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当前共找到 32645 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-30 |
Leveraging single-cell spatial transcriptomics and connectomics to resolve brain circuit function in psychiatry
2026-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02178-0
PMID:40721521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-11-16 |
Periostin-positive stellate cells associated with perineural invasion in pancreatic adenocarcinoma
2026-Jan-01, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2025.112678
PMID:41106801
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺星状细胞在胰腺癌神经侵袭中的关键作用 | 首次发现高表达Periostin的胰腺星状细胞在神经侵袭阳性样本中富集，并揭示了ANXA1-SPP1/PLAU信号轴在促进神经侵袭中的协调作用 | 样本量相对有限（24个活检标本），需要进一步功能验证实验确认机制 | 阐明胰腺导管腺癌中神经侵袭的细胞和分子机制 | 胰腺导管腺癌患者活检组织中的细胞群体 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 24个PDAC活检标本，约60,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2025-11-16 |
Digital pathology and spatial omics in steatohepatitis: Clinical applications and discovery potentials
2025-Dec-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000866
PMID:38517078
|
综述 | 本文综述了数字病理学和空间组学在脂肪性肝炎中的临床应用与发现潜力 | 整合数字病理学与空间组学技术，强调机器学习算法与空间生物学的多模态融合应用 | 讨论了现有工具的局限性、前提条件及知识空白领域 | 改善脂肪性肝炎组织学解读准确性并探索空间分子特征 | 脂肪性肝炎患者的肝脏组织切片 | 数字病理学 | 脂肪性肝炎 | 线性与非线性显微镜、空间转录组学、空间蛋白质组学 | 机器学习算法、人工智能算法 | 全切片图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 4 | 2025-11-16 |
Cell-type deconvolution methods for spatial transcriptomics
2025-Dec, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00845-y
PMID:40369312
|
综述 | 本文系统评述了空间转录组学中细胞类型反卷积方法的类型、功能对比，并创建了在线交互式表格以促进方法选择 | 开发了基于网络的交互式表格工具，帮助研究人员更高效地选择适合的空间转录组细胞类型反卷积方法 | NA | 评述空间转录组学中细胞类型反卷积方法的现状与发展 | 空间转录组学数据中的细胞类型组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2025-11-16 |
Simultaneously infer cell pseudotime, velocity field, and gene interaction from multi-branch scRNA-seq data with scPN
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf144
PMID:41229398
|
研究论文 | 提出一种名为scPN的新型高维动力学建模方法，可从单细胞RNA测序数据同时推断细胞伪时间、速度场和基因相互作用 | 首次能够在多分支数据集上同时恢复伪时间、速度场和基因相互作用，使用分段基因-基因相互作用网络建模基因调控动力学 | NA | 从单细胞RNA测序数据建模细胞动力学，理解细胞发育和基因调控关系 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育过程和基因相互作用网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高维动力学模型，分段网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-11-16 |
Allele-specific immune gene quantification and expression analysis in single-cell RNA-seq data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf149
PMID:41229397
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据中免疫基因等位基因特异性表达定量的新型计算方法 | 开发了新型R/Bioconductor数据结构，可处理多个免疫遗传注释层的表达数据，并支持免疫基因表达的交互式探索 | NA | 研究人类免疫基因组多样性中的等位基因特异性表达模式 | 人类免疫基因（如HLA和KIR基因） | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-11-16 |
Clinical characteristics and target exploration via scRNA-seq and high-throughput drug screening of FOXO1 fusion positive rhabdomyosarcoma
2025-Nov-15, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-06241-1
PMID:41240117
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高通量药物筛选探索FOXO1融合阳性横纹肌肉瘤的临床特征和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序与高通量药物筛选系统研究FOXO1融合状态对横纹肌肉瘤的影响，并发现MET作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限（65例患者），且包含罕见病例类型 | 研究FOXO1融合状态对横纹肌肉瘤临床特征和治疗靶点的影响 | 65例儿童横纹肌肉瘤患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序，高通量药物筛选，患者来源异种移植模型 | Cox回归分析，Kaplan-Meier估计 | 临床数据，单细胞转录组数据 | 65例儿童横纹肌肉瘤患者（36例胚胎型，15例腺泡型，14例其他类型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-11-16 |
Targeting the HMGB1-IL32 pathway to alleviate T cell exhaustion in epithelial ovarian cancer
2025-Nov-15, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01963-5
PMID:41240232
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了卵巢癌细胞通过HMGB1-IL32信号通路影响终末耗竭CD8+T细胞的机制 | 首次发现HMGB1-HAVCR2配体-受体对介导卵巢癌细胞与终末耗竭CD8+T细胞的通讯，并阐明HMGB1通过NFKB1和TP53调控IL32表达的新信号通路 | NA | 解析卵巢癌微环境中细胞间通讯对终末耗竭CD8+T细胞的影响机制 | 卵巢癌微环境中的癌细胞和CD8+T细胞 | 单细胞基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-11-16 |
Single-cell analysis of adult mouse testes exposed to cigarette smoke
2025-Nov-15, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03703-2
PMID:41240254
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析香烟烟雾暴露对成年小鼠睾丸的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示香烟烟雾暴露导致睾丸细胞类型比例变化及多细胞类型的转录组改变 | 研究仅使用小鼠模型，样本量相对有限 | 探究香烟烟雾暴露对睾丸组织结构和精子发生过程的影响机制 | 成年小鼠睾丸组织 | 单细胞组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因本体分析(GO分析), 基因集富集分析(GSEA) | NA | 单细胞转录组数据, 病理学数据 | 成年小鼠睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-11-16 |
Antiviral Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2025-Nov-14, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf367
PMID:40628395
|
研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断前后血浆蛋白质组和单细胞转录组，揭示了病毒反弹前的免疫反应特征 | 首次在可检测的病毒反弹前观察到CD16++单核细胞增加及其抗病毒基因表达特征 | 样本来源仅限于外周血单个核细胞，未涉及组织驻留细胞 | 识别治疗中断后病毒反弹的早期信号，为延长HIV-1反弹时间和治愈策略提供依据 | HIV-1感染者外周血单个核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-11-16 |
Identification of key diagnostic and prognostic biomarkers for aortic valve stenosis with coronary artery disease through immunological profiling integrating proteomics, single-cell sequencing, and machine learning
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152855
PMID:41151411
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学、单细胞测序和机器学习的免疫学分析，识别主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病的关键诊断和预后生物标志物 | 首次系统整合多组学数据和机器学习方法识别AS-CAD特异性生物标志物FGL1，并验证其诊断和预后价值 | 样本量有限，需要更大规模的多中心研究验证 | 系统识别AS-CAD的分子生物标志物并评估其临床预后相关性 | 主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病患者组织样本、ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型、RAW264.7巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、LASSO回归、ELISA、免疫组化、Western blotting | LASSO回归 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、临床数据 | AS-CAD患者组织样本、独立临床队列、多中心前瞻性TAVI患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 12 | 2025-11-16 |
Immunosuppression of HMOX1 contributes to metastasis and poor prognosis in glioma
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152848
PMID:41151408
|
研究论文 | 本研究探讨HMOX1在胶质瘤免疫抑制和转移中的作用机制 | 首次系统揭示HMOX1通过促进M2巨噬细胞极化介导胶质瘤免疫抑制和转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证 | 阐明HMOX1与胶质瘤免疫抑制和转移的关系 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 细胞实验, 异种移植模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA数据库693例患者, TCGA数据库702例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-11-16 |
Spatially organized cellular communities shape functional tissue architecture in the pancreas
2025-Nov-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx5791
PMID:41223257
|
研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术，揭示了胰腺中细胞群体如何通过空间组织形成功能性组织架构 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术，在时空维度上解析胰腺细胞群体的空间组织模式，发现了上皮-间质单元作为基本组织微环境 | 研究主要基于小鼠模型，人类模型验证相对有限 | 探索胰腺组织中细胞空间组织和相互作用的机制 | 小鼠和人类胰腺组织，从胚胎发育到成年稳态 | 空间转录组学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2025-11-16 |
Fibroblast-Mediated MMP2 Contribution to Nonresponse in Anti-TNFα Therapy for Crohn's Disease
2025-Nov-14, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaf263
PMID:41236836
|
研究论文 | 本研究探讨了克罗恩病患者对抗TNFα疗法无应答的机制，重点关注成纤维细胞介导的细胞外基质重塑作用 | 首次通过单细胞分析识别CD81+成纤维细胞亚群是ECM重塑的主要贡献者，并发现MMP2在成纤维细胞-巨噬细胞串扰中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要进一步体内验证 | 探索抗TNFα疗法耐药性的潜在机制 | 克罗恩病患者样本和原代细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞转录组测序, 批量转录组测序, 多重免疫荧光, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 公共数据库中的克罗恩病患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2025-11-16 |
FastSCODE: an accelerated SCODE algorithm for inferring gene regulatory networks on manycore processors
2025-Nov-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf624
PMID:41237047
|
研究论文 | 开发了FastSCODE算法，通过GPU加速显著提升单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的计算效率 | 将SCODE算法改造为支持批量计算的版本，利用众核处理器（如GPU）实现并行优化，性能提升高达6000倍 | 未明确说明算法在其他类型数据集上的适用性和性能表现 | 提高单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的计算效率 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | ODE模型 | 基因表达数据 | CeNGEN单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-11-16 |
Spider: a flexible and unified framework for simulating spatial transcriptomics data
2025-Nov-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf562
PMID:41237053
|
研究论文 | 提出了一种无需真实数据参考的灵活空间转录组学数据模拟框架 | 通过细胞类型比例和相邻细胞间转移矩阵表征空间模式，提供比现有方法更真实多样的模拟数据和建模灵活性 | 未明确说明框架在特定生物场景或技术平台下的验证局限性 | 解决空间转录组学分析工具基准测试中标准数据集多样性和准确性不足的问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据模拟 | Python框架 | 空间转录组学模拟数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-11-16 |
An islet-resident macrophage antioxidant program preserves β cell physiology
2025-Nov-14, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adz5181
PMID:41237222
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研究论文 | 本研究揭示了胰岛驻留巨噬细胞的抗氧化程序如何保护β细胞生理功能 | 首次发现SLC7A11驱动的转录程序在CD9阳性胰岛巨噬细胞中增强抗氧化防御，并确定这些巨噬细胞作为内分泌胰腺中专化免疫哨兵的功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类胰岛巨噬细胞的功能验证仍需进一步研究 | 探究胰岛驻留巨噬细胞的起源、异质性和功能作用 | 小鼠和人类胰岛中的驻留巨噬细胞 | 免疫学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序，命运图谱系统 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-11-16 |
PIEZO1 gain-of-function mutation drives cardiomyopathy by disrupting myocardial lipid homeostasis besides iron overload
2025-Nov-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady9242
PMID:41237237
|
研究论文 | 本研究揭示PIEZO1功能获得性突变通过破坏心肌脂质代谢导致心肌病的新机制 | 发现PIEZO1功能获得性突变除铁超载外，还通过钙信号-CaMKII-FOXO3通路抑制脂质代谢途径导致心肌病 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，人类样本数量有限 | 阐明PIEZO1突变导致心肌病的分子机制 | PIEZO1 D674Y突变小鼠、心肌细胞特异性过表达模型、31岁男性先证者 | 心血管疾病研究 | 心肌病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | 1名人类患者和转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-11-16 |
Integrating machine learning and experimental validation identifies a post-translational modification gene signature for prognosis and treatment response in breast cancer
2025-Nov-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23772-8
PMID:41238648
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和实验验证，开发了一个用于乳腺癌预后和治疗反应预测的翻译后修饰相关基因标志物 | 首次系统整合多种翻译后修饰数据，从117个机器学习模型中筛选最优组合构建基因标志物，并通过单细胞和空间转录组分析进行验证 | 研究样本量未明确说明，需要进一步的外部验证队列确认标志物的普适性 | 阐明翻译后修饰与乳腺癌预后的关联，开发预后预测模型 | 乳腺癌患者及其肿瘤组织 | 机器学习 | 乳腺癌 | GSVA、PCR、单细胞RNA-seq、空间转录组 | 机器学习集成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 20 | 2025-11-16 |
Exploring mitochondrial ribosomal protein S12 as a novel target for non-small cell lung cancer
2025-Nov-14, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01128-9
PMID:41238733
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研究论文 | 本研究探讨线粒体核糖体蛋白S12在非小细胞肺癌发病机制中的表达和功能意义 | 首次系统揭示MRPS12通过维持线粒体功能驱动非小细胞肺癌恶性进展的作用机制，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 未明确MRPS12过表达的具体调控机制及其在不同NSCLC亚型中的差异作用 | 探索MRPS12作为非小细胞肺癌新型治疗靶点的可行性 | 非小细胞肺癌细胞系、患者组织样本及裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, shRNA基因沉默, CRISPR-Cas9基因敲除, 线粒体功能分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 体外功能实验数据, 体内动物实验数据 | 癌症基因组图谱数据集患者样本及多种NSCLC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 基因编辑 | NA | NA |