单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 12 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-12 |
T cell populations are negatively correlated with natural killer and macrophage cell populations in aspirate samples of peripheral lymphadenopathies
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2624191
PMID:41606824
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结核病患者肉芽肿淋巴结的细胞组成和通讯网络 | 首次在细针穿刺样本中应用单细胞RNA测序描述结核病肉芽肿淋巴结的细胞特征，并发现T细胞与NK细胞及巨噬细胞/树突状细胞群呈负相关 | 样本量较小（仅19名患者），且细胞亚群丰度在个体间差异较大，可能影响统计显著性 | 探究结核病肉芽肿淋巴结的细胞组成和细胞间通讯网络 | 结核病患者的肉芽肿淋巴结细针穿刺样本 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19名患者的细针穿刺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-02-12 |
Single-cell transcriptome revealed the aberrant keratinocytes activation in antigen presentation in atopic dermatitis
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2627742
PMID:41666125
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据，揭示了特应性皮炎中角质形成细胞在抗原呈递中的异常激活机制 | 首次在单细胞水平上系统比较了人类特应性皮炎患者、自发愈合患者及卵清蛋白诱导小鼠模型中角质形成细胞的转录组变化，并特别关注了其抗原处理与呈递途径的激活差异 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证；卵清蛋白诱导的小鼠模型未能完全模拟人类慢性特应性皮炎的角质形成细胞激活机制 | 探究特应性皮炎中角质形成细胞的异常激活机制及其在慢性炎症中的作用 | 健康对照、慢性活动性特应性皮炎患者、自发愈合特应性皮炎患者及卵清蛋白诱导的特应性皮炎小鼠模型的皮肤组织 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含健康对照、慢性活动性AD患者、自发愈合AD患者及AD小鼠模型的皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-02-11 |
Immune-related biomarkers for major depressive disorder identified via integrated bioinformatics and machine learning
2026-Dec, European journal of psychotraumatology
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/20008066.2026.2619389
PMID:41665627
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学与机器学习方法，识别出与免疫相关的重度抑郁症生物标志物 | 首次结合LASSO和SVM-RFE两种机器学习算法筛选生物标志物，并通过单细胞RNA测序数据验证其在免疫细胞亚群中的表达 | 研究主要基于公共基因表达数据集，实验验证仅在CUMS大鼠模型中进行，未涉及人类临床样本 | 开发重度抑郁症的早期客观诊断生物标志物 | 重度抑郁症相关基因表达数据及CUMS大鼠模型 | 机器学习 | 重度抑郁症 | 高通量转录组学、单细胞RNA测序 | LASSO、SVM-RFE | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，包含GEO数据库多个数据集及CUMS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-02-10 |
ANXA2, DBN1, ZNF385D, and IL6ST: Endothelial cell biomarkers linking atherosclerosis progression to immune microenvironment dysregulation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
DOI:10.1080/10641963.2026.2627352
PMID:41655191
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞多组学数据和机器学习方法，识别了四个内皮细胞相关生物标志物（ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST），这些标志物连接了动脉粥样硬化进展与免疫微环境失调 | 首次结合高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）和机器学习（LASSO回归、SVM-RFE）从单细胞数据中筛选内皮细胞特异性诊断标志物，并探索其与免疫细胞浸润的关联及潜在治疗药物的结合能力 | 研究基于生物信息学分析，缺乏体内或体外实验验证；样本来源和数量未明确说明；药物结合预测仅通过分子对接模拟，需实验验证 | 识别动脉粥样硬化的内皮细胞相关诊断生物标志物，并阐明其与免疫微环境失调的关联 | 动脉粥样硬化患者的内皮细胞及免疫微环境 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、差异表达分析、LASSO回归、支持向量机递归特征消除（SVM-RFE）、单样本基因集富集分析（ssGSEA）、CIBERSORT算法、分子对接模拟 | LASSO回归、SVM-RFE | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-02-06 |
Single-cell transcriptomics and machine-learning reveal M1 macrophage-driven progression from minimal change disease to focal segmental glomerulosclerosis
2026-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2026.2620204
PMID:41622775
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和机器学习，揭示了M1巨噬细胞驱动从微小病变肾病向局灶节段性肾小球硬化进展的关键基因 | 首次结合单细胞转录组学和机器学习识别出六个与M1巨噬细胞激活相关的关键基因，作为预测疾病进展的潜在生物标志物 | 研究主要基于小鼠和SD大鼠模型，人类样本验证有限，且疾病进展机制可能涉及更多因素 | 探究微小病变肾病向局灶节段性肾小球硬化进展的分子机制，并识别预测性生物标志物 | MCD和FSGS患者的单细胞转录组数据，以及SD大鼠模型 | 机器学习 | 肾病综合征 | 单细胞转录组学，qRT-PCR，免疫组织化学染色 | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 基于公开数据集GSE213030和GSE176465，以及SD大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-02-06 |
Research on tissue-resident macrophages in the field of cancer research: a bibliometric analysis from 2004 to 2025
2026-Dec, Cell adhesion & migration
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/19336918.2026.2624204
PMID:41627832
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综述 | 本研究通过文献计量学方法分析了2004年至2025年间肿瘤研究中组织驻留巨噬细胞的研究现状与趋势 | 采用VOSviewer、CiteSpace、R软件和WoSCC构建可视化文献计量网络，对TRMs在肿瘤学领域的研究进行定量分析，并深入探讨未来研究方向 | NA | 分析肿瘤微环境中组织驻留巨噬细胞的研究现状、热点和趋势 | 组织驻留巨噬细胞（TRMs），特别是小胶质细胞和库普弗细胞等亚群 | 肿瘤学 | 癌症 | 文献计量分析，单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-01-29 |
Distinct T and innate-like lymphocyte reprogramming following lyophilized fecal microbiota transplantation in recurrent C. difficile infection
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2620127
PMID:41574864
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序，探索了冻干粪便微生物移植在复发性艰难梭菌感染中的免疫重编程机制 | 首次提供了冻干粪便微生物移植在复发性艰难梭菌感染中的单细胞免疫图谱，揭示了适应性及先天样淋巴细胞群体的独特转录特征 | 样本量较小，仅为探索性研究，结果需在更大队列中验证 | 阐明粪便微生物移植预防复发性艰难梭菌感染的免疫机制 | 接受冻干粪便微生物移植或冻干无菌粪便滤液治疗的复发性艰难梭菌感染患者 | 单细胞测序分析 | 复发性艰难梭菌感染 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 流式细胞术分析19名LFMT和18名LSFF接受者，单细胞RNA测序分析2名LFMT接受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-01-23 |
Multi-platform analysis of the tumor immune microenvironment associated with breast cancer subtypes
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2610535
PMID:41530924
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研究论文 | 本研究通过多平台分析揭示了乳腺癌不同分子亚型之间肿瘤免疫微环境的显著差异 | 首次结合多重免疫组化、单细胞RNA测序和两种反卷积算法，系统比较了PAM50各亚型的免疫景观，并观察到NK细胞和CD8 T细胞在特定亚型中的富集 | 未明确说明样本来源的具体队列特征（如治疗史、分期等），且未进行功能性验证实验 | 探索乳腺癌不同分子亚型与肿瘤免疫微环境特征之间的关联 | 乳腺癌肿瘤组织及其免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序, 反卷积算法 | NA | 图像, 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-01-12 |
Oncolytic virus OVV-03 enhances CAR-T cell therapy against glioblastoma via immune modulation and specific HER2 upregulation
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2612377
PMID:41496551
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的、携带HER2基因的溶瘤病毒OVV-03，并评估了其单独使用以及与CAR-T细胞联合治疗胶质母细胞瘤的疗效和机制 | 开发了一种新型的、携带HER2基因的溶瘤病毒OVV-03，首次揭示了其通过抑制JNK-c-Fos/c-Jun轴下调PD-L1的机制，并证明了其与B7H3或HER2靶向的CAR-T细胞疗法具有显著的协同抗肿瘤作用 | 研究主要在临床前模型（小鼠模型和细胞系）中进行，其安全性和有效性在人体中的表现仍需进一步的临床试验验证 | 评估新型溶瘤病毒OVV-03单独及联合CAR-T细胞疗法治疗胶质母细胞瘤的疗效，并探究其作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞系、患者来源的胶质母细胞瘤细胞、小鼠胶质母细胞瘤模型 | NA | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-01-07 |
Single-cell landscape of peripheral and tumor-infiltrating immune cells in HPV-negative HNSCC
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2605741
PMID:41467967
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间蛋白质组学数据，揭示了HPV阴性头颈鳞状细胞癌中肿瘤浸润免疫细胞的景观及其空间分布特征 | 首次在HPV阴性HNSCC中整合单细胞转录组与空间蛋白质组数据，揭示了细胞毒性细胞耗竭的空间特异性模式及其与疾病进展的关联 | 样本量相对有限（29个单细胞样本，9个空间验证样本），且空间验证样本均来自舌侧黏膜，可能限制结论的普适性 | 解析HPV阴性头颈鳞状细胞癌的肿瘤免疫微环境特征，寻找免疫治疗新靶点 | HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤浸润免疫细胞和外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据，空间蛋白质组数据 | 29个单细胞测序样本（约300,000个细胞），9个空间验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 11 | 2026-01-05 |
Gut microbiota dysbiosis exacerbates acute pancreatitis via Escherichia coli-driven neutrophil heterogeneity and NETosis
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2606480
PMID:41439481
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研究论文 | 本研究揭示了肠道菌群失调，特别是大肠杆菌的增多，通过重塑免疫系统、促进异常中性粒细胞胞外诱捕网形成，从而加剧急性胰腺炎的机制 | 首次将肠道菌群失调与急性胰腺炎中特定的中性粒细胞亚群异质性及NETosis通路激活联系起来，并明确了革兰氏阴性菌（尤其是大肠杆菌）是关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型，人体样本验证相对有限；特定细菌与免疫亚群之间的直接因果机制仍需进一步阐明 | 探究肠道菌群失调加剧急性胰腺炎的具体微生物种类及其免疫学机制 | 无菌小鼠、无特定病原体小鼠、急性胰腺炎患者的粪便样本 | 微生物组学与免疫学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序、鸟枪法宏基因组测序、粪便微生物移植、抗生素调节实验、单菌定植实验 | NA | 单细胞转录组数据、宏基因组数据、病理学数据 | 小鼠模型及急性胰腺炎患者的粪便样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 宏基因组测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-01-01 |
Exploring the key functions of T cells and the regulation of the immune microenvironment in prostate cancer using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2026-Dec-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2025.2596700
PMID:41474172
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，系统探究了前列腺癌中T细胞亚群的功能及其对肿瘤免疫微环境的调控作用，并构建了一个基于T细胞标记基因的预后风险模型 | 首次在前列腺癌中结合单细胞和bulk RNA测序数据，从多角度（细胞互作、拟时序、富集分析等）系统解析T细胞功能，并构建和验证了一个新的基于T细胞标记基因（BCAS2, EIF2S2, RIOK3, ATP6V1E1）的预后模型 | 研究基于公共数据集或有限样本，缺乏大规模独立队列的外部验证；单细胞数据样本量相对较小（16,999个细胞），可能无法完全代表所有患者亚型；功能机制研究主要基于生物信息学预测，缺乏实验验证 | 系统研究前列腺癌肿瘤微环境中T细胞亚群的分布模式及其与临床病理参数的相关性，并探索T细胞在免疫治疗中的作用 | 前列腺癌患者的肿瘤微环境，特别是其中的T细胞 | 生物信息学，肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 预后风险模型（基于基因标记），ssGSEA，ESTIMATE算法 | 基因表达数据（单细胞和bulk RNA-seq） | 单细胞数据包含16,999个细胞（经过质控后），具体患者样本数未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |