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当前共找到 529 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-25 |
Architectural Regulation of T-Lymphocyte Function in Hepatocellular Carcinoma: Current Evidence and Translational Opportunities
2026-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202603114R
PMID:42910499
|
综述 | 本文综述了肝细胞癌中T淋巴细胞功能受空间、机械和多细胞组织结构调控的证据，并提出以空间免疫状态为生物标志物和治疗靶点的架构导向框架 | 将T细胞架构作为跨越分子、细胞和组织尺度的调控层进行重新定义，系统整合细胞骨架重塑、免疫突触几何、机械转导、血管定位、基质排斥和三级淋巴结构组织对T细胞激活阈值、效应能力、耗竭轨迹和治疗反应的影响 | 架构与T细胞命运之间的因果关系尚未完全明确，部分机制是从其他实体瘤或基础T细胞生物学外推而来，而非直接来自肝细胞癌观察 | 重新审视肝细胞癌中T淋巴细胞功能的空间和结构调控机制，并探讨其转化应用机会 | 肝细胞癌中的T淋巴细胞及其空间、机械和多细胞组织结构 | 数字病理, 空间转录组学, 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 空间转录组学, 多重成像, 数字病理 | NA | 图像, 文本, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 多重成像 | NA | NA |
| 2 | 2026-10-25 |
A Senescence-Related Signature for Risk Stratification and Predicted Immunotherapy Response in Breast Cancer: Integrative Pathology and Multi-Omics Analysis
2026-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202603669R
PMID:42910514
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研究论文 | 该研究整合全切片病理图像、bulk转录组、单细胞RNA测序、空间转录组和临床数据，构建乳腺癌衰老相关特征（SRS）用于风险分层和免疫治疗反应预测 | 整合病理图像深度学习特征与多组学数据构建衰老相关特征，揭示衰老活性在上皮和内皮细胞中富集、成纤维细胞介导胶原相关通讯，并鉴定STARD10为衰老相关候选生物标志物 | 研究主要基于TCGA-BRCA内部划分数据验证，缺乏独立外部队列验证；STARD10的功能机制和治疗靶点价值仍需进一步研究 | 系统表征乳腺癌中衰老相关特征，构建预后分层和免疫治疗反应预测模型 | 乳腺癌患者及肿瘤样本 | 数字病理 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq，单细胞RNA测序，空间转录组学 | 深度学习，机器学习生存模型 | 图像，文本，转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq，单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-10-25 |
Long-acting pegylated interferon gamma sensitizes AML cells to killing by donor T cells
2026-Oct-27, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2026019670
PMID:42480219
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现MHC-II低表达的AML细胞中炎症信号通路下调，并测试长效聚乙二醇化干扰素γ能否增强AML细胞对供体T细胞杀伤的敏感性 | 首次发现长效聚乙二醇化IFN-γ可比重组IFN-γ更稳健地上调MHC-II表达，并增强供体T细胞对AML细胞的清除能力 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在患者中验证其治疗获益 | 探索异基因造血干细胞移植后AML复发中MHC-II丢失的机制，并评估长效IFN-γ恢复MHC-II表达、增强供体T细胞杀伤AML细胞的效果 | MHC-II低表达和高表达的AML患者样本、THP1细胞系、健康小鼠及异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-10-25 |
Si-scRNA-seq: Enabling ambient-stable single-cell transcriptomics through spatially confined biosilicification
2026-Oct-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2617730123
PMID:42912787
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研究论文 | 本文提出空间限制性生物硅化（SCB）方法，实现室温下稳定保存单细胞转录组，并开发了Si-scRNA-seq技术 | 利用空间限制性生物硅化在RNA周围包裹纳米级非晶二氧化硅层，通过加入硅化抑制剂实现时空控制，防止过度交联和细胞聚集，首次实现无需冷链的单细胞转录组保存 | 摘要未明确提及方法在极长期存储或不同细胞类型中的普适性限制，以及硅化对下游酶反应潜在影响的详细评估 | 解决单细胞RNA测序中样本存储需要冷链物流的问题，开发室温下稳定保存单细胞转录组的方法 | 单细胞转录组，临床肺癌、肝癌和卵巢癌标本 | 单细胞转录组学 | 肺癌, 肝癌, 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 生物硅化 | NA | 转录组数据 | 临床肺癌、肝癌和卵巢癌标本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 与主流平台兼容，成本约0.1元/样本 |
| 5 | 2026-10-25 |
Pathogenic B-T Cell Axis Driven by BAFF Induces Endothelial Apoptosis in SLE-PAH
2026-Oct-23, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.126.328338
PMID:42779507
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组等技术揭示BAFF驱动B-T细胞轴诱导内皮细胞凋亡，从而促进SLE相关肺动脉高压的发生，并验证贝利尤单抗的治疗效果 | 首次发现BAFF诱导的新型疾病特异性S100a6+成熟B细胞亚群，揭示其通过MHC-I抗原呈递和CD80-CD28共刺激激活细胞毒性Gzmk+ CD8+ T细胞，进而通过Fas/FasL信号诱导易感内皮细胞亚群凋亡的致病免疫轴 | 主要基于动物模型和体外实验，缺乏大规模临床干预试验验证；SLE-PAH患者队列样本量未明确说明 | 探究BAFF在系统性红斑狼疮相关肺动脉高压发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | SLE-PAH患者、人源化BAFF转基因小鼠、两种不同的SLE-PAH动物模型 | 单细胞组学、免疫学、心血管疾病研究 | 系统性红斑狼疮、肺动脉高压、心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学分析、细胞实验 | 人源化BAFF转基因小鼠模型、SLE-PAH动物模型 | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-10-25 |
Single-cell landscape of alcohol-related hepatitis reveals serum amyloid a hepatocytes as key drivers of disease pathogenesis
2026-Oct-23, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001890
PMID:42912712
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术分析了酒精相关性肝炎（AH）患者肝活检样本的细胞异质性，揭示了表达血清淀粉样蛋白A（SAA）的肝细胞亚群在疾病发病机制中的关键驱动作用。 | 首次在单细胞水平上描绘了酒精相关性肝炎的细胞图谱，识别了多个新的细胞亚群，包括表达SAA的肝细胞、瘢痕相关内皮细胞、Fibulin-3+间充质细胞、表达MMP19的瘢痕相关巨噬细胞、活化的CD4+和应激/效应CD8+T细胞亚群以及高表达FPR2的中性粒细胞，并揭示了SAA-FPR2相互作用在AH炎症中的潜在介导作用。 | 摘要中未明确提及研究的局限性，但可能包括样本量有限、缺乏功能验证实验的全面性以及未详细探讨SAA-FPR2通路的具体分子机制等。 | 旨在识别酒精相关性肝炎中的关键细胞亚群及其相互作用，并探索导致疾病发病机制的关键机制。 | 酒精相关性肝炎患者、早期酒精相关性肝病患者以及健康个体的肝活检样本和血浆样本。 | 数字病理学、单细胞组学 | 酒精相关性肝炎、酒精相关性肝病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、类器官培养、ELISA | NA | 单细胞转录组数据、图像数据、蛋白质表达数据 | 摘要中未明确说明样本数量，涉及AH患者、早期ALD患者和健康个体的肝活检及血浆样本。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-10-25 |
Targeted inhibition of HK2 expression in pancreatic ductal adenocarcinoma reprogrammes the immune microenvironment by regulating CCL5-mediated CD8+ T cell infiltration
2026-Oct-23, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117602
PMID:42914824
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研究论文 | 该研究揭示了HK2通过调控CCL5介导的CD8+ T细胞浸润来重塑胰腺导管腺癌免疫微环境，并增强抗PD-1疗法效果 | 首次发现HK2-CCL5轴调控CD8+ T细胞招募并塑造PDAC免疫微环境，且抑制HK2可增强抗PD-1疗效 | 摘要未明确说明 | 探究HK2在PDAC免疫逃逸中的作用及其与CD8+ T细胞浸润和抗PD-1治疗的关系 | 胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤细胞、CD8+ T细胞、小鼠胰腺癌模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、免疫组化、RNA测序、流式细胞术、Transwell实验、体外共培养 | NA | 基因表达数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-10-25 |
Bacteria inside kidney tumors associate with myeloid inflammation and disease progression: A TRACERx Renal study
2026-Oct-23, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2026.101335
PMID:42914984
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研究论文 | 该研究对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤内细菌进行遗传学表征，揭示共生菌Cutibacterium的分布及其与髓系炎症和疾病进展的关联 | 首次在ccRCC中系统探索活菌的存在、瘤内分布及其与肿瘤微环境的相互作用，发现Cutibacterium积累与中性粒细胞募集、髓系炎症及不良预后相关，并通过体外感染实验验证其诱导趋化因子表达的机制 | 摘要中未明确提及研究局限性，推测瘤内细菌载量较低、培养难度大，且因果关系仍需进一步体内实验验证 | 探究ccRCC肿瘤内细菌的存在、分布特征及其与肿瘤微环境和疾病进展的关系 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）原发肿瘤患者及肿瘤样本 | 肿瘤微生物组学、数字病理、肿瘤微环境研究 | 肾癌 | 宏基因组测序、细菌培养、bulk RNA-seq、空间转录组学、体外感染实验 | NA | 测序数据、图像、文本 | TRACERx队列616个样本（143名患者）；TCGA队列511个样本及患者 | Illumina | bulk RNA-seq、空间转录组学、宏基因组测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-10-25 |
Tumor cell-derived SPP1 reprograms fibroblasts into CAFs via CD44/PI3K/AKT/Twist signaling axis to promote immune barrier formation in oral squamous cell carcinoma
2026-Oct-23, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.179468
PMID:42918380
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研究论文 | 本文利用空间转录组学和单细胞测序分析，揭示口腔鳞状细胞癌细胞分泌的SPP1通过CD44/PI3K/AKT/Twist信号轴重编程正常成纤维细胞为癌相关成纤维细胞，从而促进免疫屏障形成 | 首次阐明SPP1通过CD44/PI3K/AKT/Twist信号轴驱动正常成纤维细胞向癌相关成纤维细胞转化的分子机制，并揭示了Twist上调CD44表达的自增强正反馈环路 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究口腔鳞状细胞癌中癌相关成纤维细胞介导的免疫屏障形成的分子机制，特别是正常成纤维细胞重编程为癌相关成纤维细胞的关键调控通路 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的癌细胞、正常成纤维细胞和癌相关成纤维细胞 | 空间转录组学, 单细胞测序 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-10-25 |
Dose-specific reprogramming of the mucociliary-humoral immune interface in oysters upon biodegradable microplastics exposure
2026-Oct-23, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.129389
PMID:42918596
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术，解析香港牡蛎鳃组织在暴露于两种浓度紫外老化聚乳酸微塑料7天后的早期细胞响应，揭示了黏液-纤毛-体液免疫界面的剂量特异性重编程 | 首次在单细胞水平上揭示可生物降解微塑料对海洋滤食性贝类鳃组织黏液-纤毛-体液免疫界面的剂量特异性重编程，提出体液免疫是最敏感的早期响应指标，并发现了从低剂量物理化学界面适应到高剂量颗粒负荷相关黏液纤毛-免疫重塑的非线性转变 | 细胞间通讯预测的相互作用需要进一步功能验证 | 解析可生物降解聚乳酸微塑料对香港牡蛎鳃组织的早期细胞效应，识别早期生物效应标志物并评估其生态风险 | 香港牡蛎（Crassostrea hongkongensis）的鳃组织 | 单细胞组学、海洋生态毒理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 香港牡蛎鳃组织，暴露7天，两种浓度（低剂量和高剂量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-10-25 |
Circuit architecture and regulation of the Drosophila brain neuroendocrine system
2026-Oct-23, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2026.101637
PMID:42918615
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综述 | 综述了果蝇脑神经分泌细胞的电路架构及其调控机制 | 整合了连接组学和单细胞转录组学的最新进展，系统总结了调控神经分泌细胞活性的突触输入、神经调质输入、肠道来源神经肽和细胞自主传感器 | 综述性文章，未提供原始实验数据，主要聚焦于成体果蝇，对其他昆虫的神经分泌细胞调控理解有限 | 总结昆虫神经分泌细胞的电路架构和调控机制，并探讨组学方法如何弥合果蝇与其他昆虫之间神经分泌细胞调控理解的差距 | 果蝇（主要为成体黑腹果蝇）的神经分泌细胞 | 神经科学 | NA | 连接组学，单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-10-25 |
Monoamine Oxidase A Expression Marks Aged Progenitor Signatures in Thymic Epithelial Cells and Thymomas
2026-Oct-23, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2026.106175
PMID:42918620
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研究论文 | 该研究整合单细胞转录组、免疫组化和bulk转录组分析，揭示了标记胸腺上皮细胞衰老祖细胞样状态的MAOA基因，并证明其可用于区分胸腺瘤与胸腺癌 | 首次发现MAOA标记成人胸腺中衰老祖细胞样胸腺上皮细胞亚群，并将胸腺瘤与衰老祖细胞样TEC状态相关联；证明MAOA免疫染色可补充KIT用于区分胸腺瘤与胸腺癌 | 依赖公共单细胞数据集再分析，免疫组化样本量有限（83例TETs），TCGA-THYM队列117例，缺乏功能验证实验 | 定义与胸腺上皮肿瘤亚型相关的胸腺上皮细胞程序，区分胸腺瘤与胸腺癌的生物学基础 | 非肿瘤性胸腺组织（不同发育阶段）、83例胸腺上皮肿瘤（TETs）、TCGA-THYM队列117例TETs | 数字病理学 | 胸腺瘤、胸腺癌 | 单细胞RNA-seq、免疫组化、bulk RNA-seq | NA | 图像、文本（转录组数据） | 83例TETs用于免疫组化，117例TETs（TCGA-THYM队列）用于转录组分析，另含公共人类胸腺单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-10-25 |
Single‑cell multi‑omics analysis reveals TGF-β1-RUNX2-mediated matCAF differentiation and its role in remodeling the lymph node metastatic microenvironment in bladder cancer
2026-Oct-23, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-04022-1
PMID:42918833
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研究论文 | 该文整合单细胞RNA测序、空间转录组学、临床队列和功能模型，揭示膀胱癌淋巴结转移微环境中matCAF的分化机制及其重塑作用 | 鉴定出以LRRC15和POSTN表达为特征、富集于淋巴结转移的基质重塑型癌相关成纤维细胞（matCAF）状态；揭示Hybrid_CCND1⁺恶性上皮细胞通过FOS依赖性TGFB1转录及TGF-β1-TGFBR1-RUNX2信号促进matCAF分化；发现matCAF通过POSTN-ITGAV/ITGB5激活PI3K-AKT并促进淋巴管生成，且通过CXCL12-CXCR4影响CD8⁺ T细胞功能；证明靶向RUNX2依赖的matCAF程序可减轻肿瘤负荷 | 摘要未明确说明样本量、平台型号及功能实验的具体细节，临床转化仍需进一步验证 | 探究膀胱癌淋巴结转移的基质机制，阐明matCAF分化及其在重塑淋巴结转移微环境中的作用 | 膀胱癌淋巴结转移患者样本及功能模型 | 数字病理 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 功能模型 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-10-25 |
scHGNN: A single-cell gene regulatory network inference method based on heuristic graph neural networks
2026-Oct-23, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-02087-5
PMID:42918896
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研究论文 | 提出一种基于启发式图神经网络的单细胞基因调控网络推断方法scHGNN，通过融合基因表达特征与网络拓扑信息来平衡局部与全局调控关系 | 设计统一的启发式矩阵和链接预测模块，将多阶邻居拓扑信息整合到可学习权重中，有效平衡局部直接调控信号与全局多步调控通路 | 仅在基准网络和部分转录因子靶基因预测案例中验证，尚未在更广泛的生物学场景和大规模真实数据中系统评估 | 从单细胞转录组数据中精确推断基因调控网络，解码细胞命运决定机制、阐明疾病进展分子机制并支持靶向治疗开发 | 单细胞转录组数据及基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据、网络结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-10-25 |
Cancer cell-specific FOXP3 licenses MMP19-dependent matrix remodeling and metastatic dissemination in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Oct-23, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-04025-y
PMID:42919853
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研究论文 | 本文研究胰腺导管腺癌中癌细胞特异性FOXP3通过直接转录激活MMP19促进基质重塑和转移，并探讨其作为治疗靶点的可能性 | 首次揭示癌细胞内在的c-FOXP3-MMP19程序促进PDAC基质侵袭行为，将FOXP3功能从免疫耐受拓展到肿瘤细胞内在侵袭转移调控，并初步证明c-FOXP3可被药物靶向 | 未找到验证的MMP19选择性抑制剂，FOXP3靶向ASO AZD8701仅提供初步体外证据，缺乏体内药效和临床验证数据 | 探究癌细胞特异性FOXP3在胰腺导管腺癌基质重塑和转移中的作用及其分子机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）细胞、原位小鼠模型、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学、数字病理学 | 胰腺癌 | 转录组测序、染色质免疫沉淀、单细胞测序、启动子报告基因实验、反义寡核苷酸 | 原位小鼠模型 | 图像、文本、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-10-25 |
3D tissue model to patient atlas: dynamic network topology reveals PDAC chemoresistance bottlenecks
2026-Oct-23, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00830-z
PMID:42919864
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研究论文 | 该研究建立了3D PANC-1组织模型，结合单细胞RNA测序和动态蛋白互作网络分析，揭示了PDAC化疗耐药瓶颈的调控网络拓扑变化 | 将伪时间轨迹推断与动态蛋白互作网络分析相结合，连续追踪介数中心性在细胞状态转换中的变化而非比较离散状态，发现了CDK1介数中心性选择性激增的涌现瓶颈 | 仅基于PANC-1细胞系的3D组织模型，未涵盖PDAC的遗传异质性；单细胞数据为体外模型来源，需进一步体内验证 | 表征PDAC药物耐受状态的调控网络架构，揭示化疗耐药动态细胞状态转换中的网络拓扑演化 | PANC-1细胞系3D组织模型及PDAC患者图谱数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 蛋白互作网络分析,伪时间轨迹推断 | 基因表达数据,文本 | 3D PANC-1组织模型四种条件（对照、吉西他滨、TGF-β1及联合），PDAC图谱726,107个细胞来自231例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-10-25 |
Synchronous co-infection drives lineage representation in influenza A virus populations
2026-Oct-23, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00968-1
PMID:42919914
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研究论文 | 本研究将体外单细胞转录组学与病毒谱系追踪相结合，揭示甲型流感病毒谱系富集主要发生在同步共感染期间，即多个病毒基因组占据同一细胞时，且病毒输出增加 | 首次将单细胞转录组学与病毒谱系追踪配对，用于将受感染细胞环境与病毒输出动态联系起来；识别出同步共感染这一时间依赖条件，在该条件下病毒谱系表示可以发生偏移 | 研究基于体外单细胞转录组学，可能无法完全反映体内感染的复杂性；仅关注谱系富集与同步共感染的关系，未深入探讨其他潜在影响因素 | 识别允许特定病毒谱系不成比例扩增的感染情境，并阐明受感染细胞环境与病毒输出动态之间的关系 | 甲型流感病毒及其感染的细胞 | 病毒学、单细胞组学 | 流感 | 单细胞转录组学、病毒谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据、病毒谱系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-10-25 |
Integrated single-cell transcriptomics reveals two-phase model of right ventricular failure
2026-Oct-23, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00896-2
PMID:42919929
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2026-10-25 |
Uncovering the transcriptional hallmarks of endothelial cell aging via integrated single-cell analysis
2026-Oct-23, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-026-01247-3
PMID:42919924
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞转录组数据构建了人类衰老内皮细胞图谱（HAECA），覆盖12种组织、超过37.5万个内皮细胞，揭示了内皮细胞衰老的转录特征 | 首次构建了覆盖成年人类全生命周期、多组织的人类衰老内皮细胞图谱（HAECA），发现了静脉内皮细胞血管生成基因表达下降、细胞外基质和机械转导特征广泛改变，并揭示了与p21相关的转录程序及其与细胞衰老的关联 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 构建人类内皮细胞跨组织和年龄的高分辨率转录组参考图谱，揭示内皮细胞衰老的转录标志 | 人类12种组织中的内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过375,000个内皮细胞，来自12种人类组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-10-25 |
Benchmarking segmentation methods for spatial transcriptomics
2026-Oct-23, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03272-x
PMID:42919952
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研究论文 | 该文对11种基于图像、基于转录组和多模态的细胞分割方法在15个数据集上进行了基准测试，涵盖5种空间转录组技术和12种人鼠组织类型 | 引入生物学信息驱动的评估指标，量化分割质量、转录本回收、细胞组成、形态、表达纯度和空间组织；跨技术分析揭示分割选择对下游分析的关键影响；提供统一的Nextflow可扩展流程 | 未明确说明具体限制，可能包括数据集覆盖范围有限、缺乏真实金标准分割等 | 系统评估空间转录组学中细胞分割方法在不同平台和生物背景下的性能，建立标准化评估框架 | 15个空间转录组数据集，涵盖12种人类和小鼠组织类型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和转录组数据 | 15个数据集，涵盖12种组织类型 | NA | 空间转录组学 | NA | 涉及5种空间转录组技术，具体平台未在摘要中明确 |