单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28975 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-06-24 |
Kidney diseases and single-cell sequencing research: a bibliometric analysis from 2015 to 2024
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2521457
PMID:40545992
|
研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2015年至2024年间单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肾脏疾病研究中的应用 | 揭示了scRNA-seq技术在肾脏疾病研究中的快速发展和应用趋势，包括疾病进展机制、基因调控表达等新兴研究方向 | 研究仅基于Web of Science Core Collection数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 评估scRNA-seq在肾脏疾病研究中的应用现状和未来趋势 | 2015年至2024年间发表的关于scRNA-seq在肾脏疾病研究中应用的文献 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | scRNA-seq | NA | 文本 | 1,210篇出版物 |
| 2 | 2025-06-24 |
Sex-specific neurotoxicity induced by long-term bisphenol A exposure: Single-cell sequencing reveals dual mechanisms involving hippocampal gliosis and neuronal apoptosis
2025-Aug-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2025.179810
PMID:40505511
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研究论文 | 本研究探讨了长期暴露于双酚A（BPA）对成年小鼠行为记忆和神经系统的影响，揭示了性别特异性的神经毒性机制 | 首次结合单细胞测序技术，揭示了BPA暴露引起的性别特异性神经毒性机制，包括雌性小鼠海马胶质增生和雄性小鼠海马齿状回颗粒神经元凋亡 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果向人类外推需谨慎 | 探究长期BPA暴露对神经系统的影响及其性别特异性机制 | 成年小鼠 | 神经毒理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 行为数据、形态学数据、单细胞测序数据 | 未明确说明小鼠数量 |
| 3 | 2025-06-24 |
The human infertility single-cell testis atlas (HISTA): an interactive molecular scRNA-Seq reference of the human testis
2025-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13637
PMID:38577799
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为HISTA的交互式单细胞RNA测序参考图谱，用于研究人类睾丸的基因表达 | 整合了来自多个供体、不同发育年龄和生育状态的scRNA-Seq数据，创建了一个交互式网络工具，支持简单的统计假设检验 | 数据来源于12个供体，样本量相对较小，可能无法涵盖所有睾丸病理情况 | 构建一个用于理解人类精子发生的交互式scRNA-Seq分析工具 | 人类睾丸细胞 | 生物信息学 | 不育症 | scRNA-Seq | 机器学习 | 基因表达数据 | 12个供体，包括健康成人对照、青少年和多个不育病例 |
| 4 | 2025-06-24 |
Dual nature of type I interferon responses and feedback regulations by SOCS1 dictate malaria mortality
2025-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.027
PMID:39181199
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析和数学模型，揭示了I型干扰素(IFN-I)在抗疟疾免疫中的双重作用及其调控机制 | 首次采用两种疟原虫模型比较研究IFN-I反应的机制，并揭示SOCS1通过负反馈和前馈环路调控IFN-α/β动态的新机制 | 研究仅使用了小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明I型干扰素在疟原虫感染中的双重作用及其调控机制 | 疟原虫感染的小鼠模型(17XL和PbANKA) | 免疫学 | 疟疾 | scRNA-seq, 流式细胞术, 数学模型 | 数学模型 | 基因表达数据 | NA |
| 5 | 2025-06-24 |
Integrated ultrasensitive metabolomics and single-cell transcriptomics identify crucial regulators of sheep oocyte maturation and early embryo development in vitro
2025-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.040
PMID:39233000
|
研究论文 | 本研究通过超灵敏代谢组学和单细胞转录组学技术，识别并补充了绵羊卵母细胞体外成熟和早期胚胎发育中的关键代谢物 | 结合超灵敏代谢组学和单细胞转录组学技术，首次在微量样本中识别出体外培养系统中缺失的关键代谢物，并验证了其对卵母细胞发育能力的提升作用 | 研究仅针对绵羊模型，结果在其他物种中的适用性尚需验证 | 提高绵羊卵母细胞的发育能力，优化体外培养系统 | 绵羊卵母细胞和早期胚胎 | 生殖生物学 | NA | 超灵敏代谢组学分析、单细胞RNA-seq | NA | 代谢组数据、转录组数据 | 微量卵母细胞和胚胎样本 |
| 6 | 2025-06-24 |
Novel Cell-to-Cell Communications Between Macrophages and Fibroblasts Regulate Obesity-Induced Adipose Tissue Fibrosis
2025-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0762
PMID:40063503
|
研究论文 | 本研究探讨了肥胖诱导的脂肪组织纤维化中巨噬细胞与成纤维细胞之间的新型细胞间通讯机制 | 发现了表达Mincle的巨噬细胞亚群通过分泌Osm调控成纤维细胞胶原基因表达的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 揭示肥胖诱导脂肪组织纤维化的细胞间通讯机制 | 饮食诱导肥胖小鼠的脂肪组织巨噬细胞和成纤维细胞 | 细胞生物学 | 肥胖症 | 单细胞转录组分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 饮食诱导肥胖小鼠模型及人类肥胖脂肪组织样本 |
| 7 | 2025-06-24 |
Mucosal Macrophages Govern Intestinal Regeneration in Response to Injury
2025-Jul, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.01.252
PMID:40086603
|
研究论文 | 本研究揭示了黏膜巨噬细胞在肠道损伤后再生过程中的关键作用 | 首次发现巨噬细胞通过分泌neuregulin 1和osteopontin分子诱导肠道上皮细胞胎儿样重编程和增殖 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明辐射性肠炎后肠道再生的分子机制 | 肠道巨噬细胞与肠道干细胞 | 分子生物学 | 辐射性肠炎 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、流式细胞术、器官共培养系统 | 小鼠辐射损伤模型、人类肠道类器官模型 | 基因表达数据、细胞成像数据 | 未明确说明具体样本数量（小鼠模型和人类类器官） |
| 8 | 2025-06-24 |
HMBOX1 reverses autophagy mediated 5-fluorouracil resistance through promoting HACE1-induced ubiquitination and degradation of ATG5 in colorectal cancer
2025-Jul, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2477443
PMID:40126194
|
research paper | 该研究揭示了HMBOX1通过促进HACE1诱导的ATG5泛素化和降解，逆转自噬介导的5-氟尿嘧啶耐药性，从而增强结直肠癌对化疗的敏感性 | 首次发现HMBOX1通过调控HACE1介导的ATG5泛素化降解途径抑制自噬，进而逆转5-FU耐药性 | 研究主要基于体外实验和临床样本分析，缺乏体内动物模型的验证 | 探索结直肠癌化疗耐药的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞和组织样本 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫染色、质谱蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 耐药和非耐药的结直肠癌细胞系及患者组织样本 |
| 9 | 2025-06-24 |
Molecular characterization of benign intracranial glioependymal and arachnoid cysts suggest heterogeneous mechanisms of action
2025-Jul-01, Journal of neuropathology and experimental neurology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jnen/nlaf029
PMID:40197611
|
研究论文 | 本研究对良性颅内胶质室管膜囊肿和蛛网膜囊肿进行了分子特征分析，揭示了它们不同的发病机制 | 通过单细胞测序和RNA表达谱比较，首次揭示了胶质室管膜囊肿和蛛网膜囊肿具有不同的细胞特征和表达谱，提出了不同的发病机制 | 样本量较小（仅16例患者和8例病理样本），可能影响结果的普遍性 | 探究良性颅内囊肿的形成和生长机制 | 16例接受手术治疗的良性颅内囊肿患者（8例病理样本） | 神经病理学 | 颅内囊肿 | H&E染色、免疫荧光染色、单细胞测序、RNA表达谱分析 | NA | 病理样本、囊肿液体、单细胞测序数据、RNA表达数据 | 16例患者（8例病理样本，其中5例胶质室管膜囊肿，3例蛛网膜囊肿） |
| 10 | 2025-06-24 |
Applications of spatial transcriptomics in studying spermatogenesis
2025-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70043
PMID:40202007
|
review | 本文综述了空间转录组学在研究精子发生过程中的应用 | 利用空间转录组学技术研究精子发生过程中的分子特征及细胞间相互作用 | NA | 探讨空间转录组学在精子发生研究中的应用及其潜力 | 哺乳动物睾丸中的细胞类型及其相互作用 | digital pathology | infertility | spatial transcriptomics | NA | spatial transcriptomics data | NA |
| 11 | 2025-06-24 |
Targeting FGFR Attenuates Tumor Growth in an Anal Squamous Cell Carcinoma Patient Derived Xenograft Model
2025-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23919
PMID:40256931
|
研究论文 | 通过患者来源的异种移植模型和单细胞RNA测序，研究发现FGFR抑制能有效减缓肛门鳞状细胞癌的肿瘤生长 | 首次在肛门鳞状细胞癌患者来源的异种移植模型中验证FGFR抑制剂的治疗效果，并通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤细胞的异质性 | 研究仅基于一个转移性肛门鳞状细胞癌样本，样本量较小 | 寻找肛门鳞状细胞癌的可操作治疗靶点 | 肛门鳞状细胞癌患者来源的异种移植模型 | 肿瘤学 | 肛门鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 傅里叶变换红外光谱 | 患者来源的异种移植模型(PDX) | 基因表达数据, 光谱数据 | 1例转移性肛门鳞状细胞癌样本 |
| 12 | 2025-05-14 |
Simultaneous single-cell sequencing of RNA and DNA at scale with DEFND-seq
2025-Jul, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00853-y
PMID:40355601
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-06-24 |
The Role of Omics Techniques in Diabetic Wound Healing: Recent Insights into the Application of Single-Cell RNA Sequencing, Bulk RNA Sequencing, Spatial Transcriptomics, and Proteomics
2025-Jul, Advances in therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1007/s12325-025-03212-9
PMID:40381157
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综述 | 本文综述了组学技术在糖尿病伤口愈合中的最新应用，包括单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学和蛋白质组学 | 概述了高通量组学技术在糖尿病足溃疡分子功能和机制研究中的最新进展，为靶向治疗提供了潜在可能 | NA | 探讨组学技术在糖尿病伤口愈合研究中的应用 | 糖尿病足溃疡(DFUs) | 生物医学 | 糖尿病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 组学数据 | 临床前动物和人类临床研究样本 |
| 14 | 2025-06-22 |
Deciphering Macrophage-Fibroblast Cross Talk in Obesity-Induced Adipose Tissue Fibrosis: Insights From Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0337
PMID:40540667
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-06-24 |
Deciphering the Regulatory Networks of the Migrasome-Associated Cell Subpopulation in Heterotopic Ossification via Multi-Omics Analysis
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500965R
PMID:40540299
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研究论文 | 通过多组学分析解析异位骨化中迁移体相关细胞亚群的调控网络 | 识别了异位骨化中的关键细胞亚群和分子（Ppib和Tagln），并构建了它们的调控网络和空间分布 | NA | 阐明异位骨化（HO）的关键生物分子网络 | 异位骨化中的迁移体相关细胞亚群 | 多组学分析 | 异位骨化 | 单细胞转录组、批量转录组、空间转录组、hdWGCNA、机器学习 | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的多个数据集和临床样本 |
| 16 | 2025-06-24 |
Integrating Single-Cell and Experimental Analyses Uncover Macrophage Ferroptosis Is a Key Event in the Development of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501120R
PMID:40542598
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研究论文 | 本文通过整合单细胞和实验分析，揭示了巨噬细胞铁死亡在慢性阻塞性肺疾病（COPD）发展中的关键作用 | 首次发现巨噬细胞铁死亡是COPD发展的关键事件，并揭示了相关基因表达的变化 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类样本验证有限 | 探究COPD发病机制中巨噬细胞铁死亡的作用 | 巨噬细胞和COPD患者及小鼠模型 | 生物医学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞测序、免疫荧光、免疫组化、qRT-PCR、Western blotting | 小鼠COPD模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 公共数据库GSE171541和GSE173896的单细胞测序数据，RAW264.7细胞系和BMDM细胞系，COPD小鼠模型 |
| 17 | 2025-06-24 |
Potential of SPHK1 as a prognostic marker and therapeutic target in colorectal cancer: insights from bioinformatics and experimental analysis
2025-Jun-24, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002506
PMID:40434736
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research paper | 本研究探讨了SPHK1在结直肠癌（CRC）进展中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次通过生物信息学和实验分析全面评估SPHK1在CRC中的功能及其与免疫浸润和肿瘤微环境的关系 | 研究样本量有限（90例CRC组织），且部分机制尚未完全阐明 | 探究SPHK1在CRC进展中的分子机制及其临床意义 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学与肿瘤学 | 结直肠癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化（MR）、多重荧光免疫组化 | NA | 基因表达数据、甲基化数据、免疫组化数据 | 90例CRC组织及对应正常组织 |
| 18 | 2025-06-24 |
Early multiple sclerosis activity associated with TBX21+CD21loCXCR3+ B cell expansion resembling EBV-induced phenotypes
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188543
PMID:40359016
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了早期多发性硬化症(MS)患者外周B细胞的表达谱，发现与EB病毒感染相关的非典型B细胞(ABCs)扩增与早期MS活动相关 | 首次将EBV相关的非典型B细胞(ABCs)扩增与早期多发性硬化症活动联系起来，并发现这些细胞具有独特的炎症特征 | 未检测到ABCs中直接的EBV感染证据，且样本量有限 | 探究EB病毒在多发性硬化症发病机制中的作用 | 早期多发性硬化症患者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 来自Immune Tolerance Network STAyCIS试验的纵向收集样本 |
| 19 | 2025-06-24 |
IL-1β signaling modulates T follicular helper and regulatory cells in human lymphoid tissues
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188724
PMID:40392614
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β信号在人类淋巴组织中T滤泡辅助细胞（Tfh）和T滤泡调节细胞（Tfr）中的作用 | 揭示了IL-1β通过IL-1R1和IL-1R2受体调节人类Tfh和Tfr细胞的机制，并发现IL-1β信号与自身免疫疾病中自身抗体产生的关联 | 研究主要基于体外实验和有限的组织样本，未进行体内功能验证 | 阐明IL-1β信号在人类淋巴组织中Tfh和Tfr细胞平衡中的作用及其与自身免疫疾病的关联 | 人类次级淋巴器官（扁桃体、脾脏和肠系膜淋巴结）中的Tfh和Tfr细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术、单细胞转录组学、体外培养 | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 人类次级淋巴器官样本及自身免疫患者样本 |
| 20 | 2025-06-24 |
scGANSL: Graph Attention Network with Subspace Learning for scRNA-seq Data Clustering
2025-Jun-23, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c00731
PMID:40468846
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGANSL的新聚类方法，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的聚类分析 | 结合了多视图共享图自编码器、ZINB模型和图注意力机制，有效学习潜在表示并保留数据的局部和全局结构 | 未提及具体的数据集规模限制或计算资源需求 | 提高scRNA-seq数据聚类的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, PCA, ZINB模型 | 图注意力网络（GAT）, 自编码器 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集（未提及具体数量） |