单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-05-16	Microglial intervention in ischemic stroke: Roles and intervention strategies 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01166 PMID:39995094	综述	本文综述了小胶质细胞在缺血性卒中中的双重作用及潜在干预策略	探讨了小胶质细胞动态激活与极化状态对卒中病程的影响，并提出了针对关键通路的实验性治疗策略	未提及具体临床转化障碍或现有干预策略的局限性	阐明小胶质细胞在缺血性卒中中的作用机制并探索干预策略	小胶质细胞及其在缺血性卒中中的功能状态	神经科学	缺血性卒中	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	NA	NA
2	2025-05-16	Blood-brain barrier disruption and neuroinflammation in the hippocampus of a cardiac arrest porcine model: Single-cell RNA sequencing analysis 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01269 PMID:40146000	研究论文	通过单细胞RNA测序分析，研究心脏骤停猪模型中血脑屏障破坏和神经炎症的细胞和分子机制	首次在心脏骤停后脑损伤中应用单细胞转录组分析，揭示了未被识别的细胞亚群、改变的细胞通讯网络和新的分子机制	研究仅关注了6和24小时两个时间点，可能无法全面反映动态变化过程	探究心脏骤停后脑损伤的细胞和分子机制，寻找神经保护和修复的新靶点	心室颤动诱导心脏骤停的猪模型海马组织	神经科学	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Western blotting、qRT-PCR、免疫荧光染色	猪心脏骤停模型	RNA测序数据	心脏骤停后6小时和24小时以及假手术对照组的猪海马组织样本
3	2025-05-16	A single-cell landscape of the regenerating spinal cord of zebrafish 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01163 PMID:40326988	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了斑马鱼脊髓损伤后不同阶段的细胞群，揭示了脊髓再生的分子和细胞机制	首次在单细胞水平上描绘了斑马鱼脊髓再生过程中的细胞群变化，并揭示了神经元和胶质细胞在再生中的关键作用	研究仅针对斑马鱼模型，结果在哺乳动物中的适用性尚需验证	探索斑马鱼脊髓再生的分子和细胞机制	斑马鱼脊髓损伤模型	再生医学	脊髓损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
4	2025-05-16	CD8+ T cells in breast cancer tumors and draining lymph nodes: PD-1 levels, effector functions and prognostic relevance 2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2025.2502354 PMID:40351118	research paper	本研究评估了CD8 T细胞在不同PD-1表达水平下的功能状态及其在luminal乳腺癌患者不同组织中的分布	首次详细描述了CD8 T细胞在肿瘤、肿瘤旁组织及引流淋巴结中的耗竭阶段分布，并发现PD-1表达能有效区分CD8 T细胞的耗竭阶段	研究主要集中于luminal乳腺癌患者，未涵盖其他乳腺癌亚型	探究CD8 T细胞在不同组织中的耗竭状态及其对乳腺癌免疫治疗的潜在意义	luminal乳腺癌患者的CD8 T细胞	肿瘤免疫学	乳腺癌	TCR-β测序、scRNA-seq	NA	基因表达数据、单细胞RNA测序数据	乳腺癌患者的肿瘤、肿瘤旁组织及引流淋巴结样本
5	2025-05-16	Development of an electroconductive Heart-on-a-chip model to investigate cellular and molecular response of human cardiac tissue to gold nanomaterials 2025-Sep, Biomaterials IF:12.8Q1 DOI:10.1016/j.biomaterials.2025.123275 PMID:40138961	研究论文	开发了一种电导性心脏芯片模型，用于研究人类心脏组织对金纳米材料的细胞和分子反应	开发了具有电导性的3D心脏芯片模型（eHOC），相比非导电模型，其表现出增强的收缩功能、改善的钙瞬变和心脏相关基因表达的增加	NA	构建一种更接近人体心肌电导特性的体外心脏组织模型，用于药物测试和疾病建模	人类诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的心肌细胞（hiCMs）和心脏成纤维细胞（hiCFs）	生物医学工程	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	3D电导性心脏芯片模型（eHOC）	基因表达数据	NA
6	2025-05-16	EXPLORING THE POTENTIAL OF BEND7 AS AN IMMUNOMODULATORY BIOMARKER IN SEPSIS THROUGH INTEGRATIVE GENOMIC AND TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS 2025-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.) DOI:10.1097/SHK.0000000000002529 PMID:39617402	研究论文	通过整合基因组和转录组分析，探索BEND7作为脓毒症免疫调节生物标志物的潜力	首次将BEND7鉴定为脓毒症中参与免疫调节的血小板特异性基因，并揭示了其通过细胞间粘附分子信号通路与免疫细胞（特别是单核细胞和中性粒细胞）的强相互作用	研究结果需要进一步的实验验证，且样本来源和数量未明确说明	探索脓毒症的遗传因素和潜在治疗靶点	脓毒症相关基因，特别是BEND7	基因组学与转录组学	脓毒症	GWAS、eQTL分析、单细胞RNA测序、细胞聚类、差异表达分析、细胞间通讯映射、伪时间轨迹分析	基于汇总数据的孟德尔随机化方法	基因组和转录组数据	NA
7	2025-05-16	Dissecting Autophagy Gene Expression in Endothelial Cells of Pulmonary Arterial Hypertension at Single-Cell Resolution 2025-Jun, Cardiology research IF:1.4Q3 DOI:10.14740/cr2055 PMID:40370624	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肺动脉高压（PAH）内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并鉴定了DDIT4作为潜在的生物标志物	首次在单细胞分辨率下解析PAH内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并发现DDIT4作为新的PAH生物标志物	研究样本量有限，仅通过体外PAH模型验证了部分发现	探究肺动脉高压内皮细胞中自噬相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用	肺动脉高压患者的内皮细胞	单细胞转录组学	肺动脉高压	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、western blotting	NA	单细胞转录组数据	未明确说明样本数量，但包含正常状态、过渡状态和PAH疾病组三个内皮细胞亚群
8	2025-05-16	PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs 2025-May-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151672 PMID:40138759	研究论文	本研究探讨了PINK1如何通过调节线粒体-内质网相互作用来调控猪肌肉内脂肪沉积	揭示了PINK1在调控猪肌肉内脂肪沉积中的新作用，特别是其通过线粒体-内质网接触调控脂肪沉积的机制	研究主要基于猪模型，结果在人类或其他动物中的适用性尚不明确	探究PINK1在调控猪肌肉内脂肪沉积中的作用及其分子机制	猪的肌肉内脂肪沉积	生物医学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	多个猪品种的肌肉组织样本
9	2025-05-16	Unraveling the Heterogeneity of CD8+ T-Cell Subsets in Liver Cirrhosis: Implications for Disease Progression 2025-May-15, Gut and liver IF:3.4Q2 DOI:10.5009/gnl230345 PMID:38623058	研究论文	本研究通过转录组和单细胞测序数据分析了肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其对疾病进展的影响	揭示了肝硬化中CD8+ T细胞的八种亚型，特别是效应记忆T细胞（Tem）和耗竭T细胞（Tex），并发现CXCL13+ Tex细胞与疾病严重程度和预后不良相关	研究未涉及这些细胞亚型在肝硬化治疗中的具体应用	阐明CD8+ T细胞在肝硬化中的分子机制及其对疾病进展的影响	肝硬化患者的CD8+ T细胞	免疫学	肝硬化	转录组测序、单细胞测序	NA	RNA-seq数据、单细胞数据	未明确说明样本数量
10	2025-05-16	Intratumoral Fusobacterium nucleatum Recruits Tumor-Associated Neutrophils to Promote Gastric Cancer Progression and Immune Evasion 2025-May-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2580 PMID:39992708	research paper	研究探讨了瘤内微生物群对胃癌进展和免疫逃逸的影响，特别是梭杆菌属核粒（Fusobacterium nucleatum）如何通过招募肿瘤相关中性粒细胞（TAN）重塑肿瘤免疫微环境	揭示了F. nucleatum通过激活IL17/NF-κB/RelB信号通路诱导TAN招募，并促进TAN向促肿瘤亚型分化，从而增强PD-L1表达和免疫逃逸的新机制	研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本，人类胃癌中的具体机制仍需进一步验证	探究瘤内微生物群对胃癌免疫微环境的影响及其在免疫逃逸中的作用	胃癌组织和肿瘤相关中性粒细胞（TAN）	肿瘤免疫学	胃癌	16S rRNA扩增子测序、单细胞RNA测序	小鼠模型	基因测序数据、免疫组织化学数据	人类胃癌组织样本和小鼠模型
11	2025-05-16	PERK+ Macrophages Drive Immunotherapy Resistance in Lymph Node Metastases of Oral Squamous Cell Carcinoma 2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3135 PMID:40036693	研究论文	本研究评估了口腔鳞状细胞癌（OSCC）患者淋巴结转移的病理反应率，并发现PERK+巨噬细胞在免疫治疗抵抗中的作用	首次系统评估了OSCC患者淋巴结转移的病理反应率，并发现PERK信号通路在巨噬细胞中的激活是免疫治疗抵抗的新机制	研究样本来自单一临床试验，且小鼠模型的结果需要进一步临床验证	评估OSCC患者淋巴结转移的病理反应率并寻找改善治疗效果的新靶点	口腔鳞状细胞癌患者及其淋巴结转移灶	肿瘤免疫学	口腔鳞状细胞癌	单细胞转录组学、空间转录组学、多重免疫组化	NA	临床数据、转录组数据、免疫组化数据	来自NCT04649476临床试验的OSCC患者样本及小鼠模型
12	2025-05-16	Reactivation of CTLA4-expressing T cells accelerates resolution of lung fibrosis in a humanized mouse model 2025-May-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI181775 PMID:40100323	research paper	该研究通过空间转录组学和蛋白质组学技术，发现CTLA4在CD8+ T细胞中的上调与肺纤维化相关，并证明靶向CTLA4的药物ipilimumab可加速肺上皮再生并减少纤维化	首次发现CTLA4在CD8+ T细胞中的表达与肺纤维化区域相邻，并证明靶向CTLA4的治疗可以促进衰老细胞的清除和肺泡上皮细胞的再生	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化效果尚需进一步验证	探究免疫检查点蛋白CTLA4在肺纤维化中的作用及潜在治疗策略	人类特发性肺纤维化患者样本和重复博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型	digital pathology	lung cancer	空间转录组学、蛋白质组学	humanized CTLA4-knockin小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据	人类特发性肺纤维化患者样本和重复博来霉素诱导的小鼠模型
13	2025-05-16	Pdgfrβ marks distinct mesenchymal and pericyte populations within the periosteum with overlapping cellular features 2025-May-15, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxaf020 PMID:40237625	研究论文	研究通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型，探讨了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用	揭示了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的不同亚群，包括间充质细胞和周细胞，并分析了它们的增殖、迁移和成骨能力	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探讨骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用	小鼠长骨骨膜中的Pdgfrβ阳性细胞	细胞生物学	骨疾病	单细胞RNA测序，转基因小鼠模型	Pdgfrβ-CreERT2-mT/mG报告小鼠	基因表达数据，组织学数据	转基因小鼠模型中的Pdgfrβ阳性细胞
14	2025-05-16	IAP dependency of T-cell prolymphocytic leukemia identified by high-throughput drug screening 2025-May-15, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027171 PMID:39869826	研究论文	通过高通量药物筛选发现T细胞前淋巴细胞白血病（T-PLL）对IAP抑制剂的依赖性	首次报道T-PLL对自噬靶向药物、核输出抑制剂和IAP抑制剂的敏感性，并揭示IAP抑制剂诱导的细胞死亡主要为坏死性凋亡且依赖TNF-α	研究样本量较小（30例原代患者样本），且仅限于体外实验	发现T-PLL的新治疗靶点	T细胞前淋巴细胞白血病（T-PLL）细胞	血液肿瘤学	T细胞前淋巴细胞白血病	高通量药物筛选、RNA测序（bulk和单细胞）、光谱流式细胞术	NA	药物敏感性数据、RNA测序数据、流式细胞术数据	30例原代T-PLL患者样本
15	2025-05-16	Single-Cell RNA Sequencing of Ewing Sarcoma Tumors Demonstrates Transcriptional Heterogeneity and Clonal Evolution 2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2040 PMID:40029262	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化	首次在尤文肉瘤中应用单细胞RNA测序技术，揭示了肿瘤的转录异质性和克隆进化，并识别了潜在的治疗靶点TSPAN8	样本量较小（7名未治疗患者），且CTC分析来自另一独立队列	探索尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化，寻找新的治疗靶点	尤文肉瘤肿瘤组织、肿瘤微环境及循环肿瘤细胞（CTC）	数字病理学	尤文肉瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光	NA	RNA测序数据、图像数据	7名未治疗的尤文肉瘤患者（原发肿瘤）及独立队列的CTC样本
16	2025-05-16	Acute kidney injury triggers hypoxemia by lung intravascular neutrophil retention that reduces capillary blood flow 2025-May-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI186705 PMID:40048367	研究论文	本文研究了急性肾损伤（AKI）如何通过肺部血管内中性粒细胞滞留引发低氧血症	揭示了AKI通过激活经典单核细胞释放CXCL2导致肺部中性粒细胞滞留的新机制，并区分了直接与远程肺部炎症中中性粒细胞募集的差异	研究主要基于小鼠模型，人类临床数据的支持有限	探究AKI引发低氧血症的细胞机制	急性肾损伤（AKI）小鼠模型和人类患者	病理生理学	急性肾损伤	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	基因表达数据	NA
17	2025-05-16	IGFBP3 enhances adipose-derived stem cell function in soft tissue injury repair via ITGB1 and ERK pathway activation 2025-May-15, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-025-10024-8 PMID:40369223	研究论文	本研究探讨了IGFBP3蛋白在脂肪来源干细胞（ADSCs）中对软组织损伤修复的作用及其分子机制	利用单细胞多组学技术和3D生物打印模型揭示了IGFBP3通过ITGB1和ERK通路激活促进ADSCs功能的新机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人体中的适用性尚需进一步验证	阐明IGFBP3在ADSCs中促进软组织损伤修复的分子机制	脂肪来源干细胞（ADSCs）和软组织损伤修复	组织工程与再生医学	软组织损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、3D生物打印、傅里叶变换红外光谱、X射线衍射、SEM、TEM	小鼠软组织损伤模型	单细胞转录组数据、蛋白质表达数据	未明确说明具体样本数量，但涉及正常和损伤组织的小鼠模型
18	2025-05-16	Zn-Based Multi-Active Framework Nanoparticles TSA-CAN-Zn Inhibit Skin Glycation via Dual Blockade of HMGB1/RAGE and AGEs/RAGE Pathways 2025-May-15, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1 DOI:10.1002/adhm.202500664 PMID:40370206	研究论文	本研究设计了一种基于锌的多活性框架纳米颗粒TSA-CAN-Zn，通过双重阻断HMGB1/RAGE和AGEs/RAGE通路来抑制皮肤糖基化损伤	首次将Theasinensin A (TSA)和L-肌肽(CAN)结合到锌基纳米颗粒中，同时抑制HMGB1/RAGE和AGEs/RAGE两条通路	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未进行人体临床试验	开发一种新型纳米材料来减轻糖基化引起的皮肤损伤	皮肤糖基化损伤机制及治疗	纳米医学	皮肤疾病	分子对接、单细胞RNA测序	小鼠皮肤糖基化模型	体外实验数据、测序数据	HaCaT细胞系和小鼠模型
19	2025-05-16	Single-Cell Transcriptomics and Lineage Tracing Unveil Parallels in Lymphatic Muscle and Venous Smooth Muscle Development, Identity, and Function 2025-May-15, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322567 PMID:40371470	research paper	该研究通过单细胞转录组学和谱系追踪揭示了淋巴肌肉细胞（LMCs）和静脉平滑肌细胞（SMCs）在发育、特性和功能上的相似性	首次揭示了LMCs和静脉SMCs在转录组和功能上的高度相似性，并确定了它们共同的WT1+中胚层祖细胞来源	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究淋巴肌肉细胞独特的收缩特性的细胞和分子基础	淋巴肌肉细胞（LMCs）和静脉平滑肌细胞（SMCs）	细胞生物学	淋巴水肿	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、遗传谱系追踪、全组织免疫染色、活体成像	NA	单细胞转录组数据、影像数据	小鼠后肢和腹股沟-腋窝区域的LMCs和SMCs
20	2025-05-16	Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels 2025-May-15, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322100 PMID:40371469	research paper	该研究探讨了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的作用及其在淋巴系统疾病中的病理生理学意义	揭示了TRPV4表达髓系细胞（包括LYVE1+巨噬细胞）与淋巴肌细胞或淋巴内皮细胞之间相互作用介导的淋巴收缩失调新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限	探究TRPV4通道在淋巴管功能调控中的作用及其与淋巴系统疾病的关联	小鼠收集淋巴管及乳腺癌相关淋巴水肿患者活检组织	分子生物学	淋巴水肿	单细胞RNA测序、共聚焦显微镜、细胞内钙活性测量	Trpv4fx/fx转基因小鼠	基因表达数据、图像数据、生理功能数据	小鼠收集淋巴管样本及乳腺癌相关淋巴水肿患者活检组织