本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-10-22 |
Peritoneal dialysis induces hepatic metabolic stress as an instigator for systemic inflammation
2026-Oct-20, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.09.028
PMID:42901326
|
研究论文 | 本研究探讨了腹膜透析对肝脏及全身代谢的影响,发现腹膜透析中的葡萄糖负荷会诱导肝脏代谢性炎症和氧化应激,进而引发全身性炎症 | 首次结合形态学研究、非靶向组织蛋白质组学、靶向血浆代谢组学和空间转录组学,系统评估腹膜透析对肝脏的分子和代谢影响,揭示了腹膜透析诱导的肝脏葡萄糖毒性和氧化应激是全身代谢性炎症的诱因 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证;未明确肝脏葡萄糖毒性与心血管代谢风险之间的直接因果关系 | 探究腹膜透析对肝脏和全身代谢的影响及其潜在机制 | 健康小鼠和慢性肾病小鼠(5/6肾切除C57BL/6,12-14周龄) | 代谢组学 | 慢性肾病 | 非靶向组织蛋白质组学,靶向血浆代谢组学,空间转录组学,多重空间单细胞分析,转录组学 | NA | 图像,文本 | 健康小鼠和慢性肾病小鼠,接受7周腹膜透析 | NA | 空间转录组学,转录组学 | NA | NA |
| 162 | 2026-10-22 |
Early transcriptional divergence and spatial remodeling toward immune activation and evasion shape lung adenocarcinoma precancer evolution
2026-Oct-20, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218915
PMID:42901437
|
研究论文 | 该研究整合空间转录组学和单细胞RNA测序,表征了基因工程小鼠模型肺腺癌从增生、腺瘤到浸润性腺癌演化过程中的肿瘤间和肿瘤内异质性 | 揭示了侵袭性转录程序在肺腺癌癌前阶段即可出现早期分化,发现部分腺瘤已向高增殖和代谢活跃程序分化并伴有6号染色体早期扩增,且空间分析揭示了浸润性腺癌肿瘤核心与外周区域在增殖、代谢和免疫信号上的显著差异,以及增生阶段T细胞免疫检查点基因表达的短暂升高 | 研究基于基因工程小鼠模型(129S4/Sv Kras),结果向人类肺腺癌的转化适用性需进一步验证;样本量相对有限;未对发现的早期分子事件进行功能验证 | 探究肺腺癌癌前演化过程中侵袭性转录程序的出现时机及空间组织对肿瘤和免疫程序的塑造作用 | 129S4/Sv Kras基因工程小鼠模型中肺腺癌的增生、腺瘤和浸润性腺癌病变组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 163 | 2026-10-22 |
Single-cell analysis reveals CXCL16+ dendritic cells and clonally expanded GZMK+ CD4 T cells driving joint inflammation in psoriatic arthritis
2026-Oct-20, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70371
PMID:42901778
|
研究论文 | 该研究通过配对血液和滑液免疫细胞的多模态单细胞测序,揭示银屑病关节炎关节炎症中CXCL16+树突状细胞和克隆扩增的GZMK+ CD4 T细胞的作用 | 首次在银屑病关节炎中结合多模态单细胞测序、T细胞克隆分析和细胞间通讯分析,揭示CXCL16+树突状细胞通过CXCR6-CXCL16轴招募克隆扩增的GZMK+ CD4 T细胞驱动关节炎症,并通过流式细胞术、ELISA和体外迁移实验进行验证 | 单细胞测序样本量较小(6例PsA患者、1例RA患者和6例健康对照),验证队列规模也有限(25例PsA和16例HC),且缺乏纵向随访和功能干预实验 | 探究银屑病关节炎关节炎症的免疫细胞机制,特别是T细胞克隆扩增和树突状细胞在关节炎症中的作用 | 银屑病关节炎患者的配对外周血和滑液免疫细胞,以及类风湿关节炎患者和健康对照 | 单细胞组学、免疫学 | 银屑病关节炎 | 多模态单细胞测序、流式细胞术、ELISA、细胞间通讯分析、体外迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白表达数据 | 发现队列6例PsA患者、1例RA患者和6例健康对照的配对外周血和滑液;验证队列25例PsA患者和16例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞多组学 | NA | NA |
| 164 | 2026-10-22 |
Wnt10b is required for the increase in cancellous bone caused by oxidized phospholipids blockade
2026-Oct-17, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2026.118132
PMID:42892422
|
研究论文 | 本文研究了氧化磷脂阻断通过Wnt10b增加松质骨的机制 | 揭示了Wnt10b在E06-scFv增加骨量中的关键作用,并证明氧化磷脂通过抑制Wnt10b减少骨量 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;性别差异的影响未完全阐明 | 探究氧化磷脂阻断增加骨量的机制,特别是Wnt10b的作用 | 小鼠(6月龄E06-scFv转基因小鼠和野生型小鼠)及成骨细胞 | 骨生物学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2026-10-22 |
Gestational exposure to hexafluoropropylene oxide trimer acid impairs the reproductive function of male offspring through the LCN2-ferroptosis axis in spermatocytes
2026-Oct-17, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2026.110568
PMID:42901093
|
研究论文 | 该研究通过小鼠模型揭示孕期暴露于HFPO-TA通过LCN2-铁死亡轴损害雄性后代的生殖功能 | 首次揭示孕期HFPO-TA暴露通过LCN2-铁死亡轴诱导雄性后代精母细胞特异性损伤的机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证,且未探讨其他潜在机制 | 探究孕期HFPO-TA暴露对雄性后代生殖毒性的影响及其分子机制 | 孕期暴露HFPO-TA的F1代雄性小鼠及其精母细胞 | 毒理学 | 生殖功能障碍 | 单细胞转录组测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 图像, 文本, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2026-10-22 |
SRSF1-DLAT axis drives mitochondrial fusion to confer therapy resistance in diabetes-associated pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Oct-16, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2026.101489
PMID:42901085
|
研究论文 | 该研究揭示了糖尿病相关胰腺导管腺癌中SRSF1-DLAT轴驱动线粒体过度融合,从而导致化疗耐药和免疫逃逸的分子机制,并发现小檗碱可逆转该过程 | 首次阐明乳酸诱导的SRSF1 K48乳酸化稳定化通过促进DLAT外显子5保留、避免无义介导衰变,进而驱动线粒体过度融合,同时连接代谢与免疫逃逸双重耐药机制 | 研究主要基于糖尿病-KPC小鼠模型和临床分析,人体临床试验数据有限,小檗碱的临床转化效果尚需进一步验证 | 阐明糖尿病与胰腺导管腺癌治疗失败之间的分子机制联系 | 糖尿病相关胰腺导管腺癌患者肿瘤样本及糖尿病-KPC小鼠模型 | 数字病理, 机器学习 | 胰腺癌, 糖尿病 | scRNA-seq, eCLIP-seq, 多组学分析 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, eCLIP-seq | NA | NA |
| 167 | 2026-10-22 |
Integrated transcriptomic and deep learning analyses define acRG signature for prognosis and therapeutic options in osteosarcoma
2026-Oct-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168492
PMID:42826870
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序数据,刻画ac4C修饰相关基因图谱,构建六基因预后特征acRGBS,并揭示S100A13通过维持线粒体钙稳态驱动骨肉瘤进展 | 首次基于ac4C修饰相关基因构建骨肉瘤预后特征acRGBS,并发现S100A13通过与MCU互作维持线粒体钙稳态、调控氧化应激和凋亡的新机制 | 功能实验主要基于敲低和异种移植模型,缺乏S100A13过表达或临床干预验证,且acRGBS的临床转化仍需前瞻性队列验证 | 构建骨肉瘤ac4C修饰相关基因预后特征,并探究关键基因S100A13的生物学功能与治疗潜力 | 骨肉瘤患者肿瘤样本及骨肉瘤细胞系和异种移植小鼠模型 | 数字病理 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 功能实验 | 机器学习预后模型 | 基因表达数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2026-10-22 |
Network pharmacology, single-cell transcriptomics, machine learning and experimental validation identifying CHEK2 and HPGD as key therapeutic targets of berberine in diabetic nephropathy
2026-Oct-01, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-02052-2
PMID:42821141
|
研究论文 | 该研究结合网络药理学、单细胞转录组学、机器学习和实验验证,识别CHEK2和HPGD作为小檗碱治疗糖尿病肾病的关键靶点 | 首次整合网络药理学、单细胞转录组学、高维WGCNA、机器学习(随机森林和SHAP分析)以及分子对接和分子动力学模拟,并结合体外拯救实验,系统识别并功能验证CHEK2和HPGD作为小檗碱治疗糖尿病肾病的关键靶点 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据和体外细胞实验验证,缺乏体内动物模型验证和临床样本验证 | 阐明小檗碱治疗糖尿病肾病的精确分子靶点和作用机制 | 糖尿病肾病相关的肾细胞(特别是足细胞)、小檗碱的分子靶点 | 网络药理学, 单细胞转录组学, 机器学习 | 糖尿病肾病 | bulk转录组微阵列, 单细胞RNA测序, 网络药理学, WGCNA, hdWGCNA, 机器学习, 分子对接, 分子动力学模拟, MM/PBSA计算 | 随机森林, SHAP分析 | 基因表达数据(微阵列和单细胞RNA测序数据), 文本(数据库靶点信息) | 使用了GSE96804、GSE30122两个bulk转录组微阵列数据集和GSE131882单细胞RNA测序数据集,单细胞分析鉴定出11种肾细胞类型 | NA | bulk转录组微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2026-10-22 |
Lipid nanoparticle-formulated synthetic messenger RNA induces reversible hematopoietic bias via type I interferon responses under upper-bound inflammatory conditions in preclinical animal models
2026-Oct-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag134
PMID:42853072
|
研究论文 | 本研究在临床前动物模型中揭示了高剂量LNP配方合成mRNA通过I型干扰素信号引起可逆性造血谱系偏倚的机制 | 首次系统阐明LNP配方合成mRNA在高剂量暴露下通过I型干扰素依赖途径引起可逆性红系抑制与粒系扩增的造血偏倚,并验证了该现象跨物种(小鼠与非人灵长类)的普遍性,区分了mRNA配方与LNP载体的相对贡献 | 研究所用剂量为刻意设置的高于临床的超上限剂量,与临床实际暴露水平存在差距;机制解析主要依赖干扰素受体阻断,未完全阐明下游具体分子通路;非人灵长类样本量可能有限 | 探究高剂量LNP配方合成mRNA对骨髓造血的影晌及其机制基础,并评估该造血偏倚在不同物种间的可推广性 | 小鼠和非人灵长类动物模型 | 转录组学 | 传染病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2026-10-21 |
Identification and characterization of neoplastic cells in keratin-positive giant cell-rich tumors
2026-Oct-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2611959123
PMID:42896059
|
研究论文 | 该文通过单核RNA测序和Xenium空间转录组学,鉴定 keratin 阳性巨细胞丰富肿瘤(KPGCT)中的肿瘤细胞,并揭示其与腱鞘巨细胞瘤(TGCT)的区别及 CSF1-CSF1R 信号通路的作用 | 首次鉴定出共表达 keratin、特定标志物和融合基因的细胞群为 KPGCT 的肿瘤细胞,并发现 Hippo 信号通路激活可能参与肿瘤发生,同时证实 KPGCT 是独立于 TGCT 的实体 | 样本量未明确,可能受限于罕见肿瘤的样本获取;空间转录组和单核RNA测序的细胞类型注释可能存在不确定性 | 阐明 KPGCT 的发病机制,并与 TGCT 进行对比 | keratin 阳性巨细胞丰富肿瘤(KPGCT)和腱鞘巨细胞瘤(TGCT)组织样本 | 空间转录组学 | 骨与软组织肿瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Xenium | 10x Genomics Chromium 单细胞/单核 RNA 测序平台和 Xenium 空间转录组平台 |
| 171 | 2026-10-21 |
A sensitive method for profiling cell-type-specific secretomes of rare cells from complex tissues
2026-Oct-19, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101552
PMID:42600616
|
研究论文 | 该文建立了一种小鼠模型,可在复杂组织中对稀有细胞的分泌蛋白组(分泌组)进行无病毒载体的高灵敏度分析 | 无需病毒载体即可对复杂组织中生理相关的低丰度细胞进行分泌组分析,灵敏度极高,能捕获单细胞RNA测序图谱未能捕获的细胞特异性蛋白,并将该遗传学分泌组小鼠模型开放给社区使用 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;目前仅应用于两种稀有先天免疫细胞类型 | 开发一种灵敏的方法来分析复杂组织中稀有细胞的细胞类型特异性分泌组 | 小鼠肝脏中的Kupffer巨噬细胞以及分化气道上皮培养物中的稀有气道微皱褶(M)细胞 | 蛋白质组学 | NA | 分泌组分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、RNA测序数据 | 两种稀有先天免疫细胞类型(肝Kupffer巨噬细胞和气道M细胞) | NA | 分泌组分析, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2026-10-21 |
Spatial Transcriptomics on a Diverse Pancreatic Cancer Cohort Reveals Race-Related Differences in Tumor Subtypes and Immune Microenvironments
2026-Oct-19, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2748
PMID:42896131
|
研究论文 | 该研究通过全外显子组测序、空间转录组学和空间蛋白质组学对黑非洲裔美国人和非裔美国人胰腺导管腺癌患者进行多组学分析,揭示种族相关的肿瘤亚型和免疫微环境差异 | 首次在多样化胰腺癌队列中结合全外显子组测序、空间转录组学和空间蛋白质组学进行多组学分析,发现黑非洲裔美国患者肿瘤中间型/混合型亚型富集、经典亚型细胞减少,且B细胞相互作用增加、髓系细胞相互作用减少,三级淋巴结构更大更多 | 摘要未明确提及研究局限性 | 探索黑非洲裔美国人与非裔美国人胰腺导管腺癌在肿瘤亚型和细胞微环境方面的分子差异,以理解健康差异的分子基础 | 黑非洲裔美国人和非裔美国人胰腺导管腺癌患者肿瘤样本 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 全外显子组测序、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 基因组数据、空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | 一个多样化PDAC队列及一个验证队列(具体样本数摘要未明确) | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 173 | 2026-10-21 |
Decoding cutaneous injury-induced inflammation through single-cell RNA sequencing
2026-Oct-19, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2026.103703
PMID:42896258
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术如何用于解码皮肤损伤诱导的炎症反应,并探讨了其在伤口愈合研究中的应用 | 系统总结了scRNA-seq在皮肤损伤炎症研究中的应用,整合了小鼠和人类皮肤细胞群体的标记物,并讨论了糖尿病和衰老等病理条件下的炎症失调机制 | 需要未来验证计算预测结果,并克服单细胞转录组学的局限性以提高临床相关性 | 探讨scRNA-seq技术如何加深对损伤后炎症调控机制的理解,并促进伤口愈合研究 | 皮肤组织、伤口愈合过程中的细胞状态和细胞通讯、小鼠和人类皮肤细胞群体 | 单细胞转录组学、皮肤生物学、免疫学 | 糖尿病、衰老、伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2026-10-21 |
Genetic prioritization and functional characterization of macrophage TXNDC17 in Ischemic heart disease
2026-Oct-19, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117564
PMID:42896314
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序数据与基于汇总数据的孟德尔随机化及共定位分析,系统识别与缺血性心脏病相关的内质网应激基因,并对巨噬细胞中的TXNDC17进行功能验证 | 首次将单细胞RNA测序与SMR、共定位分析和孟德尔随机化相结合,从遗传学角度优先筛选出TXNDC17,并揭示巨噬细胞TXNDC17通过调控炎症条件培养基介导的心肌细胞内质网应激和铁死亡损伤 | TXNDC17与缺血性心脏病在体内的因果相关性尚未确立,功能验证主要基于体外实验 | 系统识别与缺血性心脏病相关的内质网应激基因,评估其遗传预测关联,并探究关键基因在疾病中的功能机制 | 缺血性心脏病相关的内质网应激基因、THP-1巨噬细胞样细胞和AC16心肌细胞 | 数字病理学、机器学习 | 缺血性心脏病 | 单细胞RNA测序、基于汇总数据的孟德尔随机化、共定位分析、定量PCR、酶联免疫吸附测定 | NA | 单细胞表达数据、遗传数据、文本 | 2564个与缺血性心脏病和内质网应激均相关的基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2026-10-21 |
AAV-mediated Siglecf elimination on TAMs reverses TMZ therapy-induced T cell dysfunction in glioblastoma
2026-Oct-19, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117540
PMID:42896383
|
研究论文 | 该研究揭示了TMZ治疗胶质母细胞瘤后通过Siglec-F阳性肿瘤相关巨噬细胞介导免疫抑制和T细胞功能障碍的机制,并利用AAV靶向干预逆转该过程 | 首次整合单细胞RNA测序和质谱流式技术揭示TMZ治疗后TAM向Siglec-F阳性免疫抑制亚群重塑,并创新性地采用AAV介导的Siglecf靶向干预逆转TMZ诱导的T细胞功能障碍 | 研究主要基于原位小鼠GBM模型,人类GBM数据仅为数据集分析验证,AAV治疗的临床转化安全性和有效性尚需进一步验证 | 探究GBM在TMZ治疗后复发的免疫抑制机制,重点关注驱动免疫逃逸的巨噬细胞相关通路 | 原位小鼠GBM模型及人类GBM数据集 | 肿瘤免疫学、单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术(CyTOF)、AAV介导基因干预 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式蛋白表达数据、文本(人类GBM数据集) | NA | NA | 单细胞RNA-seq、质谱流式 | NA | NA |
| 176 | 2026-10-21 |
Emerging Role of AI in Single-Cell Sequencing Toward Biomarker Discovery, Therapeutic Target Identification and Precision Medicine in Lung Cancer
2026-Oct-19, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105653
PMID:42896640
|
综述 | 探讨单细胞测序与人工智能在肺癌生物标志物发现、治疗靶点识别和精准医学中的新兴应用 | 系统整合单细胞测序与人工智能分析技术,聚焦肺癌生物标志物发现与治疗靶点识别,并提出个性化治疗新思路 | 本文为综述性文章,未提供原始实验数据验证;单细胞测序与AI整合仍面临技术挑战与临床转化障碍 | 综述单细胞测序与人工智能在肺癌精准医学中的应用,包括生物标志物发现、治疗靶点识别及个性化治疗策略 | 肺癌及其肿瘤异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学、机器学习 | 肺癌 | 单细胞测序、机器学习、预测建模 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2026-10-21 |
Potential role of druggable gene SLC15A2 in keratinocyte hyperproliferation in psoriasis
2026-Oct-19, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150459
PMID:42896660
|
研究论文 | 该研究通过孟德尔随机化和共定位分析识别银屑病可成药基因SLC15A2,并结合小鼠模型、单细胞转录组和体外实验验证其在角质形成细胞过度增殖中的作用 | 首次通过遗传学方法识别SLC15A2为银屑病潜在可成药基因,并结合单细胞转录组揭示其在过度增殖角质形成细胞亚群中的富集及细胞周期激活相关性 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,缺乏临床药物试验验证SLC15A2靶向治疗的安全性和有效性 | 识别与银屑病相关的可成药基因并探索其治疗潜力 | 银屑病患者遗传数据、咪喹莫特诱导的银屑病样小鼠模型、HaCaT细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 孟德尔随机化、共定位分析、单细胞转录组测序、分子对接、体外功能实验 | NA | 遗传数据、单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2026-10-21 |
MMP14-mediated proteolytic cleavage of LAMC2 domain III fragment drives osimertinib resistance in EGFR-mutant non-small cell lung cancer
2026-Oct-19, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-026-01901-x
PMID:42897224
|
研究论文 | 本研究通过分泌组学分析和单细胞转录组再分析,揭示了MMP14切割LAMC2释放DIII片段激活EGFR/AKT/ERK信号通路,从而驱动EGFR突变NSCLC对奥希替尼获得性耐药的非遗传机制 | 首次鉴定MMP14-LAMC2-DIII蛋白酶切割轴作为奥希替尼非遗传性耐药机制,发现LAMC2高表达的药物耐受持留细胞亚群,并证明抗DIII阻断抗体和MMP14抑制剂NSC405020可逆转耐药 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 探究EGFR突变非小细胞肺癌中奥希替尼获得性耐药的非遗传性机制,并寻找克服耐药的靶向策略 | EGFR突变非小细胞肺癌细胞系、患者来源类器官、新辅助奥希替尼治疗患者的残余肿瘤组织 | 数字病理, 机器学习 | 肺癌 | 定量分泌组学分析, 单细胞RNA测序再分析, 拟时序分析 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 图像 | 配对的奥希替尼敏感与耐药NSCLC细胞系、四个独立队列、患者来源类器官及新辅助奥希替尼治疗患者残余肿瘤组织,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 分泌组学分析 | NA | NA |
| 179 | 2026-10-21 |
Spatiotemporal remodeling in habenula marks the onset of depression-related phenotypes
2026-Oct-19, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-026-02488-6
PMID:42897302
|
研究论文 | 该研究利用空间转录组学和纵向双光子钙成像技术,构建了慢性应激下小鼠外侧缰核的空间分子图谱,揭示了与抑郁相关表型出现相关的时空重塑过程 | 首次结合空间转录组学和纵向活体双光子钙成像,构建LHl的空间分辨分子图谱,并揭示慢性应激后基因表达的空间拓扑重塑和时间动态变化与抑郁样行为及神经元兴奋性增高的同步进展 | 研究仅基于雄性小鼠,未涉及雌性;样本量和具体分子机制的因果链条仍需进一步验证 | 探究外侧缰核在慢性应激诱导抑郁相关表型中的时空动态变化及其作用时间窗 | 雄性小鼠的外侧缰核(LHb) | 空间转录组学, 神经科学 | 抑郁症 | 空间转录组学, 双光子钙成像, 化学遗传学 | NA | 空间转录组数据, 图像(钙成像) | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 180 | 2026-10-21 |
Integrative transcriptomic analysis reveals tumor-adjacent mucosal remodeling in colorectal cancer
2026-Oct-17, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-02066-w
PMID:42891902
|
研究论文 | 该文通过对25例结直肠癌患者的配对远端正常、癌旁和肿瘤组织进行bulk RNA测序,构建正常-癌旁-肿瘤(N-A-T)表达连续谱,揭示癌旁黏膜存在协调的肿瘤导向转录改变 | 提出并构建有序的N-A-T表达连续谱,采用limma线性趋势模型识别沿连续谱的广泛单调转录变化,并基于趋势基因构建N-A-T评分,在外部bulk队列和单细胞RNA-seq中验证 | 样本量较小(25例患者),癌旁黏膜与远端正常黏膜在成对分析中无显著差异表达,结论主要基于趋势模型和外部数据验证 | 阐明结直肠癌癌旁黏膜与远端正常黏膜及肿瘤组织的关系,明确癌旁黏膜是否可作为正常参考 | 25例结直肠癌患者的配对远端正常组织、癌旁组织和肿瘤组织 | 转录组学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | limma线性趋势模型 | 转录组表达数据 | 25例患者的配对远端正常、癌旁和肿瘤组织(共75份bulk RNA样本),另使用外部bulk队列和单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |