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当前共找到 529 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2026-10-19
Enrichment of Retinal Endothelial Cells and Müller Glia Enable Comprehensive scRNA-Seq Profiling of the Blood-Retinal Barrier
2026-Oct-16, Journal of visualized experiments : JoVE
研究方法论文 本文提出一种优化的鼠视网膜细胞分离方法,结合温和酶解与机械吹打并利用FACS富集血管内皮细胞和Müller胶质细胞,实现血视网膜屏障的高质量单细胞RNA测序分析 整合温和酶解与机械吹打以保持细胞活性并减少转录伪影,同时采用FACS靶向富集占比不足2%的稀有细胞群,并测试基于抗体的细胞哈希实现样本多重化以提升成本效率 摘要未明确说明富集过程可能引入的细胞状态偏差及方法在其他神经组织中的普适性仍需验证 建立一种能够保留细胞完整性并选择性富集稀有细胞群的鼠视网膜单细胞悬液制备方法,以支持血视网膜屏障的单细胞分辨率研究 鼠视网膜细胞,特别是血管内皮细胞和Müller胶质细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
202 2026-10-19
SPP1+ TAMs drive colorectal tumorigenesis through an ARG2-orchestrated metabolic-immune crosstalk
2026-Oct-13, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 该文揭示了SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过ARG2介导的代谢-免疫串扰驱动结直肠癌发生的分子机制,并发现长双歧杆菌可下调CD44破坏该轴 首次阐明SPP1+ TAM通过SPP1-CD44轴诱导CRC细胞ARG2表达,ARG2通过USP10去泛素化稳定c-Myc进而激活HK2驱动Warburg代谢的正反馈环路,并发现长双歧杆菌作为微生物来源的精准辅助治疗可破坏SPP1-ARG2轴 研究主要基于临床标本、小鼠模型和细胞系的多平台整合策略,但未明确提及具体的样本量和大规模临床验证队列,微生物调控机制的因果关系仍需进一步体内验证 解析SPP1+ TAM重编程肿瘤进展的分子机制,并确定肠道微生物是否调控结直肠癌中的这一过程 结直肠癌临床标本、小鼠模型和结直肠癌细胞系 肿瘤免疫学、单细胞转录组学 结直肠癌 单细胞转录组学、多平台整合分析 NA 单细胞转录组数据、临床标本数据、动物模型数据、细胞系数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
203 2026-10-19
Early-life exposure to environmental pollutants and endocrine disruptors: emerging risks and mechanistic insights in maternal, fetal, and child health
2026-Oct-13, Environmental research IF:7.7Q1
综述 综述早期生命暴露于环境污染物和内分泌干扰物对母体、胎儿和儿童健康的影响及其机制 强调生命历程视角和环境正义,整合暴露组学、多组学、单细胞测序、空间生物学和微生物组研究等新方法揭示机制 未提及具体研究数据,缺乏原始实验验证,主要基于现有文献总结 总结早期生命环境暴露的暴露途径、生物监测方法、胎盘过程、分子和表观遗传修饰及其对神经发育、代谢、内分泌和生殖的影响,并强调暴露评估、预防措施和政策框架的进展 孕妇、胎儿和儿童 环境健康与暴露组学 神经发育障碍, 代谢功能障碍, 内分泌异常, 生殖损伤 暴露组学, 高分辨率质谱, 生物监测, 被动采样, 多组学, 单细胞测序, 空间生物学, 微生物组研究 NA 文本 NA NA NA NA NA
204 2026-10-19
Erratum: DestinyNet: A deep-learning framework for cell-fate analysis from lineage-tracing single-cell RNA sequencing data
2026-Oct-09, Patterns (New York, N.Y.)
更正 本文是对DestinyNet论文的更正声明 无 仅作为更正声明,未提供新研究内容 更正已发表论文中的错误 已发表的DestinyNet论文 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习框架 文本 NA NA NA NA NA
205 2026-10-19
Disentangling batch effects and biological signals across conditions in single-cell transcriptome
2026-Oct-09, Patterns (New York, N.Y.)
研究论文 提出了一种基于变分自编码器的批次校正方法Kanade,通过分离潜在变量来区分批次效应和生物信号,实现选择性校正并保留生物特征 利用变分自编码器专门化潜在变量,明确解耦批次效应与生物信号,避免传统方法 indiscriminately 混合数据导致生物信号丢失,支持跨条件比较分析 仅在模拟和真实数据集上验证,未提及大规模临床样本或多种平台数据的广泛测试;方法依赖于变分自编码器,可能对复杂批次结构敏感 解决单细胞转录组分析中批次效应与生物信号混杂的问题,实现选择性批次校正以支持跨条件比较分析 单细胞转录组数据(包括模拟数据和真实数据集) 机器学习 NA 单细胞转录组测序 VAE 文本(基因表达矩阵) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
206 2026-10-19
Tunable population diversity through a noise-driven differentiation switch
2026-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序分析神经祖细胞在40种信号组合下的分化,揭示一种噪声驱动的分化开关可调控细胞群体多样性 提出噪声驱动的退火开关机制,在log细胞命运概率空间中实现加性调控,并预测早期双潜能状态 摘要未明确说明具体局限性 探究组合信号如何通过电路层面机制调控神经祖细胞分化为多样细胞类型群体的比例 神经祖细胞(NPCs) 单细胞转录组学、计算生物学、发育生物学 NA 单细胞RNA-seq D-SPIN调控网络模型、分化开关电路模型 单细胞转录组数据 40种信号条件下的神经祖细胞,具体细胞数未在摘要中说明;另验证小鼠胚胎视觉皮层发育数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
207 2026-10-17
Distinguishing the endotypes of Chronic rhinosinusitis: the emerging roles of macrophages
2026-Oct-16, Expert review of clinical immunology IF:3.9Q2
综述 本文综述了巨噬细胞在慢性鼻窦炎不同内型中的异质性及其作用 系统总结了单细胞转录组分析鉴定的与慢性鼻窦炎内型相关的巨噬细胞亚群,并提出了基于巨噬细胞的生物标志物用于内型分型和靶向治疗的新视角 未明确说明,但作为综述可能缺乏原始实验数据验证 剖析巨噬细胞在慢性鼻窦炎不同内型中的异质性,并探讨其作为生物标志物和靶向治疗靶点的潜力 慢性鼻窦炎患者及相关的巨噬细胞 单细胞转录组学、免疫学 慢性鼻窦炎 单细胞转录组分析 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
208 2026-10-17
Biased signaling of endothelial GPCRs as a therapeutic frontier in atherosclerosis
2026-Oct-15, Journal of receptor and signal transduction research
综述 本文综述了内皮GPCR偏向性信号作为动脉粥样硬化治疗前沿的研究进展,探讨了主要内皮GPCR家族的功能选择性机制及新兴转化工具 提出将内皮靶向的偏向性GPCR信号工程化作为精准、通路特异性的策略来阻止斑块进展和稳定易损病变,并强调高分辨率结构生物学、单细胞转录组学、空间组学和动态生物工程模型作为新兴转化工具指导未来药物发现 未涉及具体临床试验数据或药物开发验证,主要基于机制综述和理论探讨 探讨内皮GPCR偏向性信号在动脉粥样硬化治疗中的应用潜力,分析功能选择性机制并展望未来精准心血管药物发现方向 内皮GPCR家族(包括血管紧张素II受体、1-磷酸鞘氨醇受体、非典型趋化因子受体和β-肾上腺素能受体)及动脉粥样硬化 机器学习 心血管疾病 NA NA 文本 NA NA 单细胞转录组学, 空间组学 NA NA
209 2026-10-17
Multimodal assessment of exceptional responders refines subtyping-directed precision treatment in HR+/HER2- breast cancer
2026-Oct-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究整合了FASCINATE-N试验中230例HR+/HER2-乳腺癌患者的多组学、数字病理和临床数据,聚焦于异常应答者,探索优化亚型导向精准治疗的策略 首次通过整合转录组学、基因组学、数字病理和空间转录组学进行多模态评估,针对HR+/HER2-乳腺癌四种分子亚型中的异常应答者,揭示了神经周围侵犯、肿瘤-基质-免疫界面空间结构、DNA修复基因突变和淋巴管浸润等与不同治疗疗效的关联,提出了各亚型精准治疗优化的新方向 研究基于FASCINATE-N概念验证试验的230例样本,样本量有限,异常应答者亚组分析可能受限于统计效能,且发现需要在更大规模的前瞻性临床试验中进一步验证 通过多模态评估异常应答者,优化HR+/HER2-乳腺癌亚型导向的精准治疗策略 HR+/HER2-乳腺癌患者,来自FASCINATE-N试验,共230例 数字病理 乳腺癌 转录组学,基因组学,数字病理,空间转录组学 NA 图像,文本,基因组数据,转录组数据 230例HR+/HER2-乳腺癌患者 NA 空间转录组学,转录组学,基因组学 NA NA
210 2026-10-17
Altered cholangiocyte subsets with neural pathway enrichment in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2026-Oct-15, Internal and emergency medicine IF:3.2Q1
研究论文 该研究整合单细胞测序和批量测序数据,利用hdWGCNA、细胞互作分析、机器学习、免疫浸润分析和孟德尔随机化等方法,揭示了MASLD中胆管细胞亚群改变及神经通路富集的特征 首次系统性地揭示了MASH患者中胆管细胞亚群的显著改变,特别是SEMA3通路表达升高的胆管细胞增加,并发现神经相关通路在胆管细胞中的富集及其与免疫细胞的复杂互作,同时通过孟德尔随机化鉴定PLEKHA5为MASLD的候选因果基因 本研究为假设生成性的生物信息学研究,缺乏实验验证,孟德尔随机化分析中部分关联仅为提示性(如SEL1L3 P=0.0413),需要进一步的体内外实验和更大规模的队列研究来验证胆管细胞相关机制在MASLD发病中的作用 探究胆管细胞在代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)中的作用,特别是胆管细胞亚群变化及神经通路在疾病发病机制中的潜在贡献 MASLD/MASH患者的单细胞测序数据和批量测序数据集中的胆管细胞亚群 机器学习 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化 hdWGCNA, 机器学习模型(共7种) 基因表达数据(单细胞和批量测序数据) NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
211 2026-10-17
Network pharmacology and single-cell sequencing analysis of gastrodin in anticancer effects against colorectal cancer by regulating key target genes and the tumor immune microenvironment
2026-Oct-15, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过网络药理学和单细胞测序分析,探索天麻素通过调控关键靶基因和肿瘤免疫微环境发挥抗结直肠癌作用的机制 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序、机器学习算法和分子对接等多种方法,系统揭示天麻素抗结直肠癌的关键靶基因NFE2L3及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内动物实验和临床样本验证 探索天麻素抗结直肠癌的潜在靶点和分子机制 结直肠癌相关基因、天麻素潜在靶点、结直肠癌细胞系 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序、转录组分析、分子对接 LASSO回归、支持向量机、随机森林、SHAP分析 基因表达数据、图像 TCGA和GEO数据集的结直肠癌转录组数据以及单细胞RNA测序数据,具体样本量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
212 2026-10-17
Emerging frontiers for AI in single-cell genomics
2026-Oct-15, Molecular cell IF:14.5Q1
综述 该综述文章回顾了人工智能在单细胞基因组学中的嵌入模型和基础模型,涵盖scRNA-seq、scATAC-seq、单细胞多组学调控基因组学以及基于Perturb-seq的虚拟细胞模型,并讨论了当前局限与未来展望 系统性地梳理了从早期单细胞RNA嵌入模型到基础模型的发展脉络,并首次将单细胞表观遗传/多组学检测与Perturb-seq技术带来的AI建模新机遇进行整合论述,提出了利用大规模图谱数据资源和虚拟细胞模型的前瞻性视角 早期单细胞RNA嵌入模型和基础模型在实验生物学家中未获得广泛关注和应用;单细胞AI模型仍存在诸多当前局限性,文中对此进行了描述但未提出具体解决方案 综述单细胞基因组学中AI嵌入模型和基础模型的发展现状,探讨scRNA-seq和scATAC-seq的AI建模方法、单细胞多组学在调控基因组学中的机器学习应用以及从Perturb-seq学习虚拟细胞模型的AI策略 单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据、单细胞多组学数据、Perturb-seq数据及相关AI模型 机器学习 NA scRNA-seq, scATAC-seq, 单细胞多组学, Perturb-seq 基础模型, 嵌入模型, 虚拟细胞模型 文本 NA NA single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, single-cell multi-omics NA NA
213 2026-10-17
Perinatal nicotine exposure disrupts hematopoietic stem cell development and elevates influenza severity in adulthood
2026-Oct-15, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本文通过小鼠模型研究发现,围产期尼古丁暴露会破坏造血干细胞发育,并导致成年后流感严重程度增加 首次建立围产期尼古丁暴露作为发育性适应性免疫不良的小鼠模型,揭示早期环境暴露通过改变造血干细胞及其后代,持久影响组织驻留免疫细胞,从而增加呼吸道病毒感染易感性 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证;具体分子机制和表观遗传调控细节仍需进一步探索 探究围产期尼古丁暴露对造血干细胞发育及成年后呼吸道病毒感染易感性的长期影响 围产期尼古丁暴露的小鼠模型及其后代 机器学习 肺癌 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
214 2026-10-17
Development and Characterization of a Rat Model of Post-traumatic Ankle Osteoarthritis
2026-Oct-15, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1
研究论文 通过切除大鼠踝关节前距腓韧带和跟腓韧带建立创伤后踝关节炎模型,结合疼痛行为学、组织学、批量RNA测序和单细胞RNA测序揭示滑膜组织中的关键分子通路。 首次建立由关节不稳定诱导的大鼠创伤后踝关节炎模型,并首次在滑膜组织中鉴定出TGF-β-MAPK/PI3K-Akt-CTGF信号轴和THBS2-FN1轴的激活。 样本量较小(每组8只),仅在大鼠模型中验证,尚未在人类临床样本中确认。 开发创伤后踝关节炎大鼠模型,评估疼痛和病理变化,并探索滑膜组织中的分子机制。 大鼠踝关节、背根神经节和滑膜组织 数字病理学 骨关节炎 批量RNA测序,单细胞RNA测序 NA 图像,文本 每组8只大鼠(RAC组n=8,Sham对照组n=8),治疗实验每组8只 NA 批量RNA测序,单细胞RNA测序 NA NA
215 2026-10-17
From Single-Cell Sequencing Data Analysis to Functional Validation: XCL1 is Associated with Glycolytic Metabolism in Oral Squamous Cell Carcinoma
2026-Oct-15, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序数据分析结合体外功能实验,发现XCL1与口腔鳞状细胞癌的糖酵解代谢相关,并促进肿瘤细胞增殖 首次通过单细胞RNA测序数据分析筛选并实验验证XCL1在口腔鳞状细胞癌糖酵解代谢中的关键作用,揭示了XCL1作为糖酵解相关候选基因的促癌功能 缺乏体内实验验证,且临床队列样本量有限,XCL1的生物学和治疗相关性仍需进一步评估 探究口腔鳞状细胞癌中糖酵解代谢的分子调控机制,筛选并验证核心候选基因的功能 口腔鳞状细胞癌细胞及GSE247582单细胞RNA测序数据集、TCGA数据库中的口腔鳞状细胞癌样本 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 GSE247582单细胞RNA测序数据集及TCGA数据库中的口腔鳞状细胞癌样本,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq NA NA
216 2026-10-17
A multi-omics integration identifies ENY2 hypomethylation as a driver of immunosuppression and progression in breast cancer
2026-Oct-15, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过多组学整合分析,揭示了ENY2低甲基化驱动乳腺癌免疫抑制和进展的表观遗传-免疫互作机制 首次构建了乳腺癌甲基化驱动的预后模型,发现ENY2启动子低甲基化通过增强染色质可及性、招募转录因子E2F1驱动ENY2转录,并揭示ENY2通过TNF-NF-κB/PD-L1轴及MIF/MDK分泌组重塑免疫抑制微环境的新机制 摘要中未明确提及研究局限性 构建乳腺癌甲基化驱动的预后模型,阐明DNA甲基化异常在乳腺癌进展和免疫微环境失调中的表观遗传-免疫互作机制 乳腺癌患者队列(TCGA和GSE76427)、乳腺癌细胞系、小鼠模型 机器学习 乳腺癌 DNA甲基化测序、scRNA-seq、ATAC-seq、Western blot、流式细胞术 SIMPO算法、Cox回归 图像、文本 TCGA队列和GSE76427验证队列的乳腺癌样本,以及乳腺癌细胞系和小鼠模型 NA single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, bulk RNA-seq, 甲基化测序 NA NA
217 2026-10-17
Single-cell insights into obesity: cellular mechanisms across metabolic organs
2026-Oct-15, The Journal of nutrition IF:3.7Q2
综述 本文综述了近年来利用单细胞RNA测序技术研究饮食诱导肥胖对肠道、肝脏、脂肪组织、胰岛和主动脉等代谢器官中不同细胞群体影响的研究进展 系统整合了单细胞RNA测序在肥胖研究中的应用,揭示了不同代谢器官中细胞身份重编程、代谢功能改变和细胞间通讯的详细机制 作为综述文章,未提供原始实验数据,且主要聚焦于饮食诱导肥胖模型,可能未涵盖其他类型肥胖 总结单细胞RNA测序在研究饮食诱导肥胖对多种代谢器官细胞群体影响中的应用,为肥胖及其并发症的治疗提供靶点 饮食诱导肥胖模型中的肠道、肝脏、脂肪组织、胰岛和主动脉等代谢器官中的不同细胞群体 单细胞生物学 肥胖 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
218 2026-10-17
IRF7 signalling in tanycytes controls brain-body-immune response across the ovarian cycle
2026-Oct-15, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 该研究利用单细胞转录组学构建了小鼠和人类下丘脑正中隆起的细胞图谱,揭示了伸展细胞中IRF7信号通路在动情周期中调控脑-体-免疫反应的机制 首次发现伸展细胞具有免疫细胞样状态,揭示了伸展细胞中干扰素调节因子7(Irf7)在动情周期中的周期性表达及其对白细胞浸润和循环单核细胞比例的调控作用,阐明了脑-免疫系统通过伸展细胞的通讯机制 研究主要基于小鼠模型,虽然有人类样本的跨物种比较,但人类功能验证有限;具体分子机制和临床转化意义仍需进一步研究 探究下丘脑伸展细胞在脑-体-免疫通讯中的作用及其在动情周期中的动态变化,理解性别偏向性疾病的神经内分泌和免疫学机制 小鼠和人类的伸展细胞(下丘脑正中隆起区域的室管膜胶质细胞) 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
219 2026-10-17
SALL1 as a marker for distinguishing microglia from blood-derived myeloid cells in stroke brain scRNA-seq data
2026-10-15, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
研究论文 本文提出SALL1作为标志物,用于在中风脑部scRNA-seq数据中区分常驻小胶质细胞与浸润性髓系细胞 发现SALL1相比常用标志物(TMEM119、CX3CR1、P2RY12)对小胶质细胞具有更高的特异性,并将SALL1与这些常用标志物联合使用以提高区分能力 摘要中未提及该研究的局限性 解决中风scRNA-seq数据中因髓系标志物共享而难以区分常驻小胶质细胞与浸润性髓系细胞的问题 中风脑部scRNA-seq数据中的小胶质细胞与浸润性髓系细胞 机器学习 中风 scRNA-seq NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
220 2026-10-17
BHLHE40 as a transcriptional rheostat: decoding microenvironmental signals in context-dependent tumor plasticity
2026-Oct-12, Science China. Life sciences
综述 本文综述了转录因子BHLHE40在肿瘤生物学中作为分子变阻器的功能,探讨其在不同肿瘤类型中依赖背景的促癌或抑癌双重作用 系统整合了BHLHE40的结构特征、生理信号整合功能及其在泛癌中的差异性表达模式,提出其作为肿瘤可塑性的转录变阻器概念,并讨论了靶向蛋白降解和患者来源类器官等新兴治疗策略 作为综述文章,未提供原始实验数据验证;BHLHE40的背景依赖性双重功能为临床靶向治疗带来重大挑战,目前缺乏有效的临床转化方案 总结BHLHE40在肿瘤生物学中的研究进展,阐明其作为转录变阻器在不同微环境信号下调控肿瘤可塑性的机制,并探讨其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 多种肿瘤类型,包括胶质母细胞瘤、急性髓系白血病、卵巢癌、乳腺癌、肾癌、肝细胞癌、胃癌、结直肠癌、胰腺导管腺癌、前列腺癌和子宫内膜癌 机器学习 肺癌 多组学数据分析,空间转录组学 NA 文本 NA NA NA NA NA
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