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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-12 |
Construction of ammonia death-related lncRNA prognostic signature model and immunomodulatory effect in glioblastoma multiforme
2026-Jul-01, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2026.150266
PMID:41861940
|
研究论文 | 构建与氨死亡相关的长链非编码RNA预后特征模型并探讨其在胶质母细胞瘤中的免疫调节作用 | 首次探索氨诱导细胞死亡这一区别于凋亡和铁死亡的新机制相关的lncRNA在GBM中的预后价值,并揭示其与代谢-免疫微环境的关联 | NA | 识别与氨死亡相关的lncRNA生物标志物并阐明GBM的代谢-免疫景观 | 胶质母细胞瘤细胞系(U-251、U-87 MG)和正常人星形胶质细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | LASSO-Cox回归 | 基因表达数据 | TCGA和CGGA数据库中的多队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-07-12 |
Sphingomonas paucimobilis-Driven Epithelial-Endothelial Transition in Adenomyosis Pathogenesis
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516652
PMID:41861114
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现鞘氨醇单胞菌驱动腺肌症中的上皮-内皮转化机制 | 首次揭示微生物(鞘氨醇单胞菌)通过TNFα→NF-κB→MMP信号级联诱导上皮-内皮转化,为腺肌症发病机制提供新视角 | 未提及的局限性,如样本量、机制验证的广度或临床转化挑战 | 探索腺肌症的发病机制,特别是微生物驱动的细胞转化 | 腺肌症组织、小鼠模型、细胞培养中的上皮-内皮转化细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序、CSI-Microbes流程、2bRAD-M验证、蛋白质印迹、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、微生物组数据 | 人体组织样本(数量未指定)、小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-12 |
Chemoradiation Reprograms Tumor Cells and the Immune Microenvironment in Cervical Cancer
2026-Apr-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3776
PMID:41860764
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研究论文 | 对宫颈癌患者在放化疗过程中的肿瘤细胞和肿瘤微环境进行了多队列纵向研究,整合RNA测序和单细胞转录组学,揭示了治疗诱导的细胞和分子变化 | 首次通过多队列纵向研究结合RNA测序和单细胞转录组学,系统描绘了放化疗如何重塑宫颈癌肿瘤细胞和免疫微环境,并鉴定出MDM2作为关键治疗靶点 | 研究中提到MDM2抑制的效果仅在HPV阳性、TP53野生型的宫颈癌细胞和临床前模型中验证,可能需要更多临床数据支持 | 探究放化疗对宫颈癌肿瘤细胞和免疫微环境的重新编程机制,寻找治疗抵抗的靶点 | 接受放化疗的宫颈癌患者肿瘤样本及其微环境 | 机器学习 | 宫颈癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞转录组数据 | 多队列纵向研究,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-07-12 |
Spatiotemporal profiling of Fat family genes highlights Fat2 as a novel marker of outer enamel epithelium and stratum intermedium
2026-Apr, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100766
PMID:41862271
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研究论文 | 本研究揭示了Fat基因家族在小鼠牙齿发育过程中的时空表达模式,并发现Fat2可作为外釉上皮和中间层的新的标志物 | 首次系统描绘Fat1-Fat4在小鼠牙齿发育中的时空表达谱,并鉴定Fat2为外釉上皮和中间层的特异性标志物,通过功能实验证实其在牙上皮干细胞分化和细胞身份维持中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚需在人类牙齿发育中验证;Fat2调控下游基因的具体分子机制未完全阐明 | 探究Fat基因家族(Fat1-Fat4)在小鼠牙齿发育过程中的时空表达模式及其功能 | C57BL/6J小鼠胚胎及新生小鼠的牙齿组织;M3H1牙上皮干细胞系 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 定量聚合酶链反应, 原位杂交, 小干扰RNA敲低, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 从胚胎第12.5天到出生的小鼠牙齿样本;M3H1细胞系样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用了公共单细胞RNA-seq数据集 |
| 5 | 2026-07-12 |
Quantifying the fidelity of in vitro human cell culture systems using a biomedical foundation model
2026-Mar-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2520482123
PMID:41860964
|
研究论文 | 利用生物医学基础模型量化体外人肠上皮细胞培养系统的保真度 | 首次提出利用基于单细胞RNA测序数据训练的生物医学基础模型(BMFM-RNA)定量评估体外培养细胞与体内细胞的一致度,为体外细胞培养系统提供标准化基准方法 | 未提及 | 开发一种定量基准测试方法,用于评估体外人类细胞培养系统的保真度 | 人肠上皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生物医学基础模型(BMFM-RNA) | 单细胞RNA测序数据 | 来自患者活检样本及体外培养的人肠上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-07-12 |
Ultra-precision deconvolution of spatial transcriptomics decodes immune heterogeneity and fate-defining programs in tissues
2026-Mar-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70645-3
PMID:41862467
|
研究论文 | 提出超精度空间转录组解卷积算法UCASpatial,揭示组织中的免疫异质性与命运决定程序 | 利用基于熵的权重实现超精度空间转录组解卷积,精准识别低丰度细胞亚群并区分转录异质性群体,发现20q染色体扩增、HERV-H沉默及IL11信号在免疫排斥和纤维化中的新机制 | 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 | 开发高精度空间转录组解卷积算法以解析复杂组织中免疫细胞的空间组织和功能特化 | 人类结直肠癌样本和小鼠伤口愈合模型(C57BL/6) | 空间转录组学、机器学习 | 结直肠癌、伤口愈合相关疾病 | 空间转录组学(空间转录组数据解卷积) | 基于熵加权的解卷积算法(UCASpatial) | 空间转录组数据 | 人类结直肠癌样本和C57BL/6小鼠伤口愈合模型样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-07-12 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
|
research paper | 本研究揭示了组蛋白乳酸化通过正反馈环路调节嘧啶代谢促进口腔癌发生的机制 | 首次发现组蛋白乳酸化(特别是H3K18la)通过激活TK1转录并形成糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin正反馈环路促进口腔癌发生,揭示了表观遗传调控与乳酸驱动的代谢重编程之间的新联系 | 组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的具体作用机制仍需进一步阐明,且研究主要基于体外和动物模型,临床转化尚需验证 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的作用及其分子机制 | 口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织、细胞系及4NQO诱导的舌癌模型 | digital pathology | lung cancer, prostate cancer, cardiovascular disease, geriatric disease | 免疫组化、CUT&Tag、scRNA-seq、ChIP-qPCR、糖酵解抑制剂、基因沉默 | NA | image, text | 研究涉及口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织样本,具体数量未在标题和摘要中说明 | 10x Genomics | scRNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 8 | 2026-07-12 |
Integrated machine learning and multi-omics analysis identifies ALOX5 as a potential therapeutic target for tubulointerstitial inflammation in diabetic kidney disease
2026-Mar-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44445-0
PMID:41857149
|
研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,鉴定ALOX5为糖尿病肾病肾小管间质炎症的潜在治疗靶点 | 首次结合多组学数据、机器学习算法和单细胞测序,系统性鉴定ALOX5在糖尿病肾病肾小管间质炎症中的关键作用,并筛选出天然小分子和厚朴酚作为潜在抑制剂 | 研究主要基于公共数据集和生信分析,缺乏体内外实验验证,且未深入探讨ALOX5抑制剂的临床应用效果 | 识别糖尿病肾病肾小管组织中的关键炎症生物标志物,并阐明其免疫调控机制 | 糖尿病肾病患者的肾小管组织 | 机器学习和多组学分析 | 糖尿病肾病 | 差异表达分析、WGCNA、LASSO、随机森林、单细胞测序拟时序分析、多重免疫组化、分子对接 | LASSO、随机森林 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 多个GEO数据集,具体样本量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2026-07-12 |
Bulliform cells: anatomical, physiological, genetic, and computational perspectives on plants' drought adaptation
2026-Mar-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04984-2
PMID:41857245
|
综述 | 本文从解剖、生理、遗传和计算多维度综合阐述了泡状细胞在植物干旱适应中的作用 | 提出了整合多组学、系统生物学和AI驱动建模的创新框架,以预测泡状细胞行为并优化作物抗旱性 | 关键知识空白仍然存在,特别是在泡状细胞如何响应复合非生物胁迫以及水分保持与叶片热调节之间的生理权衡方面 | 阐明泡状细胞在植物干旱适应中的核心作用,并探索其作为开发抗逆作物品种的潜在靶点 | 泡状细胞 | 机器学习和计算生物学 | 不适用 | 单细胞转录组学、全基因组关联研究、数量性状位点定位、高通量成像、机器学习 | AI驱动模型 | 图像、转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 10 | 2026-07-12 |
TimeVault: A molecular time machine for single cells
2026-Mar-19, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.02.019
PMID:41861790
|
评论 | TimeVault作为一种分子时间机器,使研究者能够在细胞持续分裂和分化时重建过去的转录状态 | TimeVault通过将分子历史保留在完整细胞内,提供了传统单细胞RNA测序(scRNA-seq)的替代方案,传统方法仅捕获终末快照,而TimeVault可追溯细胞历史状态 | 未在摘要中提及具体限制 | 介绍TimeVault方法以重建单细胞过去转录状态 | 单细胞转录状态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-07-12 |
Generation of tetraploid organs in mice
2026-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究结合CRISPR/Cas9、Cre-LoxP系统和囊胚互补技术,成功生成小鼠四倍体肝脏、心脏和胰腺组织 | 首次利用四倍体胚胎干细胞(4-ESCs)通过囊胚互补在哺乳动物体内生成功能完整的四倍体器官,并系统分析了四倍体对发育轨迹的影响 | 四倍体器官的质量和体积显著低于二倍体对照,且四倍体对发育程序的改变可能影响器官功能 | 探索基于四倍体胚胎干细胞的囊胚互补技术用于器官再生的可行性 | 小鼠四倍体肝脏、心脏和胰腺组织 | 数字病理学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期E18.5的小鼠组织样本,具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-07-12 |
Single-cell atlas of Exopalaemon carinicauda gills provides insights into pillar cell-mediated responses to low-salinity stress in crustaceans
2026-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和超微结构表征,定义了对虾鳃中支柱细胞介导的低盐胁迫反应的细胞机制 | 首次整合超微结构表征与单细胞RNA测序,揭示支柱细胞在低盐胁迫下的形态重塑、离子细胞谱系分化和酸性-碱平衡调节机制 | 未涉及其他组织或长期适应过程;单细胞数据可能受限于样本量和测序深度 | 阐明甲壳动物鳃对低盐胁迫适应的细胞机制,特别是支柱细胞的功能角色 | Exopalaemon carinicauda(脊尾白虾)鳃组织 | 单细胞转录组学 | 甲壳动物生理应激 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 11个转录组不同的细胞群,包括支柱细胞和间隔细胞等 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-07-12 |
Alk-Fam150b (augmentor α) expression in the paraventricular nucleus of the mouse hypothalamus at molecular resolution, and its sensitivity to acute stress
2026-Mar, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70159
PMID:41856795
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多重原位杂交,在小鼠下丘脑室旁核中解析了Alk-Fam150b(augmentor α)的分子表达,并揭示了其对应激的敏感性 | 首次在分子水平上证明Fam150b和Alk在小鼠下丘脑室旁核中共同表达,包括促肾上腺皮质激素释放激素神经元,并发现CRH神经元以互斥方式表达Fam150b或Scgn,以及应激诱导的Fam150b表达上调受糖皮质激素反馈调控 | 未明确Fam150b和Alk在室旁核中的功能作用,以及augmentor α-ALK信号在摄食和体重控制应激诱导变化中的具体机制 | 研究Alk-Fam150b(augmentor α)在小鼠下丘脑室旁核中的表达及其对应激的敏感性 | 成年小鼠下丘脑室旁核中的神经元,特别是促肾上腺皮质激素释放激素神经元 | 分子生物学 | 应激相关疾病 | 单细胞RNA测序, 多重原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间表达数据 | 小鼠样品(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-07-12 |
The PKA/MBD2 Axis Transcriptionally Represses INPP5A to Modulate PI3K/Akt Signaling and Accelerate Pituitary Tumorigenesis
2026-Mar, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70817
PMID:41857481
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research paper | 本文研究了INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的抑癌作用及其与PI3K/Akt信号通路和表观遗传调控因子MBD2的相互作用机制 | 首次揭示PKA/MBD2轴通过转录抑制INPP5A进而调控PI3K/Akt信号通路促进垂体肿瘤发生的分子机制 | NA | 探究INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的调控作用及其分子机制 | 垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs)样本及细胞系 | machine learning | pituitary neuroendocrine tumors(垂体神经内分泌肿瘤) | single-cell sequencing(单细胞测序),免疫荧光染色 | NA | gene expression data(基因表达数据) | 62例PitNETs患者样本 | NA | single-cell RNA-seq(单细胞RNA测序) | NA | NA |
| 15 | 2026-07-12 |
Prior-guided factorization for reliable imputation of scRNA-seq data
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014051
PMID:41860953
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研究论文 | 提出一种基于先验知识引导的因子分解方法用于单细胞RNA测序数据的可靠填补 | 提出scZN框架,将数据观测建模为RNA两态转录过程与dropout的联合作用,利用非负矩阵分解、先验知识约束和多重正则化,实现可解释的缺失值填补和表达重建 | 论文未明确提及局限性 | 解决scRNA-seq数据中dropout噪声与生物真实零表达的区分问题,提升数据填补的准确性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达矩阵 | 多个真实数据集,包括胚胎干细胞、小鼠齿状回和海马体数据,以及阿尔茨海默病数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-07-12 |
A single-cell immune atlas of primary and secondary lymphoid organs in pigs
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1704257
PMID:41859083
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建猪初级和次级淋巴器官的免疫细胞图谱 | 首次创建涵盖猪多种淋巴组织(骨髓、胸腺、淋巴结和脾脏)的单细胞免疫图谱,识别出新的胸腺细胞群体,并揭示猪与人之间保守的先天淋巴样细胞亚群 | 未明确提及局限性,但可能包括样本量有限或仅覆盖关键淋巴器官 | 利用单细胞RNA测序构建猪淋巴器官免疫细胞图谱,以促进农业和生物医学研究 | 猪的初级淋巴器官(骨髓、胸腺)和次级淋巴器官(淋巴结、脾脏)中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 多个猪淋巴组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 17 | 2026-07-12 |
Integrated spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing reveal Lars2-mediated spatiotemporal dynamics of myocardial remodeling in a mouse model of transverse aortic constriction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1701776
PMID:41859105
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研究论文 | 整合空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示小鼠主动脉缩窄模型中Lars2介导的心肌重塑时空动态变化 | 首次利用空间转录组学与单细胞RNA测序的整合分析,高分辨率解析压力超负荷诱导心肌肥厚过程中细胞组成和基因表达的时空动态变化,并鉴定Lars2为疾病进展相关基因 | NA | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序,全面表征压力超负荷诱导心肌重塑的细胞与空间动态变化 | 小鼠心脏组织,取自主动脉缩窄模型的不同疾病阶段(TAC-2w、TAC-4w、TAC-6w) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据(空间转录组和单细胞RNA测序数据) | 不同疾病阶段的小鼠心脏组织样本(TAC-2w、TAC-4w、TAC-6w) | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-07-12 |
Quantitative profiling of lifespan-dependent cell-cell communication potential reveals dynamic ligand-receptor network shifts across mouse tissues
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0345045
PMID:41860844
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据推断小鼠四个器官(肝脏、肺、心脏和肾脏)中跨生命周期的细胞间通信动态变化,并开发了一种量化框架来捕捉配体-受体相互作用的变化 | 开发了Shrink and Expand (SE) 评分来量化两个生物学状态之间推断的配体-受体相互作用集的定向变化,并构建了跨器官和生命周期的配体-受体对变化数据集 | 该研究基于转录组推断而非蛋白质水平验证,可能存在假阳性或假阴性结果,且未涵盖所有潜在细胞类型 | 研究细胞间通信随年龄变化的动态模式,并开发可量化的比较方法 | 小鼠的肝脏、肺、心脏和肾脏组织 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠四个器官(肝脏、肺、心脏和肾脏),涵盖产后发育、成年和衰老三个阶段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-07-10 |
Integrated multi-omics analysis identifies prognostic risk genes and constructs a predictive signature in diffuse large B-cell lymphoma
2026-Dec-31, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2026.2700818
PMID:42420780
|
研究论文 | 通过整合多组学分析识别弥漫性大B细胞淋巴瘤的预后风险基因并构建预测模型 | 首次结合eQTL-MR分析、单细胞RNA测序和免疫浸润分析,系统鉴定出15个与DLBCL发病和预后相关的风险基因并构建预测模型 | 未说明具体局限性 | 探索弥漫性大B细胞淋巴瘤的潜在致病基因并构建预后预测模型 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者 | 计算机视觉 | 淋巴瘤 | eQTL-MR分析, 单细胞RNA测序, GO/KEGG富集分析, 免疫浸润分析, 药物敏感性分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-07-10 |
POU2F2 as a dual oncogenic and immunomodulatory driver in kidney renal clear cell carcinoma
2026-Dec, Cell adhesion & migration
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/19336918.2026.2700062
PMID:42421306
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研究论文 | 探讨POU2F2在肾透明细胞癌中的致癌和免疫调节作用 | 首次揭示POU2F2在肾透明细胞癌中兼具致癌和免疫调节双重功能,特别是通过影响巨噬细胞极化来调控肿瘤微环境 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本量未提及 | 研究转录因子POU2F2在肾透明细胞癌发生发展及肿瘤微环境免疫调节中的作用 | 肾透明细胞癌细胞系及肿瘤样本 | 自然语言处理 | 肾透明细胞癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、共培养实验 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |