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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-03 |
Bioinformatics Analysis of Transcriptomic Data (Bulk and scRNA-Seq) for Immuno-Oncology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4734-9_18
PMID:41028272
|
综述 | 本章提供了免疫学研究中使用生物信息学工具分析转录组数据的全面指南 | 系统整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序在免疫肿瘤学中的生物信息学分析方法 | NA | 促进免疫学数据分析和解读,帮助理解免疫反应机制 | 免疫系统动态、免疫细胞异质性、基因表达模式、免疫受体库 | 生物信息学 | 肿瘤 | 下一代测序(NGS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 质谱流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-11-03 |
Differentiation Trajectory of Virus-Induced Tumour Cells in Rice Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70267
PMID:40693410
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示水稻中病毒诱导肿瘤细胞的分化轨迹 | 首次构建水稻病毒感染的细胞类型特异性图谱,揭示水稻黑条矮缩病毒诱导肿瘤细胞从维管薄壁细胞分化的过程 | 仅针对水稻黑条矮缩病毒,未涵盖其他植物病毒 | 研究植物病毒感染引起的宿主细胞异常分化和发育机制 | 水稻叶片鞘细胞 | 植物病理学 | 植物病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 106,973个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-11-03 |
Ki-67 in meningioma: distribution and implications
2025-Nov-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2025.4.JNS25438
PMID:40712166
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术解析脑膜瘤中Ki-67表达的细胞来源与分布特征及其临床意义 | 首次在单细胞水平揭示脑膜瘤中Ki-67表达的多细胞来源特征,发现不同WHO分级中Ki-67+细胞组成差异 | 样本量相对有限(32例单细胞分析),需要更大规模研究验证 | 解析脑膜瘤微环境中Ki-67表达的细胞来源、分布特征及其临床基因组学关联 | 脑膜瘤组织样本 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞质谱流式, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞数据, 基因组数据, 临床数据 | 32例脑膜瘤(单细胞分析), 448例脑膜瘤(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | CyTOF | 质谱流式细胞术(CyTOF)和单细胞RNA测序技术 |
| 4 | 2025-11-03 |
Use of integrated spatial transcriptomics and histopathological analysis in adamantinomatous craniopharyngiomas to identify stromal cells as a new cellular source of leukemia inhibitory factor
2025-Nov-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2025.4.JNS243146
PMID:40749237
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和组织病理学分析,鉴定牙釉质瘤型颅咽管瘤中基质细胞是白血病抑制因子的新细胞来源 | 首次确认牙釉质瘤型颅咽管瘤中LIF主要来源于肿瘤微环境基质细胞,发现基质细胞是LIF产生的新细胞来源 | 样本量相对有限(39例),需要进一步验证LIF/LIFR信号通路在肿瘤进展中的具体机制 | 研究牙釉质瘤型颅咽管瘤中LIF的空间分布、细胞来源及其生物学功能 | 39例牙釉质瘤型颅咽管瘤患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 免疫荧光分析 | NA | 转录组数据, 图像数据, 临床数据 | 39例ACP肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2025-11-03 |
Endothelial cell-ILC3 crosstalk via the ET-1/EDNRA axis promotes NKp46+ILC3 glycolysis to alleviate intestinal inflammation
2025-Nov, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01345-z
PMID:40931105
|
研究论文 | 本研究首次揭示肠道内皮细胞通过ET-1/EDNRA轴与ILC3细胞互作,促进NKp46+ILC3糖酵解代谢以缓解肠道炎症 | 首次发现肠道内皮细胞与ILC3细胞通过ET-1/EDNRA信号轴进行交流,并阐明该通路通过调控HIF-1α促进糖酵解代谢的分子机制 | NA | 探究肠道内皮细胞与ILC3细胞间的相互作用机制及其在肠道炎症调控中的作用 | 肠道内皮细胞、第3组固有淋巴细胞(ILC3)、NKp46+ILC3亚群 | 免疫学 | 肠道炎症 | 单细胞转录组分析、蛋白表达检测 | NA | 转录组数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-11-03 |
Endothelial βII Spectrin Deletion Exacerbates Inflammation and Impairs Tissue Regeneration in Ischemic-Diabetic Skin Wound Healing
2025 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70103
PMID:41157851
|
研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞βII血影蛋白在糖尿病缺血性皮肤伤口愈合中的作用机制 | 首次发现βII血影蛋白通过调节炎症反应而非血管生成影响糖尿病伤口愈合 | 研究仅使用小鼠模型和HUVECs细胞,尚未在人体组织验证 | 阐明βII血影蛋白在糖尿病伤口愈合中的分子机制 | 糖尿病小鼠模型和人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,组织染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织学图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-11-03 |
Clinical application of single-cell RNA sequencing in disease and therapy
2025-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70512
PMID:41169094
|
综述 | 系统概述单细胞RNA测序技术在疾病机制研究和临床应用中的进展 | 全面阐述scRNA-seq技术在疾病研究和精准医疗中的创新应用,包括AI与机器学习算法的整合 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在疾病研究和治疗中的临床应用 | 人类疾病中的体细胞进化、生物标志物发现和药物开发 | 生物信息学 | 呼吸系统疾病、代谢紊乱、心血管疾病、癌症、自身免疫性疾病、神经退行性疾病、感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2025-11-03 |
Single-Cell Transcriptome Atlas and Dynamic Regulatory Mechanisms of Anther Development in Alfalfa (Medicago sativa L.)
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70276
PMID:40729546
|
研究论文 | 构建了紫花苜蓿花药首个单细胞转录组图谱,揭示了花药发育过程中的细胞类型特异性基因表达和动态调控机制 | 首次构建紫花苜蓿花药单细胞转录组图谱,发现绒毡层在四分体期的快速功能转换,鉴定出MsKIN14P、ERF3和ERF025等关键调控因子 | NA | 解析紫花苜蓿花药发育的单细胞转录景观和动态调控机制 | 紫花苜蓿花药中的各种特化细胞类型,特别是绒毡层和小孢子 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-11-02 |
Parental Specific Expression by scRNA-Seq Reveals HaWRKY40 Contributing to Heterosis of Sunflower
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70266
PMID:41170640
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-11-03 |
Integrated analysis identifies CD276 in fibroblasts as a malignancy predictor and regulator of neutrophil infiltration in hepatoblastoma
2025-Nov-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000826
PMID:41171428
|
研究论文 | 本研究通过整合分析发现成纤维细胞中的CD276是肝母细胞瘤恶性程度的预测因子和中性粒细胞浸润的调节因子 | 首次系统表征CD276在肝母细胞瘤中的表达谱,发现其在癌症相关成纤维细胞中高表达,并揭示其通过调控CXCL2调节中性粒细胞浸润的新机制 | NA | 探究免疫检查点配体CD276在肝母细胞瘤中的临床意义及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 肝母细胞瘤组织和患者样本 | 生物信息学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 多重免疫组织化学, 反卷积分析, 相关性分析 | 逻辑回归模型, 风险评分模型, 列线图 | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 免疫组织化学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-11-03 |
SMAD7-mediated ferroptosis in macrophages drives osteoporosis progression: A multi-omics study
2025-Nov, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.08.021
PMID:40897147
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现SMAD7介导的巨噬细胞铁死亡是骨质疏松进展的关键机制 | 首次揭示SMAD7通过调控巨噬细胞铁死亡驱动骨质疏松的分子机制,并验证SMAD7抑制剂mongersen的治疗潜力 | 研究主要基于细胞系和生物信息学分析,需要更多体内实验验证 | 探索巨噬细胞在骨质疏松发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 骨质疏松患者样本、RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA-seq, scRNA-seq, 生物信息学分析, 免疫组化, micro-CT | 人工神经网络, 机器学习算法 | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-11-03 |
Pancreatic hypersecretion of amyloid-forming human amylin dysregulates the neuro-immune axis and B cell development in a model of type-2 diabetes
2025-Nov, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107153
PMID:41135632
|
研究论文 | 本研究探讨了2型糖尿病中胰腺分泌的淀粉样人胰岛淀粉样多肽如何通过CXCL12/CXCR4信号轴导致外周和神经免疫系统失调 | 首次揭示淀粉样人胰岛淀粉样多肽通过下调脑血管ICAM-1和上调前体B细胞CXCR4表达,导致免疫细胞脑部迁移障碍和B细胞发育缺陷的机制 | 动物模型研究结果需在人类中进一步验证,急性和慢性暴露效应的差异机制尚未完全阐明 | 探究2型糖尿病中胰腺人胰岛淀粉样多肽积累对免疫系统的调控机制 | 转基因大鼠和小鼠模型,以及2型糖尿病患者的单细胞测序数据 | 免疫学 | 2型糖尿病 | 单细胞测序 | 转基因动物模型 | 基因表达数据,免疫细胞计数数据 | 转基因大鼠和小鼠模型,2型糖尿病患者单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-11-03 |
Single-cell transcriptional decoding of iron deficiency responses in maize root tips
2025-Nov-01, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03649-w
PMID:41175233
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了玉米根尖在铁充足和铁缺乏条件下的转录图谱,揭示了细胞类型特异性的铁缺乏响应机制 | 首次在单细胞分辨率下解析玉米根尖对铁缺乏的转录响应,发现皮层功能重编程和分布式调控网络协调铁缺乏响应 | 研究仅关注V3阶段初生根,未涵盖其他发育阶段或根型;功能验证实验有限 | 解析玉米根尖在铁缺乏条件下的细胞类型特异性转录响应机制 | 玉米根尖细胞 | 植物生物学,单细胞转录组学 | 营养缺乏症 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,系统发育分析,加权基因共表达网络分析,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | WGCNA,PPI网络分析 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 15,306个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-11-03 |
Intrinsic changes in cell differentiation and identity drive impaired wound healing in aged female murine skin
2025-Nov-01, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-025-10340-w
PMID:41175301
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了老年雌性小鼠皮肤中细胞内在变化如何导致伤口愈合受损 | 首次在老年雌性小鼠模型中系统描绘了皮肤驻留细胞亚群在衰老过程中的转录组状态变化及其对伤口愈合的影响 | 研究仅限于雌性小鼠模型,且仅观察了伤后3天的时间点 | 阐明衰老过程中细胞内在变化如何影响皮肤伤口愈合的分子机制 | 年轻和老年雌性小鼠的完整皮肤及伤后3天的伤口组织 | 单细胞基因组学 | 皮肤伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年雌性小鼠的皮肤和伤口组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-11-03 |
Single-cell omics for nutrition research: an emerging opportunity for human-centric investigations
2025-Nov-01, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2566387
PMID:41176166
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综述 | 探讨单细胞组学技术在营养研究中的新兴应用及其推动人本营养研究的潜力 | 提出将单细胞组学技术与类器官和器官芯片等先进人类衍生系统相结合,实现生理相关背景下营养-细胞相互作用的机制研究 | 存在技术限制、模型选择困难和机构偏见等关键挑战 | 推进人本营养研究,揭示细胞特异性饮食反应和营养敏感通路 | 营养研究中的细胞类型特异性效应和个体间变异性 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞蛋白质组学、单细胞代谢组学 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 16 | 2025-11-03 |
Hspa8 modulation of immune responses mitigates ischemic brain injury
2025-Nov-01, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00359-x
PMID:41176589
|
研究论文 | 本研究探讨热休克蛋白A8在缺血性脑损伤后调节免疫细胞动态的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序等技术系统揭示Hspa8在调节中性粒细胞浸润和活性氧产生中的关键作用 | 研究主要基于实验模型,临床转化价值仍需进一步验证 | 阐明Hspa8在缺血性脑损伤免疫反应中的调控机制 | 缺血性脑损伤模型中的免疫细胞(T细胞、中性粒细胞、单核细胞) | 神经免疫学 | 缺血性脑损伤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据, 细胞表型数据 | 体外和体内缺血模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-11-03 |
Systematic characterization of full-length RNA isoforms in human colorectal cancer at single-cell resolution
2025-Oct-31, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf049
PMID:40702779
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研究论文 | 通过单细胞长读长RNA测序系统表征人类结直肠癌中的全长RNA亚型 | 首次在单细胞分辨率下使用高深度长读长scRNA-seq技术系统解析结直肠癌全长转录组,揭示不同分子亚型间的选择性剪接调控模式 | 样本量相对有限(12例患者),功能验证实验仍需进一步扩展 | 系统表征结直肠癌中全长RNA亚型的多样性及其在肿瘤发生中的作用 | 结直肠癌患者的结肠上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-11-03 |
Tumor-derived RAC1A159V mutation promotes an immunosuppressive microenvironment that represses response to immune checkpoint inhibitor
2025-Oct-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea1212
PMID:41160695
|
研究论文 | 本研究揭示肿瘤来源的RAC1A159V突变通过激活mTORC1信号通路促进免疫抑制微环境,导致对免疫检查点抑制剂治疗产生抵抗 | 首次证明RAC1突变通过上调糖鞘脂生物合成激活mTORC1信号,进而改变肿瘤代谢和免疫细胞相互作用机制 | 研究主要基于基因编辑小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究RAC1突变如何影响肿瘤免疫微环境及免疫治疗反应 | 携带RAC1突变的肿瘤细胞和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 基因编辑、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-11-03 |
Circulating tumor cells as predictive biomarkers in the risk stratification of DCIS: Evidence of early dissemination
2025-Oct-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz0187
PMID:41160699
|
研究论文 | 本研究探讨循环肿瘤细胞作为DCIS风险分层预测生物标志物的潜力 | 首次在DCIS患者中系统研究CTC作为生物侵袭性指标,并通过单细胞RNA测序揭示早期播散证据 | 样本量较小(34例患者),需要更大规模研究验证 | 改善DCIS患者风险分层,减少过度治疗 | 导管原位癌(DCIS)患者和健康对照 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 微流控技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 34例DCIS患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-11-03 |
Single-cell RNA-seq of small-intestinal neuroendocrine tumors reveals the cell of origin and gene expression of early tumor development
2025-Oct-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116500
PMID:41175375
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小肠神经内分泌肿瘤的细胞起源和早期肿瘤发育的基因表达轨迹 | 首次识别出位于隐窝+4位置及以下的CES1(+)、LCN15(-)肠嗜铬细胞亚群作为SI-NET的推定起源细胞,并发现PRODH2作为前体细胞的关键生物标志物 | 研究主要基于遗传性SI-NET患者样本,可能不适用于散发性病例 | 阐明小肠神经内分泌肿瘤的细胞起源和早期发育机制 | 遗传性小肠神经内分泌肿瘤患者的多发性同步肿瘤和前体病变 | 单细胞组学 | 小肠神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 遗传性SI-NET患者的多发性肿瘤和前体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |