单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-08-06	Multi-omics profiling of acute Pseudomonas aeruginosa pneumonia unmasks conventional NK cell depletion and stage-specific therapeutic targets 2025-12, Virulence IF:5.5Q1 DOI:10.1080/21505594.2025.2490206 PMID:40216004	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了急性铜绿假单胞菌肺炎中常规自然杀伤细胞（cNK）的耗竭及其阶段特异性治疗靶点	揭示了cNK细胞在感染早期阶段的耗竭现象，并提出了针对cNK细胞的免疫治疗概念	研究主要基于小鼠模型，结果在人体中的适用性尚需进一步验证	阐明吸入性铜绿假单胞菌感染后宿主先天免疫反应的特征	铜绿假单胞菌感染的小鼠模型	免疫学	肺炎	RNA测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠感染模型	蛋白质组数据、细胞数据、基因表达数据	未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠模型和公共数据库中的scRNA-seq数据集
2	2025-08-06	Spatial Transcriptomics Unveils Regional Heterogeneity and Subclonal Dynamics in the Lung Adenocarcinoma Microenvironment 2025-Oct, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108929 PMID:40617150	研究论文	本研究利用空间转录组学技术，深入分析了肺腺癌及其微环境的空间功能异质性	通过空间转录组学揭示了肺腺癌微环境中的区域异质性和亚克隆动态，弥补了单细胞转录组学缺乏空间信息的不足	研究仅基于一个空间转录组学样本，样本量较小	探索肺腺癌微环境的空间功能异质性和肿瘤动态	肺腺癌组织及其微环境	数字病理学	肺腺癌	空间转录组学，单细胞转录组学	NA	转录组数据	125,203个单细胞和3,990个空间转录组学spots
3	2025-08-06	Integrative Analysis of Bulk Multiomics and Single-Cell Transcriptomics Elucidates Age-Related Molecular Landscape Alterations in Cervical Cancer 2025-Sep, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1 DOI:10.1245/s10434-025-17464-w PMID:40415156	research paper	通过整合批量多组学和单细胞转录组学数据，研究宫颈癌中与年龄相关的分子景观变化	首次系统地比较了不同年龄段宫颈癌患者的分子特征，包括转录组、免疫微环境、基因组和表观遗传特征，并利用单细胞RNA测序技术鉴定了与年龄相关的上皮细胞亚群	样本量相对有限，尤其是单细胞RNA测序数据仅来自11个样本，可能影响结果的普遍性	探究宫颈癌患者中与年龄相关的分子特征差异，为年龄特异性治疗策略提供依据	307名宫颈癌患者的批量多组学数据和11个宫颈癌样本的单细胞RNA测序数据	digital pathology	cervical cancer	bulk multiomics, scRNA-seq	NA	genomic data, transcriptomic data, epigenetic data	307名患者（TCGA数据集）和11个样本（GEO数据集）
4	2025-08-06	Multi-omics characterization of prognostic signature and novel molecular subtypes associated with anoikis and in vitro validation of CDKN2A in thyroid carcinoma 2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156956 PMID:40527061	研究论文	本研究通过多组学分析甲状腺癌中与失巢凋亡相关的基因特征，并验证了CDKN2A在其中的关键作用	首次建立了甲状腺癌的多组学分子亚型，并提供了失巢凋亡在甲状腺癌中的全面调控框架	研究主要基于TCGA数据库，缺乏外部独立队列验证	探索甲状腺癌中失巢凋亡相关基因的调控机制及其临床意义	甲状腺癌患者	数字病理	甲状腺癌	多组学分析（转录组、甲基化、miRNA）、单细胞测序	风险评分模型、无监督聚类	多组学数据	TCGA数据库中的甲状腺癌患者样本
5	2025-08-06	Glial cell crosstalk in the local microenvironment following spinal cord injury 2025-Sep, Brain research bulletin IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.brainresbull.2025.111436 PMID:40540843	research paper	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了脊髓损伤后局部微环境中胶质细胞的相互作用及其在病理过程中的作用	首次在脊髓损伤微环境中鉴定出三种胶质细胞（小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞）的多个亚型，并揭示了它们之间的复杂互作网络	研究主要基于小鼠模型，人类脊髓损伤中的胶质细胞互作可能有所不同	阐明脊髓损伤后胶质细胞在局部微环境中的互作机制	脊髓损伤后局部微环境中的胶质细胞	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光	NA	单细胞转录组数据、免疫荧光图像数据	未明确说明样本数量（小鼠脊髓损伤模型）
6	2025-08-06	Formononetin enhances cisplatin chemotherapy sensitivity in osteosarcoma by inducing ferroptosis and reconstructing the immune microenvironment 2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156960 PMID:40543234	研究论文	本研究探讨了生物活性化合物芒柄花素通过诱导铁死亡和重建免疫微环境来增强骨肉瘤对顺铂化疗的敏感性	首次证明芒柄花素能通过抑制MAZ/GPX4轴诱导铁死亡，并重构肿瘤免疫微环境来增强骨肉瘤对顺铂的敏感性	研究仅基于PDX模型，尚未进行临床试验验证	探索增强骨肉瘤对顺铂敏感性的新策略	骨肉瘤PDX模型中的肿瘤细胞和免疫微环境	肿瘤学	骨肉瘤	单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序	PDX模型	单细胞测序数据	7216个人源骨肉瘤细胞和89,558个小鼠源细胞
7	2025-08-06	Eriodictyol from Scutellariae Barbata alleviates inflammation and necrosis via ZBP1-dependent signaling in acute pancreatitis 2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156926 PMID:40544733	研究论文	本研究探讨了半枝莲中的圣草酚通过ZBP1依赖的信号通路缓解急性胰腺炎的炎症和坏死	首次揭示了圣草酚作为半枝莲活性成分，通过ZBP1依赖的信号通路缓解急性胰腺炎的炎症和坏死的机制	研究主要基于动物实验和体外细胞实验，临床疗效尚需进一步验证	探究半枝莲及其活性成分圣草酚对急性胰腺炎的治疗作用及其机制	急性胰腺炎模型动物和266-6细胞	药理学	急性胰腺炎	转录组分析、单细胞RNA测序、分子对接、动态分子模拟、细胞热转移实验、药物亲和响应靶标稳定性实验、mtDNA分析	NA	RNA-seq数据、蛋白质相互作用网络数据	未明确说明样本数量
8	2025-08-06	Enhancing Sirt1-mediated deacetylation of p62 with a self-assembling nanopeptide and resveratrol hydrogel to mitigate sepsis-induced inflammation 2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.157047 PMID:40627928	研究论文	本研究探讨了Sirtuin 1 (Sirt1)在调节巨噬细胞线粒体自噬和免疫代谢重塑中的作用，以减轻脓毒症休克相关的炎症	开发了一种自组装纳米肽和resveratrol (Res)复合水凝胶，通过增强Sirt1介导的p62去乙酰化，促进线粒体自噬和免疫代谢重塑，从而减轻脓毒症诱导的炎症	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究Sirt1在脓毒症炎症中的作用机制，并开发新的治疗策略	小鼠脓毒症模型和腹腔巨噬细胞(PMs)	免疫代谢	脓毒症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫染色、透射电子显微镜(TEM)、代谢组学	NA	基因表达数据、代谢组学数据、显微镜图像	小鼠脓毒症模型和腹腔巨噬细胞样本
9	2025-08-06	The role and mechanisms of macrophages in chronic pain: A peripheral-to-central perspective 2025-Sep, Brain research bulletin IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.brainresbull.2025.111470 PMID:40683471	review	本文综述了巨噬细胞在慢性疼痛中的作用机制，从外周至中枢的视角	系统分析了巨噬细胞在外周伤害感受器、背根神经节及中枢神经系统中的不同功能，并提出了未来研究方向	巨噬细胞在许多解剖位置中的具体功能角色尚未充分研究且缺乏系统比较	探讨巨噬细胞在慢性疼痛发生和维持中的作用机制	巨噬细胞在外周伤害感受器、背根神经节(DRG)及中枢神经系统(CNS)中的功能	神经免疫学	慢性疼痛	单细胞转录组学	NA	NA	NA
10	2025-08-06	Selective PPARγ modulator alpinetin restores insulin sensitivity and protects from bone loss in type 2 diabetes 2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.157003 PMID:40570558	研究论文	本研究探讨了天然黄酮类化合物alpinetin作为选择性PPARγ调节剂，在恢复胰岛素敏感性和防止2型糖尿病相关骨丢失方面的作用	首次发现alpinetin可作为选择性PPARγ激动剂，既能改善胰岛素敏感性又能防止骨丢失，相比传统PPARγ激动剂具有更好的安全性	研究主要基于STZ诱导的糖尿病小鼠模型，在人类患者中的效果仍需进一步验证	开发治疗2型糖尿病的新型选择性PPARγ调节剂，同时解决胰岛素抵抗和骨丢失问题	2型糖尿病相关的胰岛素抵抗和骨代谢异常	糖尿病研究	2型糖尿病	分子对接、分子动力学模拟、CETSA、双荧光素酶报告基因检测、单细胞RNA测序、网络药理学	STZ诱导的2型糖尿病小鼠模型	分子相互作用数据、细胞实验数据、动物实验数据、测序数据	体外细胞实验和STZ诱导的T2DM小鼠模型
11	2025-08-06	BCLAF1 restrains stress responses in hematopoietic stem cells to support expansion and repopulation 2025-Aug-12, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024014916 PMID:40435510	研究论文	本研究揭示了BCLAF1在造血干细胞（HSCs）应激反应中的调控作用，支持其在胎儿发育和干细胞移植后的扩增与再殖能力	首次发现BCLAF1通过限制HSCs的应激反应来维持其发育和再殖功能	研究主要基于小鼠模型，人类HSCs中的具体机制尚需进一步验证	探究BCLAF1在HSCs发育和应激反应中的功能	胎儿和成年小鼠的造血干细胞	造血干细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	小鼠基因敲除模型	基因表达数据	NA
12	2025-08-06	Immune-responsive gene 1: The mitochondrial key to Th17 cell pathogenicity in CNS autoimmunity 2025-Aug-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2427052122 PMID:40758870	研究论文	该研究通过RNA-seq分析发现免疫应答基因1（IRG1）在中枢神经系统自身免疫性疾病如多发性硬化症（MS）中起关键作用，并探讨其在致病性Th17细胞调控中的机制	首次揭示了IRG1在调控致病性Th17细胞中的关键作用及其通过NLRP3/IL-1β轴影响巨噬细胞和CD4+ T细胞的机制	研究主要基于动物模型（EAE），尚未在人类MS患者中验证IRG1的功能	探究IRG1在中枢神经系统自身免疫性疾病中的作用机制	致病性Th17细胞、巨噬细胞、CD4+ T细胞	免疫学	多发性硬化症	RNA-seq、单细胞RNA测序、骨髓嵌合体实验	EAE动物模型	基因表达数据	实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）动物模型及基因敲除小鼠
13	2025-08-06	A recurrent de novo damaging variant in EMP2 causes progressive symmetric erythrokeratoderma 2025-Aug-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2509896122 PMID:40758889	研究论文	该研究揭示了EMP2基因中的一个反复出现的从头错义变异与进行性对称性红斑角化病谱系中的孟德尔皮肤病相关	首次发现EMP2基因的特定变异与进行性对称性红斑角化病相关，并通过单细胞空间转录组学揭示了EGFR信号通路的异常激活	研究样本可能有限，且需要进一步验证EMP2变异在其他人群中的普遍性	探究导致进行性对称性红斑角化病的遗传机制	进行性对称性红斑角化病患者及其EMP2基因变异	遗传学	皮肤病	单细胞空间转录组学、Western blotting	NA	基因序列数据、蛋白质表达数据	未明确提及具体样本数量
14	2025-08-06	Cellular senescence in renal ischemia-reperfusion injury 2025-Aug-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000003698 PMID:40625295	综述	本文综述了肾脏缺血再灌注损伤（IRI）中的细胞衰老现象及其在急性肾损伤（AKI）向慢性肾病（CKD）转变中的关键作用	探讨了细胞衰老在IRI-AKI向慢性肾损伤转变中的核心机制，并讨论了针对细胞衰老的新兴疗法，如衰老细胞清除剂和衰老表型调节剂	综述性文章，未涉及具体实验数据或样本分析	阐明细胞衰老在肾脏缺血再灌注损伤中的作用及其治疗潜力	肾脏缺血再灌注损伤（IRI）及其导致的急性肾损伤（AKI）和慢性肾病（CKD）	肾脏病学	肾脏疾病	单细胞测序技术、人工智能辅助药物筛选	NA	NA	NA
15	2025-08-06	Decoding the immune microenvironment of secondary chronic myelomonocytic leukemia due to diffuse large B-cell lymphoma with CD19 CAR-T failure by single-cell RNA-sequencing 2025-Aug-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000003690 PMID:40625291	研究论文	通过单细胞RNA测序技术解码因CD19 CAR-T治疗失败导致的弥漫性大B细胞淋巴瘤继发慢性粒单核细胞白血病的免疫微环境	首次报道了一种罕见的CAR-T治疗后继发慢性粒单核细胞白血病（CMML）病例，并通过单细胞RNA测序揭示了其免疫微环境特征	研究仅基于单个病例，样本量有限	阐明CAR-T治疗后继发肿瘤的免疫微环境特征及其发病机制	CAR-T治疗后继发慢性粒单核细胞白血病患者的骨髓样本	数字病理学	慢性粒单核细胞白血病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	1例患者治疗前后的骨髓样本
16	2025-08-06	The Key to Spinal Cord Recovery: Harnessing p21 Inhibition to Boost Neural Stem/Progenitor Cell Proliferation 2025-Aug-05, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.5c05512 PMID:40712080	research paper	该研究开发了一种基于阳离子脂质体的递送系统，通过抑制p21基因来增强脊髓损伤后神经干/祖细胞的增殖能力	首次利用阳离子脂质体递送p21 siRNA来增强神经干/祖细胞增殖，并证实其能促进脊髓损伤后的功能恢复	研究仅在T9脊髓损伤大鼠模型中进行，尚未进行临床前或临床试验	探索通过调控细胞周期来促进脊髓损伤后神经再生的新方法	神经干/祖细胞(NSPCs)和脊髓损伤大鼠模型	神经再生医学	脊髓损伤	单细胞测序、阳离子脂质体递送系统	动物模型(T9脊髓损伤大鼠)	基因表达数据、功能恢复数据	未明确说明实验动物数量
17	2025-08-06	Prg4+ fibroadipogenic progenitors in muscle are crucial for bone fracture repair 2025-Aug-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2417806122 PMID:40729389	研究论文	本研究揭示了肌肉中Prg4+纤维脂肪生成祖细胞（FAPs）在骨折修复中的关键作用	首次发现并证实了肌肉中的Prg4+ FAPs能够迁移至骨折部位并分化为软骨细胞、成骨细胞和骨细胞，为骨折修复提供新的细胞来源	研究主要基于小鼠模型，在人体中的适用性尚需验证；钻孔骨损伤模型中FAPs的贡献显著低于骨折模型	探究肌肉细胞在骨损伤修复中的作用机制	小鼠肌肉中的Prg4+纤维脂肪生成祖细胞（FAPs）	骨生物学	骨折	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠骨折模型和钻孔骨损伤模型	基因表达数据	NA
18	2025-08-06	Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations 2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-025-02360-2 PMID:40759634	综述	本文综述了癌症干细胞（CSCs）的特性、挑战及新兴治疗策略	总结了单细胞测序、空间转录组学和多组学整合等最新技术在CSC研究中的应用，并探讨了双代谢抑制、合成生物学干预和免疫疗法等新兴治疗策略	缺乏普遍可靠的CSC生物标志物，难以在不影响正常干细胞的情况下靶向CSC	探讨CSC的生物学特性及其在肿瘤治疗中的挑战和前景	癌症干细胞（CSCs）及其与肿瘤微环境的相互作用	肿瘤生物学	癌症	单细胞测序、空间转录组学、多组学整合、CRISPR、AI驱动的多组学分析	3D类器官模型	NA	NA
19	2025-08-06	Single-Cell Multi-Omics Identifies Specialized Cytotoxic and Migratory CD8+ Effector T Cells in Acute Myocarditis 2025-Aug-05, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.125.073836 PMID:40762079	研究论文	本研究通过单细胞多组学技术，识别了急性心肌炎中具有高细胞毒性和迁移潜能的CD57+CD8+效应T细胞，并揭示了其在上游炎症信号中的作用	首次在急性心肌炎中鉴定出具有高细胞毒性和迁移潜能的CD57+CD8+效应T细胞，并揭示了IL-18信号通路在其功能分化中的关键作用	样本量相对较小（40例患者），且主要基于观察性研究，需要进一步验证	探究急性心肌炎（特别是暴发性心肌炎）的免疫发病机制，寻找新的治疗靶点	急性心肌炎患者（40例，其中24例轻度，16例暴发性）和柯萨奇病毒B3诱导的暴发性心肌炎小鼠模型	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、飞行时间质谱流式细胞术、Olink蛋白质组学	NA	单细胞多组学数据	40例患者（24例轻度，16例暴发性）和柯萨奇病毒B3诱导的小鼠模型
20	2025-08-06	β-Sitosterol improves murine ulcerative colitis by inhibiting the expression of ribosomal proteins and the attempted polarization of type 1 macrophages 2025-Aug-05, International journal of colorectal disease IF:2.5Q1 DOI:10.1007/s00384-025-04974-y PMID:40762728	研究论文	本研究探讨了β-谷甾醇通过抑制核糖体蛋白表达和1型巨噬细胞极化来改善小鼠溃疡性结肠炎的作用机制	首次揭示了β-谷甾醇通过调控核糖体信号通路抑制MΦ1巨噬细胞极化的分子机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	探究β-谷甾醇对溃疡性结肠炎的治疗作用及其分子机制	溃疡性结肠炎小鼠模型和RAW264.7来源的巨噬细胞	分子免疫学	溃疡性结肠炎	scRNA-seq, KEGG分析, FCM, ELISA, Western blotting, qRT-PCR	小鼠溃疡性结肠炎模型	基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据	未明确说明小鼠数量，使用RAW264.7细胞系