单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-06-11	Microglial polarization pathways and therapeutic drugs targeting activated microglia in traumatic brain injury 2026-01-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00810 PMID:39665832	综述	本文综述了创伤性脑损伤中微极细胞的极化途径及针对活化微极细胞的治疗药物	阐明了促炎和抗炎微极细胞涉及的信号通路，并回顾了基于这些通路的药物和细胞替代治疗策略	药物和间充质干细胞治疗策略的应用仍面临诸多挑战	探讨创伤性脑损伤中微极细胞的极化途径及治疗策略	微极细胞及其在创伤性脑损伤中的作用	神经科学	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序、转录组分析	NA	NA	NA
2	2025-06-11	Changes in border-associated macrophages after stroke: Single-cell sequencing analysis 2026-01-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01092 PMID:39927762	研究论文	本文通过单细胞测序分析研究了中风后边界相关巨噬细胞的变化及其在神经炎症中的作用	首次全面分析了中风后边界相关巨噬细胞的动态转录变化及其参与的炎症相关通路调控，并提出了Stat3抑制作为潜在治疗策略	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究中风后边界相关巨噬细胞的变化及其在神经炎症中的作用机制	小鼠边界相关巨噬细胞	单细胞测序分析	中风	单细胞测序	动物模型	基因表达数据	来自GEO数据库的两个数据集(GSE174574和GSE225948)
3	2025-06-11	Progress in single-cell sequencing of retinal vein occlusion or ischemic hypoxic retinopathy 2025-Aug, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2025.110436 PMID:40414336	综述	本文综述了单细胞测序技术在视网膜静脉阻塞（RVO）和缺血性缺氧性视网膜病变（IHR）研究中的最新进展	利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术揭示视网膜血管疾病的细胞和分子异质性，探索整合snRNA-seq、空间转录组学和多组学方法以增强视网膜反应的空间和时间映射	当前挑战包括样本保存、视网膜细胞类型注释和跨物种翻译	为临床医生和研究人员提供视网膜缺血性疾病单细胞分析前沿领域的全面更新	视网膜静脉阻塞（RVO）和缺血性缺氧性视网膜病变（IHR）	数字病理学	视网膜疾病	scRNA-seq, snRNA-seq, 空间转录组学, 多组学方法	NA	RNA测序数据	NA
4	2025-06-11	Targeting SPP1+ macrophages via the SPP1-CD44 axis reveals a key mechanism of immune suppression and tumor progression in ovarian cancer 2025-Jul-28, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114906 PMID:40446696	研究论文	该研究通过整合分析卵巢癌单细胞测序数据，揭示了SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴促进T细胞耗竭和免疫抑制的机制	首次发现SPP1+巨噬细胞亚群通过SPP1-CD44轴驱动卵巢癌中的免疫抑制和T细胞耗竭，并验证了nilotinib作为潜在SPP1抑制剂的治疗潜力	研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，需要进一步的体内实验验证	探索卵巢癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)促进免疫抑制和肿瘤进展的分子机制	高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)中的肿瘤相关巨噬细胞和T细胞	肿瘤免疫学	卵巢癌	单细胞测序、分子对接、分子动力学模拟	NA	单细胞测序数据	六个HGSOC单细胞测序数据集
5	2025-06-11	Mefunidone treats pulmonary fibrosis by targeting SDH to regulate fibro-promoting macrophages 2025-Jul-28, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114971 PMID:40449267	研究论文	本研究揭示了Mefunidone通过靶向SDH并调节促纤维化巨噬细胞转化来治疗肺纤维化的新机制	首次发现Mefunidone通过结合并抑制SDH活性来抑制琥珀酸生成，进而调控促纤维化巨噬细胞表型转化	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	阐明Mefunidone治疗肺纤维化的分子靶点和潜在机制	博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型和促纤维化巨噬细胞	基础医学研究	肺纤维化	单细胞测序技术	动物模型	实验数据	博来霉素诱导的肺纤维化小鼠
6	2025-06-11	Multi-omics identifies OSM-OSMR as a key receptor-ligand in the tumor environment of endometrial adenocarcinoma 2025-Jul-28, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114933 PMID:40450916	研究论文	本研究通过多组学方法识别了OSM-OSMR作为子宫内膜腺癌肿瘤微环境中的关键受体-配体，并构建了一个预后模型	首次发现OSM信号在子宫内膜癌组织中的细胞通讯中显著升高，并基于OSM基因集将子宫内膜腺癌分为四种亚型，构建了七基因特征的预后模型	研究主要基于公开数据集和细胞系实验，缺乏大规模临床样本验证	探索子宫内膜腺癌肿瘤微环境中细胞间的配体-受体关系并构建预后模型	子宫内膜腺癌组织和细胞系	肿瘤微环境研究	子宫内膜腺癌	单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量RNA测序	随机生存森林模型	RNA测序数据和临床数据	来自GEO和TCGA的公开数据集及Ishikawa细胞系
7	2025-06-11	Abundance of a metabolically active subpopulation in dedifferentiated adipocytes inversely correlates with body mass index 2025-Jul, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2025.102161 PMID:40348015	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术鉴定了人类脂肪细胞中一个具有独特基因表达谱和功能特征的亚群，并发现其代谢活性与BMI呈负相关	首次在人类去分化脂肪细胞中发现了一个具有高代谢活性的亚群（C7），并揭示了其与BMI的负相关性	样本量相对较小（11名人类供体），且机制研究有待深入	探究脂肪组织细胞组成与代谢疾病（如肥胖）的关系	人类去分化脂肪细胞（DFAT）	单细胞组学	肥胖	单细胞RNA测序（10x Genomics）、FACS分选、批量RNA测序	NA	单细胞转录组数据、批量转录组数据	11名人类供体的脂肪细胞（单细胞测序）+1759名供体的皮下脂肪组织（队列分析）
8	2025-06-11	Phillyrin for sepsis-related acute lung injury: A potential strategy suppressing GSK-3β 2025-Jul, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2025.04.017 PMID:40359720	研究论文	本研究探讨了连翘苷（PHN）通过抑制GSK-3β信号通路缓解脓毒症相关急性肺损伤（ALI/ARDS）的潜在机制	首次发现PHN能与GSK-3β形成稳定复合物，并证实其通过抑制GSK-3β促进M2巨噬细胞极化和减少中性粒细胞募集来缓解ALI/ARDS	研究主要基于LPS诱导的炎症模型，临床转化效果需进一步验证	阐明PHN缓解脓毒症相关ALI/ARDS的分子机制	连翘苷（PHN）、GSK-3β信号通路、ALI/ARDS动物模型	分子药理学	急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征	分子对接、动力学模拟、孟德尔随机化分析、单细胞测序	LPS诱导的小鼠和斑马鱼炎症模型	基因表达数据、蛋白质活性数据、细胞表型数据	从公共数据库筛选8331个ALI/ARDS相关靶基因，并进行了体内外实验验证
9	2025-06-11	Insights into Keratinocyte and Immunologic Landscape in Cutaneous Graft-Versus-Host Disease through Single-Cell Transcriptomics 2025-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health DOI:10.1016/j.xjidi.2025.100373 PMID:40492027	研究论文	通过单细胞转录组学揭示皮肤移植物抗宿主病（GVHD）中角质形成细胞和免疫细胞的复杂反应	首次使用单细胞RNA测序技术比较慢性GVHD与健康对照样本的转录组，揭示了角质形成细胞和真皮免疫细胞的非免疫和免疫变化	研究样本量未明确说明，可能限制结果的普遍性	探究慢性GVHD皮肤病变的发病机制，特别是角质形成细胞和其他皮肤结构细胞的作用	慢性GVHD患者的表皮和真皮样本与健康对照样本	单细胞转录组学	移植物抗宿主病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
10	2025-06-11	Paracrine Orchestration of Tumor Microenvironment Remodeling Induced by GLO1 Potentiates Lymph Node Metastasis in Breast Cancer 2025-Jun-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202500722 PMID:40492378	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和多组学方法，揭示了乳腺癌淋巴结转移中肿瘤微环境的重塑机制，并发现GLO1在促进淋巴管生成和转移中的作用	首次通过单细胞RNA测序和多组学方法全面解析乳腺癌淋巴结转移的肿瘤微环境，并确定GLO1作为新的治疗靶点	样本量相对较小（23名患者的28个淋巴结样本），可能限制结果的普遍性	探究乳腺癌淋巴结转移中肿瘤微环境重塑的分子机制	乳腺癌患者的淋巴结转移样本	肿瘤微环境研究	乳腺癌	单细胞RNA测序, 多组学方法	NA	RNA测序数据, 多组学数据	23名患者的28个淋巴结样本
11	2025-06-11	Baseline total lesion glycolysis identifies high-risk patients with immunosuppressive signatures in early-stage natural killer/T-cell lymphoma 2025-Jun-10, The oncologist DOI:10.1093/oncolo/oyaf164 PMID:40492497	研究论文	本研究探讨了基线总病灶糖酵解（TLG）作为生物标志物在早期自然杀伤/T细胞淋巴瘤（NKTCL）高风险患者识别中的应用	首次提出基线TLG作为识别高风险NKTCL患者的生物标志物，并发现其与免疫抑制微环境的相关性	样本量相对较小（n=192），且仅针对早期NKTCL患者	探索基线生物标志物在NKTCL预后预测中的应用	早期自然杀伤/T细胞淋巴瘤（NKTCL）患者	数字病理学	自然杀伤/T细胞淋巴瘤	18F-FDG PET/CT, scRNA-seq, bulk RNA-seq	NA	影像数据, 基因表达数据	192例早期NKTCL患者（训练组127例，验证组65例），其中10例进行scRNA-seq，65例进行bulk RNA-seq
12	2025-06-11	The glia-immune network: Astrocytes and oligodendrocytes as microglial co-ordinators in health and disease 2025-Jun-10, The Journal of physiology DOI:10.1113/JP287015 PMID:40492604	综述	本文探讨了星形胶质细胞和少突胶质细胞作为小胶质细胞协调者在健康和疾病中的作用，特别是在中枢神经系统免疫系统中的功能	强调了巨胶质细胞（星形胶质细胞和少突胶质细胞）在免疫信号通路中的参与，挑战了传统认为免疫功能仅限于免疫细胞的观点	需要进一步研究以阐明胶质细胞之间具体的分子对话机制	探讨巨胶质细胞来源的免疫信号及其在健康和疾病中的相关性	星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
13	2025-06-11	Multi-omics analysis of tumor necrosis factor superfamily 4 reveals its prognostic value with T cell exhaustion feature in cancer 2025-Jun-10, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02666-1 PMID:40493100	研究论文	通过多组学分析探讨肿瘤坏死因子超家族4（TNFSF4）在癌症中的预后价值及其与T细胞耗竭特征的关系	首次全面评估TNFSF4在泛癌中的生物学功能及其与免疫治疗反应和T细胞耗竭的关联	研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证	探索TNFSF4在癌症进展和免疫调节中的作用及其作为预后生物标志物的潜力	多种癌症类型及其相关临床数据	生物信息学	癌症	RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化染色, 基因集富集分析（GSEA）	NA	基因表达数据, 临床数据	来自TCGA和GEO数据库的多种癌症样本及免疫治疗队列
14	2025-06-11	Nanocoding: Lipid Nanoparticle Barcoding for Multiplexed Single-Cell RNA Sequencing 2025-Jun-09, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.5c02111 PMID:40489257	研究论文	本文介绍了一种名为nanocoding的新技术，利用脂质纳米颗粒（LNPs）在单细胞RNA测序（scRNA-seq）中实现高密度条形码标记	使用脂质纳米颗粒（LNPs）作为条形码载体，显著提高了标记密度和稳定性，克服了现有DNA标记方法的局限性	未明确提及技术在大规模应用中的成本效益分析或长期稳定性数据	开发一种高效、稳定的样本多重标记技术，以降低scRNA-seq的成本并减少批次效应	培养细胞系、组织消化物中的异质细胞（如脾脏和肥胖啮齿动物脂肪组织）	单细胞测序技术	肥胖相关疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、脂质纳米颗粒（LNPs）标记	NA	RNA测序数据	培养细胞系、脾脏消化物（6-plex条形码样本）、肥胖啮齿动物脂肪组织样本
15	2025-06-11	Serum amyloid A1-Induced intrahepatic regulatory T cell dysfunction drives autoimmune hepatitis progression 2025-Jun-09, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001419 PMID:40489740	research paper	该研究探讨了血清淀粉样蛋白A1（SAA1）如何通过Toll样受体2（TLR2）损害调节性T细胞（Tregs）功能，从而推动自身免疫性肝炎（AIH）的进展	揭示了AIH中肝内Tregs功能失调的新机制，并提出了通过靶向SAA1-TLR2通路恢复Tregs功能的新治疗策略	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类AIH患者中进行验证	探究AIH中Tregs功能失调的分子机制及其对疾病进展的影响	自身免疫性肝炎（AIH）小鼠模型中的调节性T细胞（Tregs）	免疫学	自身免疫性肝炎	单细胞RNA测序（10× Genomics平台）、AAV8介导的基因治疗	FoxP3-DTR/eGFP小鼠模型	基因表达数据	未明确提及具体样本数量，但使用了小鼠模型
16	2025-06-11	Tumor microenvironment heterogeneity and progression mechanisms in intrahepatic cholangiocarcinoma: A study based on single-cell and spatial transcriptomic sequencing 2025-Jun-09, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001423 PMID:40489753	研究论文	基于单细胞和空间转录组测序研究肝内胆管癌肿瘤微环境异质性及进展机制	揭示了肝内胆管癌肿瘤微环境的异质性，鉴定了ASPH作为侵袭亚型的标志基因，并发现CEP作为ASPH抑制剂可有效抑制肿瘤进展	样本量相对较小（12例单细胞测序样本和4例空间转录组样本），验证队列虽较大（87例RNA-seq样本），但仍需更大规模研究验证	探索肝内胆管癌的发病和进展机制	肝内胆管癌患者样本（肿瘤组织、淋巴转移灶）及小鼠模型	数字病理	肝内胆管癌	单细胞测序、空间转录组测序、RNA-seq、多重免疫荧光	小鼠模型、类器官模型	基因表达数据、空间转录组数据、免疫荧光图像	12例单细胞测序样本、4例空间转录组样本、87例RNA-seq验证样本
17	2025-06-11	Temporal single-cell sequencing analysis reveals that GPNMB-expressing macrophages potentiate muscle regeneration 2025-Jun-09, Experimental & molecular medicine DOI:10.1038/s12276-025-01467-4 PMID:40490493	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序揭示了表达GPNMB的巨噬细胞在肌肉再生中的关键作用	发现了一种表达GPNMB的巨噬细胞亚群，其在巨噬细胞介导的肌肉再生中发挥关键作用，并证明了GPNMB对肌肉细胞的直接影响	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探究巨噬细胞在骨骼肌修复中的表型多样性及其在肌肉再生中的作用	骨骼肌中的巨噬细胞	单细胞测序	肌肉损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	不同时间点的骨骼肌单细胞
18	2025-06-11	Mapping the role of cytokine signaling at single-cell and structural resolution in uveal melanoma 2025-Jun-09, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-025-00337-3 PMID:40490526	研究论文	通过单细胞RNA测序和结构生物学方法，研究细胞因子信号在葡萄膜黑色素瘤中的角色及其预后和治疗意义	结合单细胞RNA测序与结构生物学方法，首次揭示ISG20在葡萄膜黑色素瘤中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力	样本量较小，仅包括8个原发性和3个转移性葡萄膜黑色素瘤样本	理解葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的复杂性并探索新的治疗策略	葡萄膜黑色素瘤（UVM）患者的原发性和转移性肿瘤组织	数字病理学	葡萄膜黑色素瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、AlphaFold 2技术、分子对接分析	Cox回归和LASSO风险模型	RNA测序数据	8个原发性葡萄膜黑色素瘤眼组织和3个肝脏转移性葡萄膜黑色素瘤样本
19	2025-06-11	Prognostic and immune modulatory effects of ammonia-induced cell death in head and neck squamous cell carcinoma 2025-Jun-09, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02508-0 PMID:40490575	research paper	该研究探讨了氨诱导的细胞死亡（ACD）在头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的预后意义和免疫调节作用	首次将氨代谢与HNSC的肿瘤进展和免疫抑制联系起来，并开发了一个新的预后模型	研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证	研究HNSC中ACD的预后相关性和免疫学效应	头颈部鳞状细胞癌（HNSC）	digital pathology	head and neck squamous cell carcinoma	random survival forests (RSF), ssGSEA, TIP analysis, single-cell RNA sequencing	RSF	transcriptomic data	NA
20	2025-06-11	Single-cell chromatin accessibility profiling reveals regulatory mechanisms and evolution in pig brains 2025-Jun-09, BMC biology IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s12915-025-02263-2 PMID:40490756	研究论文	通过单细胞染色质可及性分析揭示猪脑的调控机制和进化	首次对家猪和野猪大脑进行单细胞染色质可及性分析，揭示了细胞类型特异性调控景观和少突胶质细胞的发育轨迹	样本量相对有限，仅分析了71,798个细胞	研究猪脑的调控机制及其进化特征	家猪和野猪的大脑皮层和小脑	生物医学	阿尔茨海默病	单细胞染色质可及性分析，单细胞RNA测序	NA	单细胞测序数据	71,798个细胞（来自家猪和野猪的大脑皮层和小脑）