单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-08-20
Hippocampal LANCL1 attenuates postoperative cognitive dysfunction via the SIRT1/PGC-1α-mediated mitochondrial biogenesis
2026-Nov, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨海马LANCL1通过SIRT1/PGC-1α介导的线粒体生物发生减轻术后认知功能障碍的作用 首次揭示LANCL1在术后认知功能障碍中的保护作用及其通过SIRT1/PGC-1α信号轴增强线粒体生物发生的机制 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且未探讨长期效应或潜在副作用 阐明LANCL1在术后认知功能障碍中的作用机制,并评估其治疗潜力 老年小鼠海马组织的LANCL1表达及其对术后认知功能的影响 神经科学 术后认知功能障碍 慢病毒载体介导的基因过表达、单细胞测序、线粒体功能分析、组织学分析 小鼠模型 基因表达数据、线粒体功能数据、组织学图像、单细胞测序数据 未明确样本量,使用老年小鼠(具体数量未提供) NA 单细胞测序 NA NA
2 2026-08-17
DLL3 serves as a pivotal hub bridging malignant progression and immunosuppression in NECC with therapeutic implications validated via the organoid-TIL co-culture system
2026-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示宫颈神经内分泌癌(NECC)的肿瘤微环境及DLL3作为连接恶性进展与免疫抑制的关键分子,并通过类器官-肿瘤浸润淋巴细胞共培养系统验证靶向治疗潜力 首次通过单细胞RNA测序描绘NECC中神经元祖细胞状态及免疫微环境,创新性地建立NECC来源的类器官与肿瘤浸润淋巴细胞共培养系统,用于评估靶向DLL3的AMG757联合化疗的疗效 摘要中未提及明确的局限性 阐明NECC的肿瘤免疫微环境和致癌机制,并探索靶向DLL3的免疫治疗新策略 宫颈神经内分泌癌(NECC)患者肿瘤组织、肿瘤浸润淋巴细胞及类器官 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序、多色免疫组化、类器官培养、共培养系统 NA 单细胞转录组数据、病理图像 未在摘要中明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3 2026-08-12
ConMGIN: Interpretable multilayer GIN-Bayesian framework for spatial domain analysis
2026-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1
研究论文 提出ConMGIN,一种结合图同构网络与混合贝叶斯网络的图表示学习模型,用于空间转录组数据的空间域识别 创新性地引入基于切比雪夫距离的图构建方法,强调最大坐标偏差以形成更稳健的邻域连接,增强边界清晰度,并集成混合贝叶斯网络以更好建模空间异质性 未提及局限性 解决空间转录组中空间域识别对空间异质性信息利用不足的问题 多个空间转录组数据集,涵盖不同平台和空间分辨率 生物信息学 NA 空间转录组测序 图同构网络(GIN)、混合贝叶斯网络 空间转录组数据 多个数据集,具体数量未提及 NA 空间转录组学 NA NA
4 2026-08-08
Single-cell transcriptomics identifies potential roles of CCL2-mediated macrophage-endothelial cell interactions in endothelial apoptosis of varicose veins
2026-Nov-10, Gene IF:2.6Q2
研究论文 该研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了静脉曲张组织中细胞异质性及CCL2介导的巨噬细胞-内皮细胞相互作用在内皮细胞凋亡和疾病进展中的作用 首次利用单细胞转录组测序技术系统解析静脉曲张组织的细胞异质性、细胞间相互作用和分化轨迹,并发现CCL2介导的巨噬细胞-内皮细胞相互作用是触发内皮细胞凋亡和血管炎症的关键机制 研究样本量较小,且功能验证实验不足,需进一步通过体内外实验验证CCL2信号通路在静脉曲张中的具体作用机制 阐明静脉曲张的细胞和分子机制,为开发新的治疗靶点提供理论依据 静脉曲张大隐静脉组织和正常大隐静脉组织 单细胞转录组学 静脉曲张 单细胞转录组测序 单细胞转录组数据 未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5 2026-07-05
Single-cell eQTL and Mendelian randomization analyses of shared genetic architecture in major depressive disorder and schizophrenia
2026-Nov-15, Journal of affective disorders IF:4.9Q1
研究论文 通过单细胞eQTL和孟德尔随机化分析,揭示精神分裂症和重度抑郁症共享的细胞类型特异性遗传机制 首次整合单细胞eQTL数据与大规模GWAS统计,通过孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,在八种主要脑细胞类型中鉴定共享候选基因 未明确提及,但可能包括样本规模、细胞类型覆盖度及因果机制验证不足 阐明精神分裂症和重度抑郁症共有的细胞类型特异性遗传机制 精神分裂症和重度抑郁症患者脑组织的八种主要细胞类型 自然语言处理 精神分裂症, 重度抑郁症 单细胞eQTL, GWAS, 孟德尔随机化 NA 单细胞RNA测序数据, GWAS汇总统计 未明确提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-07-13
GLASS-seq: a gel-anchored, ligation-assisted, scalable biosensing platform for low-cost regional spatial transcriptomics
2026-Nov-01, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1
研究论文 提出GLASS-seq平台,一种基于凝胶锚定和连接辅助的低成本空间转录组学方法,能以约100微米分辨率对感兴趣区域进行定量RNA检测 将原位连接和水凝胶锚定与阵列化分子传感器结合,通过数字测序读出实现低成本、可扩展的区域空间转录组分析 NA 开发一种经济、可扩展的空间转录组学平台,用于大规模队列研究和转化应用 小鼠组织(脑、心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏) 数字病理学 NA RNA-seq, 空间转录组学 NA 测序数据 小鼠脑切片中731个基因面板覆盖212个网格采样感兴趣区域 Illumina 空间转录组学 NA GLASS-seq平台包含水凝胶锚定和原位连接,通过PCR添加空间条码生成感兴趣区域索引文库
7 2026-07-10
Integrative genomic characterization of the FADS1-2-3 mood disorder risk locus: implications for the role of polyunsaturated fatty acids
2026-Nov-01, Journal of affective disorders IF:4.9Q1
研究论文 对FADS1-2-3情绪障碍风险位点进行整合基因组特征分析,探讨多不饱和脂肪酸在其中的作用 通过整合遗传共定位分析、跨群体变异注释及单细胞RNA-seq数据,优先将FADS1而非FADS2或FADS3确定为最可能的效应基因,并发现TMEM258和MYRF作为替代效应基因涉及N-糖基化和轴突髓鞘化等新型机制 未来需要采用正交方法进一步验证该位点中潜在的水平多效性来源 解析FADS1-2-3基因簇与情绪障碍(双相情感障碍和重度抑郁症)之间的遗传风险关联及潜在效应基因 FADS1-2-3情绪障碍风险位点及相关遗传变异 自然语言处理 情绪障碍(双相情感障碍、重度抑郁症) 全基因组关联研究、cis-eQTL分析、单细胞RNA-seq NA 基因型数据、表达数量性状位点数据 最大样本量达400万人的GWAS摘要统计数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-07-03
Sini decoction inhibits colorectal cancer liver metastasis by suppressing HIF-1α-dependent exosomal integrin signaling
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究探讨了四逆汤通过抑制HIF-1α依赖性外泌体整合素信号来抑制结直肠癌肝转移的作用和机制 首次揭示四逆汤通过靶向HIF-1α减少ITGαvβ5富集的外泌体分泌,进而阻断M2巨噬细胞极化,从而抑制结直肠癌肝转移 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的临床验证来确认其转化潜力 阐明四逆汤抑制结直肠癌肝转移的活性成分和机制,重点关注肿瘤来源外泌体和巨噬细胞极化 小鼠结直肠癌肝转移模型及其肿瘤微环境 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 小鼠结直肠肝转移模型(具体样本量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-07-02
Time-dependent gene expression patterns in epidermal wound healing: Mechanistic insights into Cayratia japonica hydrogel intervention after anal fistula surgery
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究乌蔹莓水凝胶在肛瘘术后促进伤口愈合的时间依赖性基因表达模式及其分子机制 首次整合时间序列多组学分析、临床试验和体外实验,揭示乌蔹莓水凝胶通过BMP4蛋白结合Luteolin 7-glucuronide促进成纤维细胞增殖的阶段特异性分子程序 未明确提及,从内容推断可能为样本量有限(81例)及依赖公共数据集 探究乌蔹莓水凝胶促进肛瘘术后伤口愈合的分子机制及临床疗效 肛瘘术后伤口愈合过程中的人类皮肤和肛周组织样本 机器学习 肛瘘术后伤口 RNA-seq, 单细胞RNA测序, UPLC-ESI-Q-TOF-MS/MS, 分子对接, 时间序列聚类, WGCNA NA 转录组数据, 单细胞测序数据, 质谱数据 81例患者临床试验;2个公开转录组数据集(GSE28914, GSE241132) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
10 2026-07-02
Isomucronulatol 7-O-glucoside attenuates post-AMI monocyte/macrophage cardiac recruitment via HIF-1α/THBS1-mediated immunometabolic adhesion
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 揭示异荭草素-7-O-葡萄糖苷通过HIF-1α/THBS1介导的免疫代谢粘附轴减轻急性心肌梗死后单核/巨噬细胞心脏募集的作用机制 首次阐明HIF-1α/THBS1轴在急性心肌梗死后单核/巨噬细胞心脏募集中的免疫代谢粘附作用,并发现异荭草素-7-O-葡萄糖苷可直接结合HIF-1α,抑制该轴激活 NA 阐明急性心肌梗死后单核/巨噬细胞早期心脏募集和粘附的机制,并鉴定异荭草素-7-O-葡萄糖苷的分子靶点及治疗作用 急性心肌梗死小鼠模型及ST段抬高型心肌梗死患者 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、流式细胞术、表面等离子共振 NA 单细胞转录组数据 STEMI患者心脏动脉血样及AMI小鼠心脏免疫细胞样本,具体数量未提供 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium NA
11 2026-07-02
Ophiopogon japonicus alleviates pulmonary fibrosis through modulation of HIF1A/TUBB3 axis-associated M2 macrophage polarization and arginine metabolic alterations
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 麦冬通过调控HIF1A/TUBB3轴相关的M2型巨噬细胞极化和精氨酸代谢改变减轻肺纤维化 首次整合多组学分析(转录组学、代谢组学、单细胞转录组学)与虚拟敲除分析,阐明麦冬通过HIF1A/TUBB3轴调节M2型巨噬细胞极化和精氨酸代谢改善肺纤维化的机制 机制研究主要基于小鼠模型和体外实验,缺乏临床验证,且候选活性成分Ophiopogonin D的体内作用仍需进一步确认 评估麦冬水提物对肺纤维化的保护作用并探讨其抗纤维化机制与HIF1A/TUBB3轴及精氨酸代谢的关系 C57BL/6小鼠(BLM诱导肺纤维化模型) 数字病理学 肺纤维化 UHPLC-Q Exactive Orbitrap-HRMS, RNA-seq, 代谢组学, 单细胞转录组学 NA 质谱数据, 转录组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 影像数据(micro-CT) 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA NA NA NA
12 2026-07-02
Rexiao Kuining decoction ameliorates ulcerative colitis by restoring immune homeostasis via the protein kinase C alpha-FMS-like tyrosine kinase 3 ligand axis: multi-omics evidence
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
论文 通过多组学证据揭示热泻快宁汤通过蛋白激酶Cα-FMS样酪氨酸激酶3配体轴恢复免疫稳态,改善溃疡性结肠炎 整合网络药理学、药物靶点孟德尔随机化、中介孟德尔随机化、转录组机器学习及单细胞RNA测序的多组学策略,系统揭示了热泻快宁汤通过PKCα-FLT3L轴治疗溃疡性结肠炎的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,缺乏大样本临床试验验证,且机制研究侧重树突状细胞,其他免疫细胞的作用未充分探讨 探究热泻快宁汤治疗溃疡性结肠炎的治疗效果和分子机制 溃疡性结肠炎患者结肠组织样本、DSS诱导结肠炎小鼠模型、LPS刺激的树突状细胞 机器学习 溃疡性结肠炎 超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱质谱、单细胞RNA测序 机器学习模型 多组学数据(转录组、单细胞转录组、蛋白质组) 小鼠实验:DSS诱导结肠炎小鼠;体外实验:LPS刺激的树突状细胞;临床样本:溃疡性结肠炎患者及健康对照(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-07-02
Qishen Yiqi dripping pills alleviate myocardial ischemia-reperfusion-induced fibrotic injury by inhibiting fibroblast activation via the transforming growth factor-beta/Periostin pathway
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过多组学分析结合实验验证,揭示芪参益气滴丸通过抑制TGF-β/Periostin信号通路减轻心肌缺血再灌注后纤维化损伤的机制 首次整合单细胞测序、转录组学、网络药理学和分子动力学模拟,系统阐明QSYQ通过靶向TGF-β/Postn轴逆转成纤维细胞活化,并鉴定出毛蕊异黄酮-7-O-β-D-葡萄糖苷和人参皂苷R2为有效成分 未提及 研究芪参益气滴丸是否通过调节TGF-β/Periostin信号通路抑制成纤维细胞活化,从而减轻心肌缺血再灌注后的纤维化重构 C57BL/6N小鼠及HL-1心肌细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞测序、转录组测序、网络药理学、分子动力学模拟 LASSO回归 单细胞转录组数据、转录组数据 动物实验:C57BL/6N小鼠;细胞实验:HL-1细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-06-07
Zinc-based metal orchestrates early osteoimmune microenvironment to promote angiogenesis via macrophage-derived extracellular vesicles
2026-Nov, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 探究锌基金属通过巨噬细胞来源的细胞外囊泡调控早期骨免疫微环境以促进血管生成的机制 首次揭示锌基金属通过巨噬细胞来源的细胞外囊泡介导的免疫调控促进血管生成的新机制,并利用单细胞RNA测序鉴定关键细胞亚群 未提及具体局限性,但可能包括机制验证的体内模型限制或临床转化挑战 阐明锌基金属在骨再生过程中如何通过免疫调节影响血管生成 巨噬细胞来源的细胞外囊泡及其与内皮细胞的相互作用 机器学习 骨缺损 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
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