单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-09-08	Decoding coal-induced pulmonary endothelial injury using single-cell omics 2025-Sep-05, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118989 PMID:40914082	研究论文	利用单细胞组学技术解析煤尘暴露引起的肺内皮细胞损伤机制	首次通过单细胞RNA测序揭示煤尘暴露下肺内皮细胞亚群的异质性损伤特征及细胞间通讯机制	研究仅基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证	探究煤工尘肺中肺内皮细胞损伤的分子机制	煤尘暴露小鼠模型的肺组织内皮细胞	单细胞组学	煤工尘肺	scRNA-seq（单细胞RNA测序），CellChat分析	NA	单细胞转录组数据	煤尘暴露组和对照组小鼠肺组织（具体数量未明确说明）
2	2025-09-08	Single-cell analysis of human fibrous dysplasia bone reveals a fibrotic transcriptome and GNAS variants in endothelial, perivascular, and stromal cells 2025-Sep-04, American journal of human genetics IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.ajhg.2025.07.018 PMID:40848713	研究论文	通过单细胞RNA测序分析人类纤维性结构不良骨组织，揭示GNAS变异在多种非成骨细胞谱系中的存在及纤维化转录组特征	首次发现GNAS c.602G>A和c.601C>T变异不仅存在于骨骼基质细胞，还存在于内皮细胞和周细胞中，并鉴定出跨细胞谱系的共同纤维化转录特征	NA	探究体细胞嵌合现象在纤维性结构不良（FD）疾病中的细胞和分子机制	人类FD和非FD骨组织中的非造血细胞	单细胞基因组学	纤维性结构不良	单细胞RNA测序, BaseScope基因分型	NA	单细胞转录组数据	NA
3	2025-09-08	S100A12 correlates with inflammatory and pain symptoms in patients with Chronic Prostatitis/Chronic Pelvic Pain Syndrome 2025-Sep-04, The journal of pain IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.jpain.2025.105536 PMID:40914239	研究论文	本研究探讨了S100A12作为慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征（CP/CPPS）炎症和疼痛相关症状的潜在生物标志物	首次发现S100A12在CP/CPPS患者精浆和血清中显著升高，并与炎症标志物、疼痛评分及精子质量参数相关，揭示了其作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力	回顾性病例对照研究设计，样本量较小（90例患者），需要更大规模的前瞻性研究验证	研究S100A12作为连接炎症与神经性疼痛的潜在生物标志物在CP/CPPS中的作用	90名CP/CPPS患者和90名年龄匹配的健康对照	生物标志物研究	慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征	单细胞RNA测序分析，接收者操作特征分析	NA	生物样本数据（精浆、血清、尿液），临床评分数据	90例CP/CPPS患者和90例健康对照
4	2025-09-08	Single-cell transcriptomic atlas of human retina from Chinese donors reveals population-specific cellular diversity 2025-Sep-04, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2025.110623 PMID:40914339	研究论文	构建首个中国人群来源的人类视网膜单细胞转录组图谱，揭示种群特异性细胞多样性	首次提供中国人群视网膜单细胞RNA测序数据，填补亚洲人群视网膜转录组资源的空白	样本量相对有限（18个视网膜标本），未与其他族群数据直接比较	解析中国人群视网膜细胞组成和功能特性	人类视网膜组织（来自活体捐赠者和遗体捐赠者）	单细胞转录组学	眼科疾病	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	约29万个活细胞，来自18个新鲜视网膜标本
5	2025-09-08	S100A4 Facilitates Radiation-Induced Tumor Repopulation by Driving Polyploid Giant Cancer Cells Budding 2025-Sep-04, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.218017 PMID:40914345	研究论文	本研究揭示了S100A4通过驱动多倍体巨癌细胞出芽促进放疗后肿瘤再生的分子机制	首次发现S100A4-IRF3-ISG15/BST2信号轴调控PGCCs出芽过程，并提出靶向RAGE受体可抑制这一过程	研究主要基于结直肠癌模型，在其他癌症类型中的普适性需进一步验证	探究放疗后多倍体巨癌细胞（PGCCs）出芽再生的分子调控机制	结直肠癌细胞及PGCCs	肿瘤生物学	结直肠癌	单细胞转录组学、功能基因组学、纵向模型	NA	基因表达数据	NA
6	2025-09-08	Neuro-Immuno-Stromal Context in Colorectal Cancer: An Enteric Glial Cell-Driven Prognostic Model via Machine Learning Predicts Survival, Recurrence, and Therapy Response 2025-Sep-04, Experimental cell research IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114733 PMID:40914542	研究论文	通过机器学习构建基于肠胶质细胞相关基因的预后模型，用于预测结直肠癌患者的生存、复发和治疗反应	首次整合肠胶质细胞(EGC)和肿瘤相关基因表达，利用随机生存森林算法构建预后模型，并关联免疫微环境与治疗反应	需要进一步验证临床适用性	开发并验证结直肠癌预后预测模型	结直肠癌患者	机器学习	结直肠癌	RNA测序（bulk和单细胞）	RSF随机森林	基因表达数据	NA
7	2025-09-08	Standardizing single-cell approaches to osteoarthritis: Toward a comprehensive cellular atlas 2025-Sep-04, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1 DOI:10.1016/j.joca.2025.08.016 PMID:40914548	研究论文	本文探讨利用单细胞RNA测序技术标准化骨关节炎研究，以构建全面的细胞图谱	提出标准化单细胞研究方法以整合异构数据，解决早期scRNA-Seq数据集碎片化问题	依赖现有早期数据集，可能存在数据质量和一致性限制	建立标准化的单细胞研究框架，完善骨关节炎的细胞图谱构建	人类骨关节炎关节组织（重点关注关节软骨）	单细胞组学	骨关节炎	scRNA-Seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	多个早期数据集（具体样本数量未明确说明）
8	2025-09-08	Residual disease in NPM1-mutated acute myeloid leukemia 2025-Sep-03, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry DOI:10.1016/j.cca.2025.120586 PMID:40912477	综述	本文综述了NPM1突变急性髓系白血病中微小残留病（MRD）监测的技术进展与挑战	系统评估了qPCR、NGS、ddPCR等传统技术及CRISPR-Cas9、单细胞测序、人工智能等新兴技术在MRD监测中的创新应用	人工智能工具在临床实践中的整合受限，主要由于数据质量、算法偏见、基础设施不足及缺乏配套监管框架	评估分子监测技术在NPM1突变AML微小残留病管理中的临床应用与优化策略	NPM1基因突变的急性髓系白血病患者	数字病理	白血病	qPCR, NGS, ddPCR, CRISPR-Cas9, 单细胞测序	AI/ML（人工智能/机器学习）	分子检测数据	NA
9	2025-09-08	Polymer-based chemo-immunotherapy: Combining immunogenic cell death induction and PD-L1 blockade enhances antitumor immunity in melanoma 2025-Sep-02, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1 DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114193 PMID:40907793	研究论文	本研究开发了一种基于聚合物的化学免疫疗法，结合免疫原性细胞死亡诱导和PD-L1阻断，用于增强黑色素瘤的抗肿瘤免疫	使用可降解HPMA共聚物载体同时递送化疗药物和PD-L1肽拮抗剂，实现了协同免疫激活且避免了传统抗体的自身免疫副作用	研究主要基于B16F10黑色素瘤模型，尚未在更广泛的肿瘤类型或临床环境中验证	开发更安全有效的黑色素瘤免疫治疗方法，克服现有免疫检查点抑制剂单药治疗的局限性	黑色素瘤细胞系B16F10和小鼠模型	癌症免疫治疗	黑色素瘤	聚合物药物递送系统、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、免疫细胞表型数据	小鼠模型实验（具体数量未明确说明）
10	2025-09-08	Assessing the impact of perfluoroalkyl substances on liver health: a comprehensive study using multi-donor human liver spheroids 2025-Sep-02, Environment international IF:10.3Q1 DOI:10.1016/j.envint.2025.109763 PMID:40914107	研究论文	使用多供体人肝球体模型评估全氟烷基物质对肝脏健康的影响及其机制	首次在包含多种细胞类型的人肝球体模型中，通过单细胞RNA测序揭示PFAS的化合物和性别特异性肝毒性机制	研究仅使用体外肝球体模型，未进行体内验证；浓度固定为20µM，可能无法反映真实环境暴露水平	阐明不同PFAS化合物导致人类肝功能障碍的具体细胞和分子机制	多供体来源的人肝球体（包含肝细胞、T/NK细胞和Kupffer细胞等多种细胞类型）	毒理学	肝脏疾病	单细胞RNA测序，脂质染色	NA	转录组数据，图像数据	多供体人肝球体模型（具体样本数未明确说明）
11	2025-09-08	Interferon Epsilon Loss Is Elusive 9p21 Link to Immune-Cold Tumors, Resistant to Immune Checkpoint Therapy, and Endogenous CXCL9/10 Induction 2025-Sep, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1 DOI:10.1016/j.jtho.2024.12.020 PMID:39725169	研究论文	本研究揭示9号染色体短臂（9p）缺失通过干扰素ε（IFNϵ）缺失导致免疫冷肿瘤及免疫检查点治疗抵抗的机制	首次明确IFNϵ是9p21缺失介导免疫逃逸的关键因子，并解析其通过抑制CXCL9/10-CXCR3轴导致CD8+T细胞浸润减少的机制	IFNϵ丢失与肿瘤免疫微环境模式存在显著组织特异性（34种肿瘤类型中仅4种Z值≤1.95），普适性需进一步验证	阐明9p缺失导致免疫检查点治疗抵抗的分子机制	人类肿瘤样本、细胞系及小鼠模型（包括KPC胰腺癌模型和KPL-3M非鳞状NSCLC模型）	肿瘤免疫学	多种癌症（包括头颈鳞癌、非小细胞肺癌、黑色素瘤等）	空间单细胞RNA测序（scRNA-seq）、拷贝数分析、中介分析	NA	基因组数据、转录组数据、单细胞数据	13项研究报告（涵盖36个免疫治疗队列）及多种小鼠模型
12	2025-09-08	Resolving the spatial and cellular architecture of intra-tumor heterogeneity by multi-region dissection of lung adenocarcinoma 2025-Sep, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao DOI:10.1016/j.jgg.2025.02.006 PMID:39993622	研究论文	通过多区域肺腺癌活检的空间转录组学和单细胞RNA测序数据，解析肿瘤内异性的空间和细胞结构	揭示了两种癌细胞亚群（Cancer_c1和Cancer_c2）在肿瘤核心和边缘的不同空间分布及与免疫细胞（B细胞、巨噬细胞、CD8 T细胞）的共定位相互作用机制	NA	阐明肺腺癌肿瘤微环境中空间异质性的驱动因素及癌细胞与免疫细胞的相互作用	肺腺癌（LUAD）患者的多区域活检样本（肿瘤核心、肿瘤边缘、正常区域）	空间转录组学	肺腺癌	空间转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	空间转录组数据、单细胞RNA测序数据	多区域LUAD活检样本（具体数量未明确说明）
13	2025-09-08	Dissecting key contributions of TH2 and TH17 cytokines to atopic dermatitis pathophysiology 2025-Sep, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2025.05.007 PMID:40409379	研究论文	本研究通过体外模型揭示了TH2和IL-22细胞因子在特应性皮炎病理中的关键作用，并探索了联合药物治疗的潜力	首次结合单细胞空间转录组学分析，明确IL-22在TH2驱动的炎症环境中对表皮屏障功能障碍和分化缺陷的协同加剧作用，并验证联合靶向治疗的修复效果	研究基于体外人类表皮等效模型，可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境	解析特应性皮炎相关细胞因子对表皮疾病特征的具体驱动机制	原代和永生化角质形成细胞衍生的人类表皮等效模型	皮肤免疫学	特应性皮炎	单细胞空间转录组学、形态功能分析、转录组分析	体外细胞刺激模型	转录组数据、形态学数据、功能数据	人类角质形成细胞衍生表皮等效模型（具体数量未明确说明）
14	2025-09-08	Single-Cell and Spatial Transcriptomic Profiling of Penile Squamous Cell Carcinoma Reveals Dynamics of Tumor Differentiation and Immune Microenvironment 2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202500216 PMID:40470730	研究论文	通过单细胞和空间转录组技术解析阴茎鳞状细胞癌的分化动态和免疫微环境特征	首次整合单核RNA测序和高分辨率空间转录组学揭示PSCC中独立于HPV感染状态的分化轨迹，并发现具有侵袭性特征的Tum_1空间亚型	未明确说明样本规模及临床验证的局限性	探究阴茎鳞状细胞癌的发育轨迹和肿瘤微环境特征	阴茎鳞状细胞癌组织及肿瘤微环境	空间转录组学	阴茎癌	单核RNA测序(snRNA-seq), 空间转录组学	NA	单细胞转录组数据, 空间基因表达数据	NA
15	2025-09-08	Single-Cell RNA Sequencing Delineates Renal Anti-Fibrotic Mechanisms Mediated by TRPC6 Inhibition 2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202501175 PMID:40525246	研究论文	通过单细胞RNA测序技术揭示TRPC6抑制在慢性肾病中抗肾纤维化的细胞机制	首次发现并命名新型内皮细胞亚群ECRIN，阐明其通过VEGF和GAS信号通路调控炎症网络，并揭示TRPC6抑制通过Prnp转录因子网络缓解纤维化	研究主要基于小鼠模型和有限患者样本，临床转化需进一步验证	探究TRPC6通道抑制在慢性肾病中抗纤维化的分子机制	UUO模型小鼠、慢性缺血再灌注损伤模型小鼠以及CKD患者的肾脏样本	单细胞组学	慢性肾病	scRNA-Seq（单细胞RNA测序）、免疫荧光、Western blot	NA	单细胞转录组数据、蛋白质表达数据	小鼠疾病模型及CKD患者肾脏样本（具体数量未明确说明）
16	2025-09-08	NDRG1-Driven Lactate Accumulation Promotes Lung Adenocarcinoma Progression Through the Induction of an Immunosuppressive Microenvironment 2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202501238 PMID:40539245	研究论文	本研究揭示NDRG1通过促进乳酸积累诱导免疫抑制微环境，从而驱动肺腺癌进展	首次发现NDRG1通过稳定LDHA抑制其泛素化来增强糖酵解和乳酸积累，并阐明乳酸通过组蛋白H3K18乳酸化修饰加剧免疫抑制的新机制	NA	探究NDRG1在肺腺癌免疫微环境调控中的作用及机制	肺腺癌患者样本和临床数据	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、全基因组关联分析（GWAS）	NA	基因组数据、临床数据	30例肺腺癌样本单细胞测序，29,863例患者和55,586例对照的GWAS数据，220例肺腺癌患者临床数据
17	2025-09-08	An integrated single-nucleus and spatial transcriptomics atlas reveals the molecular landscape of the human hippocampus 2025-Sep, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-025-02022-0 PMID:40739059	研究论文	本研究通过整合单核和空间转录组数据，构建了人类海马体的分子图谱，揭示了其细胞类型的空间组织和功能特征	首次将空间转录组学（SRT）和单核RNA测序（snRNA-seq）数据整合，并利用NMF和标签转移方法解析海马体细胞类型的空间转录组特征	研究仅基于10名神经典型成人捐赠者的样本，样本量相对有限	解析人类海马体细胞类型的分子特征和空间组织	人类前海马体组织	空间转录组学	NA	空间转录组学（SRT）、单核RNA测序（snRNA-seq）、非负矩阵分解（NMF）	NMF	空间转录组数据、单细胞RNA测序数据	10名神经典型成人捐赠者的海马体样本
18	2025-09-08	Metabolic Stress-Induced Choline Kinase α (CHKA) Activation in Endothelial Subpopulation Contributes to Diabetes-Associated Microvascular Dysfunction 2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202417045 PMID:40548950	研究论文	本研究探讨代谢应激诱导的胆碱激酶α（CHKA）在内皮细胞亚群中的激活对糖尿病相关微血管功能障碍的作用	首次通过单细胞RNA测序鉴定视网膜血管中三个不同的内皮细胞亚群，并发现CHKA通过NAD-SIRT1-Notch信号通路调控内皮功能障碍的新机制	机制研究主要基于小鼠模型，临床样本分析虽提供支持但需进一步验证	阐明糖尿病微血管功能障碍的代谢调控机制和内皮细胞功能异质性	内皮细胞亚群、糖尿病小鼠模型、临床样本	分子生物学	糖尿病	scRNA-seq、基因沉默、Mendelian randomization	NA	基因表达数据、临床数据	糖尿病小鼠模型及临床样本（具体数量未明确说明）
19	2025-09-08	Recent Advances in Deciphering Normal and Diseased Aortic Valve Biology Using Transcriptomic Technologies 2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70835 PMID:40903834	综述	本文综述了利用转录组学技术（如RNAseq和scRNAseq）解析正常与病变主动脉瓣生物学机制的最新进展	强调瓣膜细胞可塑性、异质性和细胞间相互作用的转录组层面解析，并提出健康基线表征对疾病解读的关键价值	NA	深入理解主动脉瓣结构与功能机制，为钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）的治疗开发提供靶点	主动脉瓣（AV），重点关注瓣膜内皮细胞（VECs）与单核细胞在生理和病理条件下的相互作用	生物信息学	心血管疾病	RNA sequencing (RNAseq), single-cell sequencing (scRNAseq)	NA	转录组数据	NA
20	2025-09-08	Spatial colocalization and molecular crosstalk of myofibroblastic CAFs and tumor cells shape lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma 2025-Sep, PLoS genetics IF:4.0Q1 DOI:10.1371/journal.pgen.1011791 PMID:40906645	研究论文	本研究通过整合多组学数据揭示肌成纤维样癌相关成纤维细胞（myCAFs）与口腔鳞癌细胞的空间共定位及分子互作促进淋巴结转移的机制	首次发现myCAFs与肿瘤细胞在侵袭前沿的空间共定位形成促转移微环境，并鉴定出23基因特征谱可预测淋巴结转移和预后	机制研究主要基于体外共培养和回顾性数据，需进一步体内实验验证	探究口腔鳞癌淋巴结转移的分子机制	口腔鳞癌患者组织样本及细胞模型	数字病理学	口腔鳞癌	bulk基因组/转录组、单细胞转录组、空间转录组分析、免疫组化、体外共培养	NA	基因组数据、转录组数据、空间转录组数据、图像数据	90例侵袭前沿样本（含淋巴结阳性与阴性对照）及公共数据库扩展样本