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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-10-04 |
Dual-tracer PSMA/FDG PET/CT for lesion detection and risk stratification in biochemical recurrence with negative conventional imaging
2026-Oct, European journal of nuclear medicine and molecular imaging
IF:8.6Q1
DOI:10.1007/s00259-026-08089-6
PMID:42474501
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研究论文 | 评估配对68Ga-PSMA-11和18F-FDG PET/CT在前列腺切除术后生化复发且常规影像阴性患者中的病灶检测模式和风险分层价值,并利用公共单细胞转录组数据探索双示踪剂表型的生物学背景 | 首次在常规影像阴性的前列腺切除术后生化复发患者中系统评估配对68Ga-PSMA-11和18F-FDG PET/CT的病灶检测模式和风险分层价值,并结合公共单细胞转录组数据探索双示踪剂表型异质性的生物学基础 | 回顾性单中心研究,样本量较小(58例),公共单细胞转录组分析仅提供假设生成性生物学背景,FOLH1表达与糖酵解活性仅显示弱关联 | 评估配对68Ga-PSMA-11和18F-FDG PET/CT在常规影像阴性的前列腺切除术后生化复发患者中的病灶检测模式和风险分层价值,并探索双示踪剂表型的生物学背景 | 前列腺切除术后生化复发且常规影像阴性的患者 | 数字病理学, 机器学习 | 前列腺癌 | 68Ga-PSMA-11 PET/CT, 18F-FDG PET/CT, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 58例患者,公共单细胞RNA测序数据 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 342 | 2026-10-04 |
Hox/Meis-dependent gene-regulatory transition underlies cardiopharyngeal neural crest diversification
2026-Oct, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00886-x
PMID:42745049
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学分析,构建了小鼠发育中心咽部组织中神经嵴细胞谱系的综合图谱,揭示了Hox/Meis依赖的基因调控转变是心咽神经嵴多样化的基础 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学分析构建心咽部神经嵴细胞谱系的综合图谱,发现从Hox阳性咽部神经嵴细胞向Hox阴性心内群体的转变伴随Meis转录因子结合和基因调控网络结构的改变,鉴定出Meis2-Sox9-Scx基因调控网络定义成骨祖细胞样中间状态 | 摘要中未提及研究局限性 | 阐明心咽部区域神经嵴细胞分化的谱系轨迹和基因调控网络 | 发育中小鼠心咽部组织中的神经嵴细胞 | 单细胞组学, 空间转录组学, 多组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 343 | 2026-10-04 |
An Anoikis-Related Gene Signature Associated With Stromal Remodeling and Clinical Outcome in Gastric Cancer
2026-Oct, Chemical biology & drug design
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/cbdd.70411
PMID:42817148
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研究论文 | 该研究整合公共转录组、临床、体细胞突变和单细胞RNA测序数据,构建基于失巢凋亡相关基因的胃癌预后风险模型,并结合体外实验验证候选基因功能 | 构建了基于失巢凋亡相关基因的胃癌预后风险模型,揭示了其与基质重塑和内皮-间质转化特征的关联,并通过体外实验验证了EEF1A2和TAGLN在胃癌细胞迁移和侵袭中的作用 | 风险模型的区分性能较为有限,仅具有中等程度的预测能力,需要更大规模队列进一步验证 | 探索失巢凋亡相关基因在胃癌中的预后和功能相关性,构建风险模型并研究其与肿瘤微环境特征的关联 | 胃癌患者转录组数据和胃癌细胞系HGC-27 | 机器学习 | 胃癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA sequencing, siRNA knockdown | 风险评分模型 | 转录组数据, 临床数据, 体细胞突变数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 344 | 2026-10-04 |
Traumatic brain injury induces cell-type-specific remodelling of the proteostasis network
2026-Oct-01, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2025.0264
PMID:42817638
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研究论文 | 该研究利用存档的小鼠和人类转录组数据,揭示了创伤性脑损伤(TBI)后脑内蛋白质稳态网络的细胞类型特异性重塑 | 首次系统性地描绘了TBI后蛋白质稳态网络在细胞类型和亚型水平上的动态变化,并发现了小鼠和人类之间保守的细胞特异性反应 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证;使用的是存档数据,可能存在批次效应;未进行功能实验验证 | 阐明TBI如何改变脑内蛋白质稳态网络,并揭示细胞类型特异性的变化 | 小鼠和人类脑组织的转录组数据 | 机器学习 | 创伤性脑损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2026-10-04 |
Inhibition of Hexokinase 2 Undermines Cartilage Health and Accelerates Osteoarthritis
2026-Oct-01, Cartilage
IF:2.7Q1
DOI:10.1177/19476035261494285
PMID:42820640
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研究论文 | 该研究探讨了己糖激酶2(HK2)在骨关节炎软骨中的作用,发现抑制HK2会损害软骨健康并加速骨关节炎进展 | 首次揭示了HK2在维持软骨功能和调节软骨细胞分化中的关键保护作用,挑战了既往认为抑制糖酵解可治疗OA的观点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,人类软骨数据仅来自公共数据集的再分析,缺乏临床验证 | 探究HK2在骨关节炎软骨中的角色及其对软骨细胞分化的影响 | 小鼠软骨细胞、人类关节软骨scRNA-seq数据、DMM诱导的OA小鼠模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 346 | 2026-10-04 |
PTPN22 as a novel therapeutic target: a key intracellular checkpoint for NK cell therapy
2026-Oct-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-016896
PMID:42823085
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和TCGA数据分析,结合CRISPR基因敲除和药理抑制手段,揭示了PTPN22作为NK细胞新型胞内检查点的功能,并证明敲除PTPN22可增强NK细胞和CAR-NK细胞的抗肿瘤活性 | 首次将PTPN22鉴定为限制NK细胞和CAR-NK细胞功能的新型胞内检查点,并证明靶向敲除PTPN22可增强未修饰NK细胞和CAR工程化NK细胞的治疗疗效和持久性 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究PTPN22在NK细胞中的功能,评估其作为NK细胞治疗新靶点的潜力 | NK细胞、CAR-NK细胞(包括抗CD19 CAR-NK92细胞和原代抗CD19 CAR-NK细胞) | 免疫治疗、肿瘤免疫学 | 血液肿瘤(白血病)、实体瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR基因编辑、TCGA数据分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、TCGA临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2026-10-04 |
Propionate promotes CD8+ T-cell infiltration and enhances immunotherapy efficacy in colorectal cancer
2026-Oct-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015279
PMID:42823087
|
研究论文 | 本研究探讨了丙酸在结直肠癌抗肿瘤免疫及免疫治疗应答中的作用,揭示其通过ASS1乙酰化降解激活STAT1信号通路,促进CD8+ T细胞浸润并增强PD-L1阻断疗法的疗效 | 首次揭示丙酸通过乙酰-CoA乙酰转移酶1依赖的ASS1乙酰化及蛋白酶体降解,激活STAT1信号通路并上调CXCL9,从而促进CD8+ T细胞浸润;发现丙酸可恢复MSS型结直肠癌对PD-L1阻断治疗的敏感性 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证仍有限,丙酸作为治疗策略的临床转化安全性和有效性尚需进一步临床试验验证 | 探究丙酸在结直肠癌抗肿瘤免疫和免疫治疗应答中的作用及其分子机制 | 结直肠癌患者外周血和肿瘤组织样本、MSI-H和MSS小鼠结直肠癌模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 文本, 图像 | 结直肠癌患者及健康对照的外周血和肿瘤组织样本(具体数量未提及),MSI-H和MSS小鼠结直肠癌模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 348 | 2026-10-04 |
Subphenotype-specific serum proteomic signatures in patients with ARDS
2026-Oct-01, Journal of intensive care
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s40560-026-00951-x
PMID:42823723
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研究论文 | 本研究通过血清蛋白质组学分析,揭示了ARDS高炎症和低炎症亚型之间差异表达的蛋白质及其相关生物学通路 | 首次系统性地对ARDS已确立的炎症亚型进行血清蛋白质组学分析,并将血清蛋白质组数据映射到公开的单细胞RNA测序数据集,为亚型相关血清蛋白提供细胞表达背景 | 样本量较小(仅31例患者),且为单中心前瞻性研究,需要在更大规模的多中心队列中验证 | 探索ARDS不同炎症亚型之间的循环蛋白质组差异,以深入理解其生物学异质性 | ARDS患者 | 蛋白质组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 血清蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、文本 | 31例ARDS患者(13例高炎症亚型,18例低炎症亚型)的血清样本,以及公开的单细胞RNA-seq参考数据集 | NA | 血清蛋白质组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 349 | 2026-10-04 |
Acetyltransferase MOF Regulates Macrophage Inflammation in Abdominal Aortic Aneurysms
2026-Oct-01, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.126.329212
PMID:42817883
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析人类腹主动脉瘤组织中MOF的表达,并结合小鼠模型和靶向抑制实验,揭示了乙酰转移酶MOF通过调控巨噬细胞炎症反应促进腹主动脉瘤发展的机制 | 首次发现组蛋白乙酰转移酶MOF在腹主动脉瘤中的单核/巨噬细胞中表达升高,并揭示TNF-α信号通过诱导MOF增加H4K16ac修饰进而促进NF-κB介导的炎症基因转录的新机制,同时证明靶向抑制MOF通路可有效减缓腹主动脉瘤发展 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究MOF在腹主动脉瘤形成过程中对巨噬细胞介导炎症的调控作用及其机制,并评估靶向MOF通路作为治疗策略的可行性 | 人类腹主动脉瘤组织及对照组织、小鼠腹主动脉瘤模型(Ang II诱导和猪胰弹性蛋白酶诱导)中的主动脉单核/巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 染色质免疫沉淀 | NA | 文本, 图像 | 人类腹主动脉瘤组织及对照组织(具体数量未提及)以及两种小鼠腹主动脉瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 350 | 2026-10-03 |
Comprehensive Multi-Omic Profiling of Desmoplastic Small Round Cell Tumors Identifies Targetable Pathways with Therapeutic Opportunities
2026-Oct-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-25-1134
PMID:42312950
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研究论文 | 本研究通过对五名患者的九份肿瘤活检样本进行多组学分析,全面揭示了促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤的可靶向通路及治疗机会 | 首次对促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤进行综合性多组学分析,整合了批量与单细胞RNA测序、蛋白质分析、免疫组化、免疫分析及功能性同源重组缺陷检测,发现了缺乏基因组HRD瘢痕特征但具有功能性HRD的肿瘤亚群,并揭示了治疗依赖性的表达和活性变化 | 样本量较小(仅五名患者的九份活检样本),可能限制了研究结果的普遍性;研究为观察性分析,未进行临床试验验证靶向治疗的实际疗效 | 对促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤进行深入的多组学表征,识别可靶向的分子特征和患者特异性弱点,为生物标志物指导的治疗策略奠定基础 | 促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤患者来源的肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质分析、免疫组化、免疫分析、功能性同源重组缺陷检测 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、图像 | 五名患者的九份患者来源肿瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 351 | 2026-10-03 |
Macrophage-Induced Senescent Cancer-Associated Fibroblasts Promote SASP-Mediated Chemoresistance in Colorectal Cancer
2026-Oct-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4870
PMID:42418705
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研究论文 | 该研究基于单细胞RNA测序数据构建机器学习预测模型识别衰老癌症相关成纤维细胞(sCAF),揭示巨噬细胞来源的IL1B通过IL1B-IL1R1轴诱导CAF衰老,进而通过SASP介导结直肠癌化疗耐药 | 开发了基于机器学习的细胞衰老预测模型用于准确识别sCAF,首次揭示巨噬细胞来源的IL1B通过IL1B-IL1R1相互作用触发CAF衰老,阐明sCAF通过SASP(IL6和CXCL12)介导结直肠癌化疗耐药的新机制 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 开发机器学习预测模型识别衰老CAF,探究sCAF在结直肠癌化疗耐药中的作用及其诱导机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAF)、巨噬细胞及患者来源类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化 | 机器学习预测模型 | 单细胞RNA测序数据,图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 352 | 2026-10-03 |
Multiomics Dissection Reveals Natural Killer Cell-CD8+ T-cell Cooperation in Shaping an Immunostimulatory Tumor Microenvironment
2026-Oct-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4957
PMID:42545372
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研究论文 | 该研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和高维流式细胞术,揭示了在低T细胞浸润肿瘤中自然杀伤细胞与CD8+ T细胞之间的时空协同作用,以及疫苗接种如何重塑肿瘤微环境 | 首次揭示了IRF8+KLRG1+自然杀伤细胞与抗原致敏CXCR3+细胞毒性T淋巴细胞之间的协同程序,发现了CCR5-CCL5和CXCR3-CXCL9信号通路在协调先天性和适应性免疫区室通讯中的作用 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 揭示自然杀伤细胞与CD8+ T细胞在塑造免疫刺激性肿瘤微环境中的协同作用机制 | 低T细胞浸润肿瘤中的免疫细胞(自然杀伤细胞、细胞毒性T淋巴细胞、髓系细胞、树突状细胞等) | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,高维流式细胞术 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 353 | 2026-10-03 |
Spatial Transcriptomic Profiling Reveals a Fibroblast-Associated Extracellular Matrix Niche in KRAS G12C-Mutant Lung Adenocarcinoma Primary Tumors From Patients With Metastasis
2026-Oct-02, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.70764
PMID:42823844
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研究论文 | 该研究利用10x Visium空间转录组技术对4例KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤(2例无转移、2例有转移)进行空间转录组分析,发现与转移相关的成纤维细胞相关细胞外基质生态位 | 首次在KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤中利用空间转录组揭示与转移状态相关的成纤维细胞相关细胞外基质重塑生态位,并鉴定出由COL1A1、COL1A2、COL3A1、SPARC、POSTN和VCAN组成的基因模块 | 样本量极小(仅4例患者),属于探索性初步研究,TCGA验证和体外功能实验仅提供初步支持,需要在更大规模的空间转录组队列和机制模型中进行验证 | 探究KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤中伴随转移发生的空间转录组程序 | 4例KRAS G12C突变肺腺癌患者的原发肿瘤组织,其中2例无转移、2例有转移 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | 4例KRAS G12C突变肺腺癌原发肿瘤样本,共14,351个空间斑点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组,结合已发表的NSCLC单细胞图谱进行RCTD解卷积分析 |
| 354 | 2026-10-03 |
Unraveling the tapestry: Lessons from multi-omics and spatial biology in hepatocellular cancer
2026-Oct-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001716
PMID:41678777
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综述 | 本文综述了空间组学技术(空间转录组学、蛋白质组学、基因组学、表观基因组学、代谢组学)在肝细胞癌研究中的应用,重点阐述了这些技术如何揭示肿瘤微环境的空间组织及其对预后、免疫逃逸和治疗反应的影响 | 强调了空间分辨分析能够揭示传统bulk或单细胞分子分析无法发现的新型癌细胞与基质细胞及实质细胞群体之间的通讯轴,以及空间映射的配体-受体网络所定义的协调信号回路 | 作为一篇综述,本文未提供原始实验数据,且未对现有空间组学技术在肝细胞癌中的具体技术局限性和标准化问题进行深入讨论 | 总结空间组学技术在肝细胞癌研究中的最新进展,探讨空间生物学如何改变对肝癌生物学的理解并推动空间信息指导的精准肿瘤学发展 | 肝细胞癌及其肿瘤微环境 | 空间生物学 | 肝癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学, 空间代谢组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 355 | 2026-10-03 |
Mechanotransduction unifies healthy nondiabetic wound healing over time by promoting a Cd14+/C1qa+ fibroblast subpopulation
2026-Oct, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.02.027
PMID:41997300
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序表征了糖尿病小鼠伤口愈合过程中成纤维细胞的异质性,发现机械转导通过促进Cd14+/C1qa+成纤维细胞亚群来统一健康非糖尿病伤口愈合 | 首次在遗传诱导和病理生理性糖尿病小鼠模型中全面表征伤口愈合各阶段成纤维细胞异质性,发现Cd14+/C1qa+血管生成成纤维细胞在非糖尿病伤口愈合中特异性表达,并揭示机械转导通路(FAK和MAPK)在糖尿病中被选择性耗竭 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类糖尿病伤口中验证;样本量有限;单细胞RNA测序时间点仅涵盖术后第0、2、7和30天 | 表征糖尿病小鼠伤口愈合过程中成纤维细胞异质性,探究机械转导在伤口愈合中的作用机制 | C57BL/6非糖尿病野生型小鼠、高脂饮食诱导的病理生理性糖尿病小鼠、瘦素受体缺陷的遗传诱导糖尿病小鼠的全层切除伤口组织 | 单细胞转录组学 | 糖尿病伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种小鼠模型(非糖尿病野生型、高脂饮食诱导糖尿病、瘦素受体缺陷糖尿病)在术后第0、2、7、30天的伤口组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 356 | 2026-10-03 |
Targeting Oncomucin-Driven Immunosuppression Improves the Efficacy of K-rasG12D Inhibition in Pancreatic Cancer
2026-Oct, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.04.041
PMID:42191046
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、多重/序贯免疫染色和小鼠模型,揭示了胰腺导管腺癌中致癌性去 novo 黏蛋白(oncoMUCs)通过EGFR/UNC5B信号通路促进免疫抑制,并证明靶向oncoMUCs可增强K-rasG12D抑制剂(MRTX1133)的疗效 | 首次系统性地研究了oncoMUCs(MUC4、MUC16和MUC5AC)作为整体在胰腺导管腺癌进展和肿瘤微环境中的集体影响,发现跨膜oncoMUCs通过EGFR/UNC5B信号通路协同上调免疫检查点分子(VISTA、TIM3、PD-L1),促进免疫逃逸;并首次提出靶向oncoMUCs(使用Istradefylline)可增强K-rasG12D抑制剂的疗效 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 评估以患者为中心的oncoMUCs对肿瘤微环境的影响,为胰腺导管腺癌的诊断和治疗策略提供依据 | 胰腺导管腺癌(PDA)患者样本及小鼠模型中的oncoMUCs(MUC4、MUC16和MUC5AC)及其亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重/序贯免疫染色、NanoString profiling、基因沉默、小鼠模型 | NA | 图像、文本 | 单细胞RNA测序样本34例,以及多重/序贯免疫染色样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2026-10-03 |
Immune-mediated rheumatoid arthritis: from single-cell genomics to new therapies
2026-Oct, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02639-8
PMID:42675115
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学在免疫介导的类风湿关节炎研究中的应用,并探讨了如何利用空间转录组学、离体机制研究、类器官和动物模型来推动对疾病发病机制的理解,从而设计新的治疗策略 | 提出了将空间转录组学、离体机制研究、类器官研究和基于人类疾病数据改进的动物模型相结合,以从描述性数据中获取因果和机制见解的新视角 | 目前单细胞基因组学数据 largely descriptive and correlative,难以直接揭示因果关系和疾病机制 | 探讨如何利用单细胞基因组学及其他技术推进对免疫介导的类风湿关节炎发病机制的理解,并基于此设计新的治疗策略和临床试验 | 免疫介导的关节炎,特别是类风湿关节炎 | 单细胞基因组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞基因组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 358 | 2026-10-03 |
Accurate reconstruction of spatial cell-type maps and characterization of domain-specific functions based on a gene-aware heterogeneous network
2026-Oct-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.282246.126
PMID:42642330
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研究论文 | 本文提出了一种基因感知异构图注意力网络STGnet,用于空间转录组数据的细胞类型解卷积和功能注释 | 提出基因感知异构图注意力网络STGnet,利用混合伪斑点生成策略捕获空间富集的细胞类型模式,统一整合空间邻接、转录相似性和基因-斑点关联,并通过注意力权重突出域特异性基因实现可解释的域注释 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 准确重建空间细胞类型图谱并表征域特异性功能 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 异构图注意力网络 | 基因表达数据, 空间数据 | 模拟和真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2026-10-03 |
E protein-driven iNKT subset modulation shapes early immune responses during influenza A virus infection
2026-Oct-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag054
PMID:42089345
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研究论文 | 该研究利用具有正常iNKT细胞数量但不同iNKT亚群组成的基因改造小鼠品系(NKTWT和NKTET2),分析了不同iNKT功能亚群对甲型流感病毒感染结局的影响,发现iNKT亚群组成的改变通过改变早期免疫应答特征来影响感染结果 | 首次利用iNKT细胞数量正常但亚群组成不同的基因改造小鼠品系(NKTET2),系统揭示了iNKT功能亚群(iNKT1、iNKT2、iNKT17)的相对比例变化而非细胞总数对IAV感染早期免疫应答和疾病结局的决定性影响,并发现NKTET2小鼠中iNKT应答从I型向17型转变 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证;未明确E蛋白具体如何驱动iNKT亚群分化的分子机制;样本量及具体小鼠数量未在摘要中说明 | 探究不同iNKT功能亚群(iNKT1、iNKT2、iNKT17)在甲型流感病毒感染早期免疫应答中的作用及其对感染结局的影响 | 基因改造小鼠品系(NKTWT和NKTET2)及其iNKT细胞亚群、甲型流感病毒感染模型 | 免疫学 | 流感病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本(基因表达数据) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 360 | 2026-10-03 |
MMP12 induces fibrogenic macrophage differentiation to drive granuloma-associated cardiac fibrosis
2026-Oct-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamag354
PMID:42523188
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研究论文 | 该研究通过小鼠模型和单细胞RNA测序揭示了MMP12在心脏结节病中诱导纤维化巨噬细胞分化并驱动肉芽肿相关心脏纤维化的机制 | 首次发现MMP12是巨噬细胞内在的诱导因子和主要效应分子,将纤维化巨噬细胞身份与肉芽肿结构和心脏纤维化联系起来,并提出了不同于上游mTORC1抑制的治疗策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究肉芽肿性炎症如何在巨噬细胞效应功能层面转化为纤维化重塑,特别是mTORC1依赖的巨噬细胞激活在心脏结节病中的作用机制 | 小鼠模型(髓系特异性Tsc2缺失)和人类心脏结节病组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |