单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-05-15	Integrated bioinformatics analysis identifies neutrophils and villous cytotrophoblasts infiltration characterized by BLC6 upregulation as associated with the co-occurrence of gestational diabetes mellitus and pre-eclampsia 2025-Dec, Hypertension in pregnancy IF:1.5Q4 DOI:10.1080/10641955.2025.2475814 PMID:40122115	研究论文	通过整合生物信息学分析，发现中性粒细胞和绒毛细胞滋养层细胞浸润以及BLC6上调与妊娠期糖尿病和先兆子痫的共现相关	首次鉴定出BCL6、DNAH9和SCG2作为妊娠期糖尿病和先兆子痫的共同枢纽基因，并发现BCL6在中性粒细胞和绒毛细胞滋养层细胞中的高表达	研究依赖于公开数据集，未进行实验验证	探究妊娠期糖尿病和先兆子痫共现的枢纽基因和通路	妊娠期糖尿病和先兆子痫患者	生物信息学	妊娠期糖尿病和先兆子痫	生物信息学分析、单细胞测序数据分析	回归模型、ROC分析	基因表达数据	来自GEO数据库的多个数据集
2	2025-05-15	Faecalibacterium prausnitzii prevents age-related heart failure by suppressing ferroptosis in cardiomyocytes through butyrate-mediated LCN2 regulation 2025-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1 DOI:10.1080/19490976.2025.2505119 PMID:40364435	研究论文	本研究探讨了老年肠道菌群变化与心力衰竭（HF）之间的潜在联系，发现Faecalibacterium prausnitzii及其代谢产物丁酸盐通过抑制心肌细胞铁死亡预防老年心力衰竭	首次揭示了老年肠道菌群失调通过铁死亡途径导致心力衰竭的机制，并发现Faecalibacterium prausnitzii及其代谢产物丁酸盐的治疗潜力	研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证	探索老年肠道菌群变化与心力衰竭的关系及其潜在治疗靶点	老年心力衰竭患者、衰老大鼠模型、心肌细胞	心血管疾病研究	心力衰竭	16S rRNA测序、PCR定量、单细胞测序、基因编辑技术	动物模型（大鼠）	测序数据、PCR数据、单细胞数据	公开可用的单细胞测序数据集、老年HF患者粪便样本、实验大鼠
3	2025-05-15	The role of lactate metabolism in retinoblastoma tumorigenesis and ferroptosis resistance 2025-Aug, Tissue & cell IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.tice.2025.102893 PMID:40188688	研究论文	本研究探讨了乳酸代谢在视网膜母细胞瘤肿瘤发生和抗铁死亡中的作用	首次揭示了乳酸代谢通过上调MCT1促进视网膜母细胞瘤细胞存活和抗铁死亡的新机制	研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证不足	阐明乳酸代谢相关基因表达谱对视网膜母细胞瘤发生和抗铁死亡的影响	视网膜母细胞瘤细胞系和患者组织样本	肿瘤代谢	视网膜母细胞瘤	单细胞RNA测序	小鼠异种移植模型	转录组数据	患者视网膜组织和视网膜母细胞瘤组织的单细胞RNA测序数据
4	2025-05-15	Integrating scRNA-seq to explore offspring neurodevelopmental toxicity induced by Cyfluthrin exposure during pregnancy: A fate decision for NSCs 2025-Jul-15, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138205 PMID:40209410	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索孕期暴露于Cyfluthrin对后代神经发育的毒性作用及其机制	首次构建了孕期暴露于Cyfluthrin的后代大脑海马单细胞图谱，揭示了神经干细胞命运改变是发育毒性的主要原因	研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究孕期Cyfluthrin暴露对后代神经发育的毒性机制	孕期暴露于Cyfluthrin的大鼠后代	神经毒理学	神经发育障碍	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	不同年龄阶段的大鼠后代海马组织样本
5	2025-05-15	Combining Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization to Explore Novel Drug Targets for Parkinson's Disease 2025-Jun, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-025-04700-3 PMID:39890696	研究论文	结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索帕金森病的新药物靶点	首次结合scRNA-Seq和MR方法探索T细胞相关基因对帕金森病风险的因果效应，并识别出五个潜在药物靶点	需要进一步的研究和临床试验来验证这些潜在药物靶点的有效性	探索帕金森病的致病机制和潜在治疗靶点	帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞	生物信息学	帕金森病	单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 孟德尔随机化(MR), GWAS	NA	基因表达数据	帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞scRNA-Seq数据集
6	2025-05-15	A Case-Driven Multi-Omics Analysis for Longitudinal Ibrutinib Response Evaluation of Patients With Chronic Lymphocytic Leukemia 2025-Jun, European journal of haematology IF:2.3Q2 DOI:10.1111/ejh.14397 PMID:39988467	研究论文	通过多组学方法评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼的长期治疗反应	利用单细胞转录组学等多组学方法，首次在分子水平上探索了伊布替尼治疗期间克隆惰性的机制	研究样本量较小，仅包含两名患者的数据	评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼治疗的长期分子和临床反应	两名接受伊布替尼单药治疗的慢性淋巴细胞白血病患者	数字病理学	慢性淋巴细胞白血病	单细胞转录组学, 多组学分析	NA	DNA和RNA数据	两名患者的血液样本
7	2025-05-15	Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems 2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS IF:1.9Q2 DOI:10.1002/jms.5143 PMID:40360168	research paper	该论文探讨了空间多组学技术在理解神经系统动态生物过程中的应用	结合代谢组学、转录组学和蛋白质组学，提供更全面的分子景观研究	样本制备优化、分子完整性保持以及跨组学数据整合仍存在挑战	通过多模态成像技术增强对神经系统和复杂疾病的理解	大脑中的细胞类型及其相互作用	digital pathology	Alzheimer's disease, autism spectrum disorder	mass spectrometry imaging, spatial transcriptomics, spatial proteomics	NA	image, omics data	NA
8	2025-05-15	Unraveling the Heterogeneity of CD8+ T-Cell Subsets in Liver Cirrhosis: Implications for Disease Progression 2025-May-15, Gut and liver IF:3.4Q2 DOI:10.5009/gnl230345 PMID:38623058	研究论文	本研究通过转录组和单细胞测序数据分析，揭示了CD8+ T细胞在肝硬化中的异质性及其对疾病进展的影响	首次在肝硬化中鉴定出八种CD8+ T细胞亚型，特别是发现CXCL13+ Tex细胞与疾病严重程度和不良预后相关	研究主要基于测序数据分析，缺乏体内功能验证实验	阐明CD8+ T细胞在肝硬化中的分子机制及其对疾病进展的影响	肝硬化患者的CD8+ T细胞	免疫学	肝硬化	RNA-seq, 单细胞测序	NA	转录组数据, 单细胞数据	未明确说明样本数量
9	2025-05-15	Spatiotemporal analysis of lung immune dynamics in lethal Coccidioides posadasii infection 2025-May-14, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.02562-24 PMID:39611685	研究论文	通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析致命性球孢子菌感染中的肺部免疫动态	识别了单核细胞衍生的表达巨噬细胞作为组织重塑和纤维化的潜在介导者，并揭示了TGF-β和IL-6信号通路的激活	研究聚焦于致命性急性感染，可能不适用于所有类型的球孢子菌感染	深入了解致命性球孢子菌感染中的免疫反应机制	致命性球孢子菌感染中的肺部免疫细胞	免疫学	球孢子菌病	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
10	2025-05-15	Tumor-colonizing Pseudoalteromonas elyakovii metabolically reprograms the tumor microenvironment and promotes breast ductal carcinoma 2025-May-14, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.03873-24 PMID:40192290	research paper	研究探讨了肿瘤内微生物群与乳腺癌发展之间的关系，并分析了微生物群在肿瘤微环境中的作用	揭示了肿瘤内微生物群在乳腺癌发展中的代谢重编程作用及其对肿瘤微环境的影响	样本量较小（102例），且研究集中在乳腺导管癌，可能不适用于其他癌症类型	探究肿瘤内微生物群与乳腺癌发展及免疫治疗的关系	乳腺导管癌患者肿瘤组织中的微生物群	肿瘤微生物组学	乳腺癌	qRT-PCR, 双免疫荧光染色, SweAMI探针杂交, scRNA-seq	NA	微生物组数据, 基因表达数据	102例乳腺导管癌样本
11	2025-05-15	Single-cell RNA sequencing reveals SLC31A1-mediated M2 polarization of macrophages promotes malignant progression in triple-negative breast cancer 2025-May-14, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-025-06191-0 PMID:40360897	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示SLC31A1介导的巨噬细胞M2极化促进三阴性乳腺癌的恶性进展	首次发现SLC31A1在三阴性乳腺癌髓系细胞中的过表达，并通过功能研究证实其通过诱导巨噬细胞M2极化促进肿瘤恶性表型	研究主要基于体外实验，缺乏体内模型的验证	探究三阴性乳腺癌免疫微环境中的关键调控基因及其作用机制	三阴性乳腺癌组织样本和巨噬细胞	肿瘤免疫学	乳腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qPCR、流式细胞术、Transwell实验、划痕实验、铜离子和H2O2检测	NA	单细胞转录组数据、分子生物学实验数据	未明确说明样本数量
12	2025-05-15	Comprehensive single-cell transcriptomic reveals different destinies of melanocytes and dynamic changes of immune microenvironment in a psychological stress-induced leukoderma and leukotrichia mouse model 2025-May-14, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-025-01236-z PMID:40361040	research paper	该研究通过建立慢性不可预测轻度刺激（CUMS）小鼠模型，利用单细胞RNA测序技术揭示了心理压力诱导的白癜风和白发症中黑色素细胞的不同命运及免疫微环境的动态变化	发现了两种具有不同命运的黑色素细胞簇（Mel2和Mel3）以及CXCL16-CXCR6轴激活的促炎微环境，为压力诱导的白癜风发病机制提供了新见解	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中进行验证	探究心理压力诱导的白癜风和白发症的发病机制	C57BL/6J小鼠的黑色素细胞和免疫微环境	digital pathology	vitiligo	single-cell RNA sequencing, immunohistochemistry	CUMS mouse model	RNA-seq data, image	C57BL/6J小鼠模型
13	2025-05-15	Novel Aortic Dissection Model Links Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration 2025-May-14, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326230 PMID:40365676	research paper	该研究通过创建一种新型的自发性主动脉夹层小鼠模型，揭示了内皮功能障碍和免疫浸润在主动脉夹层发病机制中的作用	首次将非综合征性家族性主动脉夹层患者的FBN1基因错义变异（p.G234D）通过CRISPR/Cas9系统引入小鼠，创建了新型自发性AD模型	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证相关发现	揭示主动脉夹层的分子机制，特别是内皮细胞和免疫细胞在疾病起始中的作用	携带Fbn1G234D/G234D突变的小鼠主动脉组织	分子病理学	心血管疾病	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、同步辐射成像、Western blot分析	小鼠疾病模型	基因测序数据、影像数据、蛋白质印迹数据	Fbn1G234D/G234D突变小鼠（具体数量未明确说明）
14	2025-05-15	Dissection of the global responses of mandarin fish pyloric cecum to an acute ranavirus (MRV) infection reveals the formation of serositis and then ascites 2025-May-14, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.02308-24 PMID:40366173	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了急性MRV感染对鳜鱼幽门盲囊的全球响应机制，特别是浆膜炎的形成及其后续腹水症状的病理过程	首次在单细胞分辨率水平解析MRV感染诱导鳜鱼幽门盲囊浆膜炎的细胞组成变化及关键免疫细胞亚群的作用	研究仅聚焦于急性感染阶段的病理变化，未涉及慢性感染或不同鱼种间的比较分析	阐明MRV感染导致鳜鱼特征性腹水症状的分子病理机制	感染MRV病毒的鳜鱼幽门盲囊组织	鱼类病理学	病毒性鱼病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	未明确说明样本数量（鳜鱼个体及幽门盲囊组织）
15	2025-05-15	Dual oxic-anoxic co-culture enables direct study of anaerobe-host interactions at the airway epithelial interface 2025-May-14, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.01338-24 PMID:40366160	research paper	介绍了一种双氧-缺氧共培养（DOAC）方法，用于研究厌氧菌与宿主细胞在气道上皮界面的相互作用	DOAC方法能够在维持宿主细胞氧供的同时，在上皮界面创造缺氧微环境，从而直接研究厌氧菌与宿主的相互作用	研究仅持续了约48小时，可能无法完全模拟长期感染情况	探究厌氧菌与宿主细胞在气道疾病病理生理学中的相互作用机制	厌氧菌与气道上皮细胞	微生物学与细胞生物学	气道疾病	双氧-缺氧共培养（DOAC）、RNAseq、单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
16	2025-05-15	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Functional Exhaustion of T Cells in Oral Lichen Planus 2025-May-14, Molecular oral microbiology IF:2.8Q3 DOI:10.1111/omi.12495 PMID:40366262	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了口腔扁平苔藓中T细胞的功能耗竭状态	首次在口腔扁平苔藓中使用单细胞RNA测序技术分析T细胞的组成和异质性，揭示了CD8+耗竭T细胞的关键作用	样本量较小（仅3名患者和3名健康对照），且小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病	探究口腔扁平苔藓免疫微环境中T细胞的组成和功能状态	口腔扁平苔藓患者和小鼠模型的T细胞	免疫学	口腔扁平苔藓	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、HE染色、免疫荧光染色	小鼠慢性炎症模型	单细胞转录组数据、组织病理学数据	3名口腔扁平苔藓患者和3名健康对照的口腔黏膜组织
17	2025-05-15	Identifying Immunomodulatory Subpopulations of Adipose Stromal Vascular Fraction and Stem/Stromal Cells Through Single-Cell Transcriptomics and Bulk Proteomics 2025-May-14, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s12015-025-10889-6 PMID:40366552	研究论文	通过单细胞转录组学和批量蛋白质组学技术，识别脂肪基质血管部分和干细胞/基质细胞中具有免疫调节功能的亚群	整合单细胞RNA测序和批量蛋白质组学数据，首次识别出脂肪基质血管部分中具有不同免疫调节表型的干细胞亚群	研究主要基于体外实验数据，需要进一步体内验证	解析脂肪来源干细胞/基质细胞的异质性免疫调节潜能	脂肪基质血管部分(SVF)和脂肪来源干细胞/基质细胞(ASCs)	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序(scRNA seq), 批量蛋白质组学	Scissor算法	转录组数据, 蛋白质组数据	未明确提及具体样本数量
18	2025-05-15	Parvalbumin neurons mediate neurological phenotypes of anti-NMDAR encephalitis 2025-May-13, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1 DOI:10.1093/brain/awae374 PMID:40071389	research paper	该研究通过构建抗NMDAR脑炎动物模型，揭示了小白蛋白神经元在抗NMDAR脑炎神经表型中的关键作用	首次发现抗NMDAR IgG会导致小白蛋白神经元形态损伤和功能异常，并通过光遗传学和药理遗传学技术成功逆转认知障碍	研究主要聚焦于mPFC区域，虽然发现海马区也有类似变化，但其他脑区的影响尚未完全阐明	阐明抗NMDAR脑炎认知缺陷的神经病理机制	抗NMDAR脑炎患者血清提取的IgG和小鼠模型	神经科学	脑炎	免疫组化染色、电生理测试、光遗传学、药理遗传学、单细胞测序	动物模型	电生理数据、基因表达数据	未明确说明具体样本数量（使用患者血清IgG和健康对照IgG）
19	2025-05-15	Development of a machine learning-based predictive risk model combining fatty acid metabolism and ferroptosis for immunotherapy response and prognosis in prostate cancer 2025-May-13, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02484-5 PMID:40355680	research paper	开发了一个基于机器学习的预测风险模型，结合脂肪酸代谢和铁死亡，用于前列腺癌的免疫治疗反应和预后	整合了批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据，构建了一个基于铁死亡和脂肪酸代谢共享基因的预后模型，并通过机器学习优化	模型仅在TCGA-PRAD和DFKZ队列中进行了验证，可能需要更多独立队列的验证	开发前列腺癌的预后模型和个性化治疗策略	前列腺癌患者	machine learning	prostate cancer	bulk RNA sequencing, scRNA-seq, spatial transcriptomics	Lasso + Random Survival Forest (RSF)	RNA sequencing data	TCGA-PRAD数据集和DFKZ队列
20	2025-05-15	Early multiple sclerosis activity associated with TBX21+CD21loCXCR3+ B cell expansion resembling EBV-induced phenotypes 2025-May-13, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.188543 PMID:40359016	研究论文	该研究通过单细胞表达分析探讨了EB病毒感染与多发性硬化症早期活动之间的关联	发现TBX21+CD21loCXCR3+非典型B细胞(ABCs)在早期多发性硬化症患者中的扩增与疾病活动相关	未检测到EBV直接感染ABCs的证据	探讨EBV在多发性硬化症发病机制中的作用	早期多发性硬化症患者的外周B细胞	免疫学	多发性硬化症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术	NA	单细胞基因表达数据	来自ITN STAyCIS试验的纵向收集样本，包括早期MS患者、健康对照和其他疾病对照