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当前共找到 38123 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-04-06
Integrating tumor and immune cell transcriptomics to predict immune checkpoint inhibitor primary resistance in metastatic melanoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过整合肿瘤和免疫细胞的转录组学数据,旨在预测转移性黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 提出了一个由82个基因组成的转录组特征,该特征结合了肿瘤相关和免疫相关基因,并首次通过单细胞RNA测序指导的免疫反卷积,识别出四种免疫细胞亚群作为耐药预后指标 样本量相对有限(组织样本46例,验证队列54例),且液体活检的单细胞RNA测序仅涉及8例患者 识别和验证能够预测转移性黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂产生原发性耐药的生物标志物 转移性皮肤黑色素瘤患者 数字病理学 黑色素瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 预测模型 转录组数据, 单细胞数据 组织样本:发现队列(FFPE RNA-seq子队列)和独立外部验证队列共100例(46+54);液体活检:scRNA-seq 8例,流式细胞术46例 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2 2026-04-06
Retinoic acid regulates fetoplacental vascularization via notch signaling and a SEMA3E/F-PLEXIND1 axis
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示了视黄酸通过Notch信号通路和SEMA3E/F-PLEXIND1轴调控胎儿胎盘血管化的机制 首次发现视黄酸通过Notch信号和SEMA3E/F-PLEXIND1轴调控胎盘血管化,并明确了其在胎儿内皮细胞与绒毛滋养层前体细胞间信号传导中的作用 研究主要基于小鼠模型(Raldh2胚胎),人类胎盘中的具体机制仍需进一步验证 探究视黄酸缺乏导致胎盘血管化异常的分子机制 小鼠胚胎胎盘组织(特别是内皮细胞和滋养层细胞) 发育生物学 妊娠并发症(胎儿生长受限、早产等) 单细胞RNA测序、功能实验 NA 单细胞转录组数据 E9.5阶段Raldh2缺陷型、野生型及ATRA处理组胎盘细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-04-06
Mapping whole-organism genetic comorbidities across model Species using unified ontologies
2026-Apr-04, Genetics IF:3.3Q2
研究论文 本研究提出了一种基于统一本体的计算方法,用于分析与非梗阻性无精子症相关基因的跨物种全生物体共病模式 开发了一个整合新生殖表型本体与标准化全身表型类别的统一跨物种表型结构框架,实现了直接跨物种比较,并创建了CoMo DBM资源用于联合分析基因型-表型关联 研究依赖于模型生物数据库中已有的基因型-表型关联数据,可能受数据完整性和注释质量的限制 识别生殖基因功能障碍的系统性后果,理解遗传变异如何贡献于全生物体表型 204个经实验验证的小鼠精子发生障碍基因及其在人类、小鼠、斑马鱼、果蝇和线虫中的直系同源基因 生物信息学 男性不育症 单细胞RNA-seq,全生物体基因表达分析,基因本体注释分析 NA 基因型-表型关联数据,基因表达数据,本体注释数据 涉及5个物种(人类、小鼠、斑马鱼、果蝇、线虫)的基因数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-04-06
Single-Cell Sequencing Analysis-Driven Nanomedicine Design for Mimicking Endogenous Immune Repair in Myocardial Infarction
2026-Apr-04, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本研究提出了一种数据驱动的仿生策略,利用单细胞测序分析指导设计能模拟内源性免疫修复过程的纳米药物,用于心肌梗死的治疗 首次结合单细胞RNA测序分析揭示心肌梗死后修复过程中巨噬细胞亚型的动态变化,并据此设计出能时序递送模拟不同巨噬细胞亚型功能的纳米颗粒,以复制自然的免疫修复机制 研究主要在实验模型中进行,尚未进行临床试验验证其安全性和有效性 开发一种能模拟内源性免疫细胞反应以修复心肌梗死组织损伤的纳米药物设计策略 心肌梗死后的免疫修复过程,特别是巨噬细胞亚型(M2a、M2b、M2c) 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2026-04-06
Integration of machine learning-based screening approaches and single-cell sequencing technique to identify cancer stemness genes associated with radiotherapy resistance in lung adenocarcinoma
2026-Apr-04, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
6 2026-04-06
Helicobacter pylori-linked gene CFAP73 rewires epithelial programs and shapes the gastric cancer microenvironment
2026-Apr-04, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究揭示了幽门螺杆菌感染通过下调CFAP73基因表达,重塑胃上皮细胞程序并改变肿瘤微环境,从而促进胃癌发生发展的新机制 首次鉴定出CFAP73是一个在幽门螺杆菌感染早期即被抑制的、具有肿瘤保护作用的上皮基因,并系统阐明了其通过调控上皮细胞状态、影响成纤维细胞和T细胞功能来重塑肿瘤微环境的机制 研究主要基于生物信息学分析和回顾性队列数据,CFAP73的具体功能机制和作为治疗靶点的潜力仍需进一步的体内外实验验证 探究幽门螺杆菌感染过程中逐渐被破坏的上皮细胞程序及其与胃癌恶性转化的关联 幽门螺杆菌感染相关的胃上皮细胞、胃癌微环境中的成纤维细胞和T细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、配体-受体推断分析 随机森林模型 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 多个独立验证队列(包括TCGA-STAD、GSE60662、GSE60427、GSE249874等数据集) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
7 2026-04-06
scAgeClock: a single-cell transcriptome-based human aging clock model using gated multi-head attention neural networks
2026-Apr-04, npj aging IF:4.1Q2
研究论文 本研究提出了一种名为scAgeClock的新型单细胞转录组人类衰老时钟模型,该模型基于门控多头注意力神经网络,利用大规模单细胞转录组数据进行年龄预测 开发了首个基于门控多头注意力神经网络的单细胞分辨率人类衰老时钟模型,能够解析细胞和组织异质性,并提出了新的衰老偏差指数指标 不同细胞类型的预测准确性存在显著差异,部分细胞类型的年龄预测误差可能较大 构建高精度的单细胞分辨率人类衰老时钟模型,用于评估生物年龄和细胞衰老状态 人类单细胞转录组数据 机器学习 衰老相关疾病 单细胞RNA测序 门控多头注意力神经网络 单细胞转录组数据 超过1600万个单细胞转录组图谱,来自40多种人类组织和400多种细胞类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-04-06
Deciphering oxidative stress-related heterogeneity and developing a prognostic signature for colorectal cancer
2026-Apr-04, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究旨在揭示氧化应激在结直肠癌肿瘤微环境中的作用,并开发一个基于氧化应激相关基因的预后风险特征模型 首次结合单细胞和bulk RNA-seq数据解析氧化应激在结直肠癌中的异质性,并构建了一个12基因的预后风险特征模型 研究主要基于公共数据集分析,临床验证样本有限,需要进一步的前瞻性研究验证模型的临床应用价值 阐明氧化应激在结直肠癌肿瘤微环境中的作用并开发预后预测工具 结直肠癌患者样本 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qRT-PCR, 免疫组化 LASSO Cox回归模型 基因表达数据, 组织芯片图像 多个公共数据集(GSE132465, TCGA-CRC, GSE39582, GSE17538)及组织芯片验证样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
9 2026-04-06
Deciphering functional intra-tumoral heterogeneity in BRAFV600E-driven mouse thyroid cancer reveals EMT trajectory and metabolic remodeling
2026-Apr-04, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了BRAFV600E驱动的小鼠甲状腺乳头状癌中肿瘤细胞的功能性瘤内异质性,发现了上皮-间质转化轨迹和代谢重塑过程 首次在成年发病的自发性BRAF驱动小鼠PTC模型中,利用单细胞RNA测序解析了恶性甲状腺细胞的转录异性和层级轨迹,并验证了EMT轨迹与临床相关性 研究主要基于小鼠模型,虽然验证了临床相关性,但人类样本的直接验证仍需进一步研究 解析甲状腺乳头状癌中肿瘤细胞的功能性瘤内异质性,以改善诊断和开发有效疗法 BRAFV600E驱动的成年发病自发性小鼠甲状腺乳头状癌模型中的恶性甲状腺细胞 单细胞组学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-04-06
Integrated analysis of single-cell RNA sequencing, transcriptomics, and thermal proteome profiling identifies PLCG1 as the therapeutic target of isopimpinellin in treating rheumatoid arthritis
2026-Apr-04, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
11 2026-04-06
Regulation of mitochondrial ROS by C15ORF48 in a basal cell subpopulation contributes to chemotherapy resistance in TNBC
2026-Apr-03, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了TNBC中C15ORF48在基底细胞亚群中上调,通过调节线粒体ROS来诱导化疗耐药性 首次发现C15ORF48作为NDUFA4的旁系同源物,在TNBC基底细胞亚群中上调并调控线粒体ROS,从而介导化疗耐药 研究基于患者来源的异种移植模型,可能不完全反映人类肿瘤的复杂性;样本量未明确说明 探究TNBC化疗耐药的机制,并寻找潜在的治疗靶点 三阴性乳腺癌(TNBC)患者来源的异种移植肿瘤中的肿瘤上皮细胞,特别是基底细胞亚群 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-04-06
Nested co-expression network analysis identifies compact gene clusters in a black box
2026-Apr-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种名为Nested-WGCNA的两阶段无监督网络分析算法,用于从转录组数据中识别粗粒度和细粒度的基因模块 提出了一种新的嵌套共表达网络分析方法,能够识别传统方法可能遗漏的、对应于特定细胞类型子过程的紧凑基因集 NA 开发一种能够识别反映复杂生物过程的广泛和嵌套基因模块的转录组分析方法 基因表达数据中的基因模块 生物信息学 NA RNA-seq 无监督网络分析算法 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, scRNA-seq NA NA
13 2026-04-06
Unmasking FCGR2B as a high-grade serous ovarian cancer specific marker of immune suppression and tumor progression through multi-omics mining
2026-Apr-03, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过多组学挖掘揭示了FCGR2B作为高级别浆液性卵巢癌特异性免疫抑制和肿瘤进展标志物 整合亚型分层GWAS数据、血浆蛋白质组学和免疫细胞特征,构建了蛋白质-免疫-EOC调控图谱,并首次将FCGR2B鉴定为HGSOC中的关键免疫调节和预后生物标志物 研究主要基于遗传学关联分析,需要进一步实验验证FCGR2B的功能机制和临床转化潜力 探究血浆蛋白质如何影响免疫细胞特征并促进上皮性卵巢癌的发病机制 上皮性卵巢癌(EOC)及其五个主要组织学亚型,特别是高级别浆液性卵巢癌(HGSOC) 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、转录组分析 孟德尔随机化框架 基因组关联数据、血浆蛋白质组数据、免疫细胞特征数据 两个EOC队列的亚型分层GWAS数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-04-06
Spatially resolved osteoblast-traced transcriptomics uncovers TGF-β as a combination target with sclerostin in osteoporosis
2026-Apr-02, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 本研究利用空间分辨的成骨细胞追踪转录组学技术,揭示了TGF-β信号在调控成骨细胞激活中的作用,并提出TGF-β与硬化蛋白的双重抑制可作为骨质疏松症的治疗新策略 首次整合成骨细胞特异性谱系追踪与空间分辨激光激活细胞分选技术,在静止骨表面解析成骨细胞状态,并发现TGF-β是调控成骨细胞激活的关键因子 研究主要基于小鼠模型,其在人类骨质疏松症中的直接应用仍需进一步验证 探究成熟成骨细胞在活跃与静止状态间动态转换的调控机制,并开发针对骨质疏松症的骨合成代谢治疗新靶点 小鼠成骨细胞 空间转录组学 骨质疏松症 空间分辨激光激活细胞分选, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 空间分辨转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-04-06
Integrated spatial transcriptomics and pan-cancer XGBoost modeling uncover spatial drivers of immune exclusion and predict immunotherapy response
2026-Apr-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究整合空间转录组学和泛癌XGBoost模型,揭示了免疫排斥的空间驱动因素并预测免疫治疗反应 结合空间转录组学解析肿瘤免疫微环境的空间复杂性,并开发了泛癌XGBoost模型用于免疫治疗反应预测,超越了传统的PD-L1等标志物 研究涉及27种癌症类型,但具体样本量未在摘要中明确说明;模型性能虽优于传统标志物,但AUC为0.771仍有提升空间 解码免疫相关非编码RNA调控网络,揭示免疫排斥的空间驱动机制,并开发预测免疫治疗反应的机器学习工具 27种癌症类型的多组学数据,重点关注肺腺癌中的SNHG6-BIRC5轴 空间转录组学,机器学习 肺癌(肺腺癌),泛癌 空间转录组学,多组学分析,CRISPR-Cas9筛选,药物基因组学分析 XGBoost 空间转录组数据,多组学数据,CRISPR筛选数据,药物反应数据 涉及27种癌症类型,具体样本量未明确 NA 空间转录组学 NA NA
16 2026-04-06
Hepatic radiofrequency ablation induces widespread cellular activation throughout the liver
2026-Apr-02, European radiology experimental IF:3.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,探讨了肝射频消融后远处肝组织的细胞、转录和翻译水平激活情况 首次在单细胞水平上全面揭示了肝射频消融后远处肝组织的广泛细胞激活,包括细胞间互作、通路激活和蛋白质表达变化 研究仅使用小鼠模型,样本量较小(仅3只小鼠),且未涉及肿瘤模型,可能限制其临床直接应用 探究肝射频消融后远处肝组织的细胞、转录和翻译水平激活程度及其分子机制 健康C57/Bl6小鼠的肝组织 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 NA 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据 3只8-10周龄雄性C57/Bl6小鼠(2只接受RFA,1只对照) NA 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
17 2026-04-06
Nanoplastics target lung monocytes, disrupting immune dynamics
2026-Apr-02, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 本研究通过活体荧光成像、流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示了纳米塑料在小鼠体内的生物分布及其对肺免疫动力学的干扰作用 首次发现纳米塑料特异性靶向肺非经典单核细胞和CD206间质巨噬细胞,并揭示其通过延迟单核细胞向巨噬细胞分化来重编程肺免疫动态 研究仅使用雌性小鼠模型,未探索性别差异;长期暴露效应和具体分子机制仍需进一步研究 探究纳米塑料在体内的生物分布及其对免疫系统的直接细胞响应 雌性小鼠的肺组织和血液免疫细胞 单细胞组学 环境暴露相关免疫失调 单细胞RNA测序,流式细胞术,活体荧光成像 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据,成像数据 雌性小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-04-06
Chromatin remodeling in pericentral hepatocytes modulates MASH through CYP450 activity
2026-Apr-02, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究揭示了Lgr5+肝细胞中染色质重塑因子DPF2通过调控CYP450酶活性来调节全肝代谢稳态,从而影响代谢相关脂肪性肝病(MASLD/MASH)进展的机制 首次阐明了特定肝细胞亚群(Lgr5+肝细胞)通过染色质重塑调控CYP2酶表达,进而通过代谢物全反式维甲酸(atRA)非细胞自主性地协调全肝AMPK活性和代谢的机制 研究主要基于小鼠模型,虽然有人类肝组织验证,但临床转化仍需在更大规模的人类肝队列和精心设计的患者研究中得到证实 探究Lgr5+肝细胞中DPF2如何通过调控atRA稳态来协调肝脏范围内的AMPK介导的代谢,以理解代谢性肝病的发病机制 转基因C57BL/6J小鼠、人类肝组织、Lgr5+肝细胞 数字病理学 代谢相关脂肪性肝病 scRNA-seq, 空间转录组学, ATAC-seq, CUT&Tag, CUT&RUN, 多组学分析 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、表观基因组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq NA NA
19 2026-04-06
Metabolic reprogramming in lacrimal gland GVHD: Stage-specific shifts in acinar cells as drivers of disease progression
2026-Apr, The ocular surface
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了眼移植物抗宿主病(oGVHD)中泪腺细胞生态系统的时相特异性变化,特别是腺泡细胞的代谢重编程在疾病进展中的作用 首次在oGVHD中整合单细胞转录组学、伪时间轨迹分析和细胞间通讯网络,揭示了急性与慢性阶段腺泡细胞代谢重编程的时相特异性机制 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;单细胞测序数据可能受技术偏差影响 阐明oGVHD发病机制中泪腺细胞生态系统的时相特异性变化 小鼠泪腺细胞,特别是腺泡细胞、成纤维细胞、T细胞、浆细胞样树突状细胞和肥大细胞 单细胞组学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、细胞间通讯网络推断、免疫荧光验证 NA 单细胞转录组数据、图像数据 小鼠泪腺在急性(7天)和慢性(28天)GVHD阶段的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-04-06
Sirt1 deficiency promotes dynamic fibroblast-to-myofibroblast transition in ligamentum flavum hypertrophy via the Smad2/3 pathway
2026-Apr-01, Experimental cell research IF:3.3Q2
研究论文 本研究探讨了Sirt1在黄韧带肥厚中通过Smad2/3通路调控成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的作用 首次利用单细胞RNA测序揭示黄韧带肥厚中成纤维细胞的异质性,并发现Sirt1下调通过激活Smad2/3通路促进纤维化 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本的临床验证有限,且未探讨其他潜在通路或细胞类型的影响 阐明黄韧带肥厚纤维化的分子机制,并评估Sirt1作为治疗靶点的潜力 人类黄韧带样本和大鼠黄韧带肥厚模型 数字病理学 腰椎管狭窄症 单细胞RNA测序, 组织学分析, 免疫组化, 分子分析, 转录组学, 生物信息学分析 NA RNA序列数据, 图像数据, 分子数据 未明确指定样本数量,但包括人类样本和大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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