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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-08 |
Integrative single-cell and spatial transcriptome analysis reveals the functions of TREM2high macrophages and infarct border dynamics post-myocardial infarction
2025-Dec, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05317-9
PMID:40750734
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA测序,揭示了心肌梗死后TREM2高表达巨噬细胞的功能和梗死边缘区动态变化 | 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,系统解析心肌梗死后免疫细胞时空动态变化,并发现TREM2高表达巨噬细胞在组织修复中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限;技术方法复杂度高,数据分析存在一定主观性 | 探究心肌梗死后复杂细胞和分子动态变化机制 | 小鼠心肌梗死模型、AC16心肌细胞、THP-1来源的M2巨噬细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序,RT-qPCR,Western blot,免疫组织化学,免疫荧光,流式细胞术 | Milo,Monocle2,CellPhoneDB,NicheNet,SCENIC | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠心肌梗死模型和缺血再灌注模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-11-08 |
Single-cell immune landscape of acute kidney injury after cardiac surgery with cardiopulmonary bypass
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2581506
PMID:41199602
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了心脏手术后急性肾损伤患者的免疫细胞特征变化 | 首次将单细胞RNA测序、流式细胞术和蛋白质微阵列整合应用于心脏手术相关急性肾损伤的前瞻性研究 | 单中心研究且样本量较小(仅4名患者) | 阐明心脏手术后急性肾损伤的免疫细胞特征及其机制 | 接受心脏手术的成年患者 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 蛋白质微阵列 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质微阵列数据 | 4名患者,42,362个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-11-08 |
Tregs With High CD29 Expression Promote Cell Adhesion and Contribute to the Malignant Transformation of MASLD
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70421
PMID:41200753
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研究论文 | 本研究揭示CD29高表达调节性T细胞通过促进细胞粘附驱动代谢功能障碍相关脂肪肝病恶性转化为肝癌的机制 | 首次发现CD29高表达Tregs亚群在MASLD恶性转化中的关键作用,并证实靶向CD29可抑制这一过程 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究调节性T细胞在MASLD向HCC恶性转化过程中的作用机制 | MASLD小鼠模型及其中T淋巴细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外功能实验 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | MASLD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-11-08 |
Elucidating cardiomyocyte state transitions in zebrafish heart development using transcriptome dynamics
2025-Nov-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152736
PMID:41110187
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型分析心脏发育过程中的转录组动态,揭示了心肌细胞状态转变的关键机制 | 首次通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq分析,识别出M5模块在心肌细胞状态转变中的关键作用,并发现smtnl1作为枢纽基因 | 研究仅聚焦于斑马鱼胚胎发育早期阶段(24-48 hpf),未验证在哺乳动物或人类中的保守性 | 阐明心脏发育过程中心肌细胞状态转变的分子机制,为先天性心脏病发病机制提供新见解 | 斑马鱼胚胎心脏发育过程 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 伪时间分析 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎心脏在24、30、36、48 hpf四个时间点的样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-11-08 |
Vascular Niches Are the Primary Hotspots in Cardiac Aging
2025-Nov-07, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327060
PMID:41090219
|
研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了血管微环境是心脏衰老过程中的主要热点区域 | 首次通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术系统识别了11个心脏微环境,并发现血管区域是衰老相关变化的主要发生部位 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类心脏组织中验证 | 探究心脏组织中驱动年龄相关变化的微环境特征 | 3月龄和18月龄小鼠的心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 衰老细胞清除治疗 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 不同年龄阶段的小鼠心脏组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2025-11-08 |
Inflammatory niches as spatial drivers of disease mechanisms and targets for personalized treatment
2025-Nov-07, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70170
PMID:41200832
|
综述 | 本文探讨炎症微空间作为疾病机制的空间驱动因素及其在个性化治疗中的靶向价值 | 整合单细胞测序与空间分析技术揭示疾病特异性炎症机制,提出空间组织化炎症微环境的新范式 | NA | 解析炎症微空间在疾病机制中的作用并推动个性化治疗策略发展 | 免疫细胞与非免疫细胞在组织空间中的相互作用网络 | 空间转录组学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞测序, 空间分析 | NA | 空间分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2025-11-08 |
Distinct Roles of Atf3, Zfp711, and Bcl6b in Early Embryonic Hematopoietic and Endothelial Lineage Specification
2025-Nov-07, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204792
PMID:41200855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析,探讨了Atf3、Zfp711和Bcl6b三个转录因子在早期胚胎造血和内皮谱系特化中的不同作用 | 首次在单细胞分辨率下系统研究这三个相对未被充分研究的转录因子在早期胚胎造血发育中的功能,并揭示了Zfp711对Atf3启动子的结合调控关系 | Bcl6b在造血内皮祖细胞中特异性表达但敲除后对早期造血无显著影响,其具体功能仍需进一步研究 | 解析转录因子在早期胚胎造血和内皮谱系特化中的调控机制 | 小鼠胚胎干细胞体外分化模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多重单细胞RNA测序 |
| 8 | 2025-11-08 |
Biological and Therapeutic Potentials of MXenes in Tumor Microenvironment-Driven Oncology
2025-Nov-07, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00982
PMID:41200882
|
综述 | 探讨MXenes二维纳米材料在肿瘤微环境驱动肿瘤学中的生物学和治疗潜力 | 首次系统阐述MXenes在直接肿瘤消融和肿瘤免疫微环境调控中的双重作用,及其与代谢重编程的关联 | NA | 探索MXenes在精准肿瘤治疗中的应用潜力 | MXenes纳米材料及其在肿瘤治疗中的作用机制 | 纳米医学 | 肿瘤 | 单细胞测序, 高维免疫分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2025-11-08 |
GPC3-based circular RNA vaccine suppresses hepatocellular carcinoma progression by activating adaptive immune responses
2025-Nov-07, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001605
PMID:41201153
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研究论文 | 本研究开发了一种基于GPC3的环状RNA疫苗,通过激活适应性免疫反应抑制肝细胞癌进展 | 首次开发靶向GPC3的环状RNA癌症疫苗,克服传统mRNA疫苗的不稳定性,结合TLR4激动剂增强免疫反应 | 研究目前仅在小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发更稳定有效的癌症疫苗治疗肝细胞癌 | 肝细胞癌小鼠模型 | 癌症免疫治疗 | 肝细胞癌 | 多重免疫荧光,单细胞测序,空间转录组学,质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据,免疫细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-11-08 |
Unraveling the effects and characteristics of proliferating tumor and cytotoxic T cells in colorectal cancer
2025-Nov-07, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2026
PMID:41201451
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研究论文 | 本研究通过多重免疫组化和单细胞RNA测序分析结直肠癌中增殖肿瘤细胞和细胞毒性T细胞的特征及预后意义 | 首次系统揭示肿瘤细胞增殖与更好预后的关联,并发现增殖性细胞毒性T细胞的空间定位会减弱其预后价值差异 | 研究基于回顾性队列,需要前瞻性研究验证 | 探讨结直肠癌中增殖肿瘤细胞和细胞毒性T细胞的特性及预后价值 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化,单细胞RNA测序,数字图像分析 | NA | 图像,基因表达数据 | 1839例患者(两个独立队列),62例结肠癌单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-11-08 |
Integrative SMR and single cell & spatial analysis reveals the spatial heterogeneity and prognostic value of CASP9-mediated apoptotic pathways in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03798-0
PMID:41201629
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析,揭示了CASP9介导的凋亡通路在透明细胞肾细胞癌中的空间异质性及其预后价值 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化方法,系统解析了CASP9介导的凋亡通路在肾透明细胞癌中的空间异质性和预后意义 | NA | 阐明凋亡相关基因程序在肾透明细胞癌中的空间动态、转录异质性及预后相关性 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化分析 | LASSO Cox回归, DeepSurv | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 基因组数据 | TCGA和E-MTAB-1980队列样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2025-11-08 |
Venetoclax plus gilteritinib is effective in preclinical models of FLT3-mutant BCL11B-a lineage-ambiguous leukemia
2025-Nov-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025028985
PMID:40811853
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研究论文 | 本研究评估维奈托克联合吉列替尼在BCL11B-a谱系模糊白血病临床前模型中的疗效 | 首次在BCL11B-a谱系模糊白血病模型中验证BCL-2抑制剂与FLT3抑制剂联合治疗的协同效应 | 研究仅限于临床前模型,尚未进行临床试验验证 | 探索BCL11B-a谱系模糊白血病的靶向治疗策略 | BCL11B-a谱系模糊白血病临床前模型 | 癌症研究 | 白血病 | 单细胞RNA测序,BH3分析 | NA | 基因表达数据 | 多个临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-11-08 |
Functional Role of Granulocytic Myeloid-Derived Suppressor Cells in CAR-T Therapy: Insights from Single-Cell RNA Sequencing in Multiple Myeloma
2025-Nov-06, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2025.2585083
PMID:41198058
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者CAR-T治疗前后的粒细胞样髓源性抑制细胞功能 | 首次在CAR-T治疗背景下系统分析G-MDSCs的免疫抑制机制,并构建基于G-MDSC基因特征的风险预测模型 | 样本量有限且存在患者间异质性,结果应视为探索性和假设生成性质 | 阐明G-MDSCs在多发性骨髓瘤CAR-T治疗中的功能作用机制 | 多发性骨髓瘤患者 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,RNA-seq,功能富集分析,GSEA分析 | 风险预测模型 | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,生存数据 | 7例多发性骨髓瘤患者(单细胞数据),713例多发性骨髓瘤患者(验证队列) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-11-08 |
Molecular profiling of ex vivo prostate cancer CAF models captures stromal heterogeneity and drug vulnerabilities
2025-Nov-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02792-3
PMID:41198614
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研究论文 | 通过对前列腺癌相关成纤维细胞进行多组学分析,揭示其转录异质性和药物敏感性 | 首次对初治前列腺癌患者来源的原代CAFs进行整合性单细胞多组学分析,发现SOX、FOX和STAT3转录因子家族是促肿瘤CAF状态的关键调控因子 | 仅纳入7例初治患者样本,样本量有限 | 探索前列腺癌相关成纤维细胞的表型多样性和可药物靶向弱点 | 7例初治前列腺癌患者来源的原代癌相关成纤维细胞 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,高通量药物敏感性检测 | NA | 单细胞转录组数据,药物反应数据 | 7例初治前列腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-11-08 |
Integration of Single-cell and bulk RNA sequencing data uncovers lymphatic metastasis-related prognostic genes and a predictive model in bladder cancer
2025-Nov-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22803-8
PMID:41198839
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,揭示了膀胱癌淋巴转移相关的预后基因并构建了预测模型 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据识别膀胱癌淋巴转移关键基因亚群,并构建了九基因预后预测模型 | NA | 识别膀胱癌关键预后基因和免疫微环境因子以改善临床评估 | 膀胱癌患者的原发肿瘤和淋巴结转移样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-11-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers molecular features underlying microglial lipid accumulation and depression-related behaviors in high-fat diet mouse model of obesity
2025-Nov-06, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02273-2
PMID:41198848
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示高脂饮食肥胖小鼠模型中微胶质细胞脂质积累的分子特征及其与抑郁相关行为的联系 | 首次在单细胞分辨率下发现高脂饮食诱导的脂滴积累微胶质细胞(LDAM)及其转录特征,并鉴定ACSL1作为关键调控因子 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未探讨性别差异;机制研究主要基于体外实验 | 探索肥胖相关神经精神共病的神经炎症机制 | 高脂饮食诱导的肥胖雄性小鼠脑免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肥胖及相关神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 高脂饮食喂养的雄性小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-11-08 |
Effects of nucleic acid metabolism on prognosis and immune invasion of triple-negative breast cancer
2025-Nov-06, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00366-y
PMID:41198929
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研究论文 | 本研究探讨核酸代谢在三阴性乳腺癌中的预后价值和免疫浸润影响 | 首次发现PDE8B作为致癌基因通过促进上皮间质转化诱导TNBC转移,构建了包含四个核酸代谢相关基因的精准预后预测模型 | 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证预测模型的普适性 | 阐明核酸代谢在三阴性乳腺癌发展中的作用机制及其临床意义 | 三阴性乳腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,体内外实验验证 | 预后预测模型 | RNA测序数据,临床数据 | 297个TNBC样本来自三个数据集 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-11-08 |
Advancements in single-cell sequencing for cervical cancer research
2025-Nov-06, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05407-8
PMID:41199110
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在宫颈癌研究中的最新进展,包括肿瘤异质性、肿瘤微环境动态和分子机制 | 揭示了宫颈癌中HPV驱动的致癌机制、代谢重编程空间组织以及肿瘤微环境中免疫细胞与基质细胞的复杂相互作用 | 临床转化面临耐药机制挑战,缺乏关键靶点抑制剂,需要进一步功能验证 | 推动单细胞测序在宫颈癌精准免疫治疗领域的应用 | 宫颈癌肿瘤微环境中的各类细胞(肿瘤细胞、免疫细胞、基质细胞) | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间多组学 | NA | NA |
| 19 | 2025-11-08 |
TransST: transfer learning embedded spatial factor modeling of spatial transcriptomics data
2025-Nov-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06099-z
PMID:41199193
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研究论文 | 提出一种名为TransST的迁移学习框架,用于提升空间转录组数据的细胞水平异质性推断 | 通过迁移学习自适应地利用外部细胞标记信息来改善空间转录组数据分析 | NA | 提高空间转录组数据中细胞亚群识别和生物标志物检测的准确性和可靠性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组技术 | 迁移学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-11-08 |
Suppression of 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase promotes remyelination in multiple sclerosis
2025-Nov-06, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04351-0
PMID:41199250
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研究论文 | 本研究通过抑制6-丙酮酰四氢蝶呤合酶(PTS)促进多发性硬化症中的髓鞘再生 | 首次发现PTS是少突胶质前体细胞增殖的负调控因子,并揭示其通过胆固醇生物合成通路影响髓鞘再生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化的有效性仍需验证 | 探索多发性硬化症中少突胶质前体细胞功能障碍的分子机制及潜在治疗靶点 | 少突胶质细胞谱系细胞、多发性硬化症患者脑组织切片、条件性基因敲除小鼠 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序、转录组分析、免疫染色、条件性基因敲除 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 | 单细胞测序数据、转录组数据、组织染色图像 | 人类和小鼠少突胶质细胞谱系细胞、MS患者脑切片、条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |