单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28333 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-06-01 |
IGFBP7: A novel biomarker involved in a positive feedback loop with TGF-β1 in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Sep, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111867
PMID:40381971
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，鉴定出与特发性肺纤维化(IPF)密切相关的四个枢纽基因，并确认IGFBP7作为一种新型生物标志物，揭示了其与TGF-β1信号通路的正反馈循环在IPF发病机制中的作用 | 首次发现IGFBP7作为IPF的新型生物标志物，并揭示其与TGF-β1信号通路形成的正反馈循环机制 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，需要进一步临床验证 | 探索IPF的新型生物标志物以改善诊断和治疗策略 | 特发性肺纤维化(IPF)患者样本和细胞模型 | 生物医学研究 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序, 双免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据 | 公共数据集分析（具体数量未明确说明） |
| 2 | 2025-06-01 |
New insights into cancer immune checkpoints landscape from single-cell RNA sequencing
2025-Jul, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189298
PMID:40088992
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在癌症免疫检查点阻断治疗中的应用，揭示了肿瘤微环境的异质性及其对治疗反应的影响 | 利用单细胞RNA测序技术高分辨率描绘了免疫检查点之间的功能相互作用，识别了新的免疫检查点作为潜在治疗靶点 | 未提及具体样本量或实验设计的局限性 | 探讨免疫检查点阻断治疗的疗效差异机制及潜在新靶点 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 3 | 2025-06-01 |
Snail1 as a key prognostic biomarker of cancer-associated fibroblasts in breast tumors
2025-Jul, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189316
PMID:40222423
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综述 | 本文总结了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在乳腺癌中的研究进展，特别是Snail1作为关键预后生物标志物的作用 | 揭示了Snail1在CAFs中的表达与恶性肿瘤的关联，并发现了一个新的与Snail1相关的基因特征，具有预后潜力 | 主要基于已有研究和患者样本的总结，缺乏新的实验数据验证 | 探讨CAFs在乳腺癌中的异质性及其预后价值，特别是Snail1的作用 | 乳腺癌患者样本和小鼠模型中的CAFs | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4 | 2025-06-01 |
Prediction of Clinically Significant Prostate Cancer by a Specific Collagen-related Transcriptome, Proteome, and Urinome Signature
2025-Jun, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2024.05.014
PMID:38851995
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研究论文 | 通过胶原相关转录组、蛋白质组和尿液组特征预测临床显著性前列腺癌 | 研究发现胶原相关基因和蛋白质在前列腺癌中的差异表达，并建立了基于胶原的机器学习模型，其预测性能优于PSA和年龄，与mpMRI相当 | 研究的回顾性性质是一个限制 | 分析胶原相关转录组、蛋白质组和尿液组变化以检测临床显著性前列腺癌 | 前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | 机器学习模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 尿液组数据 | 转录组(n=1393), 蛋白质组(n=104), 尿液组(n=923) |
| 5 | 2025-06-01 |
Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis
2025-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC
PMID:39642371
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research paper | 该研究揭示了表观遗传调节因子CBX5在肺纤维化中的作用，通过调控成纤维细胞的代谢重编程来抑制纤维化 | 首次发现CBX5在肺纤维化中通过调控代谢重编程维持成纤维细胞的持续激活状态 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化仍需进一步验证 | 探究表观遗传调控在肺纤维化发病机制中的作用 | 肺成纤维细胞和特发性肺纤维化(IPF)组织 | 分子生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫组化、RNA测序分析 | NA | 基因表达数据、组织样本 | NA |
| 6 | 2025-06-01 |
Construction and validation of a regulatory T cells-based classification of renal cell carcinoma: an integrated bioinformatic analysis and clinical cohort study
2025-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-01030-9
PMID:39714755
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和临床队列研究，构建并验证了基于调节性T细胞的肾细胞癌分类系统 | 首次定义了44个与Treg状态相关的预后基因，并构建了RCC-TSC分类系统，揭示了高免疫浸润肾细胞癌亚型的预后和治疗意义 | 研究主要基于回顾性数据，需要前瞻性研究进一步验证 | 探索调节性T细胞与肾细胞癌异质性的关系，并建立预后分类系统 | 肾细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化染色 | monocle2伪时间分析、多变量Cox比例风险回归分析 | RNA-seq数据、临床数据 | TCGA-KIRC队列的537个RNA-seq样本和新华队列的370例肾肿瘤患者 |
| 7 | 2025-06-01 |
ENPP1 promotes immune suppression, drug resistance, and adverse outcomes in bladder cancer: Potential for targeted therapy
2025-Jun, Cancer genetics
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.cancergen.2025.03.001
PMID:40058167
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research paper | 本研究探讨了ENPP1在膀胱癌中的表达及其对肿瘤进展、凋亡和免疫微环境的影响 | 首次系统研究了ENPP1在膀胱癌中的作用机制，并发现其与免疫抑制、药物耐药性和不良预后的关联 | 样本量相对较小（36例患者），且主要基于体外细胞实验和生物信息学分析 | 探索ENPP1在膀胱癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 膀胱癌组织和细胞系 | 肿瘤学 | 膀胱癌 | RT-qPCR、Western blotting、免疫组化、scRNA-seq | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA-BLCA和GEO数据集中的膀胱癌样本，以及36例本地临床膀胱癌患者样本 |
| 8 | 2025-06-01 |
Characterizing the Cellular Constituents of Proximal Airway Disease in Granulomatosis With Polyangiitis
2025-Jun, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.1197
PMID:40062629
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了肉芽肿性多血管炎(GPA)患者近端气道黏膜的细胞组成，揭示了GPA风险基因在免疫细胞中的定位及其独特的炎症T细胞亚群 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面解析GPA气道疾病的细胞组成，并发现GPA特有的CD4-/CD8-炎症T细胞亚群 | 研究样本量较小(n=9 GPA患者)，且为单中心研究 | 阐明GPA近端气道疾病的细胞组成和发病机制 | 肉芽肿性多血管炎(GPA)患者的近端气道黏膜组织 | 数字病理学 | 肉芽肿性多血管炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Monocle 3(用于伪时间分析) | RNA测序数据 | GPA患者9例，特发性声门下狭窄(iSGS)7例，插管后近端狭窄(PIPS)5例，对照10例 |
| 9 | 2025-06-01 |
Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease
2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00296.2024
PMID:39772753
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综述 | 本文探讨了肺内皮细胞在健康和肺血管疾病中的异质性，以及单细胞RNA测序技术在这一领域的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了肺内皮细胞的异质性及其在肺动脉高压发病机制中的作用，并发现了新的细胞类型和疾病机制 | NA | 研究肺内皮细胞异质性及其在肺血管疾病中的作用 | 肺内皮细胞 | 生物医学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 10 | 2025-06-01 |
Bioinformatics identification of shared signaling pathways and core targets linking Benzo[a]pyrene exposure to HCC progression
2025-06, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2025.154129
PMID:40174762
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探索苯并[a]芘(BaP)在肝癌进展中的潜在分子机制 | 首次通过综合数据库分析和分子对接技术，识别了BaP与肝癌相关的核心靶点及其作用通路 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索环境污染物BaP在肝癌进展中的分子机制 | 苯并[a]芘(BaP)与肝癌的关联机制 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析、分子对接 | NA | 基因组数据、蛋白质互作数据 | 从多个数据库获取的数据，具体样本量未明确说明 |
| 11 | 2025-06-01 |
NOTCH1 Mutation and Survival Analysis of Tislelizumab in Advanced or Metastatic Esophageal Squamous Cell Carcinoma: A Biomarker Analysis From the Randomized, Phase III, RATIONALE-302 Trial
2025-Jun, Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology
IF:42.1Q1
DOI:10.1200/JCO-24-01818
PMID:40179324
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research paper | 该研究通过基因组分析和转录组测序，发现NOTCH1突变可作为预测食管鳞状细胞癌患者使用tislelizumab治疗长期生存的潜在生物标志物 | 首次将NOTCH1突变与tislelizumab治疗的生存益处相关联，并通过单细胞RNA测序揭示了Notch1缺陷如何增强肿瘤微环境的免疫激活 | 研究样本来自特定的临床试验（RATIONALE-302），可能限制了结果的普遍适用性 | 探索和验证能够预测食管鳞状细胞癌患者对PD-1靶向治疗反应的生物标志物 | 晚期或转移性食管鳞状细胞癌患者 | digital pathology | esophageal squamous cell carcinoma | 基因组分析、转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | genomic and transcriptomic data | RATIONALE-302研究中的样本 |
| 12 | 2025-06-01 |
Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03011-7
PMID:40211026
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研究论文 | 本研究构建了一个多维策略，用于预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后 | 通过整合基因组特征、肿瘤免疫微环境和单细胞转录组数据，开发了一个新的预测模型（EM-CXCL10），其预测性能优于传统的肿瘤突变负荷（TMB）和突变评分 | 样本量较小（60例患者），且仅部分患者接受了基因测序和细胞因子检测 | 预测晚期胆道癌患者对免疫治疗的反应 | 晚期胆道癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胆道癌 | 520基因面板测序、多重循环细胞因子检测、单细胞转录组测序 | LASSO算法、Cox回归模型 | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | 60例晚期胆道癌患者（30例基因测序，50例细胞因子检测） |
| 13 | 2025-06-01 |
Alternative splicing in autism spectrum disorder: Recent insights from mechanisms to therapy
2025-Jun, Asian journal of psychiatry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.ajp.2025.104501
PMID:40273800
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review | 本文综述了自闭症谱系障碍(ASD)中可变剪接(AS)的最新研究进展，从机制到治疗 | 强调了异常剪接事件及其调节因子在ASD发病机制中的作用，并探讨了新兴技术在AS研究中的应用 | NA | 理解ASD中异常剪接的机制及其功能后果，以揭示该疾病的分子基础并促进治疗策略的开发 | 自闭症谱系障碍(ASD)中的可变剪接(AS)机制 | 自然语言处理 | 自闭症谱系障碍 | 长读长测序、单细胞测序、空间转录组学和CRISPR-Cas系统 | NA | RNA数据 | NA |
| 14 | 2025-06-01 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal unique subpopulations of infiltrating macrophages and dendritic cells following AKI
2025-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00059.2025
PMID:40331777
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了急性肾损伤后浸润的巨噬细胞和树突状细胞的独特亚群 | 结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术，首次全面描述了急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的时空及转录特征 | 研究仅关注了缺血再灌注损伤模型，未涉及其他类型的肾损伤 | 阐明急性肾损伤后肾脏浸润免疫细胞的动态变化特征 | 肾脏浸润巨噬细胞(KIMs)和肾脏树突状细胞(KDCs) | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | scRNAseq, 空间转录组学, CITE测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA |
| 15 | 2025-06-01 |
Dynamics of T Cell-Mediated Immune Signaling Network During Pathogenesis of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun, Yonsei medical journal
IF:2.6Q1
DOI:10.3349/ymj.2024.0227
PMID:40414827
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术分析了慢性阻塞性肺疾病（COPD）从轻度到重度阶段的免疫信号网络动态，并探讨了COPD与COVID-19之间的相关性 | 揭示了COPD从轻度到重度阶段的免疫反应变化模式，并发现中度COPD与COVID-19存在相似的生物学模式 | 样本量相对较小，特别是重度COPD患者和COVID-19患者的样本数量有限 | 识别COPD病情进展的特征，并探索COPD与COVID-19之间的相关性 | 健康个体、COPD患者（轻度、中度、重度）和COVID-19患者 | 生物医学研究 | 慢性阻塞性肺疾病、COVID-19 | Bulk RNA测序、单细胞RNA分析、单核RNA分析 | NA | RNA测序数据 | 健康个体50人（43+7）、COPD患者49人（39+7+7+3）、COVID-19患者20人 |
| 16 | 2025-06-01 |
Identification and regulation of EMT cells in vivo by laser stimulation
2025-Jun, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0268350
PMID:40438388
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research paper | 本研究通过激光刺激方法探究PLCG2在上皮-间质转化(EMT)细胞中的作用及其调控机制 | 首次使用飞秒激光扫描光刺激方法激活细胞内钙信号并诱导PLCG2上调，揭示了PLCG2在EMT调控中的直接作用 | PLCG2抑制剂对转移性细胞无显著影响，其作用机制仍需进一步研究 | 探究PLCG2在上皮-间质转化(EMT)和肿瘤发展中的调控作用 | 前列腺癌PC3细胞及皮下肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 前列腺癌 | 飞秒激光扫描光刺激、单细胞RNA测序 | 皮下肿瘤模型 | 基因表达数据 | NA |
| 17 | 2025-06-01 |
Anoikis in hepatocellular carcinoma: genetic alterations and immune microenvironment insights from single-cell and computational analysis
2025-May-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02770-2
PMID:40447878
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和计算分析，探讨了肝细胞癌中失巢凋亡的遗传变异和免疫微环境特征，并构建了一个基于机器学习的预后模型 | 利用单细胞测序技术揭示肝细胞癌中失巢凋亡相关基因的细胞异质性，并首次结合101种机器学习算法构建高预测性能的预后模型 | 研究样本量有限，且模型验证主要依赖公开数据库数据 | 分析肝细胞癌的细胞异质性并构建失巢凋亡相关的预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本和Hep-3B细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、qPCR、shRNA介导的基因敲低 | 机器学习(101种算法) | 单细胞测序数据、临床样本数据 | 来自GEO、TCGA和ICGC数据库的肝细胞癌患者数据，以及临床样本和细胞系实验 |
| 18 | 2025-06-01 |
GSTM1 suppresses cardiac fibrosis post-myocardial infarction through inhibiting lipid peroxidation and ferroptosis
2025-May-31, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00610-6
PMID:40448227
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研究论文 | 本研究探讨了GSTM1在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其机制 | 首次发现GSTM1通过调节脂质代谢和铁死亡相关通路抑制纤维化的起始和进展 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床应用的转化仍需进一步验证 | 探究GSTM1在心肌梗死后纤维化中的作用机制 | 心肌梗死后的心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 蛋白质组学/scRNA-seq、Western blotting、免疫荧光、实时定量PCR、AAV9介导的基因过表达 | 小鼠冠状动脉结扎模型 | 分子表达数据、细胞功能数据 | 小鼠模型和人类扩张型心肌病患者样本 |
| 19 | 2025-06-01 |
Unravelling heart failure cellular signalling heterogeneity with spatial transcriptomics
2025-May-30, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf311
PMID:40444774
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-06-01 |
DiSC: a Statistical Tool for Fast Differential Expression Analysis of Individual-level Single-cell RNA-seq Data
2025-May-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf327
PMID:40444783
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研究论文 | 介绍了一种名为DiSC的统计工具，用于快速分析个体水平单细胞RNA测序数据的差异表达 | DiSC通过提取多个分布特征并联合测试它们与感兴趣变量的关联，使用灵活的置换测试框架控制假发现率，具有高统计功效和计算效率 | 虽然DiSC是为scRNA-seq数据开发的，但其稳健的测试框架也可应用于其他类型的单细胞数据 | 开发一种高效且统计功效强大的方法，用于分析个体水平单细胞RNA测序数据的差异表达 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | COVID-19, 阿尔茨海默病 | scRNA-seq, 流式细胞术 | 统计模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA |