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当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-01 |
Clinical application of single-cell RNA sequencing in disease and therapy
2025-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70512
PMID:41169094
|
综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术在疾病机制研究和临床应用中的进展 | 全面总结了scRNA-seq技术在多种疾病领域和药物开发中的临床应用前景 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在疾病研究和临床治疗中的应用价值 | 人类疾病中的体细胞进化、生物标志物发现和药物开发 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2025-11-01 |
Mechanisms of lactylation-related biomarker in neonatal hypoxic-ischemic brain damage analyzed through multi-omics data
2025-Oct-30, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04538-4
PMID:41168403
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析乳酰化相关生物标志物在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的作用机制 | 首次在新生大鼠缺氧缺血性脑病模型中采用多组学方法，探索乳酸盐代谢相关基因的作用 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 研究乳酰化相关基因在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的机制并探索潜在治疗靶点 | SD大鼠新生幼鼠的脑组织 | 多组学分析 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接 | 机器学习 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞数据 | SD大鼠脑组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 3 | 2025-11-01 |
A novel spatial framework to validate arsenic exposure gene expression profiling in bladder cancer using multiplex FISH and AI-powered digital pathology
2025-Oct-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23396-y
PMID:41168438
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研究论文 | 本研究开发了一种结合多重荧光原位杂交和AI数字病理的空间框架，用于验证膀胱癌中砷暴露相关基因表达特征 | 首次将mFISH与AI驱动的数字病理整合，在单细胞分辨率下验证砷暴露相关三基因模型的空间分布特征 | 仅为探索性试点研究，样本量较小(5例膀胱肿瘤标本) | 验证砷暴露相关基因表达特征在膀胱癌中的空间分布及其临床意义 | 膀胱癌肿瘤标本 | 数字病理 | 膀胱癌 | 多重荧光原位杂交(mFISH), AI数字病理分析 | HoverNet | 全玻片图像, 基因表达数据 | 5例膀胱肿瘤标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2025-11-01 |
Nicheformer: a foundation model for single-cell and spatial omics
2025-Oct-30, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02814-z
PMID:41168487
|
研究论文 | 提出基于Transformer的基础模型Nicheformer，用于单细胞和空间组学数据分析 | 首个同时训练于人类和小鼠解离单细胞及靶向空间转录组数据的基础模型，能够学习捕获空间背景的细胞表征 | 未明确说明模型在特定组织类型或疾病状态下的性能限制 | 开发能够整合多尺度数据的机器学习模型，用于空间单细胞分析 | 人类和小鼠的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | Transformer | 单细胞数据，空间转录组数据 | 超过1.1亿个细胞（5700万解离细胞和5300万空间解析细胞），涵盖73种组织 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2025-11-01 |
Integrating single-cell RNA-seq datasets with substantial batch effects
2025-Oct-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12126-3
PMID:41168710
|
研究论文 | 提出一种基于条件变分自编码器的新方法sysVI，用于整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集 | 使用VampPrior和循环一致性约束来改进条件变分自编码器，能够在保持生物信号的同时有效整合跨系统数据集 | NA | 开发能够有效整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集的计算方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器(cVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-11-01 |
Genome-wide association, single-cell, and spatial transcriptomics analyses reveal the role of the STK24-expressing positive cells in LUAD progression and the tumor microenvironment, identifying STK24 as a potential therapeutic target
2025-Oct-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07111-z
PMID:41168822
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研究论文 | 本研究通过整合基因组关联分析、单细胞转录组学和空间转录组学，揭示了STK24阳性细胞在肺腺癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 首次发现STK24作为肺腺癌风险基因，并通过多组学方法系统阐明了STK24阳性上皮细胞在肿瘤微环境中的功能机制 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证部分仍需进一步扩展 | 探索肺腺癌的遗传机制和潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | GWAS, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 多种机器学习算法, 预后模型 | 基因组数据, 转录组数据, 空间位置数据 | 来自FinnGen、IEU OpenGWAS、GWAS Catalog和GEO数据库的多个队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-11-01 |
Ex vivo lung-organoid model for aberrant basaloid cell induction and activation
2025-Oct-30, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00396-z
PMID:41168897
|
研究论文 | 本研究开发了一种离体小鼠肺类器官模型，用于诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞 | 开发了首个能够诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞的离体肺类器官模型，并识别出两个不同的ABC亚群 | 仅使用小鼠模型进行研究，未在人体组织中验证所有发现 | 研究肺纤维化中异常基底样细胞的诱导机制和功能 | 小鼠肺类器官和异常基底样细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，细胞-细胞相互作用分析 | 类器官模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-11-01 |
A Dynamic DNA Nano-Antioxidant Targeting Galectin-3 Attenuates Liver Fibrosis via Reducing Macrophage Oxidative Stress
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509977
PMID:41168966
|
研究论文 | 开发了一种靶向Galectin-3的动态DNA纳米抗氧化剂，通过减少巨噬细胞氧化应激缓解肝纤维化 | 首次开发动态DNA纳米抗氧化剂实现肝巨噬细胞特异性siRNA递送，并发现Galectin-3与巨噬细胞氧化应激的正相关性 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未进行临床前或临床试验 | 开发靶向治疗肝纤维化的新型纳米药物平台 | 肝巨噬细胞和肝纤维化小鼠模型 | 纳米医学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序，siRNA递送，IVIS成像 | NA | 基因表达数据，荧光成像数据，组织学数据 | 四氯化碳诱导的肝纤维化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-11-01 |
Spatiotemporal transcriptomic and metabolomic landscapes of wild soybean seed development reveal regulatory mechanisms of nutrient accumulation
2025-Oct-29, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101580
PMID:41169047
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和代谢组学解析野生大豆种子发育过程中的营养积累调控机制 | 首次在野生大豆中整合空间转录组学和代谢组学分析，揭示了胚胎不同区域细胞的代谢分化模式及关键调控因子GsMAPK23-4的功能 | 研究仅聚焦于中成熟期种子，未涵盖整个发育过程的动态变化 | 阐明野生大豆种子发育过程中细胞分化和营养积累的时空调控机制 | 野生大豆(Glycine soja Sieb. et Zucc.)种子 | 植物生物学 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 差异表达分析, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 中成熟期野生大豆种子 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-11-01 |
Advances in Epigenomic Sequencing and Their Applications in Cancer Diagnostics
2025-Oct-27, Precision chemistry
DOI:10.1021/prechem.5c00014
PMID:41170156
|
综述 | 概述表观基因组测序技术进展及其在癌症诊断中的应用 | 系统整合了单细胞测序与空间工具在癌症诊断中的多组学技术融合应用 | 讨论了当前技术向常规临床诊断转化面临的挑战和限制 | 推动表观基因组测序技术在精准医学中的发展和临床应用 | 癌症表观基因组特征（DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性） | 生物医学 | 癌症 | 表观基因组测序、单细胞测序、空间转录组学、多组学技术 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学、bulk测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-11-01 |
Qingre huazhuo tang regulates IgA nephropathy through immune checkpoints and ferroptosis
2025-Oct, Journal of traditional and complementary medicine
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.jtcme.2024.11.005
PMID:41169938
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、单细胞测序和实验验证，探讨清热化浊汤通过免疫检查点和铁死亡途径调节IgA肾病的机制 | 首次将网络药理学、单细胞测序与实验验证相结合，系统阐明清热化浊汤治疗IgA肾病的新机制——通过免疫检查点和铁死亡途径发挥作用 | 研究机制尚未完全阐明，需要进一步深入验证 | 验证清热化浊汤通过免疫检查点和铁死亡调节IgA肾病的机制 | IgA肾病患者的足细胞 | 网络药理学 | IgA肾病 | 单细胞测序, 网络药理学, 实验验证 | NA | 单细胞测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-11-01 |
Kell and Kx blood group systems: an update
2025-Sep-01, Immunohematology
|
综述 | 更新自2015年以来Kell和Kx血型系统的最新研究进展，包括新发现的抗原、等位基因及其与红细胞膜稳定性的关系 | 首次报道婴儿McLeod综合征诊断，发现大量新抗原和等位基因（截至2025年Kell系统已有38种抗原），强调分子诊断在解决血清学模糊性和神经退行性疾病诊断中的作用 | NA | 总结Kell和Kx血型系统的最新研究进展和临床应用 | Kell和Kx血型系统的抗原、等位基因及其与红细胞膜稳定性和疾病的关系 | NA | 血液系统疾病 | 单细胞测序、多组学分析、基因编辑、细胞治疗 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 13 | 2025-11-01 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis reveals ACACA as a potential prognostic and immunotherapeutic biomarker across cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1599223
PMID:41169354
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析，揭示ACACA作为跨癌种潜在预后和免疫治疗生物标志物 | 首次在多癌种水平系统研究ACACA的转录组、蛋白质组和免疫学特征，并通过单细胞测序解析其在肿瘤微环境中的表达模式 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于肺癌和肉瘤细胞系 | 探索ACACA在多种癌症中的预后价值和免疫治疗潜力 | 多种癌症类型（重点关注肺癌和肉瘤） | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,临床数据 | 来自TCGA、CPTAC、HPA和GEO数据库的多癌种样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-11-01 |
ADAM8 in macrophages exacerbates sepsis-induced cardiomyopathy by impeding efferocytosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1654688
PMID:41169382
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研究论文 | 本研究揭示了ADAM8在巨噬细胞中通过阻碍胞葬作用加剧脓毒症诱发的心肌病 | 首次发现ADAM8在脓毒症心肌病心脏巨噬细胞中显著上调，并阐明其通过调控MerTK/sMer通路影响巨噬细胞胞葬功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究ADAM8在脓毒症诱发心肌病中的具体作用机制 | 小鼠脓毒症模型（LPS诱导和CLP模型）、巨噬细胞特异性ADAM8敲除小鼠、RAW264.7细胞系 | 分子病理学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞转录组测序, RNA转录组测序, 免疫荧光, 慢病毒敲低 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞图像 | 未明确样本数量，使用多种小鼠模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-11-01 |
Multi-omics analysis and evidence of IL1R1 as a potential biomarker for diabetes-associated intervertebral disc degeneration
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1692185
PMID:41169383
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定IL1R1作为糖尿病相关椎间盘退变的潜在生物标志物 | 首次通过整合生物信息学和单细胞测序揭示IL1R1在糖尿病相关椎间盘退变中的关键作用，并构建了诊断模型和调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索2型糖尿病与椎间盘退变之间的共享分子机制 | 人类T2DM和IDD转录组数据集、糖尿病小鼠髓核组织 | 生物信息学 | 糖尿病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,机器学习 | LASSO,随机森林,人工神经网络 | 基因表达数据,单细胞数据 | 人类转录组数据集和糖尿病小鼠髓核组织 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-11-01 |
Comprehensive analyses of single-cell and bulk RNA-seq reveal the biological and prognostic roles of BMP4 in pancreatic adenocarcinoma
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1686938
PMID:41169612
|
研究论文 | 通过单细胞和批量RNA-seq分析揭示BMP4在胰腺腺癌中的生物学功能和预后作用 | 首次系统分析BMP4在胰腺癌中的表达模式、预后价值及其在肿瘤代谢中的非经典信号通路作用 | BMP4对免疫细胞浸润的影响有限，其预后作用主要独立于免疫调节机制 | 探讨BMP4在胰腺腺癌中的生物学功能和临床预后价值 | 胰腺腺癌患者样本和正常胰腺组织 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 列线图预测模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-11-01 |
Deconvolution and phylogeny inference of diverse variant types integrating bulk DNA-seq with single-cell RNA-seq
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf234
PMID:41169710
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研究论文 | 提出TUSV-int框架，整合bulk DNA-seq和单细胞RNA-seq数据进行克隆谱系树重建 | 首次将bulk DNA-seq与scRNA-seq整合到统一的去卷积和系统发育推断框架中，同时支持SNV、CNA和SV多种变异类型 | scDNA-seq数据成本高且技术挑战大，限制了在大规模队列中的常规应用 | 改进癌症克隆谱系树重建，解决结构变异和局部拷贝数变异检测难题 | 癌症基因组变异，包括单核苷酸变异、拷贝数改变和结构变异 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 整数线性规划(ILP) | 系统发育推断模型 | DNA测序数据，RNA测序数据 | 已发表的乳腺癌数据集 | NA | bulk DNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-11-01 |
Opportunities and challenges in the application of spatiotemporal transcriptomics in plant research
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1684057
PMID:41169728
|
综述 | 探讨时空转录组学技术在植物研究中的应用机遇与挑战 | 系统阐述将空间转录组学这一前沿技术应用于植物研究领域的创新价值 | NA | 分析空间转录组学在植物研究中的技术优势与发展前景 | 植物组织与细胞 | 空间转录组学 | NA | 高通量转录组学, 高分辨率组织成像 | NA | 基因表达数据, 空间位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2025-11-01 |
Research advances of the establishment and characterization of Helicobacter pylori infection animal models
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1683366
PMID:41170432
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综述 | 本文综述了幽门螺杆菌感染动物模型的建立与表征方法研究进展 | 系统整合了动物模型建立的关键要素，并探讨了空间转录组学在该领域的潜在应用 | 未开展原始实验研究，主要基于现有文献进行总结分析 | 为建立稳定可重复的幽门螺杆菌感染动物模型提供实践参考 | 幽门螺杆菌感染动物模型 | 病理学 | 幽门螺杆菌感染相关疾病 | 空间转录组学, 侵入性和非侵入性检测技术 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-31 |
Thymic myeloid cells are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250733
PMID:41123595
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胸腺髓系细胞的异质性并鉴定出一种新型过渡性树突状细胞群 | 发现传统认知的DC2实际包含四个不同细胞谱系，并首次鉴定出CX3CR1+过渡性树突状细胞(tDC)这一新型细胞群 | 研究主要基于小鼠模型，人类胸腺髓系细胞的异质性仍需验证 | 解析胸腺髓系细胞的谱系身份、发育和成熟机制 | 胸腺髓系细胞（包括树突状细胞和巨噬细胞） | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞转录组测序，谱系定义小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |