单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28825 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-06-17 |
Roles of central nervous system resident and recruited macrophages in the brain barrier system
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00986
PMID:39885670
|
综述 | 本文综述了大脑屏障系统中巨噬细胞的起源、发育、重要分子及其功能，重点关注小胶质细胞和边界相关巨噬细胞 | 强调了单细胞测序技术和重要细胞标志物的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证研究支持 | 探讨大脑屏障系统中巨噬细胞的作用及其在神经免疫学中的意义 | 大脑屏障系统中的巨噬细胞，包括小胶质细胞、边界相关巨噬细胞和招募的巨噬细胞 | 神经免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-06-17 |
Molecular mechanisms after optic nerve injury: Neurorepair strategies from a transcriptomic perspective
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00794
PMID:40313107
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综述 | 本文综述了视神经损伤后的分子机制，并从转录组学角度探讨了神经修复策略 | 利用单细胞转录组学技术揭示了视神经损伤和青光眼模型中视网膜神经节细胞的分子机制，并鉴定了与神经保护和轴突再生相关的基因 | 未来研究需要整合先进的单细胞测序与多组学方法，以更全面地理解视网膜神经节细胞损伤和再生的细胞特异性反应 | 探讨视神经损伤后的分子机制及神经修复策略 | 视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、转录组分析、芯片分析、CRISPR-Cas9筛选、ATAC-seq分析 | 视神经挤压模型和青光眼模型 | 转录组数据 | NA |
| 3 | 2025-06-17 |
Data-informed insights into sex differences in peripheral blood mononuclear cells from single-cell transcriptomics
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101525
PMID:40520998
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2025-06-17 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals epithelial cell alterations in benign prostatic hyperplasia following finasteride treatment
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101526
PMID:40520997
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-06-17 |
Astrocytic AEG-1 drives neuroinflammation and enhances seizure susceptibility
2025-Aug, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106957
PMID:40383165
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研究论文 | 本研究探讨了星形胶质细胞中AEG-1基因在神经炎症和癫痫易感性中的作用 | 首次揭示了AEG-1通过NF-κB信号通路介导神经炎症和癫痫易感性的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养的星形胶质细胞，人类临床相关性尚待验证 | 探究AEG-1在神经炎症和癫痫发病机制中的作用 | 小鼠模型和体外培养的星形胶质细胞 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序 | 小鼠炎症模型 | 基因表达数据 | NA |
| 6 | 2025-06-17 |
Multi-omics characterization of oncosis in spinal cord injury
2025-Aug, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106982
PMID:40467009
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法描述了脊髓损伤后细胞肿胀性坏死的特征 | 首次绘制了脊髓损伤后肿胀性坏死相关基因的时空表达图谱 | 研究主要基于动物模型，人类样本验证不足 | 阐明肿胀性坏死在脊髓损伤中的作用机制 | 脊髓损伤后的细胞死亡过程 | 生物医学研究 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR, 免疫荧光, TEM | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 大鼠脊髓损伤模型和LPS处理的PC12细胞系 |
| 7 | 2025-06-17 |
FCGR2A contributes to M2 macrophages polarization in HCC through IL-4/JAK/STAT6 axis
2025-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102429
PMID:40482466
|
研究论文 | 本文研究了FCGR2A在肝细胞癌（HCC）中通过IL-4/JAK/STAT6轴促进M2巨噬细胞极化的机制 | 揭示了FCGR2A通过IL-4/JAK/STAT6轴促进M2巨噬细胞极化的新机制，为HCC治疗提供了新的靶点 | 研究主要集中在体外和动物模型，临床样本验证有待进一步研究 | 探究FCGR2A在HCC肿瘤微环境中对巨噬细胞极化的调控机制 | 肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8 | 2025-06-17 |
Single-cell sequencing and machine learning reveal the role of dioxin-interacting genes in HCC prognosis and immune microenvironment
2025-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118484
PMID:40483782
|
研究论文 | 通过单细胞测序和机器学习揭示了二恶英相互作用基因在肝细胞癌预后和免疫微环境中的作用 | 结合单细胞和批量转录组分析及机器学习，识别了与免疫逃逸、代谢重编程和细胞周期调控相关的二恶英相互作用差异表达基因（DI-DEGs），并构建了预后模型 | 分子机制仍需进一步研究，实验验证仅限于体外 | 探究二恶英在肝细胞癌（HCC）发展中的分子机制及其对预后和免疫微环境的影响 | 肝细胞癌（HCC）患者和二恶英相互作用基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、批量转录组分析、机器学习、分子对接 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 9 | 2025-06-17 |
Analysis of Hyperexpanded T Cell Clones in SARS-CoV-2 Vaccine-Associated Liver Injury by Spatial Proteomics and Transcriptomics
2025-Jul, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70172
PMID:40522253
|
研究论文 | 通过空间蛋白质组学和转录组学分析SARS-CoV-2疫苗相关肝损伤中的超扩增T细胞克隆 | 使用新型组合多重免疫荧光(mIF)-RNA原位杂交(RISH)方法和Xenium原位平台单细胞空间转录组学技术，对超扩增T细胞克隆进行定位和表征 | 研究样本仅来自一名严重SVALI患者的肝脏移植样本，样本量有限 | 表征严重SARS-CoV-2疫苗相关肝损伤(SVALI)患者肝脏中的免疫浸润情况 | SARS-CoV-2疫苗相关肝损伤患者的肝脏移植样本 | 空间组学 | 肝损伤 | T细胞受体测序、多重免疫荧光(mIF)-RNA原位杂交(RISH)、Xenium原位平台单细胞空间转录组学 | NA | 空间蛋白质组学和转录组学数据 | 1例严重SVALI患者的肝脏移植样本 |
| 10 | 2025-06-17 |
Plaque erosion risk and JAK2 V617F variant
2025-Jun-16, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf114
PMID:40053703
|
research paper | 该研究探讨了JAK2 V617F变异与心肌梗塞（MI）两种机制——斑块侵蚀和斑块破裂之间的具体关联 | 首次明确了JAK2 V617F变异与斑块侵蚀风险之间的显著关联，并通过单细胞RNA测序揭示了中性粒细胞激活的潜在机制 | 研究样本主要来自单一中心，可能限制结果的普遍性 | 探究JAK2 V617F变异与心肌梗塞不同机制之间的关联 | 728例斑块侵蚀患者、919例斑块破裂患者和804例对照个体 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 数字滴PCR、单细胞RNA测序 | 逻辑回归分析 | 基因测序数据、临床数据 | 728例侵蚀病例、919例破裂病例和804例对照 |
| 11 | 2025-06-17 |
Single-Cell Expression Analysis of Ductal Carcinoma In Situ Identifies Complex Genotypic-Phenotypic Relationships Altering Epithelial Composition
2025-Jun-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3023
PMID:40101158
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析导管原位癌（DCIS）的基因表达，揭示了其与浸润性乳腺癌（IBC）的复杂基因型-表型关系 | 首次在DCIS中应用单细胞RNA测序技术，揭示了肿瘤内克隆异质性及其与基因表达差异的关联，并发现基底膜完整性失衡是浸润过程的关键因素 | 研究样本可能不足以代表所有DCIS亚型，且体外模型可能无法完全模拟体内情况 | 探究DCIS发展为浸润性乳腺癌的分子机制 | 导管原位癌（DCIS）病变组织及匹配的正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，但包含DCIS病变和匹配正常组织的临床标本 |
| 12 | 2025-06-17 |
Single-cell multi-omics reveals that FABP1 + renal cell carcinoma drive tumor angiogenesis through the PLG-PLAT axis under fatty acid reprogramming
2025-Jun-16, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02377-9
PMID:40518526
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研究论文 | 该研究通过单细胞多组学技术揭示了FABP1阳性肾细胞癌通过PLG-PLAT轴在脂肪酸重编程下驱动肿瘤血管生成的机制 | 发现了FABP1阳性肿瘤通过PLG-PLAT功能轴促进血管生成的新机制，并提出了针对该轴的潜在治疗策略 | 研究结果主要基于单细胞和空间转录组数据，需要更多体内实验验证 | 探究肾细胞癌中脂肪酸代谢重编程与肿瘤血管生成的关系 | FABP1阳性肾细胞癌细胞及其与内皮细胞的相互作用 | 癌症代谢 | 肾细胞癌 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本数量 |
| 13 | 2025-06-17 |
Role of local complement activation in kidney fibrosis and repair
2025-Jun-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188345
PMID:40519169
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综述 | 本文综述了局部补体激活在肾脏纤维化和修复中的作用 | 强调了局部补体激活在肾脏疾病中的致病作用，并提出了针对局部补体的药物开发作为慢性肾脏病管理的新方法 | 主要基于动物模型研究，人类数据有限 | 探讨局部补体激活在肾脏纤维化和修复中的作用 | 肾脏纤维化和修复过程中的补体系统 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | 动物模型和人类肾脏活检样本 |
| 14 | 2025-06-17 |
A multi-type programmed cell death gene signature predicts survival and reveals therapeutic targets in osteosarcoma
2025-Jun-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02944-y
PMID:40522389
|
研究论文 | 该研究通过整合多种程序性细胞死亡相关基因，构建了一个预测骨肉瘤生存和治疗靶点的基因特征模型 | 首次整合18种程序性细胞死亡相关基因构建骨肉瘤预后模型，并识别了关键基因和通路 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发骨肉瘤预后预测模型并识别潜在治疗靶点 | 骨肉瘤患者及其相关基因表达数据 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 转录组分析、单细胞RNA测序、LASSO回归模型 | LASSO | 基因表达数据 | 来自GEO和TARGET数据库的骨肉瘤患者数据 |
| 15 | 2025-06-17 |
An Efficient Organoid Cutting Method for Long-Term Culture and High-Throughput Analyses
2025-Jun-16, Tissue engineering and regenerative medicine
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s13770-025-00731-y
PMID:40522442
|
research paper | 该研究介绍了一种高效的类器官切割方法，用于增强长期培养并实现高通量分析 | 采用3D打印技术制造切割夹具，提高了切割效率和一致性，同时设计了模具方法用于创建密集排列的类器官阵列和冷冻切片 | 未提及具体样本量或实验重复次数，可能影响结果的普遍性 | 解决类器官长期培养中的缺氧和营养限制问题，提高培养效率和样本制备一致性 | 人多能干细胞（hPSC）衍生的类器官 | 生物医学工程 | NA | 3D打印技术，类器官培养技术 | NA | 生物样本 | NA |
| 16 | 2025-06-17 |
Decoding meningioma prognosis with multi-omics: macrophage diversity, immune-CNV interplay, and novel SPP1-targeted strategies
2025-Jun-16, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-05116-8
PMID:40522564
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研究论文 | 通过多组学方法解码脑膜瘤预后，探索巨噬细胞多样性、免疫-CNV相互作用及新型SPP1靶向策略 | 首次结合DNA甲基化和单细胞转录组学对脑膜瘤进行分子分型，揭示了SPP1在巨噬细胞功能和预后中的关键调控作用 | 样本量相对有限（302对样本），且需要进一步实验验证SPP1靶向治疗的效果 | 探索脑膜瘤的分子分型及其与预后的关系，寻找潜在治疗靶点 | 302对脑膜瘤样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | DNA甲基化测序、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq(scRNA-seq) | SCISSOR、scRank | 基因组数据、转录组数据 | 302对脑膜瘤样本 |
| 17 | 2025-06-17 |
Elevated CD14 in B cells associates with reduced ovarian cancer risk via CD80 + dendritic cell interaction: a multi-omics study
2025-Jun-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02956-8
PMID:40517355
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了B细胞中CD14表达与卵巢癌风险的关系及其通过CD80+树突状细胞介导的机制 | 首次发现B细胞中CD14表达通过CD80+树突状细胞介导影响卵巢癌风险 | 样本来源仅限于外周血单个核细胞，未涉及肿瘤组织微环境 | 阐明B细胞中CD14表达影响卵巢癌风险的免疫调控机制 | 卵巢癌患者和健康捐赠者的外周血单个核细胞 | 免疫肿瘤学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析 | NA | 单细胞转录组数据、eQTL/pQTL数据库数据 | 卵巢癌患者和健康捐赠者的PBMC样本（具体数量未说明） |
| 18 | 2025-06-17 |
Multiomics identifies tumor-intrinsic SREBP1 driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011537
PMID:40518290
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定出肝细胞癌中肿瘤内在的SREBP1驱动免疫排斥 | 发现SREBP1作为免疫排斥的中心调控因子，并通过脂质生物合成途径影响肿瘤微环境 | 研究样本量虽大，但实验验证主要基于体外模型，临床前研究需进一步验证 | 寻找克服肝细胞癌免疫检查点抑制剂耐药的新治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本及体外培养的肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq, 成像质谱细胞术, 空间脂质组学 | 3D共培养模型 | 多组学数据（转录组、蛋白质组、单细胞转录组、脂质组） | 900+人类样本（RNA-seq, 蛋白质组学）, 31个肿瘤单细胞RNA-seq样本 |
| 19 | 2025-06-17 |
Identification of potential drug targets for erectile dysfunction with single-cell RNA sequencing: A Mendelian randomization study
2025-Jun-15, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70082
PMID:40518741
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，识别了勃起功能障碍（ED）的潜在药物靶点 | 结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，发现了两个新的ED药物靶点，并验证了它们在特定细胞类型中的表达 | 研究依赖于现有的eQTL数据和ED统计摘要，可能受到样本来源和数量的限制 | 识别勃起功能障碍的新药物靶点，以改善当前治疗效果不佳的问题 | 勃起功能障碍患者 | 生物医学研究 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化（MR）、分子对接 | NA | 基因表达数据、SNP数据 | eQTLGen Consortium的31,684个体；两个ED队列共325,158个体（7,329 ED病例，317,829对照） |
| 20 | 2025-06-17 |
Advances in single-cell omics: Transformative applications in basic and clinical research
2025-Jun-14, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2025.102548
PMID:40517461
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在基础和临床研究中的变革性应用 | 展示了单细胞组学技术在揭示细胞互作、疾病机制和治疗反应中的新见解，特别是在癌症和神经发育障碍等异质性疾病中 | NA | 探讨单细胞组学技术在生物学和临床应用中的关键作用 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学整合技术在复杂组织解析中的应用 | 生物信息学 | 癌症、神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合 | NA | 单细胞组学数据 | NA |