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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-10 |
The shared mechanisms and potential diagnostic markers for IgA nephropathy and celiac disease
2026-Dec-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2026.2635179
PMID:41714845
|
研究论文 | 整合转录组数据,识别IgA肾病与乳糜泻的共同分子机制及潜在诊断标志物 | 首次通过整合转录组学数据并联合机器学习方法,鉴定出ITGB2、CD74和KLK1作为两种疾病的共享生物标志物,并构建了组合诊断模型(AUC>0.9) | 研究基于公开数据集,缺乏独立临床样本的外部验证,且未探讨标志物在两种疾病中的因果作用 | 探究IgA肾病与乳糜泻共病的共享分子机制及潜在诊断标志物 | IgA肾病和乳糜泻患者的转录组数据及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | IgA肾病, 乳糜泻 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列的转录组数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-06-10 |
Monocytes acquire a tumor-associated IL1B program upon encountering patient-derived colon cancer organoids
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2633012
PMID:41723598
|
研究论文 | 通过单核细胞与患者来源的结肠癌类器官共培养,模拟并分析了单核细胞在结直肠癌微环境中获得肿瘤相关IL1B程序的过程 | 首次利用患者来源的类器官与单核细胞共培养体系,模拟肿瘤细胞与髓系细胞的相互作用,揭示单核细胞获得IL1B程序不依赖肿瘤突变谱或分子亚型 | 共培养体系可能无法完全复刻体内肿瘤微环境的复杂性,且主要关注单核细胞表型变化,缺乏对长期免疫功能的评估 | 探索结直肠癌中单核细胞与肿瘤细胞相互作用的机制及髓系细胞表型异质性的形成线索 | 原发性人单核细胞与微卫星稳定型结直肠癌患者来源的类器官 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 微卫星稳定型结直肠癌患者来源的类器官及健康供体单核细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 平台 |
| 3 | 2026-06-10 |
Aberrant epithelial differentiation may contribute to endometrial polyp formation: insights from single-cell analysis
2026-Dec, Systems biology in reproductive medicine
IF:2.1Q3
DOI:10.1080/19396368.2026.2628916
PMID:41712676
|
研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序分析,揭示子宫内膜息肉中异常上皮分化可能促进息肉形成 | 首次在单细胞水平结合拟时间分析,发现在子宫内膜息肉中存在中期转录停滞和中间上皮状态富集,提示异常上皮成熟与息肉形成相关 | 单细胞RNA测序仅限于增殖期样本,可能限制研究结果的普适性 | 探索子宫内膜息肉与邻近内膜在转录组水平上的差异,特别是单细胞水平的上皮分化机制 | 12名接受宫腔镜息肉切除术女性的配对子宫内膜息肉和邻近内膜样本 | 单细胞组学 | 子宫内膜息肉 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12名患者,分增殖期(9例)和分泌期(3例) | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序,Illumina NovaSeq用于批量RNA测序 |
| 4 | 2026-06-10 |
NPTX2 accelerates cell cycle progression, activates EMT, and regulates glycolytic metabolic pathways to promote clear cell renal cell carcinoma progression
2026-08, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117950
PMID:41956427
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、临床队列分析和功能实验,揭示NPTX2通过加速细胞周期、激活上皮间质转化和调节糖酵解代谢途径促进肾透明细胞癌进展的机制 | 首次阐明NPTX2通过协调细胞周期、上皮间质转化和糖酵解驱动的组蛋白乳酰化修饰(特别是H3K18la)促进肾透明细胞癌进展的多重调控机制,并发现其在肿瘤侵袭前沿与碳酸酐酶IX共定位 | 未说明 | 研究NPTX2在肾透明细胞癌中的功能及其通过细胞周期、上皮间质转化和糖酵解相关表观遗传修饰驱动癌症进展的分子机制 | 肾透明细胞癌细胞系(786-O和Caki-1)、临床组织样本、TCGA-KIRC队列数据 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序、慢病毒介导的基因敲低/过表达、组蛋白乳酰化检测 | NA | 单细胞转录组数据、临床基因表达数据 | TCGA-KIRC临床队列及本实验室收集的肾透明细胞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-06-10 |
The rule of three: structural diversity, differential expression and distinct regulatory output of three MALT paralogues in salmonid fish
2026-Aug, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111397
PMID:42134735
|
研究论文 | 本研究探讨了虹鳟鱼中三个MALT旁系同源基因的结构多样性、差异表达及不同的调控输出 | 首次发现虹鳟鱼拥有三个MALT旁系同源基因,并揭示了它们在不同组织和细胞中的特异性表达模式,以及通过异源过表达系统展示出的功能差异 | 仅使用CHSE-214细胞作为异源系统进行过表达研究,缺乏在生理相关系统中的验证 | 探究虹鳟鱼中三个MALT旁系同源基因的功能差异及其在先天免疫信号调控中的作用 | 虹鳟鱼的MALT1、MALT2和MALT3三个旁系同源基因 | 分子生物学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-06-10 |
Inhibition of endothelial ALOX12 mitigates cerebral ischemia-reperfusion injury by suppressing 12-HETE
2026-07, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析,发现内皮细胞ALOX12衍生的12-HETE在脑缺血再灌注损伤中加剧神经血管损伤,抑制ALOX12具有治疗潜力 | 首次明确内皮细胞是脑缺血再灌注后ALOX12诱导的主要细胞来源,并揭示12-HETE通过破坏紧密连接、激活小胶质细胞和加剧神经元氧化损伤的多细胞机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本量有限,且未深入探讨ALOX12抑制剂的长期疗效和安全性 | 探讨内皮ALOX12-12-HETE信号通路在脑缺血再灌注损伤中的作用,评估ALOX12抑制的潜在治疗价值 | 小鼠短暂性大脑中动脉阻塞模型、OGD/R细胞系统、AIS患者和健康对照者 | 机器学习 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、OGD/R模型、AAV-BR1介导的基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组数据、临床血浆样本数据 | 小鼠模型(具体数量未提及)、倾向评分匹配的AIS患者及健康对照(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-06-10 |
Unraveling the spatial landscape of dystrophinopathies: a transcriptomic approach to Becker and Duchenne muscular dystrophies
2026-Jul, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70067
PMID:42067897
|
研究论文 | 利用空间转录组学揭示贝克型和杜氏肌营养不良症的空间组织景观 | 首次通过Visium空间转录组学对肌营养不良症患者骨骼肌活检样本进行空间分析,结合单核RNA测序数据解构细胞类型比例及空间定位,并识别与脂肪化区域及活性病理区相关的基因和细胞间通讯 | 样本量较小(患者8例、对照4例),且未对发现的基因和细胞互作进行体外或体内功能验证 | 探究肌营养不良症中肌肉脂肪化和纤维化的组织病理学变化及其分子机制 | 肌营养不良症患者(贝克型和杜氏型)及健康对照的骨骼肌活检样本 | 数字病理学 | 杜氏肌营养不良症, 贝克型肌营养不良症 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 解卷积模型 | 转录组数据, 组织图像 | 8例患者(肌营养不良症)和4例健康对照 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium, 10x 单核RNA测序 | 10x Visium空间转录组学平台用于肌肉活检分析,单核RNA测序数据来自先前研究的10x平台 |
| 8 | 2026-06-10 |
GLP-1 Receptors Are Enriched in the Lymphatic Endothelium and Their Pharmacological Activation With Semaglutide Improves the Pumping Capacity of Lymphatic Vessels
2026-Jul, Microcirculation (New York, N.Y. : 1994)
DOI:10.1111/micc.70070
PMID:42231627
|
研究论文 | 发现GLP-1受体富集于淋巴管内皮,其药物激活剂司美格鲁肽可增强淋巴管泵功能 | 首次揭示GLP-1受体在淋巴管系统中的分布及其激动剂对淋巴管收缩功能的直接调节作用 | GLP-1R介导的信号传导机制尚不完全清楚,需进一步研究 | 评估GLP-1受体激动剂对集合淋巴管收缩功能的影响 | 小鼠淋巴管内皮细胞 | 数字病理学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 野生型、饮食诱导肥胖及高胆固醇ApoE KO小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-06-10 |
Integrated Multi-Omics Analysis and Experimental Validation Identify BCAT1 as a Critical Driver of Hepatocyte Pyroptosis in Acute-On-Chronic Liver Failure
2026-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202600199RR
PMID:42258325
|
研究论文 | 通过整合多组学分析和实验验证,发现BCAT1是慢加急性肝衰竭中肝细胞焦亡的关键驱动因子 | 首次揭示BCAT1通过GSDMD/Caspase-1介导的焦亡通路加重肝细胞损伤,提出靶向BCAT1的代谢-炎症轴作为治疗慢加急性肝衰竭的新策略 | 未说明具体局限性 | 识别慢加急性肝衰竭中氨基酸代谢相关生物标志物,为早期诊断和治疗干预提供依据 | 慢加急性肝衰竭患者和APAP诱导的ACLF小鼠模型 | 机器学习 | 慢加急性肝衰竭 | RNA-seq, scRNA-seq | Random Forest, SVM-RFE, Boruta, WGCNA, ssGSEA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-06-10 |
Flowerbed-Inspired Mg-Loaded Scaffold Accelerates Critical-Sized Bone-Defect Repair by Reprogramming the Microenvironment
2026-Jun-09, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c02723
PMID:42204979
|
研究论文 | 受花坛启发的镁负载支架通过重编程微环境加速临界性骨缺损修复 | 设计了一种仿生复合支架,将镁离子负载的海藻酸盐水凝胶嵌入三周期极小曲面多孔Ti6Al4V框架中,模拟承重骨缺损区域稳定的成骨微生态位 | 未提及长期体内稳定性和降解产物对周围组织的影响 | 开发一种能促进临界性骨缺损修复的仿生支架 | 大鼠颅骨临界缺损模型和比格犬股骨髁缺损模型 | 机器学习 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 大鼠和比格犬模型各一组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 11 | 2026-06-10 |
Deep Structure-Enhanced Cell Clustering Model for Single-Cell RNA Sequencing Data
2026-Jun-09, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666261453098
PMID:42261796
|
研究论文 | 提出一种深度结构增强细胞聚类模型(scDSEC),通过融合细胞内部特征和外部结构语义提升单细胞RNA测序数据的聚类性能 | 首次引入外部结构语义增强细胞表示学习,设计分层增强策略融合内外信息 | NA | 解决仅依赖细胞内部特征进行表示学习导致的表示不充分问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、深度聚类 | 深度结构增强网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-06-10 |
Identification of Centrosome Duplication-Related Biomarkers in Hypertrophic Cardiomyopathy Through Integrative Multi-Omics, Single-Cell Transcriptomics, and Experimental Validation
2026-Jun-09, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.047416
PMID:42261922
|
研究论文 | 通过整合多组学、单细胞转录组学和实验验证,鉴定肥厚型心肌病中心体复制相关生物标志物 | 首次结合多组学分析、孟德尔随机化和多种机器学习模型,系统鉴定肥厚型心肌病与心体复制相关基因的关联,并发现VPS8作为连接内体-溶酶体稳态和免疫重塑的关键调控因子 | 未明确说明局限性 | 探索心体复制相关基因在肥厚型心肌病发病机制中的潜在作用,并鉴定生物标志物和治疗靶点 | 肥厚型心肌病患者的心肌细胞及相关基因表达数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型(如加权基因共表达网络分析) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-06-10 |
Impact of ceftiofur administration and Escherichia coli inoculation on the calf fecal microbiome
2026-Jun-09, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00501-26
PMID:42262118
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研究论文 | 本研究结合鸟枪法宏基因组测序和单细胞测序,评估头孢噻呋抗生素治疗对犊牛粪便微生物组多样性和结构的影响 | 首次联合鸟枪法宏基因组学和单细胞测序分析抗生素对犊牛粪便微生物组的重塑,并追踪特定功能基因(如β-内酰胺抗性基因)在不同分类群中的分布 | 文章未明确说明样本量大小及统计功效分析,且实验仅在犊牛中进行,结论向其他物种或场景外推可能受限 | 评估头孢噻呋治疗及大肠杆菌接种对犊牛粪便微生物组组成、多样性及功能基因的影响 | 头孢噻呋治疗组与对照组(仅接种大肠杆菌)的犊牛粪便样本 | 微生物组学 | 抗菌素耐药性 | 鸟枪法宏基因组测序,单细胞测序 | NA | 测序数据 | 未明确说明具体数量,但涉及头孢噻呋治疗组和对照组犊牛在35天内的多次粪便采集 | NA | 鸟枪法宏基因组学,单细胞基因组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-10 |
Development and validation of a cuproptosis-immune prognostic signature for risk stratification and personalized therapy in cutaneous melanoma
2026-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05396-0
PMID:42262432
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研究论文 | 基于铜死亡与免疫相关基因构建皮肤黑色素瘤预后风险特征,用于风险分层和个性化治疗决策 | 首次将铜死亡与免疫相关基因联合分析,构建12基因预后模型,并通过单细胞RNA测序和功能实验验证XCL2基因抑制黑色素瘤细胞增殖、迁移和侵袭的作用 | 研究基于TCGA和GTEx数据库,缺乏独立外部验证队列;功能实验仅针对XCL2基因,其他模型基因的机制有待探索 | 开发并验证一种结合铜死亡与免疫相关基因的预后特征,用于皮肤黑色素瘤的风险分层和个性化治疗 | 皮肤黑色素瘤患者 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 铜死亡相关分析, 免疫相关分析 | Cox回归, LASSO回归, 列线图 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-06-10 |
ST-LDAW: A Topic-Model and Damped Weighted Least-Squares Method for Integrative Deconvolution of Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-Jun-09, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00850-7
PMID:42262653
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2026-06-10 |
Loss of tumor-infiltrating lymphocytes and poor response to immunotherapy in IDH GOF mutant melanoma
2026-Jun-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195384
PMID:41955022
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研究论文 | 研究IDH功能获得性突变黑色素瘤中肿瘤浸润淋巴细胞缺失及对抗PD1免疫治疗反应不佳的机制 | 首次在人类黑色素瘤中描述IDH功能获得性突变与免疫微环境的关系,揭示了IDH突变通过影响DNA甲基化和免疫排斥导致免疫治疗耐受的新机制 | 具体局限性未在摘要中提及,可能需要进一步验证样本量及因果关系 | 探究IDH功能获得性突变对黑色素瘤免疫治疗反应的影响及其分子机制 | IDH功能获得性突变黑色素瘤患者的肿瘤样本及临床数据 | 机器学习, 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, DNA甲基化测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据 | 未明确说明样本数量,涉及临床反应分析、单细胞RNA-seq、批量RNA-seq和DNA甲基化数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-06-10 |
Long-acting IL-7 induces distinct transcriptomic features in peripheral T cells of patients with solid tumors
2026-Jun-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.203629
PMID:42012895
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析,研究长效IL-7对实体瘤患者外周T细胞的转录特征影响 | 首次通过单细胞转录组学揭示长效IL-7诱导实体瘤患者外周T细胞的独特转录状态,并发现二次给药后增殖减弱及远端信号通路下调 | 未提及具体局限性 | 探讨长效重组人IL-7(rhIL-7-hyFc)对晚期实体瘤患者外周T细胞的影响及其分子机制 | 晚期实体瘤患者的外周血T细胞 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞转录组学, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 流式细胞术数据 | 晚期实体瘤患者外周血样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-06-10 |
Dissecting the cellular architecture of breast cancer brain metastases reveals prognostically distinct immune landscapes
2026-Jun-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.03.016
PMID:42049023
|
研究论文 | 对156例乳腺癌脑转移患者的免疫微环境进行多模态分析,揭示了两种与患者生存期延长相关的免疫景观 | 首次通过整合组织细胞术、批量及单核RNA测序、流式细胞术和空间转录组学等多模态方法,系统描绘乳腺癌脑转移的免疫微环境异质性,并识别出两种与生存预后相关的免疫景观,且这些景观无法从配对的原发肿瘤中推导得出 | 未提及明确的局限性 | 探究乳腺癌脑转移的免疫微环境异质性及其对免疫治疗的敏感性 | 156例乳腺癌脑转移患者的组织样本及患者衍生模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单核RNA测序、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、空间转录数据 | 156例临床样本 | 10x Genomics, Illumina | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 19 | 2026-06-10 |
A conserved re-epithelialization program underlies malignancy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jun-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.03.021
PMID:42066759
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研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学,发现一个保守的再上皮化程序MP10,该程序标记胰腺导管腺癌的侵袭性癌细胞,并在PanIN向PDAC进展过程中激活,揭示了一个类似于伤口边缘角质形成细胞再上皮化的程序及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次识别出与伤口愈合再上皮化程序相似的MP10程序在胰腺癌恶性转化中的关键作用,并阐明其与肿瘤抑制基因和FOSL1转录因子的调控关系,以及形成的伤口样循环促进肿瘤侵袭 | 未说明 | 揭示胰腺导管腺癌从PanIN向PDAC进展的分子机制及保守的再上皮化程序 | 胰腺上皮内瘤变和胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 未说明 | 空间转录组数据 | 人类PDAC样本及小鼠模型 | 未说明 | 空间转录组学 | 未说明 | 未说明 |
| 20 | 2026-06-10 |
The architecture of salt tolerance: A multi-scale view of sodium transport in plants
2026-Jun-08, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101888
PMID:42116609
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综述 | 整合古典方法与单细胞RNA测序数据,提供植物钠稳态的多尺度视图,重点分析双子叶与单子叶植物在盐胁迫下的离子调节机制 | 利用公开的单细胞RNA测序数据集生成主要钠转运体SOS1及其钙依赖性调节因子以及高亲和性钾转运体(HKTs)的细胞类型特异性表达谱,揭示双子叶(拟南芥)与单子叶(水稻)在离子调节上的关键差异 | 依赖公开数据集,可能受限于数据质量和物种代表性 | 理解植物如何通过离子感应、膜转运、亚细胞隔离和组织水平分布协调钠离子跨空间域运动以在盐环境中生存 | 植物(拟南芥和水稻) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |