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当前共找到 66 篇文献,本页显示第 41 - 60 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-06-08
Age-associated differences in XBB.1.5 trivalent booster vaccine-induced adaptive responses revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Dec, Emerging microbes & infections IF:8.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示XBB.1.5三价加强疫苗诱导的适应性反应中与年龄相关的差异 首次使用单细胞RNA测序技术系统比较老年人和年轻人在接种XBB.1.5三价重组蛋白加强疫苗后免疫反应的年龄相关差异,揭示了B细胞和T细胞转录轨迹的年龄特异性变化 需要进一步的纵向和功能研究来阐明这些观察结果的机制基础和临床意义 表征老年人对更新版COVID-19加强疫苗免疫反应的年龄相关差异 22名年轻个体(<38岁)和20名老年个体(≥73岁),均曾接种过2-3剂灭活COVID-19疫苗 机器学习 新型冠状病毒肺炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 42名个体(22名年轻和20名老年)的外周血单核细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
42 2026-06-07
Neoplastic CD3⁺ B cells remodel the DLBCL tumor microenvironment via single-cell and spatial transcriptomics
2026-Dec-31, Cancer biology & therapy IF:4.4Q2
research paper 通过整合单细胞、单核和空间转录组学数据,构建弥漫性大B细胞淋巴瘤的高分辨率多组学图谱,发现了一群表达CD3的恶性B细胞亚群 首次识别出弥漫性大B细胞淋巴瘤中表达CD3的恶性B细胞亚群,并揭示其由BCLAF1、CHURC1、FLI1、NFATC2和ELF2等关键调控基因驱动的遗传回路,以及其在肿瘤微环境重塑和临床预后中的重要作用 未明确提及研究局限性 构建弥漫性大B细胞淋巴瘤的高分辨率多组学图谱,并探索肿瘤微环境中的细胞异质性和分子机制 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的肿瘤样本 machine learning diffuse large B-cell lymphoma single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq, spatial transcriptomics NA gene expression data 未明确提及样本数量 10x Genomics single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3' 和 10x Visium 空间转录组学平台
43 2026-06-07
Ubiquitination-anchored signature defines neuroendocrine prostate cancer: hub genes and single-cell ecosystem insights from integrated bioinformatics analysis of public transcriptomic datasets
2026-Dec-31, The aging male : the official journal of the International Society for the Study of the Aging Male
研究论文 通过整合公共转录组数据集,结合生信分析定义泛素化标记基因特征,并揭示其在神经内分泌前列腺癌中的核心基因及单细胞生态系统 首次将泛素化失调与神经内分泌前列腺癌谱系可塑性关联,通过整合 bulk 和单细胞转录组数据定义以泛素化为中心的诊断和治疗相关特征及肿瘤微环境回路 结果依赖于公共数据集,需在前瞻性收集的临床队列中进行外部验证,缺乏蛋白水平评估 定义神经内分泌前列腺癌中的泛素化相关基因特征,并探索其在诊断和治疗中的潜在价值 神经内分泌前列腺癌与前列腺腺癌的转录组数据 生物信息学 神经内分泌前列腺癌 RNA-seq, scRNA-seq 共表达网络、蛋白互作网络 基因表达数据、单细胞转录组数据 GEO发现队列49个组织样本;单细胞数据集25,325个细胞 NA bulk RNA-seq, scRNA-seq NA NA
44 2026-06-06
T cell populations are negatively correlated with natural killer and macrophage cell populations in aspirate samples of peripheral lymphadenopathies
2026-Dec, Virulence IF:5.5Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序对结核病患者肉芽肿性淋巴结进行细胞和通讯网络分析 首次通过细针抽吸物的单细胞RNA测序描述结核肉芽肿性淋巴结的细胞组成和通讯网络,并发现T细胞与NK细胞及巨噬细胞/树突状细胞群呈负相关关系,且可检测到结核分枝杆菌RNA并识别单个感染细胞 NA 描述结核病患者肉芽肿性淋巴结的细胞类型和通讯网络特征 结核病患者的外周淋巴结细针抽吸样本 单细胞组学 结核病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 19名结核病患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
45 2026-06-05
ANXA2, DBN1, ZNF385D, and IL6ST: Endothelial cell biomarkers linking atherosclerosis progression to immune microenvironment dysregulation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
研究论文 通过多组学整合和机器学习方法,鉴定与动脉粥样硬化进展和免疫微环境失调相关的内皮细胞生物标志物ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST 首次利用单细胞转录组数据构建动脉粥样硬化图谱,结合高维WGCNA和机器学习筛选出四个内皮细胞特异性诊断基因,并通过分子对接预测其与沙利度胺和白藜芦醇的结合能力 NA 识别与动脉粥样硬化进展和免疫微环境失调相关的内皮细胞生物标志物 内皮细胞生物标志物ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、高维WGCNA、LASSO回归、SVM-RFE、ssGSEA、CIBERSORT、分子对接 NA 基因表达数据 来自单细胞RNA测序数据集的动脉粥样硬化单细胞图谱 NA 单细胞RNA测序 NA NA
46 2026-06-05
Immune-related biomarkers for major depressive disorder identified via integrated bioinformatics and machine learning
2026-Dec, European journal of psychotraumatology IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别出与重度抑郁症相关的免疫相关生物标志物 首次整合多个基因表达数据集并结合两种机器学习算法(LASSO和SVM-RFE)筛选MDD诊断标志物,并通过单细胞RNA测序和动物模型进行验证 未说明具体限制 识别重度抑郁症的免疫相关生物标志物以改善早期和客观诊断 重度抑郁症患者和慢性不可预测轻度应激大鼠模型 机器学习 重度抑郁症 RNA-seq, 单细胞RNA测序 LASSO, SVM-RFE 基因表达数据 来自GEO数据库的多个数据集及CUMS大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
47 2026-05-30
Exploring the key functions of T cells and the regulation of the immune microenvironment in prostate cancer using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2026-12-31, Autoimmunity IF:3.3Q3
研究论文 利用单细胞RNA测序和批量RNA测序探索前列腺癌中T细胞的关键功能及免疫微环境调控 通过整合单细胞和批量RNA测序数据,系统分析T细胞亚群在前列腺癌肿瘤微环境中的分布模式及其与临床病理参数的相关性,并构建基于T细胞标志基因的预后风险模型 未明确说明 系统阐明前列腺癌肿瘤微环境中T细胞亚群的分布及其功能,并构建预后模型以评估免疫治疗相关性 前列腺癌患者肿瘤微环境中的T细胞 自然语言处理 前列腺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 预后风险模型 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 16,999个单细胞(质量控制后) NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
48 2026-05-30
Exploring the molecular mechanisms underlying the inflammation-cancer transformation in Hashimoto thyroiditis using single-cell transcriptomics
2026-12-31, Autoimmunity IF:3.3Q3
研究论文 通过单细胞转录组学探究桥本甲状腺炎炎症-癌变转化的分子机制 首次利用单细胞RNA测序技术揭示桥本甲状腺炎向甲状腺乳头状癌转化过程中IL1B阳性滤泡上皮细胞通过FN1/CD44轴招募肥大细胞,后者分泌IL-8激活PI3K/AKT通路促进恶性表型的创新机制 仅基于公共数据库和体外细胞模型验证,缺乏体内实验和更大样本量的临床验证 阐明桥本甲状腺炎相关甲状腺乳头状癌中炎症向癌症转化的分子机制 桥本甲状腺炎和甲状腺乳头状癌组织中的单细胞 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析,差异基因表达筛选,功能富集分析,细胞间通讯分析,Transwell共培养模型 NA 单细胞转录组数据,体外实验数据 未明确说明具体样本数量,但包括HT相关和PTC组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
49 2026-05-25
Integrating tumor and immune cell transcriptomics to predict immune checkpoint inhibitor primary resistance in metastatic melanoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 通过整合肿瘤和免疫细胞转录组学预测转移性黑色素瘤对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 使用单细胞RNA测序指导的免疫解卷积方法,识别出四种免疫细胞亚群作为耐药预后指标,并构建了82基因转录组特征签名 样本量较小(46例发现队列和54例验证队列),且液态活检仅用于8例患者的scRNA-seq分析 基于新型基因表达特征预测免疫检查点抑制剂原发性耐药的生物标志物 转移性皮肤黑色素瘤患者治疗前的肿瘤微环境转录组和外周血单核细胞 机器学习 黑色素瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 46例发现队列FFPE RNA-seq样本,54例独立验证队列样本,8例scRNA-seq液态活检样本,46例流式细胞术样本 NA 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA NA
50 2026-05-06
Altered crosstalk of bacterial lipopolysaccharide with immune cells in colorectal cancer compared to paired adjacent intestinal tissue
2026-Dec-31, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 应用3D光片成像、空间转录组学和成像质谱流式技术,比较结直肠癌与癌旁组织中细菌脂多糖与免疫细胞的交互作用变化 首次在患者来源的结直肠癌及癌旁组织中,结合多种空间组学技术同时可视化细菌脂多糖、免疫细胞和血管,揭示了肿瘤微环境中免疫细胞-细菌交互作用的区域差异 样本量有限,未深入探讨细菌组成对交互作用的具体影响机制 探究结直肠癌中细菌脂多糖与免疫细胞空间交互作用的改变及其对宿主-微生物互作的影响 结直肠癌患者肿瘤组织及其配对癌旁肠组织 数字病理学 结直肠癌 3D光片成像, 空间转录组学, 成像质谱流式 NA 图像, 转录组数据 患者来源的结直肠癌及癌旁组织样本 NA 空间转录组学, 成像质谱流式 NA NA
51 2026-04-30
3C suppresses PINK1-mediated mitophagy and contributes to coxsackievirus B3 replication
2026-Dec, Virulence IF:5.5Q1
研究论文 揭示柯萨奇病毒B3非结构蛋白3C通过抑制PINK1介导的线粒体自噬促进病毒复制的机制 首次发现转录因子FOSL1作为PINK1转录的负调控因子,并阐明3C/FOSL1/PINK1/MAVS信号轴在病毒性心肌炎发病机制中的关键作用 未提及具体限制 研究柯萨奇病毒B3如何通过抑制PINK1介导的线粒体自噬促进病毒复制 柯萨奇病毒B3感染的心肌细胞和小鼠模型 数字病理学 病毒性心肌炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2026-04-25
Identification and multi-layered experimental validation of feature genes related to butyrate metabolism and oxidative stress in sepsis
2026-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
研究论文 该研究鉴定了与败血症中丁酸代谢和氧化应激相关的特征基因,并通过多层面实验验证了其表达和诊断价值 首次系统鉴定败血症中丁酸代谢和氧化应激相关的特征基因,并利用单细胞RNA测序揭示单核细胞在其中的关键作用 尚未提及具体限制,但可能存在样本量有限和机制研究不够深入的问题 阐明败血症中丁酸代谢和氧化应激相关基因的分子特征,寻找潜在治疗靶点 败血症相关基因、丁酸代谢和氧化应激相关基因 机器学习 败血症 RNA-seq、单细胞RNA-seq、CIBERSORT免疫浸润分析 机器学习算法 基因表达数据、单细胞数据 多个败血症相关数据集及前瞻性收集的临床样本 Illumina 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq Illumina NovaSeq 未提供具体配置详情
53 2026-04-17
Dietary conjugated linoleic acid enhances resistance to Salmonella infection by promoting PPARγ-mediated metabolic reprogramming and effector function in CD8⁺ T cells
2026-Dec-31, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究揭示了膳食共轭亚油酸通过激活PPARγ信号通路,促进肠道CD8⁺ T细胞的代谢重编程和效应功能,从而增强宿主对鼠伤寒沙门氏菌感染的黏膜抵抗力 首次阐明膳食共轭亚油酸通过PPARγ介导的代谢重编程增强CD8⁺ T细胞效应功能,从而抵抗肠道感染的分子机制 研究主要基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性尚需验证;且未详细探讨不同CLA异构体的特异性作用 探究膳食共轭亚油酸增强宿主对沙门氏菌感染抵抗力的免疫学机制 小鼠肠道CD8⁺ T细胞、肠道微生物群、鼠伤寒沙门氏菌感染模型 免疫代谢学 肠道感染 单细胞RNA测序、ATAC-seq、粪便微生物移植、药理学抑制 NA 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、微生物组数据 NA NA 单细胞RNA-seq、ATAC-seq NA NA
54 2026-04-12
Oxidative stress in neurodegeneration: from a simple insult to a dynamic regulator
2026-Dec-31, Redox report : communications in free radical research IF:5.2Q1
综述 本文综述了氧化应激在神经退行性疾病中的核心作用,将其重新定义为一种复杂的动态调控系统,并探讨了其分子机制及先进的抗氧化干预技术策略 将氧化应激重新定义为神经退行性疾病中一个复杂的动态调控系统,而非单一事件,并整合了亚细胞器靶向、纳米载体递送以及单细胞/空间组学等先进技术策略,为开发靶向和个性化治疗提供了新视角 本文是一篇综述,主要基于现有文献进行分析和整合,未报告新的原始实验数据或临床研究结果 评估氧化应激在神经退行性疾病中的核心作用,探索其动态调控特征、信号通路、分子机制以及先进的抗氧化干预技术策略 神经退行性疾病中的氧化应激过程及其调控 NA 神经退行性疾病 单细胞氧化还原组学,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞组学,空间转录组学 NA NA
55 2026-04-04
Single-cell landscape of piglet lung response with Actinobacillus pleuropneumoniae
2026-Dec, Virulence IF:5.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了猪肺在感染胸膜肺炎放线杆菌后的免疫反应和纤维化特征 首次在猪肺感染模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地鉴定了18个细胞亚群,并揭示了单核细胞、中性粒细胞和浆细胞样树突状细胞在感染后的富集和基因表达变化,以及胸膜肺炎放线杆菌通过抑制单核细胞分化和触发肺泡巨噬细胞凋亡来减少巨噬细胞数量的机制 研究仅针对猪肺模型,未直接验证在人类纤维化肺病中的适用性,且样本量可能有限,未详细说明具体样本数量 探究猪肺对胸膜肺炎放线杆菌感染的免疫反应和纤维化机制 猪肺组织,包括感染和未感染胸膜肺炎放线杆菌的猪肺样本 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2026-04-02
Single-cell transcriptome deciphers key targets of thrombopoietin receptor agonists and immune microenvironment characteristics of immune thrombocytopenia
2026-Dec, Platelets IF:2.5Q2
研究论文 本研究结合网络药理学与单细胞转录组学,系统解析了四种血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的关键靶点及免疫微环境特征 首次整合网络药理学与单细胞高维加权基因共表达网络分析,系统鉴定出TPO-RAs在ITP中的五个关键靶点基因,并揭示了骨髓微环境中异常的细胞间通讯和巨核细胞成熟动力学紊乱 研究主要基于计算生物学和体外数据验证,缺乏体内实验的直接功能验证;样本量可能有限,且ITP患者的异质性可能影响结果的普适性 阐明血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的作用分子机制,并探索其治疗靶点 免疫性血小板减少症患者的骨髓单细胞转录组数据、四种TPO-RAs药物(罗米司亭、艾曲泊帕、阿伐曲泊帕、海曲泊帕)的靶点 生物信息学 免疫性血小板减少症 单细胞RNA测序、网络药理学、高维加权基因共表达网络分析、分子对接、伪时间轨迹分析、计算机基因敲低 hdWGCNA、分子对接模型、伪时间分析模型 单细胞转录组数据 ITP患者和健康对照的骨髓单细胞RNA测序数据(具体样本数未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
57 2026-03-13
Immunotherapy impact of macrophage glycosylation on cholangiocarcinoma and its prognostic and immune microenvironment significance
2026-Dec-31, Human vaccines & immunotherapeutics IF:4.1Q2
研究论文 本研究基于糖基化相关基因构建了胆管癌预后模型,并探讨了巨噬细胞糖基化在免疫治疗中的影响 首次通过单细胞RNA测序分析胆管癌巨噬细胞亚群的糖基化模式,并构建了包含五个基因的糖基化相关风险模型,同时验证了PGK1在促进糖基化终末产物积累和巨噬细胞M2极化中的作用 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验和临床样本的进一步验证 开发基于糖基化相关基因的预后模型,以预测胆管癌的预后和免疫治疗反应 胆管癌肿瘤微环境中的巨噬细胞糖基化模式 生物信息学 胆管癌 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,差异表达基因分析,LASSO Cox回归 风险评分模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2026-02-20
Bulk and single-cell transcriptomics for identification of potential diagnostic biomarkers associated with pulmonary arterial hypertension and integrated stress response and experimental validation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
研究论文 本研究通过整合生物信息学、单细胞转录组学和实验方法,识别并验证了与肺动脉高压相关的四个新型整合应激反应相关诊断生物标志物 首次系统探索整合应激反应相关基因在肺动脉高压发病机制中的作用,并利用单细胞转录组学揭示其细胞类型特异性表达 研究主要基于公开数据集和临床血液样本,缺乏更广泛的组织样本验证 识别和验证肺动脉高压的潜在诊断生物标志物 肺动脉高压患者和对照组的转录组数据及临床血液样本 生物信息学 肺动脉高压 RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, ELISA 机器学习 转录组数据 多个数据集(GSE38267, GSE131793, GSE210248)及临床血液样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
59 2026-02-20
Diethyl Phthalate (DEP) as a potential osteosarcoma risk factor: a multi-omics study integrating network Toxicology, single-cell RNA sequencing, and molecular docking
2026-Dec, Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过整合网络毒理学、单细胞RNA测序和分子对接等多组学方法,探究了邻苯二甲酸二乙酯(DEP)作为潜在骨肉瘤风险因子的作用机制 首次将网络毒理学、单细胞RNA测序和分子动力学模拟相结合,系统研究DEP在骨肉瘤中的作用机制,并鉴定了P4HA2、COL18A1和COL10A1等新型生物标志物 研究主要基于计算分析和体外验证,缺乏体内实验验证DEP的直接致癌效应 探究邻苯二甲酸二乙酯(DEP)在骨肉瘤发生发展中的分子机制 骨肉瘤(OS)相关基因和信号通路 生物信息学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、分子动力学模拟、机器学习 LASSO、SVM-RFE、Boruta算法 基因表达数据、蛋白质互作数据、分子结构数据 未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
60 2026-02-06
Single-cell transcriptomics and machine-learning reveal M1 macrophage-driven progression from minimal change disease to focal segmental glomerulosclerosis
2026-Dec, Renal failure IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和机器学习,揭示了M1巨噬细胞驱动从微小病变肾病向局灶节段性肾小球硬化进展的关键基因 首次结合单细胞转录组学和机器学习识别出六个与M1巨噬细胞激活相关的关键基因,作为预测疾病进展的潜在生物标志物 研究主要基于小鼠和SD大鼠模型,人类样本验证有限,且疾病进展机制可能涉及更多因素 探究微小病变肾病向局灶节段性肾小球硬化进展的分子机制,并识别预测性生物标志物 MCD和FSGS患者的单细胞转录组数据,以及SD大鼠模型 机器学习 肾病综合征 单细胞转录组学,qRT-PCR,免疫组织化学染色 机器学习算法 单细胞转录组数据,基因表达数据 基于公开数据集GSE213030和GSE176465,以及SD大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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