单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 30193 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-31 |
Characterization of stem cell landscape and identification of stemness-related gene ENY2 in colorectal cancer by intergrated transcriptomic analysis
2025-Dec, Global medical genetics
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.gmg.2025.100067
PMID:40735504
|
研究论文 | 通过整合转录组分析，研究结直肠癌中的干细胞景观并鉴定与干性相关的基因ENY2 | 首次通过单细胞转录组数据整合分析，鉴定出ENY2作为结直肠癌干细胞的关键标志物，并探索其在肿瘤发生和转移中的潜在作用 | 研究样本量较小（9个原发性结直肠癌样本），且ENY2在结直肠癌中的具体作用机制仍需进一步实验验证 | 阐明结直肠癌干细胞的异质性及其潜在机制，为开发有效的治疗方法提供依据 | 结直肠癌干细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 9个原发性结直肠癌样本 |
| 2 | 2025-07-31 |
Single-cell transcriptome analysis of in vivo and in vitro human pancreas development
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101573
PMID:40735693
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2025-07-31 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Critical Role of SEC16B in Lung Metastasis of Osteosarcoma
2025-Aug, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00161
PMID:40735296
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了SEC16B在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 发现了一个可能通过下调SEC16B促进肺转移的新细胞亚群，并揭示了肿瘤微环境中成纤维细胞和内皮细胞在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 样本量相对较小，仅包含6个原发骨肉瘤样本、2个肺转移样本和4个正常骨组织样本 | 探究骨肉瘤肺转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺转移组织、正常骨组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qRT-PCR、Transwell实验 | hdWGCNA分析 | RNA测序数据 | 6个原发骨肉瘤样本、2个肺转移样本、4个正常骨组织样本 |
| 4 | 2025-07-31 |
The Critical Role of APOE+ Macrophages in the Immune Microenvironment and Prognosis of Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70731
PMID:40736341
|
研究论文 | 本研究探讨了APOE+巨噬细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的免疫调节功能及其临床意义 | 通过单细胞转录组分析揭示了APOE+巨噬细胞的独特亚群，并开发了一个APOE+巨噬细胞相关风险模型（ARM），在多个公共队列和前瞻性免疫治疗队列中验证了其预测价值 | 研究未涉及APOE+巨噬细胞与其他免疫细胞相互作用的详细机制 | 阐明APOE+巨噬细胞在肺腺癌免疫微环境中的作用，并开发个体化预后评估模型 | 肺腺癌患者和APOE+巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析、CellChat分析、多重免疫荧光分析 | RSF和Ridge结合的机器学习模型 | 转录组数据、突变数据、免疫荧光图像 | 七个公共队列和三个前瞻性免疫治疗队列 |
| 5 | 2025-07-31 |
Immunoregulatory Endothelial Cells Interact With T Cells After Myocardial Infarction
2025-Jul-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326145
PMID:40735785
|
研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后心脏内皮细胞的一种新型免疫调节功能 | 发现了一种短暂出现的免疫调节内皮细胞表型(IMEC)，并阐明了其在心肌梗死后通过细胞因子介导的激活机制以及与T细胞的相互作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚需进一步验证 | 探究心肌梗死后内皮细胞的免疫调节功能 | 心肌梗死后小鼠心脏内皮细胞 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、骨髓移植和谱系追踪实验 | 内皮特异性缺失小鼠模型 | RNA测序数据、空间转录数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠模型 |
| 6 | 2025-07-31 |
Oxidative Stress Links Thyroid Autoimmunity to Cancer: Peroxiredoxin 2 Protection via Genomic and Single-Cell Insights
2025-Jul-30, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785251360744
PMID:40735789
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，识别了桥本甲状腺炎（HT）与甲状腺癌（TC）之间的共享遗传因素 | 首次通过孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和机器学习分类模型，揭示了PRDX2作为HT和TC的关键保护因子及其作用机制 | 样本来源主要基于FinnGen数据库，可能无法代表所有人群 | 探究桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的遗传关联及其分子机制 | 桥本甲状腺炎和甲状腺癌患者 | 基因组学 | 甲状腺癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、机器学习分类模型 | 机器学习分类模型 | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 76,243个甲状腺细胞 |
| 7 | 2025-07-31 |
Comprehensive analysis of cholesterol metabolism-related genes in prostate cancer: integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Jul-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03294-5
PMID:40736630
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建并验证了一个与胆固醇代谢基因相关的预后特征，用于预测前列腺癌患者的预后 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据，构建胆固醇代谢基因相关的预后特征，并探索其生物学、临床和治疗意义 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制 | 构建和验证胆固醇代谢基因相关的预后特征，以预测前列腺癌患者的预后 | 前列腺癌患者 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | TCGA PRAD数据集及三个外部队列 |
| 8 | 2025-07-31 |
Investigation of the mechanism of Xiaoyin Jiedu Yin in the treatment of psoriasis based on bioinformatics, machine learning
2025, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2025.1623449
PMID:40735022
|
研究论文 | 本研究基于生物信息学和机器学习探讨了消银解毒饮治疗银屑病的作用机制 | 首次结合网络药理学、机器学习靶点筛选和单细胞RNA测序技术，揭示了消银解毒饮通过多靶点协同作用治疗银屑病的机制，并鉴定AKR1B10为核心治疗靶点 | 研究主要基于体外细胞模型，缺乏动物模型或临床试验验证 | 探究消银解毒饮治疗银屑病的药理机制 | 银屑病患者皮肤组织样本和IL-17A诱导的HaCaT细胞模型 | 生物信息学 | 银屑病 | 网络药理学、机器学习靶点筛选、scRNA-seq、空间转录组学 | 机器学习 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及银屑病患者皮肤组织和HaCaT细胞系 |
| 9 | 2025-07-31 |
High cGAS-STING expression associates with improved efficacy of neoadjuvant chemo-immunotherapy in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584061
PMID:40735041
|
研究论文 | 本研究探讨了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中cGAS和STING表达与新辅助化疗免疫疗法（NACI）疗效的相关性 | 首次揭示了cGAS和STING表达与NACI疗效的正相关性，并提出了它们作为预测生物标志物的潜力 | 样本量较小（仅38例患者），且为回顾性研究 | 探究cGAS和STING表达与HNSCC患者NACI疗效的关系 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、bulk RNA-seq、scRNA-seq | NA | 基因表达数据、临床数据 | 38例HNSCC患者 |
| 10 | 2025-07-31 |
New insights into liver injury and regeneration from single-cell transcriptomics
2025, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2025-100202
PMID:40735115
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在急性肝损伤（ALI）和肝再生研究中的最新进展及其应用 | 揭示了肝损伤和再生过程中未被识别的细胞亚群，包括胎儿样和迁移性肝细胞、不同激活状态的肝星状细胞以及区域特异性的内皮细胞反应 | NA | 探讨单细胞转录组学在急性肝损伤和肝再生研究中的应用及其潜在治疗靶点 | 肝细胞、肝星状细胞、内皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 急性肝损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11 | 2025-07-31 |
PM2.5 Induces Cell-Specific Transcriptomic Alterations in the Lungs of Juvenile Mice
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S514437
PMID:40735270
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了PM2.5对幼鼠肺部不同细胞类型的转录组影响 | 首次在幼鼠模型中利用scRNA-seq技术揭示了PM2.5对不同肺部细胞类型的特异性转录组改变 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步在人类样本中验证 | 探究PM2.5对儿童肺部健康的细胞特异性影响及其分子机制 | 幼鼠肺部细胞 | 生物医学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), GO和KEGG富集分析, 苏木精-伊红染色 | 幼鼠PM2.5气道暴露模型 | 基因表达数据, 组织病理学图像 | 未明确说明数量的幼鼠肺部样本 |
| 12 | 2025-07-31 |
Disulfidptosis-Related Genes as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525114
PMID:40735269
|
research paper | 该研究通过分析扩张型心肌病（DCM）患者与健康对照中24个二硫键死亡相关基因（DiGs）的表达，构建了预测模型并验证了核心基因的作用 | 首次将二硫键死亡机制与DCM发病联系起来，并鉴定出ACTN4、MYH10、TLN1、DSTN和NCKAP1作为核心预测基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索二硫键死亡相关基因在扩张型心肌病中的作用机制及治疗靶点 | 扩张型心肌病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | SVM | 基因表达数据 | 多个GEO数据集中的DCM患者和健康对照样本 |
| 13 | 2025-07-31 |
Editorial: Single-cell sequencing of the immune microenvironment in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1660831
PMID:40735316
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2025-07-31 |
Targeting the KLF5/PI3K/AKT axis as a therapeutic strategy to overcome neoadjuvant chemoresistance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1593639
PMID:40735324
|
研究论文 | 本研究探讨了KLF5/PI3K/AKT轴作为克服结直肠癌新辅助化疗耐药性的治疗靶点的潜力 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了KLF5在化疗耐药性中的作用，并提出了KLF5/PI3K/AKT轴作为新的治疗靶点 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索克服结直肠癌新辅助化疗耐药性的机制和潜在治疗策略 | 结直肠癌患者样本和动物模型 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、InferCNV、差异表达基因分析、通路富集分析、细胞通讯分析、SCENIC、高通量药物筛选 | 动物模型 | RNA测序数据 | 结直肠癌患者样本(具体数量未提及)和动物模型 |
| 15 | 2025-07-31 |
An integrated approach for analyzing spatially resolved multi-omics datasets from the same tissue section
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1614288
PMID:40735471
|
研究论文 | 本文开发了一种湿实验室和计算框架，用于在同一组织切片上进行空间转录组学（ST）和空间蛋白质组学（SP）的整合分析 | 首次在同一组织切片上整合ST和SP分析，实现了RNA和蛋白质表达的单细胞水平比较 | 未提及样本量是否足够大以覆盖广泛的肿瘤异质性 | 开发一种整合空间多组学数据的方法，以更深入地理解肿瘤-免疫微环境 | 人类肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学（ST）、空间蛋白质组学（SP）、H&E染色 | Weave软件 | 空间多组学数据 | NA |
| 16 | 2025-07-31 |
Collection of Growing Bovine Oocytes and Library Preparation for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4658-8_4
PMID:40736790
|
研究论文 | 本文详细介绍了用于单细胞RNA测序分析的牛生长卵母细胞的收集和文库制备方案 | 提供了针对牛生长卵母细胞的详细scRNA-seq分析方案，有助于识别物种特异性转录特征和发育轨迹 | NA | 研究牛卵母细胞的基因表达和发育过程 | 牛生长卵母细胞 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 17 | 2025-07-30 |
Characteristics and significance of γδ T cells in colorectal cancer
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2532231
PMID:40726078
|
研究论文 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌中的特征及其预后意义 | 首次在两项独立队列中通过多重免疫组化和单细胞RNA测序分析γδ T细胞在结直肠癌中的分布特征及其与患者生存期的关联 | 研究结果在第二队列中的HR置信区间较宽(0.50-1.33)，可能影响统计效力 | 阐明γδ T细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用机制 | 结直肠癌患者组织样本中的γδ T细胞和αβ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 1687例结直肠癌患者(两个队列) + 62例单细胞RNA测序样本 |
| 18 | 2025-07-30 |
Inhibition of FAK promotes pancreatic cancer immunotherapy by mediating CXCL10 secretion to enhance CD8+ T cell infiltration
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2539442
PMID:40726089
|
研究论文 | 本研究探讨了FAK在胰腺癌免疫治疗中的作用及其通过促进CXCL10分泌增强CD8+ T细胞浸润的机制 | 揭示了FAK在胰腺癌免疫抑制微环境中的具体作用及其抑制剂与免疫检查点抑制剂的协同抗肿瘤效应 | FAK在胰腺癌发展和进展中的具体作用及其对肿瘤免疫微环境的调控机制尚未完全阐明 | 探索FAK作为胰腺癌免疫治疗靶点的潜力及其调控肿瘤免疫微环境的机制 | 胰腺癌患者来源的类器官、免疫细胞、小鼠胰腺癌模型及双人源化模型 | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞测序、患者来源类器官(PDO)与免疫细胞的共培养系统 | 小鼠胰腺癌模型、双人源化模型 | 单细胞测序数据、临床标本数据 | 未明确提及具体样本数量，涉及患者来源类器官、小鼠模型及临床标本 |
| 19 | 2025-07-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals altered immune and stromal landscape in primary and liver metastasis of gastric cancer
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102163
PMID:40727437
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胃癌原发灶和肝转移灶中免疫和基质细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上比较了胃癌原发灶和肝转移灶的肿瘤微环境差异，并识别出与肝转移相关的特定细胞类型 | 样本量相对较小（7例GC，5例LM），且为回顾性研究 | 鉴定与胃癌肝转移相关的基质细胞 | 胃癌组织、邻近正常组织、肝转移灶和健康肝组织 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq, RNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 7例GC、2例NT、5例LM和3例HL组织样本，共计107,875个细胞 |
| 20 | 2025-07-30 |
B- and T cell receptor sequencing elucidates characteristics of lymphocyte depletion by ocrelizumab
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113068
PMID:40727939
|
研究论文 | 该研究通过分析B细胞和T细胞受体序列，揭示了ocrelizumab治疗对多发性硬化症患者淋巴细胞耗竭的特征 | 首次在ocrelizumab治疗背景下，对多发性硬化症患者的B细胞和T细胞受体库进行了全面分析，并发现了组织驻留记忆细胞的基因表达特征和初始治疗抵抗现象 | 样本量相对较小，未来需要更大规模的研究验证发现 | 阐明ocrelizumab治疗对多发性硬化症患者适应性免疫系统的影响 | 35名多发性硬化症患者、11名健康供体和14名接受natalizumab治疗的多发性硬化症患者 | 免疫学 | 多发性硬化症 | B细胞和T细胞受体测序、单细胞转录组学 | NA | 序列数据、转录组数据 | 35名MS患者(ocrelizumab治疗组)、11名健康供体、14名MS患者(natalizumab治疗组)、29名供体的脑脊液和血液样本 |