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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-10-25 |
Integrative multi-omics profiling of insomnia-related molecular features reveals microbiome, immune, and therapy-relevant heterogeneity in colorectal cancer
2026-Oct-06, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00815-26
PMID:42714160
|
研究论文 | 本文通过整合多组学数据,揭示了失眠相关分子特征与结直肠癌肿瘤生物学、免疫微环境及治疗反应之间的关联,并构建了失眠评分(ISscore)用于风险分层 | 首次基于失眠相关分子特征对结直肠癌进行无监督分子分型(IS1/IS2),并结合单细胞转录组学提名PPIA-BSG等细胞间通讯信号,将睡眠相关通路与肿瘤免疫微环境、微生物组及治疗反应异质性联系起来 | 摘要未明确说明,可能包括回顾性队列设计、失眠相关分子特征的因果性尚未验证、ISscore的临床实用性需前瞻性研究确认 | 探究失眠相关分子特征与结直肠癌肿瘤生物学、免疫微环境状态及治疗相关表型之间的分子关联,并建立可重复的风险分层框架 | 来自七个独立队列的3,026例结直肠癌患者,包括大型、注释完善的COCC队列 | 多组学整合分析、肿瘤免疫学、微生物组学 | 结直肠癌、失眠 | 基因组学、转录组学、微生物组学、单细胞转录组学、多组学整合分析 | 无监督非负矩阵分解(NMF)聚类 | 基因组数据、转录组数据、微生物组数据、单细胞转录组数据 | 3,026例结直肠癌患者(来自七个独立队列) | NA | bulk转录组测序、基因组测序、微生物组测序、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-10-25 |
Integrative genotype-environment association and single-cell transcriptomic analyses identify candidate mechanisms of environmental adaptation in pigs
2026-Oct-03, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag260
PMID:42851070
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研究论文 | 该研究整合基因组-环境关联分析与单细胞转录组分析,揭示家猪环境适应的候选遗传机制 | 首次在全球1151个猪基因组、146个种群的大规模数据上整合RDA、BayPass和LFMM三种GEA框架,并结合高原与商业品种的肺单细胞RNA测序,发现传统GEA方法遗漏的NOTCH信号通路等调控通路及ASXL1候选基因 | 摘要未明确说明具体局限性,候选基因与调控通路尚需功能验证 | 解析家猪在不同生态环境下环境适应的基因组机制 | 家猪(Sus scrofa),包括146个种群及高原与商业品种 | 群体基因组学 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 冗余分析(RDA),BayPass,潜因子混合模型(LFMM) | 基因组序列,基因表达数据 | 1151个猪基因组序列(146个种群),以及高原与商业品种的肺单细胞RNA测序样本 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-10-25 |
Nonhistone Protein Acetylation Reprograms the ECM-Receptor Interaction Pathway: Multiomics Profiling of Cartilage Degeneration in Rat Models of Osteoarthritis
2026-Oct-02, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.6c00137
PMID:42918097
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研究论文 | 该研究整合转录组学、蛋白质组学和乙酰化蛋白质组学,系统分析大鼠骨关节炎软骨的分子变化,揭示非组蛋白乙酰化通过重编程ECM-受体相互作用通路驱动软骨退变 | 首次整合多组学(转录组、蛋白质组、乙酰化蛋白质组)系统解析非组蛋白乙酰化在骨关节炎软骨退变中的作用,发现Fn1、Tnc和Itgb1乙酰化升高重编程ECM-受体相互作用通路,并通过113种机器学习策略鉴定出11个核心诊断基因,其中Wisp3诊断效能最高 | 研究基于大鼠模型,需进一步在人类样本中验证;Wisp3的临床诊断价值仍需大规模临床队列验证 | 阐明非组蛋白乙酰化在骨关节炎软骨退变中的具体作用机制,并鉴定早期诊断生物标志物 | 大鼠骨关节炎模型的软骨组织 | 多组学、表观遗传学 | 骨关节炎 | 转录组学、蛋白质组学、乙酰化蛋白质组学、单细胞RNA-seq | 机器学习(113种策略)、单细胞分析 | 组学数据、基因表达数据、文本 | NA | NA | bulk RNA-seq、蛋白质组学、乙酰化蛋白质组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-10-25 |
Integrated Multi-Omics Analysis Reveals Candidate Serum Biomarkers Linked to Cancer-Associated Fibroblast-Mediated Extracellular Matrix Remodeling in Metastatic Gastric Cancer
2026-Oct-02, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.6c00601
PMID:42918122
|
研究论文 | 通过血清DIA蛋白质组学与多组学整合分析,鉴定与转移性胃癌中癌症相关成纤维细胞介导的细胞外基质重塑相关的候选血清生物标志物 | 整合血清DIA蛋白质组学、TCGA-STAD生存分析、多算法机器学习建模、单细胞RNA测序和空间转录组学,发现并验证血清ITIH3作为与胃癌进展及肿瘤微环境改变相关的候选生物标志物 | 需要在更大规模的临床队列中进一步验证ITIH3的临床效用 | 寻找与胃癌进展相关的候选血清生物标志物,并阐明其在肿瘤微环境中的作用 | 转移性胃癌患者、健康对照、非转移性胃癌患者、仅淋巴结转移胃癌患者及远处转移胃癌患者 | 多组学分析、数字病理学、机器学习 | 胃癌 | DIA蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、ELISA | 多算法机器学习模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、空间转录组数据、血清样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、DIA蛋白质组学 | NA | NA |
| 65 | 2026-10-25 |
Unveiling the Clinical Potential of Prostate Cancer Three-dimensional Models: A Systematic Review
2026-Oct, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2026.03.007
PMID:41927412
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系统综述 | 系统评估前列腺癌三维模型(患者来源类器官和组织切片)的可行性、分子保真度及转化应用潜力 | 系统性地整合了前列腺癌三维模型在类器官建立效率、分子特征一致性、生物标志物探索和药物测试等方面的证据,并遵循PRISMA指南和PROSPERO注册方案 | 缺乏微环境组分,类器官建立耗时且成功率变异大(15-90%),长期扩增超过5-10代仅少数模型实现,标准化和可扩展性仍面临挑战 | 系统评估三维模型在前列腺癌中的可行性、分子保真度和转化应用 | 人源前列腺癌三维模型(患者来源类器官和组织切片组织) | 数字病理学, 精准肿瘤学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 基因组分析, 转录组分析, 表观遗传分析, 药物筛选 | 患者来源类器官, 器官型切片组织 | 文本, 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-10-25 |
Multi-layer network biology combined with single-cell evidence reveals core regulatory nodes in atherosclerotic plaques and potential drug-targeting directions
2026-Oct, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05672-4
PMID:42410224
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研究论文 | 该文通过多层网络生物学结合单细胞转录组证据,揭示动脉粥样硬化斑块的核心调控节点,并预测槲皮素等多靶点药物的治疗潜力 | 将bulk转录组差异分析与WGCNA、四种拓扑算法筛选枢纽基因、单细胞转录组细胞定位及分子对接、体外实验验证相结合,系统识别AS斑块枢纽基因网络并验证槲皮素的多靶点保护作用 | 枢纽基因筛选主要依赖公共数据库和计算预测,样本来源有限,单细胞数据为独立数据集整合,体外oxLDL模型不能完全反映体内复杂斑块微环境,缺乏体内动物实验和临床队列验证 | 识别动脉粥样硬化斑块形成中的核心调控网络和可成药靶点,并探索潜在药物靶向方向 | 32例患者的配对晚期颈动脉斑块与远端早期病变组织、GSE159677单细胞RNA-seq数据集以及oxLDL诱导的体外细胞模型 | 数字病理学, 机器学习 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA, PPI网络分析, 分子对接, qRT-PCR, Western blotting, CCK-8, ROS染色 | WGCNA, STRING PPI网络, Cytoscape拓扑算法(MCC/EPC/Stress/Degree), 分子对接 | 文本, 图像 | 32例患者的配对斑块与早期病变组织bulk转录组数据,一个单细胞RNA-seq数据集(GSE159677),以及oxLDL诱导的体外细胞实验样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 10x Genomics单细胞平台, 表达谱芯片(GSE43292) | 10x scRNA-seq数据集GSE159677用于细胞类型注释和枢纽基因定位,GSE43292为bulk转录组表达谱数据 |
| 67 | 2026-10-25 |
Multi-omics Mendelian randomization and experimental validation identify PRKAB1 as a regulator of phosphatidylcholine metabolism in IBD
2026-Oct, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05685-z
PMID:42443636
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研究论文 | 本文整合多组学数据、孟德尔随机化与遗传共定位分析,并结合实验验证,揭示PRKAB1是IBD中磷脂酰胆碱代谢的调控因子 | 首次通过多组学孟德尔随机化与多组学QTL分析(DNA甲基化、基因表达、蛋白质丰度)识别PRKAB1与IBD及溃疡性结肠炎风险的因果关联,并结合单细胞RNA测序与功能敲低实验验证其对磷脂酰胆碱代谢的调控作用 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解析磷脂酰胆碱代谢相关基因与炎症性肠病之间的因果遗传关联及其病理生理机制 | 炎症性肠病(IBD)及溃疡性结肠炎(UC)相关的磷脂酰胆碱代谢相关基因与结肠上皮细胞 | 多组学、遗传流行病学 | 炎症性肠病 | 孟德尔随机化、遗传共定位、多组学QTL分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、分子对接 | NA | 遗传数据、多组学QTL数据、单细胞转录组数据、图像 | 来自FinnGen研究的发现数据与IBD Genetics Consortium的重复数据,覆盖78种脂质(5种lyso-PC、46种PC、27种PCE);GEO数据及scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq、多组学QTL分析 | NA | NA |
| 68 | 2026-10-25 |
Crosstalk Between CTSB+ Glioblastoma Cells and S100A10+ Macrophages: A Self-Reinforcing Circuit Promotes Immune Evasion and Limits Response to Immunotherapy
2026-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76905
PMID:42666105
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研究论文 | 该研究整合生物网络分析与多模态AI,揭示CTSB+胶质母细胞瘤细胞与S100A10+巨噬细胞之间的正反馈环路促进免疫逃逸并限制免疫治疗应答 | 首次发现CTSB+ GBM细胞与S100A10+巨噬细胞之间存在由IL-6/STAT3/CTSB/S100A10构成的自增强正反馈环路,并证明靶向CTSB可增强抗PD-1免疫治疗疗效 | 研究主要基于小鼠原位和皮下GBM模型及体外共培养体系,人体临床验证仍有限;CTSB抑制剂的临床应用安全性和有效性尚需进一步评估 | 解析胶质母细胞瘤与肿瘤相关巨噬细胞之间的分子对话机制,寻找可靶向的免疫治疗增敏策略 | 胶质母细胞瘤细胞(GL261、CT-2A)与肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学、数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、染色质免疫沉淀(ChIP)、双荧光素酶报告基因实验、分子对接、免疫共沉淀(Co-IP)、慢病毒介导基因敲低 | 多模态AI、生物网络分析 | 图像、文本、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-10-25 |
Polyethylene terephthalate micro-/nanoplastics suppress SAT1-dependent ferroptosis in triple-negative breast cancer
2026-Oct, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2026.110506
PMID:42731238
|
研究论文 | 本研究探索了聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)微/纳米塑料暴露与三阴性乳腺癌(TNBC)进展之间的关联,发现PET通过下调SAT1抑制铁死亡从而促进TNBC进展 | 首次在乳腺癌组织中进行微/纳米塑料的表征,并结合空间转录组学揭示PET微/纳米塑料通过SAT1依赖性铁死亡途径促进TNBC进展的分子机制 | 研究主要聚焦于PET与SAT1-铁死亡通路的关联,未全面评估其他类型微/纳米塑料的效应,且具体分子互作机制仍需进一步深入验证 | 探究微/纳米塑料暴露对三阴性乳腺癌进展的潜在相关性效应 | 乳腺癌组织样本及三阴性乳腺癌细胞 | 空间转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 扫描电子显微镜、显微拉曼光谱、热裂解-气相色谱-质谱联用、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 70 | 2026-10-25 |
Spatial Transcriptomics of Micropapillary, Plasmacytoid, and Sarcomatoid Urothelial Carcinoma Reveals Distinct Molecular Landscapes
2026-Oct, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2026.106160
PMID:42641761
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研究论文 | 利用Bruker GeoMx数字空间分析技术对微乳头型、浆细胞样型和肉瘤样型尿路上皮癌进行空间转录组分析,揭示其分子特征及共识分子分型 | 首次利用数字空间分析技术对三种罕见尿路上皮癌变异亚型(MP、PC、SM)进行空间转录组分析,揭示同一肿瘤内相邻不同组织学成分可对应不同的共识分子分型,并发现PC呈现介于MP和SM之间的中间表型 | 样本量较小(17个FFPE组织芯),仅选取38个感兴趣区域,仅检测18,676个mRNA的表达 | 确定微乳头型、浆细胞样型和肉瘤样型膀胱尿路上皮癌的共识分子分型并表征其空间转录组特征 | 膀胱尿路上皮癌的微乳头型(MP)、浆细胞样型(PC)和肉瘤样型(SM)亚型组织 | 数字病理 | 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 17个FFPE组织芯(5个MP、6个PC、6个SM),共38个感兴趣区域 | Bruker | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | Bruker GeoMx数字空间分析系统,基于H&E染色和荧光标记选取感兴趣区域,检测18,676个mRNA表达 |
| 71 | 2026-10-25 |
Multi-omics insights into uric acid metabolism in cardiometabolic disease: from genetics to metabolomics
2026-Oct, Biomedical journal
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.bj.2026.100997
PMID:42190810
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综述 | 本文从多组学角度综述尿酸代谢在心血管代谢疾病中的作用,涵盖遗传学、表观遗传学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学 | 系统整合基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等多组学数据,结合eQTL定位、因果建模、网络生物学和AI分析,全面揭示尿酸代谢在心血管代谢疾病中的分子机制 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,多组学整合的临床转化应用仍需进一步验证 | 总结尿酸代谢在心血管代谢疾病中的多组学研究进展,探讨风险预测、生物标志物发现、治疗靶点和个体化预防策略 | 高尿酸血症患者及心血管代谢疾病(高血压、2型糖尿病、慢性肾病、代谢综合征、动脉粥样硬化性心血管疾病)相关的多组学数据 | 多组学 | 心血管代谢疾病 | GWAS、表观基因组学、转录组学、单细胞RNA测序、代谢组学、蛋白质组学、eQTL定位 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2026-10-25 |
Current Advances in Spatial Pathology of Nasal Polyps: Challenges, Opportunities for Artificial Intelligence, and Future Directions
2026-Oct, World journal of otorhinolaryngology - head and neck surgery
DOI:10.1002/wjo2.70145
PMID:42662489
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综述 | 本文综述了鼻息肉空间病理学的传统与新兴方法进展,重点探讨人工智能工具在鼻息肉炎症异质性分析、内型分型及临床转化中的应用潜力 | 系统整合空间转录组学与深度学习技术,提出AI赋能的空间病理学框架,将形态学与分子特征相结合,推动鼻息肉的精准内型分型和靶向生物治疗 | 作为综述文章,未提供原始实验数据验证;AI空间病理学在鼻息肉中的临床转化仍面临技术标准化和数据整合等挑战 | 总结鼻息肉空间病理学的最新进展,探讨人工智能在其中的应用机遇、挑战及未来发展方向 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)患者组织样本 | 数字病理学 | 鼻息肉/慢性鼻窦炎 | 空间转录组学、深度学习、组织病理学 | 深度学习 | 图像、分子标记数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 73 | 2026-10-25 |
Cancer-associated fibroblasts drive papillary thyroid cancer progression through ROS/NF-κB/IL-6 signaling in hypoxic microenvironments
2026-Oct-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-26-0198
PMID:42847132
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研究论文 | 该文揭示缺氧微环境通过ROS/NF-κB/IL-6轴激活癌症相关成纤维细胞(CAFs),进而以旁分泌IL-6信号驱动甲状腺乳头状癌进展 | 首次整合单细胞RNA-seq数据确定成纤维细胞是PTC中IL-6的主要细胞来源,并阐明缺氧通过ROS/NF-κB通路诱导CAFs产生IL-6的调控机制,提出靶向该轴的治疗策略 | 摘要未提及具体样本量、单细胞数据规模及体内实验的详细设计,缺乏临床队列验证和更深入的分子机制解析 | 探究CAFs是否为PTC中IL-6的主要来源及其在缺氧微环境下的调控机制,并评估靶向该通路的治疗潜力 | 甲状腺乳头状癌(PTC)患者组织来源的癌症相关成纤维细胞(CAFs)、正常成纤维细胞(NFs)及PTC细胞 | 肿瘤微环境、单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA-seq、细胞共培养、体内移植瘤实验、ROS检测、NF-κB信号通路分析 | NA | 单细胞转录组数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-10-25 |
Integrating scRNA-Seq and Spatial Transcriptomics Reveal Novel Risk Stratification Signatures in Cervical Carcinoma
2026-Oct, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.71184
PMID:42891568
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学,识别与宫颈癌前病变进展相关的预后生物标志物,并使用改进的原位测序进行验证 | 发现了一个以前未被识别的上皮亚群epi8,该亚群主要来源于正常宫颈但具有癌症相关特征,并与预后生物标志物FAM19A4和miR124-2共享分子特征;证明了epi8相关标志物能够将LSIL风险分层为进展、持续和消退组 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 识别与低级别鳞状上皮内病变(LSIL)结局相关的预后生物标志物,以实现宫颈癌筛查中的精准分流 | 宫颈癌及低级别鳞状上皮内病变(LSIL)患者样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 改进的原位测序(IISS) | NA | 图像, 文本 | 341,978个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 75 | 2026-10-25 |
Osteoclasts intercept meningeal lymphatic paths for dural metastasis
2026-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-11082-6
PMID:42816624
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研究论文 | 本研究揭示了脑膜淋巴功能障碍在硬脑膜转移中的作用,并发现靶向癌相关破骨细胞可恢复脑膜淋巴功能并增强抗肿瘤免疫 | 首次发现脑膜淋巴功能障碍在硬脑膜转移病理生理中的未知作用;建立新的小鼠硬脑膜转移模型;通过单细胞RNA测序揭示硬脑膜转移肿瘤微环境中癌相关破骨细胞驱动的免疫抑制策略;发现大破骨细胞特异定位于颅骨-肿瘤界面而小破骨细胞渗透瘤内区域;证明破骨细胞来源的血管生成素-2导致脑膜淋巴引流失调 | 摘要中未提及具体研究限制 | 探究脑膜淋巴功能障碍在硬脑膜转移中的作用机制,并寻找恢复脑膜淋巴功能以增强抗肿瘤免疫的治疗策略 | 硬脑膜转移小鼠模型及硬脑膜转移肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学, 单细胞组学 | 乳腺癌, 肺癌, 硬脑膜转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床影像, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-10-25 |
Cancer-associated fibroblasts drive immune resistance in MSS colorectal cancer via the FAIM2-CES1-ER stress pathway
2026-Oct, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05705-9
PMID:42742855
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研究论文 | 该文揭示癌症相关成纤维细胞中FAIM2-CES1-ER应激轴调控细胞外基质重塑和免疫微环境,从而驱动MSS结直肠癌免疫抵抗 | 首次鉴定FAIM2为MSS结直肠癌基质调控因子,阐明其通过负调控CES1介导ER应激和ECM重塑的新机制,并发现其促进三级淋巴结构形成 | 机制研究主要在L-929细胞和原代CAFs中进行,体内实验模型有限,尚未在临床免疫治疗队列中验证其治疗潜力 | 探究MSS结直肠癌中CAFs调控ECM重塑和免疫抵抗的分子机制 | MSS结直肠癌患者样本、癌症相关成纤维细胞、L-929细胞 | 肿瘤免疫学、单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、功能实验、基因过表达与敲低 | NA | 单细胞转录组数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-10-25 |
HIV and Antiretroviral Therapy Influence Tumor Microenvironment Architecture, Subclonal Evolution, and Immune Evasion Strategies in Diffuse Large B-cell Lymphoma
2026-Oct-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-26-0343
PMID:42831881
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研究论文 | 该研究利用成像质谱流式、空间转录组和外显子组测序,刻画了HIV相关及抗逆转录病毒治疗暴露的弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤免疫微环境架构、亚克隆演化和免疫逃逸策略 | 首次在HIV相关弥漫大B细胞淋巴瘤中联合应用成像质谱流式、空间转录组和全外显子组测序,揭示了HIV和抗逆转录病毒治疗暴露对肿瘤免疫微环境架构和亚克隆演化的塑造作用,并识别出ART暴露肿瘤中免疫抑制、检查点富集的微环境特征 | 探索性配对Exome分析的样本量有限;未明确提及前瞻性验证或功能实验验证;研究结果基于治疗前活检样本,可能存在选择偏倚 | 刻画不同HIV相关免疫失调状态下的弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤免疫微环境和肿瘤内在特征 | 61例治疗前弥漫大B细胞淋巴瘤活检样本,按HIV状态和抗逆转录病毒治疗暴露分层 | 数字病理, 肿瘤免疫学, 空间组学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤, HIV相关淋巴瘤 | 成像质谱流式, 空间转录组, 全外显子组测序 | NA | 图像, 空间转录组数据, 外显子组测序数据 | 61例治疗前弥漫大B细胞淋巴瘤活检样本 | NA | 空间转录组, 全外显子组测序, 成像质谱流式 | NA | NA |
| 78 | 2026-10-25 |
Single-cell study of human ovarian response to phthalate exposure reveals glial cell susceptibility and disruption of adhesion and mitochondrial pathways
2026-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106487
PMID:42838884
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和免疫染色,解析了MEHP暴露对成人卵巢组织中各细胞类型的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示卵巢胶质细胞对MEHP的易感性,并发现黏附和线粒体通路被扰乱 | 仅一个供体进行了单细胞RNA测序,样本量有限 | 绘制MEHP对成人人类卵巢组织在单细胞分辨率下的影响图谱 | 成人人类卵巢组织外植体及原代卵巢细胞和干细胞来源的施旺细胞 | 单细胞转录组学 | 生殖毒性 | 单细胞RNA测序, 免疫染色 | NA | 基因表达数据, 图像 | 7个供体的卵巢组织外植体(1个用于scRNA-seq,6个用于免疫染色),3个供体的原代卵巢细胞,以及干细胞来源的施旺细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-10-25 |
Medulloblastoma Spatial Transcriptomics Reveals Tumor Microenvironment Heterogeneity With High-Density Progenitor Cell Regions Correlating With High-Risk Disease
2026-Oct, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-01195
PMID:42868339
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研究论文 | 该研究通过对18例儿童髓母细胞瘤样本进行空间转录组测序,揭示了肿瘤微环境的异质性,并发现高密度静息祖细胞样肿瘤细胞区域与高危疾病相关 | 首次在髓母细胞瘤中应用空间转录组学,揭示了超越细胞组成的空间结构对肿瘤进展和治疗结果的影响,识别出与高危特征相关的静息祖细胞样肿瘤细胞密集区域 | 样本量较小(18例),仅有两对匹配的诊断-复发样本,发现需要在更大队列中验证,空间转录组数据的分辨率和覆盖度可能存在技术限制 | 探究髓母细胞瘤肿瘤微环境的空间结构及其与疾病风险分层和复发的关系 | 18例儿童髓母细胞瘤患者诊断时的肿瘤样本,包括两对匹配的诊断-复发样本 | 空间转录组学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据、图像 | 18例儿童髓母细胞瘤样本(包括两对诊断-复发配对样本) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 80 | 2026-10-25 |
Intranasal HSV‑1 infection drives region‑specific interferon‑dominant microglial remodeling
2026-Oct, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014684
PMID:42873820
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研究论文 | 该文通过整合单核RNA测序、染色质可及性分析和空间蛋白质组学与转录组学,研究鼻内HSV-1感染模型中微胶质细胞的转录和表观遗传重塑机制 | 首次在鼻内HSV-1感染模型中整合单核RNA测序、染色质可及性分析、空间蛋白质组学和空间转录组学,揭示IFN驱动的微胶质细胞区域特异性重塑 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 定义急性HSV-1感染期间微胶质细胞反应的转录和表观遗传机制 | CD11b⁺细胞核(微胶质细胞和巨噬细胞群体)及鼻内HSV-1感染模型 | 空间多组学、神经免疫学 | 神经退行性疾病、HSV-1感染、神经炎症 | 单核RNA测序、染色质可及性分析(单细胞多组学)、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |