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当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-05 |
MLRR-ATV: A Robust Manifold Nonnegative Low-Rank Representation With Adaptive Total-Variation Regularization for scRNA-seq Data Clustering
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3432740
PMID:39046863
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研究论文 | 本文提出了一种名为MLRR-ATV的新型单细胞RNA测序数据聚类方法，通过自适应全变分正则化和流形学习来减少噪声影响并保留数据结构 | 将自适应全变分正则化引入低秩表示模型，通过梯度学习减少噪声，并同时学习线性和非线性流形结构 | 模型是非凸的，需要采用交替方向乘子法进行优化，可能影响计算效率 | 开发一种鲁棒的单细胞RNA测序数据聚类方法，以改善基因表达数据的分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示模型 | 基因表达数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-04-05 |
Deep Imputation Bi-Stochastic Graph Regularized Matrix Factorization for Clustering Single-Cell RNA-Sequencing Data
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3387911
PMID:38607719
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研究论文 | 提出一种基于深度矩阵分解和双随机图正则化的单细胞RNA测序数据聚类新方法 | 结合特征选择、缺失值填补、降维处理和双随机图正则化的深度矩阵分解框架 | 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率及对特定细胞类型的适用性 | 开发单细胞RNA测序数据的聚类算法以揭示细胞异质性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度矩阵分解 | 基因表达矩阵 | 九个数据集（未指定具体样本量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-04-05 |
Human organoids with an autologous tissue-resident immune compartment
2024-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07791-5
PMID:39143209
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研究论文 | 本研究开发了包含自体组织驻留免疫细胞的人类肠道免疫类器官，用于模拟上皮与免疫系统的相互作用 | 首次构建了整合自体组织驻留记忆T细胞的人类肠道免疫类器官，能够模拟体内免疫-上皮相互作用 | 类器官系统可能无法完全复制体内复杂的微环境，且研究主要聚焦于T细胞，未涵盖所有免疫细胞类型 | 研究组织驻留免疫细胞与上皮细胞的相互作用机制，及其在疾病中的作用 | 人类肠道上皮细胞和自体组织驻留记忆T细胞 | 细胞生物学 | 自身免疫疾病和癌症 | 单细胞转录组学 | 人类肠道免疫类器官 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-04-05 |
Transcriptional control of the Cryptosporidium life cycle
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07466-1
PMID:38811723
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了隐孢子虫完整生命周期的基因表达程序，并鉴定了控制雄性发育的关键转录因子Myb-M | 推翻了现有模型，提出隐孢子虫仅存在三种细胞内阶段；首次鉴定了决定雄性命运的最早转录因子Myb-M；通过条件性表达和敲除证明了该因子对发育程序和感染的调控作用 | NA | 阐明隐孢子虫生命周期和性别发育的分子机制，为疫苗和治疗开发提供新靶点 | 隐孢子虫（Cryptosporidium parvum） | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 体外培养和感染动物模型中的隐孢子虫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-04-05 |
Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain-Barré syndrome
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06916-6
PMID:38233524
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研究论文 | 本研究通过体外T细胞筛选、单细胞RNA测序和T细胞受体测序，揭示了吉兰-巴雷综合征患者中靶向周围神经髓鞘抗原的自反应性T细胞的存在及其特征 | 首次在吉兰-巴雷综合征患者中鉴定出具有细胞毒性T辅助1样表型的自反应性记忆CD4 T细胞和罕见CD8 T细胞，并证明这些细胞在血液和脑脊液中共享，且直接参与疾病病理生理 | 研究样本量有限，仅从一名患者的神经活检中鉴定出自反应性T细胞，且疾病亚型聚焦于脱髓鞘变异型 | 探究吉兰-巴雷综合征的自免疫机制，特别是自反应性T细胞在疾病中的作用 | 吉兰-巴雷综合征患者（尤其是脱髓鞘变异型）的血液、脑脊液和神经活检样本 | 免疫学 | 吉兰-巴雷综合征 | 体外T细胞筛选、单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 | 超过1,000个自反应性单T细胞克隆，来自多名患者和对照个体的血液、脑脊液及一名患者的神经活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-04-05 |
An IL-4 signalling axis in bone marrow drives pro-tumorigenic myelopoiesis
2024-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06797-9
PMID:38057662
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了IL-4信号轴在骨髓中驱动促肿瘤性髓系生成的关键作用，并探索了其作为免疫检查点阻断联合疗法的潜力 | 首次在人类和小鼠非小细胞肺癌中通过单细胞RNA测序鉴定出IL-4是肿瘤浸润单核细胞来源巨噬细胞表型的主要驱动因子，并发现骨髓中嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞来源的IL-4通过作用于粒细胞-单核细胞祖细胞编程免疫抑制性肿瘤促进髓系细胞的发育 | 临床试验样本量较小（仅6名患者），且仅有一名患者显示出接近完全的临床反应，需要更大规模的验证 | 探究免疫抑制性髓系细胞状态的分子驱动机制，并开发针对癌症的系统性治疗策略 | 人类和小鼠的非小细胞肺癌病变组织及骨髓细胞 | 单细胞测序与免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 人类和小鼠非小细胞肺癌样本，临床试验涉及6名复发或难治性非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-04-05 |
Single-cell transcriptomic profiling of microvascular endothelial cell heterogeneity in congenital diaphragmatic hernia
2023-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-37050-y
PMID:37330615
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了先天性膈疝（CDH）肺中微血管内皮细胞的异质性，特别是炎症性mvEC簇和mvCa4+ ECs的减少，可能参与疾病发病机制 | 首次在CDH模型中利用单细胞RNA测序识别出转录组学上不同的微血管内皮细胞簇，包括独特的炎症性mvEC簇和与肺发育相关的mvCa4+ ECs减少 | 研究基于大鼠硝苯酮模型，可能无法完全模拟人类CDH的复杂性；样本量相对较小；未进行功能验证实验 | 探究先天性膈疝肺中微血管内皮细胞异质性及其与肺发育不良和重塑的关系 | 大鼠胎儿肺组织（E21.5），包括健康对照组、硝苯酮暴露对照组和硝苯酮诱导的CDH组 | 数字病理学 | 先天性膈疝 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组大鼠胎儿肺组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-04-05 |
Ocular macrophage origin and heterogeneity during steady state and experimental choroidal neovascularization
2020-Nov-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-020-02010-0
PMID:33187533
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠和人类脉络膜中巨噬细胞的起源和异质性，特别是在稳态和实验性脉络膜新生血管形成（CNV）条件下的变化 | 首次系统性地揭示了脉络膜巨噬细胞在稳态和激光损伤后的异质性，并鉴定了小鼠和人类中不同的巨噬细胞亚群及其与疾病（如nAMD）的关联 | 研究主要基于小鼠模型和已发表的单细胞RNA-seq数据，可能无法完全反映人类nAMD的复杂性，且样本量有限 | 探究脉络膜巨噬细胞的起源、异质性及其在脉络膜新生血管形成（CNV）中的作用，以寻找nAMD的潜在治疗靶点 | 小鼠（野生型和Ccr2-/-突变体）以及人类脉络膜样本（来自健康个体和nAMD患者） | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 多参数流式细胞术、单细胞RNA-seq、命运映射 | NA | 流式细胞数据、单细胞RNA-seq数据 | 小鼠模型和已发表的人类单细胞RNA-seq数据（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-04-05 |
Simultaneous single-cell profiling of lineages and cell types in the vertebrate brain
2018-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4103
PMID:29608178
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研究论文 | 本研究开发了scGESTALT方法，结合CRISPR-Cas9条形码编辑和单细胞RNA测序，用于同时分析脊椎动物大脑中的细胞谱系和类型 | scGESTALT通过可诱导系统在多个时间点编辑条形码，首次实现了在发育后期同时进行大规模谱系追踪和细胞类型鉴定 | 方法目前主要应用于斑马鱼大脑，在其他生物体或疾病模型中的适用性有待进一步验证 | 开发一种同时分析细胞谱系关系和细胞类型的方法，以揭示脊椎动物大脑发育过程中的分化限制 | 斑马鱼大脑中的细胞 | 单细胞组学 | NA | CRISPR-Cas9条形码编辑，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约60,000个转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-04-04 |
Single-cell landscape of piglet lung response with Actinobacillus pleuropneumoniae
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2646800
PMID:41843736
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了猪肺在感染胸膜肺炎放线杆菌后的免疫反应和纤维化特征 | 首次在猪肺感染模型中应用单细胞RNA测序技术，系统性地鉴定了18个细胞亚群，并揭示了单核细胞、中性粒细胞和浆细胞样树突状细胞在感染后的富集和基因表达变化，以及胸膜肺炎放线杆菌通过抑制单核细胞分化和触发肺泡巨噬细胞凋亡来减少巨噬细胞数量的机制 | 研究仅针对猪肺模型，未直接验证在人类纤维化肺病中的适用性，且样本量可能有限，未详细说明具体样本数量 | 探究猪肺对胸膜肺炎放线杆菌感染的免疫反应和纤维化机制 | 猪肺组织，包括感染和未感染胸膜肺炎放线杆菌的猪肺样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-04-04 |
Identification of Novel Drug Targets for Pulmonary Arterial Hypertension through Integrated Plasma Proteomics
2026-Apr-03, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.5c01199
PMID:41777075
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研究论文 | 本研究通过整合血浆蛋白质组学数据，利用蛋白质组范围孟德尔随机化等方法，识别了与肺动脉高压（PAH）因果相关的血浆蛋白，并评估了其作为药物靶点的潜力 | 首次采用蛋白质组范围孟德尔随机化（PWMR）方法结合多组学数据（包括GWAS、scRNA-seq和PheWAS）系统性地识别PAH的潜在药物靶点，并利用分子对接预测小分子结合能力 | 研究主要基于遗传关联数据，缺乏直接的实验验证；PheWAS分析未发现经FDR校正后的显著不良表型关联，但可能存在未检测到的副作用 | 识别肺动脉高压（PAH）的因果相关血浆蛋白，并评估其作为新型药物靶点的潜力 | 肺动脉高压（PAH）相关的血浆蛋白质 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 蛋白质组范围孟德尔随机化（PWMR）、贝叶斯共定位、SMR、药物预测、分子对接、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、表型范围关联研究（PheWAS） | 孟德尔随机化模型、贝叶斯模型、分子对接模型 | 基因组关联研究（GWAS）数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、表型关联数据 | 整合了两个大型蛋白质组GWAS数据集和两个PAH GWAS数据集，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 12 | 2026-04-04 |
Self-regulating hydrogel for diabetic wound healing: From animal models to a pilot clinical study
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed4981
PMID:41920988
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研究论文 | 本研究开发了一种自调节水凝胶（GPP@ZnBG），用于糖尿病伤口愈合，通过响应高血糖和氧化应激释放治疗性离子，并在动物模型和初步临床研究中验证其疗效 | 开发了能响应糖尿病伤口中高血糖和氧化应激的自pH调节水凝胶，实现锌、钙和硅酸盐离子的顺序释放，以同时靶向感染和组织再生 | 初步临床研究样本量较小，需进一步大规模验证；长期安全性和有效性尚未全面评估 | 开发一种新型水凝胶治疗平台，以改善慢性糖尿病伤口的愈合过程 | 糖尿病伤口愈合，包括动物模型（糖尿病小鼠）和人类患者 | 生物医学工程 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 动物模型（糖尿病小鼠）和初步临床研究患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-04-04 |
Integrated bioinformatics analysis of the shared molecular mechanisms between Parkinson's disease and COVID-19
2026-Apr-03, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00908-25
PMID:41930954
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序，探讨了帕金森病与COVID-19之间的共享分子机制 | 首次通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，识别出CHI3L1作为连接帕金森病与COVID-19的关键基因，并揭示了星形胶质细胞在调节神经炎症和突触可塑性中的核心作用 | 研究依赖于公开数据库的样本，样本量有限，且需要更大规模的研究来验证CHI3L1的功能意义和病理相关性 | 探究帕金森病与COVID-19之间的共享致病机制和潜在治疗靶点 | 帕金森病患者和COVID-19患者的脑组织样本 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 未明确具体样本数量，使用了公开数据库中的COVID-19和帕金森病样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-04-04 |
Global scientific growth and thematic development of spatial transcriptomics in oncology research
2026-Apr-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04937-x
PMID:41931230
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2026-04-04 |
New perspectives on the mechanisms and treatment of valvular heart disease: Mendelian randomization and systematic analysis based on plasma proteins
2026-Apr-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048210
PMID:41931316
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化和系统分析，识别了瓣膜性心脏病的关键分子靶点和潜在治疗候选物 | 首次结合孟德尔随机化、药物重定位、分子对接、蛋白质-蛋白质相互作用网络及单细胞RNA测序分析，全面探索VHD的分子机制和治疗靶点 | 基于公开的GWAS汇总统计数据，可能受限于样本异质性和潜在混杂因素；药物预测和分子对接结果需实验验证 | 识别瓣膜性心脏病的关键分子靶点和潜在治疗候选物 | 瓣膜性心脏病相关的血浆蛋白和基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化、全基因组关联研究、功能富集分析、药物重定位、分子对接、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组关联研究汇总统计数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-04-04 |
Transcriptome data combined with two-sample Mendelian randomization reveal IRF1 and PRKD1 as UPR-related key regulators in intervertebral disc degeneration
2026-Apr-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048213
PMID:41931350
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据与双样本孟德尔随机化分析，揭示了IRF1和PRKD1作为未折叠蛋白反应相关关键调控因子在椎间盘退变中的作用 | 首次结合多组学数据与孟德尔随机化方法，系统性地识别并验证了UPR相关基因IRF1和PRKD1在IDD中的因果驱动作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证其分子机制 | 探究未折叠蛋白反应相关基因在椎间盘退变发生发展中的调控作用 | 人类髓核组织 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 基于GSE70362和GSE56081两个公共数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-04-04 |
Exploring Parkinson's through the Lens of Genomics and Bioinformatics
2026-Apr-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041621
PMID:39929729
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综述 | 本文综述了基因组学和生物信息学在帕金森病研究中的应用，探讨了从风险基因识别到单细胞转录组学技术如何推动对疾病分子机制的理解 | 整合了近三十年来基因组学数据生成和生物信息学分析技术的革命性进展，特别强调了单细胞转录组学技术在揭示帕金森病细胞类型特异性失调方面的最新应用 | NA | 通过神经基因组学和生物信息学方法解析帕金森病的复杂本质，以识别新的治疗干预靶点 | 帕金森病的遗传和分子机制，包括风险基因、疾病通路以及人类大脑组织中的细胞类型特异性失调 | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因分型、基因组测序、转录组学、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-04-04 |
Altered MDC1 Interactions and Dysfunctional DNA Repair in Lobular Breast Cancer Confers Sensitivity to PARP Inhibition
2026-Apr-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1217
PMID:41512199
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研究论文 | 本文探讨了乳腺浸润性小叶癌（ILC）中MDC1与ER的相互作用如何导致DNA修复功能障碍，并揭示其对PARP抑制剂的敏感性 | 发现ILC细胞中MDC1相互作用组呈现独特的“BRCA样”状态，缺乏关键同源重组蛋白，但不同于经典“BRCAness”，并首次证明PARP抑制剂他拉唑帕利在ILC中具有持久生长抑制作用 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，临床样本验证有限，且未详细探讨MDC1-ER相互作用的分子机制 | 探究MDC1如何调节ILC中的ER活性和DNA修复功能，并评估PARP抑制剂的治疗潜力 | 乳腺浸润性小叶癌（ILC）细胞及肿瘤组织 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、信号传导和功能数据评估 | NA | 转录组数据、功能数据 | 多个ILC异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-04-04 |
Translation of scRNA-seq to a clinical blood test for infection diagnostics
2026-Apr-02, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2026.2647154
PMID:41918251
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综述 | 本文讨论了将单细胞RNA测序技术转化为临床血液检测用于感染诊断的方法，重点介绍了无需细胞分选的单细胞类型基因表达量化技术 | 引入了基于比率的生物标志物DIRECT LS-TA，能够无需细胞分选即可估计单细胞类型（单核细胞）特异性基因表达，提供了一种更经济、易于临床实施的方法 | 文中讨论的单细胞RNA测序和细胞分选后基因表达分析等方法在常规临床环境中难以实施，且传统感染诊断测试存在周转时间和成本等限制 | 开发一种早期、准确的热病患者分诊方法，用于感染诊断 | 外周血单核细胞的基因表达 | 数字病理学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序，定量PCR，数字PCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-04-04 |
Single-cell transcriptome profiling reveals herpesviral manipulation of host processes in spleen of gibel carp infected with a Cyvirus cyprinidallo2
2026-Apr-02, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014114
PMID:41926453
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了疱疹病毒在感染银鲫脾脏中操纵宿主细胞过程的机制 | 首次在银鲫中应用单细胞RNA测序技术，识别了疱疹病毒的主要易感细胞（巨噬细胞和壁细胞），并揭示了病毒通过抑制宿主抗病毒反应和上调负向免疫调节因子来促进感染的新机制 | 研究仅关注了脾脏组织，未涉及其他可能受影响的器官；样本量相对较小，可能影响统计显著性；功能验证实验可能不够全面 | 解析疱疹病毒（Cavirus cyprinidallo2）与宿主银鲫之间的相互作用机制，特别是病毒如何操纵宿主细胞过程导致疾病 | 感染疱疹病毒的银鲫（Carassius auratus）脾脏组织 | 单细胞转录组学 | 疱疹病毒性造血坏死伴急性鳃出血 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但基于感染鱼的脾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |