单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-08-05	Single-cell transcriptomic analyses reveal cellular and molecular patterns of rose petal responses to gray mold infection 2025-Sep, Horticulture research IF:7.6Q1 DOI:10.1093/hr/uhaf152 PMID:40756631	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了玫瑰花瓣对灰霉病感染的细胞和分子响应模式	首次在单细胞水平上解析了玫瑰花瓣对灰霉病感染的防御机制，鉴定了关键细胞群和调控基因	研究仅针对'Jumilia'玫瑰品种，结果可能不具备广泛代表性	探究玫瑰花瓣对灰霉病感染的防御机制	玫瑰花瓣细胞	植物病理学	灰霉病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	未明确说明样本数量
2	2025-08-05	BCLAF1 restrains stress responses in hematopoietic stem cells to support expansion and repopulation 2025-Aug-12, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024014916 PMID:40435510	研究论文	本文探讨了BCLAF1在造血干细胞（HSCs）应激反应中的调控作用及其对HSCs扩增和再植能力的影响	首次揭示了BCLAF1作为转录调节因子在限制HSCs应激反应中的新功能，从而保护HSCs在胚胎发生和干细胞移植后的再植功能	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类HSCs中进行验证	研究BCLAF1在HSCs应激反应和再植能力中的调控机制	小鼠造血干细胞（HSCs）	干细胞生物学	造血系统疾病	单细胞RNA测序	小鼠基因敲除模型	基因表达数据	小鼠胎儿和成年造血干细胞
3	2025-08-05	Single-cell eQTL Mapping Reveals Cell Subtype-specific Genetic Control and Mechanism in Malignant Transformation of Colorectal Cancer 2025-Aug-04, Cancer discovery IF:29.7Q1 DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1561 PMID:40029140	研究论文	本研究通过单细胞转录组、空间转录组和snMultiomes技术，揭示了结直肠癌恶性转化过程中的细胞和分子变化及动态细胞间相互作用	创建了结直肠癌单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)图谱，发现76%以上的sc-eQTL具有细胞类型特异性，且基于sc-eQTL的多基因风险评分显著提高了结直肠癌风险预测能力	NA	探究结直肠癌恶性转化过程中的细胞亚型特异性遗传调控机制	142个多阶段样本中的751,531个单细胞转录组	数字病理学	结直肠癌	单细胞转录组测序、空间转录组、snMultiomes	NA	单细胞转录组数据、空间转录组数据、snMultiomes数据	142个多阶段样本，751,531个单细胞
4	2025-08-05	Spatial Analysis of Hereditary Diffuse Gastric Cancer Reveals Indolent Phenotype of Signet Ring Cell Precursors 2025-Aug-04, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-1039 PMID:40192595	研究论文	本研究通过多组学分析探讨了遗传性弥漫性胃癌（DGC）早期印戒细胞（SRC）病变的分子表型及其与晚期DGC的差异	揭示了SRC病变中CDH1基因表达降低和细胞外基质重塑增加的特征，并发现SRC病变缺乏胃癌已知驱动基因的突变	样本量较小（20例），可能影响结果的普遍性	阐明遗传性弥漫性胃癌早期病变与晚期病变的分子差异	人类全胃切除标本中的SRC病变和晚期DGC	癌症研究	胃癌	空间转录组分析、单细胞RNA测序	NA	转录组数据	20例人类全胃切除标本
5	2025-08-05	CRISPR-based genetic tools for the study of host-microbe interactions 2025-Aug-04, Infection and immunity IF:2.9Q2 DOI:10.1128/iai.00510-24 PMID:40757822	综述	本文综述了基于CRISPR的遗传工具在宿主-微生物相互作用研究中的应用及其最新进展	利用CRISPR技术高效、精准、高通量地探索微生物组，并结合单细胞RNA测序等新兴技术研究宿主与微生物的复杂相互作用	当前CRISPR工具仍存在局限性，未来需要开发更先进的遗传工具包	研究宿主-微生物相互作用的遗传基础及其在健康和疾病中的作用	宿主细胞和微生物	基因编辑	NA	CRISPR筛选、靶向基因组编辑、记录系统、单细胞RNA测序	NA	遗传数据	NA
6	2025-08-05	Unraveling Liver Cirrhosis: Bridging Pathophysiology to Innovative Therapeutics 2025-Aug-03, Journal of gastroenterology and hepatology IF:3.7Q2 DOI:10.1111/jgh.70037 PMID:40754005	综述	本文综述了肝硬化的病理生理学、系统性影响及创新治疗方法的最新进展	整合了单细胞转录组学和空间生物学的最新发现，探讨了肠道微生物组在肝硬化中的作用，并介绍了抗纤维化药物、衰老细胞清除剂及干细胞治疗等新型治疗策略	未提及具体临床研究样本量或治疗效果数据	探讨肝硬化的病理机制与创新治疗方法的联系	肝硬化及其相关病理过程	医学研究	肝硬化	单细胞转录组学、空间生物学、弹性成像技术、液体活检	NA	NA	NA
7	2025-08-05	Revealing the core immunotoxicity of di-n-pentyl phthalate exposure in murine models using single-cell RNA sequencing 2025-Aug-02, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118754 PMID:40753775	研究论文	通过单细胞RNA测序技术揭示邻苯二甲酸二正戊酯（DNPP）在小鼠模型中的核心免疫毒性	首次使用单细胞RNA测序技术全面评估DNPP对免疫系统的毒性作用，揭示了DNPP对多种免疫细胞功能的影响	研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步在人体中验证	系统评估DNPP对免疫系统的影响	小鼠脾脏组织和外周血白细胞	免疫毒理学	免疫相关疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	RNA测序数据	不同剂量DNPP处理的小鼠脾脏组织
8	2025-08-05	Macrophage activation determines muscle wasting in pancreatic cancer 2025-Aug, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03434-9 PMID:40442475	研究论文	本研究探讨了胰腺癌中巨噬细胞激活对肌肉消耗的影响	通过单细胞RNA测序分析，确定了巨噬细胞在早期肌肉消耗中的关键作用，并揭示了CHI3L1-HDAC3信号通路的新机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	阐明胰腺癌相关恶病质中肌肉消耗的分子机制	胰腺癌小鼠模型和C2C12肌母细胞	癌症生物学	胰腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	Kras;Trp53;Pdx1-Cre (KPC)转基因小鼠模型	基因表达数据	PBMC(29,615个细胞)和MDST(23,151个细胞)
9	2025-08-05	Single cell RNA-sequencing reveals BHLHE40 and NDRG1 as key regulatory molecules modulating the trophoblastic senescence in preeclampsia 2025-Aug, Placenta IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.placenta.2025.06.009 PMID:40517485	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示BHLHE40和NDRG1作为调节子痫前期滋养细胞衰老的关键调控分子	首次通过整合生物信息学分析和实验验证，揭示了BHLHE40和NDRG1在子痫前期滋养细胞衰老中的关键调控作用	研究主要基于生物信息学分析和体外实验，体内功能验证和临床转化仍需进一步研究	探索子痫前期滋养细胞衰老的分子机制和关键调控靶点	子痫前期患者的胎盘组织和LPS诱导的子痫前期大鼠模型	生物信息学	子痫前期	单细胞RNA测序(scRNA-seq), ChIP检测, 批量转录组测序	WGCNA, nomogram模型	RNA测序数据	来自GEO数据库的多个数据集(GSE173193, GSE24129, GSE75010)以及人类PE胎盘和LPS诱导的PE大鼠模型
10	2025-08-05	Defining the Ovarian Cancer Precancerous Landscape through Modeling Fallopian Tube Epithelium Reprogramming Driven by Extracellular Vesicles 2025-Aug-01, Cancer research communications IF:2.0Q3 DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0064 PMID:40689422	研究论文	本研究通过微流体组织培养平台结合空间转录组学和蛋白质组学，探索了卵巢癌来源的小细胞外囊泡（sEV）对人类输卵管上皮（hFTE）的重编程作用	开发了一种新型微流体组织培养平台，结合空间转录组学和蛋白质组学技术，首次系统研究了sEV对hFTE的短期转录组变化和长期蛋白质组影响	研究仅使用了体外模型，未进行体内验证；样本量较小，仅观察了特定时间点的变化	探索卵巢癌前病变的分子机制，特别是sEV在输卵管上皮重编程中的作用	人类输卵管上皮组织（hFTE）和卵巢癌来源的小细胞外囊泡（sEV）	癌症生物学	卵巢癌	微流体组织培养平台，空间转录组学，蛋白质组学	体外组织培养模型	转录组数据，蛋白质组数据	未明确说明具体样本数量，但分析了1天和14天两个时间点的变化
11	2025-08-05	From Molecular Chaos to Precision Medicine in the Treatment of Cardiac Hypertrophy: A Rational Use of Natural Products by Integrating Artificial Intelligence and Multi-Omics Data 2025-Aug-01, Pharmacological research IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.phrs.2025.107898 PMID:40754044	综述	本文提出了一种结合天然产物、人工智能和多组学技术的创新方法，用于治疗心脏肥大	结合天然产物与AI及多组学技术，提出针对心脏肥大的精准药物治疗策略	NA	探索心脏肥大的精准治疗方法	心脏肥大的分子机制及治疗策略	精准医疗	心血管疾病	单细胞空间转录组学、机器学习算法	机器学习	多组学数据	NA
12	2025-08-05	Molecular insights into the causal role of TG/IDL in rheumatoid arthritis: Integrating Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing 2025-Aug-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123883 PMID:40754101	研究论文	本研究整合了孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，探讨了TG/IDL与类风湿性关节炎之间的因果关系及其分子机制	首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，揭示了TG/IDL作为类风湿性关节炎风险因素的分子机制，并鉴定了关键基因ABCA1、PLTP和GAS6的治疗潜力	研究结果主要基于小鼠模型和体外细胞培养，需要进一步在人体临床试验中验证	探讨TG/IDL与类风湿性关节炎之间的因果关系及其分子机制	类风湿性关节炎患者滑膜组织、胶原诱导性关节炎小鼠模型和成纤维样滑膜细胞培养	分子生物学	类风湿性关节炎	孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	胶原诱导性关节炎(CIA)小鼠模型	基因组关联研究(GWAS)数据、单细胞RNA测序数据	NA
13	2025-08-05	SCENE: Signature Collection for Endometrial Cancer Prognosis 2025-Aug, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70762 PMID:40754672	研究论文	该研究创建了一个名为SCENE的数据库，用于收集子宫内膜癌(EC)的转录组特征并与患者预后相关联	开发了首个将EC转录组特征与生存预后相关联的工具SCENE，填补了该领域空白	仅基于PubMed文献综述，可能未涵盖所有相关研究	提高子宫内膜癌预后预测的准确性	子宫内膜癌患者的转录组特征	数字病理学	子宫内膜癌	scRNA-seq	NA	转录组数据	约200项研究中的700个mRNA特征、60个miRNA和150个lncRNA
14	2025-08-05	Single-Cell Omics Analysis Reveals Immunological Dysregulation in COVID-19 and HIV: Identifying a Shared Abnormality of B Cell Activation via the Unfolded Protein Response and Diagnostic Biomarkers Using Machine Learning Algorithms 2025-Aug, Journal of medical virology IF:6.8Q1 DOI:10.1002/jmv.70538 PMID:40757697	研究论文	通过单细胞组学分析揭示COVID-19和HIV的免疫失调，发现B细胞通过未折叠蛋白反应异常激活的共同机制，并利用机器学习算法开发诊断生物标志物	首次在单细胞水平上揭示了COVID-19和HIV感染之间的相互作用，并发现B细胞中未折叠蛋白反应通路的异常激活是两种疾病的共同发病机制	研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证	探究COVID-19和HIV共同感染的分子机制	COVID-19和HIV感染患者的外周血细胞亚群	生物信息学	COVID-19, HIV	单细胞转录组测序	机器学习模型	转录组数据	大量批量转录组数据集验证
15	2025-08-05	Preliminary Study on GZMA- and GSDMB-Associated Pyroptosis and CD8+ T Cell-Mediated Immune Evasion in Skin Cutaneous Melanoma 2025-Jul-31, Current topics in medicinal chemistry IF:2.9Q3 DOI:10.2174/0115680266416033250731102049 PMID:40755114	研究论文	本研究探讨了GZMA和GSDMB相关的细胞焦亡及CD8+ T细胞介导的免疫逃逸在皮肤黑色素瘤中的作用	首次基于单细胞和批量RNA-seq数据，结合细胞焦亡特征，揭示了GZMA和GSDMB在皮肤黑色素瘤中的表达模式及其与预后的关系	未发现显著的细胞焦亡相关差异表达基因，且细胞焦亡通路在肿瘤组未被激活	揭示皮肤黑色素瘤基于细胞焦亡特征的潜在发病机制	皮肤黑色素瘤(SKCM)患者	肿瘤免疫学	皮肤黑色素瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序, qRT-PCR, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验	NA	RNA-seq数据, 临床信息	来自TCGA和GEO数据库的SKCM患者数据
16	2025-08-05	Traditional medicine Kuanxiong Aerosol alleviates atherosclerotic plaque inflammation by mitigating CX3CR1+ macrophage apoptosis via the cGAS-STING pathway 2025-Jul-30, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.157120 PMID:40753933	research paper	研究探讨传统中药宽胸气雾剂通过cGAS-STING通路减轻动脉粥样硬化斑块炎症的机制	首次阐明宽胸气雾剂对巨噬细胞亚群的调控作用及其抗凋亡功能	研究主要基于ApoE-/-小鼠模型，人类样本验证不足	探索宽胸气雾剂治疗动脉粥样硬化的潜力及机制	ApoE-/-小鼠及CX3CR1+巨噬细胞亚群	心血管疾病研究	心血管疾病	UHPLC-HRMS、单细胞RNA测序、生物信息学分析、分子对接	ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型	基因表达数据、组织学数据	未明确提及具体样本量，使用ApoE-/-小鼠模型
17	2025-08-05	Analyses of Nogo-Family Genes in Mouse and Human Microglia Omics Datasets Identify LINGO1 as a Candidate Drug Target in Alzheimer's Disease 2025-Jul-30, Current neuropharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.2174/011570159X359944250722061312 PMID:40754867	研究论文	本研究通过分析小鼠和人类小胶质细胞组学数据集，探讨了Nogo家族基因的表达模式，并发现LINGO1作为阿尔茨海默病的潜在药物靶点	首次在小鼠和人类小胶质细胞中全面分析Nogo家族基因的表达模式，并发现LINGO1在人类AD小胶质细胞中的高度富集	研究主要依赖公开数据集，可能受到数据质量和样本量的限制	探索Nogo信号系统在小胶质细胞中的功能及其在阿尔茨海默病中的作用	小鼠和人类小胶质细胞	神经科学	阿尔茨海默病	RNA-seq, RiboTag翻译分析, 单细胞测序	NA	组学数据	21个人类脑细胞单细胞测序数据集
18	2025-08-05	Single-Cell Transcriptomics: Technical Advances, Applications and Challenges in Cancer Drug Discovery 2025-Jul-30, Current cancer drug targets IF:2.3Q3 DOI:10.2174/0115680096372729250715050452 PMID:40754872	综述	本文全面概述了单细胞RNA测序技术的基本流程、发展轨迹及其在癌症药物发现中的应用，并探讨了该技术面临的挑战和未来方向	单细胞RNA测序技术为癌症药物发现提供了高分辨率的基因表达分析，能够深入理解肿瘤异质性并识别潜在药物靶点	文章讨论了单细胞RNA测序技术面临的挑战，但未具体说明技术限制或样本量不足等问题	增强读者对单细胞测序的理解，启发肿瘤药物开发的新思路，支持临床研究的转化应用	单细胞RNA测序技术在癌症药物发现中的应用	数字病理学	癌症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
19	2025-08-05	NNMT inhibition in cancer-associated fibroblasts restores antitumour immunity 2025-Jul-23, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-09303-5 PMID:40702186	研究论文	本文探讨了NNMT在高级别浆液性卵巢癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力	发现NNMT通过诱导H3K27me3低甲基化驱动CAFs分泌补体，吸引免疫抑制性MDSCs，并开发了特异性NNMT抑制剂以恢复抗肿瘤免疫	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	研究NNMT在肿瘤微环境中的免疫调节作用及其作为治疗靶点的潜力	高级别浆液性卵巢癌、乳腺癌和结肠癌的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和免疫细胞	肿瘤免疫学	卵巢癌、乳腺癌、结肠癌	空间转录组学、单细胞RNA测序、高通量筛选	小鼠肿瘤模型	RNA测序数据、免疫组化数据	多种小鼠癌症模型
20	2025-08-05	Renin Cells Drive Kidney Neurovascular Development and Arterial Remodeling when Renin Activity is Deficient 2025-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.07.08.663706 PMID:40672316	研究论文	该研究通过新型超亮肾素细胞特异性tdTomato报告小鼠、高分辨率3D成像和单细胞RNA测序技术，揭示了肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的作用	使用新型超亮肾素细胞特异性tdTomato报告小鼠和高分辨率3D成像技术，首次详细描绘了肾素细胞与神经纤维及周围细胞的相互作用	研究依赖于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探索肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的功能	肾素细胞及其与周围神经纤维和细胞的相互作用	细胞生物学	肾脏疾病	单细胞RNA-Seq, 高分辨率3D成像	tdTomato报告小鼠	图像, 基因表达数据	小鼠模型