单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 40810 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-23 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomic data to construct a risk model for histidine metabolism-related epithelial cell features in lung adenocarcinoma, predicting prognosis and immune landscape
2026-Dec-31, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2662721
PMID:42003422
|
研究论文 | 整合批量与单细胞转录组数据构建肺腺癌组氨酸代谢相关上皮细胞特征的风险模型，预测预后和免疫景观 | 首次通过整合批量与单细胞RNA测序数据，鉴定了组氨酸代谢相关上皮细胞特异性预后基因，并构建了稳健的风险模型，揭示了上皮细胞在肺腺癌组氨酸代谢中的关键调控作用 | 摘要中未提及研究的局限性 | 探究组氨酸代谢在肺腺癌发病机制中的作用，并构建基于上皮细胞特征的预后风险模型 | 肺腺癌患者 | 自然语言处理 | 肺癌 | RNA-seq | Cox比例风险模型, LASSO回归 | 转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-06-23 |
Spatial transcriptomics unveils immune cellular ecosystems associated with patient survival in diffuse large B-cell lymphoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2660418
PMID:42010788
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示弥漫大B细胞淋巴瘤中与患者生存相关的免疫细胞生态系统 | 首次在DLBCL中识别出六种基于空间组织的细胞生态系统（Cell-Eco），揭示了免疫细胞丰度相似但功能状态和临床关联相反的生态系统，强调空间背景和局部相互作用对免疫功能的影响，而非仅细胞类型频率 | 初步研究规模较小，需更大样本验证；蛋白水平验证仅针对关键细胞特征 | 阐明DLBCL肿瘤微环境中恶性细胞与免疫细胞的空间组织及其对免疫功能和临床结局的影响 | 弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）原发组织切片 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 超过1000例DLBCL病例（来自大型独立队列） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-06-23 |
Corrigendum to "A palmitoylation-related prognostic risk scoring model and tumor microenvironment characterization in lung adenocarcinoma, using single-cell RNA sequencing data" [Comput. Biol. Chem. 123 (2026) 109054]
2026-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2026-06-23 |
8-Chloroadenosine suppresses hepatocellular carcinoma progression via ADAR1/PPARγ axis-mediated lipid metabolism
2026-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101874
PMID:42327978
|
研究论文 | 8-氯腺苷通过ADAR1/PPARγ轴调节脂质代谢抑制肝细胞癌进展 | 首次揭示ADAR1通过直接结合mRNA调控脂质代谢促进肝癌进展，并发现8-氯腺苷通过抑制ADAR1及后续PPARγ介导的脂质代谢过程抑制肝癌发生发展 | 现有关于肝癌脂质代谢分子调控网络的知识仍不完整 | 揭示ADAR1在肝癌进展中的作用及其通过脂质代谢调控的机制，并探索8-氯腺苷的治疗潜力 | 肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 多组学方法，包括单细胞测序数据库、临床样本分析和细胞模型 | NA | 转录组数据 | 使用公开单细胞测序数据库中的样本，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基于公开单细胞测序数据库的数据分析 |
| 5 | 2026-06-23 |
Experimental upregulation of Lancl1 promotes axon regeneration after optic nerve injury in vivo
2026-Aug, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115789
PMID:42002019
|
研究论文 | 通过实验上调Lancl1表达促进视神经损伤后轴突再生 | 首次发现Lancl1作为新的轴突再生促进因子，在体内通过上调表达直接修复受损中枢神经系统轴突，且不依赖mTOR通路 | 未阐明Lancl1促进轴突再生的下游分子机制，且需进一步验证其在不同中枢神经系统损伤模型中的治疗潜力 | 探究Lancl1是否能在体内直接促进中枢神经系统损伤后轴突再生 | 小鼠视网膜神经节细胞（RGCs）及其轴突 | 计算机视觉 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、功能增益实验、AAV2介导的基因递送 | NA | 单细胞转录组数据 | 具体样本量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 6 | 2026-06-23 |
Cucurbitacin B targets PPAT to suppress de novo purine biosynthesis in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158362
PMID:42259163
|
研究论文 | 本研究揭示葫芦素B通过靶向PPAT抑制食管鳞状细胞癌中嘌呤从头合成通路，从而抑制肿瘤生长并增强放疗效果 | 首次发现PPAT是食管鳞癌发展的关键调控因子，并揭示天然化合物葫芦素B通过TRIM38介导的多聚泛素化降解PPAT，同时证明其放疗增敏作用 | 未提及具体局限性 | 阐明PPAT在食管鳞癌进展中的作用及PPAT靶向干预的潜在治疗价值 | 食管鳞状细胞癌细胞及小鼠模型 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、结构虚拟筛选、蛋白质印迹、泛素化分析 | NA | 基因表达数据、代谢数据 | 体内外实验涉及食管鳞癌细胞系及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 7 | 2026-06-23 |
Dihydrotanshinone I inhibits PHGDH to suppress serine synthesis and remodel TME in NSCLC
2026-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158366
PMID:42263544
|
研究论文 | 本研究鉴定出二氢丹参酮I（DHT I）作为一种新型PHGDH抑制剂，通过抑制丝氨酸合成通路并重塑肿瘤微环境，增强非小细胞肺癌免疫治疗效果 | 首次从天然产物中筛选出靶向PHGDH的抑制剂DHT I，阐明其通过阻断PRMT1介导的PHGDH甲基化而抑制酶活性的新机制，并揭示DHT I调控组蛋白修饰和巨噬细胞极化的免疫微环境重塑作用 | 天然产物来源的PHGDH抑制剂尚未获批临床应用，其抗肿瘤药理机制的精确分子细节有待进一步阐明 | 从天然产物中鉴定PHGDH抑制剂并阐明其抗肿瘤药理机制 | 非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系及小鼠模型 | 计算机视觉 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序、分子对接模拟、细胞热位移分析、药物亲和反应靶标稳定性、微量热泳动、免疫共沉淀、蛋白质印迹、代谢组学分析、定量实时PCR、酶联免疫吸附试验 | NA | 基因表达数据、代谢组学数据、单细胞转录组数据 | 公共数据库中的人类非小细胞肺癌患者样本；小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 8 | 2026-06-23 |
Licochalcone B alleviates pulmonary vascular remodeling via inhibiting Furin/TGF-β1 in pulmonary hypertension
2026-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158373
PMID:42263545
|
研究论文 | 该研究揭示了Furin在肺动脉高压（PH）相关肺血管重塑中的关键作用，并发现甘草查尔酮B（LicoB）通过抑制Furin/TGF-β1信号轴缓解血管重塑 | 首次发现Furin在PH发病机制中的驱动作用并鉴定其新型抑制剂LicoB | 仅基于动物模型和体外实验，缺乏临床患者数据验证 | 探究Furin在PH相关血管重塑中的作用并评估LicoB的治疗潜力 | 肺动脉高压动物模型（小鼠、大鼠）及肺动脉血管细胞 | 机器学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多种PH动物模型（小鼠和大鼠）及体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-06-23 |
Cepharanthine triggers immunogenic cell death in solid tumors by suppressing protein kinase C zeta-mediated poly(ADP-ribose) polymerase 1 expression and synergizes with immunotherapy
2026-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158350
PMID:42287818
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研究论文 | 本研究探讨了千金藤素在多种实体瘤中诱导免疫原性细胞死亡的能力，并阐明其通过抑制蛋白激酶Cζ介导的PARP1表达实现促免疫原性及与免疫治疗协同作用的机制 | 首次发现天然生物碱千金藤素通过靶向PKCζ/NF-κB/PARP1轴诱导免疫原性细胞死亡，并与PD-1阻断和OX40激动剂协同增强抗肿瘤疗效 | 主要为临床前研究，尚需进一步临床试验验证其安全性和有效性 | 探索千金藤素作为免疫原性细胞死亡诱导剂的潜力及其与免疫治疗的协同作用 | 多种实体瘤模型（乳腺癌、结直肠癌、食管癌、肝癌、肺癌） | 机器学习 | 肺癌, 肝癌, 结直肠癌, 乳腺癌 | 流式细胞术, 蛋白免疫印迹, 免疫荧光, ATP定量, 细胞热移位实验, 表面等离子共振, 批量与单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 同源小鼠肿瘤模型及患者来源类器官系统 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-06-23 |
Intracellular microbial shifts during COVID-19 infection and longitudinal recovery revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Jul-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116344
PMID:42325555
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示COVID-19感染期间及长期康复过程中细胞内微生物群的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术，深入探究SARS-CoV-2奥密克戎变异株感染和康复期间免疫细胞内微生物群落的动态变化，并揭示其与长期COVID病理生理学的潜在关联 | 未明确说明，推测可能包括样本量有限、微生物检测方法的灵敏度限制、以及缺乏功能验证实验 | 探究SARS-CoV-2奥密克戎变异株感染和康复期间宿主-微生物动态变化，特别是免疫细胞中细胞内微生物群落的作用 | 57名个体的191,417个外周血单核细胞，包括健康对照、急性感染期、近期康复和长期康复者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 57名个体，包括9名健康对照、24名奥密克戎感染患者、16名近期康复者和8名长期康复者 | BD Biosciences | 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统，用于外周血单核细胞的单细胞RNA测序 |
| 11 | 2026-06-23 |
SOX4 is a transcriptional activator for CTHRC1 in lung fibroblast activation
2026-Jul-10, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150171
PMID:41997467
|
研究论文 | 研究发现SOX4是肺成纤维细胞激活中CTHRC1的转录激活因子 | 首次揭示SOX4直接结合CTHRC1启动子并激活其转录，确认SOX4-CTHRC1调控轴在肺成纤维细胞激活中的作用 | 未明确说明研究局限性 | 探究CTHRC1在肺成纤维细胞激活中的转录调控机制 | 肺纤维化中的成纤维细胞 | 机器学习 | 肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个公开数据集（GSE124685、GSE169500、GSE135893）及TGFβ1诱导的MRC5成纤维细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-06-23 |
Deciphering MFAP5+ Fibroblasts in Pancreatic Cancer Progression via Multi-Regional Single-Cell RNA Sequencing With Experimental Validation
2026-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70114
PMID:41995689
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研究论文 | 通过多区域单细胞RNA测序和实验验证，解析MFAP5+成纤维细胞在胰腺癌进展中的作用 | 首次利用多区域单细胞RNA测序技术，系统解析MFAP5+成纤维细胞在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的功能、空间分布和通讯动态，并发现MFAP5+成纤维细胞与内皮细胞之间的促肿瘤轴 | 研究主要基于有限的样本和多区域采样，尚未在大样本队列中验证MFAP5+成纤维细胞与内皮细胞轴的临床相关性 | 探究MFAP5+成纤维细胞在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中对肿瘤进展的调控机制 | 胰腺导管腺癌肿瘤组织中的MFAP5+成纤维细胞、FABP4+血管内皮细胞、VWF+血管内皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、拟时间分析 | NA | 单细胞转录组数据、多重免疫荧光图像 | 59829个细胞，来自多区域采样（GSE285264）及公开数据集（GSE277782、GSE155698、GSE212966） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 13 | 2026-06-23 |
Single-cell transcriptomic atlas of shrimp hepatopancreas reveals an endoplasmic reticulum stress-dependent immune response to Vibrio parahaemolyticus infection
2026-Jul, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111364
PMID:42000089
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研究论文 | 通过对南美白对虾肝胰腺进行单细胞核测序，揭示了副溶血弧菌感染下内质网应激依赖的免疫应答机制 | 首次构建了甲壳类动物肝胰腺在细菌感染下的单细胞转录组图谱，并发现内质网应激是免疫应答的关键调控通路 | 研究仅使用snRNA-Seq分析，可能遗漏某些细胞类型的转录信息，且未进行功能验证实验 | 解析甲壳类动物在细菌感染时的免疫应答分子机制 | 凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）肝胰腺细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞核测序（snRNA-Seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 20000个以上高质量细胞（包含B、F、E、M和R五类细胞） | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-23 |
Decoupling lactylation-associated metabolic remodelling in Asthma: Integrated multi-omics and machine learning identify RCC2 as a potential therapeutic target
2026-Jul, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2026.109371
PMID:42000636
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研究论文 | 通过整合多组学和机器学习，揭示哮喘中乳酸化相关代谢重塑，并识别RCC2为潜在治疗靶点 | 首次构建可解释的乳酸代谢生物标志物诊断框架，整合批量转录组和单细胞RNA测序数据，系统描绘哮喘中乳酸/组蛋白乳酸化相关的代谢状态，并识别RCC2作为连接糖酵解与表观遗传重塑的候选调控枢纽 | 机制研究仅在体外细胞模型中验证，缺乏体内和临床队列的进一步验证 | 绘制哮喘气道细胞谱系中乳酸/组蛋白乳酸化相关的代谢状态，并开发可解释的乳酸代谢生物标志物诊断框架 | 哮喘患者的气道细胞，包括巨噬细胞和上皮细胞 | 机器学习和数字病理学 | 哮喘 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、siRNA敲降、乳酸定量、组蛋白乳酸化免疫荧光、非靶向液相色谱-质谱代谢组学 | 高斯混合模型引导的逻辑回归分类器 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 训练集GSE63142（未指定具体样本数），验证集GSE43696（未指定具体样本数），单细胞RNA测序数据集GSE193816（未指定具体样本数），尘螨刺激的16HBE细胞系 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-23 |
Curcumin modulates the function of SPP1+ macrophages via NF-κB signaling to alleviate endometriosis
2026-Jul-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116644
PMID:42001649
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建子宫内膜异位病灶单细胞图谱，发现SPP1+巨噬细胞是关键的致病细胞亚群，并阐明姜黄素通过调控NF-κB信号通路缓解疾病的分子机制 | 首次通过单细胞图谱鉴定SPP1+巨噬细胞为子宫内膜异位症的关键致病亚群，并揭示其通过NF-κB通路促炎重编程及介导旁分泌串扰的机制，同时提出姜黄素靶向该信号轴的新治疗机制 | NA | 探索子宫内膜异位症的关键致病细胞亚群及其分子机制，并评估姜黄素的治疗作用 | 子宫内膜异位病灶中的巨噬细胞、基质细胞、上皮细胞及动物模型中的异位病灶组织 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序、多组学分析、细胞通讯分析、功能验证、动物实验 | NA | 单细胞转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-06-23 |
Comprehensive Multi-Omics Profiling of Tertiary Lymphoid Structures Reveals Immunogenetic Landscapes and Prognostic Subtypes in Lung Adenocarcinoma
2026-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70120
PMID:42070266
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研究论文 | 通过对三级淋巴结构的综合多组学分析，揭示了肺腺癌的免疫遗传学景观和预后亚型 | 首次通过整合多组学策略构建了与三级淋巴结构相关的预后模型，并利用孟德尔随机化鉴定具有遗传支持的TLS相关基因 | 未明确提及 | 构建三级淋巴结构相关的预后模型并阐明相关的免疫遗传机制 | 肺腺癌患者及细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 逆转录定量聚合酶链反应, 孟德尔随机化 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本总数 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-06-23 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and RNA-Seq Revealed the Role of Programmed Cell Death-Related Genes in the Prognosis of Glioblastoma Patients
2026-Jul, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05687-w
PMID:42008052
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2026-06-23 |
Exploration of the Key Mechanism by Which Kaempferol Inhibits Glycolysis in Hepatocellular Carcinoma Cells via the AKT-mTOR Pathway
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202600141RR
PMID:42322592
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研究论文 | 探究山奈酚通过AKT-mTOR通路抑制肝细胞癌糖酵解的关键机制 | 首次结合转录组学、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示山奈酚通过靶向AKT-mTOR通路下调CA9基因表达来调控糖酵解，从而抑制肝细胞癌进展 | 未明确说明山奈酚在体内模型中的效果及长期安全性 | 阐明山奈酚抑制肝细胞癌细胞糖酵解的分子机制 | 肝细胞癌MHCC97H和Huh7细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, Western blot, 分光光度法 | NA | 转录组数据 | 两种肝细胞癌细胞系（MHCC97H和Huh7） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-06-23 |
TCF7L2 promotes abdominal aortic aneurysm through smooth muscle cell-mediated extracellular matrix remodeling
2026-Jun-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195681
PMID:42060473
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研究论文 | 研究转录因子7类似物2（TCF7L2）在腹主动脉瘤发病机制中的作用，通过平滑肌细胞介导的细胞外基质重塑促进动脉瘤形成 | 首次整合汇总数据孟德尔随机化与单细胞RNA测序，确定TCF7L2在血管平滑肌细胞中富集并与腹主动脉瘤有因果关系，并揭示了其通过调节MMP14、TIMP3和ITGB1表达驱动细胞外基质重塑的新机制 | 未明确提及，但可能包括仅在动物模型中验证和缺乏直接人体干预数据 | 阐明TCF7L2在腹主动脉瘤发病中的角色和机制，探索潜在治疗靶点 | 人及小鼠主动脉组织、血管平滑肌细胞 | 机器学习 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、汇总数据孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据、文本 | 三个不同的腹主动脉瘤小鼠模型（血管紧张素II输注、β-氨基丙腈/血管紧张素II联合给药及弹性蛋白酶诱导） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-06-23 |
SpaVGMC: A Unified Representation Learning Framework via Structural and Semantic Alignment in Spatial Transcriptomics
2026-Jun-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c01121
PMID:42253102
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研究论文 | 提出SpaVGMC，一种通过结构和语义对齐进行统一表示学习的空间转录组学框架 | 首次将结构化变分表示学习、结构信息对齐和语义对齐统一在一个框架中，同时建模局部空间依赖和全局转录组织结构，无需数据增强即可实现分布感知的对比学习 | 未明确提及局限性 | 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性，解决局部过度平滑、拓扑保真度受损和全局语义结构建模不足的问题 | 空间转录组学数据集中的组织切片及空间域 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 结构化变分自编码器、图神经网络、对比学习模型 | 空间基因表达数据 | 多个空间转录组学数据集（具体数量未提供） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |