单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-05-07	Microglial intervention in ischemic stroke: Roles and intervention strategies 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01166 PMID:39995094	综述	本文综述了小胶质细胞在缺血性中风中的双重作用及潜在干预策略	探讨了小胶质细胞动态激活和极化状态对疾病进程和治疗结果的影响，并提出了新的治疗策略	NA	研究小胶质细胞在缺血性中风中的作用及潜在干预策略	小胶质细胞	神经科学	缺血性中风	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	NA	NA
2	2025-05-07	Blood-brain barrier disruption and neuroinflammation in the hippocampus of a cardiac arrest porcine model: Single-cell RNA sequencing analysis 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01269 PMID:40146000	研究论文	通过单细胞RNA测序分析，研究了心脏骤停猪模型中血脑屏障破坏和海马神经炎症的细胞和分子机制	首次使用单细胞转录组分析揭示心脏骤停后海马区的细胞亚群变化、细胞通讯网络改变及新的分子机制，特别是发现了一组表达S100A8的激活小胶质细胞亚群	研究仅观察了心脏骤停后6小时和24小时的变化，缺乏更长时间点的数据	探索心脏骤停后脑损伤的细胞和分子机制，寻找神经保护和修复的新靶点	心室颤动诱导心脏骤停的猪模型海马组织	神经科学	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Western blotting、定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)、免疫荧光染色	猪心脏骤停模型	单细胞转录组数据	心脏骤停猪模型在自主循环恢复后6小时和24小时的海马组织样本，以及假手术对照组样本
3	2025-05-07	A single-cell landscape of the regenerating spinal cord of zebrafish 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01163 PMID:40326988	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了斑马鱼脊髓损伤后不同细胞群的分子和细胞机制	首次在单细胞水平上解析了斑马鱼脊髓再生过程中的细胞亚群动态变化和分子调控网络	研究仅针对斑马鱼模型，结果向哺乳动物(如人类)的转化应用仍需进一步验证	探索斑马鱼脊髓再生的分子和细胞机制	斑马鱼脊髓损伤模型	再生医学	脊髓损伤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	未明确说明样本数量(斑马鱼脊髓组织)
4	2025-05-07	Identification of CXCL13 as a Promising Biomarker for Immune Checkpoint Blockade Therapy and PARP Inhibitor Therapy in Ovarian Cancer 2025-Jun, Molecular biotechnology IF:2.4Q3 DOI:10.1007/s12033-024-01207-5 PMID:38856873	研究论文	该研究通过分析公共数据库和实验验证，发现CXCL13可作为卵巢癌免疫检查点阻断疗法和PARP抑制剂疗法的潜在生物标志物	首次发现CXCL13在HRD肿瘤中显著上调，并证实其与免疫细胞浸润和新抗原负荷正相关，为卵巢癌免疫治疗提供了新的生物标志物视角	研究主要基于公共数据库分析，需要更多独立临床队列验证CXCL13的预测价值	探索卵巢癌免疫检查点阻断疗法的预测性生物标志物	卵巢癌患者肿瘤样本	数字病理学	卵巢癌	基因组测序、免疫组化、单细胞测序	NA	基因组数据、临床数据、单细胞测序数据	TCGA、ICGC、GEO等公共数据库样本及独立验证队列
5	2025-05-07	A Case-Driven Multi-Omics Analysis for Longitudinal Ibrutinib Response Evaluation of Patients With Chronic Lymphocytic Leukemia 2025-Jun, European journal of haematology IF:2.3Q2 DOI:10.1111/ejh.14397 PMID:39988467	研究论文	通过多组学方法评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼的纵向反应	利用单细胞转录组学等多组学方法，首次在分子水平上探索了伊布替尼治疗期间克隆惰性的机制	研究样本量较小（仅2名患者），可能限制结果的普遍性	评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼治疗的纵向分子反应	接受伊布替尼单药治疗的慢性淋巴细胞白血病患者	数字病理学	慢性淋巴细胞白血病	单细胞转录组学、多组学分析	NA	DNA和RNA水平的多组学数据	2名患者的血液样本
6	2025-05-07	Dual cytokine-engineered macrophages rejuvenate the tumor microenvironment and enhance anti-PD-1 therapy in renal cell carcinoma 2025-May-27, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114725 PMID:40294469	研究论文	开发了一种双细胞因子工程化的巨噬细胞，用于重编程肾细胞癌的肿瘤微环境并增强抗PD-1治疗的响应	使用双细胞因子（IL-12和CXCL-9）工程化的巨噬细胞，能够重塑肿瘤微环境并显著增强抗PD-1治疗的效果	研究尚未涉及临床转化后的长期效果和安全性评估	克服肾细胞癌对检查点抑制剂的耐药性，提高抗PD-1治疗的疗效	肾细胞癌（RCC）的肿瘤微环境（TME）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）	肿瘤免疫治疗	肾细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
7	2025-05-07	Loss of ADAP1/CentA1 Protects Against Autoimmune Demyelination 2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202403078R PMID:40326762	研究论文	研究发现ADAP1/CentA1蛋白在CNS自身免疫中的作用，并揭示其在EAE模型中的保护机制	首次揭示ADAP1/CentA1在CNS自身免疫中的新功能，特别是在EAE模型中的保护作用	研究主要基于小鼠模型，人类MS中的具体机制仍需进一步验证	探究ADAP1/CentA1在CNS自身免疫疾病中的作用机制	ADAP1/CentA1缺陷小鼠及EAE模型	神经免疫学	多发性硬化症	scRNA-seq	EAE小鼠模型	基因表达数据	ADAP1/CentA1缺陷小鼠及对照小鼠
8	2025-05-07	Single-cell elderly blood-CSF atlas implicates peripherally influenced immune dysregulation in normal pressure hydrocephalus 2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2412159122 PMID:40324076	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术构建了特发性正常压力脑积水（iNPH）患者外周血和脑室脑脊液的细胞图谱，揭示了免疫失调的潜在机制	首次构建了iNPH患者的单细胞转录组图谱，发现了外周血和脑脊液单核细胞的促炎性改变以及与认知功能下降的关联	样本量相对有限（140,207个单细胞转录组），且仅针对iNPH患者进行研究	探究特发性正常压力脑积水（iNPH）患者外周血和脑脊液的免疫特征	iNPH患者的外周血和脑室脑脊液细胞	digital pathology	geriatric disease	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	140,207个单细胞转录组
9	2025-05-07	Single-cell analysis reveals the implication of vascular endothelial cell-intrinsic ANGPT2 in human intracranial aneurysm 2025-May-06, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae186 PMID:39187926	research paper	通过单细胞RNA测序分析揭示血管内皮细胞内在的ANGPT2在人颅内动脉瘤中的作用	首次在单细胞水平上揭示了颅内动脉瘤中血管内皮细胞的转录组变化，并发现ANGPT2在动脉瘤形成和进展中的关键作用	研究样本量相对有限，且主要在斑马鱼模型中验证了ANGPT2的功能	探究颅内动脉瘤的发病机制和潜在治疗靶点	人颅内动脉瘤组织和对照动脉组织	digital pathology	intracranial aneurysm	scRNA-seq	zebrafish model	RNA sequencing data	43,462 cells
10	2025-05-07	Effects of Bacterial Infections under Heatwaves on Chinese Soft-Shelled Turtles and Their Single-Cell Transcriptomic Landscapes 2025-May-06, Environmental science & technology IF:10.8Q1 DOI:10.1021/acs.est.4c09111 PMID:40274607	研究论文	本研究探讨了细菌感染和热浪双重压力对中华鳖的影响，通过单细胞转录组、行为和生理指标的综合分析	首次整合单细胞转录组、行为和生理指标，研究中华鳖在细菌感染和热浪双重压力下的免疫反应	研究仅针对中华鳖，结果可能不适用于其他物种	探究细菌感染和热浪双重压力对中华鳖的影响及其免疫反应机制	中华鳖	生态学与免疫学	细菌感染	单细胞转录组测序	NA	转录组数据、行为数据、生理指标	四组中华鳖（基于温度与感染状态分组）
11	2025-05-07	Astaxanthin promotes in vitro maturation of mouse oocytes by regulating mitochondrial functions and protein homeostasis 2025-May-05, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioaf107 PMID:40324205	研究论文	研究虾青素通过调节线粒体功能和蛋白质稳态促进小鼠卵母细胞体外成熟的作用	首次报道虾青素在小鼠卵母细胞体外成熟(IVM)中的作用，并揭示其通过增强线粒体活性和调节蛋白质稳态来提高成熟率	研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种或临床前研究	探究虾青素对小鼠卵母细胞体外成熟和早期胚胎发育的影响	小鼠卵母细胞	生殖生物学	NA	单细胞转录组测序、微蛋白质组学、透明带激光打孔辅助体外受精(IVF)	NA	转录组数据、蛋白质组数据	未明确说明具体数量的小鼠卵母细胞
12	2025-05-07	Integrated multiomics and Mendelian randomization identify CHIT1 as a novel sepsis biomarker and therapeutic target 2025-May-05, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-99619-z PMID:40325173	研究论文	通过整合多组学和孟德尔随机化方法，识别CHIT1作为脓毒症的新型生物标志物和治疗靶点	首次将CHIT1鉴定为脓毒症的新型生物标志物和潜在药物靶点，揭示了其在加剧中性粒细胞过度炎症和免疫抑制中的作用	研究主要依赖于公共数据库的转录组数据，缺乏实验验证	识别脓毒症患者预后的新关键生物标志物并探索其分子机制	脓毒症患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据	生物信息学	脓毒症	转录组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析	Cox回归模型	转录组数据、单细胞RNA测序数据	多个公共数据库的转录组数据集(GSE65682, GSE28750, GSE57065, GSE95233)和单细胞RNA测序数据(GSE167363)
13	2025-05-07	Quasi-spatial single-cell transcriptome based on physical tissue properties defines early aging associated niche in liver 2025-May-05, Nature aging IF:17.0Q1 DOI:10.1038/s43587-025-00857-7 PMID:40325195	研究论文	该研究开发了一种名为FiNi-seq的方法，通过利用组织的物理特性富集与衰老相关的纤维化微环境，并进行单细胞RNA测序和单核ATAC测序分析，以探索衰老初期微环境的特征	开发了FiNi-seq方法，能够富集稀缺的衰老相关纤维化微环境细胞，并进行准空间分析，发现了具有衰老表型的Wif1和Smoc1产生间充质细胞群	研究仅针对雄性小鼠的肝脏，未涉及其他组织或性别，且衰老细胞的稀缺性和技术偏差可能影响分析结果	探索衰老初期微环境的特征及其潜在治疗靶点	年轻和年老雄性小鼠的肝脏组织	单细胞测序	老年疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单核ATAC测序(ATAC-seq), FiNi-seq	NA	单细胞转录组数据, 表观遗传数据	年轻和年老雄性小鼠的肝脏组织样本
14	2025-05-07	Modulation of senescent Lepr+ skeletal stem cells via suppression of leptin-induced STAT3‒FGF7 axis activation alleviates abnormal subchondral bone remodeling and osteoarthritis progression 2025-May-05, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-025-04342-1 PMID:40325465	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和病理分析，揭示了瘦素受体阳性骨骼干细胞（Lepr+ SSCs）在骨关节炎（OA）进展中的衰老机制及其通过STAT3-FGF7轴加剧软骨下骨异常重塑的作用	首次发现瘦素-Lepr信号通路通过激活STAT3-FGF7轴促进骨骼干细胞衰老，进而加剧软骨下骨异常重塑和OA进展	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；对STAT3-FGF7轴下游具体分子机制的探索不够深入	探究骨骼干细胞衰老在OA进展中的作用机制，寻找潜在治疗靶点	创伤后骨关节炎（PTOA）小鼠模型的膝关节软骨和软骨下骨组织	骨科学	骨关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、显微CT（microCT）、病理分析、功能获得与缺失实验	小鼠PTOA模型	单细胞转录组数据、影像数据、组织病理数据	未明确说明具体样本量，使用PTOA小鼠模型进行研究
15	2025-05-07	Single-cell RNA Sequencing Identifies Prognostic Biomarkers in Extramedullary Multiple Myeloma 2025-May-05, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2 DOI:10.2174/0109298673352012250414100227 PMID:40326029	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术识别了髓外多发性骨髓瘤的预后生物标志物	利用LASSO方法开发预后特征，并通过外部MM队列验证其效能，揭示了CD4+ T细胞作为与MM进展相关的主要免疫细胞类型	研究依赖于公共数据库的转录组数据，可能受限于数据的质量和样本量	研究与髓外进展相关的多发性骨髓瘤克隆进化特征，识别新的预后生物标志物	多发性骨髓瘤（MM）患者	digital pathology	multiple myeloma	scRNA-seq, LASSO	risk score model	transcriptomic profiles, scRNA-seq data	126 DEGs identified, external MM cohorts for validation
16	2025-05-07	Delivery of Itgb1-siRNA by triptolide-modified and anti-Flt1 peptide-guided ionizable cationic LNPs for targeted therapy of corneal neovascularization 2025-May-03, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1 DOI:10.1016/j.jconrel.2025.113811 PMID:40324532	研究论文	本研究开发了一种新型的离子化阳离子脂质纳米颗粒（icLNPs），用于递送Itgb1-siRNA，以靶向治疗角膜新生血管（CoNV）	结合抗Flt1肽引导和雷公藤甲素修饰的icLNPs，提高了CoNV的靶向性和抗炎效果	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证其安全性和有效性	开发一种新型的非侵入性治疗方法，用于治疗角膜新生血管	角膜新生血管（CoNV）	生物医学工程	眼科疾病	单细胞测序、siRNA递送技术	NA	NA	小鼠模型
17	2025-05-07	Identifying the Pattern Characteristics of Anoikis-Related Genes in Keloid 2025-May, Advances in wound care IF:5.8Q1 DOI:10.1089/wound.2024.0027 PMID:38775414	research paper	该研究首次全面分析了anoikis相关基因(ARGs)在瘢痕疙瘩(KD)中的作用，并鉴定了六个核心ARGs	首次研究ARGs在KD中的潜在价值，并鉴定了六个核心ARGs及其与KD免疫浸润的关联	研究仅基于三个KF RNA-seq数据集，样本量有限	探究ARGs在KD中的表达特征及其分子机制	瘢痕疙瘩(KD)和anoikis相关基因(ARGs)	生物信息学	瘢痕疙瘩	RNA-seq, 单细胞测序, LASSO-Cox回归分析	LASSO回归模型	基因表达数据	三个KF RNA-seq数据集
18	2025-05-07	Exploring genetic and immune cell dynamics in systemic lupus erythematosus patients with Epstein-Barr virus infection via machine learning 2025-May-01, Rheumatology (Oxford, England) DOI:10.1093/rheumatology/keae537 PMID:39361430	research paper	本研究通过机器学习方法探索系统性红斑狼疮（SLE）患者与EB病毒感染相关的关键基因和免疫细胞动态	首次识别出IFI27作为SLE患者EBV感染的关键基因，并揭示了其对CD4 CTL和B细胞亚型的影响	研究样本量有限，且仅基于公开数据集分析	阐明SLE患者EBV感染的分子机制并寻找潜在诊断和治疗靶点	系统性红斑狼疮患者与EB病毒感染	machine learning	systemic lupus erythematosus	RNA-seq, single-cell RNA sequencing, CIBERSORTx	machine-learning algorithms	gene expression data	多个GEO数据集（GSE50772、GSE81622、GSE85599、GSE45918）
19	2025-05-07	KanCell: dissecting cellular heterogeneity in biological tissues through integrated single-cell and spatial transcriptomics 2025-May, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.009 PMID:39577768	research paper	KanCell是一种基于Kolmogorov-Arnold网络（KAN）的深度学习模型，旨在通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学（ST）数据来增强细胞异质性分析	KanCell利用KAN有效捕捉非线性关系并优化计算效率，为ST提供了准确高效的工具	NA	通过整合单细胞和空间转录组学数据，增强细胞异质性分析，揭示疾病微环境并识别治疗靶点	人类淋巴结、心脏、黑色素瘤、乳腺癌、背外侧前额叶皮层和小鼠胚胎大脑	digital pathology	melanoma, breast cancer	single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics (ST)	Kolmogorov-Arnold networks (KAN)	gene expression data	模拟和真实数据集，包括STARmap、Slide-seq、Visium和Spatial Transcriptomics技术的数据
20	2025-05-07	Single-cell multiomics reveals a gene regulatory circuit driving leukemia cell differentiation 2025-May, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03309-z PMID:39984714	研究论文	本研究通过单细胞多组学分析揭示了ATRA诱导白血病细胞分化的基因调控回路	整合单细胞染色质可及性和转录组分析，发现SPI1和CEBPE组成的正反馈基因调控回路驱动白血病细胞分化	研究主要基于NB4细胞系，在其他白血病细胞类型中的普适性需要进一步验证	探索ATRA诱导急性早幼粒细胞白血病细胞分化的调控机制	PML/RARα急性早幼粒细胞白血病(APL)细胞系NB4，以及非APL白血病细胞系HL60和K562	单细胞多组学	急性早幼粒细胞白血病	单细胞染色质可及性分析，单细胞转录组分析	NA	单细胞多组学数据	NB4、HL60和K562白血病细胞系