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当前共找到 529 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-10-21 |
From HPV infection to cervical precancer: Molecular mechanisms, immune microenvironment and emerging technologies
2026-Oct-16, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06473-x
PMID:42888274
|
综述 | 本文综述了从HPV感染到宫颈癌前病变的分子机制、免疫微环境和新兴技术 | 系统整合了基因组学、转录组学、免疫治疗和人工智能等多维度技术，提出了个性化干预策略 | 未涉及具体实验数据，深度学习模型面临数据变异性和可解释性挑战 | 探讨宫颈癌前病变的分子机制、免疫微环境及新兴技术在诊疗中的应用前景 | 宫颈癌前病变（高级别鳞状上皮内病变和原位腺癌）及HPV感染相关研究 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 深度学习 | 深度学习模型 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 182 | 2026-10-21 |
Sulforaphane Attenuates Ulcerative Colitis by Activating Nrf2 and Suppressing the NLRP3/IL-1β Inflammasome Axis
2026-Oct-16, Current molecular medicine
IF:2.2Q3
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研究论文 | 本研究探讨了Nrf2与NLRP3炎症小体在溃疡性结肠炎中的关系，以及萝卜硫素通过激活Nrf2抑制NLRP3/IL-1β炎症小体轴来减轻炎症的作用 | 揭示了Nrf2表达与NLRP3炎症小体活性在肠道上皮细胞炎症条件下的负相关关系，并证明天然Nrf2激活剂萝卜硫素可调控该轴，结合公共bulk和单细胞RNA-seq数据验证了临床相关性 | 仅使用单一细胞系Caco-2，缺乏体内实验验证 | 研究炎症条件下肠道上皮细胞中Nrf2表达与NLRP3炎症小体活性的相关性，以及萝卜硫素对该轴的调控作用 | Caco-2肠道上皮细胞系及溃疡性结肠炎患者的公共RNA-seq数据集 | 分子生物学、炎症与免疫学 | 溃疡性结肠炎 | qPCR、ELISA、Western blot、siRNA基因沉默、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、文本 | 体外Caco-2细胞实验及公共溃疡性结肠炎患者bulk和单细胞RNA-seq数据集（具体样本量未在摘要中说明） | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2026-10-21 |
The petal identity gene PhDEF has a major binding and regulatory action in the epidermis
2026-Oct-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.113154
PMID:42878643
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研究论文 | 该研究结合单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀技术，揭示了花瓣身份基因PHDEF在花瓣表皮和叶肉细胞层中对靶基因的不同调控作用，并发现其在表皮中具有主要的结合和调控功能 | 首次在细胞层特异性突变体中结合scRNA-seq和ChIP技术，发现同源异型基因PHDEF在不同细胞层中调控不同的靶基因集合，且表皮中的结合和调控作用远强于叶肉，揭示了细胞层身份对同源异型基因调控过程的影响 | 研究仅针对矮牵牛花瓣的PHDEF基因，未验证其他同源异型基因或植物物种；单细胞水平解析可能受细胞类型分离度和测序深度限制；未深入探讨表观遗传修饰和下游形态建成的具体机制 | 探究花瓣身份基因PHDEF在花瓣不同细胞层（表皮与叶肉）中的靶基因结合谱和调控功能差异，明确细胞层身份是否影响同源异型基因的调控作用 | 矮牵牛（Petunia）花瓣的细胞层特异性突变体，包括表皮层和叶肉层中PHDEF表达异常的突变体 | 植物发育生物学、单细胞转录组学、表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质免疫沉淀（ChIP） | NA | 单细胞转录组数据、ChIP-seq数据 | NA（摘要未提及具体样本数量） | NA | 单细胞RNA-seq、ChIP-seq | NA | NA |
| 184 | 2026-10-21 |
NUPR1-positive tumor-associated macrophages facilitate the progression of hepatocellular carcinoma via ferroptosis resistance
2026-Oct-15, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112943
PMID:42880562
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研究论文 | 该文探讨NUPR1阳性肿瘤相关巨噬细胞通过抵抗铁死亡促进肝细胞癌进展 | 首次揭示NUPR1通过调控GPX4相关铁死亡抵抗维持TAMs的M2样免疫抑制表型，从而促进HCC进展 | 机制研究主要基于THP-1衍生巨噬细胞和BMDMs，人体内TAMs的异质性和临床相关性仍需进一步验证 | 探究NUPR1是否功能性调控TAMs的铁死亡相关应激适应并维持其免疫抑制表型 | 人肝细胞癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞、THP-1衍生巨噬细胞、原代骨髓来源巨噬细胞及原位HCC小鼠模型 | 肿瘤免疫学、单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组织化学、药理学和遗传学方法、铁死亡相关指标检测 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据、实验检测数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2026-10-21 |
SLC25A4high Hepatocytes Enhance Lifestyle Intervention Response in MASLD by Recruiting Eating Macrophages
2026-Oct-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78004
PMID:42881487
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研究论文 | 本研究揭示了SLC25A4高表达肝细胞通过Pannexin 1释放ATP招募脂质吞噬巨噬细胞，并经GDF15-PPARα轴增强脂肪酸氧化，从而改善MASLD生活方式干预应答的机制 | 首次发现SLC25A4高表达肝细胞通过Pannexin 1介导的ATP外排招募Clec4fTimd4P2ry12脂质吞噬巨噬细胞，并揭示巨噬细胞GDF15激活肝细胞PPARα驱动脂肪酸氧化的肝细胞-巨噬细胞互作轴 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证样本有限，且具体分子调控细节仍需进一步阐明 | 探究生活方式干预应答型MASLD患者中驱动组织学和代谢改善的分子机制 | C57BL/6N小鼠及应答型MASLD患者 | 单细胞组学、代谢疾病研究 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | single-cell RNA sequencing, 代谢组学, 共培养实验, 流体动力学基因递送 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2026-10-21 |
Targeting Nupr1-Mediated p53 Mitochondrial Sequestration Alleviates Aortic Dissection by Restoring the Gadd45b-Dependent Survival Program
2026-Oct-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78143
PMID:42881547
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研究论文 | 该文揭示Nupr1通过线粒体p53隔离抑制Gadd45b生存程序，促进血管平滑肌细胞凋亡和主动脉夹层进展 | 首次发现Nupr1作为线粒体空间开关隔离p53，驱动不依赖转录的凋亡并抑制Gadd45b保护程序 | 摘要未明确说明研究局限性 | 探究主动脉夹层中连接应激信号与线粒体凋亡级联的上游调控因子及治疗靶点 | 主动脉夹层患者和鼠模型的主动脉组织及血管平滑肌细胞 | 心血管疾病研究 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本和动物模型数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2026-10-21 |
IL-6 receptor inhibition promotes expansion of cytolytic CD4+ T cells after cellular immunotherapy
2026-Oct-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025032420
PMID:42485668
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析IL-6受体抑制（托珠单抗）对造血干细胞移植患者CD4+ T细胞和CD14+单核细胞的影响，发现IL-6R抑制促进I型干扰素相关转录程序和细胞溶解性CD4+ T细胞分化 | 首次在人体中揭示IL-6R抑制可促进细胞溶解性CD4+ T细胞（包括Eomes+亚群）的分化，并增强抗肿瘤效果 | 样本量有限，且主要聚焦于未发生急性GVHD的患者，需进一步验证在不同患者群体中的普遍性 | 探究IL-6信号在人类造血干细胞移植中的作用及IL-6R抑制对免疫细胞分化的影响 | 接受异基因造血干细胞移植的患者外周血CD14+单核细胞和CD4+ T细胞 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本（基因表达数据） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2026-10-21 |
Multi-omic spatial mapping of the human habenula defines the molecular and anatomical organization of medial and lateral subregions
2026-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.30.755667
PMID:42856330
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研究论文 | 该文通过多组学单核测序和空间转录组技术，构建了人类缰核的高分辨率空间分子图谱，揭示了内外侧亚区的细胞类型和空间组织 | 首次结合单核多组学和空间转录组技术，系统解析了人类缰核内外侧亚区的转录组和表观遗传特征，并关联了精神疾病的遗传风险 | 摘要未明确提及样本量、技术平台细节及验证实验的局限性 | 解析人类缰核内外侧亚区的分子和解剖组织，并探索其与神经精神疾病的关联 | 人类缰核组织 | 空间转录组学, 单细胞多组学 | 抑郁症, 成瘾, 精神疾病 | 单核多组学测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 189 | 2026-10-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals vascular heterogeneity and cell-cell communication remodeling in the glioma blood-tumor barrier
2026-Oct-09, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2026.150595
PMID:42854890
|
研究论文 | 通过对公共单细胞RNA测序数据集进行二次分析，揭示了胶质瘤血肿瘤屏障中血管细胞的转录异质性及细胞间通讯重塑 | 系统刻画了从血脑屏障到血肿瘤屏障转变过程中血管细胞组成和转录异质性，预测了细胞间通讯从周细胞-平滑肌细胞向周细胞-星形胶质细胞及血管-免疫相互作用的转变，并识别了以细胞外基质重塑和血管生成激活为主的IDH野生型血管程序 | 样本水平的趋势大多无统计学显著性，候选标志物在独立队列中未显示一致的预后关联，研究为二次分析且缺乏空间和蛋白水平的验证及功能实验 | 全面了解胶质瘤从血脑屏障到血肿瘤屏障转变过程中血管细胞组成和转录异质性，以改善胶质瘤治疗 | 胶质瘤患者的手术标本，包括IDH突变型低级别胶质瘤和IDH野生型胶质瘤的肿瘤及邻近非肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Harmony、SingleR、Monocle、Slingshot、CellChat | 文本 | 7名患者的13份肿瘤及邻近非肿瘤手术标本，并在三个独立胶质瘤scRNA-seq队列和CGGA bulk队列中验证 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2026-10-21 |
CD180-Associated B-Cell Alterations in Type 1 Diabetes and the In Vitro Effects of Chlorogenic Acid: An Integrated Transcriptomic and Experimental Study
2026-Oct-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27198933
PMID:42884178
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研究论文 | 该研究整合转录组学分析与体外实验，探究1型糖尿病中CD180相关B细胞改变及绿原酸的免疫调节作用 | 首次将公共转录组数据挖掘、单细胞RNA测序、分子对接与分子动力学模拟以及DARTS实验相结合，揭示CD180与1型糖尿病炎症性B细胞状态的关联，并探索绿原酸对CD180及β细胞功能的潜在影响 | DARTS实验结果尚需独立重复验证；绿原酸的作用是否特异性通过CD180介导仍需进一步实验验证；研究以探索性分析为主 | 研究1型糖尿病中B细胞相关分子改变，并探索天然化合物绿原酸的潜在免疫调节作用 | 1型糖尿病公共转录组数据集、B细胞、NOD小鼠胰腺组织、MIN6细胞 | 转录组学、单细胞组学、免疫学 | 1型糖尿病 | 转录组测序、单细胞RNA测序、差异表达分析、WGCNA、机器学习、分子对接、分子动力学模拟、DARTS实验、体外细胞实验 | 机器学习模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、图像/分子结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、批量转录组测序 | NA | NA |
| 191 | 2026-10-21 |
Molecular Mechanisms Underlying Progression and Spontaneous Regression in Desmoid Tumors
2026-Oct-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27198887
PMID:42884130
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综述 | 本文总结了硬纤维瘤的分子发病机制及自发消退的潜在机制，包括Wnt/β-catenin信号减弱、激素调节、免疫微环境改变及通路间串扰 | 系统整合了硬纤维瘤自发消退的多因素分子机制，提出其是从活跃增殖向静息纤维化表型转变的过程，而非单一分子事件 | 为综述性文章，未提供原始实验数据，自发消退的具体分子机制仍不完全清楚，需进一步单细胞和空间转录组研究验证 | 总结硬纤维瘤的分子发病机制及自发消退的潜在分子机制，为治疗靶点发现和患者分层管理提供依据 | 硬纤维瘤（硬纤维瘤病） | 数字病理, 肿瘤分子生物学 | 软组织肿瘤, 硬纤维瘤 | NGS, 转录组分析, 单细胞转录组, 空间转录组, 免疫分析 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2026-10-21 |
A cellular view of seed development and germination
2026-Oct-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag286
PMID:42886515
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综述 | 该文综述了单细胞和空间转录组学在拟南芥及主要作物种子发育和萌发研究中的应用，提供了从受精到幼苗建成的细胞视角 | 系统整合了单细胞与空间转录组学在种子生物学中的最新进展，揭示了此前无法检测的细胞复杂性和异质性，包括形态均一组织内的转录亚群、特化的胚乳微域、细胞类型特异性基因组印记模式以及空间分离的激素信号枢纽，并实现了从相关性到因果推断的细胞类型特异性基因调控网络构建 | 作为综述文章，未产生新的实验数据；所综述的研究主要集中于拟南芥和少数主要作物，种子封装结构、致密储藏化合物和空间异质性仍对技术应用构成挑战 | 综合单细胞和空间转录组学研究，以细胞分辨率系统解析从受精到幼苗建成的种子发育连续过程 | 拟南芥及主要作物（水稻、玉米、大麦、大豆、小麦）的种子 | 植物科学、单细胞生物学、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组测序、空间转录组学、染色质可及性测序、转录因子结合分析 | NA | 转录组数据、表观遗传数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 193 | 2026-10-21 |
Spatial Transcriptomics in Thyroid Cancer: A PRISMA-Style Systematic Review of Platforms, Architecture, and Clinical Applications
2026-Oct-02, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm15197636
PMID:42882098
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系统综述 | 本文系统综述了空间转录组学在甲状腺癌研究中的平台、应用及主要发现 | 首次以PRISMA 2020规范系统梳理甲状腺癌空间转录组研究的平台架构、分析方法与临床转化证据，并对纳入研究进行逐项方法学质量评价 | 纳入研究多为小样本、选择性队列，仅两篇为同一公共数据集的再分析，缺乏独立外部验证；12项病例系列中仅1项报告连续完整纳入，8项未报告所分析患者的结局，9项以spot或细胞而非患者为分析单位，方法学质量高偏倚风险研究达10项 | 系统评价空间转录组学在甲状腺癌中的研究平台、应用场景与主要发现，并评估其方法学质量与临床转化证据强度 | 应用空间分辨转录组学技术研究甲状腺癌组织的英文原始研究文献 | 空间转录组学 | 甲状腺癌 | 空间转录组测序、数字空间表达谱分析 | NA | 空间转录组数据、图像 | 纳入21项研究：12项病例系列、4项分析性横断面研究、3项单病例报告、2项同一公共数据集的再分析研究 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | 10x Visium, GeoMx Digital Spatial Profiler | 19项研究使用基于捕获的全转录组平台（以10x Visium为主），2项使用GeoMx数字空间表达谱分析 |
| 194 | 2026-10-21 |
Subepithelial ALOX15+ macrophage niches orchestrate eosinophil recruitment in chronic rhinosinusitis with nasal polyps via the ALOX15-ERK-CCL13 axis
2026-Oct-01, Rhinology
IF:4.8Q1
DOI:10.4193/Rhin26.124
PMID:42467066
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研究论文 | 本研究通过bulk RNA测序、空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示了慢性鼻窦炎伴鼻息肉中上皮下ALOX15+巨噬细胞通过ALOX15-ERK-CCL13轴招募嗜酸性粒细胞的空间机制 | 首次发现上皮下ALOX15+巨噬细胞生态位是嗜酸性粒细胞招募的关键空间决定因素，并阐明IL-4/IL-13诱导的ALOX15-ERK-CCL13轴机制，验证了Dupilumab和Stapokibart靶向该通路的治疗潜力 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别驱动嗜酸性粒细胞招募的空间细胞生态位，并评估靶向特定巨噬细胞驱动的致病环路在嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的治疗疗效 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的鼻息肉组织及健康对照者的鼻组织 | 空间转录组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | bulk RNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | CRSwNP患者鼻息肉组织30例（按嗜酸性粒细胞严重程度分层），健康对照10例用于bulk RNA测序；独立健康对照队列12例用于体外验证 | NanoString | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | GeoMx DSP | GeoMx数字空间分析平台 |
| 195 | 2026-10-20 |
Single-cell atlas of neuroma-induced DRG remodeling reveals intervention-specific glial and immune programs
2026-Oct-19, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.053052
PMID:42894959
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建神经瘤形成损伤后背根神经节（DRG）重塑的图谱，并比较近端神经挤压与神经切除两种干预手段的差异 | 首次在单细胞水平系统解析神经瘤诱导的DRG重塑，并揭示不同干预方式（近端挤压 vs 神经切除）下胶质细胞、神经元和免疫细胞的干预特异性转录程序 | 摘要中未明确说明样本量、具体分子机制验证及长期功能恢复数据 | 探究神经瘤形成损伤后DRG的转录重塑机制，并比较近端神经挤压与神经切除两种干预对再生与持续性损伤状态的影响 | 神经瘤形成损伤后的背根神经节（DRG）组织，包括感觉神经元、卫星胶质细胞、施万细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学、神经生物学 | 神经病理性疼痛、周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 196 | 2026-10-20 |
HPV16 E7-Containing Exosomes May Contribute to PD-L1 Expression in Tumor-Infiltrating Lymphocytes of Cervical Cancer
2026-Oct-19, Balkan medical journal
IF:1.9Q2
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研究论文 | 该研究探讨了HPV16 E7蛋白在宫颈癌组织及血浆外泌体中的存在情况，以及其与肿瘤浸润淋巴细胞中PD-L1表达的关系 | 首次揭示了外泌体携带的HPV16 E7蛋白与肿瘤浸润淋巴细胞中PD-L1表达之间的关联，并发现外泌体E7水平与患者预后不良相关 | 研究未直接证明E7蛋白直接介导PD-L1上调，其功能及临床意义仍需进一步研究验证 | 探究宫颈癌来源外泌体中HPV16 E7蛋白的存在及其与肿瘤浸润淋巴细胞PD-L1表达的关系 | HPV16阳性宫颈癌患者血液和病理样本、宫颈癌细胞系C33A和SiHa培养液 | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、多重免疫荧光、qRT-PCR、蛋白质印迹 | NA | 图像、文本 | 30例HPV16阳性宫颈癌患者队列、104例组织芯片队列、3个宫颈癌单细胞RNA测序数据集、C33A和SiHa细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2026-10-20 |
Sequential TPRX1 and HERVL activation delineates a progression toward the totipotent-like state
2026-Oct-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.118163
PMID:42893511
|
研究论文 | 该文通过构建TPRX1-EGFP/HERVL-tdTomato双报告hPSC细胞系，解析了从hPSC向8细胞样细胞（8CLC）诱导过程中TPRX1与HERVL顺序激活的逐步转变轨迹 | 构建了TPRX1-EGFP/HERVL-tdTomato双报告hPSC细胞系，首次在活细胞层面按时间分辨解析了TPRX1激活先于HERVL激活的顺序性轨迹，并结合单细胞转录组与时间分辨流式细胞术定义了从primed状态经TPRX1中间态到HERVL+ 8CLC态的连续转变，同时通过CRISPRi和RNA导向扰动验证了HERVL元件及HERVL来源RNA的功能贡献 | HERVL元件及HERVL来源RNA发挥功能的具体位点依赖性机制尚未阐明 | 研究人8细胞样细胞（8CLC）体外诱导过程中的细胞动态，揭示全能样状态获得及合子基因组激活（ZGA）的调控规律 | 人多能干细胞（hPSC）及其体外诱导产生的8细胞样细胞（8CLC） | 干细胞生物学、发育生物学、单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序、时间分辨流式细胞术、CRISPRi、RNA导向扰动、双荧光报告基因系统 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、荧光报告数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 198 | 2026-10-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies a proinflammatory S100a8/a9+ macrophage subset contributing to acute kidney injury
2026-Oct-17, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02395-3
PMID:42892624
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定出小鼠肾脏中一个独特的促炎性S100a8/a9+Ly6chigh巨噬细胞亚群，并揭示其在LPS诱导的急性肾损伤中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出LPS刺激后小鼠肾脏中独特的S100a8/a9+Ly6chigh促炎性巨噬细胞亚群，并证明S100a9缺失可通过减少CD11b+Ly6chigh巨噬细胞浸润和抑制促炎细胞因子产生来减轻急性肾损伤 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；S100a8/a9作为治疗靶点的安全性和有效性仍需进一步临床研究 | 鉴定内毒素血症诱导急性肾损伤中巨噬细胞亚群及其功能角色 | 小鼠肾脏巨噬细胞、LPS诱导或缺血再灌注损伤的急性肾损伤模型、S100a9-/-小鼠及骨髓移植受体小鼠 | 单细胞组学、免疫学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2026-10-19 |
CXCL14+ fibroblasts promote development of IBD-associated fibrosis and cancer by interacting with SPP1+ macrophages via collagen IV secretion
2026-Oct-17, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03636-2
PMID:42892644
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研究论文 | 该文通过单核转录组、空间转录组等多组学方法揭示了CXCL14+成纤维细胞通过分泌IV型胶原与SPP1+巨噬细胞互作，促进IBD相关纤维化和癌变的机制 | 首次在单核水平揭示CXCL14+成纤维细胞是微环境中胶原的主要来源，并阐明其通过分泌IV型胶原与SPP1+巨噬细胞互作形成TGF-β1反馈环路驱动IBD相关纤维化和癌变的机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究IBD相关癌症发生发展过程中细胞亚型的动态变化和相互作用机制 | IBD相关纤维化和癌变过程中的细胞亚型（CXCL14+成纤维细胞、SPP1+巨噬细胞等） | 数字病理学 | 炎症性肠病相关癌症 | 单核转录组测序，空间转录组学，生态动态建模，多重免疫组化，体外共培养，体内动物实验 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 单核RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 200 | 2026-10-19 |
Spatial Neighborhood Construction and NICHES Connectomics for Differential Ligand-Receptor Analysis in Fibrotic Human Lung
2026-Oct-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70816
PMID:42891635
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研究方法 | 本文提出了一种基于成像空间转录组数据的计算流程，在单细胞对分辨率上推断配体-受体信号，并构建空间邻域与NICHES连接组学图，用于纤维化人肺组织的差异配体-受体分析 | 在单个细胞-细胞对分辨率上保留信号推断结果，利用测量的物理距离约束候选相互作用，并将邻域定义、LR数据库和评分函数等所有建模选择作为用户可调参数暴露出来；同时构建C2C、C2N和N2C三种互补表示及邻域组成分析 | 摘要中未明确说明该流程的局限性 | 开发一个可重复、模块化且可调的计算协议，用于研究空间组织的细胞间通讯，并在纤维化肺组织中识别区分纤维化区域与周围组织的差异配体-受体机制 | 纤维化人肺组织 | 空间转录组学, 生物信息学 | 肺纤维化 | 成像空间转录组, 配体-受体分析, 连接组学分析 | NA | 空间转录组图像数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |