单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-07-04	Microglial intervention in ischemic stroke: Roles and intervention strategies 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01166 PMID:39995094	综述	本文综述了微胶质细胞在缺血性脑卒中中的双重作用及潜在干预策略	探讨了微胶质细胞动态激活和极化状态对疾病进程的影响，并提出了针对关键通路的实验性治疗策略	NA	研究微胶质细胞在缺血性脑卒中中的作用及干预策略	微胶质细胞及其在缺血性脑卒中中的功能状态	神经科学	缺血性脑卒中	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	NA	NA
2	2025-07-04	Blood-brain barrier disruption and neuroinflammation in the hippocampus of a cardiac arrest porcine model: Single-cell RNA sequencing analysis 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01269 PMID:40146000	研究论文	通过单细胞RNA测序分析，研究了心脏骤停猪模型中血脑屏障破坏和海马神经炎症的细胞和分子机制	首次使用单细胞转录组学揭示了心脏骤停后海马区的细胞亚群变化、细胞通讯网络改变及新的分子机制，特别是发现了高表达S100A8的激活小胶质细胞亚群	研究仅观察了心脏骤停后6和24小时的变化，缺乏更长时间点的数据	探索心脏骤停后脑损伤的细胞和分子机制，寻找神经保护和修复的新靶点	心室颤动诱导心脏骤停的猪模型海马组织	神经科学	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Western blotting、定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)、免疫荧光染色	猪心脏骤停模型	单细胞转录组数据	心脏骤停猪模型在自主循环恢复后6和24小时的海马组织样本，以及假手术对照组
3	2025-07-04	A single-cell landscape of the regenerating spinal cord of zebrafish 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01163 PMID:40326988	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，描绘了斑马鱼脊髓损伤后不同阶段的细胞群变化，揭示了脊髓再生的分子和细胞机制	首次在单细胞水平上解析了斑马鱼脊髓再生过程中的细胞亚群动态变化和分子调控网络	研究仅聚焦于斑马鱼模型，未验证这些发现在哺乳动物中的适用性	探索斑马鱼脊髓再生的分子和细胞机制	斑马鱼脊髓损伤模型	再生医学	脊髓损伤	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	NA
4	2025-07-04	Uncovering common transcriptional features shared by mature peripheral blood PMN-MDSCs and tumor-infiltrating neutrophils in humans 2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2025.2521396 PMID:40590753	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类外周血中的成熟PMN-MDSCs与肿瘤浸润中性粒细胞在转录特征上的相似性	首次通过scRNA-seq技术识别出PMN-MDSCs与TANs共享的特定细胞簇及其转录特征	研究样本主要来自非小细胞肺癌患者和G-CSF治疗供体，可能限制结果的普遍性	探索人类循环mPMN-MDSCs与肿瘤相关中性粒细胞(TANs)之间的转录相似性	非小细胞肺癌患者的循环mPMN-MDSCs和肿瘤相关中性粒细胞	肿瘤免疫学	非小细胞肺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	非小细胞肺癌患者和G-CSF治疗供体的样本
5	2025-07-04	Single-cell transcriptomic profiling of the whole colony of Botrylloides diegensis: insights into tissue specialization and blastogenesis 2025-Oct-15, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.204265 PMID:40406997	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术对Botrylloides diegensis整个群体进行了转录组分析，揭示了细胞异质性和组织特异性标记	首次对Botrylloides diegensis整个群体进行单细胞转录组测序，识别了29个主要细胞簇，并发现了胃上皮特定区域的独特标记基因	研究仅基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的验证	解析Botrylloides diegensis群体的细胞异质性和组织特异性，为发育和再生研究提供资源	Botrylloides diegensis群体（包括个体、芽体和血管被膜）	发育生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq），原位杂交	NA	单细胞转录组数据	一个完整的Botrylloides diegensis群体（包含多种组织类型）
6	2025-07-04	Single-cell landscape of immunological responses in patients with juvenile idiopathic arthritis 2025-Sep, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101577 PMID:40605976	研究论文	该研究通过单细胞转录组分析，探讨了青少年特发性关节炎（JIA）患者免疫细胞的异质性及其在疾病中的作用	揭示了JIA患者中干扰素和急性炎症反应的普遍紊乱，特别是在系统性JIA患者中更为显著，并识别了与疾病进展相关的独特配体-受体对	样本量较小（14名JIA患者和4名健康个体），可能限制了结果的普遍性	理解青少年特发性关节炎（JIA）患者免疫系统的细胞异质性及其功能变化	青少年特发性关节炎（JIA）患者和健康个体的外周血免疫细胞	数字病理学	青少年特发性关节炎	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	14名JIA患者和4名健康个体的外周血样本
7	2025-07-04	Blood and urine-based biomarkers in prostate cancer: Current advances, clinical applications, and future directions 2025-Sep, The journal of liquid biopsy DOI:10.1016/j.jlb.2025.100305 PMID:40606769	综述	本文全面概述了前列腺癌(PCa)当前和新兴的诊断、预后和预测性生物标志物，强调了它们的临床应用和未来前景	介绍了新兴技术如机器学习和单细胞组学在生物标志物发现中的应用，以及新型生物标志物如外泌体RNA和免疫相关标志物的潜力	尽管提出了多种新型生物标志物，但大多数仍处于研究阶段，尚未在临床实践中广泛应用	提高前列腺癌的早期检测、个性化治疗和监测水平	前列腺癌患者	数字病理学	前列腺癌	液体活检、单细胞RNA测序、空间转录组学	机器学习模型(如复制应激特征RSS)	血液和尿液样本数据、ctDNA、CTC、外泌体RNA	NA
8	2025-07-04	Exploring the untapped potential of single-cell and spatial omics in plant biology 2025-Aug, The New phytologist DOI:10.1111/nph.70220 PMID:40398874	综述	本文探讨了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的未开发潜力及其当前应用	强调了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的创新应用及其未来潜力	植物特有的技术挑战和资源限制，如细胞壁复杂性和抗体资源有限	推动植物科学领域的重大发现，深化对植物生物学的理解	植物细胞和组织	植物生物学	NA	单细胞转录组、染色质可及性分析、空间转录组学、多组学、谱系追踪、分子记录、高通量遗传和化学扰动表型分析	NA	分子和细胞数据	多个模型植物物种的细胞图谱
9	2025-07-04	Tracing Early Migratory Neurons in the Developing Nose Using Contactin-2 (Cntn2) CreERT2 2025-Aug, Genesis (New York, N.Y. : 2000) DOI:10.1002/dvg.70021 PMID:40580015	research paper	研究通过生成可诱导的Cntn2CreERT2小鼠系，追踪发育中鼻子内早期迁移神经元	利用Cntn2CreERT2小鼠系作为时间控制嵌合操作特定神经元群体的有效工具	可用的分子标记数量有限，可能限制了对早期迁移神经元的全面追踪和功能操作	研究发育中鼻子内早期迁移神经元的追踪和功能操作	啮齿动物发育中鼻子内的神经元，特别是嗅觉基板早期神经源性波中形成的神经元	神经科学	NA	单细胞RNA测序，可诱导CreERT2小鼠系	Cntn2CreERT2小鼠模型	基因表达数据	NA
10	2025-07-04	Cellular Landscape of Synovial Chondromatosis Synovium Revealed by Single-Cell RNA Sequencing 2025-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202500034RR PMID:40600952	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示滑膜软骨瘤病滑膜的细胞景观	首次使用单细胞RNA测序技术全面描述了滑膜软骨瘤病（SC）滑膜组织的细胞组成和转录组特征，发现了新的成纤维细胞亚群和巨噬细胞表型转变，以及增殖性免疫细胞群体的动态变化	样本量可能有限（未明确说明具体数量），且为观察性研究，未进行功能验证	解析滑膜软骨瘤病的细胞基础及其发病机制	健康个体和滑膜软骨瘤病患者的滑膜组织	单细胞组学	滑膜软骨瘤病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	健康个体和SC患者的滑膜组织（具体数量未说明）
11	2025-07-04	Single-cell analysis of the decidua unveils the mechanism of anti-inflammatory exosomes for chorioamnionitis in nonhuman primates 2025-Jul-04, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adp0467 PMID:40601753	研究论文	本研究通过单细胞分析揭示了携带超抑制IκB（srIκB）的外泌体在非人灵长类动物绒毛膜羊膜炎中的抗炎机制	首次在非人灵长类动物模型中验证了Exo-srIκB对绒毛膜羊膜炎的治疗潜力，并通过单细胞RNA测序揭示了其作用机制	研究仅限于非人灵长类动物模型，尚未进行人类临床试验	探索Exo-srIκB对绒毛膜羊膜炎的治疗潜力及其作用机制	怀孕的非人灵长类动物及其胎盘组织	生物医学	绒毛膜羊膜炎	单细胞RNA测序、批量RNA测序	LPS诱导的绒毛膜羊膜炎非人灵长类动物模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量，但涉及非人灵长类动物的胎盘组织
12	2025-07-04	Large-scale dependency and drug screens to characterize the therapeutic vulnerabilities of multiple myeloma with 1q 2025-Jul-03, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024025102 PMID:40073369	研究论文	通过大规模依赖性和药物筛选，系统性表征了1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性，并发现其对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性增加	首次系统性揭示了1q+多发性骨髓瘤对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性，并阐明了其作用机制	研究主要基于体外实验，尚未进行临床验证	开发针对1q+多发性骨髓瘤的靶向治疗策略	1q+多发性骨髓瘤患者	肿瘤学	多发性骨髓瘤	大规模依赖性筛选、药物筛选、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
13	2025-07-04	IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes 2025-Jul-03, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027689 PMID:40163892	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了特发性多中心Castleman病（iMCD）患者的免疫景观，揭示了IL-6和IFN-II信号通路在疾病进展中的关键作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了iMCD患者中CCL单核细胞通过IFN-II信号与NK/NKT细胞相互作用，以及IFN-γ水平与疾病严重程度和治疗抵抗的正相关性	样本量较小（15例iMCD患者和4例健康对照），且部分发现需要在大规模独立队列中进一步验证	深入了解iMCD的免疫机制，建立早期预后分层并发现新的治疗靶点	特发性多中心Castleman病（iMCD）患者的外周血单个核细胞（PBMCs）、淋巴结和骨髓样本	免疫学	特发性多中心Castleman病（iMCD）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	15例iMCD患者和4例健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs），以及部分淋巴结和骨髓样本
14	2025-07-04	N6-methyladenosine-mediated upregulation of MANF promotes ER stress resistance in renal cell carcinoma 2025-Jul-03, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07798-4 PMID:40603319	研究论文	本研究揭示了MANF通过m6A修饰上调促进肾细胞癌（RCC）中内质网应激抵抗的新机制	首次发现MANF通过m6A修饰调控在RCC进展中的作用，并阐明其通过抑制IRE1α磷酸化缓解内质网应激的具体机制	未涉及MANF靶向治疗在动物模型或临床中的验证	探索肾细胞癌治疗抵抗的新机制和潜在治疗靶点	肾细胞癌（RCC）及其近端小管细胞前体	肿瘤生物学	肾细胞癌	单细胞转录组测序、m6A修饰分析	NA	转录组数据	未明确说明样本数量（包含RCC样本及其前体细胞）
15	2025-07-04	Choroid Plexus Fibroblast-ILC2 Niche Promotes Adult Hippocampal Neurogenesis after Traumatic Brain Injury 2025-Jul-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415984 PMID:40605604	研究论文	本文研究了创伤性脑损伤（TBI）后脉络丛（ChP）中2型固有淋巴细胞（ILC2）的积累及其对神经发生的影响	首次揭示了ILC2通过优化免疫微环境和促进神经发生在TBI后的潜在治疗作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨TBI后脉络丛的结构变化和免疫细胞浸润特征及其对神经发生的影响	创伤性脑损伤（TBI）小鼠模型	神经科学	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序、单核RNA测序、组织学分析	小鼠模型	RNA测序数据、组织学数据	未明确提及具体样本数量
16	2025-07-04	Cathepsin K Aggravates Pulmonary Fibrosis Through Promoting Fibroblast Glutamine Metabolism and Collagen Synthesis 2025-Jul-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413017 PMID:40605618	研究论文	本文研究了组织蛋白酶K（CTSK）如何通过促进成纤维细胞的谷氨酰胺代谢和胶原合成加剧肺纤维化	首次发现CTSK通过SNX9介导的内吞作用促进TGF-β1诱导的SMAD3激活，进而上调GLS1和谷氨酰胺富集，最终增加胶原合成	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究肺纤维化中成纤维细胞异常活化的触发因素及其分子机制	肺纤维化小鼠模型和患者血清样本	分子病理学	肺纤维化	蛋白质组学、单细胞测序	NA	蛋白质组数据、单细胞测序数据、血清生化指标	小鼠模型和患者血清样本（具体数量未明确说明）
17	2025-07-04	Single-cell transcriptomics reveals depletion and dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-specific Th1 and Th17 cells early after acquisition of HIV 2025-Jul-03, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1 DOI:10.1093/infdis/jiaf354 PMID:40605619	研究论文	该研究通过单细胞转录组学揭示了HIV感染早期对结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭和功能失调	首次在HIV感染早期阶段，通过单细胞RNA测序技术揭示了结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞的耗竭和功能失调机制	研究样本量有限，且仅关注了HIV感染早期的变化	探究HIV感染如何影响对结核分枝杆菌的CD4 T细胞免疫应答	HIV感染者和非感染者的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞	免疫学	结核病/HIV感染	流式细胞术、单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	一组HIV感染者和非感染者的样本（具体数量未明确说明）
18	2025-07-04	Engineering a Lipid Nanoparticle with Atypical Calcium Crystal Structure for Enhanced IFNβ-Mediated Immunotherapy 2025-Jul-03, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202419870 PMID:40605669	研究论文	本研究开发了一种具有非典型晶体结构和pH响应特性的纳米材料NanoCa，用于增强IFNβ介导的免疫治疗	发现NanoCa通过Ca-calcineurin-NFATc2-PKCβ-IRF3信号通路触发干扰素，增强抗肿瘤免疫反应	未明确提及具体局限性	探索金属离子通过干扰素激活促进树突状细胞成熟的机制，并开发新型抗肿瘤免疫治疗策略	钙磷酸盐脂质体纳米材料(NanoCa)及其在肿瘤模型中的免疫调节作用	纳米医学	癌症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	CT26肿瘤模型	基因表达数据	多种肿瘤模型(具体数量未明确)
19	2025-07-04	Lamin A/C Expression in Hematopoietic Cells Declines During Human Aging and Constrains Atherosclerosis in Mice 2025-Jul-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322893 PMID:40605747	research paper	研究探讨了人类衰老过程中造血细胞中Lamin A/C表达下降的现象及其对小鼠动脉粥样硬化的影响	首次在体内模型中研究了Lamin A功能增益对动脉粥样硬化的影响，并揭示了Lamin A/C作为年龄相关动脉粥样硬化的新型调节因子	研究主要基于小鼠模型，人类数据的直接应用可能存在限制	探究衰老过程中造血细胞Lamin A/C表达变化及其对动脉粥样硬化的影响	人类循环白细胞和小鼠模型	生物医学	心血管疾病	流式细胞术、单细胞RNA测序、活体显微镜检查	Lmna-null小鼠和Lmnatg小鼠模型	基因表达数据、图像数据	未明确说明样本数量，涉及人类白细胞和小鼠模型
20	2025-07-04	Single‑cell RNA sequencing reveals TMEM71 as an immunomodulatory biomarker predicting immune checkpoint blockade response in breast cancer 2025-Jul-03, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-03068-z PMID:40608205	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了TMEM71作为预测乳腺癌免疫检查点阻断反应的免疫调节生物标志物	首次揭示了TMEM71在乳腺癌中的免疫调节作用及其作为治疗反应预测标志物的潜力	TMEM71的具体作用机制尚未完全阐明	探索TMEM71在乳腺癌中的预后价值、免疫相关性及治疗意义	乳腺癌	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序, ssGSEA, CIBERSORT, GO, KEGG, GSEA	NA	转录组数据, 单细胞RNA-seq数据	来自TCGA、GTEx、GEO和公共scRNA-seq数据集的数据