及B细胞的保护作用	揭示了B细胞在抗肿瘤免疫中的新作用及其通过增强T细胞反应促进抗肿瘤免疫的机制	研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中免疫细胞的作用及机制	小鼠模型中的肝脏免疫细胞，特别是B细胞	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	μMT小鼠模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但使用了小鼠模型进行研究
19	2025-04-25	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Molecular Signatures that Distinguish Allergic from Irritant Contact Dermatitis 2025-May, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.09.008 PMID:39341550	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示区分过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎的分子特征	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎在转录组水平上的差异，并开发了一个高敏感性和特异性的诊断模型	样本量较小，且仅针对健康志愿者进行研究，未涉及不同年龄或疾病严重程度的患者	发现区分过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎的生物标志物	人类皮肤组织	生物医学	过敏性接触性皮炎和刺激性接触性皮炎	单细胞RNA测序	逻辑回归模型	转录组和蛋白质组数据	健康人类志愿者
20	2025-04-25	Lipoxin A4/FPR2 Signaling Mitigates Ferroptosis of Alveolar Epithelial Cells via NRF2-Dependent Pathway During Lung Ischemia-Reperfusion Injury 2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202401475R PMID:40270323	研究论文	本研究探讨了Lipoxin A4（LxA）通过FPR2/NRF2信号通路减轻肺泡上皮细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤（IRI）中的保护作用	首次揭示了LxA/FPR2信号通过NRF2依赖的途径减轻肺泡上皮细胞的铁死亡，从而保护肺IRI	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人体临床试验中验证	探究铁死亡在肺IRI中的作用及LxA的保护机制	肺移植后患者样本、C57BL/6小鼠、Fpr2和Nrf2基因敲除小鼠、肺泡II型上皮细胞	生物医学	肺缺血再灌注损伤	单细胞RNA测序、小鼠肺移植模型、体外细胞实验	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、氧化脂质水平、肺功能参数	未明确说明患者样本数量，使用多组小鼠和细胞实验