单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-28 |
CD73 inhibitor AB680 suppresses glioblastoma in mice by inhibiting purine metabolism and promoting P2RY12+ microglia transformation
2025-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01585-9
PMID:40500344
|
研究论文 | 本研究探讨CD73抑制剂AB680通过抑制嘌呤代谢和促进P2RY12+小胶质细胞转化来抑制小鼠胶质母细胞瘤的机制 | 首次揭示AB680通过改变嘌呤代谢微环境促进P2RY12+小胶质细胞向M1样抗肿瘤表型转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床效果需进一步验证 | 研究AB680在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤效应及其作用机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和人类GBM样本 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢组学分析、单细胞RNA测序、核RNA测序 | 动物模型 | 代谢组数据、单细胞测序数据 | G422-GBM荷瘤小鼠模型和人类GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序、核RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-28 |
EpiFoundation: A Foundation Model for Single-Cell ATAC-seq via Peak-to-Gene Alignment
2025-Sep-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.05.636688
PMID:39975086
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研究论文 | 本文提出了首个专门针对单细胞ATAC-seq数据的预训练基础模型EpiFoundation，通过峰值到基因对齐解决数据稀疏性问题 | 开发了创新的跨模态预训练方法，专门处理非零峰值集以提高信息密度，并利用基因表达信息监督预训练过程 | NA | 开发专门针对单细胞ATAC-seq数据的基础模型，解决高维稀疏数据的表示学习问题 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞表示学习 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 基础模型 | 表观基因组数据, 基因表达数据 | 超过100,000个单细胞，包含配对的scRNA-seq和scATAC-seq数据 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-28 |
Spatial transcriptomic analysis of HIV and tuberculosis coinfection in a humanized mouse model reveals unique transcription patterns, immune responses and early morphological alterations
2025-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635571
PMID:39975088
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研究论文 | 通过人源化小鼠模型研究HIV和结核分枝杆菌共感染的早期空间转录组特征 | 首次在HIV和结核分枝杆菌共感染模型中应用空间转录组技术揭示早期免疫细胞浸润模式和转录特征 | 研究仅观察感染后三周的早期变化，未涵盖疾病全程发展 | 理解HIV和结核分枝杆菌共感染早期免疫细胞浸润的表型和功能变化 | 人源化小鼠模型的肺组织 | 空间转录组学 | HIV和结核分枝杆菌共感染 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 人源化小鼠感染模型（单感染和共感染组） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-28 |
STAMP: Single-cell transcriptomics analysis and multimodal profiling through imaging
2025-Sep-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.027
PMID:40532697
|
研究论文 | 开发了一种名为STAMP的新型单细胞分析方法，通过成像平台实现转录组和蛋白质组的多模态分析 | 通过成像而非测序进行单细胞分析，消除了测序成本，支持RNA、蛋白质和H&E的多模态分析，同时保留细胞结构和形态 | NA | 克服单细胞RNA测序在可扩展性、高成本和细胞破坏方面的限制 | 外周血单核细胞、细胞系和干细胞 | 数字病理学 | NA | 转录组成像、蛋白质组成像、多模态分析 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 10,962,092个高质量细胞/细胞核和6,030,429,954个转录本 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 成像平台，支持多模态（RNA、蛋白质和H&E）分析 |
| 5 | 2025-10-28 |
Identification of shared pathogenetic mechanisms between endometriosis and RSA based on comprehensive bioinformatics analysis
2025-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03596-1
PMID:40705269
|
研究论文 | 通过生物信息学分析识别子宫内膜异位症和复发性自然流产之间的共同分子机制和关键基因 | 首次发现FXYD1作为连接子宫内膜异位症和复发性自然流产的关键枢纽基因，并通过单细胞RNA测序验证其在基质细胞和蜕膜细胞中的表达 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证功能机制 | 探索子宫内膜异位症和复发性自然流产的共同发病机制 | 子宫内膜异位症和复发性自然流产患者样本 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症,复发性自然流产 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析 | WGCNA,ROC分析 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 来自GSE7305和GSE165004数据集的样本 | NA | 单细胞RNA测序,基因表达谱分析 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-28 |
Powerful and accurate case-control analysis of spatial molecular data
2025-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.07.637149
PMID:39975274
|
研究论文 | 提出一种结合深度学习和统计原理的空间分子数据分析方法VIMA，用于识别与疾病相关的空间特征 | 将变分自编码器与多重检验控制相结合，通过定义数据依赖的'微生态位'来发现传统方法难以识别的疾病相关空间结构 | NA | 开发更灵活精确的空间分子数据分析方法，识别与疾病相关的关键空间结构 | 空间分子数据中的组织斑块和微生态位 | 空间转录组学 | 类风湿关节炎,溃疡性结肠炎,痴呆 | 免疫荧光显微镜,CODEX,空间转录组学 | 变分自编码器 | 空间分子数据 | NA | NA | 空间转录组学,免疫荧光,CODEX | NA | NA |
| 7 | 2025-10-28 |
CROPseq-multi: a universal solution for multiplexed perturbation in high-content pooled CRISPR screens
2025-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.17.585235
PMID:38558968
|
研究论文 | 开发了一种名为CROPseq-multi的多重CRISPR筛选系统，用于在高质量集合筛选中实现通用多重扰动 | 开发了具有多功能读出兼容性的CROPseq-inspired慢病毒系统，支持单个和组合扰动，在条形码识别和扰动性能方面表现优异 | NA | 开发兼容多种筛选方法的多重CRISPR扰动系统 | CRISPR筛选系统和遗传扰动技术 | 基因编辑技术 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞RNA测序，光学集合筛选 | NA | 基因表达数据，条形码序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，光学集合筛选 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-28 |
Specific cell states underlie complex tissue regeneration in spiny mice
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637521
PMID:39990382
|
研究论文 | 本研究通过细胞增殖动力学分析揭示多刺小鼠复杂组织再生的特定细胞状态机制 | 首次发现基质细胞在损伤后快速重新进入细胞周期并维持严格的时空控制，识别出CRABP1+和αSMA+等与再生特异性相关的关键细胞类型 | 未明确说明样本规模，且对年轻小鼠中类似成纤维细胞无法促进再生的机制解释有限 | 探索哺乳动物复杂组织再生过程中的细胞增殖动力学和特定细胞状态 | 多刺小鼠(Acomys spp.)和实验室小鼠的耳组织再生过程 | 发育生物学 | 组织损伤修复 | 时间脉冲追踪实验、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据、免疫染色图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-28 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
|
研究论文 | 评估Element Aviti平台通过亲和碱基化学测序技术准确读取单细胞RNA-seq文库中同聚物区域的能力 | 首次利用亲和碱基化学测序技术直接准确读取单细胞RNA-seq文库中的同聚物引物区域 | 与单端比对相比，双端比对并未持续提高读段映射率 | 改进单细胞RNA-seq文库的特征分析，特别是多聚腺苷酸化位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti | 亲和碱基化学测序技术 |
| 10 | 2025-07-17 |
Unveiling new therapeutic targets for esophageal cancer treatment through single-cell transcriptomics: pH-responsive nanobubbles enhance the efficacy of 125I radiotherapy
2025-Jul-15, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03552-2
PMID:40665303
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-10-27 |
Distinct adipose progenitor cells emerging with age drive active adipogenesis
2025-Apr-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adj0430
PMID:40273250
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现中年小鼠内脏脂肪中出现独特的脂肪祖细胞亚群CP-A，揭示其通过白血病抑制因子受体信号驱动年龄依赖性脂肪重塑的机制 | 首次鉴定出年龄特异性富集的脂肪祖细胞亚群CP-A，并阐明其通过LIFR信号通路驱动中年期脂肪生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探究年龄依赖性脂肪组织重塑的细胞机制 | 小鼠脂肪祖细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，细胞移植，药理学和遗传学操作 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-27 |
Visualizing Immune Checkpoint Inhibitors Derived Inflammation in Atherosclerosis
2024-Oct-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324260
PMID:39328090
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研究论文 | 本研究使用CCR2靶向放射性示踪剂和PET成像技术，可视化免疫检查点抑制剂引起的动脉粥样硬化炎症反应 | 首次开发非侵入性方法检测ICI治疗引起的动脉粥样硬化炎症，揭示IFNγ信号在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体验证 | 探索免疫检查点抑制剂引起动脉粥样硬化的机制并开发可视化检测方法 | Apoe-/-和Ldlr-/-基因敲除小鼠 | 分子影像学 | 心血管疾病 | PET成像、单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术 | NA | 影像数据、分子数据、单细胞测序数据 | Apoe-/-和Ldlr-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,PET成像 | NA | 64Cu-DOTA-ECL1i PET示踪剂 |
| 13 | 2025-10-27 |
Single-cell transcriptomics of peripheral blood mononuclear cells indicates impaired immune and inflammatory responses in alcohol-associated hepatitis
2024-Jan, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2023.110735
PMID:38040543
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示酒精性肝炎患者外周血单个核细胞的免疫和炎症反应受损机制 | 首次结合单细胞转录组、细胞表面蛋白和淋巴细胞抗原受体分析，系统揭示AH患者PBMC中各细胞亚型的协同免疫应答异常 | 样本量有限，未包含不同疾病阶段的纵向数据 | 探究酒精性肝炎中免疫失调和炎症反应的分子机制 | 酒精性肝炎患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 酒精性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、抗原受体数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 14 | 2025-07-06 |
Combining spatial transcriptomics and AI to enhance brain tumour diagnosis
2025-Nov, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-025-00851-6
PMID:40615732
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-10-26 |
Natural killer cells and IFN-γ protect against liver injury during HAV infection in mice
2025-Oct-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01395-25
PMID:40970716
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了自然杀伤细胞和干扰素-γ在甲型肝炎病毒感染早期对肝脏的保护作用 | 首次在免疫活性小鼠模型中证明NK细胞通过产生IFN-γ抑制HAV复制并保护肝脏，而非引起病理损伤 | 研究使用基因修饰小鼠模型，结果在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 阐明甲型肝炎病毒感染早期NK细胞的免疫应答机制及其在肝脏保护中的作用 | 肝细胞特异性I型干扰素受体敲除小鼠和全局敲除小鼠模型 | 免疫学 | 病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术，细胞耗竭实验 | NA | 基因表达数据，血清生化指标，组织病理学数据 | 多种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-26 |
A novel ZIKV-targeted scRNA-seq method for precise quantification of ZIKV RNA
2025-Oct-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01114-25
PMID:40990513
|
研究论文 | 开发了一种新型寨卡病毒靶向单细胞RNA测序方法，用于精确量化单个细胞中的寨卡病毒RNA | 开发了专门针对缺乏poly(A)尾的寨卡病毒RNA的靶向scRNA-seq方法，解决了传统方法检测寨卡病毒RNA的难题 | 研究仅使用免疫健全乳鼠模型，样本量有限，需要在更广泛的模型中验证 | 开发能够精确检测和量化寨卡病毒RNA的单细胞测序方法，并识别易感细胞类型 | 寨卡病毒感染的免疫健全乳鼠脑组织 | 单细胞测序技术 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 寨卡病毒感染和对照乳鼠脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 17 | 2025-10-26 |
Concerted changes in Epithelium and Stroma: a multi-scale, multi-omics analysis of progression from Barrett's Esophagus to adenocarcinoma
2025-Oct-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.034
PMID:40695287
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研究论文 | 通过多尺度多组学分析研究巴雷特食管向腺癌进展过程中上皮和间质的协同变化 | 整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白质组学、组织力学和空间蛋白质组学，首次系统揭示巴雷特食管进展为多组分协调系统 | 样本量相对有限（26名患者的107个样本），需要在更大队列中验证发现 | 阐明巴雷特食管向食管腺癌进展的分子和细胞机制 | 从鳞状上皮经化生、异型增生到腺癌的进展路径样本 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 空间蛋白质组学, 组织力学分析 | 多组学整合分析 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间定位数据, 力学数据 | 26名患者的107个样本，来自两个独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-26 |
Enzyme-converted O kidneys allow ABO-incompatible transplantation without hyperacute rejection in a human decedent model
2025-Oct-03, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01513-6
PMID:41044341
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研究论文 | 本研究开发了一种供体导向的器官工程策略，通过酶转化将A型肾脏转化为O型肾脏，实现ABO血型不相容肾脏移植 | 首次提出供体导向的脱敏方案，在低温灌注期间通过酶处理去除肾脏A抗原，避免传统受体脱敏方案的并发症 | 研究仅在人类遗体模型中进行，观察时间仅2天，长期效果和安全性需要进一步验证 | 开发ABO血型不相容肾脏移植的新方法，提高器官分配的公平性和可及性 | 人类A型肾脏和O型脑死亡受体 | 器官移植工程 | 终末期肾病 | 酶转化技术，单细胞测序 | NA | 临床观察数据，基因表达数据 | 人类遗体模型研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-26 |
Microglia-neuron crosstalk through Hex-GM2-MGL2 maintains brain homeostasis
2025-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09477-y
PMID:40769205
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞通过Hex-GM2-MGL2通路与神经元进行双向通讯的新机制 | 发现了小胶质细胞向神经元递送β-己糖胺酶降解GM2神经节苷脂的先前未知相互作用模式 | NA | 探索小胶质细胞与神经元之间的相互作用机制及其在维持大脑稳态中的作用 | 小鼠模型和神经退行性Sandhoff病患者 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 非靶向脂质组学, 高分辨率空间脂质成像, 单细胞转录组分析 | NA | 脂质组数据, 空间成像数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-26 |
Cholesterol metabolic reprogramming mediates microglia-induced chronic neuroinflammation and hinders neurorestoration following stroke
2025-Oct, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01379-7
PMID:40987840
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研究论文 | 本研究揭示了胆固醇代谢重编程介导小胶质细胞诱导的慢性神经炎症并阻碍脑卒中后神经修复的机制 | 首次发现缺血性损伤通过胆固醇代谢重编程诱导持续性小胶质细胞活化，并证明通过CYP46A1激活减轻胆固醇负荷可促进白质修复和功能恢复 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未验证在雌性动物中的效果 | 探究脑卒中后慢性神经炎症的机制及胆固醇代谢在其中的作用 | 雄性小鼠和小胶质细胞 | 神经科学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |